Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA026350

[Submit comment/correction]

Sequence	AA026350
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA026350
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GCAGCGGCGCTAGCCTCCAAGGCGCCTCGGTGTCCATGAATATGATCTCC TGGAATCCCCGAGGGGTGGGCAAGACCCTCGGCAGTAACAAGATGGAGTA TCTTGCCAAACTGATCTCATCGACACGCGCCAAGGTAATCTTTGTTTCTG AAACTCTTTCTTCAAAAATTACAAAGCATGATCTAGCTAATCGAGCTAAT CGTTTTCCTATCCATGATAGTTTTGTTGTCCTTGCTGAAGACCGTGTTGG AGGTCTTTGGGTCATGTGGTCGGATGAGATGCAGTTGTCTATAGTTTTTG CTAGCCAAAATCTAGTCCTAGCGACTGTTGTAAATAGTACTACTAAGTTT GCTTTTAATCTAGTTTGTGTGTATGGTGACCCGCATCACCCTAGAACTAG GGATATCTGGTGTAAGATCGAGTCCTTTGTTGTTTCTTCTCCTGGGAAAC CAGTTTATTGTATGGGTGATCTCAACAACATCATGTTTCCTTGCGAGAAG AGCAACCCTAGCAAGGGCAACCATCATCGTATGCGTAATTTCATGTACCT TGTAAAAAGATGTGGATTAATGGATATGGGCTATAATGGTCCTGCTTATA CTTGGTGTAATAAGCGTTTTACTTCTATTCCTACTTATGCAAGACTTGAT CGTTGCCTCGCCAATGCTGAGTGGTGTAATGTGTTTCTGAATACTACTGT GTACAATCTTCCTATTATCTTAAGTGATCATGCTCCAATTTTAACTATCA CTCAGCCTACTACTGTTAAAACAAAGAAAAGCTTCAAGTTCGAGAACTGG TGGTTACTTGAGGAAGATTTCCATGAGACAGCACAACAGGCCTGGGTTGT TTCTACTAACAAACCTTTCCATGTTAGAACTTCCATCCTTGCAGGATCTT TGAAGAAGTGGTGTAGGAAGAAAAAGCCTTTACAGCAGCAGTTAGATACA ATACATGCTGAGATTGAGGCTATCCAAATGCAACCTATACACTCTCAGGA TCATGTCAAGGAGGCGGAGCTGACTGAAAGTTTCGAGCAAACGATGACCA AACTCACTGAATTCCATAGGCAGCGTGCAAAGAAGCTTTGGGCGAAGCAT GGTGATCGTAACTCTTCCTATTTTAATAATGTTGTTTGTAAGAGGCGTAG GAAGAATAGAATTAGTATCATAAAAGATATCCATAACAATCTGCTCTATA ACCCTGAAGACATTGTTGCATGTTTCTCTAATTACTATTCAAATATTTTC ACTACTTCTAATCCAGATCTAAGGAATGAGCCACCTATTATTAGTCCACA AGAACAACCTGATCCGTTTGTTAGTTCTGCTCCAGATAAAGATGAAATTT TACAGATCTTGAAAGACATGAAGAGGAATGCTTCTCCTGGACCAGATGGA TTAAATGTGGAGTTCTATTTATCAGCATGGAGGTGGATAGAAGATGATGT CACGAAGATTGTTCATGATTTCTATACAACTAGTACTCTCCATCCTAAAC TTAATGAAACTGTTATTGCGTTGATTCCAAAGAAAACCAATCCGATGGTC CCGCAAGATTTTAGGCCTATCAATCTTTGCAATGCCATTTATAAAATTAT TACTAAATCTCTTGCAAATAGGCTCAAGGTTTCTTTGCCTGAATTCATTC ATGAAACTCAACAAGCTTTTGTACAAGGTCGTAGAATTGCAAATAATGTT GCTCTAGCTCAGGAAATTACGCACTCTTTTCAACTTTTCTCTTGGAAACA TGAGGATTTTATGCTAAAAATTGATCTTGCAAAAGCTTTTGATCGAATAG AATGGGACTTTATCGTGATGGCTCTCGCACGTAAAGGGCTGCATGGTCAT TTCATTAATCTTGTCCGTACTTGCATTTCAACTGCTACCTTTTCGATTCA GATTAATGGACAACCGTTTGGTCGCTTTCGCAGCAGTCGAGGCATCATAC AGGGTTGTCCGTTGTCGTCGTTCTTATTTGTCCTTGCAGTTAATGAGCTA TCCCTTTCGATGCAACAATCAATGGAGGCGACAAATATTGAAGGGATAAA GCTGGGACCCACATGTCCCTCGATACACTGGCTGATGTTTGCGGATGATC TAATTGTTTGCGGCTCGGTAACTAATGACGATGCAAAAAACATTGCCCAG GTACTTAAACATTTCTACAAACTCTCGGGGCAAACTCCGAATTGGTTTAA ATCTGCTATCCTGTTTAGTAAAAATACAAATCCTTTGGCTACTGCTGCAA TTAAAAGTCTTTTTCCTGTTGATAATATGAATTCCTCCATCGTTCACCTT GGCCACCCTCTCATTCTGACTGGGAGGAATAGAGCATCCGCTTATGTTTT TTTAGTTGACAGGTTTAAGACAAAGCTTACTTGTTATAAGGCAAAAAAAA ACTTTCTCATGCTGCTAGGCTTGCCTTAATCAAGTCGGTATTTGCCTCTA TTCATGTTTACTACATGTCTAGCATTTTGCTTAGCAAAAAAATTCTTTCC AAGCTTACAGCTATTGTTCGAAAGTTTTGGTGGACTGGTATTCAGCATGA TAATGCTTCCAAACCGCTTTGCTTTAGAGCTTGACATGACATCTGCCAGC CTATCAAGGAAGGCGGGCTAGGAATTAGGGATCTGTTCACTATGAATAAA GCTTTGGTAGCTATGTCTATTTGGAGGATTCTTAAAGAGTCCGACTCTCT TTTAGCGCGTGCGCTAAAATCAAAGTACTTCCCTAGCAGTAACATTTGGA GAGCTAACTCTTCTATTCCTAAATCTGCATTTTGGTCTTCAGTTCTTAAT ATTTTGCCGCAGATGGAAAACTCATGTCACCTACAAATTGCAAAAGGCAA TTCTAGCATTTGGTCATCTCCATGGTGTCAAGACTGGAAGGAAATTTATG ATCATCTTATCACAGATACATGCATAGACTGTCCAAGCATAGTCAGTGAT CTTTGGCAACAAAATACTAAAGGATGGGATAGCAATAAACTGTCTTTACA CTTTGATAATCATATGAAAACAAAAATATTGCAGGTCCCGATCATCAATG CTGAGTTTCAGGACGAGCTTTGTTGGAGGCATACAACAAATGGTGATTGC ACTACCAAGAGTGCATATAAGGTTTTTTTACAGGACCAAATTTGAGCTCA GGGGTTGCTCTTGGCAGTTCGGGTGGTGCAGCTGATGGAATGGCGAAGGG TTTGCTTCCTCTCAGATAGCAAGACTCTTGTTGATGCTTTAGCTATAGAT GATCTGCTCTCGAGGTCGAGTCACTGGGCGCTCAGACCGCTTCTTGCCGA TGTGCAGAATCACAGGAATGCAAATGAAGACCTGGTACAGAAGGTACCTC GCGCTGACAACAAGACGGCGCACGCGCTGGGAAAGCGCGTCTATCGGGAT CGTTCTGATCCCCGCACGACGTTCAGGTGTAGATCGAACTTGCTTTTCCC CTCCCACTGTGCCTCTAGAAACAGGCTTTGTAATATTAGGTTCAAGAACA TTAGGTTGGAGGTTGTACACTGCCTTGGTTGTAGCTCTAGCCTACGTTCT GGTAGGCATCAGGCACTGGGTTGCCTTGCTATGTGAAATAAAGGAGATAG CTTGCCAAAAAAAACGAGCCTGCTCCTCTCAAACAAAAAAAAAGACTAAC GAGCCTGCTTTCTTTCCCAATTTCTATTTCTTGCCGGGACTCCCTTTTGT CTTTCACGGTGCTCACTCGTTTGGCGCATTGGATCTGTATCGTTTGTCCC GGACGAAGCGGCGTATCAGTCCAAGGAAACGGCAGCCCTTTAACTTTTTT TCTCCCCCAACTGTTCAAAATCATCCACCGAGCTCGAGCTCGCGAGCTCA TCCCCATTCTCCTTCTCCTCCACGGCTCCGCCTGATTTCACTCCGACGAG CGTTCGACGAATGACATAGCCGGTAGGGAGAAGCGAAGGAGGAGCGTCGA CAGCGTGGACCAGCGGATTTACTCGTCTGAGGCAGGGGTGCTTCGGGTGG AGAGGGTTACTTGCGACCCTGCGGTTGGAGAGGTAGTGCTGTGTGGGGGG GAGGGGAGGTGGCGTTGTGGGTGGAGAGTTGCCGGTGAAGGTGAATCGGC GACGGGCCACCGCGGATTTAACCTGCTCACGGCTGTTTTGTCTCGTGCTC GCAAGCCTTGGTGAATTTTTGAGGATTTTGGTGGTGATTTCACTGGTGAG TTCTTCGATTTTTTGCTGTCATCGCTCATCCTGTTTTGCTGTTTAGAAGC TTGTGATATCTCTCAACACGTGGTCCTTAATTTTAGTCACATCGATGGTG GTTGTAGTCACGGTGGTGTTTTGCGGGCAAGCGGTGGTGGCCTTTTGTCG AGGAAGAGCCTGATGAAGTGTCGGAGCCACCGTCTCGGTGCCATGGAGGG TGATGGGTCGATACCCGGTGCAATACTGGTTTTGGAGCCATCGGTGCTTA GAAGTGTCGGAGCTTGATGACGTTTTGGAGCCACCGTCTGATCTCAGCCT CATACAGTAGTTATACCCGGTGTACTATTATTGGGGATGATCTCAGCCTC ATACCCCAGTGGTGCTAATCCCAGCCTAGTTCGTTTAGAACATACAATAG GATTTTCATGGTGTAAACCATTTTTTAGCATAAAGTGGGTGGTCCTAATT AATATGTAGCATGTATTTTTACCCAATTTTTTGGCCACGGTGGTGCTTCC CTATTGTGCTCCTTTAGTAGTCGGTGCCTTTTACCGGTAATACAATACTG TGATACTCGTCTAGTAGTCTTAGGTTTGTTCATATGGTTCAGTTAACCTT TTCCATGAGACAAGTGTCCTTAGTGAATTCTCTAGTAGTCATCAGGCTCA GTATGCAAGCATCCCATGTAGTTTTGGCTCAAAATAGGTACACATGCAAA CCCTCGGTAACTTTTCAATGAAAAACAGCGACCACATTATGCTAGGATTG GCTGTTTTTTCCTCAAACAACATCTAGTTATCATAATTATAGGATATAAT TTTCTCTAATTAATACAAGCTATGTTCATACCGTTGCACAAATAGGATGT ATTTTTTTTACCCTTTTTACATTTGCTAGTTAGTGCTAGTCAGTTCTTAA ATATGATTTTTGTTAGCATATAAATGAACATGTGTAGCATGTAAATATTC TACTAGCCAGCAGGCTCAATATGCAAGCATCCCATGTAGTTTTGGCTCAA AATAGGTACACATGCAAACCCGGCAACTTTTCGATGGAAAACAGCAGCCA CATTATGTTAGGTTGGTTTTTTTTTCTCAAACAACATCTAGTTATCATAA TTATCAAATATAAATTTTCTCTAATTAATACAGGCTATGTTCGTACCGTC GCACAAATAGGAAGTATTTTTTTTACCCTTTTTACATTTGTTGGTCAATA CTAGTCAGTTCTCAAATATGATTTTTGTTAGCATATAAATGAACGTGTGT AGCATGTAAATGTTCTGGGCATAGACTATGAAATCCATAGGCATATTTGT TAGAACTGTCACAAAATAGGACTGTGAAATTAATAGGCATGTTTGTTAGC AACTTAGCATGTAAATGTTTTTGGGCATGGAGTGTGAAAATCCTGCTAAT ATAAAGTAGAGCTCATAAAGTAGTCAAGGTGGTGCTTTTGTTCAGTACTG ATGGTGGTTTACCATGTGTTTTATCATGTGTGATTTTTTGTTCAGTAGAG CTAATATGTTTTTTATCATGTGTTCAGTACATGGGAAAGGGCCACGGAGA CCACTTTCTTTTTTTTCGACAATAAATACATGTTGTTTATTACTCTTATA TCAAAAAGTTTTAGGCATGGGATGTAATATTTTGACAATAAATACATGCT CATAACATTTTATTTGATAGGACTGTTTAACATATGCTAATTATGGATGT ACAAAAAGCTAAAAATCAGTACTGTTATTTAGTATCTACTAGTATCACGA TGTAATACTAGTGATTTTTACACTTTTTTGTTTTTTGCAGATTTATAATT TCCATAGTCTATCTGAAGCAAATCTTCTTTTTTCTTATCATAAGATGATT CCTGCTGTAGCTATGGTATGACCATTTTTTGCGCTTATATACTTGTATGC TTTTTTAATTTCCTCTATGTTTTCATTGTAGAGACTAATAGTTTCTTTTG TTTCTGCAGAAACTCTCTCGCACACAAAGGAGTGTCGCCGGGTCTAGAAA CTCAAAATCAAGAAGGATGAAGCACATGTTGCAGTACAAAGTGAAGATTA CTAAAGGGGAGCATATAGAGCCACCTCAAGAAGATGTTGAGCCTCTCTCA ATGGAGCCACCTGCAAATGAATATGGTCGAGCCGCAGATGATGACCATGG GGAAGAAGCCTGCATTGTGCAAGGCCAAGGACCATCCAGGAAGAATAAAA ATCGGGTACTAAACAACCACTTATTCTTTGTTCTACTTTTTTATTTTACC CTCTTTTTTTAGCTTTTTAGTTCTGACATTTTCTAGTTCCTTCTTTGTAT GTTCTCTTCAGAGCAATCTATTCAACCGTTCATCCCCAATAAAGATTGTC AAGGTTTGCAAAGCAATGACTGATGAACATCGGATTGTTATAAGCAAAGC AGACTTCGGAGGCATGCTAGGCATGAAGGTGTCCAAGCTTATCCCTGAGA TGTGCAGATATTTGATGGGATGTTTCAATTCAAAAACGTGCGAGCTAGAT TTTAGGGACAAGGGAAAGATACCCATAACAGTTGAGTCTGTTGTTAGGGT TATGGAGTACTCGGGGGCGGCACTCTAGTTCCGTACCATCTAGACATCAA TGACATCAGACTGATGTTGGAGATGTTTGGAATTCACAATGGGAAGCAAC CAACAGTTGCATTTGTGGAGAAGTTGCTAGGTCCCACCTACCCTGCTAAT CCGGAGTACTTGAGGAAGTTTGTTATTTACAGTGTGTCCTCGGTTTTTGC CCCAACCACAGGGACTCTTGTCAGCCCTAGATGCTAGCCAGCTGTTGTCA ACGCAGATGCAATCCATTATCTCAATTGGGCCAGGTCATAGTTGATGTTC TAATCCAGACAACAAGTGCAAAAGATAACAAGAATTGGTTTAAATCTTGC ATGCCATATCCCATGGTGTGTTTTTCTTAAATTTTTACTTCTTTTCCCCA AATACATTTTCTCTTACATAGTCTGTAACTATTTTGTTTCAAACTTTTAA TTTTTCACATGCTAGTATTTTTTCTTACATGTTAGTATACAAGTAGGTTT TGTTTTTGGTACGTAGTCTGTAATAAACACATATAGGATGTAATAAACAG AACACATTTTTTCTCTGAATATTTTCGTGTTTAAACTTTTTTAGCATTTC TTTTTCAGAGATGTAATTTTTAGATAATTACTACATGTTTTTTCAATCTG TTTACAATGTGTTTTAAACTCTTACTTTAATTTCTTACATGCTAGTATAT TTCTTTTTACATGCTAGTATATAGGATGTAAAAAAACCACGTTCCTAATA TATTTCTTACATGCTAGTATAGAGGTAGGTTTCAATTTTTCTATGGGTTT TATGACAGTAGGTTTTATAAGGAATCACATTTTTAGGATGTAAAAAACCC CATCACATATATTCGAATATACTCGGATTTATACCTTTTTAGCATTCTTT TTCGGCAGAAAATGTATTTTTTTTAGATAATTACAACATGCTTTTCTCCA ATCTGTTTTACAAATGTGTTTTACACTTCTCAAATTATGTATGTGTTTTT ATACTCTAAAATTTTCCATATAAACCTGTTTTCCTATGTACAAGTATGAC CAGCAGCCACATTATGTTAGGGTTGGCTGTTTTTTTCCTCAAACAACATC TAGTTATCATAATTATATGATGTAAATTTTCTCTAATTAATACAAGCTAT GTTCGTACCATCGCACAAATAGGATGTATTTTTTGACCCTTTTTACATTT ACATCCTATTTGTAAATGTAAATTTTTATACTCTAAACTTTTCCATATAA ACCTGTTTTCCTATGTACAAGTATGACAAATGATGAAAATTTATTTTGGC AGGTTTAATATGTTGACTCACTTGAAACAAATGCATAAAACTTGCCCGAG GACGGACCTCGCATATGCATATGGACAAACAAGATGGTTAGACTTATAGT TGATCTAGATATAAATAGTGATGGCTCATTTGGAAAATTACCGGTAGGTT CCTATATAACCGTGGACTGTTTTTGGAGATTTCAAGCATCTCTTTTTCAT TATTTTATTTTCCTAAATGTTTCCATGATTTTTTTTGCTACAGCTGAAGC AATGTTACAGGATTAGGTTGTCTCTGTTCTCAGTTGAGCCTTCTGATGTG GACATGTTCATCAAACGCCATGTCATGGGAGATCACAACGATGAGGTAAA TGTCTTTTTTTAAAACAGATGGTAAATCATATCAGTTCCATTCTCTTCAT AATATTAAACTGATTTTTCCTAACTTAGTCTCCATCTGTATATATACTAC ACAGGACATGGCAAAATATAGGAGAGCTGTAATCGACATGTGCAATGTTT TTGAAGATGGGCTAGCGCAGTTTCTTAAATTGTCAAACAAAGACCACGAG GGTCTTAGACCAGAGCAGACACAAAAATTTGTGGAGCAGGTGCAACAAGT TGTGCACCAGCCAAAACGTAGAATGCGCATACGCCGCCAAGGCTCGGAGC AGTCGCAGCAAGATGTGCAGCCGCTTAAAGAGGACAACTTGTAGGGAGCA AATGAAGATGGCCAGCTGTTGGAGAGAAGAGTTGTGGCAAAAATGAAGTG ATGGCAACATCAGCGCCTGAGAATGAGTTCATGAAGGAATGTGAAGAACA AGGCATGGAAGAAGGGAAGGCTTGCAGGGGTGAAACAATGTTGACGGGTG GAGAAAAGGAGTCTGAGTTGGCACATTTGCCAGATGTAGTCAGGAGCAGC ACTCCAATGCATTCAGGAGACAAGAGACTTAGTTCTGAAATGGGCCGGAT TGTGAGTTTCAAGGAAGATCCGTTGGAGTTACTAAAAGCATCCGGATCTG GATTGCGGTCTAGCACATCCATTGGAGTTACACCCATGGAAACTATGTCG CTGCCTTCCCCACCACTTCATGCACCTTCCACTTTGAAGCAACAAACTGA AGGACCATTAGTGAAAAAAAAGAAAAAGTGTAGCATTTGTACAACAAGAA AAGGAACCTGGACAAGTAGACATAAGTGAATGCATGGAGCGCAATAGCAG TCCTTGTGCTGAAGTGAAAGCAGCCCCTGTTGACCTTCTAAAAACTCAGA ATTTGGGAGGGAGTCCAATTGGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.