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GrainGenes Sequence Report: AA022178

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Sequence
AA022178
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA022178
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TTCCTGGATTTTGATGAACATCCGATTGCTGCTGCATCAATTGCTCAGGT
TCATCGAGGTCGGTTGAATAATAATCAGGAAGTGGCTGTAAAGGTTAGAT
TACTGTTAACACTGGACCTCTTTCTTGTTCTCTTTTGCTTTTGTTTGGAC
TTTCTGTTTTAGGTCATGTGCAGTGTATTTTCCTTTCAATTGAAGCTGTG
TGTAATGACCTGTGGTCTATATGAAATACCATTCATGTGAACAGGTGAAG
TATGTCCAGAAAGACATCATCACGCTGTACGCTCATAGGTTCAGGAGTAA
TAAGTAGAGAGATTCCATTTGTGCAGCATACAACTATAGAGTTCTAGCTT
GCGACCTGCATAAGTTTATGTCCACCATCAGTTTTCTACCTTGCAGAGGG
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ACAGCTTCTCACTTTCCCCAGGAAGTGCCAGTTTCATATTGTAGTCGTTT
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TCTCTTGTCAAAGTCTGTCTCTTTGGTAAGTTACGCTTATCATTACGCAT
TTTCCATAGATTCTGGCAAAGATAATATTTCCCTACTTGGAGCCCAACGT
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AGCTAATGATGTCCCACTGACCACATTTCCTTGAGCATAGTAATTCAACT
GCTGGCTTTGTTGCTGGCTTTGTTAACAGTCAAGGTTGTTGCTGAAATGC
AACCTTTGTTAAAGTACTGCTCACTGTAGCTATATTCTTGTAATGAAAAG
AGACTTAACATAGTTGGCACTCCCACTAAGTCCTTGATTTGTGTTGACTA
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AAAGTGACCAAATATATTGTTCAATCGAAAGCAAGTCATTGCTTTTAACT
TATTAGCTTGACTTTTGTATGCATTTGGTATTCTTGACCCGTTTAGCTTT
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AGTTTTACAAACCTCCTAGGAGGCTCTACTCGGCAAAAACTGAAAAATAC
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GTGCCCAAAGGGCGGCTTCCTCTTTGATTTTGGTCATCAGGCCGCTGACA
GATGGCCTAGCGTGATTGAAGACGCAGGCGTTTCTGTGCTTCCAGATCAT
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TTGCCGCGAGAAAGGACAGGCCAGGGTGAGATGGCTCATCGTCTCGGGCA
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AGTCGCTCTGTGGTCCAACATCTATCGAGATCATCTAACCAATGGAAGAA
TTTGACGCGAGGGGGCGCCCAAGATCTCCAGCAGCTTCCACGACTTGGAC
TCGAAGGATCCCATGAACGTGGCCTTGTACCAGGACTGTGCTGTGTACAC
GCCGTTCACTGTCCATCAGATTATGCGGTGGCGCTCATTGGTGAGCGTCG
TCTTCGAGATAGCTTGCCACAGGCATAGGTACTGCCTTACCTCGTGGACG
CCCAGGACACCATGGATGTCCCTGGCCCAGCTGTTAGCGTTGAGGCCATC
AGCAACCTTTCTGCTCTTACGCCTGCGCTTGGGGATGCACTCGTAGAGCT
GCGGCGCGATCTTGTGGACCGCCAGGACACCAATTCACCGATATTCCCAG
AATAGTGCAGCCAGAGGAGCTTGGTGAAGACCTTGGCGATCATATGAACG
AGGCTGATGGGCTGGTGGTCGCCGAGCATGCTCGCGTTAGCGCGTTTCGG
CAACAACGTGAGCAAGGCCTGGTTCAACTGGTGGAAGCCCCTGCCGCGGA
GCTCAAACAAGCGGTGGAACACGTCCACCACGTCTTGTCTGACCGTGCTC
CAACATGCACGAAGGAATTCAACTGTGAATCTATCGGGACCAGGTGCCTT
GTGCGCCGGCATCCCCTTGATGGCACCCCAAATCTCATCAAGGGAGAAGG
GGACCTCAAGATCCGCGAGGACAGCATCAGGGGTGCTGAGGTGAGCTAGG
TTCAGCGTGTGGTCACGCTCTGCAGCCTTCCCTAGCAGCTTGTCAAAGTG
GGTGATCACCGTTGAAAGATCGGTATAAGCGACTAGAGGGGAGGTGAATA
GGCGCTACTCAATTTTTATTTTCTTTTTCAATTTAAGTCTTGACACAAAG
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CAAACAACAAGAGTAATAAGGAGTAAAGGATAGAAGTCACTGAGAGAAGA
CACGGAGATGTTTTCCCGAAGTTCCTTCCTTTTGAAGGGAAGTACGTCTC
CGTTGGAGGGGTGGTGGTACTAATAAGACCACCAGTGCCACGAAAGGCCT
CACCCTATTCTCCAGCGCACCCGCCTCGCGGCATGCACACGATCCACTAT
ACGGTGGCCTTCAAGGTGGCGACCAAAACCTTGTACAAAACCTTGGGGCA
CTTCTCCACAACTGAATTGGAGGTTCCCAAGACGACCTCGAAGCTCTTAC
ACACGAGGATGAGCTATGGAGGGCGACTTCTTCAAGTTAGGGTTTCCTCA
AACCCTAGGGCAACGAAAACTTACACAAATGGTGGGGTAACACAAATCCC
TTTGGTGGAAAGCTAGGTCTAGGTCTTCTCCCTTGATTCCCCAAGGGGCA
TCAAGTTCTAGTGGCTAGGGAGGGAGAACTAGGAGGTTTAAGCATGGCAA
CAATTGAGGAGAGTGTAGAAGCCGGCAACCTTCACTTGGGGAAGAAGGGG
GGGGGGGGTATAAATAGCCCTCCTAAAAATAGAGCCGTTGCAGAATCACT
AACACCGGAGTCTCCAGGGTCCAGGGCCGGAGTCTCCAGGGTGAGGGCAG
GACTCCGGGCCAATCTCCGGGGGGTGAACTGGGAGCAAAATCGAGGCCCC
TGGAGACTGGGCCGGAGACTTGGCCGGAGTCTCCGGGGTGGGGCCAGACT
CTGGGCCATCTTCCGAGGTACCATACAGAGACTTCCCTAGGGAGGGCCGG
AGACAAGGCCGAAGTTCCGGTCAGGCACACCGGAGTCTTCGGTCCAGGAC
CCCGGAGTCTTCGGTCCAGGACCCCGGAGTCTCCGGACCTAGGGGATGCA
GCAGTTCCATCTTCCAAACCAGGTGACCCTTCTTGATGAAATTTTAAACC
CTTCTCCATTGCTAGGAAGAACACCGTCTCGTGCTATGACACTGATAAAA
CCTTCAATATACATAGCACACGGTAAAAACTTACTTGTGTTGACAACAAA
CACCAAAACATCATTAAGGAAGGAAATGCCCTTTCAACCATATCACCAAT
CGAGATGGCGTATATCCTGTTCTTCTACCGTCGATGAGTGCACTGCTGGT
GAAAGAATGAAGTATTGGCGTCGCCGTCCTTGAGTGCGACGATGCAGCCG
CGCTGGCACGCGATAGTGCGCTCTAGGGATGCAAGGCCTAGGTAGGAAAC
CTTGAGACTCTTGTGCAACAGGAACTCGTGCGGCGATAGCTGCCTATCCG
CTTGTGCGCGATCGAATCTCAGGATCAAATCTTTGGCAATGGCGAGCTTT
AGGCACACGCTGCCGACCTTGGAGGCACTCCAGCTCGTGAGCTTGCATGT
CGTGGCTCGTAGGCGAAGCGCGAGCCAATGGAACGGGTCGACGTCGTCGA
TAGAGTGCCAGGCCTCCGTAACGGTGTCATGGAAGCCATCTAACCGCAGC
CAGAATTCCTCAAACCGAAACCGGCGGTGCGTGGAGGGAGGGCTACCGGC
GAGGAGTCGATGGCGGCGGGGCTAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG
AGGACAACGGCGGGGCTAGGGGGGAGGGCTACCGGCGGCGGGGCTAGAGG
TGGGGGTTGGGAGCACATCCATCCTGCTCTTCTGTTTAATTCAAGTTAAA
TTTAATCTTGAGATATAACAAAGTTTTGAACTTCTTTGAAATACTTTATT
TGTGTCTGTTGGTGAAGGGGAAAATTTGAGCCTTTCTTTTGGCAGATCTT
TCCTGATTATAGGTTTGAGAAGATATTACTTGAATTTGAGAGAAGCATGT
CAATGGAACTGGGTAAGTGCTTGAACATTTCCTCTGTCACAGTATTTTTG
TGTTATTTAATATGATATCTGTTTAAATCAATTTCTTTGTTGTTCTGTCG
AGGCCCCTGCTGTAGAACCCTCAAAATGTTGCATTTATTAAAGATAGCTA
TACTGTTGTCGATCCGTCATTTCTCACTCTTAGTGAATCAAAGAACAGAA
GTCTTGTGTATGTATAAATGGGCCTACACACATAAAAAAGGAAAACAGTC
ATGGTATATAACATGAGCTACATTGGTTAACTTCTTTGTAGGCTTCCTTT
CAGTTCTATAACTAATACTTCCTCCGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGC
TTTGTGAAGCAAATGTATCTAGACTACTTTTAGTATATAGGTTCACTCAT
GTTTGTAGTGAATCTACACACTAAAACAAGTCTAGATACATTCTCTTCAC
AAAACTAAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTACATGATAGGTGA
GAAGCTCCTCATCCCCCGCATAATTCCCCATACTTTTCACATGCATCCAG
TTTTGGTTTATCTGGGACCTTGTACCTTATAGAAATTACAGCACAGGTGT
TGTTGCTTTGCAGATTTTACCGAAGAGGCTAGTAATTCCGAGAGAACAGC
AAGCTGCTTCAGAAAAAATAATGTTGTCAAAGTACCTCGTGTATTTAGGG
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GGTGGAGGCACATAAAGATGCACTTATGCAAGTAGCTCTGTAGTCTATTG
CTGACACAAAGCCCAGCGAGATGTTAACTTGCTGCTCATAAGATGCTGAC
TGTTTAGGTTTACATATAGCAGCTTTTGACTAGTTAAAGCTATTGCAGGA
ACTGACAACCAAGGAGGTATTGACAATGGAATTTTTTTATGGTCACAAGG
TAAATGATTACTCCTTGTGGACTGCTTGGAATAGGTGTAAAATTAGGGTG
GCGAATTTTGAATTAATACCAACACCACACTAAATTACACCCATTCTAAG
TGGGGCCTTGATCATATTTTACAAACTGTTTTGGGGCTGCATTTACGAAT
CAGTTGGATCTCGTCCATTACCCACAAATAATCCTTGAACTGCATTGAAT
ATATGGAGAAGCGAAAATGGGCGATTCAGTCCAGAGATAAGAAAAGTAGG
AGAGCATTAGCTCTAGTCGATGGAATATCTGAGTTGCTAACTATTGATGC
AGGAGTACACTGACATAACCTCTCTTGTTACTATTGTGTACAGGTTGATG
ACTTGGATTTTCTAAGGAAAGCAGATATCAGCCCTGCCAAGGTTATTCTT
TTGAGATGCATGCTAATATGAAATGTATTTATTTGTCCGAGTGATCATCT
TTTTTACGCACATGCATGTTATTGATTTAAAAATGACTAAAAGCAATTGT
GAGACACACGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAAC
AGCAGCAGCATGAGCAGCAGCAGCAGCAGTAGCAGCATGCAGCATGCAGC
ATGCCGCATGCCGCATGCCGCATGCCGCATGCCGCATGCTGCCAGCAGCA
GCAACAGCAACAGCAACAGCAAAGTGCCCTGGACCCATTTCGATAGTTCT
GTATCATTATGTTTGTTTGCTACAACTTGGGTACTACTGTTTAACGTCTT
ACCCACTACATGGCGATTGCTCGACATAGAAAGTAATATGTATTTTTGTT
CTTTAGTCCATGTCTTGCAGCAGGAAACTGGGTGCCCATTTATATTATTG
TATCTATGTATAATTGACACTTATTAATGGCTTACAAGATTCACTATTAA
AGAATTATGAAATCAAGGTTACATTTTTGTAAGGATGCAGAATAATGGTT
CTCATTACTATTCTCTCGAAATAAATGGTTCTTCTACTTGGGTCATATAT
TTCTTACCGCTTCACATTCATCTATTCGTCTCATTGCACATAATATAATC
ACTGACCTGCTATTTTGTGTGTAAGTGTTTTCTTACGACTGTATGTCCCT
CCAGGTAGCTAAAGCATTAATCGAACTGTTTGGTGAAATGATATTTGTAC
ATGGTTTTGTTCATGGTGATCCTCATCCTGGAAACATATTGGTTTCTCCT
CAAGGCCAAGGGAAATTTTCATTAGGTGTTCCTTTTGCTTCATAACATGA
TATTTTCTGCATGTTTGTATTCATTATATCATACGCGCCGAGTTTAGTAA
TGTATGTCTTGCAAGCATTATGTTAAGAAGCACATGTATTAGAAAGTAAA
TACTTCATAGTTTAAATTATTGGATCCGTATTCAGCTCTTCCTATCTGAC
AGATTGAACTTGTCCTTGTTTTGAATCGATTATATCGTGCATTCCTTTTA
CAGTGTTGTTGGATCATGGAATTTATAAAGAATTGGACCCAAAGTTTAGA
CTAGACTACTGTAAGCTTTGGAGAGCATTGATACTGTTGGATACGCAAAA
AATTCTGGAGTTAGGTGAACAGTTTGGTGTTGGCAAATATGCGAAGTACT
TTCCTTTAATATTCACTGGAAGGACTATAGACAGGTAAACCATTTTTTCA
CTTCGACTATAATGCTCATATGTCGTGATGTTCTGTGGATTTCTCTTATC
ATGTGGCAAAGAACGTCAGTGAACTTAATTTTGAACTTTAACAAGGACAT
GCTTACAATAAACTACTTTTACCAAGCGACCCGATGTATATCCATACTCT
CGACAATTCTGTGTTGTACATATATCCATACTCGTTAAGTTTGGAATTAT
AAATTGGATAAATGACTGCATAAAAAGCAAGGGAAAGGCTGCCTAGAAAT
TCCCTTCCCCAGGCCCCACAATGTGTGGGAGCTTTCAGCACCGGTTATGC
CTTTTTAAGGTGCTGCATGCGAAAACATTAAGTTTTTTTTACATCTCCAT
GCATTAAGTAAAGCCAGATTGTTTTAACTTTAAAATGAGCGCTGGTTCAT
ATTGTTTGTACATGTCCCTTAGTATTTATTCTATACCATTACTTTTATTA
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ACCAGTGATAACCAAGTTTAGCTTGCAGGAGTAAACTAGATACTAAAGCA
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TTATGGGCTAGGCTCTGACGGGCCATAAGTTACTTCCTGATTAAAACTGC
ATATATAATTCATGTGTAACTGTTGTAACTTGTAATGTTCATCAGCAAAT
CAGCTCTTGGAACACAAATATCTGGTGAAGAGAAAATGCGTGTAAAGCAG
GACTTGAGCTCTCTTGGAATGGATGATATATCTTCATTTATGGAATCCTT
GCCACCTGATTTTCTGGTGATACTTCGAACAGAGTAAGGAAAATCTTGGT
AGAGTCCATAACCTGCTATTACTTTCTCGCACTCATTATTGTTGTTTGCC
ATGTTTATTTGTTTTCTCAATTCAGTGGATTATTGAGGTCCATTTTAGGA
AATCTAGGGGCGCCACGTCATGTTCGACTTCTTGCTTATGCGAAGTGTGC
CATATACGGCCTTGAGGAACAGTCTAGATTGGAGTCTGGTACGTCTTAAC
CAACTTCATATGCTTCTCAAAAGTAGTTTAAATCTTTTCGGATCCTGCCA
ACATCCTAGTTAATCTAATAGTCTGATTTCCCTAATATAGGTGCAATCAA
CCGTATGTCTCTGCGAATCAAAACAAACATTAGCTATCTCCTTCTGAGGA
TAGTTATTGGTAGTACAGCACCTCCACCTACCCTACTTATGCTTGTTCCC
AGTTTGTCTCATACTCCCTCTGTTCAAAATATAAGATGTTTTAGCTTTGT
AAAATAAATGTATCTTGACTTATTTTAACGTGTAGGTTCGGAGTGAACCT
CTATGAACCTACACACTAAAATTAGGCTAGATACATCTCCTTCACAAAGC
TAAAACATCTTATATTATAAAACGGAGGGAGTACATGCTAACCTGGAAAA
TCCCATTTTCAGAATTAGCGGGGTTATTGGTGCAATTCAACGACTGCAAG
CATAAGGTCATGAACAAATTGAGGTGGATGCTCCAGAAGATAAGTTTGGG
ATGGTACAGACCTATGATGTGATGTCCTACAGTTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.