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GrainGenes Sequence Report: AA001534

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Sequence
AA001534
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA001534
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGTCCATGGGCCGGCAGCAGCCGTCATTTCGGCCTGGCCATCTGCCGTCC
CTCTGCTTCCAGTCTTCCACCATTCCACCGTTCCGCCGCCCCCCAAAGTC
CCAAGTCGCCGTCCTCCCGACCCCTCCACCCCCTCTGTTCGACGGCAACA
TCCTCGTCGGCGGCAGGGTCTGTGAGCAATGGCGCCGCCAGGGTCGCGCC
GATGGGCGTACGTGCGGATCATGGCCGGCACCATCCTCGGCGGCGGCCTC
GGCTTCTACGTCATGCACCGCATGGAGACCTCCTACAAGGTACGCCGGAT
CCCGCAATTCCCGTCCCCCTTCCCGCCTATCCACCGCGATTCGTAAGAGC
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GGCGAAGATGGAGGAGAGGCTGCAGAGGTACGAGGCGCACATGCTCGCCA
AGGCAAAGGAGGCGCAGCAACTGCAAGACGAGGGGCCGCGCGAGGACCAG
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ATACATTTAAGAACACATTTCCAATAAGATGCAGTAGTATATATATTTCA
TGTATGCCATTAGTTCATTTGAAAGAGTGGGCTGGTAATTAAGTAGATGG
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TTTAGCTTATTGAGTCATGTGTTGTATGTTCATGCAAAAGAGGGGCCCTG
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AAGCACCCTTGTTTTTTCCCAAAATGTAAGGCGCCTAAGATGATTTTCGT
TGCTTCCCTTTTTTCCCTCGCACGCATGCAGCCGAAGCGCCATCTCTGCT
CAGCAAATTCCATTTGGTGCCAGCAGCCCACGATATGATACGGACAAATT
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AAATCCAAAAGAGAACTCACATCACATCTCCATGGCGAGCGAGGAAGGGC
CCATAGACCAACTCAACGCGCCTAGACGATGAAGAGCTGGCGCAGTACAT
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GACAATCAAATAGTCGAACAATGAGTAGGCATTGCTTGATTAGACTCAAG
TGACTAGACTACTGCTCACGGATGATAGCAAGGAATAGTTAATTAGTGGA
GTAGCTAGGAGTAGCTCGAGTGATTGGTCAGTAAAAGAGCACAAAATTCA
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ATTCGATGCATACAATATAAATAAAAAGGCAATGTAGCGAAACATAGAAA
TTCTCCACTAGGTTTACGTTACACGTTCACAAGCACAAGAGCTTCTTTGA
CCATATCTAGATCACACTGTAGTCTCTCATAGAATACTCCATTTCTCTCA
AGAGCCTGTTTCATGTGTGGAATGGAATAATGATGGCTTCCTCTCTCTTT
CATGATTTGCGTCATGCATCAAACTGTGATGCGTGAGAAAAATACGATTG
GACCTTTCCACTGGATATTGGTGAAAATCTTCATCGACTTTGGCAATAAT
TTCGTCTATGTTTCTTGGGGGTGATTTCTAAAACATGGCTTGAATATATG
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GTTCACAATCCTCAGCATGCTTGAACATGGTCTTGCCAGTAATAAAACAG
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TGCCAAAACACATATTGACGTCAATTATGCAATGCTTAAACAAGCGACAA
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ATCATCCCTGAGAAAAATAGACAAAGTTATTGTCAAAGTCAATGAAGCTT
TTCAGCAATATCCAGTGTAAAGGTCCAATCGTATTTTTCTCGCACATCAA
TCATGCATGCAAATCATGATAGAGGAATGCATCATTATTCCATTCCACAC
ATGAAGAAGCAAGCTCTTCATAGAAATGGAGCACATCTTGAGAAACTACA
GTGCTATCTAGAAGCTCATGTGTTTGTGAACGTGTGACATAAGCCTACTA
GATAATTTCTATGTTTTGCTACATCGTCTTTTTCTTTATATTGTATGTTT
TGATGTTATGTTCAAAATTTCTTATGTTTGTTAACCCAACGGTACTCTGA
ATTTCTTTATTTTACTCTCTTGGGAATTTTGTGTTCTTTTACCGATCAAT
CATTTCGGCTACTTCTAGTTACTCCACCGATGAACCACTCCTTGCCAGCA
TTCGTAAAAAAAAGGAACAACCGCAGTAGTCTAGTTCGCTCGTGTGTAAT
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CACATACTCACTGTTTGACTATTCGATGTCACTATTCATGAAACAAATAC
TCACTGTTTGACTATTCGATGTCACTATTCATGAACCAATGAAACATAAA
TGGTTAAGGACAGTAGGTTAGCAGCAAAAAGACTCAAGAGGAATACCACA
ACGTTTTTACATACGACTCTTTCTGTTTCCGCAATATTTCCTGCTGCGAC
TCGCATCCATTTACAGTTAATAGTCTGGCATGCCGGAGATCTGCCGTTGG
AGTTTATATTTGTCTTTTAGAACAAGTGTTCTGGAATGATCTGCCATGTT
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ACATTCAGCTGAATTCTGACTGACTTACTATTTCGTTCATGTCTATTTGC
AGAACATAATCTAGCGGCACACAGCGTCGAGACCGCTTCCCCGGAAGTAT
CTGCCATGTACTACTTCCGGCATCTGTGCTCGTTTTGTGAACATGAGAAG
TTCATCTTTTTTTTTTGTGTGTGTAGAGAATGAGGGTGCATCAGTTGAAA
CTTGTGGTTAACTGCAAGTGAACACTATAAGGTTCGGATCAGCTCTGTGA
AAAATAGAACTTGTAATTGCATGAGTAGTCTTCCTTGACAATTTCCGCCT
AATGCTTCACGCTCTCCGAACAGGAAGAAATCTGTATTTTCCTCTAGTAA
GGTTGCTAGTGGTTCATTGGTCGCTACAAATTGTAAAATTGATGTTACCA
AGATAATAAATACTAGTACTTTCTTTATTTTTCATGCCATTGCCCGTTCA
GGCCTTGTTCGTTTAATCCACCTGTCTAGTGGATTGAAGTGTTTTGGAGG
GGATTGAAGTGGATTTTGACTTAGATGGGATTAATTCCCTTTCAATCCAT
GCCAATCCCGTTGAAATCCAAGGTAACCGAACAAAGCCTCATAGTTTTTC
ATAAAGGAAAATCGCACCAGAACACTTTGCTTGCTGTATAAATTCGAGGC
CAGGGGATTCTCCTCACCGGAGAAGATGGCGGTCAGAGGGATGGCCGGTG
TGGCGGTAGGACGGCGAGGTGACACGGCCCTGGGAGAGGGAGACGTCCGG
TCAGTCTGCGTCGGAGCCTTGTAGGAGGCCGAAGAAAAGAAGCCGTTGGA
TTGAGATCCGACGGTGGTCTGCGTTTTTCGACTTCTCTCCCTACCCAAAG
GAGAAAAGGGAAAAATTATCAGGCCGAGATCCAGGTTTGTAACCGGTGGC
CGTGACCGAAGCCCAGCGAACCTACCCGGCACCGGCAAGCTACGTCGTCC
GGTCGTCCGTCCCTCTCTTCCAAACCGCCGACTCGCCGAGGCCCCAATTT
TCGCCGGCACTCGACGTCGCAACGCGCCCCAGTCCACCGGAAGCGCGGCG
CCAGCCACCTCGAACCCCTCTGCTGGGTTGGCGCGGAGTGGAGATCGAGG
TCCAGCCGGACTGATCTTCTCCGTCGGTAAGCCCGTCCTTTCTTCCTCTG
ATTGATGCATCGATTTTCATGATCGGCTCTGTTCACGTCCTAGCCGCGAG
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CCCGAGGCAGCAGCCCTTGCCACGGAGGAGCAGATCCAGCATCTCCGTCG
ACCTGCCCACGGGCTGCTCTCAGATCTGGAGCTGCCCCGACGTGGCAGAT
TCCACATGTCTGGCGTGCAATCTTGCAATACACGCTGCCGGGATTGTAGT
TCAATTGCTGAGAGCAACTGCCCTGTCATGGTGCGTTGAGTTCAACCCAT
GATGCCAGCCGCCCCCATTGGTCTGCCACGCTTTGCGGCAGAGCTGGTCA
TGTTGTGTTTGAAGGCATTGTCTAGCCAGGATCTTCGCAACATGATTTGT
GCAGCATAAGGAGAGTACATTTGAACCTATTTTGCGTGATTGCTTGATTA
GTTATGTTCACACCTAAATCACGTGGCTGGCAGGCTGCTCCTTGGCAACT
ATGATGGTTTGTGCTGATTTTTGTGGCAAGTGTATTAGTTAGTGCAAAAA
AAATAGAAACCTGTAGGGCAAACATATACAGCTGATAATCGACTCCAGGA
GAATAAAGAGAAGCTTGTCTATCTAGATTTTTTTTTTGCGTAGGTATGTT
AAGTTTGGGGAAAATTCTCCTGTTTATGGAGAGCATTGTAGATTTGTCCC
AAATTTAGCTGACTTCGATAAAATCCTCTTGAATAAGTTAGTGATTGCAG
TTTGATGATATCAATCTTAAATTTTAGCATCATGAATCTGCAGGTGGACT
GTATCATTGGTTACATTCGAGCTTTAGAAGACAATGTATCTTGTGGGCCT
GTTCGTTCTTGACCATTGTTGAACTGGACAGGGTTACTGGTCTGTTGATA
TGTCACTCAAACTTCCACTTCCGCAAGGGCTCTCATTTTTCAAAGGTGTT
GGGTGGTTCGAGGATAGTAAAGCCGACTTAGCTGCCAAGCAGCAGTTGTC
TCCGAAATTTAAGCTCCAGACAGATAAGGAGGTGTACAGACCTGGTGATT
CAGTTACCGCGACTATAGAAATCTGTAGCCCCGCTAGTTTAAAGGGTGAC
GTGGGAACGGGTGAAGATGTCCCATCTCTCTTGGTAGATGGGCTGTCATT
CGAACTTAAAGGAATTGAGAAGTTGGATAGCCAATGGTTCTCTGTTCCAA
AGCCCTTACCAGGGTCTAAGCAAAGGAGAGGTATATAGTCTGGCTATCTT
ATGTAAATAACTGATCAATGTATCTTTTATTTAATATGTCTGATAAGTGA
TAACCCTCTATGTTGTGATTGATAACATAGGTGAATATTTGTTTTTGGAT
TGTTTGGCGCCATCATTAGTCTCTAATGTAATAATTGCTTCGGGGCAAGC
AAAAACATGTAAGTTATCTCTTGTTCTGGAGGATTAATGGAGGTTTTAAT
ACTGCACTTATGTAATGTTACATTTCTAGATTGCTTGAAACATAAATATT
GTTCATATGCTTTACCTGCATTCTTGCCTAGTAGTGTACAAATGTTGGTG
TGATGCAGTAAATGGATTTTCCTTTACTTCTTGTTCTGCTAACCACCTGT
CTCATCTATCACCTTGTATCTGATCTAAAGTAATAGTTATCGGATCTATC
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TATAGAGTCTGTTACAGAAGGTCATGAGTATGAGGATTTAGGGAGATGAT
ACATGCACGTTCCTCAAATACTTTATGAGGGTAGGTTCCTGTTTAGCCTA
GGATCTTCAGTGGACCAGGGATAATTTTTCTCCTATTAACCTGCTTGCTT
AACTAAACTGTCCTGCCTAGGATCTACACTTTTTCTTACTAGAATTTGTA
ACTCAGCTGAAAATATACCTTCTGCAGATATGGTACGTCTTGAGCTCCCG
AAGATTTTACCACCATCATATCGAGGCATCAGTATTCGCTATATTTATTA
TGTTAGGAGTACATTGTTTGGGAAATTGATTGAGGGCAATGGAGATCAAA
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GCTGACATAAAATTGTGCTCCTTAAGTTCACACATTCTGAGCTGAAATAT
TGGAAGCTTTGATCTGGTAACCGTCAGTAATTTCTATTATTTTCCAATTT
CGAGTGCATGTTTAGTATAAGTGTTAATGGGATCATTTTGGGTCCAATGT
TCTAACTTTCCTAGAAAGAAAATATATTATAAACTAAAGACATTGTTTAA
ATATTAAATTTTAGCATAAGATATGAAAATCAAGTAAATACTGTGTAAAA
TGGGGCGTTGCAGCTCAAGCCTTGGCCAATCACCCCATACAACCTTCTAT
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GGTTTTTAAAGAAACAGTCTTACTGAAGTGTCAAAAACATTTGTCATGAT
GATGTTCTATGCCCAGGGATTTAGGGCATGTGAACGTGTAGACCCAAAAC
CTGACAAAAAGACATCGACTGGTATTAGTTCTTGCTAGACCTAGCCTGTA
GGATCAGAAGAATGCAATGATACATGCCTCCGTTATATTGTGATGGGAGG
CAGCCGCAGGCTTCTGTATATTTGAGCATTATATGGTCCATCTGTTTCCT
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TTTTTCTTATTTCTAGCATCAATGCTCTACTTCATTCCCAGTCTGTAATG
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AGTAGTATGACTATGACTCACACTGAAGCATGCGGGCATACTCACTGAAG
ATATGGGCTTTGCTTGATGTAATATCTGGTGCACATTTTTCTCACACTAA
ATGCAATATATTAAATCTGCAGGGGGGGGCTATCTATTTTTCTCACACTA
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TGCATGTGCACTGTTTTCTCTAGGCCTTAATGAATCATATAGTCTGTATT
GCTACGTCCACTCCTCACAGTTCTTGATGTGATTGTTAGACATATTGATT
CTTTCAAGTTATCATACAGATTCACATCTTTGTGCAGTTGGTATAACTTT
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AAAATACTTATAGCTTTCTATTTTTCATGAAAATCTGCATATATGTCAGG
CTTCTTAAATAATCTAGTGGAGACTGACACCACACTCCTCATTTAATATG
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TAATGCCATTCCCCGATTGTCAGTGTCCGAGATTTCAGACGATCATGGTG
GAGGTAAAGAGTGAACCTTATAGTTGTTGTGTGGTTTTGCGAGAGCTGCA
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TTGCTTCACATTTTCTTTCATGAACAAAGGCTTTTTTAGTTGTCCTCACT
TCTTCAAATTGAACTTTTTTAGGCATCTCTTTAGGTTTTTTAACCGCGCT
TATTCCCCGTCCATTTCACAACGAAATAAGAAGTGTTACATTAGTCAAGT
TTCATGAGAATGCTACCATTTGGCTTTTCCATAAAAGAGTCAGGGTTCTG
TGTATGAACAAATTTTGATGAGCACATATCAATATTTTCTGCCAAGTATT
TATTTATATCAGACAGCCTTATACTTTCACTGTTGGTGTTTAATTAAGTA
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ATCTAGATCATCCTCCATCAAACGTTCAAAGGTTTTCTTTAGACTCTGAT
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GTCTGGATGTAAGCCTCCATGCCTCAGTTGTGGAGTTATTTTAGTTGATC
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CCAAAGAATTCTGACTCAACTTATTACTTCGGTGATATGGTATTCTAATT
AGCCTTATTATGCTTGTTAGTTGGTTACTGCTTTATCATTGATAGAGCTG
ATTATCTGAGTTTACCTATTGCAGATTGGTGGAGCACTCACTTTTTTTCA
TGAAACTGGAACACGTAGATGCCTAGAGGTAAAATACCAAGCTTAATGAA
TTATTATGTATTGAATTGGGATTAACTAGTTGTGGTGCTTCACAGGTATC
TGTAACCTTGGAAACATCAGAAGCAATTAATCCTCGTGTAATACATCCTT
CAAGAAGGGTCTCACCCTCAATAACCAAGGTATATCTTCTGCAGCTACAG
GGGTATCTCCATGATCAGATGCCATTTGTGCATGGAGTTTGATTACCACA
TTATTATGCCTGGTGTTATTTGTTGGGATTACTTAAGATGTGTGTAATTC
GAAAGTACCCAATCTTGATAAAGTGTACTATGAACTTCCACCTCCAGTAA
ACTCCTCTGAAAATCACCGCATTAAATAATGCTGCTGGCCTTCGTATTTC
ACTTGTGTTGGATACAAATGCCCTTGTCTTTCATGTCTCCACATCCTTCT
CAGTGGCTGCAATGATTGTGGTGTTGGTTGATGTGGGCAAATCTAACTGG
GGGCTTCCACTCACAAACTTGTTAAACCCATGGACAGGGCGAAGTTGCCA
TCTCCACCTTTGGATCCAAAGTTGGACACAGCATGAATTGCACCATATCT
GCAGTGAAATCGAGCCGCTGCCACCATGAATCGATCATTCAATGGGCAGG
AGCTTGCAGTTGTGGTCAATTGGTCATCCATGTACATCCCCAACCTGAAT
ACCAGCAAGCTTCGTGGTAGTTAACCCTGGTGGTTGGTCATTTTAAAATT
CGAGAAGGTCAGAGATGTGAGGGGGCTGCTTATAGAGGCAAAGCAGCCAA
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AAGGCGTGGTACTATTTTCTACTATTAGTGGAACATGTAGCCCGATGATA
TCTTTCCTAATCTGTTGAGTTCGTAGTGGCATTTTTCAAAGCCGTCACTT
TGCTGTGACATGTCTAAACAGCCAGTTTTTTCAGTATTGAGAAAACAGAA
AAGGAAATGTGTTGATGCTCTCAAACAGTCACATGATAAGCCATGACCTC
ATGATCATCAAAAGATAGTTTAATATGAACTTCTGTATTTACCTTATGAT
GACAATAATAAACATATTCCAGTAATATCAGATTTCATGGGTTCTTACTA
GCTTATTATTCAAGTAGCTTGGTCTATTTGAATGTTTATTACTTCTATTC
TGTAAAACACAAGATCTTTGTTATTTTTTGATCCAACCTTGTCTCCGTGA
GCAGGTACACAGTGAACATCATGAAGTTGTTGCAGATCTTCATCAGACGA
GCTTTCTCTTTTCAATTCCTATTGATGGACCAATGTCATTTGCTACTTCA
AAGGTCTCTGTACAGTGGTCCCTTAGATTTGAGTTCTTCACAACCCCTGC
AGGAATGGACTCATCGAGGTATGTAACGTGATGATTTTGTTGGAGTCGAT
TTGTGTTTACTATTACTCTTTCTATGTGCATGTGTTTACCGCAAGTTAGT
CAATGACATGCTACCTCCATCTGTAAATATAACATTATTTTCTTTAGTTT
CAGCAACTTTTTTAGAAGTGTTGTCTGGTACCGATGAAGTGTGAATATTT
CTAGTCTGTTGCTGCTAGCTTTGAGTCGGTAATCCTGGTCTCTCTTTGGC
AGGTATGAGCATCCACTTCTTGTTGAGAAAAGAGAGAAGGGGGACTGGGT
CCTCCCAATAACAGTTTATGCACCTCCACAGCGCAGACGAGCTACTCATG
GAAGAAACGATAGATCC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.