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GrainGenes Sequence Report: AA018932

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Sequence
AA018932
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA018932
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTGCGCTTCTGGTCGGGCTCAACCGCTGCCCAGCACAACCGCACGGCCTC
CCCCCTTCTCGGCGGCTCCCCTGATCTCCGTCTCCCTCCTGATCGCCACT
CCCCCCTTTCCGGGCCCCTAGTCCGCGGCAGCCATGTACCGCATCGCCGG
CAGCCACCTCCGCGCTCTCAAGGTACCCCCTCCATACTCTATCCTTCCCG
CAGTAAACCTTCAGCGTTCGTCAGATGAACATGCTGATTCGTCTAGATAC
TGATGGCGCTTGTGGAGTTGTTGCCGATCCATGTGTCATTGCTTTATATG
TCCGATTGGTCTAGTTTTCATCATTTTAAAATGGGCCCTAGAGTGCAGAT
GCATGGTGTTTGCTGTGGGTGTTGTGTTGGTTGTTCCTCGATTATAAGAA
GAGATACTGATTAGCTTCTACTACCAGGTGATTCTGGCTAACATTGACCT
AGAAAACTTCCTGAGATGATGTAAATACCGGTTTATCCAATCCACAACTG
AACCAGAACCAGAATATGCAGCATGTGATCTTGGTGCTGGAGCTACGATT
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AAAACTGTGGTGCATTGGTTTCATGAATCTGCCATACTGTATAAAATGCC
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GAATTGCCACTCAGAAACACCATGATCAGAATGACCGACAAGAAGGCAGT
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ACCAGTGAACATCACTGTTTCGAAACATCCGGTATAAGAACACACAAATA
GGTTCACTATCCTTTCATATGGAAGCCTAAACCTGTGTAAACATCATGTT
CCTGTGTCTATTCTTCTTTAGTTTATTTACTTCCTACGTATCATACTGTA
AGATCTAGAACATCGGCAACTATATTTTTGTTGAGACTCAAGGGAGATAT
ATTTGTTACTGGCCACATTTTGTTCTTGTAAATCTACATCTGCTGGATTT
TGGTTTATAATTTGATCTTGTTAGTTCTGATTTTCAGTGCTGCCTGCCTT
CAACTTCTAATGTATTTTGCACACAATTTTGTTTCATGTTACCTTATATT
CTCGTGGCCACACAATTTATTTTGTTTTTGTGCTTGCAGCAACATGGTTC
GAGCAGGTTTGCTAGTACAAGTGTTGCGAAGCAGTCTTCTGGTGGTCTAT
TTGGTTGGCTTCTTGGGGGGAAGCCAACCCAGCGTCCAACTCTTGATGTC
CCTCTCCCAGGCATCACCCTTCCTCCATCACTACCAGACTTTGTGGAGCC
AGCTAAGACAAAAGTTACCACTCTCCCTAACGGCATCAAAATTGCTTCAG
AAACATCAATGGTATCACTATTTGGCTGCTGAGGTTTCACCGTGTTCCCC
TTTTTTACATTTGCATGAGAGTAATCTGTAGGTACTTAACTGCAGAGCCC
AGCTGCAACAGTGGGGTTGTATATTGATTGTGGTTCTATCTATGAAACAC
CTGATTCATCTGGAGCATCACATTTACTTGAGAGAATGTCATTCAAGAGC
ACCACAAACAGGAGTCATTTGCGGCTAGTACGCGAGATAGAATCCATTGG
AGGGAATGTCTCTGCGTCAGCTTGTCGCGAACAAATGACTTATACCTATG
ATGCATTCAAGGCCTATGCACCCGAAATGGTTGAAGTGCTTATTGATAGT
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GGCACTGGCAAAGCCTCTGATGGCACCAGAGTCGGCTATACATAGATTGG
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TCTATATTATTATTTAGTTAGAAAGGCAATCCTTGACATTTGCATGCATT
GAGTCATTTAGGAAAACTACACAGCTCCCAGGATTGTCCTTGCAGCATCA
GGAGTTGAGCATGATGTGTTAGTCTCAATTGCTGAGCCTCTTCTGTCCGA
TCTTCCTGGTGTGAAGCGTTCAGAAGAGCCAAAATCAATTTATGTGGGAG
GAGACTATCGGTGTCAAGCGGACTCTCAAGTGAGATATTGCTGTTTTTCT
TTGTTCTGCGCCATTTGATCACGGGGATGTATATATGATTTACTTCTATA
GTTCTAACTTCTTTTCTCTTGTGCATAGAGCACACATGTTGCTCTTGCTT
TTGAAGTGCCAGGTGGATGGTATGAAGAGAAAACAGCTATAATTGTTACC
GTCCTTCAGGTATAGTTGCCGTTGGCAAACATTTAAGTGATTTGTTATTT
ACGGACAAAAATCTAGAGTAGAGCAGTTTCCTTTGGTTCTCTGGTTTACC
GATTAGCATGCTTGCATATTGGCCAGCGTGTCCAATTTCCATTAATGACA
AGTTAATAAATACTGCTGTATGGACAATTTGATGTTTCTCCAGATGCTCA
TGGGGGGAGGTGGCTCTTTCTCTGCTGGTGGTCCTGGGAAGGGCATGCAT
TCTCGACTATGTATGTTCTCCCTTTCAATTATGCATCCCCGCCAATGACT
CAAATTTGAAATTGACTGTACTCATGCTACTTTACCAACAGATCTTAGGA
TATTGAACCACTACCATCAGATTGAATCATTCTCTGCGTTCAACAGTATA
TACAACCATTCTGGTCTGTTTGGAATACTTGCTACAACTGTAAGCTTCTT
CAGACATAAATTGCCTTTCATTTTCTATTTATGAAATTTAAGGTGTAAAT
AAAACTCCATGTTGTCTTGTATCGCTTGGAAATAGTTAATTTGTGTGCAT
AGCTAAGTGGTCTCTTTTATCACTGGGTTAACTGACATAGTGGTAATTAG
TCTTACATGAAACAACACAAGGCATATAAACTTATTACTCGTAGAGGAAA
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GTAGCTTGAGTATGGAAAGAGTTGAAACTTTGATGCTTTTGTAGCAATAA
CAAAAGCTAACTGGCTAGGGCTTTTCTAGGGTGGGGGTGGGGGTGGGGGA
GCATCCAGTTAGAATTGTGATATATTCCTAAAGAGGCATGTAACTGTAAC
GCCCTGGAAAATATATTCCATATATATTTGCCTTTTGGTTTCTTGTTTGC
ATCTGTTGAAGTGTATAAGTGGATTGCACTAGCCCTTTTCATCAGTTCGG
ACTTTTGGTTGCGTTGGCTAGTGCATGAAACTTGACATGGTATCAGAGCC
TAAGGGTGTGTTTGTTAGCCTGGGTGGGTGTGTTTGTTAGCCTGGGTGAG
TCCAGAATTCCCATCTCATCCCATACAAGCTGAACCTAGCTAAGTTGAGC
TGAGATTTTCATATGTGTTTGGCAGCCTGTGTCTGTTGAGATATGATGAA
TAGAGATGTTGTTTGGTGGGCTGTGTCTGTTGAGATATGATGAATAAAGA
TGTTGTTTGGTGGGCTGAGTCTGTTTAGCCATGCTGAACTTAGACTTTGT
TTGGTAGAGTGCACGTGAGTAAGATGTGATTGCCATGACTTGGTGCGATG
ACCACACAAACATTTTCAAATTTCATCCATTGTCATAAATTCAAAACACA
AGCAAGTATATACATCATAAATTCAAAACACAAGCAAGTATATAGCACAA
AATTACCCAAAATGATATATTACCAAGGCTCACTTGAGCACATAATTCAG
CATGTCTACAGCACCAAAAGCTAACATAGAAAATACGTCCAAATTACCAA
GTCCGCATCATATAATATATAGTAGGCATTACAAAATATATAGATTTTCA
AGTTGCATCAACTCACAACAACTCAAACTAGATCCGGATTTTTGGCTATG
ATACGCTTGAATGAGGCTTCACGGACATCCGCTTCCATTTTCATGAAATT
AAGGCCTTTACCCTTATGCTCCGTCAAATAATCCAAAACAGCCAACCGTT
CATCCATGTCGAAATTGGTAAGGTCCATAACCGTTTTGCACAAATCAGGG
TGTGTTTCGGTATGACAAGTGTTATTGATAGCACCAGCCACATCACGCAT
GCATCAGACATGTTTACCTGAACTGCATCTTCGTCACTCAAAACCCGCTT
CCTCTTTTTATTATTTGTTGAGCCAGAAGGTGAAGGAGTAGTTGCTCCGA
GGCCTTGAACTCCAAAGTTGATGGGGATTTCACCTTGCACAAAACCTTCA
CCATTGGTTTCTCCACCCTCCAAATCAATAGTTTTTTCTAGACTTTCAAC
TTCAATGGGTTTCCCCAAAGGCTCATTAGATCCCATTGCGAACTTTCCTG
TGGCTAGCTTATTGGCAAAGCAAGCTTCCATGTATTCATAGTTCACAAGT
GGTGTGTTCAAGAATTCAGCATCCTTAGGAGTATCCTACAGATATCATGA
ACAAAAATATATTCAGCACTATAACATGTTTCCAACAGATTTTAGTAATG
AAACAATGGGTTCTTGGACAAACCTGGGTATGCCCCAAGTAATGTTGGTC
TTCTAAAACAATCATCTTTTGATCATCATCCCAAAGTGCCTCGCTTAGAA
GTCTCAGTTTCTCGATTCTTTGATACCTGATCTTCCACTTGCGGAGATGA
TTGGTTACTTGGGTAGTTGTCACATCGTAACCGACGAGTTTGGTCAAAGC
TTTTGCTGCTTGTCCAATATGGATCTCTTTGAATCCTTTGTCGGTCTTGA
CACCTTTTGCTGCAATCTCGGCGAGACATCGCATCATGCATGCTGACATC
ATAGGGGTCCAAGTCATAACCTTCGGAGCCTTCTTTTTTGTAGCACCTAC
ATCCGGAACTTCGTTCTCAATTTCAGCCATCTACAAAAAAAAAGCAGCAC
CAAAAAAATAGACATTTCAGCACCATATTGATATATTCCAGCAACAAAAT
ACAAGTTCCAGCAAAAGAAAAGTAGTACCAGCACTAATAGAGACATTTCA
GCACCAAAATGAGTAATTTCAGCAACAAATATAGACATTTCAGCACCATA
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CCAGCACTAATAGAGACATTTCAGCACCAAAATGAGTAATTCCAGCAACA
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GTTCCAGCAAAAGAAAAGTAGTACCAGCACTAATAGAGACATTTCAGCAC
CAAAATGAGTAATTTCAGCAACAAATATAGACATTTCAGCACCATATTGA
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TCAGCACTATATTGATATATTCCAGCAGCAAAATGCAAATTCCAGCACAA
AAGTTACACATTTCAACACCATATTGATATATTACAGCACCAAAATGCAA
GTTCCAGCAAGTTCTAGCAATAATAAAATAGTTCCAGCGCTAAAGTTACA
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ATTCATCCTCCCCAAATTGAAGGATCCAATTATGGAGAATGGCACAAGCT
ATTACTACTTTTACTTGGGTCTTGTAAGGATGGAATGGCTTATTGTAAAC
AAACTTCCACCGATTCTTATATGCGGCAAAAGCTCGTTCAACTGTTATCC
TTAGCGAAGAGTGTCTCAAGTTGAACAATTCTTTATAGTTTTCAGGATGA
TTCCCTGCACCATACTCCTTCAAGTGGTACCTTGTTCTACGGTATGGTGG
AAGGAAACCCGGTCTCACGGCATACCTAGCGTCAACAAGATAGAATTTTC
CTACGAAATTCCAACTATTAGGTACATCAAAAACTATTAAAAACTATGTG
GCTGCTAGGTTTAAATTATTACCTGGAGGTAATGACAACCCATCATCCCT
CTCCACAGCATCCGCAAGTATGAGGGCATCATGAGCTGACCCCTCCCAAC
CAGCAAGTATATAGGTAAACCTTAAATCAAAGTCTACCGCAGCCATAACA
TTTTGAGTAGTACCATCTCTTCTACCCCTAAAGGCGGCCGAGATATTTGC
TGGGACTCTAGCCATGACATGTGTTCCATCAATTGCTCCAATACAATCCT
AGTTCATAAATATGTAAGTGTGAGTGGAGGGAGGACGGGATGAATATATA
GATTTTTTCGAATAAAAGTAGATTACCTTGAAGTAAGGATTGAAGCGGTT
GTTTTCCTGAATTTTAGGGTGTATATTACTGGAGGGAGGACGGATCATCT
CACCTCGCAACTCGCCAACAACATACAACACCGCCTTAAAATACCTACTT
ATTACTTCAATAGATCTTCTAAAAATCGGTTGAAGAGCTCGAAACCTTGT
GTTGTGGCCAACTACCAAGAGAAACATGGCTACTTGTTCCTCAATGGAAG
TATTAAATACTATCTTTCAATAATTCTCTCTCTCTAAACAAATTGCACAA
GCGAAAAAAGGGAGCTCTTTTCATTCTAAGCTGATTTGAGCAATTTGATT
CGGTAGAATGATAGATAAATCTCAAGTTTGATTCCCTAGCTATATCCATA
TCAATCCTACGACCTAATAACATCGGAGTTTGGTTTCTAGCTCTCCTTGA
GATAAAAATCATGTAAGCTCCCAATGCAGCTGCAAGGCCGGCTGCTTGCA
CGATTAGTTGACGTCGTTTTTTGGCCAAATCATCCATCTAAAGAAACAAA
AAAATCATTTTCACACACTGGAATGAAACAAACATGACACACCAAGTATC
CATCATGCATACAATTGCATAGAATAAAATCCCTACTGTCCACAACATTA
ATATCTGAAAGTATCATATGTAACCCATGTTTTTTGCAAAGAAACAGAGG
GAGTGACTACCTCAGATTATGGCCTGGTGTGTCCTGTTGGAGAAGTGGTG
GACGTACAGAGCGGTCCTGGCGTGCTGGCTCGCGTTGGCCTGGTCCCGTG
CAGATGGCTGTCTGTCCCGGCGTGCTGGCTCGCGTTGGGAGGTTGACCTG
GGCGGGGCGGCTGGCTGTTGATGGCGGGGTGGCTGGCTATCGATGGCGGG
GCGGCTGGGGAGGAGCAGTGGCGGCTGGGGAGGAGCAGGGAGAGAAAGGA
AGGGATCAATCGGAGCTGGTTGTCGATGGCGGGGCGGTTGGGGAGGAGCA
GGGAGAGAAAGGGAGGGATCAATCGGAGCTGGCGGCGGCGGGATTTGACG
ACCGGAGGAGTGGCGGCTGGGGAGGCGCGGGGAAGGATTTGGGAACGGGT
TCGACCGCTCGAGGGAGTTGCCCTAGCGCGGGGCCGAGCGGGAGGATTTT
TGCGGACGCGCGGGGCACGATTTTTCGGGTCAACTCGGCCAGGCTCAGCT
GCGAACCTCGTTTTTTGCTTCTCAATCGGGCCAGGCCGAGAGCCGTTTTT
CGTATGAGGTGAGCTTAGCCCTGTGAGTCCACCCGGTCTAACAAACACCG
TCTCTGCTAATAAAAGTGGGATGAAGTTAGATTTTCTGGGTTGGCCCAGG
GTAACAAACACACCCTAAGGGCTCGAGTTCGAGTCCTGGCTTTCGCAATT
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GTCATACGTGAGTTTCGCGCGCCGTCGCTCTCTTCCGGTTGCACGTGTTG
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CACTAGCCCTTTCCATCAGTTCGGACTTTTGGTGCGTTGGCTAGTGCATA
AAGCTTGACAGCATCATCATGACATCATGCATATTTTCTTCGCATATTTT
TTACTGCAAACTTTTTTTCTAAAAGCTTATTTTTGTTTTGCTAAAATATC
TCCATAGTATAATTAAACCTGTATCCCTTTACTTATTTTCAAATTAAATA
AATATTATTTTCCGGTCCGTTAAAAGAACACAATATATTTTATTATTTTC
TCAAAATTAAAGTAGGAAAAAAGCCACCTAAAGTTTTAGCCCAAAACTAG
CCCAAGCTAGCCTACTTTGGACTATATAAATACTCCAATCCACCTCTTCC
GCTCAAACCCTAACAACCAAATCTGAGTCATCTTTTCAGTTTGCTGCTGA
CGCAGTTCTCTCTATTCCGTGTGTGTGCACCAGACCGGCGTGCCGTCCAG
TCCACGAGGACTCCTTCGATAGATTTGTCGTAGGGTACCACAACTTAAAT
ACTCAAACATGGCAATAGGATAACCAAGGCATATAAGCTGTTGTTGTTGC
TGCATATAACCATGACACCGGACCACCGACAGAAGAAAAGATGGAGAAGG
AAAGGGCAAAATTTCAGATCTAGATTTGACCCAGATTTGAGGGTTAGGCT
TTGGGAGGAAGAAGAGGTAGATTGGAGTATTTATATAGTCCAAAGTAGGC
TAGCTTAGCTAGTTTTGGGTTAAAACTTTATGCATGCTTTTTGCCTACTT
TAATTTTAGAAAATAAGAAAACAGATTGTGTTCTTTTAACCGACCGGAAA
ATGTTACTTATTATAATTTGGAAATAAGAAAAGGGAGGCGAGTTTAATTA
AACCACGGGGATATTTTAGCAAAACAAAAATAAGCTTTTAGAAAAATAAT
TTATGGTAAAAAATATCCGAAGAAAATATGCATGATGTCATGATGATGCA
AAAACAAAACAAAAGGCAAATCTATATGGAATATATTTTCCAGGGCGTTA
CAGCAACCTGCCCTAATTTCAGCTGTATGGCATCTCTCTTCACCATATCA
CTATTTCATCAAACACTTTGTACAGTTATTTCCACTTTCTACTTCCCCTG
AGCCAGAAACCACGTAAAGAGTGAGTACATATTCAGTAAAGACTTGCCTA
GACTCCATTTTACGTCCCTTATTTATTTTCTGTTTGTTGTTTTCTTTTTC
TCATAGTACTGTGAAATGGACAAACGATTGCATGAATGCTATCTAGTTTC
ACACTTATGCACGGATTCCAACATTGTGGTACTTATATTTCCTGTTATAT
AGTTGTATCTAACATGCTTTTATGTCCTGCAATCACTGTCAGAGCCCAGA
TTTTGCCTCAAAGGCTGTGGATTTGGCAGCAGGAGAACTTCTTGAAATTG
CTACTCATGGAAATGGTTTGCAGCTTATTTGGCATCATGAGCCTTAAGGA
ATCATCCGTCTAGAACTATTAATTCATCACTCGTTGATCTTCCCACTTGG
TTTTGTTTTTTACTTAGTTACACAAGAAGAGCTTGATCGAGCTAAACAGG
CGACCAAGTCTGCAGTTTTGATGAACTTGGAATCAAGAGTATGCATTCCC
GACTCCTAACTGAATCTTTCAGGCTTACCTTTAATTCTGTATCCACCTTT
GTTCTTGAAGAGGCCTTCAAGTCCAGTACACCTGTTTGACCACTACTTTT
TTTTCTAATTATATGTTTATGGAAATTATATAAAATGGCACGTTAAGGGA
ATTTTGTTGATGATCTGCTAATATCATTTTCATGTGACAAACCTTAAAAG
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AATATGTCTATTTAGGGTCAGAAAGTATTATATTCTTGATAACTAGTCTT
ATTCATCTCAGGATGTAGCATGTGAAGACATTGCGAGGCAGATTTTGACT
TATGGTGAAAGGTATGGCTACGCAAGCATTGGCAATTTAGCTGTTGATCT
TCCCCATGTTGATCTTCTCCACTGTTTATCTTCCCATGCACTAGTCATGT
ATTCAGTATCATTTTATCATTTGGGAATCATGTACTCCCTTCGGCCCATA
TTAATTGACTCAAATTTGTCTAGATTTGAATGAATCTAGACACTATTTAG
TATATAGGTTCATCCAAATTTTGACAAATCAAAGTCAATTAATATGGATC
GGAGGGAGTACTATAGTTTCTCTCTACCGAACTAGGTAGTTACTATACTT
ATTACTGTCTGACTTGAACATTGTTTATGTTGTATTACCTTGTCTTCGGT
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TTGCAGTCTCGTTTCAGGGGAAAGAGTTTTCCAAATTATATGTTTTTTCT
GAGAAGAATAAACATTGCTTACTAATTTTTGGAACTCAAACATATGTGCT
TACTTTGATGCATGAATTATATGTGAATTTTGACAGTTGAATTATAATTT
CTTATATATAGGCTTGATCATTGATTGATTAGGCTCCCGGCTGAAATGAA
ACTGAAAAGTCATGTAGTGCATAATTTGAATATAGCTACATTAAACCATG
AATTGGCAACAACACTTTTAGTCCCCATTTGTTTGAAAATAGTCCTGAAT
TAGGTAAATTGGCTTGGTGTACCAAGTCTGAGGTGGCCGTAGAGGCTGGA
TGAGCGGAAATATCTTGCAGTTTTCTTCTGCAGAGTTGGTGCAAGTCTTG
TTAGGCCATCTGGAACATTTTTTATTTTTTCATGGTGTTATTTCCATTAT
AAGATAGTACTTAGGTATCCGATTAAGTATCACTGTTTTGCTATGGTAAT
CTTGATGCATAAAAGATTGCATGCGATCATTGTCCACAATTTTATACTCC
TATTATCTAGTCAACACTTGATCACTACCGCACTGTAATAGAGTACAGTT
TCACCTTTCCCCCCTTTGGTTCCCCCTTGGTTTTGAATCCCGGTTATTTT
GTTCATGACATTTACAGGAAACCCATTGAGCACTTCTTGAAGGATCTTGA
AGCAATCACTTTGGATGACATTTCTTCAACCGCCAAGAAAATTATTTCTT
CACCCCTGACAATGGCATCATGGGGCGATGGTATGTTGGTACTAAGCATA
ATGGGCTTTTTAGATTTTTTTTCTCGATAAGATTGTGCAATGTTGGTTCA
ATTGTAGTCCATGGCTTACTAAAATGTTCGTTTTGCAGTTATTCATGTCC
CAAGCTACGAGTCCGTTAGTCGGAAATTTCATTCACAGTAAGCAAAATTC
GGTTGTGTAGTTTCTGCTGGACTTCCGGCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.