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GrainGenes Sequence Report: AA037872

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Sequence
AA037872
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA037872
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTGCTTTTTGCCTTCAGCGAGTCCCGTGGAGGGCCAGCGCCCGCCGCCTC
GCGCTGGATTGGCTTCTCCATCGGCAGGTGCCGGGATCCCCTCCGCAAAA
ACCCTAAACCAGCAAAAAGGAATACAGGCACGTTAGCAAGCGAACGAAAA
AAAAACCAACCGCCTCCTCGTGTTCGTCAGAGATGGAGCACGACGGCGAG
ATGGCTCCGCCGATCCCCTCCCACGCTACCCCCGCCGATGCGGATGCCGC
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CTCACTCTCATCCCCCGCCCCCGGCAGCCGCGGCCGCCGAAGAAGAAGCC
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TCTTCTTCTGGTACGAATCAAGATCCTAGATTCTGGCTTGACTTTCTGTA
GCTCCTTTTTTTTATCTCTGAACTCTAGTTTCGATCAACTCCCTGACTGA
ACAATTACTGGGCACCTAACTGAACAGAAATATCTACTATACTTATAATC
CCAGGACTCGCCTTGCACATGACAGCTCCTTCTTTAGCCCATAATGAGCT
GGTGACAACTCCTTGCTTGACCATGTAACGAGCTAGTGTCAACGCCATTG
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GCAATGCTCCATGCCTATCCTTCTGCTGCACACACTGCACCTGCTTCTAG
AGTTTTTGGCCACAAGATTACATGACAATAAGGCCCAATGCTGCTGTCAT
ATCTTTTGAGAGATCAGCTTAGCTACAACAACATTTGTAGGTGATGATGA
GCAGCTGGTACATGTTCTGATGTCGTTGTAGTTGCATATTGGGGTGGGGA
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ACCTGTCATGAGCCAAACCATGGATGATACATTTGTACGGCATCGGTTGA
CAGTTCAGAGAAGATGGCTCTGCCACAAGGGTAACCTCCATGGCTCCATT
TGTGCTTGCCTTCCCTGGGGACAGCAATAGTTGTTTGGTCTGGTCTAGCA
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AGTTTTTTGCTATATTCTTAAATGTCCTCCTATTTCGTCTAATTTTTTGT
GTGGCTCCAGATGCTGGGAAGTCAACTGCTGGAGGTCAGATATTGTTCTT
AAGCGGTCAAGTAGATGACCGAACCATCCAAAAATATGAAAAAGAAGCAA
AGGATAAAAGCCGTGAGAGCTGGTAAGGTCTTGCTTTAATGATGTATCAT
AAGTCCGTGGTATCGTTTGTGCTACACGGTCCATATGCTTATTCTGTTTA
AGCACATAATGCACAGCTCATCAATGATGAAATTTTACCATGTCATTTTT
TGTTACTAAGGTGACTTCTTAGATCTGAGAATTATACTCATTCTATCATT
TCAAAAAAGATATTCGGGATATTATCTGTTTAGTTCCACCAGCTGACTCT
CATTTCTCCTTTTGCCATTATATTTGATCAAAATAACTCAAGATCTTGCC
TAGTTTTGCAAATTGTGGTATCTAGTACAGAAATATATGATGCATTTCTC
TTTGATTTTTGAATGGGAGCTTTTGCGTGCATGCGGGCATCGACATCCTG
ATAATACCTTCGTCGAAGCGCATGAGTTGTAACCTTGTTAATTACCTAGT
TCATTATATATATGTTAAACTTGAAGCATGTTATGTAAATTGTATGTCTG
TAACAAGAAAAAATTTCGTACTCAGAGTTGCTCCATGATCATTGCATTTT
TTCTCATTTATGTTAGCCAGTGTTCAATTATACTTTGTCCGATATTGTGT
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TATAGCCCATAACATCATTATTTCCGCTGTCTTCTCAAATTTAACTATGG
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AGGCAAGTATCAGCTTATTTTTGTAGTAGAAAATGTTGTGTATGGCACTT
GGCGAAGTTCTTTCTTGAGCAGAACTTTGTGAAAAATGAGAACTGAAGTT
ATATGATTAAAAATAAACTTATGCATTGACCATACTCCCAGTAACTTCGA
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AAAGCATGAAAATTTCAATGTTATTGTTAGTACATGACTTGTCCACTTCA
ATTTTCTCGTTATGCTTTGCAGTTTGAAGTTGTAGGTTTCTCCTTATGGC
ATGTTGGGAACCTTTTGGCACATATAATTTGATTATACTTTGGTGCATTT
GGTGGTGTTACTAATTTAAATAATTTCAAGCAACTTAAGGAAAAATGAGT
CTTGGTTTACACTGGGCATTTGCAGGCCCTTTGTTGCATGAGGCTGAGGT
CTCATCTGTATTTGTTCTACAGGTACATGGCGTACATTATGGACACAAAT
GAGGAAGAACGGGCGAAGGTATATTTCTGTGAAATTGTTGCACCCATCCT
TATAGATTGTTTTACAAAAGGCTGCTGGTGGCTGCATTATGTTTAGTCCA
CAAAGAGCTCTGTTGAAAATTCTTTATCAGGATACCTTTTGCAGCTTTTC
CAATTAGCTCAGCCTAAGCATGTTAAATACTTCCATTTGGAGTTTATTCC
GATTTATGTTTTTTGTGGATAACATGTGTTCTAAATTACGCCTGAGTTCA
GCTTTCTTTACTTGCCATGATTGTGTAATGTGTTCTATTTTTAATCTACT
TCAGGGGAAGACTGTTGAAGTTGGGAGAGCTCACTTTGAGACTGAAACTA
CAAGATTCACTATTTTAGATGCACCGGTAACTTTTTTCTCTTTCATATAT
GAGCTACTTGTGTGTATTATGGTAAGTAGGCTCATAGCTTTACTTTGAGT
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GGATACAGGACAGTCTCGTGTTATATGTTGTATTTGTAGCAAAACTTTGT
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GATTTTGTATTTGCGTATATCAGTTCATTATGCACACCCTAGCGTAATAC
ATGCAGCTCTCATGCTGTAATAAGCTACTTCTAATTGTTGCACTAACATT
TTACTGATTGTTTATTTATCAATTTTGATGTTTTCTTGTATGTTTCTTGT
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TATGTTCCAAACATGATAAGTGGTGCATCTCAAGCTGATATTGGTGTTCT
GGTAAGCAAGTCGATGCTAGATGAGAGACTTATTAGCTGTCATTTGAGCT
TGAGGTAACTGGCATTTTTTGCTCTCATCAGGTGATATCAGCTCGAAAAG
GTGAATTTGAAACTGGGTATGAAAGAGGAGGACAGACTCGTGAACATGTA
CTGCTGGCAAAAACTTTAGGTGTTTCTAAGTTGATCGTGGTCATAAATAA
GATGGACGACCCTACTGTTGGATGGTCTAAAGAAAGGTATAATTGTTGGT
AACAAATATTCTGTTAAGTATTAGTACTTCAATTAGTTATGAAAAAGAGA
TCATGCCAGGTATATGTTCTCTTGGTGTCTGCCAGGTATAAGGTTGAGTG
ATGAGATTATTCTTTTTATTTTCAGATATGATGAAATAGAAGGCAAAATG
ACTCCTTTCCTTAAATCATCAGGATACAATGTTAAGAAAGGTAACCGATT
GGTGATAGCGGTCCATTCATTTTAATTTTGGAACATTTATATAGTAGAGG
CTGTAATGTCAAATTAATTTTAGTACTTCTTTGTTTGATTACTGAATTTG
ATGCCTAAGACATGCTTTATCTTCATTTTTAAATAGTTACTTCCAAATTG
AAACATCAATTATATTTTGTACCGGTCAGCATTATTGCATTAACGAATAA
TGTCATGATGTGCGGCAAATGTGTACTCTACTATTTTGTTGCATCTTTTA
CAGATGTCCAATTTTTACCAATATCTGGTCTTCTGGGAGCTAATATGAAG
ACCCGAATGGATAAAAGTACCTGTAAGTGGTGGAATGGCCCATGTCTATT
TGAAATTATGGACTGCATCGAAGTTCCTTTACGAGATCCCAAAGGTCCAG
TAAGGTATGACTGCACTGCTTATCGGAAAATCTAACCTACGAACTGTCTA
TACCTTTGTGTCTGAATTACTTGCGTGCTGCTGGATGGCTTCCCACAGCG
TTGGTTCGTGAGCCAAGACGATTTCATACCCATGGAATACGAGACCGCGC
TCTTACATCCCAAAAGCTAAGGGGCGCTGCATGGTTCAGCAGCTGCTGCA
TATGGTGTTTGGACTAGTGCTACCATGCTATGTACAGCCGGCTGTATGCA
AACAACTCAATGCCGAGTGAATGTGAAGCACTGCATTTCACAACAAGCTT
TTACCTTGGCTCTGTCAAGCTACTAGAGCCTACTAATTGTTACTTGAACA
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GTGCAGCAGCTGGGTAAGTATATCAGCGCTATAATGAACTTGTACATGAA
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ATAACTACACCAGCCCTATGCTGGTAACTGGTAGTTGAATGTTGGGTCTG
AAGGAGCACAAGGTTGTGGAGGAACAACTCCATCTTGCTGCTACAATATG
GACAGCACAAATATTGAAGAAACCACTTCTGCTGCGTTGGATATCTCTCT
AGGGGCAGAGCTGTCACAAGTTCAGTCCAAAACTTTTAACGCAGAAGATC
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GGGTACATAGTCTCGTTCCATATCTATAGGTGAGGACCTCTGTTTATAGG
CCTCATGAGCCTCCACTAATAGCTACAAGGTTCTAGAGAATAGTACTTAA
AACTAGGAAAGAAAACACAAACAACATGGTTACAACTCACACTAGAACAC
TCTGGAAACTACTAAAACACATATGACTAAATGACCAAATTACCTAGAAG
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CCCTCGTCATAAGGTGATCTAAATTGATGAAGTAAATCCATTTAGTGGTG
CATGACGAATCCTTATTGCATGGGACTTTTCCATAATCTTCTTGTCATAT
TAAGTGACTGTATTCCCTTTGTGCTCAGTGCTCACATTGCATATTTTGCT
TGATAATTATGTTGAATAATGGTAACAGTCAAGGTGTACATATATGCAGG
ATGCCAATCATGGATAAATATAAAGATATGGGCACCGTCGTGATGGGAAA
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ATAAGGTATCAGTTTTTTGGATGATTTATTTTGATGGCAAACACTTCTTA
ACTGGTCTTCCAAGAGTTGGGGTATCTGATTTTTTATTCGCTTGCTCTTT
TACTAAAGGCAAATGTGAAAGTCATTAGTGTATACTGTGATGAAGACAAG
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TGTATTTTTTTGAACTTCCAAGCAGATTGGCAAGATTATCTGTGATGCTT
TCCCCTGGATGAAGTCTGCCTTATCTTTATGTTGTTTGATAACTACTAGT
TTCTGTTACTGCACTTTTTTTTGGCATGGGGAACTCGTGGTTTGGTATTA
TTAGGCAGTGGAAAATCTCATTAGATGCATGTCTACTATATCTCGAGTTG
AAAGAGAGCTTTCTCGAACTCTTGAACCCTGCTTTAATATAGATGGATTA
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TCTTTTCTAACTTGACTAAGAAAATACATATAACGAATTCCCAATTACCC
AATAGTCAACCCAGTATTAGTATGATTCACCACAATATGGTAAACTACAG
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TTACCCACTGCCAATGCATATCCTGTTACATTAAATAGTTACTCCTGATT
AGGTATTTTTGTTAGCACCTTGACTCTTTCCATAAACATGACTTAATTTT
GCCCTTCGGAGCACTTGAGCTTTTTTGTTAACTTACCTGTGGGATATTGC
ATGCTTGTCAATACTTATTCTTGTTCTGGCAGGAAATCCTGTTGGTGCTG
TATCTGAATTTAATGCTCAACTGCAGATACTGGAGTTGCTTGACAATGTA
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ATACCATACTCCTGTTAAAATCTTCAATTTTATATGATCTTCATGATATT
ACTGTATGTTCCTCTTTTCCATTATCTGAATGGTTTGAAAAGGTATCATG
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GGCTACAAGGCAGTGCTGCATATCCATTCTGTAGTCGAGGAGTGTGAGAT
TGTAGATCTCATAGAGGAAATTGATCTGAAGAGGAAGAAAGAAACTGACC
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GTTGTTGTTTGCCGTGTTCAGGTTATCCCTTAAAACCATACCTGTGTCAA
AATGTAAGCATTTAATATTTTCTAATCATCTTGGTTCTGCATCAGGTCAG
TAACTTGATTTGTATCGAGAACTTCTCTGACTCTCCTCAGCTTGGAAGAT
TTACACTCCGGACAGAAGGCAAGTACACACTTATTTAATTGTCGTATTTC
ATCTTGTGCTGAATACAGATGGTTTAAGTTAACGTGTTGTGCATGTAATA
AAGAGGAAATATCCAGTGCTTCCTCCCCTTAGGGTGTTACCTCTATCTAG
AGGTTTCAGAACCCAAAAGTTTCAAGATATAGGAGCAGCACATTATTATA
TAACAATGTAATTTTTTTAAACCAATCTTGACAATGGAAGGTATGAAGTT
GATACGATAGGGACTCCCGATCTTCACGGATTTAAGGATAAATAAGGAAA
TAAACTCAAAAACACAGCCCATGAACAAACGTCAACGCGAAAGCCTTTGG
ATCAACAACCTGTAGTCGAAACTGAATTCCATTCTCACAATCCAAGAGGA
GAGGGGGAGTGGGGTATTTATAGCCCTACGCCTAAACCCCTAACTCATGG
GCCTCAAAGAGGTTACATAGGCCTTTTGCCTGTTCTCTGTATGCAGGCAG
TGGATGGTACGGGGTAGTCGGCCGGACTGTCTGGCACTCTGTCCTAGGAC
AGAGTTTCTGGGCTTCTTGGCCCAGAATCAATTCCCCCTTTTAATCCAAA
ACATTTTCTCAGCTGTCTCGCTGGGGTGCTCAGGCCCGGACTATCCGGAG
CTTCATAGCCCAGAGTGTCTAGCTGGGGGCGGCTTCTCTTTATCTGCCCC
GATGCTCCACACTTGGATGAAGGAGCTTGGATGATTTGATTGCTGATCCA
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AGGATAGACACTTGAACTTCAAGCGCTTCACATGGTGATGCCCGTGGAGC
CCACCGTCTCAGATGAGACTGATGCCGTGTTTCTAACCTAGAAATGACCA
GGAATATCTGACACCGCTTGTTCCGTGACTAGAGTTCTTGGCGTTTCCAA
CTGGGTCTGGATGGTAGTGCGATGGCCTTCTACTGACCTGTTATCTAATA
CCATGGATCTGATAGAGTCCGCTCAGAAACAAACACGTGTGGTGTATTAA
ATAGCAATGGTACATAACGACTGATGACATTTTCTTATTTCATTCAATAA
GAATGTCTCCTTTGTTAGGTTAGTTTTGTTATTCTAGGATAAAATACGTA
ACTTTAAGATAACACAAATGCGGATAGATTTCCAGCCAAATATCTTAACC
ATAATGGAGTGTCAAACTATAGGTTGACCTGCAAAGTTGAGATGCAAAAC
GCGCAAGCAGTCATCAAAGGCTTTGTTTCCTTTGTCAGTTTCACCTTAGC
AAAAGCTGTAGCAGGTGTTCTATACTTACATTTTCTAAGCGCCAAGTAAT
CTGGTTGAATCTAATGATATTGCTGTTTTCCCTGTTTGACTTGTTCTTTA
TGTTTCTCGGACTCTGCCAAGCACCTTACATGTTGAATTGGTCGCAGGTA
AAACAATTGCTGTAGGAAAAGTTGTTGCTGTTCCACCAGCTGGGAGCGCA
ACATTTAAAGCTTAAGCCAATTTTCCAGAGGGTGGGTACAAGAGAACTAC
TTTGTGTGGCTCAGTTGTAATACATTTTTTGTAGCTTGGATAAGTATCTT
GAAAATTACACCGCTTATGCCTGCACTTTTCCTCTTCAAGGTGCAATATG
TAGCTCAAAATTTAGCAATTTACAAGACCTTATTTTAGATACTCAGATAG
TACAGGTTGGTCTTGTCTTTTTCACCATTATCTTGTATTTACACCGCTAT
ATTTGGTGCCAGGGGAACAGGAAATTTCTTTGCAATGAGCCGCATTCTTC
CATCAGGTGTGATCAAGAAGCTAGATTGCATATTTTACCTCAGTTTGCTT
AAGAGGCTGTACAACCATACTACATGCACCTCAGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.