Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA043964

[Submit comment/correction]

Sequence
AA043964
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA043964
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCAGATGATCCATCGTCCAGATTACTTCAAGTTTGGTTCGACTACATCA
CACGGATTCGCCAAGGTAATTACCAAGATTTCCTTGAGATGGGCTCATCC
TCATAAAATTTGTTATGCTTCATAGTTCCTGCTGATTTGTGTGTTTCTTC
TGCTACCCAAATTAGTGAACTAGATTTGTCTATTAATTTGGATCGAAGGA
GTTACTAGCAGAAACCGCAACCGGACGGACGGCGCGTAAGGTTTAACAAG
TGACAAATGATGTGCTTGCTCTCCTTTCAGGGGTACCTTGCATATAACTG
CAAATGGATCACCGATCCAGTATTATTACACCAGGGGACCTGGAGCGCAT
TCTGTGTGATGGAACAGCAGACCCAAAGGCCCTGCCGCTGTCACTTCTGG
AAAAAATCACAGATGGTTTCTCTGATGAGCACCAAATTGGCAGCGGTGGG
TTTGCGGTGGTTTATAAGGTAAGGTAATTCTGAGCTGTCTAACCTTGACA
AAGCTTTATCTATCTGATAACTGAAGTCGCTTCTGACAAGTCATCTTCTC
ACTTTAGGGGAAGCTTGAGACTAGAACTGTAGCCGTGAAGAGGATGTCAG
ATGCGTATATGGATGAGAAGGTGTTCCACCGAGAAGTTGAATGTCTCATG
ATGGTAAAGCACAAAAACATAATACGGTTTGTCGGATACTGTGCTAACAC
ACAAGGAAGTATGGAAAGGTATGATAAGAAATTTGTCATGGCGGATGTAC
ATCAAAGGTTACTCTGCTTCGAGTATCTTCCTAAAGGGAGTCTTGATAAG
TACATCACTGGTAAGACTATATGGCACACAATTCGTCTTCCAAAATTTAG
TTTTAAAGATCACATGGTTCATTATCCCACTATAGTATGCACCCTTTCTA
TAATTCCAATATACAGACTTGGAGTATGTGAAATAATACTTAACTTCCTT
TATCATCTCCCCTGCTAGATATATCTCGTGGACTTCAGTGGAGATACCGC
TACCAAATTATCACGGGAATTTGTCAAGGGTTACATTATCTTCATCAAAA
AAAAATTGTCCACTTGGATCTAAAGCCTGCGAATGTACTGTTAGATGATT
ATTTGGTACCAAAAATTACCGATTTTGGTTTATCAAGGTGCTTTGGTGAA
ATGCAAAGCCGTGTTGTTACTAAGATAGCTGGAACATTGTAAGTTTGCTA
AGCCTCTCAAAAGTTCACTCTTGTACTATGATTTACAACAATATTATTGT
GTTGCCTTGGTCATTAACCAATCACACAAACATATATTTATGCAGCGGAT
ATTTGGCACCAGAATCTTTTAATAATACTGAAGTCACATACCGAAATTCA
TATCGACTTGATATATACAGTCTTGGTGTAGTAATAATAGAGATACTCAC
CGGAGAGAAGGGCTATCACGATGTTGACAATGTAAGAACATTTTCGGTCT
TCTTTCAAACATATGCAATATTTTTTTCTCATTTTAGATCCAAAATAATA
TCACTCTAAATCCATCATGGACCACATATTTTGAAGGAAGATTAAAAATC
ATTTTTTTTAAATGGGTGATATATTACTTAAAAAATTTGAAGTATAAACC
TGACCTTTGCATAACCAGGATGCACACAGCCGACAAAAGTCAAGAAAAAG
GTAAACCAACTGCGGGAGAATTACATGGATCTAAAAAAGAAACAATAATA
CGCCTAGAAAAGACTAAGACGGTCCGATGCGAAGATCAAAATATCCATTG
ACGATAGATTCAACAAGAATGGGTCCACTCTATAGTTGGAAAAGAAAACG
TTTTGATCTAAAATACTTAGCACTTCAAAATCCTACAAATTAGCACACTG
AACCAGATTGAAATCAAAGTTTTGGCTAAACCATTTGGTGCAACATGAAG
TATTTTAAAAATACGGTTGAACTTATGATATGTAACAACTAAATGCTCCA
TGACTAGATCTATTTTTTTTTTTAAAAATGCCACCATGCACCACCACCAG
CAGCACATATACACAGTGTTTGTCGATGGCAACGGATCTCCCAGAATATT
TTGCCTTAATGAGACAACAAGACACCAATCCTAGGGTTTGATCCTTGGTA
GGTTGGGGCTATAACCACCTTACTAACCAGCCAACCGCATGTTGGTTCTC
GAATATACGTTTTCCTTTATTAATGCTGTCTAATACTATAATTCTTGTTA
ACACATCAAATGGGGGAGAAAAATTGGGTACACAAGAACCAAAAACAAGC
TCTTTTCGACTTCCCAAGCATGTAGATAACTTCAAGATTTACAAATTGAA
CAAAAATGAGAATGCTCCTTACACAGACAACTCTATCAGAATATTGGAAT
ATTGAAAATGTAAGAAAAGTCACCAATACTTATTATTGGATGAGCAATAT
TTTTCTGGAATAAGTTACCTTCTATGCATAACCAATTTCATGAATGAGAT
AATGTAAACTTACATGGCTCTGCATGTGAGACCGAAAAGAAAGGAGGGCT
ATCTATGTGATAGTGTGGTTGTAAAATTTCATCACCATGTCCAAGTTATC
TCTAACCCGAATTTGCATGCATAATTCTTATTGATTCAGTTGACTCCATA
AACAACTTATTGAGGAATCTATAATTAGTTTGCAATCTTAATTGATGTGG
TTTTGTGTAATATGTTAAAATTATGTGTGGAGCTAGTATATAATACTGCA
AACTTTCATTTCACATTTGATGGATGGTGATTCCTTTCATATCTCACAAA
TTCAATTTGTAGGTAGTTGAAAGTTGGAGTAACATGTTGGAGAAGTCACA
AAGTGACGTACAATTAAAACAAGTACGAGTATGTGCTGAGATAGGAATAG
AGTGCATCGACTCCAATCCAGCAAAGAGACCGGATACCCAACATATAATT
AATATACTAAACGAGTATGTCGATACTAGTGTGATTAATTCACATCAGGT
AAGATCAGTCTCACATCATCCATGACATCCTCCAATAAAACTTAGTCATG
AGAGCTTGTGTACATCTCCATTTGCATTTTTTGCTCCAAGCCAACAAATG
AGGTCAAGTGTCCTTACTTGGTTATTTGAACAGGTCGAAGATGCTTCGAC
AAGTAATCTTCCTACTGTCCTTGAGGAGCTTAGTTTTTCTTCCTCTGAAG
GTCTTACATATTTTAATTTATGCAATTTATTTCTCCACATCTCAAGTTTC
GATGTTAAAAACACCAGTTTTCATGAATGAGCAACTGCAGAGGAGGAAAT
CCTGCCATCCATAGATGGGCTAAGAATCACAGGTGAAGTTTTCCCTGGAA
GAGAAATTCATGCAAGTGGGTATTCCATAGATGGGATCACAACTTGTAAC
TTTATGGTGCGTTTTGTAGTTGTGCTTCAACAAGATGTGATTTATCAAAT
TCCCGTCCCTTCGAATTTGTTCATGATTCACTATAATTCCAATGTTTGCA
GTGGGTACGCCATTTGGAAGATGGATCAGTAAATTACGTAGAAGGTATTA
TGTTTTCACCGTTTGCTAGGAAGCTTTTGTTTTATTGTATTTTATTTGGT
ATTCTACTCCCTCCGTTCCATATTACTCCACACCAACTATTTGTGTGCTA
GGAGGGTTTTATTTTATTGTATTTTACTTGGTGTACCATTAGAAAATTAA
GTAACATTTCCATTGCCTGATGTAGGTGCACATAATCCCACATACTTAGT
TACTGCAGATGATGTGGACTCTTTACTAGCCATAGAGGTCCAGCCTCTTG
ATCCTCTGAGAAGAAAGGTAAATCCTCTCGTCTGATCATTCTTAAGTGGA
ACTTTTTCATGTTGACACCAATAGCTTGGTATGGTTTTGCTCACTGAGGA
GATTCTATAGGTTGACCATCATATCTAAACTATATGCATTTGGTTTGGTT
TATCTCCAAATACATTAATAAACTAGGGATGCGTTCACACATAGTTTTTT
GTTTGGAAACTATAAAATGGTTGACTATTATAACTTTTCAATAGGAGACT
CATGATATCTAAATTCATCTGAAGCATTTATTATATCTGTTTGCAGGGGG
AGATCGTGAAGGTTTATGCTAACGAGCAGAGAAAAATTACTCCCGGTGAG
TTTGTTGAGAAGATATTCCTATATTTCGTACGTAGCTTAAACTTTTGCAT
GCATCTTGTGTTTTTATTGATGAAGTGTCTGTGCTCCATGCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCTCCCCTCTCTCCTCTATAATACTGATATTTCTGTGCTG
GTTCTTCTTATGTATGACAACGGAAAAATATTACTAGAAGAACCATGTTG
CTGATCATAAAGAATCATTATCTGTGCAGATCCTGAAATGAAGGAGCTTA
TCAAAAAAATTCTTTCAATTGGGCATGTGTCTTATGAAACTCTGCTACGC
GTATGTCACCAATCTTTCTCTAGTGGCCTGCCAAAGGCTCAATCCATTCT
AGCTGCACCTATTTTGTAATTTCATATAACCTTTGAAATACTAATTTTAC
AGGAAAGATTTACAGACATGTGGGAACCTGCTGTATTGGCAATAAAGAGG
GAAGGCTACAGCATTAAGTGTAATGGACAGCGTGGCGTTGTCATTACAGA
GAAATTCCAGCAAGCTACGGATGTATGGTTCCAAATAAATCATAGCCCTG
AAAATTACTCTGTTCCATTTTCTGATTGTACTCACCCAGTCACAAAACTT
TGATTCAGTGATTTAAAAAAAAACGAGTATTTTTTTGCATTGCCTACATG
GATTTTATGCTACCATACTTATATGGTATAATTTTATAAAAAATTGGTAG
AATTGACTGGTCAAATTTACAAGGTTGCCAACAAAGATCGCTTATTTTTT
TGTGGCCGTGGGTAGTAATAGCTAGGTTTGTGCTATACATTTTCGTACTT
GTGATTTCTGGAAGGATAAACTGAATTTTGCATCGCATTGGCTTGTTCAG
TATGTAGTGGTCTAATCTTGTACTACGCTTGCAGATCAATATCCCATATG
GCTATGGGAGTCGTACTGAATTTTCAATCCAGTCTGCTGATGGTGTGGAG
TCATATACGCTCAAACCTGCAGATAATTCCCCGTGAGTTTGAAAACCAAT
TCACTACTATTATGTATCATACTACATTTGTACAGTCATCCATTTAGTGG
TTTCACATGTAATCATATGTCGCTGGAAGAATAGTAGTGCCAGTTTATTG
TCATCGTTATTGGGGTATTTATTTTTCTTAGAATGATATGACTTATGACA
TAAAAGTTGCAGATCACGAGATAGCATTGTTCTAATATTGAGGCTGTTCA
GAACGAAGGTAAGGACTCCGGACCCATTCTGCTGGTTTGGATTTGTGTCT
GCTATGATATTATAAATGAAGGAACATGATGGATGGTGCATAGTTAGGAG
CAATAAGTCTATATTTGCTGTTTTCGAATTGAAATGATGACGTGCGTGTA
TTGTTCTTATCTTGCAGGCCGTCGAGAAGAGTAAGAGAAGGAATAAGGGC
ATCTTCTTCAAGTAGAGTGGAGTGGACAAGATGGGGTGATGAGATTTGTT
GTTTCCCTGTAGCTATTTTTTTAAAAGAGTATATATTAATATCACAGAGA
TACAAATTACGTCCAGCCTCTGCAACAACGCAATGCCCTAGCGGCCTTAC
TGATGCACACAGCCAAAAAAAGAAAAAACTTACAAAAAAAAATCTTCCTA
AAGTGATCTACTCCTTGTTGCAGCGGACCAACCACCACCAAGACAACACT
AGAAATCTAACTTCTCCAAAAGCAACGTCTCCAAGAAGGAACTTAATAGT
GCACAAGCGCCATCATCGACCTGATCATCGATTATAGGTTTTCACCCAGG
AGGAAGTCTGAACTCACAAAACAATGCCTCTAACAAGGTCATTGCCAGAG
ACAACCAACTAAGACCGGACCTTGGCCTTTCATCCTGTAAGATTAGACCA
TAAAATCCTCGTGTGTTGTCGCCCCCACTTGCTAGGGTTTTCATGCCTGT
GACTAGCTAGGGTTTTCATGCCTGTGATGACAGTTCACATTGTATATATA
TCATATGTCTGTGTGTAAAGAAAGACAAGATAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.