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GrainGenes Sequence Report: AA034122

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Sequence
AA034122
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA034122
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCTCGCTGCCACCCTGTCCCACCTCCCCTGACCCCACATGTCACCGACA
CACCGCCTCCACAAATCCCCCGAATATTCGCTCCCATCGCGAGCCACGCC
GTCGCCTCTATAAAGAAAACCGGAGCGCCCGGCCTGCGTCGCCACATCCA
TCCATCCGTCCGTCCGACCAAAGCTGCGTATCCTTCCTCACTCCCTCGTC
CAGATCGCCGCCGATCCGATCCACGGTGAGCCCCCTCCTCCTCCTCCGAT
CGCGATCCGCTGCTTACTCCCCTCGTGGGCTGTTGTCTAACGCTCGCGGT
GTTGTTTTGGGGTGCAGGGATGGCGACCAAGAAGAGCGTGGGCACCCTCG
GGGAGGCGGATCTCAAGGGGAAGAAGGTGTTCGTGCGCGCCGACCTCAAC
GTGCCGCTCGACGACGCCCAGAAGATCACCGATGACACCCGCATCCGCGC
ATCGATCCCGACCATCAAGTTCCTCCAGCAGAAGGGCGCCAAGGTCATCC
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GTGGTGTGTGAATTTAAGAGTTACCTCGGTATTTAGATCAGTAGCTATAA
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GCGCCTCCCCATTTAACATGCGACATCCAATTTTTTGTTTGATACTTTCT
ATATAGCTTAATAATGATAACCAATATTAGAATATTTGATGGTATTTTAA
GCATTTTTACCCTTGTACAGTTACTGGTCGGGCAAGTATTCAGAGTAAAC
AATGTTGGTTTCAGCTGATTGTATGTCACCAACATCTTCTCAACACAAAC
ATTAGGCTCTGATCTTTGGCTCAGTAGTGTTATGTTAATTACGTTGCTTG
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ATTATTACTTTCCTCTTTCTAATGTGATCCATTGTTGTATTTTCAGGGAC
GCCCAAAAGGTGTCACCCCCAAGTTCAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGC
CTGTCTGAGCTCCTTGGAGTTAATGTATGTTATGGGACTATATATATAAG
CTCACGATTACTTCTGTTGTCTCTTTGAACTGTATTAAGAGGACTTGTAT
TTCCACAATGTTTTACTTCTGTCAATAGGTTGTGATGGCCAATGACTGTG
TTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTGCTTTGCCAGAGGGTGGTGTT
CTACTCCTAGAGAATGTTAGATTCTACAAGGAGGAAGAGAAGAACGACCC
TGAGTTTGCTAAGAAGCTTGCATCAGTTGCTGACCTTTACGTGAATGATG
CATTCGGCACAGCACACAGGGCTCATGCCTCAACAGAGGGTGTAACCAAG
TTTTTGAGGCCGTCTGTTGCTGGCTTCCTCATGCAGAAGGTATAGCTGAA
ATGAATCTCATTCCTGCAGATTATTTCCTTACAATCATAAATAGATCTTT
AATTGTCATTACATGCTGCTGTTATTGGATTATGGTAATTTGCCTCATTG
ATTGACATGGCTTATTAGGATTTTAAAGTTCAAGCTAGTACTTAAATCCT
TTGCTATCTGTTCCATTTTGCAACCTTAGGCTGACAGTTAAGATGCTTAC
CTAGGTTTTTCATTAAGCTTTGGTAAAAATATGTTAGAACAAAATAGCAG
GGTGCCTAACTATTTAAATCATCCCAGGAACTTGACTATCTTGTTGGAGC
TGTTGCCAACCCAAAGAAGCCATTTGCTGCCATTGTTGGTGGATCCAAGG
TCTCATCTAAGATTGGTGTGATTGAGTCTCTCCTCGCCAAGGTTGATATC
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ATCTGTTGGAAAGTCTCTTGTGGAGGAAGACAAGCTTGAGCTAGCAACTT
CACTAATTGAAACAGCAAAGGCCAAGGGTGTTCAGCTCTTGCTTCCAACC
GATGTCGTTGTAGCTGACAAGTTTGCAGCAGATGCCGAAAGCAAGGTTTG
TTAACGGCTGGATGGTCCTTAGTTTCAAATGTTCTTGCTGTAATTCAACT
GATTGTGCACCAAAGCATGCTTCGGTGTTTGCCTGCTGATGCCCACTCTC
TTTAACACTATTTACAGATTGTTTCTGCCGATGCTATCCCTGATGGTTGG
ATGGGTCTTGACGTTGGCCCAGATTCCATCAAGACTTTCAGTGAAGCCTT
GGCCACCAGCAAGACTGTTATCTGGAACGGTCCTATGGGAGTGTTTGAGT
TTGAGAAGTTCGCAGCAGGAACTGATGTTAGTAATAAACTCTTGCATTGC
ATCCCTTTGTCAATCTGTTGCCATCTTTTTGTTGCTAAGTACAGTTGTGT
TTCCTCAGGCAATTGCCAAGCAGTTGGCTGAACTTACTGGCACTGGCGTC
ACCACCATCATTGGTGGCGGTGACTCTGTTGCTGCTGTTGAGAAGGCTGG
GCTGGCCGACAAGATGAGCCACATCTCGACCGGCGGTGGTGCGAGCTTGG
AGCTGCTGGAAGGCAAGCCCCTCCCAGGTGTTCTTGCCCTTGACGAGGCT
TAAGTTAATTCGGCTGCGCCTATAAGCTTTGCATGCCCTTTTGCTTGGGA
TATCGGTGTAACCTTGCAACCTTATGTTTTAAGGAACCTTGAGATAGGCT
TGTCACCAATTTTTGCTAGGTGAGTCGTGAATAATGATCGACTTCCTCTC
TTGTGAGTGAAGTGGTTGGGAACTGACATACCCCTGTGGATGTGTATGGC
TATCTGTTTCACGCCTTGCATTTTTGCATCCTGTTTCCTGTGTTGCTTGC
TTTGCTGTTATTGTGAATTGTGATGTTAGTTTCAAATTACACCATGTCGC
CTACAGAATATTGTTTACAACAACCTGAGTATGGCAGGCCGATGAAAAGG
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GTCGGTTGCAGCTGCCGTGGGCACTCCAATCTCATCTCCATTTGCCCAGT
CAAACCGCACCCCACCCCACCCCATCGAAACCCCTGACCGCCTAGGTCCA
CGCCGGAGCCAACCCCGACCCTAACCTGGCCAGCACATCACCACGCCTCT
CCCTGCATCTTCACGGAGGAGGCCAGCGGCGCTCGGAGGCTTGCGGGGCG
ATGAAGGAGGACTGGCCGGAGAGCTTGGCTCCTCCGCTGCCGGATTTGGG
CAGGGTGCCCCCTGGCTCGCTTCTTGCGGTCCTTTGGCTTGGGTGGGTGA
CGACGCGCCAGGAGGATGGACCCGGCGCCGTCGGGTCCTGATTCAGATCT
TTGCCTCCATCCTCTCCGTCGCTGGCAGCCATGGTGGTGGGGGCGAGGGA
GGACTGATGATGTACCTGGTGTTTCCTCTCACGATGGTGGGGGCGAGGGA
GGACTGTGTTGTTGGGGTTTTATTCCTTCTCCTATGTTCTTATCCGTGGA
TGACGAGGTGGAGGCTGTTGTTGGAGTTCTGGTCGGTGGAACTTGGTGTG
GATCTCGTCCTGGTATCCGTGGTGTTTGATCTGGAGTTCTTTCCATGTTC
CCCTCTTCTTCCTTGCTGCCATGGGGTTGGCCGGAACCTTGGAGTGGTTG
TCGGGGTGGGCTAGATCGAGGCCATGAGCGCCATCCCTCGCTGCATCGTG
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GACCTAGGAGAGTGTTGCCAAGCAGAGCAACATCGTCGGTGCCGCTGAGC
AGCAGATCAGAGGAGACTGAAGAGAGCAACGCCAGTGTCTTCACCCCTCT
CCACCTTGTTTGCACCCCCTGGCGGACTCCCCCTATCCCTCTTACTAACC
ATAGCTACTGACTCTAATGAAGCCCGTGCATAATTCTTATTCGAATTTAG
ACCCTAACCATCTCTTGCTTTCATAGAAGCTAACCATGAGTCCGTATATA
GGCTGTTTTGTCCAGTAGTGGAGTATCACATCAGTTTGCCTTTTTTTCAC
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TGTAGATACAGATAGTGGCATCGAACTGAAATGCATGTTTACTGAATTGT
GTGTTTAGTGTCATATGACATTGCCATTCTTTCAGACGAGTCCATCTCTG
AATTTCGAAGTTCTGAACACTGTGAGTTTATCTAGACAGTTGCTTATGGG
GGATGCTGCCATTTTCATGTACGCTAACACAATAAGGGCAGGTTATTACC
TAATTTTAAGTTTGGCATGGAATTATTTAAATATAGCATGTGTTGACCAG
AATTGGCTGTTTTATGTTCCTTTATCAGGATGGCTATAATCTCCAATCTC
AAATTTACTCAACCCCATGTTGATCTTCCAGCTGAGGCAGACCAGCACAT
TCGCTACAATTTGAAGCTCGACGAGAAGGTTGTGGGGGATGCACTGACGT
ACGCGTGTGGCCAGACAAACAGAACCAGCGAGACCATCATCTGCAGCCAG
TACTTCCAGCCCAACACTAGGGCGGCGCACACTAGCTACACATTCAACCC
CACTACAGCAGCTCAGGAAGAACGGAGCTTCATGCTACTTCAGTAACCTC
GTGACCAGACTATTAAGGACCCATGCAAGCATGCTCAAACTTACCATATA
TTTGCATTTTTTGCGGGGATATATATTTGCATTCTGCGAACTACAGATCT
AAGGTTTGTGCCCAGTTATCTATAAATAATGATAATGGATAACATGATTC
CATGAGGTGAAAATAACTTACACAACAAATTTTATAGCTGCTCCTTTTGC
TTGCTATATACCTCACCTCTCTTAGCTCATAACACCAAAATTGTCTAGCC
TTCAAAACGGAAAACTACTAAATAAAATGTATCATGCTTTTTTTATGGTA
ATTTATCAAAATAGAAACTTCACAATTATGTGACAGTCAGAAATTTTCTA
CGTAGTAGAAATTATGGAGTATTATTTTATTTTTCAGATATTGGCTGGTT
ATCTTTTCCTTGTAGATACCATTTTTCTCACACTGGCAGTTGGCCTATGA
TTGCAGTTGCAATGGGCTATACATTTAAAAAACATCTATGTGAGTCTGTT
TCTTACATGGTTTGGATTGGTCCTAATGCTAAGCATATTTTTTTACTTTG
ATTCTTGTGAGATGTGCCGAGTCTATCAGCTAGCTATGGTTCAAATATTT
GTTTTAGTGAGCCCAACCTCTGATGTCGTTCCTCCTCAGAACAAGAACAA
GTGAACCATTTTGTCCTCTTTATTTTTGTCTGTATGAATTTGTTGGTTGG
TTATGTTCCTCACTTGAAGTTCTTTTCTTGCTAGAGTTGTTGCTGCTGTC
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TTGGTAGTGGTTAGGATTGTTAACTTGTGCTTCTTATCATACTCGTGATT
TTAATATTGCAACCGTCTTTACGGAGAAATGTTTGGCTGCAAGATTAGCA
TTCCTTAAAAGCTTAAGTGTGGTGATGAGCGAGCGATTTGAGGCTACTTC
CCGAGCGTGTTGCCTGTTTTCTGTCCTTGCATGTGGGCCACCTGCTGTTT
TACTTATCGAACGTGGTGAGCTGGTGGGTGGGAGCGTGATGCGGTGGCTT
CGCTTGGCCACGCGTTCGATGTACGGAAGCTAGGGTGTGCGGTGGTTTTT
TTTCGATGACATGTGGGCCGTGATTTGTGGGTCGTGCCTGTTAGTTCCTT
GCTGGATCGGTCGAACTGTACTTCTTACATTACATGGTGGGAGTTGTTTT
CTGGTCTTCTTGGCTGCTTCGACTGGGGCGTTGTCGGGATTCTACTCTTC
TTTCCTGGTTCCACTAGGGCGGATTTTCTGCTAGATTTGTACCGCGGGTG
GATTTCTCGCTGGCGGTGCTGGATTTCTTGGCGGCGGTGTGCTTCGTGTT
GTTTATTCTGCCTGCCTCGGCGGATCTTAGCTCGGCGTTGATTGTTCGGG
CGGCTGCTGTCTGCGAGGTTCGCTCCCTTTGTTGTTCTAATTTTTGTTGG
ACTTTCCGGCCTGCTAGCTGTCGTTCTCTGGGATTTTGATTTGAGGGGTG
GTTTAGGCCTTGATTCGCGTACTGCCTGCCTACAGTTTGTTCTGTAATAT
TGTCCTTAGTATGTAATTATTGTTGGGACGCACCACATGATTCAATCCAC
TAAAGTAAATTTTTATACTGATTTTCATGGCGTGGATTTAGAAAAGGTAA
ACCATTGAGCTATTCGTTTTCTAATAATTTATGCTCTCTCTATCTAGGAA
TAACTGACTTGTGCTTTTCTAGATTCGAATGTATTTATACACTTAAACAT
GTCTAGATACATGTGAATCTAGATAAATACAAGTCACTTATTCCGAAACA
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GATTAACAATAATTAGGCAATCAGTTCTTGGTTAGGAAGTTATACGCATT
TTGATGTTCCAATTTATTGTTTTTTCTTTCCACCTTTGTAGTTGTATAGA
GATCACATGAAGCAATAATATGATGAATTTTCCTCTGCAAAATCAGCAGA
GTACTACATGCATAATTAATTATCATTATTTTTTTTGCTTCCTTGAGTCT
AATAGCACAGCTGTCCCATGCACATCTTCAGTCAAGTGCATGACCAAATT
AGCTCAAATATACTATGGCTTTATTAGATTTGTTAAGTTATTTTCAGTGT
ACCACAGCATGCAATTGAAATATAATAGTAATTTGCTTACATAAAATCAG
AGTACTTGTGGTTAATTATTATTGTTTTTCTTTCTTGAGTTTTGCTTATG
AAATATAATAGTAATTATTATTTTCAATGAAGTGCCAAGGCTGTATCAAC
ACAAAGGTCCTATAGCTTGAGAATTGTTAAGTTGTTTTCATTGTCAACGT
GGAATGTTAGCGTCAATGTAAATTTCAGTTCTAGGTGTCAAGTATGGAAA
GAGAACCATGAGTTCTTCAATCAAAATGAGAAATTATGTTACCTTTCTAT
TATAGTTCCTAGAATCGATTATCTTAGGACTCATTACAAGTCGTGACCAT
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GTACTACAACATTTGTTTAAATTTCATAAATAAGATGCACCTCATGTTTT
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TTTCTGAATATCTCATATCCATGAATGATTAAAATGCTCATATTATGCGT
CTTCATATATAATCTACTAAAGTCTTATAGAAGTTATAGAAGTAAAGTAA
CAGTCTTTGTCTAATTGTAAGCTTCGTGACATTTTGTATTTTATATGGGT
GCTTCTCCCATATCATTCTCACCACCACCTCTTCTTTCTCTTGGTGTGAG
GCCCCTCAGGTATCCTTGCTACCACCAATTCCTCATGTGGGCGCTTGGAT
GTGACTACCTGAGATGGTGGAGGAAAGGGAGGAGGAAGAATGAGATACAT
CTGTTAGTTCCGTGGCGAATCAGGGAGGCTGCAGAGGAACATGACCATCT
ACCTTGCGCGTTGTGAGTCATAAACCTTGCACGTGCTGAACCGGCATCCG
GACTTAGGCATCTCCATCATATACTTTTGTAATGAAGGGACCAACGTGGA
GCTGTCCCGCTGATCTGTCAAGTCCAATATTTACCCGTCTGACTTCTTAT
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GTTCTGGAATAGATTATTGTATAAGTACAAACATTGTTGGCCAATGAATT
TGAGAACTAGCATCTTATGCTTGCTCATATCCATTTCGTATTCTGAAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.