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GrainGenes Sequence Report: AA004926

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Sequence
AA004926
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA004926
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AAAACCCTCTCCACTAAACTCGCCCTCAAAGCTCCCCCCTTCTTCCTACC
AACGAACCTGGCATTCTCCGGCGATTTCTTCTCGAGTTCTTCCTCCCGTC
CCCTCCGCTAGACCGGCGCGCACTGACGATCCGCCCGGACTTTTTCGATC
GATTTCTCTCGCTGGTGAGGAACCCTAACTTTTTTGAGCGCTGCTTCACG
AGTTTGTGCTGCTGGGGTTTTCTTTGCTGTGACTGAGAGCAATGCCCCCA
AATCCATCCGCTTTTCTCGTCTTCCTTTTCTCTCTGGTCGTTTGCTGTTG
CTGCGTGCTGTATCCGAGTTTATTTTTTCCGATTTCGGAAGAGGGGATGG
GGGGATTGGGGGCGGCGCCGGCGGCGATTCTTGCTGTCCCCAACATCAAC
AGCTTCATCGACTCCACCTTTTATCTTCGTTCGTGGGTTTGGGGGCGGTT
GCTGTACTGAAATCCGCTGCTCTGAATGATCTCTCGCTTCTTTTCTTTGG
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GGACCGCCCATTTGTCCTTTGTTATGGTGGCACGCCGGTTGCTCACACTA
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GTATCATCTAACCTTGAAGCTGGTCATGGTGGTGTGGAAGGGGCTATGCA
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CTGTCGTGCAGCAGCCTGGAAATCAGGTCTTTGTTGAAGCAGGGAATTGC
ACCCAAGAGGCCATGCAGCAGCCTGGAAATCAGGTTTTTGTTGCAGCAGT
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GATGATCCATCCTTGTTTGCAGAACAAGTTCTTCCATTAAGTGATTGCTC
CGAAGAGGCTACGCAGTCTGAACATGCAGACGATGATGCTGCTGCGTGCT
CGGCGATGACAGAAGAAGATGTTACATCATCCTTGTCAATGGCAGAACAA
GTTGCTACTCCATCCTCATCAAGGACACAGCATCAGAATCACAACACAGA
TGCATTGCTGGGTTCCCCTCCCATCTCAACTGCAGCGCCTTTTCCTCGGC
AGTTCTGGAAAGCCGGGGAGTACAAGGGTGCTGCTCAAGCTTCCATCAAA
TGTATGTTCTTAACCTCCTCCCCTTTCAAGCTCGGCACTCTATTTATCGT
CCCACCAGTAAACATTATCGCAGGTTGGGTAGACTCCCCTGTCTGTTCAC
TCCGCTCCTTTCCATCGGTGGGTCAAAACTGCCTCACACACAGTCTACTG
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TTGGTATTATTTTTACATAGAAGATACAATATGCCTTTTATTTTCACCCA
AGTATGGAACTGGGAGTTGTGTTTATGTGAATAATATAGTCCAGCAAAAC
AAAATCCTCGTTATACTGTATATCTCACAGTGTACACTAGTTCCTATTTT
TTGCTTTATTTCATACATATGCCAGAGCTGCATCCGACCTGCACTGCCGA
AATGTTGCATTGACAGAGGCGAGGTACAGTCATGTCAGTCCTGCCAATGC
AGCATCCAATCTTCCTTGACAGTTTACTTTGCCTACCTTTTAGCATTGTT
TGCTTCAATCTTTAGTTGGTTTATTTTTAGCGTTAGTTGGGTTCATGTCC
TTTGGATATATTCCACATCGTTGAGAGATGTTTGATCTATTATATAAGCC
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TTTCTTCATTATTTTTCTGTTCTTACCACTGAATTTTGCAATCTGATTAG
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GCTGGCACATATTTTTTTTATGTCTATGCTTCTGTTTATTGAAAGATTGA
CATGTGCTTAACTCTTATTCTACAGCTATTGCAGAACTGCTCGACAATGC
TGTTGACGAGGTTTTAATTTAAAATATATGTACAAAAATATAAATATTAT
CGACATTATCCATGAATCTCATGCTTTTCTTTATTAATGATTCTTCTATT
TTACATGGGTGACATGGAGCAGGTGCAAAACGGGGCAACCTATGTGAAAA
TAGATAAAGTGAAATATTCTCCTGCTGGGGAGTATTCACTAGTGATACAA
GGTAGCATACAGATATGCGCTATCTAATTGCACAGTGGCTGCATTATATA
TAGTATTTTCTGTATCTTATTTCTTGTGTTGCATGCTCAAGATGATGGAG
GCGGTATGAGCCCAGAGTATCTTCGACATTGTCTGAGTTTCGGATTCTCC
AATAAATGCACGAATTCTTCAATTGGACAATGTAATAGTTTTTTCGAATT
CCTGATGCTGATTGCATTGCTAAGTAGTCACTGACTCTTGGTGAAAACTA
CAGATGGAAATGGCTTCAAAACCAGCACAATGAGGCTTGGGTCAGATGTT
GTCATATTCAGCTGCAGACAAGACAATAGGTTTGTCCTAATTCACCGTTA
GATATTAGCAAATATTGGAAAAATGTTCTAACTCTAAATTAGCAGGATAA
ACCACAATATGAGACAAAACTGTCCTTTTTTTTGCTGCTAAAACATCTAT
CCTTCTTGCCCTTCCATCCTTAGAAAAGTATATCCCCATGGTGTTGCTAA
GAGCGAATTTATCATTGCTGCACTTTGCCATGGAATCTAATTAAGGTATC
CAAATACTTAGAGGGAAAAACAATGTGCTTTAGAAATCTGCTACTGCCAG
CCTAATAGTCCTAAGACACAGATGTTGCAAATTTAAGGCCTTTTAACATC
TGACTTCCAATGTCTTGTGTTGATGTGTTGCTAACTTGGTACCCAAACCT
GTTTTCAGTATTTTTCCCAGTATATCTTTGATTTAGTGATCTAATTTTAA
TTTAGTGCTTGATATGACAACAGATTGACACGAAGTGTTGGGCTGCTCTC
TTACACATTTCTTACAAGAACCGGCTGCGATGACATATTAGTGCCAGTGG
TCAGTTCGTTAAACTTGTCATCATTATTCCAGTATATGCAGTCACACTCA
CATCACCAAGCTTTTGTTTTGAATTTGTACAGTGTAGACTAAATTTTGTG
TTTAACATAATAACTTTTAGTTGGTGATATTTTCAGAAAACCATTTAGCA
TGTGTATGTGTAATTGCGGATTTTTAACTCAGACAAACCCTCTATACTAG
CCATTTCCTACTAAACAAGTGATCTTATTTTCTTCGTAGGTTGACTACGA
ATTTGATCCACCATCTTGTACTTTCAAGAGGATAATGGACCGTGGTGAAA
ACCTTTTCTATTCCAATTTGTCCACTATTTTGAGGTGGTCTCCATTTTCT
ACAGAAGAGGATTTATTGAATCAAGTAAGTTACTACTCCCTGTTTACCCG
TTCAACCTTTTTTGTTGGAATTCTTTCATGACATCCTCTCGGAAACAGTT
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TCTATGATTGCTTAGTCACTTTGTACATATAGTTTTCTTTTCATATCTGG
AGTTCTGGACTGGCTTGTTTTTTCAACATTGTTAGCTGCTTACCTGATGC
ATGTCCTGACAGTTCGGGGACATGGGATGCCATGGCACAAAAATTGTTGT
ATTCAACTTGTGGTTCAACGACGCATGGGAAATGGAGCTTGACTTCACAA
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CTCATGTTCAGTACCCCTTGTGTTTATGTGTATTGCAACACTTGAAAACT
ATTTGTTGCAAAAGTTTTTTGCTAAAGAAAAACTCTGTTGCATTGTGGTG
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TATACCTTCGTCTACCAGAACGCTTTAAAATCATCTTGTGTGGACGAGTT
GTTGAACCCCACCATATTGTCAATGATCTCATATATCGTGAATGTATCGA
ATATCGACCACGAGTTGGAGGAAGCATACAGGTTTGTTCTAGAAAACTTG
TTCAGAACTGATCTCGGCTGCACTGTACCTCTACTGATAAGGCATTGTGC
ACATTTTTCGTAATTAAATTATAGTTTTTCAGAAGCAATGTATAGGACTA
GCTGCCTCATTTGTTTTTGTGTTGGACATTGATATGGTCTGCAATATGCA
ATTTTGACCATGATTTTTCCTATCTATATTGTTAGTAAAACTTATTCAAA
GTATTATGAGATACCAGTAAGTATGGGGTGACATTAGCGCACTACAAGTT
CTTTCAAGAATATTTTCACGTCAAAATCCAAATACTTTAGTTACACTAGT
AGTCAAAGTTTTAAATGGTTGATCGCACACATTCTGAAATGACATCTGAA
AAATAACTAAACATCATTCCTTTTTAGCAATGATCATTTCAATGCTCATG
CTATGTTATTGCACATTAAGTTTTTCAGGGAACTTAGTTTTGAAATAGAG
TTTGCATCCATCTAAGTGTAAATTCTTTTGGGTGGCTGAAAACTATCTAA
TGCAACGAATTCATTTGTTTGGGGCAGGCTGATGTCATCACTACAATTGG
CTTCTTAAAAGGTGCTCCAAAACTGGATATCTATGGATTTAATATCTACC
ATAGGAACCGTCTTATTCTGGTAAAATATAATGTTACCACATGCCCTACT
GCTTTTAAATTTGGTATATGCTTGTTGCTACATACTCCCTCCGTCTGGAA
ATAAGTGACTTGGATTTTTCTAGATTCACATGTATCTATACAGTAAAACG
CGTCTAGATACATGTGAATCTAGACAAATCCAAGTCACTTATTTATTCTT
GTAAGCTCTTTCAGAAAACAACTAGTTTGTATGATAATGCAAGTGCTGAA
TAAGAGCATTGGCCAAAGCACAAACTCTGTATTTTTTAGTATGTTCAGAT
GATCAATGTCCAGTACAGATTAGTTGAGAACTTACTAGAGTGGTTTGGGC
CAATTAAAATTTGGATACAACTTAAAAAGGACTCTCATTACAAAGCTTTT
GCTCCAAGTGGATATTGTGGATTTGGGGTTAACACTTGACTCATATAGGA
TGTTTAGGCGATCCCTCTTTGCTTTAAGGTGATTCCTCTTTGTTTTGAAG
CCTTTCCTCACTACCGAAATTTCCTTCCAGATTGGCTATCCTGAATTTCT
AACGTTACAAATTCAAAATGATATTCATTGTGATAGTGCAGTCACTTTTC
GAACTTCCACTGACTAAATGCTAGCATATCTTATTATATTAATTTATTAG
TTTCTTTGTTCAGCCATTTTGGCCTGCAGGCCCTGAGAGAGGTAAAGGCA
GAGGCATTGCTGGTATGAATTCATACTGCAGTTTTTCGTTTGTTGCCTGT
TCCCACTTTTTTCACTAGTATTTTAATCGAATCAAATATTTTTGCAAGGG
GTTTTGGAGGCGAACTTTATACAACCTACACATGATAAGCAAGATTTTGA
GAAGACAGAGCTTTTCCAGAGACTGGATACGAGATTAAAAGACATGACAA
CAGAGTATTGGTAAGTTTGATGTATCATATATATATGGGACTGAAAGTGC
TTAGGTGCAATACAGCCTTTGGTGTGTACTCATATTTGTAAATGACATTA
GTCTTCCAACCAGATGCACACTTCTCTGTTCTTTTACTGCCTGCACACTC
CGATGTCTTCCTATTATTTATATATATACTGTTTGCGTGCCAACCAGATG
CACAGTTCTCTGTTCTTTTACAGTTTTACTGCCTCCATACTGTGATGTTT
TCCGTTCTTATATATTCGTAATCACCATCTATTTGTGGCAGGAGGCACCA
TGCTCATTTGATTGGTCACCACCAAGTCTCAAAAGCTCGTCCTCCAGAAT
ATTATTCATCCGTTGCTCCTGTCAATGTTGATAGCTCAGCAACTCAAGCT
GCCATAAGGACTTATACCGGCAATAAAACATCTGTAGGGTTGAACCCCTG
TTCCAGTGGAGGTAACTCACTAAATCCTAATCCTTTGCATGTTAGTGCCT
CGAGGGATCAAATGGAATATGGTGCATGCATGTCAACAAGTATATGACAA
GCATACCTCAGCAAACTTGTTGGTTTCAGATCTTCGCCCCCCTTTAATGA
ATACCCTTAACATTTTTCTGATTGACGTAATGCAACCAGAACCGTGCAAA
AGAAGAAACTCTGGCCCGGTGATTGAAATGAGGGCTCAAAAAAGGCAGAA
CATGAATGACGATGCTAACTCTCCTGGAAGTGTCGGTGCTGTTGAGGTTA
GAAATTTTTCAGTTTAGTAATTTATGGTAATCAACTTTCGTAACTCGTGA
GTAATGATTTCATGCTTCTAGGTAGGAGAAGAAAGGAGGAGAGTCTTAAT
TTATCAGAACAAGACGCTAAAGGCCGAGTGAGTTATAAATCATATCTTAG
CTTGTTTTTAGTTTCCACTTCTATTCACTTCCTCATTGAAACGGCAATCA
TTTCTAAATGCATATTTCGTTTTATACCTACTTTATGTCTAAACAAAGTA
AAGCAAACAGTTTATTATCATACAAATTAATCAATTATAACTCTATAAGC
ATGAGGTGCAATTTTTATTATTAAGTAACAAAATTACAAGGATATGCATG
GTTTGGAAAGGAAACATGACAGCCACTTGTTAGTTGTCATTGGGAGACAA
TGTAGAAGACTTGGTTGACCGAAATTCTCGCAAGATTTCTTAAGGCATGG
CCAAATTTGATAGTGCAAGCCAAGCTTTGTAGACAAATCAAATAGCAGCA
TCAGTTGCGAAGGCATGGAAAGAAGCGATTACTGTGGTGAACTGATACAA
AGCTGACATTTGATGCAAACATAGTTCTTTCTTGGTTGATTATGGCTTAG
CAGTGTTGGCAGAAATACATCCATATGTTTACATTCATTAGTGAAATATA
AGTGCTCTATGATATCTCTACGGAGGTGCCTATGGTTGAGGTATCTCATC
TTTGCTTCATGTATATCATAACAGCGACAAATTGTGAACTAAATTTGAAC
ATATTTCTGAGATGTAAACGTAGATAACTTAATTGAGTCTCACTGTAGAT
TATAGCTACCAAAAATACACTTTACTGTTTTACACTGGGTCAGCTAAAGC
TTGTAAATCTGGACCTCTTTCTTTTCCGTGATGCACTCGCCTGCTTCCCA
TTATAGGACGCTGTTCATTTCTCATTCTCTTGCAGCAGCAGTTACACTGT
TTAGTTTCAGATATGATCCCCGCAAAAGTTCAAATGAAGTGAAGAGGCTG
ATCATTTGATTAGCTGGTGTAGGGGTGTGGACAGTAGAAGAGCTTATTTG
TAGTCTGTAGAGTCGTAAAGAATAGTAAAAACTGAATAAATGTATCATCC
CAGCATTTTGTTTTGCCATGGCCCGCACATTTTTCTGATTCGCTGGCTAA
AATTGTTTGCTATTGTTTCATTTTATGTGAAACCCATGTCTAATGATTGG
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CATCCATGTATATCCACTTGATCTCTATATATTCGAACAGCTGATTTGGT
CAATTGGCACTGAACAGGCGAACGAGCTGATGAGCCAACTCCGGGCGTCG
CAGCGGATGCTCAAGAGCCTGGACGACGAGCTGAAATTCTACGATGGCCT
CAACGCGTTCCAACAACACAGGGTCCCCGTCGCGGCCAACAACGGAGTGG
GATGGATCTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.