Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA004557

[Submit comment/correction]

Sequence	AA004557
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA004557
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGACCCACCCCACTGCACCCCTTCCCCACACCCCCCCGCCCGGCCATGC TGTTGCTTCCCTGTTGCCGCCTAGCTCCTCCGCCCATGCCTACTCGAAGA CACAGACACCCAAGGTCGAAGTTTTCTGTGTAATACACCACCGCCGCCTT GCTTCCCCGTGCCACCGGCGCTGGATCTGTGAGCAGAGCTACTTGATGTG CTCTCTGACGGCGAGGAGAAGCCCCAGGTCCCCATCCTCGTTCTCACCGA CATGGCGGGCCAGGGGAGTGCGCTATGCTGTATGCCGGCCACCATCACGT TCAGCTGCAGCTCCACATCTCCTCCGGCGACCCCGTCCGTGATGAACTCG CATCCATCTGCCCTCAGGTGAGAATCTCTGTTTCCCCTATTCTTGAAACA GACTGAGAAACAGTCAAGCATGAATAATAACAGTCAACGAATCAAAATTT ACCAATCGATTTAAGTCAAGCATGGACTGATGGTACTCTCCTTCAGGTCC AGAGCATGTTATCACTGGAGAAATCGCAACATGTTTGTTCATGGATTAGC TATACTGTAAATCGACTTGAGTAGCTATACTGTAATTATAGAATGAGGCA AATTCAACTGTATATTCTGTAGAGAAGAAATGCATTCTGTAAATTCAAGA GTATATTGGCTTGTTTCTTTGTAGAGTATGAGAGGAAAAAACAATAGCTA GAGGATACCCTGAATCTTGCATGTAGATCAGTAGTTGAGTTGATGGATCT GATTGTTTAACGTGACACTATATGCTCCTTCTAATTAAGTACTGATATGT TTACACACAAAAACAAGGTGGATCTGATTGTTGATTTAATCTACACTTGT TCAATAGTATCCATTTTGCTTTATTTGCTTACGCATGATTTAGTTTAGTG GCATATGTAATTCTACATGGTCATCTACCATTCTAATTGTCTATTTCATG TTTCTCTGCAGCTAAGCAAGTTTTTCTACAGGCAGTAGTATTCATTTGAC AAGGACTTGATTCAAGCTACATGAACACCCCGCGCTGCATATTTGATTTG ACAATTGTCGTGGCTGAAAATTTTGCCTGGACAAAAGAAGTTCGACCATT ATTCTAGAAAAATAACCTTCCTGAACACCATATTTTAAGGTATGTTTGTA GTATCTTTTCTTGCAATTAGAACTTCCTGGATAATTGATGCCTAGCATTT CATCATAATACTAAATATTTTCTATGATCTATTATGTTGATCTTGTTATA CTGATTTAGTTGCCAGGTGGGCTTTGTCCCCTGTAGGCCTTTTCAAAAAT ATAATTCAGTTGGATCCCTTATTCATTTGTGTGCATCTTTTAATGTTTAT TTGTTGGCGAGTAGTCGATAGTATAATGATCCTTTGGGTTTAGGATGAAA AAATTGAAATATTTCTGGCATGACCATCTGAACAAAATTATGGAGTACTA TCATGTTGCTTGTTAGAGAATACTTCTAACCGAAAGAATAAAGTTGGTTT GTTCATACTGCTGCCTTATTTGTGTAACTGCACATGAGGTCGATCCAACG AGGTGTTGAACATTAGCAACATCATGTGTTGGAGCCTTTAGCATTATTTG CTCCTACAGCTGAAGAAGTGGTAAAGTTTGTCCTATTATTTCTAAATTAG GATAATCTTACTATTATATATAGTAATATGGTAAATCTAGCCTCAGATCG ATCGGCAAATGTTAAAACTTGGCGAACCACAAGTACCGCATGCATGCACC AATAGCTGACATCAGCATTTAATGCAGAAAACCGAATATTTAAAAAGTTT TGTAGCGTAAATCGTGTATCCGATTAAAAATTTGTTTTCACATCTAGTCG CGACGAGATCTTCGAAACTAGACTCCATATTGATATTTTTTTAAATCAGT CCAAAAAGTTATCAATCCCTAACACGTGAGTTATCCATCATAATATGTAA GTTATCACCCTGTAACATATAAGTTATCCACCATATAAATGAATTAGATG GAGACGCCCTAGTATTTCTCATGTGTGTAATATTTATATTTTTTGTCTCA TCAAATCTATGTATTTTAGTTTAGTTAATCAAATGTGTGCTATGAGCTAG TTTAATTGAGACGCATCGACAAACTATGAGACTCGGTACCCTAACACTCT TCGAGGATTCATTACCCGTACGGCGACGGACAATGAAACTGAACCGTTAG ACTATTAGTTGTGTCTTATGTTGTTCACTATAACTTAGTGTGGTGGGTGG GATGGGGCGTAAGTCCCTATTTATATTATCGTATAGAAAATAAGTTTAGG TCTAAATATGCTTGATCTTCGACACGGTAGCCTTTCAAAGTTGAGTCGAC ATACGTCACGAAAGTAGCGATAGACGACGAAGCCGGGACGCTAGAATAAC TTTTATATTCTATCTGTTGGTAAATTTTTATAGTGATGGATAACTTACAT GTTATTGTGTGGGTAAGTTACATGTTGAAGCCTAGATAACTCTTGTATTA CTGATGGATAACTTTTTTAAACATGTGAGTTATTCATGTCATAGTTGTAA GCTATTCACACTATAACATATAAGTTATCCATTATATAAACGGGTTAGAT GGAGTCATTTCTCATGTGGATATTTATATTTTTTTGCCTCATGAAATATC GATTAACCCATGTATTTTACTTTACTTAATTAAATGTGAGCTATGAGCTA ATTTAATTGGGACGTAGTAGTCTAGGTGTTATTAGGGTAATAAGACTTTG TCGCCCATAGCGGCAACTTGCGATAAAATCGAGCCGCTGGAAAAACTTTT GTATTCTACCTATGAGTAAATTTTTGTAGTGGATAAATTACATATTATTG AACGGATAACTTAAATGTTGAAGTCTGGATAACTCACGTGTTATAGGCGG ATAACTTTTAGGTCTCAAAAAAAGTCGTCAAAACATATCAATATGGGATC TAGTTTCGAAGATCTCGTCAGGACTAGTCCAACAATAAAAACGAATCTTA AATCTGATAAACGGTTTAACCTACAAAACATTTTAAATTTCATATTTTTA AATTTAAAAACAATACGTGAGCATGTGTTGTCGTTTTGTGTTTAGGAACT AAGCAAATCTTAATTACTACTGGGCTAACCACATGCATGAGCCGTGCTCA TTTTTTTGACCGTATGCATCACGGCTTGCACGGTGGCCTGTCGGGAAGAA TTGTCTGATCCGCTGAAATTGAAATTTTATAGAATGTCCGCCAGGTAGCA GACTCCTAGTAATATGTAGGATCTTTATATCTCACAGTTCTTGTTATATT CGTAGACCGTTTTAAAAGCAATTAACAAAAGGGAGTCATAAACAGTGGTG TCTATTAGGTTTTCAAACGTTCTATTGAGAAAATTAATCGTGATGGAGTG ACTCTAAAAGCATCTAAATTAGGTTTGCTGATTTTTTTTCTCATCATATC TGGGTTCCGTAACCGCAGTTAAGAACATGACCTTGCCAATATTGTTCTTG TTCCGAACGGTGCGCAAGGGATCTTCTTCTTCTGGGAGTAGGTAATATGT TATGTTCCTCGTTGTCATATCAAACCATTTTTCATCGATATGTATTATGT TCTCCATAATTTTGAACGAAGGCATTGCTTTTGTTATTGTTGCTTCATCA ATTATTGAAATGCAAAATTTAAGCCTTTTGATTTGATATTGTTTTCCGCT GACTGAAATGGCTTAAGACTGCTTGTGTGGCGCCTTAAGTCGCCCCATGT TAACCTTCTCTGCAGTGTACTGTAAGGAACATCTAGAAACCTGGCCAGCG CCCTTAGTGTATCCCTTTTATTGAGTTCAACCAGAGGCACCCTTTTTGTT AGACGAAAATTTTTCCTCTTTCGACCACAATTGCCTTTCCTTTTATTTGA AATCAACTTCTTATTCCTGTTTCTCCATTTCTAGTCTCTGTTTCCAGATC TTTACAATGGTTCGAAGACATACTTTCAAAAGTTGGACAACAAGTTCTTT ATCGGCCTTCTCAACTGGTCTATGTTTGCTAAGTGCTTTCAAAGCAATAT ATGCCATAAATTTGTCCTTCTCTAGCAAATTTATATGTTGTCGCTGGGCA ACAGTTTCTTCTTCAGGTATCTGCTCTGGCTGTGCAACAGTTTCTTCTTC TTCTTCTTCTAGTATGACGTTGACATCCTCCTCTTCCTCTTCTAGTCTAA CATTGAGATCAAGATCCATCCTTCTAAGATCATCTACGAGTATGAGGTTG ACATCCTCGTCTTCCTCTTCTAGTCTAACATTGAGATCAAGATCCATCCC TCTATCCTCCTCTGGAAAAATGTGCGACTTGTGACGAGCAGTAGCTTAGG ACGCTCAAGGATCTTCCTGCCTCATGTACCTGCATGAATGAGCAACACAT CTATGAGTTCATCCAAGAACAAGGTAATCTATGAACATTCCTTGCATCCA AGTTTAATTATCTATCCCTGCAGCTAGAAAAGAACAAGGTATTTTGACCA AATATTCAGCTAAATGGAAAATATTCTTTAATTAGAGATGATCTTTAATT ACTCCCCTATCACTTTTGAAATGCATTTTCTTCCTCTATCAGTTTTCTGA ACCTCTGTGCCTGAAGCAGAAACATGCCTCTCAACCAACTTAGTTATGAC TAGTGTCTTAGATTCACCTCTTTCTGAACCTTGTGCTAATCTTGATTACT CCTTGTTGTAGCTACTGGACATAACATACATGTACATGGCATACTATTAC TTGTTTATTGTAGCTGTGCTAACCTGATATCACATACATGCCATACTATT ACTTGTTGTAGCTACTGGACATATTACTCATGCATGTCCTGGAGGAGGTT ACTTCTACTGTCTATATTTTCTTATTTGCTATAGCCTATTTATGTTGAAT GAGGATAAACAGGACCAATGTAGAACAAGGGTTAAGACAATTTGAATTTG CTTTCCGCAATACTATTGAACCTAATTGAAAGGAACAGATAGAGTTAGTT TGAATGATTGAAAGGAACAGATAGTTACTGGCCTGGCGTTTTTGCCGTTC TTGATAAGCATCTGGTTTGCACTGTGGCAACACAAGATAAGATTACCATT TTTTGGCACTAGATTGTCACTTTGTTGTTTTGGCCATTCTTGATAAGCAT CTGCTAGGAATACATACATTTTCCTGAAAGCATACGCAAACTTACCAATT TCCAGTATCTACATAGGCAAGGGTGAGCGCTTGCTGGAGCCGCAGGGAGG AGGCCGCGGCGACGGATGAAGGCCGGAGGAGCTCGACGCGGTCCTTGTTG TTTAGGTCGTCCAGCAGTGCGAAGGAGCTCCACCTCCCCCGAGATTGCTG GGAGGAGGCCGCGGGGAGGATGGAGCCGCAGGGAGGAGCTCCACCTCCCC CGAGATTGCTGTTGAGGTCGTCCAGTTGTGCGGATGGAGTCGCAGGGAGG AGGCTGGAGGACGACGGACCTGGACCGGCGTGCGGGCACCGGTGATAGCG GTAGGGGCCGATGATCGCGGGCTCGCGGCTGATTGCGAGGATCATGGGGC GGCGAGGATCATGGGGTGGCAGTGATTGCGGGATCCCAGGGATCACGGGG CGGCGTGGATCGCGGGCACCGGGATCGCGGGGTTGGGATTACACTGATTT GCAACGATTTGGAGACAGTTTAGAGTTTTTTGTAAATACTGCTCCCGCGA ACAATAAAACGGGTTGGAGGGAGTACATACATTGAGATTAATATAACTCA ATGCCAAACTATGATTCACGATTATCTTATTTGCACTTCACGAAAATACA ATTGTTTGGAAACACTATAACAAATAATATAAGAGTAAATATCTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.