Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA004052

[Submit comment/correction]

Sequence	AA004052
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA004052
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGAAGGGCTCACAGGCCCAGGCGGCAATCCGTCGGCGGCCTTGTGCGTG GCTGCTCCGTCTGCTCGTTGGCGTCGCTTTCCTCGTCGAGATCGCGTTCC TCGGTCGCATCGACATGTCGAAGAATGCTGCGGCGGTCGAGAGCTGGACT ACCTCCTTCTACCGCCGCTCCGCAAACTCGAGCCCTGACGCGCTTCCGGG TGGCGGGGACGACGATGCCGACGAGATCCGGCAGTGCGAGGAGCGGCTCG AGAGGGAGGACGCCGTGCCCTACGACCGCGATTTCGAAAGGGACCCCGTC CTCGTCGGCGGCGCCTCTAAGGCATGTCACTTCCCTCGTACTCTACATTT TATATTGACGCTGACAGGCTCGACGGATCTGCTGCCTATTTGGGTCAACA TTTATTTTTGACAGCTCTTAGTTGGGTAGCTTTAGCAACGTCTGTACAAG TTCCAGTGATCCCTCCGAGTTTTTGTAGAAAATCTTGCCAAGGTAGTCGT CATATGAAATTCTGGGATTTTAGAGTAATACTGTAGATATTTTGATCGAA GCTTGTAGAGCTCTGGAGGGCGGACCATGCACCTTGTCAGGCCGCCTGCC TGATACTCCACCGAAGAACATCTCCGTCAGACAAGCAACGGTTAGGATCT GCGGATAGCGCTTCGCCAACCATCTAGCGGCTGTTATTGAAGTACCCAGT TGAACTCTGTGTTTCGCGTTAATCGCGTTTAGCCATGTAATAAACTACTT AAGAACTGTAATGTAATGCATCTGTAAGCGTGGTCCTGCTCTTCGGATAT AAAGGAGCAGGAGAGGGAGGTCGGGTGGCACTACTAATAATGAAACCCTA ATTTACCTATTCCTGTCTTGCTCCTACTTTTCCTAGCTGCTACTCCCTCC GTTTCAAAGTATAAGATGTTTTAGCTTTGTGAAGCAAAACATCTTATATT TTGAAACGGAGGGAGTAGATCTGAGTTGCCGGCACTCCCTCTTCTCCCTC CTCTCCGGCATCTTGTTAGAGGCCACCGGGTCCTAACACACCTAGAGCTA TACTTAGTGACACGATGCCAGTGTTTGGACTTGCTATCTCCCGTAGGGGC TTACTTAGTGACACAATGCCAGTTTGGACTTGCTATCTCCTGTAGGGGTT TAATTGTGTTTTATATGCTGCGTTTTGAACTAGTTTAACTTGGAAAACTA TCAGAAGAAGCTCGTTACTGTTACAAGGATCTCTTCAGGTTGCTTGTGTT TGTTTTGGAGGTTATGTCAACGCTGCAACCCCTACTACGATACGTCCTGT AATCAGGATACCGTAATAATTATCAAGCACAAATACTGGGATACATCCAG TAATCAGAATACCCTAATACTTATCATGCACAAATACTGGGATGAGTCCA ATCCAATAATCGGTCTGACCAAGCTCACTTCCACCCCTAATTTGTAATTG TACTTCAATTGTAAATTTGAACAATATGATCTTGTTCCTTTCATTGGCAT CATTTATGAGGGTATTGAAGAAGCTCTTAGGAATCAGAATTTTTTATATA TACCGGTAATAGATTTGAATACATGTGGTGCCATGTGTAATCACTAACCG TATAAACAAAAAAGCAGGCTTGATTCTAGTGGGTTAATCAAGAAACACTT TCTGAAAACAAAATGCTTCATTGCCTACTTTGTTTTACAATGTTTGGACG TTTAGTTGTTGTGTCTCATTGTTCACTTAACCATACTTGATGCCTCATAT GTACCAACGCTAATGATTCCACCTTTTTTTTTTTTGCTTTTTTTGTTGTT TCCATCTATAATGCTTATGCATTTCCCCTTCTCAGGATTGGAATAAATGT TCTGTAGGATGTGAGTTTGGATTTCCAGCTAGTAAGACACCTGATGCTAC TTTTGGAATGGCCCCAGATCCTTCCATAGAGAGCATCCTCAGATCAATGG AATCATCTCGTTATTATCCATGGAACAGTATTAACGCGGCTCGAGGGTGT GTAAGAGCCAAGTTAATTCTGATTGTTGATTTACAGTTCTTTGCCTGTTT GAAATGACGTTAACTTATTAACTGTGGTCAGAAAAATTACAGTGCCTATG ACCAAAATTCAGAACTGATATGTGCTTCCATATATAAGATAACTTGACAC TCTGTCCCAGCCTCCTAGTTCGTTATGATGTCTATATTAAGTGCAATGTT TAGTGATCTAATCTATTTGTAGGTTCCATCTTTGATTATCTAACTTTAGA ATATCATAAGAAAGTATGGTGGTATTATTTGGCTATCAGATCAATTTGTT GCTGACTTGTAACAGCTATCACTTCAAAGAAAATCTAAAATGAACACTGC GTTGTCACTGGCTCACTTGGAACAATATTTTTTATCACGTATTCTGTATG CCCCACTGTTGAACCATTGTGTGTGCTCCCTGTAGGATTATTACTTCTGA TAATTGTTATTGTAATTTAGGGCTAACTCTAATCCTTTCTGTCACAGGAG AGGGTACCAAATTGTGATGACAACCAGCCTTTCATCAGATGTGCCGGTTG GCTACTTTTCATGGGCTGAATATGATATCATGGCACCCGTGCCTCCGAAG ACTGAAGAAGCCCTAGCTGCAGCCTTTATTTCCAACTGCGGTGCACGCAA CTTTCGTTTGCAAGCCCTTGAGATGCTTGAAAGCTTAGATGTAAAAATCG ATTCTTACGGTAGCTGCCATCGTAATCGTGATGGCAACGGTACACTTTTC TTTCAATACCTTGCTAGACATAGTGCTATCATTAAACATTTCAGCTTATA AACAAATGCCGGATATGCTCTGTTGTTCTTATAAGGCCGTATCTAGTGGC CAGCTTCAACCAACAAATGAATATGGTATGATGATATTAGTTGCAATGCA AACGATAGCGGTACTGAATGCTGAATATGTTGTCAATGTGTATTTTTACA TTGAGATGAATTACTAATTGATTCTTACTTAGTATGGCACGATAATATTT TGTAATCTTGAATTTTTTAAGAACATTTTGTTGACGGTTTGGGATTTGGT CTTATGTAGCGAGCAACTGCTAACTTCACATTTGACTTGAACATTCAGTT CTTTCAACCTGCATATGTGCTCGTAATTTGTGTCTATGAGGTACTGGCAA GCCCACCTCCCAGGCCCTTTTACATGTTTGAATTGGGTAATTGACAAGGG GTTTGACTGTATTACATGGCATTGAATGTTTATTGGTTCAACACATGATG CCATGTAGCACCTACTTCCCTAATTTGAATGATGAAAACACTATTAGGTT CCACTTCGCTAATTAAAGTTCTGGTTTGTATCATTATATAGTTCTTACTC CCACTTATTGCAAACATGAACTTTTTTGGACATCGCAACTATCTTTATAT ATCTTTTTTGTTGCTTATTAGGTCATCTTACAATTCCCAAAAGAATATGT ATTAGTGTATTTCACAATGAGTCACAATTTTGTGTAGCCAATCTAGGTAG GTTCTTATATACTGATGACGGTCAAATATGAAAGTGTTTGTATCAGCTCG AATTCTAGAGTGACTTATGTTTGTCTCTGTAGGTTGTACATGTTTTTTTT ATCCATGAGAACAACGACACAATACTTTATGCTTGAATTTTGCTGTTATA TTACAATTTATTTGATAAAATAATTGTAATTTGTACTTCATTTGCTGCCT GGATGCAGTGGACAAAGTGGAGACTTTGAAGCGCTACAAATTCAGTTTGG CCTTTGAGAATTCTAACGAGGAAGATTATGTTACAGAAAAGTTTTTCCAG TCACTGGTAACAGGTAATAGTGTATGCTATAACCACTCACCAAAACACTA GTGCACACCTAGTTTCACTCACACAATTTGCATGGGGTAACTTTATTCAC CATCACTTGACTCATAGTTTATAGATAATATTTTGATGACATGGAAAATG TACAATCTCATCAATTGAAATGTTTTGTAAAAATATCATTTTCACGAAAC TGGACAATTTATTGTGAAACATAAAAAGTAGCATCAAACTGATTAGAAGA ATTGCGATTTTTCTAATGTATGGATTTATCATTTTGTTGCTATGATGCAT CTTAATTTCAATTTGAGGTATTGATTTACATTTTAAGTTCATGAAAGTTT TAATTTGTTGCTGGAGTGGAAGTGATTTTCAGTATTCAATTTGCACCTCA TTTACAGGGTCCATTCCAGTTGTCGTTGGTGCACCAAATATTCAAGAGTT TTCTCCAGGAGAAGGTGCAATAATACACATTAAGGAGCTTGATGACGTTA CTTCAGTTGCTAGGACAATGAAACATATTGCATCAAATCCTGATGCTTTT AATCAATCTTTGAGGTAGATATCCTGATTTGCCTGTTGACCTCAGCCCTG AGTGTGACATGGATAGTGTACCAATCATTTTGTTCGAACAGCACATGTTC TCTTGCCAAAGTTTAGACTCATTTATGATCTATATTTGCAAGATACAGTA CTTAATTAGCATGATAGCGATGGACATCATGGGAACCATGTTTATTTATG CTAAGCTTAATTCCAGTTTGTTAAGGAGTAGGCTGTGTTACATTATGAAC TTCACTATGGTGATGCTTTCACTTCATTTTTGTTGCATCAAGATCAGGCA TTAGTCACCATATCTGGTAAATAAATGACTTGTTGAGGAACCAAATTACT GCCCACTGGATCAATTCCCCAATGTAGATAGGCTTTTGCGTGGTCCTGGT ATTTGGGTATTTTTTGCCAAATCTGCCCAAATATGGAAACTTCAACCGAA TCTGACCCCTCCCCGAAACTAATTCAATCTGACCCCTGGGATCGGCGCCA TTTTAAATGGAGCCGAAGTTGTACAGGTCGGCGCCAACACATCAGAAAAC CGAACCGAAGGAGGTCGGCTCCATTTAAAACGGCGCCGACGCCGGCTCCA TGTTAAACGGCGCCGACCTCTCTAGGTTGCCCCCTTGTTGTCACGTGTTG GCGCTGACCTGTATAACTTCGGCTCCGTTTAAAATGGCGCCGACCCCAGG GGTCAGATTCCGAATTAGTTTCGGGGAGGGGTCAGACGTGGAATTAGTTT CGCAAAAATGTCAGATTTGGCAAAAAATACGGTATTTGGTACTAAAGCTT AGGCTACAATCTTTGACTGTGACTGCAACGGCATGAAAATGACCACCTAC TGGCTTAAATGACGCAGGAACTGCTTGAATTAGGCTTCACATTAGGATCG AAAATTAATTTGAACTGACAAATACTGTTGTAATAAGCTATTTGTCTGAA TGACGGTGCTAGTACACGATATACTACTATAAGCTTCTACTGGAGTAGAA GTGGTCTCTTGTTCTAGTACCTGTCATGAACTGATCTCTTTCATGATTGT TTGGACTAGGTTAGATTATGTCATGACCTATGGTTTGATCAAATGTAGGG TTGATTATACTGTAGAATTTCCATGAAAATAGGTGCTTACTACTGATGAT ATCTTAGCTTACACTTTTGTCAGATATCTTCTAGCAACCATTGTTAAGTG TCTGTAGATTCTATACTTAAAATTATACTCCCTCTGTCTCAAAATAAATG TCTCAGATTTGTCAAAATTTGGATGAACCTATATACTAAATAGTGTCTAG ATTCATCCAAATTTTGACAAATCTAAGACATCTATTTTAAGACGGAGGGA GTACCATTTTGTTTCCATTTGTAGGTGGAAGTATGATGGTCCATCTGATT CTTTCAAGGCACTTATTGACATGGCAGCGGTTCATTCATCCTGTCGTCTC TGCATACATATCGCTACGAAGATTCATGAAAAAGAAGAAAGGACTCCAAA ATTTATGAATCGCACATGTAACTGTTCCAGCAAAAAAGGAACAGTATACC ACTTATTTGCTAGAGAGAGAGGGAGGCTTAAGACAGAAAGCATTTATCTA AGGTATGGAATGAATGTTGTACTTACCCTGTATTGGTGTCTGGTATTTGT AGTTTACATCATAAACAGCCAAGAGGAACAACAGCAACTTTATGTCCTAT ACTCCATAGTCCTAGCTGCTGTTGTATTTATTTATCAGTAAGCTGCATAT GTTGCTTAACTACTGCTATTTTGTTGTCTAAGGTCTTAAGCGCTAGTTCC TTTGCATTACAGAATTAAGTTATTTTTACTGCATCGTTTTTTTGCTTGTT TTATTTCTACATTCTTATGCTTGTTTTTGGTCTATGCCATGCAGATCAAA TGAATTAACTTTAGAAGCTTTGGAGTCTGCTATACATGCCACATTTAGAT CCATCAACCATGTTCCTGTATGGAAGGATGAAAGGCCATCAAGCATACGA GGAGGGGACGAGTTGAAGGTGTACAAAATTTATCCAGTTGGTCTTACAGA ACGAGAAGCATTATACAAATTTAAATTTAGTGATGATGAACTTGCTAGAT ACATTAAAGATCATCCATGTGCAAAGCTTGAGGTAATTTTTGTATAACTA TGATATAACAATTTTTGTGCCCTTTGGCAACCCCAAACTAGTTCTGTGTG TTCTTTTTTTTGAAACAAGGCAAAAGATTTGCCATTTTCTTTAGACAAGA GGAAGTTTTAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.