Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA002036

[Submit comment/correction]

Sequence	AA002036
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA002036
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCGGTGCCCACCAGAAGAAACCCTCCCATTTCAGTCCATATCTCTTCAGT TCCCCACTTAAACCCCACGCCGCACCAGTCGCCGCCGGCCGCCGCCACGC CCTCACCATGGCTCACATCCGCCTCCTCGTTTCCCACTCGAGATGCCGCC CGCATCCTCAACGCCTCCTCCCGCTCTTCCGATTCTGCTCCTCCAACTCA AGCAACTCCCCACCGCCGCCCATCAAGCCCGTCTCCTACGCCCCGAAGCC GCCGGCCCCACCCGAGGAAGCCCCCTCGTCGGAGGCCCCGCGCGCTAGCC CCGACTCGCAGGACCCGCTTCCGAGGAGATTTCAACAGCAGCCGCAGAAT CCGCCGCGGCAGTTTACGAGGCAAGAGATGCGGTTCGTGAATGAGGCCGG GCCCGCGATCGCGCCGGTGTCCTACCCGAGCAGGGTCGCGCCGCTGCCGG AAGACCGTCCAACGGAAGAAGGGGCCGGCGAGGGGGCGAAGGAGGCGGAT CTTCGCGGCGAGGGGGAGCGGATTGAGAGGGAGGCTGCGTGGTCGAGGAG GCCCATGTTCGGTCTGCAGGTGGAGGAGGAGTCGGTGCCGTACCCAACGC TGATACCCGTCGTGAAGCGGCCACAGAAGGTTGCCATTGATCTCGTCGAT GCACTCCGCGAAATCAAGGTCCGCACTTCTAGTGATTTGCTTTATCGCAG TTCGAAATTACAAATCGATATCCTTGGTGTGGCTCCATTGGGGATTATAG TTCTCTCTAATTTACAGATGGTTTGAGTGCTATAATCTTTAGATATTTGC GCCGAGAAAAACACCTGATCTGAAGTAGCATGATTTTGTCTGGTTTAGTC ATGGGGATTTAATAGGTCTTTGTTTGACTGAAATGTAACAATAAATTCTA AGTTGCGGTTAAGCCAAATTTTGATGTTTCTTGTTGTGGCAGTAGATGCT AGCCTACTAGGCGGAATACTCCTACTTTCTTAGGCCGCCTTTGGCATTGT GGTGGACTATGATAATCCTGTTTGATTGAGTTGCTCTGACCTATTTTCCT GGTTGGTTACATGATTTTGGTTTCATCAACAAAAGAATAGTTTAAAAGTT CTGGCTAACAGAAATGTAGAAAGAGATATCAAACTGCATAAGTATAGTAT TTAATTTTCCAGTTTAGTTAAATTACAACCTGTTTACCAAACAAGGCTCT AACTGCTTCACAACTACCCTAGAATAAGTTGAGCAACCTCAAACTGGCAC ATGATCTATATTTCTATATAAATGCTATATTTTTTTGCCTTTTTTTGGGA ACATTGGGTTGTGCGGAAAGTTTATCTGATGAAAAGGCTGAAGGTGCCAG TAGGTGTCGTGATGGGCAAAGATTTTAATGGCATGGGTAGGATAGTTTAA ATGTCATGGGTAGAAAAATCAGAGAACTGAGTAGGTTAGTAATAGCATAT AGTAAGCAAGATTTTTTTATTGATTGAACCAAAATGATTGCATGCTTAGC CTAGCGGAAGACCTGGAGCGTACTAATCTAGAATAGGTTTCTACCAGCTT ACTGAAATTAGACTCTCCAAATATCTTGCTTAACACTAAATGGACCTAGC CTCCCTTGCCTTATTCTGCTTATCCTTGCAATACTTCAGCTGTGGCAGAG ACCGTCAGAGCCCGTTTTCTGTGTCTTCTACTGCTTCCTCTGCACTGCCT AGTCTGGATCCAGTGCCAGCACCGTCTCTTCTTTTCTGGTTGCTGGCTCG GCATACCGCCCTACTGATAATGCCTTCCTGCGTCAGATTCCACGGCACAT TACATGTTCGGCAAGTTTTATTTGGGCATGTGATTTGCATTTGGGACTTG AGATGCTGCACATTATGCTATGCTCTTCTATTACAGTGAAATAGTGAAAC CTAAATGAATCTACTATACAATTGTGTGTTATACAACTGTAAACAGTCAT GGGGCGTTTGGAATACATGATACTAGAGCATAGGATTCCTATCCGATAGA TTTTTTGGCACCTCTTGCAATTCAGGAATCCACCCAGGAAAAACAAAATG AGGTTCCCATCCCACTGATTTCATAGGCAAAGCTCAGACCACCACACTAA CCTCATTTTTCCTAACTCTGCATTGGTTGTAGCAAATGAAAGCGGCGTCT TGTTTTGAGGGCCACAAGTACCGCACCGCTTGTTTGAGATGCTGTGACCG CCATAACTGCAGTTGCTTCCAGACTTCCAGTGACTCTTATTGATGATGGC GCTACCATTTTGAACTAGATTGCCATTATGCTGCATCGATTTAGTCTGGG AGGGAGAGAGACTTGAATGAACTAACAGCCATAGGGAGGGACCAAGAATG ATAGATTGCTTGGGTTCGGTCTTTGTTATTTGAAGAATTGAAGGCATCAT TACTTCTTGTTTGTTTATTTATTGCTTATGTACTTGGCTGGACCTGTGAG TGTGTCCAACATGAAGACTTGTTTACAAATTGCTTCATTGACGGCTGGAA CCAGCCTCGACTAGCACATCCTTGACCTTGCTTAACAGGATTCATGAGAT TTCCTTGTTTTTCCCACCTATTTCCGTTTCTGTTCCTGCGTTGCAAACAA GGGATTTGCAGCATTTTATTGCTACGGCACTGTACACATACATAAAACTT GAGATGATGCTGTATTGCTGCATGCTTCATCATACCTGCAACCGGCTTGT TGATGACATCCTGCTGCCAACATGCCTCCCAAGTACTTTTTGATCTTTTT ACTGAAATGCATCTGATATTCTTAAGAATTATTTCATGATGAATTATTTC TGTAATGAGAAGCCTGAAAGAGTCCTTATTCAAGCAGCTAGATAATAGAA CAATTGATCTGAACAGAAGAAGTTGCAATTACTGTGTGCCAGTTTAGGGC TATATTGCAGCACCACTATAAAACTAGATCTTCAACATTACTAAGAAAGA TATATTTTTTACATTACTAAGTTGCAGTTGATGACAGGAAGTACAGTTAC ATGATATCTCATACCAATTGGGATGGTAAGAGGTTGGTATTCATCGTTGG ACAAACACCTTATGTATTATACATGGAGTAGCTGTAAATTTTTTTTGGTG AAAAGATAGTGTAATATCCAAAAGAACGTGCTTGTGAGAATAGGTTACTT CTGAGGTTATTTTGTTGATGCCCAAATCCAAAATCTGGTACAAACATATG TTTTGGAAAATGTCCAGTGGAAACCACCCTTCTGGTGAAAACCTCTAGAA ACCAGGTTGAGAGGTTTGGAAAAATTATATAAAAAAGAGTATGCTGGGGA GAGGTGATGTTCTATAAATATGTTAGAACTTGAAGATCAAACTCAGTGGA ATTCTAATAAGTATGAATAGAGGAAAGAAAAATTAACAGTAACATATTAC GGAAATCCTGTTCATACTAAATTTTTAAATGCGATTGGGTTTGAACTCGA AATTTTGTAGGTTTATAGGACATAACCTCACCTACATATGGTATATATTT TAAAAGTTTCTTCTATAACTTGTACACATGGTTTCCGTGGAGTTTTCACT GGATAGTTTCTCCACCTTTTAGCTACAAGATCTTTCAAAAATTTAACCGC CTTGAATATCTTCGATTAGTAGGACAAGTAGTAGAGGCCGGTTGAAGTGT GATGAAGTGCATAAATTTTGATATTTCATCATCTTTGAATATCTCAAAAA GTATTTACTTCAAAAATTCTCTTAGAGGTTTTACAATTTTTTTGTTCAGG GTGTCATCATGATGTTGGGTTGGAGAACCAAATTGTTTTTGTCAAAAATT AAAGAAAATGATCAAGAATGTTGTTTTGGTCCTATATTATCGCCTAATGT GGTTAGCTTTCTCCTTTACATTTGGGACCTCTGCTGGTTCTTCACCCTCA TGGTTGAGCACTTATCTAGATATACTTATAAGTCAAGATGACTTGTAACC CAAGAAGTGTGTGAAAATGTAGAAATGCTTTTAAGTTTCCATAGTACTCC CTCCGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGCAAAGAATCTAATGGTGTTACC CTGTTCTGTTGCTTTCTTCCAGGCCAGCGCAAATGAGAAGGAGAGGAATT TTACTGAAACAGTGGAAGCTCATGTAATGTTAGGTGTTGATCCACGTCGT GGTGACCAGGTCTGCCGCACTTCTTAAGAAAGTACCTTAAAGTACACATT TTATCCTGCTAAGTTTTCTCATGTCACAGTTCTACTGGAATATGGAAATT TTACTTGCCATGATACTGAGTTAATGATTGATATTTTACCAATTCCAGTA CAAAAATGACTGACAGTTTGTGCCATCATGCTTGCTGGGAAGCTAAAGTT CTCTTGCGTGAAACCAGTGTAGAAGCTATTTAATTTAATAAGGATGCTAC TTAAATGTTTTTTGTACCCATTGAGGTCTATCTAATACTCCCTCCTTGCC AAAATATAGTGCATATAAGATTTTTTAAAAGTTAAAAGAGATAAAATTTG ACCAAGTATGTAGAAAAAATTATCAGCATCTAGAATACCAAATCAAAACC ATTAGATTTATCAGGATGTATATTTTTGTATGTATACATTTGGTAGTGCA GATATAGATAATTTTCTAAAAAAACTTTGTCAAAGTTGATGAAGTTTGAC TTAACAAAAAACTTATGCACTATATTATGGCAAGGAGGTAGTAACATTCA TATACAGAAGAAATGTTGTCCAGGGGTTCTGTGCTTGCAAAAAGAACTGA TGGTTAACTAAGGCTTCATCATTTGATTAGCCAAGTTACCTCAGGATAAT TTTATTTGTGCCAATCTGCTCGTGAATGTTAGATTGATAGAAAGTTATTT TCCGACACTGACCAAAATCTTTCCTGGTGTATAGATGGTCCGTGGAGCCA TAACTTTGCCTCATGGCACTGGCAAGGTACCTTTCTAATTATCAGATGCA GCCTATTTATGCAAGAATTTTACAGGCATCACACCTTTTTCCTGCGAAAC ATTAAAAAACTTGTTGCGTTCCCAACATGGCCTTGGTTCTATAAGTGCTT AACGTTGAGGTCTTTATTATTTTTAAGACTGTCAGGGTAGCAGTATTTGC TGAAGGTCCTGCAGCAGAAGAAGCTAGAGCTGCTGGAGCAGATGTTGTTG GTGCTGATGAGCTAATTGAGGAGATTCGGAAAGGTACTTCATTTCCATCT GATGATGTAGGAGTTCCTTTACTATGTTATGGTTTTTTTAACTTATTTTC CCTTGAAATATCACCTATTGCTACAAGTTCTCACTCTAGTACAGCTTTGT AAACATATATCAGATTGATGTTTTAGTTTTCCATCTTTGATGTTTGAAAT CATTGTTGATTGGGAGTTCTTTTCCACTTACGATTATATATCTAGGAGGA GGCAAACTAAGCTTCGACAAGTGCATAGCAACCCCAATGTTCATGCCTCG GCTTTCAAAGGTAGTAGTGCGAATTTACTGACATCAATGTTATTTCATGT TTGACAAATTATTGACGACCTGATTGATTTGCTTCCTCAGATTGCTAGAA TATTGGGTCCTCGTGGTTTGATGCCAAACCCTAAGGTAGGCATCTTCCTA TTTCATTTTATTCTGGACTTATACTTAAATATTCTGCCTTTGGTAACACT TCAATTCTACAGCTCGGGTCTGTTACAAATGACGTTTCTGGTGCTGTCAA AGCGGCAAAATCAGGCCGTGTTGATTTCAAAATAGACAAAACTGCTATAG TGCATGTTGGTCTTGGAAAGGTATGGGACATCAGTACTAATGGAAGATAT GCCTAGTGAATTTATCAATGTGATCGCATATATATCTAAGCAATTTTTTA TACGTTGCAACTCTGTGCCATGCCTCATTATTGTTTCTGTTTTTTTTGCA GGTGAATTTTTCCGAGGAGAGTTTACGTGAAAATATTGGCGCTTTTGTAA ACGCACTTTTACTTGCTAAGCCGGTTGGCTTAAAGAAAAGTAAGTGATCT GCTGGTCGTGCTTATACACAAGTATTTTTGTTGAACATTGTATTATGAGT GAATATTTTTCATGTATTACAAAACTCCAAACATGTTTTAAATAGTTGTA GTAATATTCCTTATGTTGACAATATATAACTGATATTATGCATGAACTTG GAGTCTGACTGCTCTACCCTTTACAAAATGACTGGTTTAGTTTTGACTAT TCTCTCGTGACTTCAATACTTTGGGCGCTTGATATGAAATGGCTTTGGCC AGTGTAAGAGCCATCCGGACCTCTAATTCATTCTTGGATATTAATTTTGC TTCATGTACACTTCAACTTTAGGTTGTCTCTGGTAATTGTGACGATGCTA TGAAATCCAAGTTGTTAACAATCTCCCTTTCTTTCAGCTTCGAAATATGT TGGATACGTGAAGAAGTTTACGTTGAGTAGCACAGTAAGTTCTCTTCCCT TCCACAGACCTATCGATTCTTTCCATTTTCTAGGGATGTCAGAGAATACT TCACACAAAATGTAATGACATGCAAAGATGTTTGGGTGTTCATATTCTTA TGAACTCATATGGTTCTTTTATGACAGCAGTAGGGGAAAACCCTACTGAA TTCGTGTTAGAATAATGATGATAAATACAAAGTTTTGATAGGCTTAGAAG AAGGTTGAAAAGGGTACATTTTTAGGTCAGAAAATCTAACAGACTAACAA AATTGAGAAGGTTGAAAAGGGTACATTTTCATGCTACACTGGCATTTTTT TTACTTTCTGCATAGGCCAATCAAACTGCAATTATGCAGTTTCTTTGTCA AAACTCTTTTGTTTTCTGAAACTAGTTGTCTTGACATGATTCGTGCAGCG GCATCTGTACTGTCCAATAAGTGGTCTTGTGAAAGACTGACAATTGAACC TCTAGTGTGCCTGTACTGTAGTATCGGTTTGTACTGGTTGATCATAGTAT ATGAATTGGAATGGCTGCTAGTGGCACATGTCAAGTAAGATTAAGGTTGC TTGTGATATTTGGCTATTTGCATGTAAGCAAGTTAATGAGTAATTGTTAG GGACAATAACCCCAACTTCATCAATCAGTCATTTTCAGCTGCAACATCTC CTTGGATTCTCTTATCTTCTATGTCTCTTACTGGAGGAATTTTCTTGCAG ATGGGACCTGGATTTTCTGTTACCATACCCTCACTATCGGCGGCGGCTGA TAATTATACCAAAGTGCAAGTCAGCTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.