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GrainGenes Sequence Report: AA039586

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Sequence
AA039586
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA039586
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGAATGTTCAGCAATCAGGTCCTCATTCATCAACTATTAATGCAGCAAGA
GAAGGAAAGAGGCGAGGAAATTACGCTAGGTAGGAGGAGGTGATGAGCAA
GGTGGACATCATGGAGATGGGCGAGGCAGCAGCGCAAGAAGAGATAGCCG
ATCACGAGTCAGAGAAGAAGGAGGCGGCCTCAGCCGCGAGCAGGCTGCAG
CTGTCGTCGTCGTCGTTGAGGGAGGCGCTCTCCTCCTCCTCGTCCCTGTC
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GCGAGCTGAAATGGGCGGCCATCGAGCGGCTGCCCACCTTGGACAGGCTG
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GTGCATATCTACTATTCCAATTTATGTAATCCCAAGATCAATTTTGGTAT
ATAAATAAATTTTATGGCTTATTTTTTTTTCACTTGTGAAAAATGTCTTA
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CAGCCAGCACCAGAGACTTACGACCTTTTTGATGATATTATCTTGATGGC
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TTGAATCATGTGGATTTAAGTGCCCCAAAAGAAAAGGGTGCGCTGACTTT
CTTCAAGAGGTATTTACTAAAATACTAAGTTTTACATGGAATGACTGATT
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TCTTTCTACCTATACAGTCAGGCAGAATGGCGATCTGGCATATTGAATTT
GTTCGCCATATGCATATCATTTGGTGAATATGTAACAACTCAACTGGGTA
TTTTATGTTTCTAGAGCAGTGCCAATTACTTTTCTCTTGTAGAGATATGT
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AAAGCGCCGCAGCTACAGTGTTTTTTGGTTAAAATACTTACAGTTTTCAT
TATAAAAATCGATTCCACTTACATCTATGCGATGTTTCACTTTTCTCAAC
ATGACCGCCATAATTAGCATACTACATATTTCACTGCAGCTTGGACTACT
TGCTATTATTACCGGGACAGTATTTCTTCGCACACGTATGGGTGTTGACA
GAGTTCATGCTAACTATTACTTGGGTTCAATCTTTTATGCTCTCCTGCTT
CTGATGGTGAATGGATTTCCTGAGCTGGCCATGGCACTTGGCAGACTCCC
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CAATACCATCTTTTATCCTAAAGATTCCAGTCTCTTTAGTTGAGTCAGTA
GCTTGGACATCAATATCCTACTACCTGATTGGCTATACTCCAGAAGCATC
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TACCTAGGATTTTTCATTGAAAAAAGTTGAGATCCAGGGGGGTGGAGAAA
AAAGATTAGGGAGAGAGAAAGAAATTCAAATTACATAAACCGAAGACAGG
ATAAAAGTAGGAGAGACTAGCTCTCTCTTCCATCAAACCATGATTGGACG
GCGCTTCTCTCTCATTTCTTGGATCCGAGACCACAGCTTCACCAGATATA
TGCGTTGGTTGGCAGCCAGCCACTTCCACAGGCACTTCGACGTCGCCAAA
AACTTTCCTGTTCCTGGATAACCAAACACCCCAATAAGCTGCTATGCTCA
CCAGATCCCACGCCATTATTTTGCCGGCATCACATCCCTGTATGGAAGAT
GTCTTCCAGATCTGGTGAAGGAACCACCAACTCAATTATAGCAATATTGT
CTGTTGTCATTCCGGACTTATCACCATTACCAGAAAGTCATTCAGAGTAT
AATCACCTGAGTTTAAATATATATATCCCTGCAAAACAAAAGAGTACAAA
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ATTCCTTTATCCAGCACTTTATTTACTTCTCTTTTGGAATTTCTTTCCAC
AATTTTTTTTTCAAATGCAATACTTTGTGTTAACATGCACAATTCTTGTG
TTTAGATTTTTCAGTCAGTTCCTCGTCCTCTTCCTCATCCACACTGTATC
ATTGTCAATGTTTCGATGTGTCGCCTCATACTCTCAAACAATGGTGGCTG
GTTCGGTCTTTGGTACATTGGCATTTCTACTCCTCCTTCTGTTTGGGGGC
TTCGTAATTCCTCGCCGTAAGACATTCCCTTATTTTCATATTGCTAGCAA
GAGATGATTGATAATTTCTTGCAAAAGTATGTTGTACTCGACTATGAAAC
AAGCATCACTAACGTTTTCACTTCCTTACTGTTACAGCATCTCTTCCTAA
TTGGCTAAAATGGGGATTTTGGCTCTCTCCATTGTCATATGCTGAGATAG
GCTTAACTGGAAATGAGTTTTTAGCACCAAGATGGTTAGAGGTACACTCT
AGCATACCAACTCTGAACTAATTGTAAAACTGGTGCAAACTCAAATGATA
CTAAAGGTTCTATGTTGACAGATCACGGTTTCTGGTGTAACAGTTGGAAG
GAGGATACTAATGGATCGAGGGCTAGACTTCTCCAGCTACTTCTACTGGA
TCTCAGTTGGAGCAATGATTGGGTTTATTTTACTGTTCAATGCCGCCTTT
GCTATTGGCTTGACTATTAAAAACCGTAAGTGCACGTGGCTGAAACTTCA
TTTTAGCTAAACAACTTAAATACTTGTAATATCAATCAATCATATGCTGG
AGAAAAAATAATGTTGGAGGTGGAGCAAAAATAGTTCCGTTCAGAAGAAC
ATTCTGTTTGCCCTGGTTAGACCTGCCATCTGTTCTAACCTCATGTGGTC
TCTCAGCTCCAGGAACTTCTCAAGCTATTATCTCTCGCAATAAGCCTAGC
ATGTTTGACGGAAGAGACCAAGATATGTCCAAGGAGACCGAAAATGGGAT
GCCCAAGTTACAAGCAGAAACTGCTTTGACACCTAATAGGACTGGTTAGT
CAAATTATACAAGACGCAACTAAACACGCAACTCATGATGTCAATGGAAT
AATTAAGATTTGACTAATCAGTAATTGAATCTTGTGCAGGGAGGATGGTA
TTGCCTTTCACACCCCTTACAATATCATTCCAGGATGTCAACTACTACGT
AGACACCCCTGTGGTAATTCTCATGTAGCTTGAATATCTATGAACACATG
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TGCAGGAAATGAGGGAGCATGGTTACATGGAAAGGAAACTACAACTTCTC
CACAGTATCACAGGAGCATTCCAGCCAGGTGTTCTCTCGGCACTCATGGG
GGTTACTGGAGCTGGAAAAACGACACTCTTGGATGTTCTTGCTGGAAGGA
AAACAGGCGGTGTTATTGAAGGGGATATAAGAATAGGAGGTTATCCTAAA
ATTCAGCAAACTTTTGCTAGGATATCAGGCTACTGTGAACAAACTGATGT
TCATTCCCCCCAAATCACAGTGGGCGAGTCAGTAGCATATTCAGCATGGT
TGCGGCTTCCACCAGAAATTGAATCAAAAACAAGAAATGTGAGCTAGATG
AAAGAATAAGCATACTATACAGGGTTTGTATACTTGTATCGTGGGTGCTT
AGAACAGTTGAGATGAAAGTGTGAGCTCACCGTATATCTTATCATCGCAG
GAATTTGTCAATGAAGTTCTTGAAACAATTGAGCTGGAAGAAATTAGAGA
TTCTTTGGTTGGAGTACCAGGGGTGAATGGACTATCAACAGAGCAGCGGA
AACGGCTCACTATTGCAGTCGAGCTCGTGTCTAACCCTTCAATTATATTC
ATGGATGAGCCAACATCAGGCTTGGATGCAAGGGCAGCTGCTATTGTCAT
GCGTGCAGTGAAGAACGTTGCAGACACAGGTCGAACAGTTGTGTGCACCA
TTCACCAACCAAGTATCGAGATATTTGAGGCATTTGATGAGGTAACTACT
TTATATATATACCCTTCTCCACCAAGATATCAGTTTACTATGATGGTTTT
CAAGCGTAAAAAATCCAATGTATGTTCATCATAAATATAGTATTATAAGG
TGATTATATTGGAGAAAGTTATCAAAAATCAGTTTTTATCAAATCGTACA
TGAAGTAAACAAGTGCTACAACTCCGGCCTGAATTTACTATGAAGCATTT
ATTTGCCTGACACTTAATGTTTGGACCTAGAATAATTGGAATTAGCCAGG
TCCTAACATTACTTATCAAACAGGGAATAAATTGCATGCTGCCTCAAATA
GAACTAGCAACACCTTATCTACCAGAACTGAAAGTTATCAAACCATATTA
TTATTAACTGGCTACTTAAATAACCCTAAACTAAGTCCCGTGCAGAGTTT
AAACCAAGGGTTCAAGAAGGTAGCAGTGAAATCACTGACTTTTGTGAAAG
AGTGACACATGATCTCTGTTGTATTATTCAAATGAGCTTACATGTTCGTT
CATGAGGTAGAAATTCCAAGATTAATTGGAAAAATAGGAAAAAATCTGGT
ACTCTTATCTTGGTAGGGTTTAAACGATAACAATGATGATTAATAAATGT
AGTATATGAGAACAGCTCCATACATTTTCCAAATATAGTTTTTTTAAAGG
AGAGTTTCCTCTTCGATTTCTATTTATAGAAAGGGTATTGCTACAAAGTG
TTTGCTACAAGAACCAACAGAAAATAAAAGGAGTTCTCGAAAGAAAGAAG
TCCAGATGAGTAATGTTTGGTATCGCTGCTGTCTCCATCAGTTGATCAGC
CTTGCTCTGGTTCATGTGCAGCTGCAGATTCTCTGCTTCCAACCTTCCCA
GCAGCAACTACATGCCCGGCACCTTTCCAGCAGCAAACCATTCAACCAAG
AACATATTGGGATCTAGCAACATGTACAACTGCATATTAAACAAAACCAT
GCCAAAAAGTTCTTCACTAACATGGTCTTGTCAGTCTCTATAATAGAACA
ACATGTACACCATGATCCTGTTAGTCTCTGTAATAGCACAACATCAGTAG
CTACACACCATGTCAAAAAGTTTAGGAAAAACACCACGACCAATTTTAAT
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GATGCAATCGGCTGCAGTCCTACACCTACGAGTGAAAGACATTGGATGTA
GGCATGCAGCACAACATTGGATAAGGTACAGAACAATTTACCATGAGAAA
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TGACATCAGTAGCGACCTAATTTATTCTGTCAATCGGCTGGAGCGAGCTG
CTGCAACAGTTCTGTGGCGGGCACTCCGAGTCCAGGACGGTGGCCGTCTT
GGCGGGCACTCCGGCGACGGCCAACAGGGCACGCAGAGGGGTGCCCTCCG
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GCTCCTCGGCTGCGGGGGTGGCGTGGTGGCGGCGGGCGGAGGTGCGGTGC
GGAGGTCGCGCTGATGGACCTCCAGTGCCAGATCTAAAGGTGCTTCCCCT
AACGCTGCCCTTCTCGTTTCACCACGCCGGCCCTGGATTCGTTTTGGTGG
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TTGGCCACCGGCGGCGGCCACGACGTCGACGCTGAGCACCGTTCTCCCTT
CTTGAAGGCGACATCGAGGTATTTTCCCCCACCCTGACCTTCCTGTCGGT
GAACACCCAAAAGCTTCGGCTTGGGCAACGGTGGCGTTCCGACGTCATAC
CCTCCATGGAGGCGCCGCCTTGAGATAGTGGGTTTGGTAGACGAGCTCGG
CGGTGGATGATAGGTAGCTGGTAGCGGTTGCTCTGTCTTAGGTGTTGTGG
TGATGTTGCTGGCCATGTGTTGTGCCCTGTTCCCCGGAGGTGTCTGCTCA
CCGGCGGGTCGACGCCTTCGAGCCTGGGCGAGAGGGGAAGTGCTCCCCTC
TCTGGTAGCAGATTTTTCCCGGTCGTCGGCCTTGTTCCTTAGTCAGCCTT
GTATCGGCACATTTTCTTCACCGCATCTTCGTTGGCGTCTCTTCCTGGCA
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CTATTTCCAGGTATTTTTTTCTCTTCTGAAATCAGTAGTACTAACTCTTC
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CACGGTATCAGAGCCCTAGGTTTTTTCCAACGCACGGGCAACTCGTGCTC
CCGATCGTTTCTGGTCTCCCATGCCATTGGTTGGTCGATGGATTTGTGCT
GCTCCTGACTGGATTTCGTAGCCCTGACATGTATTGAATCATGCTTCTCT
TGATTGGATTGCGCCTGTCCGGATTGTCCATGCCCCCGCCCCCATAGGCC
GCATTCACTACCCCATCTTTAGCAGTGGCATCATCATCTGTGTCATATTT
GTGTCTCTCATCTACTTTAGTTCGTCGTGACCTTCTTGCTCTGTCTCCGA
AACGTTCCATTGGATTGTCAGGGTTGTAGGTTAGGTAGAAGATTCAGTTA
CCTTATCGCCATAGTGAGTCTATGTGTCAACGTTCCTTGATCTTGTTCAT
TATGATGTTTGGAGCCTGACCCCCATTGTTTCGGGAGGGGTTCATCGCTA
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TCATACCCAATTCTCCACTCCTATCCGCGTATTTTGAGTAGAATCTATCG
GTGAATGCACATATTTCTTACTGAGTGGGGTACACTTGCTCAGTTCTCTC
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CAACGGTTGCGTAGCAACCATGGCAGTGGAACGAGAGCGTGTGAAGATCA
TAGGCGGGTCTGCTAGCAGTGGCGACCGTTGCCAGATGCAAATTTCCTGG
GATGTGACTTTTGTTGAGTCTGATTTTCCTAACGCCCTCATCTACCCATG
GGCATGTTCGACTTATCATTTGCATGATCCACATTTATAGGATGAACTAA
AACCTGCAACACTAGCAATAATATTTAGTTCTGCCAGTGTCTTGTCATAA
ATAATCCAAAACCCTTTTAGGGGTCCTAGATGTACTTTCATGAATCATGA
TGGCTTCTTCATCTCCCAAGAGAAGTGCATCCATGATCTTCTTGTTCGTG
CAACTCTTATGGATGAGCGTACTGGTGAGGCTCCAGTGGAGCTCAGTGTC
CACCTCTGAGCTTATGATGGGAGCCTCTTTGATCTCACTCGCTATCGTCA
TCTTGTTGGGAGTCTATCTAGTTATCGCTCATCATGATATCTCGTAGTCA
TTTCACACTCGGAGTCAGTTTGTCTCTACTCCCATTCAGGTTCACCATGG
TCACCTCCTTTGGGTTCAATGGTACCTTCGTGGAACTACCTCCTGTCATC
TCTTCTACACTTGTTATAGCTACGGGCATATTCATTGCTACTTGGGCTAG
TGATCCTTCGGATCATCAGTCGCTTTCTACTTTTTGTGGTTCTCTCATTG
TCTAGAAGGCGAAGAAACAAACTACAGTTTCCCGTTCGGAGTGCAAAGGC
TTCCAGGTCTTAGTTCATTACAGCTACAGGCATATTCATATGCTACTTGG
GTTAGCGCTCTTTCGAATCGACGGTCTTTTTCTATTTACACCATTTTTTT
GTGCTTCTCTCATTGTCTGGAGGACGAAGAGACATACTAAATTTTCCTGT
TTTAGTGCAAATGCTAAATTGCGAGCTATGGCTCTTTTGCTAGCAGGGCT
GAATTGGCTATGGTGTTTGCTTGGGGATAATGGTGTTTCTGTCACTACAC
CGACTCCTCTTTGTTAGACAATGTAGGTGTTGTTAGTATTGTGCGTGACC
CTATGAAACATGAGCACACCAAGCACATTGTGTGTCGATGCTTCCTCCAT
GCACTCACCTGTGTGAGATCATGTTGTTGCTCTAGACTATGTGCCTTCTG
AGTTACATTAGCAAATTTCTTCACAAAGGCCTAACCTAGAGGCTAGAGCA
CAACAGTTTTTACCTCTCCAGACTATGTCTTGTTGATCCACCACGAGTTC
GAGGAGGGTTGTTAGAGTTGTATATACTTTCCATGTATTATCCCATTGCA
TAATGGGTTTTCTGCATATTTACCACACATGTATGTGCATATATCGGCCC
TTATGGAAATATAAATTCATATTTTCTCACAACATAAACTGGTGAAATAA
TTTTCTGTGATTTTCTAGGCAATACATGGGGTACCAAGGATCGAGGACAA
CTACAACCCATCAACGTGGATGCTAGAAGTTACTTCTACATCTATGGAAG
TTCAACTGGGAGTAGATTTTGCACGGATATACAGAGAATCAGCAATGTGC
AAGTAAGTTTCGAAGAACCAGCTCACTTAGCTCTAGTGCCTTAACAATCT
TAACTATATGACTACATAGTGAACTATGAAAGGCGTGTAAAACAGATTTT
CGAACCTTCCACAATTCTTGAGAAAAACAAAAAAAAACAGGCACGTGTCT
CTCAAAAACTCAGTTTTGATCAGAATCAAACATAAGCATGGGTCACCATA
CCATACTTAACAAAGCTCTCATTTAGTCTTTAAATTAAGCTTATAATAAT
ATTCGTGCTAACCAGTATGTAAATTTGGTGATCAAAGGGACAAGGACATG
CTGGTAAAACGCTTGAGCATACCAGCTCCAGGTACGAGCGATCTCCATTT
TCCAACACAGTTTCCACAGAAGTTTCGGGAGCAATTCAAAGCATGCCTCT
GGAAGCAGAGTTTATCGTATTGGAGAACCCCTTCCTACAACCTGGTGCGA
ATGGTGTTCATAACAGTCATATCCATTTTCTTTGGTGTATTATACTGGCA
GCAAGGCAACATCAACCACATGTGTGTAAGCTGTCTCTTAATTCTATATC
TTTACTGGTGCATCAATTGGCAGCATATGATTGAAGTGTCTTGTTTTGTT
TGAGGGTAGAAACGACCAGCAAGGTCTGTTCACCATATTGGGGTGCATGT
ATGGAACCACTCTGTTTGCCGGCATCAACAACTGCCAATCGGTGATGCCA
TTCGTCTCCATTGAGCGCTCCGTCGTGTACAGGGAGAGGTTTGCGGGGAT
GTACTCTCCTTGGGCCTACTCCTTTGCGCAGGTCCTATTAATCACATGGA
GATTACTAGTTTCAGACAAATTATATTACACTTATGTGCAGACACTGACT
TTTCTTTTTGCGAGATAGGTTGCCATGGAGATACCTTATGTGCTAGTACA
GGCAGTGCTGTTCATGTTAATAGCATACCCGATGATAGGGTACGCATGGA
CAGCAACGAAGTTCTTTTGGTTCATGTACACCATGGTGTGCACGCTGCTG
TACTTCCTCTACCTTGGAATGATGCTGGTGTCGCTCACCCCCAGCATCGA
AGTCGCAACCATACTTTCATCCAGTTTCTACACCCTGCAAAACCTCCTGT
CTGGCTTCATTGTGCCTGCGCCAGTAAGTCAAGCCATCTAACTCTAGCAT
ATATACCATCAACTTTTTGGACCAAGAGGATGGTGCTTAAAAGGATTTCA
TAAACATATGGCAGCAAATACCAAGATGGTGGATATGGCTCTACTACATC
TCCCCATTGTCGTGGACGCTCAATGTCTTCTTCACCACACAATTTGGGGA
CGACAACGAGAGGATGATCAACGTATTTGGAGATACCAAATCCGTTGCAG
CGTTCACGAAGGACTACTTCGGTTATCGCCATGACCTGCTGCCACTATCA
GCCATAGCTCTGGCGGCATTCCCCATCCTCTTTGCTATCCTCTTCGCTTA
CAACATCTCAAAGCTCAATTTCCAAAGGCGATAGACACAGAGATATTTAA
AGTACTTAGTAGCACGCTATAGAATAGATATTACAGGCAAGTGCATCCCT
GTGTACTAAAATTTAAAAGCATGTGTCTGCTTGCCAAGTGCCAACACGAA
AAGGTCAGTGTACTTTTGTGTAACAGTGCAACAGAATTACCGTAGCGGCT
AGCTACTGGATAGTTTTTGGGAAGCTGTGTGATATTGTTTCTAATAGAGG
CTCTTAGGCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.