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GrainGenes Sequence Report: AA037098

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Sequence
AA037098
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA037098
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTTTCTCTCTCTTCCCCATCGGCCAAGCCATGCCTTCTACTACTACTCCC
CCCACCACATCACAACCCACCGCCTTCCCCCCTCCTCCGCGTCCTCTGCC
TCTCCCCTCCTCCCGTCCACAAACCCTAACCCTAATCTCGCCGACTTCTC
CGCCGCCGCTGGCCGTCCACGCCGCTGTCCCCGTGCTCTCCTCGGCTCCT
ACTCCACCCCCGGAGCGTCCTTCCACGCGCACGGGCGCGCGGGGGCGCTA
GGGTTTCGCCATGGACCCGCGCCGTCCTCCCCCGCGCGGCGGCGCCAACG
GCAACGGGTTCTCCTACTCCAACCTCTTCAACCTCGAGGTAGTTGCTCGC
TTCCTGTCTCTCTTGTCCATCCCTCCTCGCTTGACTAGAGGCTTCTGCGC
GTGGTAGGCATCCGTTGTATCGGGGGCGAGGCGTGATGGGGTCTGGGGAT
GGACTGTGGAGCTCATTGTCACTACACTCGATGAATTCTCTCTGGGGGGG
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TATACTCTTCTCCTGATCACTGGTGTTACGGTTGCCCGGTGTACCAACTG
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TCATTCTAATATCGGTTTTTACTGGACCTACTGCTATAGCCACTGCTAAA
CTTTAAGGTCCCTTTACCGGAAGATCTTGATCGCTATGGGAATAGTAGCC
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TGTATTTCTTAGGCTTCAGTGTGTCTTGTTGCTTACCAATTTTTCCTTCA
AGGTCAAGCGTCATTGTCCGATCAGTACAATGGTGTGAGTGATGCTTCTC
ATGGGTTGCATCGGAAGCGGAAAAGGCATCCTGGTGTTGCTAGCGATGAT
GAGGAAGCAGATGACTACAGTAACCAAATTACCGAGGAGCACTACCGTAC
AATGCTGAGTGAACATGTTCAGAAGTACAGAAGGTCCAAGGTTAAGGATG
GTGTCTTTGGTTCGGATCCTCCTCGGGCAGATGTTCGCCAAATAATAAAA
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GATATCTCAGCGCATATGGTGGTTTCAATAAGATTGTAGCTTCACTTGAT
TCTTCCTATTTGGATATGGGGGATAATGTAAGCTACTTAATTCCAGAGGG
CTATGACAAGTTGGCATCTTCCCTTAATCTGCCTGTTTTTTCCGATATAC
GTGTCGAGGAGCATTTCTTGAATGGCACGCTAGATCTGCGCACCCTATCA
GCAATGCTTGGCACTGACCGGAAGTTTGAGGCTACCAATCGTGGTGGATT
AGCCGAACCTCAGCCGCAACATGAATCGCTCCAGGAAAGGGTAAAGATGC
AGAAATTTGCTCTTCAAGTAACTGAGGACCCCTTTGCAATTCCAGAAGGA
TCAGCAGGGAGGATACGGAGGTCTATTATTTCAGAATCTGGCAGTTTGCA
GGTTCATTATGTTAAAGTTTTGGAAAAAGGAGATACATATGAGGTTGGTT
TCAGCTCTTAAAATTTTATTTCATGCTGTTGTATTTGTGTACTAAGCAAT
TATACAATATCAATGCAGATTATCGAGCGTAGCTTGCCAAAGAAGCAAAT
ACTGAAAAAGGAACATTCTGAAATTGCAAAAGAAGACTTGGCAAGTTTTT
TGAAACGCTGGCAAATTATTGCCAGAAACATTCCAAAGCATCACAGAAAT
TTTGCTGCTTTGCTGAAGAGACGACAAATGGATGCTAAACGCTTCTCTGA
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GTATCATTTCACCGTGCTCTAGTTTACGTTCTTGAACCACATGTATTCTG
AAGCTTTAGTCAATTTCTGTTCAACATCCAGGTGAAGCTCAAAGTAAGCA
GGTCACTGAAACTGATGAGAAGTGCTCCAATACGTACAAGGAAGCTTGCT
AGGGATATGCTGATATTTTGGAAACGAGTAGACAAAGAGCAGGTATTTGT
CTCAAAAGCTTTCAAAGGTTTCAAATGCAATTATTAAGTTATGCAGTCTG
TCTTTTATTAGGAATGGTATATCTATTTCACATTCTCAAACTCTATGAGT
TGATTATTCTAAAGCCATCTCTTACATTCCTTTGGTCATTGCACTCTATA
TACGCACTAATATCTGAAGTCATTCTTAAAGATTATAAAGCTCATTCTTT
GTGCCTGTTTCATAGTATGAGTTGAGGAAAAAAGAGGAAAGGGATGCAGC
TGAAGCTTTGAAGAGAGAAGAGGAACTACGTGAAGCAAAAAGACATCAGC
AGAGGCTCAACTTTCTGATATCCCAAACAGAGCTCTATAGTCACTTTATG
CAAAATAAGGCCGGCGAATCAGCACTACCTGATGAGGGATCTGTCCCTGA
GGATGACGAGGAAGAAGATCCCGAGGAAGCCGAATTGAAGAGAGAAGCTT
TAAGAGCTGCTCAGCATGCTGTGTCCCAACAGAAAAGGATGACAAATGCA
TTTGATAGTGAAATTGTGAGACTTTGTCAATCTTCAGATCCCGGTATTCC
AACTGACGATTCAGCTGTTATGGAGCCTAACAAGATTGATCTCTTACACC
CGTAAGTTCTCTTGAAAATTTGTTTTCTCATTGCAAGCAAGCATGATAGA
ACAGGAGTATTATTATTATCTAAACTGAGTGCTTGGGGTCTTAACTTCTT
TTCAGCTCAACAATGCCTGAGCAGTCATCTGTGCAGACCCCGGAGTTGTT
TAAAGGTGTATTAAAAGAATACCAGTTAAAGGGCTTGCAGTGGCTGGTCA
ATTGCTATGAACAGGTTATCATAGAGCTAATGTATTTCGATCACTCCTGA
TGAACTGCCATTATTGGGTCATAACGCACATTTTGGGTTTCTTGCAGGGG
TTAAATGGCATTCTTGCTGATGAGATGGGTCTTGGCAAAACTGTCCAGGC
TATGGCATTCTTATCCCACTTGGCTGAGGTTTGTGAATATATTATTCTCT
TCTTTTGGTTTCTTCCTTTTTTAGACATCACATGTTACTGTAATTTATAG
TTTAATAGTGCATGACAAACATTTGCTATGACATGGGCATCTCATGCAGG
ACAAGAACATATGGGGACCCTTTCTGGTGGTTGCTCCGGCATCTGTTGTG
AATAACTGGGCTGAAGAGGTGATCAGATTCTGCCCTGATCTTAAGATACT
CCCATATTGGGGTCCGGAAAGGATGGTTCTTCGGAAGAACATCAACCCCA
AGCGTCTTTATCGGAGGTAAATTCTCAGTCTGAGGTTCTTCATGTGCTGT
TTTTCTCTATAATATGGTCATGTAACTAATCATGTGGCATTTGTTCTTTT
CGTCCATAGAGATGCTAGCTTCCACATTCTCATTACAAATTATCAGATAC
TTGTGAACGAAGAGAAGCTTTTGAGACGTGTTAAGTGGCAGTACATGGTA
CTGGATGAGGCCCAGGCTATTAAAAGTTCAAGCAGGTGAATTTTCATGCC
CTTGCATGTTTCAGTATTTTGTTTGAATTCAGAATTTCGTAACACATGCT
TGTCTTAATGTTTTTCCTTATTTTGTGGTCCTTGCTTGACAAATAGTTAC
TTATTGCTCTCTACTGCAGCCAGCGCTGGAAGACTTTGCTGAGCTTTAAC
TGTAGAAATCGTTTGCTTCTTACTGGGACACCGATTCAGAACAACATGGC
TGAGTTATGGGCACTTCTCCATTTTATCATGCCCACTTTGTTTGATAGCC
ATGAACAGTTTAATGAGTGGTTCTCAAAAGGGTAATGTTCTCCTTTAGAA
ATTACGGCTTTCTTTATTTTTCGTTGTTTTCTTTTGCTAACGTTTCTTTG
CCTGCCAGTATTGAGGGCCATGCTGAACATGGAGGGACCTTGAACGAACA
TCAGCTTAGTCGACTGGTAAGATATTTCTCTATTTAGTGAATGCTATGGT
TAGTGAATCTAAGTACTTGGCTGAGTCTAATGCTTATTCATAAGACTTGA
CATTAGATCTGAGGAACATTTTTTTTCTGTATTTCTGCATTTTAATTTCA
TTTGGGCGTAGTTTTGTACAACATTGCTGTTTCTTAAGATTGTGACATGT
TGTCTATATCCACAGCATGCTATACTGAAGCCGTTTATGCTCCGCCGGGT
TAAGATTGATGTCATTGCAGAAATGACAAAAAAGAAAGAAGAAATTGTGC
ACTGCAGATTGAGTTCTCGTCAGCAAGTATTCTATCAAGCCATAAAGAAT
AAGATCTCTCTTAATGAGTTGCTTGATGGAAGACGTGGCAATCTAAATGA
TAAGAAGCTGCTTAGCCTGATGAATATTGTCATGCAGCTGCGGAAGGTAC
AGTTCTTTCTGATGCTTAAATTTCATTTAGTCCCTTTGAGGTCCCTACTG
AAAATTATGGTAGTGTAATTTTTTTAACGCATAGGGTTTTCTTTGTAATG
TGCTCCATGTAACTTTTAGGTCTGCAATCATCCTGAGCTGTTTGAGCGCA
ATGAGGGAAGCTATTACTTTAACTTTGCGGAGATCCCAAATTCTCTTCTT
CCTCCCCCATTTGGTGAATTGCAAGATATACATTATGCAGGCAAGAGGAA
TCCAATAATGTTTGAGGTATGACCTCTCTTTCTTTAGCCTCTTTCTGTTT
TTGTTGATCATAGGGTTTATGACATCTCTTTTCTTGAGCACAGACACTGT
ATTAATGGACTTCTTTCTCAATCCCCACAGATTCCGAAGTTGATCTATGA
AGGAATCATCTGTAACAGGGAAATGCCCCTGCATGGTTGTGGATTCCAGA
GTGGATATTTCAACAGGCTGTTCAATATATTTTTGCCGAGCTATATCCAT
AAGTCAGCATTCCCAGAATCAACTCCATCAAACAAGCCTGTTCTGCTATC
TGGTGCATTTGGATTTACGCGTTTAACGGATCTGTCCCCTGTTGAAGCTT
CCTTTTTGGCCACGTGTTCATTATTTGAGAGACTAGCATTCTCAGCGACA
CGTTGCAAGAGGGAGTACGTCGATGAAATCGTGGATCTCTTCATTAATAC
AGAAGGTCCTGATCTCCAGCTCAGTCAGAATGATGCCACAAAAGTCCGTG
CTGTTACTAGATTGTTGCTTTCACCTAAAAGGGCAGACTCCAGTTTGCTC
AGAACAAAGGCCGAGATAGGCCTGAGTGATAACCCATGTGAAGCACTAGT
TCTTTCTCATCATGATAGGCTTGTTTCCAACATACGGCTTCTTCGTTCAA
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TTTTCCGCGTTGATGTTGATTTGGCACCTGTGCTGCATCAGGGAATCTGT
TTGTGTTCAGTAATTTTTGCTTTAGTTTTAAAATTTTTAAACTTCCATGT
ATTGCCGGAGATGTCTATTTGGTCTTATGCATGTTTGCTGACTCACAATT
GTTGTCATATTGATTGACCTGCTTTCCTCTTTCCTCTTCTTCCAGATAAA
TGTCAGGTGTTCAGATAGAAATTTTGCCTACAAGTTAACCGATGAGATGC
ATGATCCCTGGATCAAGAAGCTTTTTTTGGGATTTGCTCGCACTTCTGAG
TTTAATGGTCCTAGAGAACCGAATGTTCCTAATCCTATGATCCAAGAAGT
ATGTACTGTTTTGCCCATCCCTGAGCCGATACTGCAGCTACCATACAGGA
TATTTGGGTCATCTCCGCCTATGAGTAACTTCGATCCAGCTAAAATGCTT
ACAGTAAGTCCATCCCTTTTCCTTGTACCTTCAGCTGCAAAATTTCATCA
TCTTTTTGTACTTATGATTTTAATCAATGTGGATATTGTTAGCTTTATGA
GCTGCTTAACTCCTTGCAGGATTTTTTTGAAACTTATACCTCGATTGTTA
TGCAATCTTTGTTTATTTTTTTCTGTTTTTACATACTTGAGTGACTCCTT
GTTTGATGCCAGGATTCCGGAAAGCTCCACACCTTGGATAAACTACTACG
ACAACTCCGAGCTGAAAATCACCGTGTGCTCCTATTTGCTCAGATGACTA
AAATGTTGGACATCCTTGAGGTATTTTAGGAAAAAAGTTCACATTTTGCT
TTGGATAGTTAAAACCTAATTCTTCGTGAGAGCTGAAAATAAAAAATCTT
TTCCAGAAACTGATTTTAGTCTTGCGTTATACATCGTAGATGTGCAGGGA
AATGTTGTTGAACTTTATTTAGCTGAAAGGTGCTTGTATCATCACAGTTC
ATTTTATTCTATAGATTTGTGCTGATTTTCTACAATTGTTTATCTTTAAT
AATGTAGTTTATGCTATTTTGTGTACTTGGATCCCACTAAATGATGATAT
TTTCCAGTTATGAATGCCTTTTAAAAACATCAATATACGGTAATTGCATA
ACAGGATGCAAAGTATACTGAGTGTTGGGTTTCAGAAACTTTAGGAGCGT
TGTAGATTGTGTTATTTTTTGACTGGTCCTGTGAACTTTATGAAGAACTA
AAATAATAGTGATTGAAATGAATTGTGGAAGCCTCACTACGCTGAGTTGT
ATCTGTGAACTGCTTATTCAAAACGTCCGGTTGTGTTTGTGCACAAGTGT
GACTAGTTTTCTAATTCTGTATCTCGTGATTTTTTTCAGGACTACATGAA
TTTCAGAAAATTCAAATATTCTAGACTTGATGGTTCTTCTGCAATTTCTG
ATCGTCGTGACATGGTCCGGAATTTTCAGAACAGGTAGGCATTAGTGGGT
AGGATGTAACTACTGCAATAAGATGATAAAGCTCTTTGAACATGACTTCA
GCTGAGTTTTCTTGTCTGCAGGAATGATATATTTGTTTTCTTGCTAAGCA
CAAGAGCAGGGGGCCTAGGAATTAATTTGACCGCTGCTGACACGGTTATA
TTTTATGAAATTGACTGGAATCCGACTCAAGACCAGCAGGCAATGGATAG
AACACACAGGCTTGGTCAGACGAAGGAGGTAAGTGAAACCTCACTTCATA
CGCCATTATCTAGCCATGGTCTCATTGACCATTATTTCATCATTTTTAGT
AGCACTTAGGTATGTAAGCAACTGCATATGGAAGTGCTCAGTGTGTGTGT
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TTTGTGAATTTCGTAAGTTTTCATTTGCCATTCCCTTGTTTAAGATTGAC
TGGTTGCACTTTTAGCACTATAATATTTGTAAGTGAATTTGTTATTATAC
AAGATTCTCAGACTAGAGCTGCCGATTGTTCAAGGTTCACACTAAAACTG
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GTACATTCTGAAATATGAAAATACAGGAAATAAGTTATTTAATCCCCATG
CCTTTGCTCAAGTCTAGATTGATCGTCTGTATTGCCTTTGCTCAAGTCTA
GATTCATCGTCTGTATTTAGTTGGTGACTGTTCAGCACTATGACAAGTGA
ATACTTGTTTGTAAACCGATTTGAACATTTGCGAGAGAAGATGATTTGCT
ATCATTGTGTAGCTGCTGATTCATCATTAGGGCATCACTAGGTTCTACAG
CCAGGCACGAGCATTCTCATTTCTTGCGCAGAAGAGTAGTAAGAAGCGTT
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CACTTTGGCATATGGGTGACTCTGTTTCTAGTTATATTGGTCTCGCTGCT
ATTCTCACTGTCATTGATGTCTAGGATTTTTTGGTTGAGTGACAACTCAG
TAGAAAAACTAACTTAACTGGTTCACAATCCTGTTTTTATACTTGATATA
ACTCCACGATCATGCTGGATTGCTGGGTAAAACTGGAGACTAGCCATTCT
TTTCATGGTTTCTTGCCAACATGCTGGATTGCTGGATATAACTCCACGAT
CATGCTGTATTGTCTGTTATATTTTTTCTTGTGTTCATTTTTTCTGCTAA
AACTTGTATGATCACTAGTTTAATGTTTTGTTTAAAAGCAGTCGTTCAGC
TCATATCTATTAACTGTTTGATTTTCACCATCTCTTAGCACACTAGTCTT
TTATCTGGATTTCCAAATTGCACCAGCATTTGAAATAAATTTGTAGCAGC
TCAGTTTCTTATATATTATTTCAAACATGGAATTGTAGGTAACTGTGTAT
AGACTTATATGCAAAGACACTATTGAGGAGAAAATATTGCAAAGGGCGAA
GCAGAAAAATGCAGTGCAAGAGTTGGTCATGAAAGGGAAACAAGTCCAGG
ATGATCATCTGATGCGACAAGAGGATGTAGTTTCATTACTTCTTGACGAT
ACACAGATCGCACACAAATTGAAAGAAATATCAATGCAGGTAATTGTTCC
CCCAATTCTTAAGTAGAGGATATTTTAGGCTTGCTACCTTGGTTCTATTT
TGAGAATAGATGACATTTTGCAACTTCAGGTGATTTTTGTGTCATTAGTT
ATATGCTCTTCACTTCATCAAAAGTTACCAATAGATTGAGGTGTTTCTTG
TGCATGCATTCATCGTTTGAGCGTATAAGGGCATATGCTGTATTGTTGAT
CGTATATTACTTGCATCAAAGATGACTGTATAATACTTGCATTAAAGATG
CACATTTTACTCAACACAAGCATATTTTGAAGTACACTGTGCCCTGAATT
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AAGGTAACATTTCATGTAAATACGAACAGTGGACAATATATCATTTCCAT
CGGTTAACCGACTCCAGTCAGATGAACATGAGCTCTGTAATTAGCTGCAT
GCTGCTCTCATTATGTTTCAAATATACCACACTCATGTTGCTAGTGGTCT
GATATCTCGTTGCCAGTAAGAAAACAGTTTTGGCTGGTTTTCATTTTCTC
TAGCTCACAGGGAAAGGCCGTCTCACCATGACCATGATCCTTGCCATGTT
GTTTTGATCCGAGATACTGATTTATGTCTTGCATTGCTGATTCTGCTGAT
TACGAATTAGTTCAGTTGATAAATTATAGCATATGCCATTGTTGAATTTG
GGGGACTTAGGAAAAGAGTAATAACAAGAGCCCTAGGTTATATCCTGCTC
TGAAAACTGACAATTTCTGGCTTATTAGTTTAATGTTCAATTTTGTGTAG
GGATTCTTATATCTTGCAAGCATTTGGTAACTGGTACAGATGGGCCTTGG
AAAACCAGACCCTTCGCTTTATAATTCAGATTGATAGAATTGTTTGAGTT
CATCTGGAGTGTTTACAGCTAATTTTATTTGACTTAATCGCAAAAAGTCT
GGCAAGAATATTCCTACTGATCTGCACTACCCTTTTAGGCGAAGGATCGG
CTAAAGAAGAGGCGAGCAAAGGCCATCAAAGTTGACAAAGAAGGAGATTT
GATGCTTGAAGATTTGGATGATCCGGCTGCTGAATCTGTAGAACAAGATA
ACACAACCAGCAAAAAGGTATGTACGGAAAATGCATCTGAATAATTGAGT
TTGTTCTTTCTTTGTGATTGGAGAAATCACCCCCTCGGGATAGCTATCTT
CAGTTTCTTTTGCCATATAGTAGCCTGTGATTTCTTAAGCACTCATATCC
ATACAAAATAATCGAGAAGTTACTTAGTATGCAAGCTTAAGTGAATGTAA
AAGAACAAGTGTTTATAGAGATATAATTTCATAGATTATGTTAATATCCA
TATAGAACTTCGTTAGCTCTTGCAATATAAGTATGACGATTTATTTTTAT
GCTTACTGATTGTGTGTGACTCGCATTTTAGTCCGTATATGCGAACTAAA
AGTGCAGTGCGTGATGTATATAAGGATATAATCAAAGGAGTTATCCGCCT
CTTTCAGTTTTAGCATCTTTGCCTGCATGTGTTTGTATCCCACTTGATGC
TTTTATGAATTAACTTTGCTTTACAATGTGATATGGCTGCTGTATTTAAG
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AATTATGATAAACTATTCGTGTTTTCCCTGAGGCCAGTTAGTCATCTAAT
CGTGCTCAGTGTAAACTTCATTCTCTTAACTGCTAATATATTTGCAGAAA
AAAAGCTCGCACAAGAAACCTCCAAAGTCACAGGACAACGATAGTGATGT
CAAGGCTCTCACGGAGAACGATATCCCCGAGAGTACTCCTGCTGAAGATG
AAAATATTGCTTCTTTGAGGCCTAAACGATCAAAGAGGTTGGCGAAGAGC
ACGGGTGAAGATAAGGAAATCCTTGCTGGTTCTGATCTCGAGAAACCTGC
AGATGCAGCTGAGAACTACCATGATGCAGAAGAGTTGCAAGATCAGACTC
CTACAGCCTAGTCGACTGACTGAACTAACCAGATGAGAATAGAATATGCG
AAATGGGAAGACTCGTGTAATTTATCATGTGGATTATGAGCATCAGAGAT
GGCACAGTTTAATGACCAGAGGAGGCGTCTCTGGATCTGCTGAAGCTGTC
ACTCAGTTCAATAAGTATTTATCATACAGCTTCTTTTCAGAAGCCTCGGG
CCTGCGAGAGTGTGACTAGTATCTGATTATTTGGAGGACAGGACACTCAG
TGTGGTTGCAATAAGCCAATTATGGTTGCCACTCCTCCAGCTGTTACTGG
CCTTGGATGTTAGCCTGCTCGTGATGCTAGCTGGAGCCATTGTGTAAATA
AGTTTTAGCAATGTTTCATCACATATAGAAATATTTTTGCCTGTGTAAAG
AGAGTAGGTTGATTTACTAGTCATAAGCTTTTGTAATGTTCAGGCTAAAA
ATGAACATAGCAGGAAACAGCTGACGTGGCTTTGAGTTGGAAACATATCT
TTTGTGGCAATGTATGCTGCTTCAGTCCGCAGTCCAGTAGATGAGTAACA
TGCCTTGAACGCAATGAACGGGAGCTCGTCCACATGTTTAGCGTGCATGT
ACATTTGGCTGGATTTACCAATAAAATGTTGAATGGCAACGTCTCAAATC
AATGAGGTTGTTTGCCAATTATGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.