Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA044738

[Submit comment/correction]

Sequence	AA044738
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA044738
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTTTTCTTCGCGTCTCCCTCCAGCGTCCCCACCCTTCACCGTCACAGCAC CACAAACCCGCACGTTTCCTCTCCGCGTGCTTGGCCGCCGCCGCCTTCCG ATAAGCTTCCGCCCCGCGCCCGACCGGGGCACAAATCCCCAGCATCTCCC CGATTCGGGAAGGTACGACCTCCAGTTCGATCCAGAACCCCCAATTTTTG TCTAGGGTTTGGTTTCGGTCCGAAGATCTAGGGTTTGCCGGGCGATCCAG CTTCGATTGCTAGGGTTTGTGCGTGCGCATCATGGCCGCGGGGCGCCACG GTGGGTACCGGGGCTACGAGGTGTCGAGGGAGCGGGAGTTCGATCTGGGG GCTTCTAGAAGAGACAAGGAGTACCATCACCGCCACCGCGACTCGGACCG TCGCCGTGATGGCGTCCGGGGCAGGGACCGGGAGCCGTCAAATGGGTACA GCCGCCACCGCTCGCCGCACCTGCCACCGAAGAGCCGGCCCTCAGGGAGG AGGGAGGAGAGGGAGCCCGGCGAGGTTTCGAGCGGAAGTGGCTCAGAAGA ATCTCGTGGGCGCCCGCCGAAGGCAAGTGAGCCGAGGGTGAATGGTGTTG TGGGAGTCAGTAGGGATGGCGGGGTGCGTTCCCCAATCAAGAAAAGGAAG CACTCACCGGTTATTTTGGATAGGAATGGTTCGAAGCCTCGCGTTCAAGA TGTTGTGAGGAGCATGGAAGTGGTAGACAGTGTGGTTGCCGAGCTCCCAG GTGTTAGCACCCCGGGCAGCATGGATTTGGATGTGTCAGTTGATATGCAA AAGGTTGAGAGACTGCACGAGCATGATGATAATAGTAGTATTATTGTTGA AGAGGAGGGTGAGGATGGTTATACAACAATGCGAAACATTATGACTTCGC GATGGGCAAATCCTGATGATGAGGAAGAGATTATTATGCCCAAGAGAAAG AAAAGTGTGTCGCCAGAACAAGGCTCCACGAAGAAGGTTACGAGCCCACA GCTTGGGGACTCGAGGGTGAACTCCTCGGTGTCTTCTGACTCAGTGGTAG CACGGTGTAGTCCAAATGGCGATCTTGAAGTAGACAAGGATGACAACATT GATGTTGAGAAGGATGATGGCGACGATTCTTCCGCTCTTTGTATGTTGCA TACTGATTCTGAGAGTCGTGCGCGTAGGTCTAGAACCCCAGAGCCTGCAG GCTCGTCGCGTAGATGCATTAACATGCTTCAGGGTTGTAGGAGTGTTGAC GAGTTTAAGAGGTTAAACACAATCAATGAGGGTACATACGGAATTGTATC TAGGGCGGAGGACAAGGAAACTGGTGAGACTGTTGCATTGAAGAAGGTCA AGATGGAGAATGAACGGGAAGGTTTCCCTCTGACTTCTCTAAGGGAAATA AATATCCTGTTATCTTTCCATCACCCTTCAATCGTGGATGTCAAGGAAAT AGTTGTTGGGAGTGGTGATAGCACTTATATGGTGATGGAGTACATGGAAC ACGATCTGAAGGCGGTCATGGAGACTATGAAACAGCCATATAGTCAAAGC GAGGTCAAATGTTTGATGCTTCAGCTGCTAGAGGGCGTTAAGTATCTTCA TGACAATTGGGTAATTCACAGGTAATGACTAACCATTGTTTTTTGTTCAA CCTTCATATGCACATTTCTTAATTGGAGTTATTCTTTGGTATATATATCC TAATGACCTGTGTTCTTAAATAGGGATCTCAAGACGTCTAATATTCTCTT GAATAACCGTGGTGAGCTGAAAATATGTGATTTTGGGCTCTCTCGTCAAT ATGGTAGCCCATTAAAGCCTTACACTCAATTGGTTGTGACTCTGTGGTAC AGGTTAGTCATCTGCCAGCATCCAAATTTTTCAAATGTCAGTTTGTTGTT AAGTTAGCATTCAACTGTAAGTTCTCACTTCTCCCATCATGGTCTCACAG TTTGATCCTTATGGTTGCAGGGCTCCAGAACTACTGCTAGGAGCAACGGA GTATTCTACTGCTATTGATATGTGGTCTATGGGTTGTATTATGGCAGAAC TTCTGACAAAAAAGCCACTATTTGATGGGAAACGCGATATTGATCAACTT AGCAAGGTATCTGGTTTGACTTACGATTTCTATTTGTTTATTGTAATTAG ATTAAGAAAATCTTACATGACTAACTTCCATTGCAGATATTTAAAATGCT TGGTACACCTAATGAGGACATATGGCCTGGTTATTCAAAATTACCTGGTG CCAAGGCCAAATTTCCCAAACAACCGTAAGTGGTTAACCATTTCTTCTGC TTATTTTGTATATTGATCATGCCAGGTTTATGTCATACCATGGAAGTCTT ACCTTCGATTCTGTCCTTCAGGTACAATAAATTAAGGGAAAAGTTTCCAG CTGTATCTTTCACTGGTGGGCTGACCTTATCAGAAGCTGGATTTGACCTG CTAAACAGAATGCTGACGTATGATCCCGAGACGGTAATATATCCCTATAA AGAACCAACTGATTCTCCCTTCCTCATATTTTATATGTCTGAACATATTT GTTTCTTCCTTACAGCGAATATCAGCAGAGGCTGCCTTGAAGCATGAATG GTTCCGTGAAGCACCCCTGCCTCAGTCGAGGGATTTAATGCCATCATTTC CTTCTCTTAATGAACAGGACAGGTACTGTTTTTTTCCTTTTAATCTTTAG CCTACCAGTGAACTTTTTTCCTGATCAATATGGTTGAATTGATGTTACGT TCTTTTAACTTTATTAGGCGTATGAGAAAGCGTGTGAAGAGCCCTGATCC ACTGGAGGAGCAACGTATGAAAGAACAAGGGAGCATAGGAGATCGTGGCA TTTTTGGCTGAGCTTACACCATATCTTTTGGTTTGGTGCAGATGCCAATC TTCAGTGCGGATTGATGGAAGTGCATGCGTTCCAAGGTGAGATGTCTGCT GGGCATGAAGTACCTCACCTTCTGGTGTCTGCCGACGGCTGATGGTATTC TTTAGCAATCATGGACGCAGGATCAAAGGGATAAGTTTCTCCTTTTGTTC CATGCTAGGCACATCATTTACAGGGTTAGCTCTTTCTCAACTTCTGGTCA CAGTGAGCTCTTTCTCATGTTCTGGTCACAATCTAATCCACCTGTGCATT GTAAGGTGTGCAAATCTAATAGAGCTGCGTCGTATGGTCTGGCCTGTTCA CTGCTATTGGGTACATCAGTTTCACTTCTGAAACTCCTATATGTATAGTA CTATAAAGTGATTCCTTGTAAACACTTATCAATGAATACTCTCAGTTCTC ACTTCATTTTCCTTTGTTACTAGAAAATTTTCTTTTGATCTTTGCATTTT GTTTGCAAGAGATGAATGAAGCAAAGAGGGAAGAGTACCTTTTGTTTTTT CGCGAGGAAACTGATGAGTAATAGTGCAAATTGTGAGGTAATATGCTGAG CAGTTCCTTGCTACTGATGTGTTATCATGCTAAATCTGATGAATTTTCTA TCTTTCTTCTGTTTTCGCAAAAGATCTGTCTGTACTCTATGGTCTCTTAT GCTCAGGGTGAACTTTGACATAGCTTGAAAATATTAAGCTCTACATATAA TGGCTAACTTTGCTCGATATGTTCGTGTCGTCTGTTCACTACAATGAGTA ATGATTGTCCATTTGCTACAAATTGATGAAGTCGTGAAACAGTAACATAC TGTAGTCTAGATAATTTTACTGAATGAAATCATTAAGTTACTGGTGCACT ATGGATACATTATAACTTCAAAACTCTTTTGTGTACTCTTTGCAACTTTT AATGTGAGGGAGTTCTTGCAATGGAAGGAGATTCTTCATATCTATTTTTG TTTGCTTTGCTGAAAACAAGAATTTGAGAGCAATGTCTAGAATTTGACTT CAGTTACCTTTTTTCTCTCTCCCCCCTCCCCAAAGTCTAGATGCTGTTCT TCTGCTATTATCATTTTCAGGATTTTGTCTCTTCTGATGAAATTACTAAT TATTCTATGGAAGAATTGATTTTCAATGTTAGATTCTTCTTCAGTTTATC TCACCTTGGATCAGAAGTCTTACTTGCACTGTTGATGATATATAGTGCTA TGCTTTTCAGCTAGGCTTGCATTTTGTGTTCTACACTTCCTGCCTTCCTC CATGATGATGTTTTGGGCATTGACATGGTCGACAATATGTAACTTTGACC ATAATTATAAAATTTAATATAATTATTCTACTGGGTGTATGTAATGACTA ATGAGACAAATCTGCGCATCTGATTTTTACACACCAGTCTATATAAAGTG TCAATGTTTTAGAAGTTCTAAACCTGTAAGGGAGAAGGCTGAAAATACAT GCAATGGGATAGCTTTTAGAATAGTTCCATATACTGTATTTTCTCTTATA ATAATACTTCCATGCGATTCACTATATTCGGTTGAGCTAGTCACTTTTGG TTGTTCCAGTTTCAAGTCATTTGCACTTGTGTGGTACATCTGGTGATAAA CAAACTAGTGGTTATCGTTCTGATTCGTGTCCACACTTGAATTTATTGGA GCAAACCGGTGTTCGTTCAGAAATAGCATGTTCTTGTGAAACCAGTTAAT GGCGATTCTCTTTCACAATTTGAACTTTGAACATTTTGTACTGTGTAAGC TGTTTGGAGAGTTGATTGGACTCACTGTAAGTGTTCTGTAACCCGTCTGC AGCTTAAGCTGTGGCTACACCAAGACAGGAAGCTTGAGGGCTGTCAGCTT ATACTATGCCTAATTGACTTTCCTTGTGGATGGTCTCCAAGCTCTGTGAC TCTTGTGAATCTTAGTGGTCAGTCTACTATCCTATCTTGGTATGTTTTCT TGCTAATAGTTCTTTTGATAACTGTTCATTGATTCCCCGGTCGAACAAAT AGATTATGGTTAAATCTCCTCAGAGTACAGGCGAGTCCTTTGCCTATTAT AGCAGGTATTGCTACATGGTCCCTTGAAGAACTTTCCGTTTTGCTGGTTC TTCATTTTCTGGGATGCATGCCACTGCCATGAAATGCTACACTTACAGTC TAAGGTCATCATTGTTAAACATAGTTACTTTAACTGGATATAAAATTTTG AATTCTGCATGTTATACCTATTGCAGAGAAGCTCACTGAGGCTGATAGAA AAAAGGAAAGGTTTTCATTTCGATCCTACTTAGTTTCCTTAATCTTATAA TTTTGCAATGATAATTGTAATGGATGCCTTGGAGTTCTCAGTTCATTGTA ATGTTATTTAACGTTAAACATGTGCCACCACTCCCCAGTGGACATGATGA TTGCTGGTTGGACAATTTGTGGATTACTGCAGCGATTAGTTAGTTGAAGC CTTATTAGTTGCTTTCTCGTACCGTGCCAGTAAATGGCACCACCAGTGGA GAAGAGAGCCTTCCTTATCATTCTGTTTCGGCTTATGGGTGTACTTTTTC ATATAGTTACAGCCCTTTTGTATTGAATTCATTGCCTGACTTCTGAATAA AATACTTATATCAGTAATAAACAAAATGAGAATATGGATCCATATATTTG GTTCTTTTGGTGACATGTATTCTGTTGTTGTGGGCTTCAGATTTTTTGCA GAGTTCAGATATCTCCAATTTGCTACATATTCACTACAGTAACTTATGTA GTGGTGACCTAGGCGAGGTTTGGGTCACACACATGATAGGTTCTAATAAA CTCAAACTCTGGTACAATATCAAGAATGTTGGTCAACATGTTTTGATATA AGCTCCTTCCTAGAGGTGCAAAAATCTTGAAATTATCTTGATGTAACAAT AACCAAACATGAAAGATGCAAGTGTTTGGCTGGTGAAAATTTGGGCATGC AGTCTCTCCCAATGGGAGAATACGTTTGAGGTTTCATTGTGTGATAAATC CTAGGTTTGATGCTTGCAGAGGGGAAATATAAATCTCCGAATGTCAAACA TGTTTTGGTGGTGGCATTGCCTTTTGCAGTGTATAGTTGCAGCACCAAAG CACTGGACCTTGTCCTTTGTACTGGCTGTATCTGTGTATGGTAACCATAG AAGTTTTCGGCAGCTCATGTGATCTGCACTGTCCTTGTTATCCTCTGCCA TCTCCAGAAACTTGGGACCTCTTATCTTGGCTCGGCAAATGCTCCTTTTT GCAGTTGCTGTCGCCACAGCTCCACGCCCATATGGTGTTAGTGCGTGGTC TCTCACAACAATCACATGGGCGTGCTGGTTTGACCCGCCTGCTTAACTGC CACACCCATTTCTGCGAATGAAGTGGCAGCAACCACACCCTTTTCTGTGA ATGAAGTGACAGCTCTTGCTGCCGTTAGACGTCACACTCCCATCAGGCTG CTTGTTAGCTATTTCTGTTTTTGCTGCCTGCGACTTGGGTAGCATGTACC GCAGTGTGGACAGAAAAAGGAATAGGAGTGGGAGCCTGGAGGTAGCCAAG TGAGATGTGAATAAGATGCTAGCGTCAGTGTCGAGGCAAGCAAGTATTCG AGCTGAGTGCTAGCCTGCCATGGGTAATTTGGTTTCTTTGTTGTTGGTTC CATCCAATAGTCATAAACAGTGTAAATCCATCTGACTTTCATATCAGTTA TAACTCCCAAAAATTGTGCACCTATACAATATACCCTTTTCTGTTTGTAA ATTGATTTTTCTGTCTTGTTCACTCATTACCATATTGTATTAGTTCAGTA GGTTGTTTAGTCGTTCAGTAGGTTGTTTAGTCAAGTCTACATGGTTGGGC GACCTGAACTTCTTTTAGTGGCACTTCATCTCTAGTTATCAGTTATACAT TGTGAAAGGCATGTTGGTATACATCCTCTTGGACAGCTTTTTTGCTGATT GAATGCCTGCAGGAGAGCTGCTGACCCATCCCGTGCTATGCATTCTACAA TGAACCTTAAGGTACCTTTTCAAAACAAGTTCATGTGAACATTGCGAATA GAAATGCTATTTAGCTTCCTTAACGTCATCTCTCTGTTTGTTAATTTCAA TGCTGAGGGTCAATTCCTCTGTAGCCTGGGATTTTAACAGCCCGTTTGAC AAACATAGGGAATGTGAAGGGAGTTTACGACCAATTCCCTATCCCATGTC TAAATTACCACCTGCCATCAGGTAAGAGATTTATGGGGATTTAGCCTATG AATTCCCATTCCCATTCTGTTCTTAACCCCAATTCCATCGAACCAATCAA GGGACCATAGGTCTCGTGTTCTCAAATTCCCATTCCCTGCCTCCAACTCC CCAAACCAAACATGCTGTAAAGGAAAAATGCTGAAAGGGTTTATATCAAA TAAGCTTGAGTTAAAAGCCTTGTAAAGCATTGCAAGGTCTGTCCAGTATC CTGATAATCCTCGTTTAGCTAGGAATGGGAAGGGGGATTCATAGGCACAT TTTTATTTGGCAATAAATTTTAAAACCATCTACTTAGCGCCTATTTGATT TACAGGAATAGGAAAAACACAGGATTTAGATGTCATGTATGGTGAGATCC TAAATGATTCCAAAAAACACCAGAATTTTGTAAGACACCTTTCTTTGGTG CATAGGAAACAAACACAGGAATTTCACAAGGTTGAGGAGAGAGAGTAGAT AGATAAGAATACAAAGTACATTCGACTAATCAAGGAAAAAACAAGATGAG GTGTGAGCTCATGTTGAGATTCCCATGGAATGGAGGTCATAGGAATAGAC TCCGTAGGAATTTGATGACCTCAGTCCTGTAATTCAAAGGGCTTCCATAG GAAAAATTCATGTGGATTGAAATCCTCCAAAATTATTACTCCCTGTGATC CAAATTACTTGTTGCAGTTTTAGGCCAAATGTTGCCCACCATATGTCTAG ATTCAGCGAACCCGTTCCAAGTAATTGGATCGGAGGGAGTATAAAATTCC TCCAATCCAAAGAGGCTCTGAGTTCTTACTGAACAGCTAAAAATATTTTG ATTCTACAAGGTACTTGGTAGGGCCCATCAGCTTGAGCCTGGCTCCCCAT TGCAGTATTGCATTATTTTGGGTAATTAGAGCAAATCAATCATTTTTATT GGATGGGTTATGGTTTGTTGATAGTGTCAATGGATGATTATGATTAGTAA GGTGGAGAAGTACACTTTACTAGCTTTTACATTTTAGTTGCACCACTTGT ATACCTGCCACTGCCAGCTTGTCTCAATTTGCTAACACGGTTCAGCCTGT CCTGGTGTGTGGCTGGTGAGCCTAATATCTGCACGAAGGCTGCAGGCTGG TGTAATTATTCACTTGTCAACTCTTGAAGTATCTTATTCAATTTCTAAGC ATCGCTTTGTTCTATTTATCTGCCCTTGCTAACCATGTGCACAGCAATGA CGGGACATCAATAAGAGTTGCGGAGGCCAAGAAGCTTCTGCTGTCTATAT GGCCTTTTGACCATTTGTAAGAGTGACAAAGTTCAAAACCCATGGTGTAG GTTTCATGATGCTGTGATTTGACTCAGGAAGACTGAAAGCGAAACCAAGT TTTTGCTGATCATTTATTTTATTATCTATTAGGATCTATAGCTGTTTCTA TTGAAAATTTGGTAATTAACTTGTGGTATCAAGATAGATGAGTGCAGCTT ATTGTGTTTCTCAAGTGTGCAGCGTCCTGTGGATGTGGCCGCCATAGATG TCGTCTGCATGTAGCAATGGATTGATATTTTTGTCATATGTGTTTTCTGG ATAATGTGTTGTTGGTTAGTTGAGGATCTCCTTGCAGTCATGTTTTTTCA TGTTGACTGTATACTGGAAATATGTTGTGGGATGTGAACATACACAGCTC GTTTGAAAATATGTTGCCCCATTGTAGAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.