Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA042551

[Submit comment/correction]

Sequence
AA042551
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA042551
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAAAGAGGCAAAGACACGCTGCACGGCGCCAACCCCACGCCATTTCACCT
TCTCGCTCGCCGCGGCGCGGCGGAGCAAGGCAAAACCCTCACCGCCGCCG
GTCGAATCGCGGTTCCGACCACCCGAAACTCGATTTCCTGCGCTTCTTTC
TCCTCCTCGTCCGTCACAGTCTGATTGACTCTCCCGTTCGCTCCTTTTCT
CTGTGATTATTTTGGGTTTTTTTTTGCGAGTTTTTCGCTCCTCTTTTTTA
TTATACGCAATTGTTTCCTTTCAGGAGCGCGCGGCCTCGGCGGGTTCGCG
GCGGCTAGTCTGTGCAATCGCCTTCCCCTCATGTGCCTTTGAATTTTAAG
TAGGGTTTTGTAGTCAGGGGTTTTGATCTGGTGGCTGCATGCTTGTAGGG
TTTGGAATTTGACGGCTCAGTGAAGGGCATTGTTCGCTGGGCACCGTTCA
GACCTCTCTCCGCGATCGTTGCTAGGTGAGCTCCCCCCATTCTCGATTGT
TAGGGGTTTGAAGTGCCTGCCCCTGTGCGATTTGACAATAGTTAAGATGG
GTTAGGGATTAATACGTTGTTACTTGGGGTTTATGAGGGGTTTAGGTGTA
GGTTTTTCTGTGAGAGGGGTTGATAGTGATCATTGGTGTATGCTGTTCGG
TGACATTTGCGTGCGTGCCTTTTGAGGTTTTGGTATGTGCTCTGGAGTAA
AGTCTGTGCCTTGGGATTGATTTTGTTCTTTGTCCAAAATTTCGTGTAGT
TTTGACATGTTGCTTATGTGCACACATGGCCTATGCAACTTTGTTATGTG
TGGCTGATGTTTTTAAGTTGTGAATTTCTCTAATATGCGTTTTTTCCACA
CAGTTCTTGCCAAATAATCAGTGTAAAACTTTTATTTCAACATGGGACAT
TTCACATAATTTATCCCACGAATGTATGTTAGATAGTTATGTCTTTGAAC
AATATTTTTGGTTAGCAGTTCGCACATGAGTTGCCACTTTTTTAGAGTTC
CTACTTCCTAAATGCTAGGACATATATTGATATATATGCATATCATGTCT
TCTTAACAGTTCTCATAATTTTGTAGCTCCAGCTGAGAAAGGAAACAATT
TTTGGCTTAGTTCATATATTGAATTTTCTCACCATTTTCTTTTCATTATG
CTACTAGTAAAGTTCATCGCAAATGGTTTAACTGATTTTATGATACAGGT
GGAAATTTGCCAGCCACAATGTCAACATATCCTGTGCTGAATGACCAGCC
AATTGATCAGTGGAAGATCATGGACCTGAAGGATGAGCTCTGCAGGAGGA
ACCTACCTATCAATGGTTTGAAGGAAGAACTTGTGAAAAGGCTCTTTGAG
GATCTACAGGGTGATATAGAAGGAACAGTTAGTGGATCTTTCCCTGATGA
TTATCTGAAAGAGGACGAGATAACTGGTTCTGCTGATGTATCTGTTTGCC
AGGCTGTGATGGAACCAAGTGTTGATGAAGACCCTTCTCTGGTTTCAATG
CAGACCGTGGATCTTGTTGTTTCTGTTACAGAAGCTATTAAGGAAAGTGC
AGCTGCTACTACAGACGTTAGTCAGGAATTTGTTGTTATTAGCGAAGAAG
TTAATCAAATAACTCTTGCTGCTGCAGAAGTTAGTGATGCCCCACTAGTT
GATGTGGTGACAACTGATAAATTTTGTCTAAGTGGTGCAGTGGCAACTAA
AGATGGCCTAGAATCAGCTCCATCTGACGGTACTATGGCGAAGGAAGTAC
ATGCATTTGCTGCTGGTTGTAGTGAGTTTATTGCAGAGAAGGCTCTAGAA
GAAGACATTGGCAAGAAAACAATTGTTGATTATCCTTTTGCCACTACTGA
TGTGAAGTTGGATGTGACTCCTGCTAAAGGCAATTTAGCCGCCGACATTC
TAGAGCATGAAGTGGTGTCATCACCTTCAGATGCTATTGTGTCTCATGCT
GATCATTGGGATGTTGATGCTGTTGCAGCTGCACTAGGACATAATGTTGA
TGCTCTGATTCCTAAGATAAGTTCGATTGACAATGATTTGATGAACTGCA
AGAACCACAAAGATTCTGGGCACACAAGCAGTGCTTGCAAACTAACCCTA
TCTGGGCCAATAGACCAGACAAGTGGAACCTTGCCAGCAACAATGTCGAC
ATATCATGTGCTAAACAACCAACCAATTGATCAGTGGAAGGTCACAGAAC
TGAAGGATGAGCTCTGTAGGAGGAACCTACCTATCGAAGGTTTGAAGGAT
GATCTTGTGAAAAGGCTCTTTGCGGACCTTGAGGGTGATATACTTGGTGG
ATCTCACCCCGATGGTGATCTCAAAGACGATGGAACTCCAGGTTCTGCTG
GTGCATCTGTTTGCCAGGATGCAATGGAACCAAATGTTGATGAAGATCCT
TCTCATCTTGCAACTCAGGAAGGAGATCCTGCTGTTTCTATGACAGAATT
TAGTAAGGAAAGTGCACATGCAACTAGAGGTGTTAGTCAGGATGCTATAG
TTACTACTGAAGAAGTTAGTCAGACATGTCATGTTGCTGCTATAGATAGC
GATGCCCCTCTGTTTGATTCTGCGACAACTGATAAAGTTTCTGTGAGTGA
AAGTACTGTAGTGAAGGGAGCACCTCCACAAGCTGATCTTCATGAGGAGA
TTATTGCAGAGAAGGCTCCAGAAGAAGGCACCATCAAGAAAGTAATTGTT
GATTATCTACCATATGATGTTGCCTGTACTAATGTTAAGTTAGACGCAAC
TTCTGCTAAAGACAAGTTAGACTCTGCTATTGTAGAGCAGGAAGCAGTAC
ACTCGCCTCCAGATGCTATTGCGCCGCATACTGATCATTTGGATGCTCAT
GCTATTGCAACTGCACCAGGCCAGAATGCCGATACCCTGATTCCTAAGAT
AGATTCGGGTGACATTGCTTTCATGGACGGCAAGGACCACGAAGATTCTG
GGCGCACAAATGGTGCCTTCAAACCATCTGTATCAGGAATAAAGGACCAG
GTATCTGAGGCCAACACTGATATATGTTCTCAAATCAAGTGTGTATTGAT
TTCACATGACAATATACCAACTAATGTAAATGGTGACTGGAATGCTGACA
ATTCTGATTTGGAACTAGAGGCTAAGATGGATATGGTCGAAGCACCATGC
AGCATTCCCTCCATAGGTGATGATTTGCAGGCATTGGACGATGGCAACCA
GTTGACAAAGAATGGGACCTCATTGCAAGAAATAGAATATACAACCGATA
TGAACTTGGACAAGAAATCGGACAGTCCTGATGGCGCTTCTCTGGAAAAA
CTAAATTTAGTCAGGAGCTCAGGTAATGAACCGATAGAGGATGATGTGAT
GGAAAGTAAGCATGTTATTGCCAATATCAGATCTGATGATCTTGGAAGAG
AGACTGAGGATACTTCAGACCATAAGGTCAAAGAGGTGTTGCTCTTTAAT
ACTGTTGATTCATCTGTGCAAACAAAGGATATTGTAGCTGAGGAGAAACC
AGTAACTACATCTGAAAAGAGGAAACCTGAAGGTTTGTCTTTACCTCATG
CATACATTGTTGGATTATTTCCTGTATTCCTTTCTTATATGGATATCTTG
AGCCATGTTTGTTTTCTTTATAATATCATTTTCGTTGACATTTTCTTATG
TTTCAGTAGGTGTGTGCATGCACACTTTCTGCGAGTATGCAGTGTAAAGT
TAATTATTAGTGATGCATGATCATTGTCATTGTAGATTCTTTCTGGCCTT
TGGTAAATTTTGCATGAAATAATTGTACCTCATGTATTCTGCTCTTTTAC
GGTTTTGGGGACAGGACAATTTGTAATTTATTAGCTTTTGTGCCACCGTC
ATTTCACATGCTGCATTCACATCATGCCAGATTTTGTTCTTACACACTGT
TAAATGAACAGACAAAGAAGTAGTTGCAGTTGAGCCCATCAAACGTCAGC
GCCGAGTGGATAATGTCAAACTTCCTAAGGAACAAGCACGCAAAAGTTGG
TCTGATTCTCCAAAGGATGTGGTTCAGCCTGCTCTAAGACTTCCTTTTGG
CAGGTCTAATTCAACAGCAACTGGAAATTCTCACGGAGAGCAGATAGGTG
AGGTTTCTCCTGCTCTTTTAGTAAAGTAAATGCACTTCTCATCAGTATCT
AATTTCTTATTCGTATTTCAGTGCCACTTTCTCAGAAGCCTGCAACTACT
TCCTTAAGAATTGATCGATTCGTGCGCCCATTTACTTTGAAAGCTGTGCA
AGAGCTTCTTGGTAGAACTGGATCTATTTGCAGTTTTTGGATGGACCATA
TCAAGACCCACTGCTACGTTACAGTATGTCGTTAACTTCAGTATATTATT
TTACCTGTGCAGCATACTGTCAGAAGTGAATGTCAGCATTTCCCCATCTA
TGAACTTTTCAGGCTTTGTCAATTATTTCTTTAATTTGTTTACACCAAGT
GTCCATGCGGTAGTCATTCGCTGCTAATCGATTGATGTTGCCTTGTGTAA
GGATTAATTTTTGCTCCATGGTAGTTTGAAGATGGTCATGGTCTCTGTAT
AAAGGATGCAAACCTGAGAAGTTAACCTTGTCGTGCCTTATTGTTGGTTC
AAAGCATTTCAATGATGCGTTACTTGTTTTACCGTTTATTCCAAATTTGA
TAATGGTATGCTGTTAACTTGCTGTACCTCTTATCCACAGTACTCTTCAG
TGGATGAAGCTGTGGCTACCAGGAATGCTGTTTACAACCTCCAATGGCCC
CTACACAATGGCAGTTACTTAGTTGCCGAATTTGTTGATCCACATGAGGT
GAAGCTCAATGTCGAACACCCTCCTCCACCGCTAGTGCTTAACAGCCTCA
GAACGGATACAGTGCCAAAGGCAGCAGCCTTCCAGCAATCGAAGGCTAAC
CAAACCATGCTTCCTCATGCCGCTGGTACCTCAAGGGGTGTGTTACCTGT
TCCACAACCTCTTCCTAAGCTGTTTCCTATCTCTAAACCCGGGTCGGAAA
GGGAGATGCTTCCACCCCCTCCAAAGAAGCCTGAAACAACACGTGTCTTG
ACACTTGATGATCTCTTCAAGAGGACACAGGCCCCTCCAATGATTTACTA
CCTGCCGTTATCGGAAGAGGAGGTGGCAGCAAAGCTTGCAGCACGCAGCA
AACGGAGGAAGAGAGGGTAGGGGACTCGAATCTGCTGCTCTGGCTGGTAT
GTTGGTGCCTTGTGGTTGATATCGATGTTTTGAACCGAAACTTGCTGAAA
TGGTCATTAACTATTCATCTTTTTTTTTCTCCAGATAAAACCTGTCTGAT
CAGCAGATTCTCCTCCAACAACCTTGACTGTCGCCACTGCTGTAGTCCAT
GAAGTGCCAGTTAATAGTTGCTGATCGTAGTTGTAGGTGGTATTTTGGGG
CGAAGAAACTCATCGTCGTGAGAACCTTGTAGTCCAGGTGTAAATTGAGC
TAGTACTCTTATTTTCGCTTCTCTATCGAACTGTTAACATCTTCACGTCA
ATCTTTTTACACCACTGGGTGTGACTTGTGAGGCGCGGCTGCTTTTGTTT
TGCTGAACTTCTGGCAACTGGAAGAAATGTATACGTGTCTTCCAGGTTGC
TCTTGTTACGTGTCAATGAAAACT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.