Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA011936

[Submit comment/correction]

Sequence	AA011936
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA011936
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	AAAGGAACCAACCAACAAACCTGACGTCACCGCTCTCTTCCCTTCCATTT CCGGAGCTCCTTTTCACACGCGATTTCGCATCCCCGACATAAATTTCAAA AATCTTCCACTACTGCAGCCACACGCACCGATCCCTCCCTCCCCCCTGCC GAATCCCCACCAATTCGCCGCGCAAGCCTCGATCCCGCATTAGCTCCGAT TTGCCCCCCGCGTTCTCGCGCTTCCCCGACCCCCTGGATCTCGGGGTATC CCCTCTGTCAAATCCGTCACGGGATTCTTGCCATTTGGAGCTCCTTTTCT GCTTCAAATAGGAGATCTCAGTGTGCAATTCCTTTTGTGGGTGCGACAAG TTTTCGACTGCCCTAAGCAGCGGATTCAGACAGCGCCGCAGTTGCAGTTC CAGTGCTGTTGGTGCGTCGCGGCATTGGATCGGGCAGGAGAGGTTGGTGG GCGGGTGGGCGTCTGTGATCTGCGCCGCTACGCCAGCACAGCGTAGCGGG GCGATGAGAGCTGGCGCCGTGGTCCCGAAGGCGGCGGCGGCATGAGCGGC GGGGCGTCGCTGGGGCTCAGGACCTCTGGGAGCTATGGATCCTTGCAGCA GTCCAACGGTCAGTTGGCGTTGCCGGCGCCCTCGCCGCCGCTTGCGGCCC GGAAGCCCGCGAAATTGTCCCTTGGCGGCGGCGGTGGCGCCGGCCGCGGA GGCGAGCGCCTCCTCCTAGCCCGGATCTGGGTGTTCGCGAGCCGTCGCCA GCGGATGCTCCTGCTCCTCCTCGTCGCCGTCGCTGTCGTCTGCTACTTCC ACTTCTCATCACTTGTCAGTAAAGGTGGTCGTTGTATTGCTTTGCCTCGT GTTTCATGCCTAACCCCACTGCGACTGTTATCATGACTAGATCAAATCTT TACCATGCTATTGTTAGTTTGCTTTCCTTTCGAATAATTTGGTCAATGAG ACAATAATGAGTTCAGCTGAATGATGCACTCAGTATAGTTATGTGATTCA TGTAGGTGTTTCTCATCGCCAGGGCTAGAAAACATCTGGTTTCCTGTTAC TTAGGCATACTTCACTTCCTGTGTCCAAGTTATAGGATGTTACTGAGTAT TATTATTAGTGTGTCTGCCTTCAAGTGCACATAAAGATCAAGCTAATAGT TGACTTCCAAATTGTAAAAGCTTTAGTGTAGTGGAAAGAATGCAATCAAG ACCTTGACTGATGGAAAATAAATAAGTAAATGAATCTAAGTTTCAATGTT CTGATGCTCGCTGGCGACCATTTTTTCCTCTAGATTGTTTATTGGGTAAG CATTTGAATATTTGATCTCCTATATCCTTGTTTGTGTGAATGCTTTAATT TCCAGCACTTTTAACTCTTAGCTGGCTGATGTAATGCAAATGAACTATAT GCTGTTAGTAATTTAAATCAGGCGAGCAGTGTCAGCATTATTTCTGTTAT ATTTGAGCTAGGCAAGTTTGCATTAAAGATTGTTGTGGTGCAGACTTGTT TGGGATGTATGCTGTTAGATACAGTAAATATGATATAGCTATTTCTAAGG GTTAAGGCTTTACAATGGGCTTGAAGGATGAAAAGTGCTAGTGTTTACAA TGCTGTTGAGATTTGTTCCTTTGTGTTACCTGCTAGGTAGGCTTCCGGAT TAGTAATACCTAGATGTTTATTTCTGCAATCATTTAGTCAGCTGCGTGCA TGTGATTGCACATGTTCCTTTATATAATTTTTTCTTTCCAATATGCATGT TGTTTCACTTTGGCATACTAATGAACACCTTTTAAAATTTTGACTTAAAA TGATCAAGTCTTTTGTTTCCTAGCAATCCATCTGTTCAAATTTCACGCTT ACGATAACAATAGGTTGATCTGGATCGAATCACATCAGTTTCTTATTTTT GAACTTCACTGGTTGAAGAATTTAATCCTGTTCTGGTGCTAATTTTTCAT GGGGCCTTCTGAATGTGTGTAGTAGATGTTGATGATTCTACTGAATACCT GTTGTCTAACCCTTATGGGCCAACAAGAATTTTTTTGTTATGTTGCTTGC CCTAAATGTTGTCTGCTAAACATTTTGTCTCGATTAAAAACTAACTTATC TAATCTATTTTTTAGTTTGTAACAAAATAAGACAGAATCTAATAACTGTA GTAGTACTCACTTTTGTTTTGTTTCTGTGTTTTCACCTTGATATTATCTT TGAATACTGAGCCAATAAATCTTCTTTTGGCTTATTGTAGATGAAGTTGC AGCACCTGGTACCCAGACCATGCTGGGGTTTTCTGATCATGTCCAGAGCT TGGTAAATGGAAATGGTTTGAATACCACATCTCGGACCGAAAAACAGTCT GACATCAGTAACGAAAAGGTTCAGGGTCCTTTGCGGACTTTCCCACCAGC TATTGCTCTGGAGCACCATCCTTGTGAAAATTTCTCCTTTTCTCCTCCTC CTGTTGATAGGAAACGCACTGGACCACGGCGTAAGTTTCTTACTCATCCG TATTCAGAGTTACAAAATTTCTGAATCTAATTATAGTATTTTGAACTTGT GTAGCATGTCCTGTTTGTTACGTGCCTGTTGAGCAGGCCCTGGCATTGAT GCCACGTGTTCCAACAGCATCACCTATCCTTCAAAGTCTAAATTATTTGT CCGAGGACCAATTGGTTTTGAAAGAGTCCAACAGTGGGTCCTTGTTTGGT GGCTATCCATCCCTGGAACAACGAGATATGTCTTATGACATAAAAGACTC GATGACAGTACATTGTGGGTATGCTCATACGACTCATCTGCTTTAACTCT TGTACATCTGTAGTGTATACAATCACTGTAACTGTACCACTAACCTTTTC TTTATCTTAAGATTTGTGAGGGGGAAGGTACCTGGTGTCAATACTGGATT CGATGTAGATGAAGCTGATCTGTATGAGATGCGGAAGTGCCACGGAACTG TTGTAGCTTCTGCTATTTTTGGTAACTGCATGCTCTTTCTACGTTATAGT TATGTTTATATGTCATCATCTTTCTATGTTGGTGCTGATTTCACGTCCTT TTGTAAACTTGCTTATTTGTTTGTACTTTCTCAGGAAATTATGATATAAT GCAGCAACCAGAAAATATTAGTGAATTTTCAAAGGACACAGTTTGCTTCT TCATGTTTCTGGATGAAGAAACAGAAGCTGCAATAAAGAACACCACTACT GTTGATAATATGAAAAAGATCGGTCTGTGGCGTGTGGTTGTTGTCCACAA CCTTCCATATTCAGATGCGAGAAGGAATGGAAAGGTACATGTATATTCGG TTATTTTGAATTTCCTAGTCAATTCTGTGGAGGCCAGTTACTTCTGGCAT GCAGATGCATAAGTTCACAAGTTAAATTTCAGCTAAGCAGGCGATGTAAA CTACAAATTATCGGTGTAAAGATAATTACGGTATCTGCTTCTAAGATCTT TATGTCATATTCTAAAAAACATGCATCTTGATCTAGATAAATTGGCTGCT AAAGTTGCCTGCACTGTGAGGTGGCTAAGTGTGAATGAGACTAAATTTCT TGCCTTTTTATCTTTATTGCATTATTCAGATATTAAGTAGTACTGTAAGT GATGCTTCCAAGACAAATATATTTTCATCATTTTATCCATTAAGTGAATG TGTAAAAAGGAGATCGCAGAATCCCCATCTATGTTTCCTGACTTAAAAAA CACATTTCTTTTGTTCTGTAAAAAGGTGACGGCATGCCATGCTTAATGTG AGTCAGCATCAGTGGTTTGTTTTTCTAATCATTTATTTATTTTGATGTTT TTCTCAAACAGGTTCCGAAACTATTACTTCATCGACTTTTTCCTAATGTG CGATATTCACTCTGGATTGATGGGAAACTTAAACTAGTGAAGGATCCTTA TCAGCTATTAGAGAGGTAAACATCACATTCACTCACTGAGTTCGACTGCT GTTTGTTGTAACTGCACTCTGCATATAACTGAAGGACATTTAAGTTTGCT GTAAAAAATGTAAGTTTGCTTGTTGCCAGTGCCACTGATGCTCTATCTAC TGTATTAAGATCCAAGCTGTGTCACATTCTTGCTGTATTTTTTTTTTTCA AAGTCACTGTTATCTGGATTTTGACATGTTATTTTCTGATTTCTGAATAC GCTGTTATGCTACAGATTCTTGTGGAGGAAAAATGTGAGCTTCGCAATTT CCAGGCATTATAGACGCTTTGATGTCTTTGAGGAAGCTGAGGCTAACAAG GCTGGTGGAAAGTATGATAATGCTTCAATTGATAACCAAATAGAGTTCTA TAAGAGAGAGGGTTTAACCCATTATTCATCAGCTAAGCTTCCTATTACGA GTGGTAATTGCTTCTTCTTACTAATTTTTGACATAGTATCATTTTCAATG TACGTCATCCTGATGACTTGGATGACTTAAACTATACAATATCCTTAACA GATGTCCCTGAGGGCTGCGTGATAATAAGGGAGAACATCCCCATCACCAA CCTCTTCACATGCCTTTGGTTTAATGAAGTTGATCGCTTCACTTCAAGAG ATCAGATAAGCTTTAGCACAGTGAGAGATAAAATACGGACAAGAGTTAAT TGGACTGCAGACATGTTCCTGGATTGTGAAAGGCGCGATTTTGTTGTTCA GGTAAAATTTTGAGTTAATGCGTTTGTGCGGTGCGTTTCTATATTTTCTG TGCACCCTGTTCTCATGGAGTATACTCCCTTCGTTCACTAATGTAAGACA TTCTAGCCTTTTTCTACAACACACATGTACGTAGATGTGTTTTAGTGTGT AGATTCACTCATTTTGGAGTGTATCTAGTCCATTTTGAGATATCTAAAAG GTCTTACATTAGTGAACGAGGGAGTAGTATTGATAGTTTCAAAGGATAAC CAAATGTAGAGCCCAAAATATGATTGATGATAAGACACTCTACAGTCTGG CTTCTAAGTGGAAATCGGAGGGCTTTGATCCCTCTCGTGTTAAGAAATAA CATGATTAGTAATAACATGCTTATTTTCTGAATAGTACCATTGTTGCTCT TCACCAGTCCCTTATTTGTCGTGTATGTCATTCTTACATTGCAGGCATAC CACAGAGAGCTGATGGAGCAAAGGCTGGCTGCCTTAAGAAGCCAGCCTCC ACCGCCGCCTCCCGCGGTGCGCGCGCAACAACCTAGAAAGATGCTCCCAG ACAACATGGCAAAGGAACCCGGGAGAGCTTCTGCAGCCAAGAAGTCGTCA GGGAAGCGTTCACGGAAGTCAGGCTCGAAACGGGCCCATCGAACGAAAGG GACCGGCGGGAAGGATCCCATCCGGCTGTAAATCTCCCCGCGAAAATTTT GCACCCATACGACATCCCACACGGACTGGTTTATTTAACTCCTACTACTA TTCATGTTCCCCCTCCCCAAAGGCTCGGAAAATTTTGGTCAGGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.