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GrainGenes Sequence Report: AA029042

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Sequence
AA029042
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA029042
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCTCGACCGGATGAGAGCCCGGCTTCCCAGGCCGCACATCCTATATCCTC
ACCCCCTCGCACGCCCCTGCCTTCTCGCTCCCCTTCGAGTCGAGCTACCT
CCTCCTCCTCCTTCTTCCTCCCCCACCTCATCCCTTGTCTCTCTCTTCTC
CATCATCCCTTGCACCTTAGCTTAAACCCGTATCCTCTATCCATTTTCGT
CTCCGTTGGGTTGGAGGGAGCGTAGCAGCAATGGCCCCCAAGGCCGGCCG
CGGCAAGGGGAGGGGCGGCGGCAAGGGCGACCGCAAGAAGAAGGAGGAGA
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CTGAGCACCATTGTTTATTCACATTGCGCTTCACAATGCGCATATATACT
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TATCGACGGATCGCGTGCTGGACGTGAGGAAGCTGCTGGGGTCGAACGTG
GAGACGTGTCACCTCACAAACTATTCACTATCCCACGTGGTAATAATGCT
CCTCCCTCCCTTGTGCCTGCTACGGCCCCAATTCATTTGCACTCTTGTAG
CTGCACGAGACGGCTAGCTAGCCCCAACATTCTTGTCTGCAAGTCGTCCT
AGCTAGCTAGCTACTCCTGACAAACAAATCAACTCTCTGCATTTACTTGC
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TTGGCCTATATATGCAGGTGCGCGGTCATCGGCTGGACGACGGCGTGGAG
ATCGTGGCGCTGAAACCCTGCGCTCTGACCATCGCCGAAGGTAGGTGGCC
GTCCACAGAATCCATATACGTACCTGCTTCTGCTTGCGTCTGGTGCATTT
GCTGGCATTTCCTTGTTCTTTTCGCCCCGGTTCCATTCTTGGCGTTAGGA
AAGGTTCACGTGGATTCGCGCGCGCTAGCTAGCTTGGCGTTTCTCGGACG
AGCACGGCGGAGCTGGCACAAGCTTCTCATGTCGTGACGTACGCACGGAC
GGTGGAAACTAACGGGGAGCACGCACGCATGCGCGATCGATCGAGTTTCT
TTATGCGACCTTCCCACCATCGACACATTGTAGAATGCGCCGCCGTCACG
TCCGAACTAATGCCATTTCCCTGGCTAGCGACACATCGTCCTACCTGCTG
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CTTGGGGACTTCGATCACCTACGAGAGCGGAGGACTTGCCGATTGGTTCC
ACATTTTTATTTCTCACCTTTCCTTTTCATAAGAATATAAAGATCGAGGA
GGGGTTCTGACTCTGACCACGCATAGCATAGTACTTGACGTTGGACTCGT
ACGGCCAGGCGAGGTGATTGGTCGTCAGATACGTCTTGTTTAACATCGGC
AAGTATTAGTATTTTTTGGCAGGGTGCACTGTGCTGTCGTCAAGTGCTAA
ACTGGCATTTGGACGCACTGAGAGGGCATATTTCCACTTGGCCGATGCCA
ATTCCATCTCTTGCACCTTCTCTCTATAAAATAAATCGTGATTAATCCGA
CCAATTAGGCACGGCGCTTAACTCTAGTATACAATCTTATTACCTGAGTA
GAAAATTCAACTTGTGCAAGGTTTGTCTTTCCTAACTGCTACCAGCAAGT
ATCTAGTTGCTATATTTTGTTACACAAAAAGTATCTGATCTTTGTCGGGA
ACTCCGGGGGTTGGTATGTACGGACAAAGGGCGGCTCTTTGGAATCAGCG
GATTTCGGTGTATGTGCGCGTGTTGGACTGTTAGGTCCAGTGGCCGCTAA
TTTTAATCCTCCTCCGTCGCTTGCAATGACCTGATAGCTCTACTACGTCA
GCTAGATTAGGTGTACAGTGATAATATTACTATACATGTACTAGTACATT
ATCTTCCTACTAGTCAAAACATGTGTATTAGCAGCTTGCTGACTCTATTG
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TACTAGCTTGTTGATTCTACAGGGCGTGTGGGTCGAAATTACCGACATTT
CCTTACCTTGACACATCTTATCCTACTTTTTCCCCTCTTTACAAGTATGT
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TCATTCCAAAATAGATGTCTTAGATTTGTCAAAATTTGAATGAATCTATA
TTCTAAATAGTGTCTAGATTCATTTAAATTTTGACAAAATCTAGATTCAT
TCAAACTTGACAAATCTGAGACATCTATTTTGGGACGGAGAGAGTATTTC
AAGTGAAAAAAAAACATTTTCTCTCTAAAATAAATGGACCCGATCGGCAG
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TACTAGGCCTTGATTCTAAATGGGCCCGACAACGGCATTCCCTTTGTGCA
GAGGAGTACGCGACGGAGGAGGCCGCGGTGGCGCACGTCCGCCGCCTGCT
GGACATCGTCGCCTGCACCACCGCGTTCGCCAAGCAGAAGCACAAAACAT
CGGCCAAGCACGCCCGCCCCGCGACGCCTCCGTCTCCCCCCACAGCCTCT
TCCCCCGCGGCCAATGGCGGCAAAGGCGCCGGCGATGTGCCCGCGATATC
GGAGGCGCACGACATGGCGGCCATCGGGCCGCCGCCGAAGCTCGGCGAGT
TCTACGACTTCTTCTCCTTCGCCCACCTCACACCGCCCCTCCACTGTAAG
GATACGCATTTCGCTTAACTGTGCCCTCTCGCGCGGAGCCTGAGCGCCTG
TGTGGGGGATTAACTAACGCGTACTTCGCGTGTGCAGTTATCAGGAGGAA
GGAGAGGAATGGCGCTACCCAGGAAGGAGATTTCTTCGAAATCGAGGTAT
GTGATCTATCTCCCTCCCTCTAGGAATGCACTAGAGCTCCTGACATTGAC
CCTTTAATTTGCAACCCTGCAACTGGAAACTCCACCGTGAGTCTCTACTC
TCTAAGACTGTAACCATAGTCACCTCACTGAATGGATTTTGGGTATTGTG
ATCCAGGTGAAGGTTTGCAACGGGAAGCTACTGCACATAGTTGCTTCGGT
CAAGGGTTTCTATCTGGTGGGGAAGCCGCACACCGTGAGCCGATCCTTGG
TTGACCTTCTACAGCAGCTTAGCACCGGATTTGCCAATGTTAGTATGAGC
GCAAACGCTTCCTTACTTAACGTTGCCTTGCTTTCTTTGTTTCTAATTTC
GCCTTTTTTTTTTGCTGAATGCACTTCAGTTTCCATAATCTAACAAGTGT
TTTGGCACAGGCATACGAGGCACTGATGAAAGCTTTTGTGGATCACAACA
AGGTGATTGTCGTAAATACTTTCCTTTTTCTTAGTTATACTGAAGATCGA
GTCACTGCTTAAATCTATTGAAGTTTTGATGGTGATACATTTCTTTCATC
CTCAGTTCGGGAATCTACCGTTCGGCTTCCGTGCAAACACATGGCTTGTT
CCTCCTGTATATGTGGATGCTGCTACAAAGAGCCCAGCATTGCCTGTTGA
GGATGAGAACTGGGGTGGGCATGGAGGTGGTTGCGGACGAGATGGAAAAT
ATGACAGGAGACGGTGGGCAAAAGAATTTTCTATTCTGGCTAGAATGCCA
TGTAAAACAGAGGAAGAGAGGGTGATCAGAGACCGCAAGGCTTTCCTTTT
ACACAATTTATTTGTGGATACAGCGATTTTCAGAGCTGCTTCGACAATAC
GGCGACTGGTTGATACTAGTCCACAAACCGGTTCTGATGGTTCGTTAGTA
TTTGAGGAACGTGTTGGGGACATGCATATGACTGTAAAGAAGGATGAGGC
TGATGCCAGTTTGAAGTTGGGGGATAAAGTTGATGGAGCTGCCATCTACC
AGACGGATTCTATGGATATATCACAAAGGAATCTTCTGAAAGGTTTAACT
TCTGATGAGAGTGTTGTTGTTAAGGTGATTGCCTGCCTCCTTCATGATTT
GTGCAATTAACGGTGTGCTCTTAATATTAAGTGCTAAGTTCTTTCAACAT
AATTCCCTTGCAGGACTCTTCCACGCTAGGTGTGGTGATTGTTAAGCATT
GTGGATATACGGCAACAGTGAGGGTTTCGGGACGTACAAAAATTATCAGT
GATAGCAAACAAGCCAGTGATATCTCTGATCATCTTGATGGAATGCTTAG
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ACAGGTTTGATATCTATTTTCATTTACATACCTGCTTAAGCATAGGCTGA
TAACTTCAATATCTTATTCGAATGTTTGCTCATCACTCGAGGAAATACTG
TTTGGCACGTACTAATTCTTTTACATCTGACTCTCGATGTTGTTATATTA
ACCTTGTTCTCTCTCTCTCTCTGTGTATTTTTTTTCAGTCTAAGAATACC
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ACATATCAGATGGGAACTTGGGTCTTCCTGGCTGCAACACTTGCAGAAAA
AGGATTCTTCAGTTTCTGAGGATAGTGAGAAGAGCGCAAAAAAATTTGAA
AAAGATTCATCTGTCAAAGGTCTTGGCAAGCACTTCGAACAGTTAAGGAA
AATTAAAAAGAATGCTGAAGACGCTAAGTCTGAGAAGGAAGAATCTGATA
GCAACTGCTCGCTGACAAATGGTATGGAAGAATCAGATAATTTAGCACTT
AACGAATCCAGTGAGGCTGAAATAAGGAAGCTGATTCCAGAAGATGCTTT
CTGTCGCCTGGAGAGTTTGGGAGCTGGCTTTCATCAGAAGGTGACTTAAC
TATACAAGTTCACAGTTTTATTATAGAATTTCGAAGTGCCACCAATTGAT
ATGTTCTGTCTGAAAAGAATTTAATTTATGCCCCCTTGAGCCTATCCATG
CTATTTGCTCAGGATTGACAGAGCAACCAATTTGCTCTACATATGCTATT
AATTTGCTTGAAGCCTTTGTATTTTGTTGTGTCCATGATGTATGAGCAAA
GGACATCATTGTACTCAGCAACATGTTGGTGGGACTTTGTTGTGTTATTA
CCTAACTTCACTTTTTCTTGATCCAGACCCTTGATGAGCTCACAAAGATG
GCCCATAAGTTTTATGATGATACTGCACTCCCAAAGCTGGTAAAGCGTTG
TCTACTCTTATCTATTCAGAGAACCTTTATTTAAGATCCATCATTCTGAG
AGGGATATTTAAACCATTGCTTGTTTTGAAACTTTCTTAGTGAATAATTA
GTTTTCTCTGTGACTAATTTGCGCAGGTGGCTGATTTTGCTTCCCTTGAA
CTTTCTCCAGTAGATGGAAGAACCATGACTGATTTCATGCACACAAGGGG
ACTTAATATGTGTTCATTAGGCCGTGTGGTGAGTGTAAATACTATACTTA
ATTGCTTTTGCTTCTAATACTCTGATGAAATTGCCAGAGTCCTGATGTTT
TTTTTTGTTCAAATATCAGGTAGAGCTAGCAGAGAAGCTCCCACACATCC
AGTCAATATGCATACATGAAATGGTCATTCGATCATTTAAGCATGTCATT
CGAGCTGTTATTGCAGCTGTCGATGACATGCAAAATATGTCTGCAGTTAT
AGCTGAGACTTTAAACATTTTACTGGGATCTCCAAGATTAGACAATAATC
TTGATACAGATGCCCATAATGAGCATAACTTAAAGCTGAAATGGATAGAG
AGCTTCCTATCTAAAAGATACTGTTGGAAATTGAAAGATGAATTTGAACA
CTTGCGGAAGTCCATCATTTTGAGAGGCCTTTGTGGCAAGGTACACACTA
TAAAGTGAGATCTACAAACATTCACAGCATGCATTTTCTAAACACCTTAA
CATTGTATTTTTTGATCAGGTTGGCCTTGAGTTGGTTGCAAGAGATTATG
ATATGAATAGCCCAAACCCATTTGACAAATCTGACATCGTCAACCTAGTT
CCTATATGCAAGGTAGCGTACGGACAGTTGCTGAAGTATCTATGTCTCCG
TCTATTAGATAAATTGTTGACTAACTTTGCTTTGCACTGTCTTCTCTTTT
AGCATGTCGTCTACTCATCTATTGATAGTAGAAACTTACTAGAATCATCA
AAGATGGCTTTGGATAAAGGAAAGCTTGATGATGCTGTTAACTATGGAGC
AAAAGTATGTAGTGGTCAACCTTTTTTGTGTCTTTTCTGTAATCATTTAA
CTGCTGTGCTATATTTCTTGCATTTTGAATAGTGAAGTTATTCGTATGCA
CCTTTATGTCTAATGTACTCTCTTTTCTTATGAAGGCACTGTCCAAAGTT
ATAGCAGTTTGTGGTCCATACCACCGGCTAACTGCTAATGCCTACAGTCT
TCTTGCTGTGGTTCTTTACCATACTGGAGATTTTAATCAGGTATGTAAAC
GAATTGAACTAGGTTGGCTGTACTCTGCTTGTTGGATACTCTAGTTTAGT
AGTTTTCATAAATCTGTTTTTCTCAAAAACAGCCCTAGTATTAATATTGC
AGTGAGCTGCATAGTATGTCATTATAGAAGCTCCTGCAAGGAGAGACATG
TCGAATAGCACCGTGTGAAGATATTGGAAGTTGCACTTACTCTGTATTTT
GTTCCTTGTAGGCAACAATATATCAGCAAAAGGCACTTGATATCAATGAA
AGGGAGCTTGGTCTTGACCATCCGGAAACAATGAAGAGCTACGGGGATTT
ATCTGTTTTCTACTACCGTCTCCAACACATTGAGATGGCTCTGAAGTAAG
TGTTGTCATAGATGTTTCCTTGTGAAAACGTGAAATCTATCAATCATGAC
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ATGAAAAATGGCCATGGTCACTTTTTTGTTGGAACAATCATTTGTCACAC
ATCATCCACTTCTTGTCATTTTTGTTGACTCTAAGAGTATATTTCGTCTT
GAAGGTATGTCAACCGTGCACTTTATCTACTTCAATTCTCCTGTGGGCTT
TCTCATCCAAATTCAGCTGCCACATACATAAATGTGGCTATGATGGAAGA
AGGTATGGGAAATGTTCATGTTGCTCTAAGGTATTTGCATGAAGCGCTAA
AGTGCAATAAAAGATTGCTTGGAGCTGATCACATACAGGTAAATGGATCT
TTAGTTTTTTTTTCTTACCATGTTTTCATAGTCCACCTCAAGGCAATTTA
TATTAAGAAACTTTTTATTGGAATTGGTTGATGTACTCCAGGTTAAGATA
TTTTGCAGATATCAGTTATTTATATCTGTCTACTCCAACACAATATTTGA
GCTCTCTCCTGCACTACTATTTGTTAAGAATGTCATGTTAGTACTGGAAT
GCTTGTCTTATTACAATGATGATATAATACACCACTTATAATCATTATCA
GATCGATTTCTTCATATAGCTGATCACATACATTTTAGAGGCTCTGTTGA
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TATCTTACAGCAAAATGTGCATAGACACCTGTGGTATATTGGACGTGTCG
GGTTACGCTCAAACAATACATGCAAAATCCATCTTTTGATGTAGCTTCTA
GAATTTCAGGATATTTTTCACGTTCTCGGTAAAACTCTTCAGTGTGTTCT
AAGTTTTGAGATGACATATTTTTTAGATAATCCAATATAACCATGCTGTT
CTTAGGTTCAGAAAAGGTTTATATACTGTAGCTCTGTGCTGTCATGTATG
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TTGAATTCCTTTGTGTACAATATGCACACGATCCAGTTACTAAATTAGCA
TCACTTTTTTTTGCCAATCAGACTGCTGCAAGCTACCATGCCATAGCCAT
AGCCCTTTCCATGATGGATGCATACTCCCTAAGCGTGCAACATGAACAAA
CCACCTTACAGATACTTCAGGACAAGCTAGGAGAAGATGACCTTCGAACT
CAGGTTAACTTTCCGTGAATATAGAAACAGAAGGCCAAAGATTTCAATGT
TCTCTTAGATTATTTAATGTTACTTTCTTGCTGCAGGATGCTGCTGCTTG
GCTGGAGTATTTTGATTCAAAAGCATTAGAACAACAAGAGGCTGCTCGGA
GAGGCATTCCAAAACCTGATTCTTCTATTGCAAGTAAAGGACATCTTAGG
TATGAATAAATTGTGTATTATCAATTTTAAACTGTTTCAATCCCGATTGA
AACATTTATCCTTCCAGTGTATCAGATCTACTTGACTACATAAGCCCGGA
CCAGGAAAGAAAAGAGAGGGATATGCAAAGGAAGTGCAGGCGTGCAAAGG
TGATTATAGTATCTCTTTTGGAGATATACCCATTATATTTGGTTAAAAAG
ATCTTCTAGACATATACTGACAATATTTGACTAAGGTACCTGATTGTTTA
GTGTCAGTTATCTACCTAGCAACAATCCAGGTCCACCTATTAACTTATGA
ACCAACAATAAATCCATTTTGTTCTTAAATGGAACTTCTCTATATGTACA
AGCATTTAATCCTTTATCATGCTGTATGATTCATGAATTACGGTCACTTT
TCTGTTCCTTGTGTAACCTGTTGCTTAAGGGTTCTATAACTGCTGCCTGA
AGCACTATGTGAGACTTCCATTTTGCTCATATTTCCTCTTACTTAACCTT
TTTCATCACATGTTATATTAAATGCAGAATAATACCAGAGCCCAACAGGG
TGAATCAGTTGACGAAAAGGAGAACTTCCAGCATGACTCAGGATTTCTTC
TTGAAGCAGACAAAAATGATATCCAAGAAGCAAAACTGGAAGTGCAGGCT
CCTGTAGTAGCAGCAGTAACAGAAGCAATTTATGCTGTCCATGATGAGCT
GAAACAGGTAGATGCTTTGTCACCTGAAGAGTATTCTGATGAGGGTTGGC
AAGCAGCTACTTTGAGAGGGAGGTCTGCAAATGTGCGGAAGAAAAGCATC
CGCAGAAGGCCAGCTCTCACTAAATTAGTCGTTGATCACATAGAAGATGG
CCGCACTGCTTCTGCCACCAGGACTGGTGTACAGCAACAAACAAAAGAGC
ACAAAGAGGAAGCTATATACTCCCCTAGCCAACTGTCATTTGGCAACTTC
TTGAAAAGTGACAAGTTGAATGGGGATCCTTCCATTACTGAAGACAAGTC
TAGTAATGCTATGTCGAAGCCAGAAAGGAGCATAAAACCTGCAGGAATTA
ACAGGCCAACCAGCATAGCTTCCAAGTTGGTATCATACAAAGATGTGGCA
GCGTCACCGCCTGGCACCGTATGGAAACCAATTTTGGAACAGAAGGAAGC
AAAGGAGAAGGATAATGAACAAGATACTGATGTAACACCCTCATCTGAGG
AAGAAGATAGGAAGCTTACAGATGAAGTTGAGAAGTCAAGTGATGAGGGC
AGCAAAGAGATAGTCTCAAGTCAGCCAGAGGGAGGCAGTCATTCAGAGAA
AGCTTCTGACAGCAATAGTGACGGAAGCACATCTCCACACAAGAAAACAA
GTGGAAGCAAACTTTCAGCTTCAGCACCTCCATTCAATCCTGGATCACTC
TTATCAGTGTCCCATCCTTACAGCACAGTGGCAATCTATGATGCTAGTGT
TGTTCTTCAGCCAATCCCAAGTCAGGCAATGGAGATTCTTCCTCATGCTG
TTGATACTAGAGTACCTCGTGGTCCTCGGTCCACCTTATACTATCGTACT
GGGCATTCTTTCCAAAGGAAGCAGGGTTATACACAGAGCCAGAGCACTAT
TCTGAGGGGTAGCACCTCCCCTCCAGCCATGAATCCCCATGCTGCCGAGT
TTGTGCCTGGAAAAACTGCGCAACAAACTGATTCGGCTAACGGGGAACAT
GTAACTGATTCAGCAGAGAAGCAGTTGGCATCACAGACCGCAGATGAAGT
GAAAGTCGATATTCATGCCGCAGAGAAAGCAGGACAATTGGAGAAGACAA
CTTCAGGTAAAGGGAAGGAAAACAGAGGGAGAGACACGATGCGAGATTCA
TACAAAGCAGAGCTAGCAAGGCAGATTCTTCTCAGTTTCATTGTCAAGTC
AGTGCATGACAGTCTAGGTTCGACCCGAGCTCAACCGGATAGAAAGCCAA
GTGTACTGGATGAAGCCAGTATTGAACAGAGCAGCAACGTGACTAAGTCT
ACCTCAGGTGGTCGCAAGGAGTTCGATAAACAACCGAAGGCCGCCGAGGT
GCCAAAAAGCGACAAGGATACAGAGGGCTTTACAGTAGTTTCGAAACGCA
GAAGAAGCAAGCAACACTTCGTGAATCCCATAAATGGCCTCTACTCTCAG
CAGTCAATCTGCACTTCGGTCAGCTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.