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GrainGenes Sequence Report: AA023052

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Sequence
AA023052
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA023052
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TCCCTCGCTCTCGCTCTGCACACTGCGCTTCCCCCTACCTCTGCCCCTGG
CCCAAAAGCTTTTCACACGCATCTCCCTCTCTGTCTGTCGCGGAACACTT
CACACTTCACACCCGCACTGCGCGGCGCAGTGGGCGAGTGGAGCGAGCCC
AAGCGTCGCCTCCTACGCCCCATCATCGTCGCCGGACGCCCCTGCCCGCC
AGCCACCGGTGAGTTCCAGGTCTCCCACTTTCGCCCGTCAATCACGAGCC
ACCACCCGGCGCTCAATTGGAGCGATTTGGTGCTTGTTATAGGGCTTTTT
TCTGGGCGTTTGTTGGGCAAATTCTGTCGAGATCTCGCGAGTCGTGGGTC
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ACAGTGGGGAGCGATCTGTGGAGGGCCGTAAGCAAGCCCGTAATTCTCTA
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TACTACCTCCGTTCAACAACATAAGCCTTTTTAGCAAACTGTTTTAGCTT
GCTAAAAAGGCTTATATTGTGGAACAGAGGGTACTCTAATTTGATGGTTA
CAACATGTCCTTACATATGTTAAAACCATGGTTGAGGGGTATATTCCTTT
TTTGGCTGTTAGAACTGGATCTACTACTGTGGCAGTGTGGCTATTAGACT
ATGCATCTTTTGATATGGCACTCTTAAATTTACATGAATGTGTTATTATC
ATGGTAACCACATGCTCTAAGTGGTAACCTTTCCGCCATTTTGGTATTGC
GTAGTTAATTTGAAAAATGGATGACACAAGCTGGCTATATTACTTTATTA
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GTATAAAATATCTCATTTTGTTCACTATTCTTTTGTTATGCTTATGACTT
ATGACTAGTCTGAAAGTAAATGTTATTTTGCATTGGAAGTTTTCGTAGAA
TTGATTGCTCTGCAAAATTAGCTTAGCTTCTTTGACTTGGTAGTTGTTAC
ATCGTCATTTTGCAAGTATTTGTGTTTATTTCAATTTTTCAAGCATTTGT
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TAGGGAAGCATGCAATCTTGCAGATGTCGATGATCCTGAAAGTGCAATGT
CCACGGTTGCTCGATTGCTGGAGCAGCTACATGGTAGCATGACGTCACTA
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GCCCTACTTAGTGCACTCTGCAAGGAAGAGGACCTGCGTATCAAGGTTCT
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CTGAAGCAAAGAAGGCTGCTGCTGAGGCTATTTTTGAAGTGTCTTCAGGC
GGTCTTTCGGATGATCACATAGGCATGAAAATATTTGTGACAGAAGGTGT
TGTGCCGACTCTTTGGGACTTGCTTAACCCTCGGTCACGCCAAGATAGAG
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GATGATTATTGGAAGGCCACACTTGAAGCTGGTGGAGTAGAAATTATTAC
CGGCCTTCTTTCATCCAAGAATACTGCTTCACAGTCAAATGCTGCCTCCC
TCTTGGCACGGTTGATCTCTGCTTTCAGTGATAGCATTCCCAAAATCATA
GCTGCTGGAGCTATTAAGGCCCTTCTTCAGCTTCTGAATCGAGATGATGA
CATTGCTGTTCGGGAAAGTGCAGCTGATGCTTTGGAGGCCCTATCTTCCA
AGTCTATTATTGCAAAGAAAGCTGTGGTGGACGCAGGTGGCCTCCCTGTT
TTAATTGGAGCTGTTGTAGCGCCTTCAAAAGAGAGCATGCGGGGGGATAC
CTGCCATTCTCTGCAAAGCCATGCTGTTTGTGCTTTATCAAATATTTGTG
GTGGCACAGCTTCTTTGTTGCTTTACCTGGGAGAGATCTGCCAATCACCC
CATTCTGTTGCCCTTTCTGACATTCTTGGAGCACTTGCATATACTTTGAT
GGTGTTTGATGGCAGTGATGGTAAATCCTTTGATCCAGTTGAGATAGAAA
GCATTTTGGTTTTGCTCCTAAAATCCAACGACAATAAGCTTGTTCTTGAT
CGTATTCTTGAAGCTTTAGCGAGTCTATATGGAAATGCCTGTTTCTCTGG
CAGACTCCATCACTCAAATGGAAAGAAGATTCTTGTTGGTCTAGTCACTA
TGGCGTCTGATGATGTCCAGGAGCATCTCGTTCGTGCCTTAACTAACTTG
TGCTGTGATGGTCTTGGACTATGGGAGGCTCTTGGAAAGAGAGAAGGAGT
TCAGTTGCTAATATCATTACTTGGGCTTTCTAGTGAGCAGCATCAGGAGT
ATGCAGTTTCTTTGTTGGCTATCTTGAGTGATGAAGTAGATGACAGTAAG
TGGGCAATAACAGCTGCTGGAGGTATCCCTCCACTTGTCCAACTGCTGGA
AACAGGATCTCAAATAGCAAAGGAGGATGCAGCTCATATCATATGCAACT
TGTGCTGTCACAGTGATGATATCAGGGCATGTGTTGAGAGTGCCGGGGCT
GTTCTAGCGCTGCTTTGGCTTCTAAAGAGTGATAGTCCTCGTGGACAAGA
GGCATCAGTCAAAGCACTCAAGAAGCTTATACGGTCCGCTGATTCTGCCA
CAATTAATCAGTTGTTAGCATTGCTGCTCAGTGACTCGCTTAGCTCAAAG
GCACATGCCATTACAGTTCTTGGGCATGTCCTTGTGCTGGCTCCTCACAG
AGAACTAGTCCAGAATGGAGCTCCAGCTAATAAAGGCCTTAGATCTCTTC
TTCTTGTTCTTGATTCATCAAACGAAGAATCTCAGGAATATGCTGCAACT
GTGCTGGCAGATATTTTCAGTACGCGTCAGGATATTTGCGAGAACTTAGC
GACTGATGAAATTGTTCAGCCATGCATGAAGCTTTTGACAAGTGGAAATC
AAGTTATTGCAACACAATCTGCTCGAGCTTTAGGAGCACTCTCGCGCTCG
GCTAATTCCATCTCGAAGAATAAGATGTCATGTATAGCTGAGGGTGATGT
GCAACCTCTGATAGAGATGGCGAAGACATCGTCCATTGATGCAGCTGAAG
CAGCGATTGCTGCGTTGGCAAATCTCTTATCAGATCTGCAGATTGCTAAA
GAAGCACTAGATGATAATATTGTCCAAGCTTTGACTAGAGTGCTAAAGGA
GGGGAGCCTAGAAGGAAAGGTTAGTGCCTCACGGGCACTTCATCACTTGC
TCAAACAGTTTCCCCTGAGTGAAGTTTTTCCAGATTACTCGCTGTGCTGT
TTTATAATTCATGCTCTGCTGGTGTGTCTATCTGGCATCAGTTTGGAAAA
TGTTACCAGTATGGATCCGCTGGATGTACTTGCTTTGATGGCTATGACGA
TGGAGGGCCATTTTGACACCCCTTTGTGTACTGCCTTTCTGGAATACCCG
GAAAGTTTAGAACCTTTAATCTGCTGTATAAGTGTTGGGCTTCCCCCGAT
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GCTTGTAGAGTTATGGAATCAGCCAGCATGGAAACAAAAATAGGCAGTGC
AATCATCCTTATATCTGCTTTGAAGGACAATAGAGAATGTTCAATTGAAG
TTCTTGAAGCATCAGGACATCTGAGGAGTCTAATATCCGCACTCATCAAT
ATGTTGAAGCAGTGTTCCACTTTAACATCTCTAGACATTGAAGTTTGGAA
GCCTTACACAGATAAGAGTTTTTTCAACTGTGAGCGGGATGTTGTGGATG
TGGCTGAATCAGGAAAGGTTTTGGAAGAAGCTGTGGCACATTTGCTCTCA
CTTATTTGTTCTTTTCATCCTACGAGTAAACTTACTGTGACGGACCTTGG
TGGAGTTGACATTGTTTCTGACAAACTTGCTAGCCACATTGCAAACCAAC
AGGTGCATATTTCACCTTTTAAATTTCTATTTTCCATTGTGCTGTTATTA
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TTTTACTTCTCCGAATTTCTATGCTGTCGGAGTTCAGGGATAGATCATGA
TTAAAAAAACAATGCCATCTTTGTGGGCCATGTACATATTTGGCTCTGCA
TTGATTACTTTAACCTGTTATCTTTACGAGCTAATTGGTTCTTTTTGGGT
CCATGTTTTTCAATCCATGTTACACCCGTTGGTACCTCAAGCTGCATTTA
AGTTGTTCAAACATTAAAATTAAGTACAAAACCAGATTAACTTATGCTCA
GAATCCTGATTAGTATATCTACATGTACCAGTGATCTGACATTATTATCA
AAATCTAACCTTCACGGATATGTCCTTTTTTAATTCCTGATAGTCAGGCA
CTCAGAATGAACAAATGTGGCTGCATGGATCCCTATAATACACCTCGTTG
TTAACAATTTTAGGAGACCAAAAGTCCTTGAATGATCCCCAAGCTACACC
ACAATTATATAGATGGATATGATGCACACAAATTTTATCAAATTTGTTTG
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AATTTGCCTCAAAGGGCCCATACCTCTGTCTAGCCTTTTCTTGCTACAAA
AAGATGTGCTTCTTCATCAGGATATACTTGCACGAGCATATCATATTCAT
CGGCACATATGAAGTTACTCCTTACATGTTCTTGTTATTACCCTAACCCG
TGAAACACCTATACTTGCAAAACATGGTGTAAACAGAATTCCAGTCATAC
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TATGTTCAATTTTTTACCTTTGCACTCCAGACTGGAGTGCTCTGTTTTGG
ACACTAGAGTTGCAGTGCTTGGGTTTGGGATTCAGCGGTAATACCGATTA
CACTATTGCATTATTAGTACCTAATTATCCAACTGGAGTGGGAAAAATAA
GCAAGAAAAAATTGTGGTCCTTGTGTATTGTAGCCGAACTATCCTTTATG
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ATTTAGTGCAACTTTGTACTGAATCAGCGACACTTATTATGAATCTGAAG
TAGTACTCAATATGCAGCCAAGTGGCCAATTCTTTTCTCAGTTCCATTAG
TCCAAGTTTTACTGTTTCTTCTCCCGTGCCAAATTTGAAGCTGTAAATTG
CTCTGTGTTGCAGGAACAAGATGATGATTCAGAGAGCATGTGGACTTGCG
CCCTTCTCTTGGCTACTTTATTTCAGGATTCAGTGGTTGTTCAATCTGCA
GGAATAATGCGAATAGTTCCTTCTTTAGCTTCATTGCTAAGATCTGCTAA
GATTATTGACAAGTACTTTGCTGCTCAGGCACTGGCTAGCCTGGTCGTCA
CTGGAAGCAGAAGTATACAGCTTGCTATTGCAAACTCAGGTGCAGTTGCA
GATGCTATAGCAATGATTGGACAGATAGAATCTGATATGCCAAACCTTGT
TAAAATGGCTGAAGAATTCAAGTTGGCAGAGAATCCGAGTCAAATAATAT
TGAGAAACCTTTTTGAGCTTGAAGATGTTCGTACTGGTGCTACTGCTCGA
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GCGAAACAAATAAAGTTGCAATGGCGGAGGCCGGAGCTATAGATGCTTTA
ACTATGTATCTATCTTTAAGCCCGCAAGACTCAACTGAAACTGCCATTAT
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AGAGAATTTAAGAGATACAGAAGTGGCTAGGCAAGCTATTCAGCCATTAC
TTGACATGCTAGATTCAGGAACAGAAATAGAACAGCAAGCCGCACTTGGT
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TGATGTAGAAGGCAATACGCTTGAAAGCCTCTATAAAATTTTATCCTTCA
GTTCGTTCTTAGAGCTTAAGAAAGATGCTGCTCAGCTCTGCTTTGTTTTA
TTTGACAACTCAGTCATACGGGCATCACCAATTGCCACAGAATGTCTTCA
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CTGTCTGTGCTCTCAGCAGATTACTGGATGAAGAGCACAATGCAGAGATT
GCTGCGACTAGTGAAGTTGTTGATCTTCTTGTTGGTTTTGTTCCTGGAAC
AAACTACCAATTGTCAGAGGCGTCTATTGCTGCTCTCATAAAGTTGGGTA
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CATGCACTTGATATGATTCTGGATGTTCCTCCTTCTGTTAGTTCATCCAT
TGCTGAGTTGCTTCGCATTTTAACAAACAACAGTGGCATTGCTAAAAGTT
CTGCTGCTGCAAAAATGGTGGAACCACTTTTCTTGCTTTTACGTCGCCCG
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CAACTTGGCACAGAGGTGCTGTCACATCTTCTGGAACAGGAACATTTTCA
ACAAGATATCACTACAAAAAATGCAGTTGTCCCACTGGTGCAGCTTGCTG
GTATTGGAATTTTGAGCTTACAGCAAACTGCAGTTAAAGCACTTGAAAAC
ATATCTCAGAGTTGGCCCAAGGCTGTAGCAGATGCAGGTGGAATTTTTGA
ACTTTCAAAGGTTATTGTCCAGGATGACCCTCAGCCAAGTCAAGCATTGT
GGGAGTCTGCAGCACTTGTATTATGTAATGTTTTGCGCTATAGCTCCGAC
AACTATGTTAATGTCTCAATGGCTGTACTTGTAAGGCTGCTGAACTCCAC
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GTTGCTTGAAGCACTGATAAATAATGCAAGGGTCCGGGGAACAAAAGTTG
CCAAACACTCTATTGCTCCTCTCTCACAGTATCTGTTAGATCCTCAATCA
AAGAACCAGGCAGCTAAATTTTTGGTGACTCTTGCATTAGGTGACATTTT
CCAGCATGAAGCACTTGCAAGAGCAAGTGACTCCGTATCTGCCTGCCGTG
CTCTTGTAAGCCTACTTGAGGACCAACCTACAGACGATATGACAATGGTT
GCTATTTGTGCACTCCAAAGCTTAGTGATGCACAGCAGGACAAACAGGCG
TGCTGTTGCGGAAGCTGGAGGCATTTTGGTTGTACAGGAGTTACTCTTGT
CTCCAAATGTAGACATTGCAGGACAGGCCGCTCTTCTGATCCAGTATCTT
TTTTCAAATCATACACTTCAAGAATATGTGTCTAATGAGCTCATCCGCAC
TCTCACTGGTTAGTCGCCCATCTTTCTGCCAGAATCAGATTTATTTTTCA
GTTACTTTTCATGTTCATGTGTAAATTGTTGCACCTTAAGTTTTTTCTGT
TGTCATTTTGGCTATGATGACCTATATTTCATCTAACTGAATTTTGCCCC
ATAACTACAAAGATATCCATCAGCATCTGACTCTTCCAACTGATTGATCA
GATGTGTTTATAAATATTTATGTTGCAAGTACTAAGTATCTCTTCACTGT
TATGTTTCATCTAACTGAATTTTGCCCCATAACTACAAAGATATCCATCA
GCATCTGACTCTTCCAACTGATTGATCAGATGTGTTTATAAATATTTATG
TTGCAAGTACTAAGTATCTCTTCACTGTTATGTTTGTACTTTGTAATCTA
AACTGCAATTTCTTTTAACTGCCTTAGAAAGTGAGCTGCTCGCTACATCA
ACTATCAATGAAGTTATTTTGAGGACCATATATGTGATATTCAGCAACTT
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TATTACTGTTATATGCACTCATTGGCTCAAAGCATATCATTTGTTGGAAA
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GGTCAAACAGACCGTCCAATGACAGTATGTAGCATGGCTAATTTCACCTG
GGGTCGATTATTATAGTCCCCGCTTCCATGTAAATGTGCCCCCATAAACA
TCCGCATTCATTGGATTGGATTGTAGAAATCTACACTACTTACAAACATC
TGCTTCATTAAATTATTTCAAGGTGTTTTGTATCCCATATACTAGATGTA
AACGGATTTTGGACCGGCTATTCTTTTTGTATAGGTGAGGTTATTTCATG
TAACTATAATTCGGACTAGCTTGAGGCTGGTTTGAAGATGCACAGTGTTG
TGCATGTGCTAGCTGCTTGATGTGTGTGTTCTTTTGTTGTATTTTGTAGG
CATTTTTCTGCTGTATGTTGAAAGATGTTGCCTCTTTTTGAGCAAGTTTG
GAAGGGTAGATAATACGAGACCCCTTCATTGTATTCATCATTTCTTCTGA
TAGGGACATATGGAGCCTGAGCTGGAAAATCATATTTAAGAGTTTCACTG
TAATCTGAGATGAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.