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GrainGenes Sequence Report: AA005498

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Sequence
AA005498
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA005498
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCGCGCTCCGCTTGCCGACGTCACCTCTGTACCGGCCAAAATCCGGCCCC
GCCACCACCAGCTCCCCCATCCCTCTCCGGCTTTGGGATCCCTCTTTCCT
CCACGAGGTAGCGTCCCTTCCCTGCTATTCCCTTTGCGTCCTCGAATCCC
TGCCCCGCCATGATGGAGATGGAGGCCGCCTCCAGGCCGCCACGATGGAG
ATGGAGATGGAGGCCGCCTCCGCCGAGATCCCGCTCGACACATCTCGGCT
CCAGTTGAGAATTTCTCCACAAAGCTAGCGACATTTCCTGCCCTCAACTT
CTTAATTGTTTCATACCGCTTTAGAGAACTATTTGATTATTATTGTTTAG
TTAAAAACTATTTGATTATTTGATTGAGTAGCTGTGTTTAGACTTGAAAC
TGCATATATAGAATTTTCTGCTAAGAGAATCTCTTGCTAATTCAGGTTTG
TATATTTTCGAAATTTGTATGTTAGAAATATCAGAAAACATACGACCGTG
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AAGTTTATAAACATACTAGTATTAATTTCTGATTTTTTTTATAATTCCTA
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GAGCAGGATCATCCAGTGAACAAATGGTATAAAATGAAATCTACGCTTGC
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GTATTTTGTTTTCTCAATTTGTTGTTGAGAAACTCCTGATATTTGATATA
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AGGTCAGTGTTCTTCTTAGCAGTTACATCTGCTATTTCCCTCCATCTTTC
CTTTTTGTTTTTGTTTTCTTTCGTACAGGACGAAGCTTATGAGGTATGAG
TTCTGATGTTAATCGTTTTTTTATTGTACTCTTTCCTGGCAATTAAAGCT
TAGTTTGGTGGGTTAGAGTCCAGTGTGGGGGGCTTTGAGTAGGGCAAGAA
GCTACTTTTTTTTAGGGGTGCAAGAAGCTAGTACTACATACAAATGAATG
TATGCATAGATGGAGGACAAAAGCGGACCCACACACTGAAGCTGTATTGC
TAAGTCTTATTTGAACATCTTGGAAAGTAAGTGTCAGTAGGGACATAAAG
GAAATGATTTCATGACTTGGAAAAACCCCAAAGGTCTTTCTTACTGTTCT
CTTAGTCAATTGGTTATCTCCGTTGCGCAAAAAGAGGGGTGTGTTTCGCA
ATCATAAGTCATATTTTCCACTGTGGCCTATCTGTTTTCTACAAATGAAA
AGCTCTGCTCTAAATGATTACGGACACAATCATGTATGTCTTGTACAAAT
TATTCGGCTCCGTACATGATTAGTGGGATTCAGCTGAACAATGCACCCAC
GGAGTGTGTTTTTAGCAGAGATTTAGCATGGTTAGAAGGAGAAAGCTGTC
AATGAGTCTGGAAACAGAGACACTTTCCCAACCATTTTCTTTACAAATCC
CTATTATTTTAGGACTCACACAAAACAAGGCCAGATATAAAACAAGAGGA
AAAATACAGTAAGAAAAGCAGTAGGTATCGTAGGCGATATAAAACACATG
AGCGAGCGATCATGGGCGGTACAGTAGGTATCAAGCTCAAGCCTCGGTGT
AGAGGTGAGCCGGGAGCTTGGGGTGGACGACGACCTCCAGTGGGAACTTG
CGCGGTGTCGACAGCCCGAATATCTCCTCCATGCTGAGCTCCTCCTTGGT
AGCGCTGTCGGGGAGCCTCCAAGCGAAACCGTGCAGCAGGTTGGCGAGGC
TCACCTGTATCACCTTGAGCCCAAGGCTGTACGCGGGGCACATCCTGCGT
CCCGACCCGAACGGCAGCAGCTCGAAGTCCTGCCCCTTTACGTCGATCTT
GCTACCCAGGAACCGCTCCGGCATGAACTCCTCTGGTGCATCCCACAACG
CTGGGTCGCGGCCGATGGACCACACGCTGACGAGCACGCGCGTGCCAACG
GGGATGTCGTAGCCACCGACCGATGTGTCCTCGCGGGACTGGCGGGGCGC
AAGCATGGGCGCGACCGGGTGCAGCCGCATTGTCTCTTTCACAATGGCAT
CCACGTAGGGGAGACTCGGAATGTCCTGCTCTGTCACCCAGCGGCCTCGC
CCCACCACGCTGTCCATCTCCTCAGCGGCCTTGGCGAATACCTCAGGCTT
CTTGAGGATCTCCGACATTGCCCACTCGACCGTCATGGCTGAGCTCTCGG
TGCCACCGGTGATGAGGTCCTAGCATCCATATCGAGCACCAGGCAGTTTA
GTGCAGTTGGTGGTTAAGTAAACAGAAAGTTGTTTTACTAGTTACGAATA
ACTGTCGGGAACTGAAACATGGATGGACTTGCCTGAATGAAAGCCTTCAC
GCCATCCCGGCCGATCTTTACCTCAAGATCGGGGTCACTGGCTATCTCTA
GCAGCACGTCTACCATGTCCTTTGCAACGAAGCTCTCCCCCTCGAGGTGG
CGTCGCCCATTGTGCTCGTCCACCACATGTTCGAGGAACCGATCGAACAT
CTTGCTCAGCTTCTTCATCCTCTTGATATACCCCTGCAGGTCCATCCAGT
CGAGCCACGGGATGGAGTCGCCGATGTTGAGCACACCGTTGAGGAAGAAC
CACTCATCGACCATCCACTTGCACTCCGTTTCCTTGTGCAGGTACTTCTT
GCCCAGCACCATGCGCGTGATCACGTTGAGGCTCAAGGTGGACAGGTAGT
CCTTGAGCACTACCACGCGCCCGGAGGCTTCGTGTAGATCGCGCAGCAGT
GCACGCATCTCCTCGCTGCGGATGTACTCGTATGACTCCAGCCGCTTGGC
GCTGAAGAGCTCCGTGAGACACATCTTGCGCGCTTGCCGCCAGTAGGCGC
CATATGGGGACCAGGTGATGTCGCTGTTGTTGTAGTTCGTGTACTTGCCG
GCGGCCGTCGTCGGCCGGTCGATGAACACCATGTCGTGGGTCTTCAGGAA
GAACTTGGCCATCTCGACCGACGAGCCGACGACGACGGGGAACGAACCAA
ATCGGAGGTACATGAGAGGGCCGTAGCTCTTGGACAGTTCGTGGATGGAG
CGGTGCGGGAGCGCGCCCATGAGGTTCAGGTTGCCGATGATGGGCCACGC
CTTAGGTCCGGGCGGGAGCCTGTATGCTCGGCGGCCAGCACAAAGGACAA
TGGTTGCGAGGGAGAGTACGGTTGCAAGCACGACCGTAAGGAAGGGCATC
CATGCTGTTAGCTCCATTGTGGTGATTTCCCGGGTGCCTTCCTTCCAGAT
ATTAAGTGGCTGGTTAAGTAGAGCATGACCAACCACCGATGAGTCATGAT
TCACGAGGTGGAAACTATATAATAAGACGCTGATACAAGAGAATAAAAAG
GAGAAAATAAGGGATATTATATAAAATGTTGCACGACTTGCATGACCTTG
TTAATAACAATAAAAAGGAGAAAAAGAAAGTTACATTTGTAGCGGTCTCC
AAGAATAATCTGTTGAAGTGTATAAGTGGATTGCACTAGCCCTTTCCATC
AGTTTGGACTTTTGGTTGCGTTGGTTAGTGCATGAAGCTTGACATGGTAT
CAGAGCCTAAGGTCTCGAGTTCGAGTCCACGTATAGACCTCTTGAGTCAT
ACGTAAGTTTCGCGCGCTGTCGCTCTCTTCCGGTTGCACGTGCTGACTTC
TCCCCGTCACACGTGAGAGGGGGTGTTGAAGTGTATAAGTGGATTGCACT
AGCCCTTTCCATCAGTTCGGACTTTTGGTTGCGTTGGTTAGTGCATGAAG
CTTGACATAATCAACCTTTTGCCAATTGGTTTCCCATGTAAATCCTTTGT
TTGGAATTTTAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGGGGGGGGGGTGTAAGG
GAATGCAACATTTTTTTTCAGTAGATTCTCTATGGGCAAACGCAGAGAGT
AGTAAATAACCATGTTGGTAATTATCTTCATATTATTTGCTACAGAGAAA
AAGACGGTATCTAGTGGTGCCCTGCTATGTAAGGTGAGTTTCTCCGGGAG
ACCGGGGCAGAGTTGCTCCTTCTCTTCTTATCTGTTTGCTCAGACGCTTC
CGTCATCCCATCTGGATTTGTCGTGCCTTTCTTGATTGTTTAGGAATGTT
GGTCAGGCATGGATTCGGGTGACCGGGTCGATGGTTGAGGTCTGGAGGAA
TCATGCTTGAAGGGTCGTGTTGATTAAGAAGCTCTGTAACGACACTATCC
TCTGCATGACTCCCCTGCCAGTGTAGCCACTTAATAGTCCCTTCTACGGT
CCTCATCCATGATGCTTGGCGCGGGCGATGACTTCTTGACGACCATCCTG
AACTAGATGGACCTCGACGAAGGTGTAGGGGCTCGAACGAAGATGACGAC
AATCAAGTGACACCACGATTTCTCGGGTACAATTTTTTTTTAAACCCTGG
CCTCTTGGGGTAGCTAACTTGTACTATGAAGTGGCTGTCTAAATGGAAGA
TGACCAAGCTCTCATGAGTCATGAATGATGTCACACGATGGAAATTGCAT
GATTAGACGCTGACATATAAGAAAATAAAAAGGAGAAAGAAGGACTAAGA
TGCTGCACAATTTGCACGACATGATTAACATAAAAAGGAGAATAAAAAAT
GGCAACGACCATATGGTCTTACCAAGAGACATCAACTGGAGCTGGGATGG
ACAAACGAGCACCCGGGTGCTGGCTAGCCGCGTCCTTAGTTTATTCATTT
TGAGAAATTTCACCCATGAAAAGAATGCCCGACTGGCTAAGCAATTTTAG
AAAGTTTTTTATGCCTGTATCTACAGCTACAAGTGATTATTGTATGGACG
TGAGTAAATGTTTCATGTTGAGAATTTATCCACAAAGCTAGCGACATTTC
CTGCCCTCAACTACTTAATTCTTTCATACCAGTTTAGTGGCGCCCTATCT
GAACTCTGAACCTGTATGCAACATTGTACTGAGCCAACAAAATGAGCTTT
AGAGAACTAGTTGATAATTATTTTTAAGATAAAAACTACTTGATTATTTG
ATGGAGTAGTTGTATTTTGACTTGAAACTGCATATATAGAATTTTCTGCT
AAGAAAATCTCTTGCTAATTCAGACTTGTATATATTCCAAGTTCGTCTAT
TAGAAATATCAGAAAATATAGGTAAATGGCTTACCAACTTTCAGTGGATA
TATGGTAAGAGTTAGGTTGTACGGTAAGAATTTCCGATAGCTTGTCGGTG
GAATGAGATTTTGGTCGTGCCGTTATCCAGTGAACAGATGGCATAAAATG
AATTCTGCGCTTGCTTTTTTCTTTGTCTAAATTTTGCAGAAGAAGTAGAT
GAGCTTGTTATTCTTTCATTTTGTTTGTATTTCGTTTTCTCAATTTGTTG
TTGAGGAACTTCTGAAATTTGATATAAGTTTTACGGATATGTAGGAGCAG
ACAATGTTTTTTACCTTTAGACTTGGTGGAAGGTAACACGGAAATTCATA
GAAAATACAACAGATCAGATGAAGGTGAGCAATCGCATCTGCTATTTCCC
TCTGTCTTTCCTTTTATTTGTTGTTGCTTTCGTACATGATGATGCTTATG
AGGTATGAATTCTGATGTTTATCGGTGTTGATTGTACTCTTTCCTAGCCA
TTAAACCGTAATTTGATGGGTTAGAGTCCAGTGTGTGGGGTTTGAGTAGG
GCAAGAAGCTACTTTTTTTAGGGTTGCAAGAAGCTACTAGTACATACAAT
TGAATGTATGCATAGATGGTGGACAAAAAAGCAAAGCCACATATTGAAGC
TCTATTGCTAAGTCAAGTGGTTATCTCCGTTGCGCAAAAAGACGGGTGTG
TTTCACAATCATAAGTCACTTTTTTTCCCAGTTTATAGCTGTGGCTTTTT
TTTACAAATAAAAATCTCTGCTCTAAATGATTAAGGACACAATCATGTAT
TTCTCGTATAAATTACTCGGTTTCATACATGATTAGTGGGATTCAGCTGA
ACAATGCACATAGCAGGGTTAGAAGAAGAAACTCTCAATGAGTCTGAAAA
CAGAGACACTTCCCCAACCCTTTTCTTTAACAAATCCCTATTATTTTAGG
ACTCGGACGAAACAAGGCCAGATATAAAACAAGAGGAAAAATACAGTAAC
AAAAACAGTAACCGAAGACACGAGTGTGCCATCATGGGTGGTACAATTGG
TATGAAGCTCAAGCTTCGGCGTAGAGGTGAGCCGGGAGCTTGGGGTGGGC
GACGACCTCCAGCGGGAACTTGCGCGGCGTCGACAGCCCGAATATCTCCT
CCATGCTGAGCTCTTCCTTGGTAGCGCCGTCAGGGAGCCTCCAGGAGAAG
CCATGGAGCAGGTTGGCGAGGCTGACCTGTATCACCTTGAGCCCGAGGCT
GTACCCTGGGCACATCCTGCGTCCCGACCCAAAAGGGAGCAGCTCGAAGT
CCTGCCCCTTGACGTCAATCTTGCTATCAAGAAACCGCTCCGGCATGAAC
TCCTCTGGTGCATCCCACAGCGCCGGGTCGCGGCCAATGGACCACACGTT
GACAAGCACACGCGTGCCAACGGGGATGTCGTAGCCACCGACCGACGCGT
CCTCACGGGACAGGCGGGGCGCCAACAGGGGCGCGTTTGGGTGCAGACGC
ATAGTCTCTTTTACAATGGCTTCCACGTATGGGAGACTCCGGATGTCCTG
CTCAGTCACCCAACGGCCTAGACCCACCACACGGTCCAGCTCCTCAGTCG
CCTCGGCGAATACCTCAGGCTTCTTGAGGATCTCAGACATTGCCCACTCA
ACCATCATGGCCGAGCTCTCTGTGCCGCCGGCGATAAGGTCCTAACAACG
GCATTGACGATTAGGTGGTTAATTTTCTGTCTTGAAAAAACATTAGCACA
ATCGGAAACTCAGCTTGGGTGAAAAAGTTTTTTACTGATTACTAGTAATT
CATTACTTACTGAATACAATAGTCAATAGTGGCCGGGAACTGAAAGTCTG
GAACATATATGCATGGGCGCTTACCTGAATGAAAGCCTTGATGCCATCCC
GGCCGATCTGTACATCGAGATTGGGGTCGCTAGCTATCTCCAACAACAGG
TCTACCATGTCTTTTGCGACGAAGCTCTCCCCCTCGAGGAGGCGTCGCCC
GTTGTGCTCGTCCAGGACATGTTCCAGGAACCCATCGAACATCTTGCTCA
CCTTCTTCATCCTCTTGATGTACCCCTGCAGGTCCATCCAGTCGAGCCAC
GGGATGGAGTCGCCAATGTTGAGCACGCCGTTGAGCAAGAACAGCTCGTC
GAACATCCACTTCCACTCCTCCAGCGTCGTAGCCTCGGTAGTCGCCTCTT
TGTGCAGGTACTTCTTGCCCAGCACCATGCGCGTGATCACATTGAGGTTT
AAGGCGGACAAGTAGTCCTTGAGCACTAGCACACGGCCGGAGGCCTCGTG
CAGGTCACGCAGCAGTGCGTGCATCTCCTCGCTGCGGATGTACTCGTATG
ACTCCAGCCGCTTGGCGCTGAAGAGTTCAGTGCGGCACATCTTGCGTGCC
TGCCGCCAGTAATCACCATACGGGGACCACACAATGTCGCTGTAGTTGTA
GGTCGTGTACTTGCCAGCGGCTGTCTTGGGCCGGTCGAGGAACACCGTGT
CGTGGGTCTTCAGGAAGAACTTGGCCATCTCGACCGATGACCCAACGACG
ACGGGGAACGAACCGAATCGGAGGTACATGAGAGGGCCATAGCTCTTGGA
GAGTCCATGGATGGAGCGATGCGGGAGCATGCCGATGAGGTTCAGGTTGC
CGATGATGGGCCATGCCTTAGGTCCGGGCGGGAGCCTGTATGCACGGCGG
CCAGCGCGACGGACAATGGTTGCGAGGAAGAGCACGGTTGCGAGCACGAC
AGCAAGGAAGGGAACCCATGCTGCTGGTAGCTCCATTGTGGCAATTTCTT
GGGTGCATTGCTTCCGGTTATTAAGTGGCTGGTTAAGTAGAGGATGATCA
AGCGCTCACGAGTCACGATTCAAGAGGTGCAAATTGTATATAGGGCTAAT
ATATAAGAAGATGATGCACGATTTAGCATGACATGCTTAGTAACAACAAA
AAGGAAAGGATCGAGCATCCCCGCGGGATCATACCCACCCATCCCCCGTG
GGTCCTCATGCTGACGGGTGTAATCCCGCAATTGTGTCTATGTAGCAAAT
TCTTTTTCGGTTTTGCTTCATTGTAGAAAAAACGATTTGGTTAAAAACAA
AAGAAAAGAAGAGCTAGTATATAAAATGCTACATGACTTGCACGACATGG
TTAATAACAACAAAAAGGAGAAACCACGTTGGTAATTATCTTCATATTAT
TTGCTTCACGAAGAAGAACAAACAGCCTAATACCTAGGGTTGCAAGCGGG
GCGGGTTGCGGGTTGGATATTTGTGCTAATGATGCTTTAAAATTCGATAG
TTTCTGCTGCTCTTTTTGCCTGATTTCAGTTTTGCGGGATAAAATGCGGG
TGCCGCCTGTAGCCCTACTAATACCTACCGTGGTACGCCCATGAATCTAG
TTGTGCCCTTCTGTGTGAAGTGAGTTTCTCTGGGAGATGCATAGTGCAGT
GTAGTGGGGGTAGAGTTGCTCCTCTGTTTGCTCCGATGCTTCCCTCGTCC
AAGTCTTGGTTTGTCGTGCCTTTTTTGATTGCCTTGGAAAGTTGGTTAGG
CGCATGCTTGTGGGCGGCGAGTTTGGTGGAGCAATCCGAAGCATTTGTGT
TTTTTTGAGGGGTCGGGAGAAATCTTTATCGTCGAGACATCGACATGGTG
ACGTCTACGGGTGTCGCCGGCCTTTCGGAAGGACGTCGGATGTATCTTTT
CCCCACCTCCCGTTGCGCATCGGAGGAAACCCTAGGACATGTTCGGACAA
CAACAGCGTTGTTGTCGCTTTCCTTTTTGAAGGTGTTGCTTGGTAGGCGA
CGCTTAGGAGCTGGTGGTACTTCTCTAGAGGGCGCATCGGTGGCGAGTCA
TCCTCGTATTCGTCGAGCCACCGTCATTGACTTGTTTTTTTTTTCATTTT
AGCGTTGTGTTGTCTGGTCCAGTAACGGTATTAATCGTGGTTGCTATATT
AATATAGCTGGGCGCATGCCTGTATCGAGGGTCGGCTTGACGAAGAATCT
CCGAAACAACACTAATGCACTATCCTCCGATTCTTCGAACGATAATGCTA
CACCTACGGAATAATCTTACGGGCTGACGTGGTGGCTGGCGTTTGGTCCT
AATTGTCTTTCTTCCTTAAATTGTGGATCATGAACTGATCTGGTGTGCAT
GAGGTGTTTGTCCGTAGAAAATTTTCGTAGAAAACGTCCGTAGATGTAGC
ATTACTCTTCTTCGAACGACTCCGGACGAACGGTAGTATATAGCCACCTA
ACTCGTACTCACTAACTATTAATTGGCTAGCTAAGTGGAGGATAAATTCG
CAAAAAGAGGCTAAGTGGAGGATGACCAAGCTCTAATGAGTCACGATTGA
TGTCAAGATGTGGACAGTTTATAATAGGATGCTGATATAAAGAAGAAAAT
AAATAAACGGAGAAAGAGGGGCTAAGATGCTGAACAACTTTTGCACGACA
TGATGAATCTCTACTAAAAAAGGTTTAGAACGAAAAATGGCTACGACCAT
ATGGGCTTACCAAGCACATCAATCGGAGCTAGCTCCCGGTGAGGCAGTGG
CGTAGTAGATACTGGACAACTACGTTGAACAGAATAAAATATGTAATCGC
CTCACTGAACTTCAACAACCGGGGGTGGTGATGTGGAAGCACTGGCGAGA
GTACAGTGACTGAACGGGAAACAAAAATATACTCATTTTTCCATCACTGA
CATGAAAAGAATTAATTCTCTGTTTAGAAATAAGTGATTTAGATTTGTCT
AAATTTAGATGTATCTAGACATATTTTAGTGTTCAGGTACATGTGAATCT
AGATAAATGCAAGTCATTCATTTCTAGACGGACCTATTAAATAAGGAGAT
ATGTGAAGCCAGCCATTCTATTAAAGAGAACTTTTAGTGACAAATCGGAG
ATGGTAATTCGGTGCGATTGTTATAAGACCCTTGGCTCGGTGGGACTGCA
TCGAATAGAATGCAAGGCCTATTCCTATGAACATGTCAGAGCTGTTTTGG
AAGATTTGTCTCTGTCCCACTATCTCATTCCTAATAGGATGGTACGATGT
CCAAGTCACATATGGAGATGAACGGGATATACCGATTTTAGCTTCGCTAC
TGGTGAGAAAGTCTCATTGTAGTCAACTCCTTAAATTTGTCGAAACCCTT
TTGCGACAAGTCGAGCTTTATAGACAGTAACATTACCATCAGCATCTGTT
TTCTTCTTAAAAATCCATTTGTTCTCGACAGCCTTCCGGCCATCCGGTAA
GTCCACCAAAGTTCATACTTGGTTTTCGTACATGGATCCAATCTTGGATT
TCATGGCATCTTGCCATTTATTGGAATCTGGGCTCATCATCGCTTCCTCA
TATGTCGCAGGGTCATCGGTGTTATCCACCAACATGACACTCATAACGGG
ATCATACCAATCAGGAGTGGTACGAGTTCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.