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GrainGenes Sequence Report: AA001567

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Sequence
AA001567
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA001567
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCTACTTTTTTTTAGGGGAACCGCCTTTTGTTAATTTATAGGACCCACA
AGCGGCCCATCCTCCACCCTATTCCGGGCTGATCAAAAGCTAGCGCTCGG
GCGGCGCCGCCCAAGTCTCTGGTAAGCTTGGCCCAACAGGCCACGTCAGC
GCCGCCATCCCCTCCGCACCGCACGCAACGCGCGCCGGCCCGTAGCTGGA
GACCGTGCCGTGACCGGCGTCAACACACTTCGGCGCTGCCGTCCCCCCGC
CTCCCGCACCGTGTCCACATCGCCGCTCAAGAAAAAAAAACGTGGGGAGA
TCCCCTCGATCTCTCCGCCACGGCCTCCGCCACGGCAGCTCCGGCCGCTG
CTTCTATGGCAGTCTAAGCATCGCTGCCCCGCGAAACCCTAGATCGCCGG
AGCCGCGTACCACGTGTGGTTCCCGAGCTCGCTGCTTGCTACCGTCCGTC
CATGGCCTCTCCGCCGCCGGAGGCTGGAGGGGACACCGGAGCCCCTTTAT
CCAGCGGTATCGCTCAGCTCCCCTCCTCTTGATAGCAGCGCGGTGCTGCG
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CGGATTTTCTTTGCCTTGGGGCTTGAGTTTGATATCTGCGCGCCATGCGT
TTTATGCCATGTATTGGGAACCTGCTGAGCTAGTAATTCACTCGCAGCTG
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CAATCGAGTCCGCCTGTATTGGTCACTAGTATTTTTCTGCCGCTTGTATG
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TGGGTAGAAATAATAACTGTTTCCCTTGGCAAACTTATCGGACCATGTAA
AGCATTGCATCAAATCATGCTGTAGAGTCATTGTCTGGTTTAGATAAAAT
ATTCCTTGTTTAGTTTTGAGGGTTGTATTTTCAACCATGTGCCTTTTAGT
TGTGGCTCGCTATTCCCACATATTTTGGGTTTCCTAGCTTTTCATCATGG
TCAACATCTTTTTGCTGTCGAGAGTATCCAAAGCATGAACAATCTCTATT
TCTGCACTGCAGGTACTTTGCCCCAGGATAAGTCTATAGTTGGTCAGATG
CAAGCAGCGGAGCAGGAAGGAAGTGCTCAAACAAGCCAACAAGTAGGGAA
ACCGCATATGAATCCATCAGATCAGTTATCTCAACCAACATTGATAACTG
GAGATTCAGAAAACGAAAACTTTATCCAACAGGAGCAACACCATTACCAG
CCAGAAGAGCAGCCACGTTCTGAGAATCAACTGCAACAGTCAGAATCAAA
TAGCTTTCAGTTGGCTGAAAAAGGAACAGACTATGTTGGCCAACAGAGTT
TGACAGGCTCCACGGAAGATGTCGCTCAGCCTTCGCTAGATCAGCAGCAT
GTAAACCTAGTGGCTGGTCAGCAAGCACCACCTGGTGCCCAGGAAACACG
GAAGAGGGGATATCAGCCATCGATACCATTTAATATGTTGATTCCAATCC
TACAGGCGCATCTGGACAGAGATAAAGATATGCAGCTTCAATCTGTATGG
GCAAAACTTAGGGTGCGTTTTGTTCATTCTTCTGTTATAAGCTGATCTGT
TTTGTCAACAAATTGATTGTCTGGAGAAACTACAGATGCAAAGAGTGGTG
GGGTAAAGAAAAACTCCGTATTTTATATATTAATCTAACTTATAAGTTTT
GTATTTCTATGTTGCTATAGACTTCTGAGTGTATTTATTCTAAAAGCTTG
TAGAGCAAAAGGCCATAATGAACACTAATGGAAACTAACCACTGTACTGA
TAAGGGAAAAAAAATGAACGAGTTACTCTCCTATGAAGCCATGATCGATA
ACATTACTTAGGAACCGTGATCATGTTTTGGGCATGATACCAATTTATTA
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TAAGGGGTAGTGCAAGTGCACTTTCTTTGGTGCATGGTTTTTAAGGCGTT
AAGGCGTCTTAAGGCGACCTGGGGGTGCTTTGGCGCCTAGGCGACGCCTA
GGCGGGCGCTTTGGACGCCTAGGCGCCTAAAGCGGTCGTTTTTGCAAAGC
GGAGGGTGGGCGCCTTGACGCCTAGGCGTCGCCTAGGCATCCTAAAGCGG
ACACCTTAAAAACCATGCTTTGGTGCATGTTTCCTCGTCTGATAATAAAA
GAAAGCATGATATTATGAAAAGAACCAGTTGTCATTCTTGTTGCAAATGT
GGAGGGAATAGATAAAAGAACAGTAACAAAGGCACATCGACATAGAAAAT
ACAGTATACACCAGTGCGCTGAATTAAATTGACTAAGCTGTACTATTTTA
TGTTTGCAGCGTAATGAAGTCCATAAAGATGATTTCTTAAGAGTCATAAG
GAATATCGTTGGCGATCAAATGCTCAAGCAGGCAGCCCATAAAGTTTTTG
CACAGGTGAATTTATGGTGTTAACAACATTGTTACCCTTTTTTCCTTGAT
ACCTAACTAGTATCATGCTTGATGAGCATGCAGCCAATTTGAGTTTCCAT
GTTTATTGAGTGATTCTTTGAGTAATATCTCATATTCTCGTGCCCATATT
TGCTTTATTTTGTCTTGTTTGCAGATGCAAGCTCAGGCACAACGAAATAA
CCAGGGAAATGCAAATCAGCATTCTTTATCATCTCAAGCGTCTACACAAC
AGAGTGCTGCCAGTGGATCGGCAAAATTGCCTGATCAGCAAGTTCGTGCG
CCTACCCCAGCTAACCAGGGTCAGAAAAGCCAGGCATCAGCTTCACCTCA
GAACTTTGTGCCACTTTCAGGCACACAAATGCAGAAAAGTATGCACTACT
TTGCTCATGATAATTCCATCCAAATGCCAGATGCAAAAGGGGTACATGCT
ATGCAGAATCGACCACCTAGTATGAACCCGCCAATTCCATTGCAGACAGG
TAACAAACAGCTGCAACCGTCAAAAATCCAGCAACTCTCGCAGCAATTAT
ATGGAACCACTAACACTCCTCAGTCGTACCCTCGTCCAACCAGTGGTTTG
ATACCTCTTAGACCACAGAGTTCAGCATCTGAAACACGACCTCCCTTGCA
TACGCATGGAATGGTTCCTGCAAAAGTTGGGACCATACCTACTCATCCCA
CAATGCAACAGAATGCACCTGCACGCCAAATGCAACAAAACAAGGATATG
AAAAACAATGCTTACAGTCCAATTGCTAATTTACAACAAGAGTCTGAATC
TGCAGGCAAGGCCCGCCAGGTTGGCACAGGAGGTCCTTCGGCGAAATCGC
ATGGAAAGCAGGTAATTTGTCCTCCAGCGTTATCTCACTCTCTGTTACAC
AGTACCTTGTCACTTTCCAAATCACACCGGAACTTAATTCATTTTAGTTT
CCTCTCAATAGTCTGAACCACTAAATGTATCGCTTGAGGATTAGATTGGT
TTCAGGTGTTTCCATCTATATTAGGAGACATTGGCTGTTGATTAAAGAAG
GCAAGAAGTTATCTATAATTTCCTCTCCTCTCTCCCTCTTCCCTAGCCAC
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TTGACACCAAACAGTTTGACAATGGGGATTGACAGGGTATATATATCACC
AATTTTGCTTGTTAGTTGTTACATGTATAGTTTTAAGACAATTGCTATCA
AGGCATCAGCTGGATTACACCTCGGCTTCCAATCGGTTGGGACTAGGCGC
TGTGGAGTCTCTTCACTTGGGCGAAGTAGATAAAAGGTGAAGGTAAAGGG
GTGCAGGAGGTGCTAAATGGTACTGCCAGTAGCACAACATAAAGCTTTGG
GTGGGAAGGGAGTGGATACAAGGTTGGAAGTAGGGGTGGGCAAAATGGTT
CGAGTCAAATCGGCTAAAACTGGCCTAGAAAAGCTAGTTCACTTTCCTTC
ATTGTACATAACAGATATTTTCTACTAGTACAAAAATTTGTACACCACAG
TTTGTTGGTTTCCATGGTTCATGGTTTTGCCTGCCCCTAGTTGGAAGAGG
CTGGTGAATTTGGAATGGTTCAAAATATTGGATATTGGGTTCGTATTGGT
TTGGCTTCAACATATTGGATGTTGCATATCAGGTGATATATCAGAGCATA
TGCAGTTATATAGGAGAAAACATATCTGTTTTTTCCATTACTCTTGTTCA
AAACATGCCTTGTAAGTACAAGAAAATGAACGATTTCAGTGCTTAAGCAT
AAAAAGTATATGATTCCAAGTTTGTTAACTAGTTAATTAAGAAGTAAAAT
GATGGAGACTCACAAAATCCTTACTCTAACATAAAGAAGTACATTGTATA
TGTGCATCTACAGAACATTATGCATGACTCTGATAATATGAACTTGTAAA
TACCTAATTTTACGTCCAACATTTTTTTTTGAAAAAAAATCATTGTCATC
TATTTATTGGTCTATATCAGTGGACATATCAGCTCAAACATCGGTCACAT
CGGTTGTTATGTTGGTCAATCTTGGTTGATATGTGTGAAAACAATGTTTA
CAAAATGCTATATTACATCTGTATTGGTAGACTCCCAATATCGATATATC
GGCTGATATAGCGGTCGTATCGGCCTAGATTTAGAATCTTGTTGTTGGAT
TTGTCATTTGCAAGAAATTTGCGGAAATGGGTTCATGCTCCACCCCAAAT
TGCACCGCGAGGCGTTTCAGCTCATCCCTGTCTGTTGCATCTGACAGATG
CCTGAAGCAAGGCACTCAGTCAACGATGTGGCAGGCAATCAGATCAGAGC
AAGCCAATTGGCGACAGGACCACCTAAGGCCTGATCTGTCAAAACTCACC
AACCCAACCAAGGTGGAGGCGCCAGCACCCAGAGACGGACATACGGCTTG
TTCAGTCGCATTGACGAACTACTTGTTAGTGTGCGTTGACATTCGACAAA
AAACTCGTCCGCACATGTTGACAAACAAATGTATCGTCCACGTGAGCAGT
CCCAACTACTAAAAACATGTCTGCACGGGCCCACAAATAACTCATCCATG
TGCACGAACATGGATGAGATGGGCAGGGTCGTAATTAGTGCAACGATATA
ATTGTAGTTAGTGTAATTTTTCTAGGGGTAAAATTGCAGTTTCACTCTAC
TTGTGTTCATCCCTAGGATACCATGGGATATTCCTTTGGCCATGTGTAGA
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ATCACTCATTCCCCATAAATGGTTATGACTTTGGAGTTCTTCGCCTCTCC
TTGGAGCATCACAGTTCTTCTATCATTGGTAGAATTCTACGTGTTGGATC
AGGTGGATGCGATAGGTAGACGAGTGGACACGGCAGATGGATGAGCAGAC
GCGGCGGAGACCAAGATGCTGGAGTGAAGCTTGTTTCTCCTGTACTGACA
CCTCGTTAGACAAGTGTTCAGACCAGGGTGCCACAAGTTTACAGTTTGGG
CTTGCATCCGCCAACAATAGTAATAATTAATTGAGGGAACAGAGTCCTGA
ATGGTAAAATATGCATGTTCACAAATATCTTGTAACCATATAATATCACA
TAATTAGCTAATACTGTGAAAAAGTGTGTTATTTTCATAATACTCCGTAT
AAGATGTTTTATCTTTGTGAAAAAGTGTGTTATTTTCATAATATAGATTC
GGAGTGAACCTACACACTAAAAGTTGTCTAGATACACTCTTTTCACAAAT
CTAAAACATCTTATATTATGAAACAGAGGGAGTACTACTTAGTAGGGATA
TCTGCTTTGGCAATAGCCTGTGGCATTTTGGACTTATAATAGCACATGTA
GAAATTATTGGTTTTTGTAGTGCATGTGTAAAGTTCCTCTATTTAATGAG
CACATTAGATCCTTCATCCAGGCTTTTAGGTTATACTTGGATCAGCTGCA
GCGCAATGTCTGGTATGTGTTTTCTAAATGAGCATCGGCCATATTCTTTA
GTTAGAAAATGAGGGGAAACGAAATGTAGGATACTTGTTTCGTGTTGCAT
GGCCATATGTATGCCCTATATCCATTGAGTTTTTTTTTCATACATCAGAA
CCATGCAATTTTAAAATGCTTAATCACATGTAAAATGTGCATTTACTCTT
GTGGCTGCACTGTTAGGCTGCCCCTAAAACATCTACACCACCTGCCGCAA
GGACTAGTAAGAAATCTGGTGGCCAGAAGAAATCATTGGAAATGGTTGGC
TCTGCTCCAGCACCGCCCAGGTTTTCATAATTCACATCATCCTACCTCTT
ATGTTTTACTATCTGATTGCTGTGTGTATTATAGTTTATAGGTTGGTTGC
ATTTTATGGATAATTCAATCTAATTTCCTTTGTGTTACTAGCAAAAAACA
AAAGACAGCTGGAGCCTTCCAGGAACAAAGCATTGATCAACTTAATGATG
TAACAGCTGTTAGTGGTGTTAATCTTAGGGTACGTATCTCTGGTTGATGC
TTGATCTCTATTCCTATCTGTGTGTCATGTTTATATTCCATTGATACTCT
TGTACATCAATAGGAAGAAGAAGAACAACTGCTGTCTGCCCCCAAGGAAG
AGAGCCCAGCCACAGAAGCAGCACGAAGAATTGCACAGGAAGAAGAAGAA
AATCTCTTTTTGCAGAAGGGTCCACTTCTGAAGAAACTAGCAGAAATCAG
TTAATCCCGTTAAACTTGATATTGACACCATAAAACTGTATTTACATATA
AATATTTGAGGCAACATTGACTGATGACATGTTCTTGTCAGTTCATAAAT
GCAACTTGAAGAACGCTAGTGCTGATGTTGAGCGTTGTTTATCTATGGTA
AGTTCATATGATCGTCCTCAGAATTTTGTGGCGGTATGTCTAACTTTTAC
TACTCAGTGTGTGGAGGAGCGACTGCGAAGATTCTTAAGTACTCTCATAA
GAGTTTCAAAGCAGGTTAGTTTTTTCACATAATTTAGTTATTGATTTTTC
CAGTTTATGGTATAGTTTGATATTGTGAGATACTAAACATTCTTGTGGTG
TTGCTAGAGAATCGACACAGAAAAGACTGGTCATCGACTAGTTATTACTT
CAGATGTCGGCCGTCAAATTTTGCAGATGAACCAGAAAGCTAAAGAAGAA
TGGGACAAAAAACAAGCAGAAACTGACAAGAACAAGAAACAAACTGAGGT
GTTCCATAAGCTCCATTTTATTATATTCAACTTGGATGGCATGCTTCCTC
CACTGAACTATCATGCTATTATTATTTAATTATTTGCATGGTAACAGAAG
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CTTAAAGACATACCTTTTGTTTATCCACGTCTTTCTGGAATTTATATATG
TGCTGGTTAGCTATAAATCCTTCAGTTTCCACTTGTGTTTTGGTAAATTC
TACAAAAGATAAAATAGATTTGAACTGAATTAAAGGTATTTTTTATTCAC
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ATTCCGCACTAGAATATCTATTTGCTCACTTATATTCGCAAAATCTCATG
CAAGTGTGCGTTAGTGACTTCAATTAATTTTATCCTTGCATGCAGGATGA
CGGCAGTGGTGCTACAGAATTGGACAAAGAAAAAGAGGAAAGTCGTCCAA
AGAATGCGAAGGTAAATATCTGATGCTATCTCTCAGACTGACAGCTGTTC
TTTTCCTGATATCCTTAACCTCTTACAGCCCAACAAGGAAGAAGATGATA
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GCGAGCACCAGTCCCGAGGCCATCACCTATGTCTGGAAAAGGTTTGGCAG
AACAGAATGAAGCTTCAAAAAGAAGCCATTTCGCAGCCTTTGGAACCGGT
AAAGAAGCATTCCAGCATCAAATTACTTTCGCATTCTCATGTTATGGCAT
TAGAGAGTATTTCAAACTCAGGACACACACACACACTCACTCATCATTGA
GATTTGTTTATTTCAGGAGGCACGAAAAGGCAAGGCAAGGGTTCATTCGC
GACGCGTCACTCACATGGACCGCAGCGAACTGTTTCCGTGAAGGATGTAA
TCAGTGTCCTGGAGAGGGAGCCTCAGATGACGAAATCGCGGCTGATTTAT
CGGCTGTACGAGCGATTGCCTGGAGACTCTACAACAGATTAGGTTGAACT
ATTTAGCGGGTGTAACTTATAGTGTGTAACGAGGTTGATGCACAGCCTGT
TGCCCTGACCTGACGTGTCCCGTTCGGTGTGGTGGTTTGCAGTGGGTAAT
CATATAAACTGATGATAGCGCCGGTTAGTTGACATGCCACATCTGTTGTA
AACACATAGGATGGTGGATAGCCATCAAATTTGTTCTGTAAAAGTTCCAG
TGTAAAGTGTGTCATATGATGACAATAAGATCGTTCAGTGCTTCTGGATG
CACCTGCTTTACTTGTTCTTTTGTTCTGACG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.