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GrainGenes Sequence Report: AA018056

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Sequence
AA018056
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA018056
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CACCTTGCTCTCTCTTCTCTGTCGTCGGCCAAAGTCCCTACTCAGATCTC
CCCGACCTCCCACCCCCCCGCGAGCTCCCACAACAAACAACACTGCCCCT
CTCCTCTGCTCCTCCGCCGGATCTCCAGATCTCTCTCTCTCTCACGCTTA
TACCTCTTCATCGCCCGCCACGACGTCGCCGCCGCACGCGGCGGGCGCGG
CGATATGCTCCGCCTCAGGGCGTTCCGGCCGACGAGCGACAAGGTGGTGA
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GACCGCGTCTCGGTCTGGGACTGGGAGCACCGCCAGGTACCACTTGCTAC
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GGTCTGAATGCAATTGTATCTGTAACACAGTCTATCAGGGGTACTTTTTT
TTTTTTGTTATGACTGCTGTGAGACTTGCCCTACTGCGTTAGCTTGTCCA
CGTATAGTGACACATAATGACGGGATGAAGAGAGCGAAATTAAAAATTCA
GGCCTTCATGGGTCTGGTTGGTGCTTATCTAGTTCAAGAACTAATGAGCC
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AAGCTGGTTTTAATTTAGTTTTTACGTAAATAGTCTGTTTTCTCGCTTCA
CAATGTTCCCCTCAACCTTCGCTATACATTGTTTTAGTTATTTGCTTTAT
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ACAACCACAACCACCACCACCACCACCACCACCACAACAACAACAACAAC
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TTGAACTGAACTGAAATGTTACACTCATAAACCTTATGCTCCTTAATTGG
TGCTGCTGCTGCATTTCCTCTTATATTTTGACCATACAGTAATACATGAG
AAAATGAATCAATTACCACCAAGTCCAATACACGATTAAGGAATACAGAC
AGCTTGGCCTATGTTATGTAGTTATCTCCAAAACCCAGGTCAACATACGT
CCGTTGAACAGCAACAAGTACTTTAAAACTTTAGGTTAGTGCTAGCGTTG
ACTTGGATCATGTTTGTGCTTTTGCAGTATGGAGTTCCTCTCCAGGTTAT
CTTCTAGTGATGCCCCTCTTGTTGCATTCGGGGAACTTTAGATTAGTGCT
AGTGTTGACTTTGATCTTGTTTGTGCTTTTGCAGTATGGAGTTCCTCTCC
AGGTCATCTTCTAGTGATGCCCCTCTTGTTGCATTCGGGGCATCCGATGG
TGTGATCAGAGTTCTCTCAATGATGACATGGAAGGTTACGCATCTTATAC
TTGCACCCTCTGCTTCTTTGTAATTGCATCTCAAACCTGGCTGTATGTTC
CTTGCAGCTCGTGCGAAGGTATACTGGTGGGCATAAAGGAGCAATAGCTT
GCTTAATGACATTCATGTCTGCGGCTGGCGAGGTAATTTTTCTCATAGTT
TCTTTTGTTTTACGTTTTGGTCTATTCTGTTTGGTCATCAGACTGTGATT
TTCCCCTTGACTGTTGTGTCCATATGCTATGTGCTTGTGTTGTTTCTTGT
ACTTATCATCTATTTCATTGTTGTTAGTTTGTGCAGCATTTTAATTTTCC
ACATGTTACTGTTATATCTTTACTGATCAATAATTATGCGTGGCTTCAGG
TACATTTAGTTTCTGGTGGTAGTGATGGTCTGCTGGTATTATGGAGCGCT
GATCATATCCATGATTCTCGTGAACTTGTACCTAAGATTAGTTTGAAGGT
ATCATTTCTAACACATTTTTTTGTTTCTGTTTTTTTTAAAATGCAGAATA
TTTAGGTTAATCGTAAGTAAATTTAATAAGCAGTTTATCATGGTTTTTTG
ATACTGGTTAATTCTCTTTGGGTATCTGTCCAAAGGCTCATGACGGAGGG
GTGGTTGCGGTTGAACTTTCAAGGGTTATGGGAAGTGCCCCACAACTCAT
TACGATCGGGGCTGATAAAACTTTGGCCATATGGGATACCGTTACATTCA
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AAGCGCTTATTCAATAGCATATTTGCTGTGCAGGAAATAAGGCGAATTAA
ACCAGTACCTAAGCTTGCCTGCCATAGTGTTGCATCTTGGTGTCATCCTC
GTGCACCAAACCTTGATATTTTGACTTGTGTCAAGGACTCTCATATTTGG
TATGATTTTCTTTGTGTTTGGAATTAACCGCAGATTGTAGATATTCTATA
TAGTGATGATTTTTACATGCATAATTTTGCATTCTGGATTGTTACAGGGC
CATAGAACACCCGACTTATTCTGCTTTAACAAGACCGCTCTGTGAATTGT
CCTCGCTTGTGCCTCCACAAGCCCTTGCACAGCATAAGAAACTTAGGGTA
TGCTTCTGGACTGCTACCTTTAGTAGAAAATATCATTTTTTCATTTCAGG
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TAGTATTTATTTCCTTCTCATTTTCTCCGAGCTTTAGTAACTCTAGTGCT
GCAGAGCTAGGCATGTGTATTGTGTGTAAGAATGTGGCACACAGCCAGAG
TGTAAGCATTCAATCACTGGTCATGTTGTTAATGTTGTCTCCAGTCCTAT
TTGTAGGACACAGCAGATTTCGTTTAAGACAAGATTTTGATGAAGAATAA
CTCCATTAATACGTAGTTCATATGATACCAGTTTCATGTGATTAAACACA
TATTAAAAAAGTGATTCTTGGTCAAAGCCTTGTCTGAACGAAACGTTATC
TGCCTACAAATGGGAACAAAGGGAGTATTAATTATTTAGGTGTTAACATA
TGTCTCTACTCTCCAGTGATGCAGTTTGCAAAAGCTGCATACCACATCAT
TCTGGGCTTAAAAAATGGAAAGCGAGTTATCACACATCAGGGAAAGATAA
CTTGAATGTACGTAATGTAAAAAAACAAAATCTGGTTCACAGTACCTTGT
TGCTGATGAAATGCTGGTTTCCTTATAAAGATAAAGCCACTGTAATGCAT
TTTCTCAAGCATGCTAACATAGACTGAACTTTGTGACTACTCTAGGTTTA
CTGCATGGTGGCACATCCCTTGCAACCACATCTTGTTGCTACTGGAACGA
ATATTGGTATTATCTTAAGCGAGTTTGATCCAAGAGCACTTCCAGCTGTT
GCTCCTTTACCAGCACCGGCAGAAAGCAAGGAACACTCTGCTGTTTACAT
TGTTGAAAGAGAACTTAAGTTACTGAATTTCCAATTGTCAAACACAGCAA
ATCCATCCCTAGGAAGTGCATCTGAAACAGGAAGATCAAGGAATGACTCT
ATGGATCAGCTGATAGTAAAGCAATCCAAGAAGCATATCAGCACGCCTGC
TCCGCATGATTCGTATTCAATCCTTTCAGCTAGCAGCTCTGGAAAGTAAG
TATTTATGCCATCTCATCCCAATATTGCCTAGGACTTGAGCACTAAAATA
GACAGACATCATGTACTGGGGTTTGTCTATTTCATGAATGTCACGTTGGC
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ATTGTTGCAATGTGTGTGAGAGGTTTAGTGTTGCATAGTAGTTACTCCAC
CGTTATGTGCTGTGAGTTGTTCATTGCAACATGTCGGTTTAGAAGTCAAT
GTTTCGGATGTCTAAACTGTTTTGCATTTCCTACCGTCTTATGGTGCAAC
ATGTCTAAACATATTTAGTTGCTCCTTTGTTATGAGTATATGCTATGATT
TTTGTAAAAAAATTATTTATTTATTTGCAGGTACGTTTCAGTTGTATGGC
CAGACATTCCATCGTTCGCTGTGTACAAAGCTAGTGATTGGTCAGTTGTT
GATTCAGGTACAGGAAAACTTTTTGCATGGGACAGCTGCCGTGACAGATA
TGCTGTGGTCGAGAGTGCATTGGCCCCAAGGATGCCACTTATTGTGAAAG
GAGGTTCTTCTAAAAAGGCAAAAGAAGCAGCTGCAGCAGCAGCTCAAGCA
GCAGCTGCAGCAGCTAGTGCTGCTTCTGCAGCCACGGTACAAGTTCGGAT
TTTGTTAGATGATGGAACAGCCCATGTTTTGCAGAGGTCCATTGATGGCC
GCAGTGAACCGGTTGGTAATCATCATTTATGATATATCCTTTATGAACTT
AACGGAGAATTTTTCCTTTTCTTTAGATACACCAATTTGATAGTGTGATT
TTAGAACGGCGGTAATTAAATTACTTTTTACTTTTGGTTTTGTTTCTTGA
TGGAAATATGAAGACCATTGGCATCACTTATAGAAAACCATCATACCGTG
CTCAGCATTTTGACATGATGCAGTCATTGTTTTCTTGAGGGGATAATAGA
GATGTTTTGTAATTATTTGATATAGAAAGGCTCATTTTCTCTTTCCGAGC
AGAAAAGGTTATAGTTCAGTTAATGTTATTGATGTTAGCCTGAATGTAAT
CTTGTCATGGTGTGATCTGCACACATAGGTTGTGTGCAGGCTGTAGAGCA
CACATAGGTTGTGTGTTTGCTGTTAGAAGTAAAAATCTTGTCAATGTAGT
TGGCTAGTAGAAGGGCTAGCTAGGTCATGAAGTATCCAGGGTATGTTGGG
AGAACTCCAGAATTAGGAATGTTCTAGAGTAAGATATTTAGGAGTAGTAT
GAATGTCTAGAGTTTGTAGAGTATTCAAGAAATATGATGTAGGGTTTTGA
TTGTGCTACATGGCAACAAACTAAAGGGTACAAGTATAAATAGGTCCAAG
CATAGGTTGCTGTGGGCTAGCATAAGTTGCAAGCCAAGACGTAGATAGCC
TGTGTATCAGGTTGAAGCACATATGTATGTGTGTAAGCATGGGTTGCAGT
TCAGTAGGCATTTGTTGCTGAGTAGTGTAGCATCCGTTGCTGCAAAAGCT
AATAGAAGAAGAATGCATCTGTTGCCTAAAACTCCTGTGTGTTCTCTGTA
GTGCTAGTCCCTCATTTTCTGCTTTTTTTACTCAAAAGAGAGAACAGAGA
CGAGATAACAGAGAGGGAACACTAACAATCGATCTCTATTATATAAATTA
CAAAATATCAGGTCATCTGTTTTCTTATTGTGCTTGGTTAATTGTACCGA
GTACTTATTTTTAAACTCTATTTGTTGCCATTGTTAAGCAAATGTCTGTG
TGCATACCTTGGTTTAGCTGTCTTGCATATCAGTGTTACTGAAACATAAG
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TCATCTCTAAGCACATATACTTGGTTGGCCAGTGAAATGCAACTTAATTT
TTTTTGCCCATATAGCTACAGGATCTTTCTGTGGGCACATATCCTTGGGA
CTGAAGGAGTGTCATTGTACTTTTGTGGGATTTCAATCTTTCAATGAAAT
TTAAGTATAGGCCATTTGGCTCATAAGATGAGACCATTAAAATTCCTATG
GATTGCTTTCCTACACCCCACTTCTATAGGATTCATAGCAAGAGGTTTGA
CCACATGGAAATTTCCCTTTATTTCCTTGATGCAGCTTCTATCTTTTGAA
ATTCTTACGAAAATCCTTTGGAGCACCCAAATGCGAAGTTTACAAAATTC
CTCTTTCATCTTCCTTTCCTGTAGGATTCAATAAATCATGAAATCTCAAT
CCTACTGTTTTTCCTATTCCTGCGTATTTAAAATCCCATGTTCCAGAGAG
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GGTTGTACTCTTGCAGGTTGTTGGCTTGCATGGTGGTGCTCTGCTTGGTG
TCACATATCGGACATCTCGTAGAATCAGTCCTTTGACAGCCACAGCTATA
TCAACTGTTCAATCAATGCCCCTATCAGGGTTTGGCGGAAGTGCATCATC
ATTTGCTTCCGATGACCCATTTTCCACCAGAGAAGGGCCGCCCCAAAATT
TCCAGCTATACAGGTATATATGCACCTACTTATTTCATGCTTCCTGGATA
TCTAGAAAATTGTTGGCGAGATGATTGCTATGCTATGTATTACATATATT
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TGTTACCCTAAAACTGCCTACTTAGCTACATTTGATTCGTGCAGCTGGGA
GACCTACCAGCCTGTAAGCGGCCTACTTGCACAGCCTGAGTGGACCGTGT
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CTTTGCTACTGGTGCTGTTTGGCACCGTAGGCAGTTATTTGTGGCTACTC
CAACAACCATCGAGTAAGTTAACTCTTCTCTGTACAGTCTGAATTGTTCA
TTTAGTGTGCCACAATATTTTCGTTATCATGTGTTCCCAACTTCCACTGC
TGTGTCTGTTTCAAGCTCTTGGCTGTCTTTTAATAATGCTATACTTGTGC
GTGATGCAAGCTGGTAAGTAGAAATCGAAAGTGCTGTAGATTAGGAGTCC
TTGTACGATTCATGCTATATTATCCAATGAATTCTGAAAAACTATATTAT
ATTTATCAAGTTGCATAATAATATATTATACAATCAATGGCGTAAAAAGT
GGCAGTGCTAGGATATTGAGAAGGCACTACTTTTAAATGGATATCTGGTA
TAGGTACAGTTTTACTAGCAAACAGTTTTTTGATGCTTTGATGGCACTCC
CAGTACTTGAAAAAAAACTTAGATAGCCCATGGGACATCTTGCTATATCT
TGAACTTCTGAACATATTTTCCAGGTGCGTTTTTGTTGATGCTGGAGTTG
CTGCAATTGATATCGAGACAAAAAAGAGAAAAGAAGAAATGAAAGCAAGA
GAAGCTCAGGGTCGAGCAGTTGCAGAGCATGGAGATTTGGCGCTTATCAC
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TTTTACCTTGAATATTTGCTTCTGCGTTCACTAAATATTAATGGAAGTCA
GGGTTACTAGTATAGTTTCTTAATTTGAATATACTTACTGCGTTATGTGA
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AGCAGTAACCCGCTTTCCGGCAGAGCAGAAAAGACCTATTGGACCACTTG
TCCTGGTTGGTGTCAGAGATGGAGTTCTGTGGCTTGTTGACAGGTAATAC
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TTGTTCTGGTGATATGTGATGCTGATTTGGGTCCAATTCTGACTTCTTGC
AATATTCTTCAAAGGTATATGTGTGCACATGCCTTGTCTCTCAGCCATCC
CGGTATAAGATGTCGGTGCCTGGCAGCATATGGAGATCCAGTTAGTGCTG
TCAAATGGTATGTTTTTATGGCTTGGAGCATTTTGTTGGCTTTTGCAAGC
GGTGGGAGTGACAACTTAAAAACCAATCATGCAGGGCTACTAGACTTGGC
CGAGAACACCATGATGACCTTGCTCAGTTTATGCTTGGAATGGGCTATGC
TACTGAAGCACTTCATTTACCTGGAATATCTAAGAGGTGAGAATTCTTTG
CTGCCTGAATTTTTCTATTATCAGATATTCATGTGTTTCTCTTTATTTAA
TTTTATCCTCATGTTTCTCTTCGCTAGATATAAGCATACCATTTTCATGA
GTTTAAATTTGTGCTGATATTCCTCAGGTTGGAGTTTGATCTTGCAATGC
AGAGCAAGGACTTGAAAAGAGCACTTGCATGTTTGCTGACAATGAGCAAT
AGCCGAGACGTGGGACAAGAAACTACTGCTACAGATGTTACACAGATTCT
CAATTTAGCAGTAGCCAAGCAGGCTAAGCAAGAAAGTCTTGCAGATGCTG
TGCAGGGAATAGTGAAATTTGTCAAGGAGTTTTTTGACCTTATTGATGCG
GCAGATGCCACCGGCCAGGCTGAAATTGCTCGTGAAGTTTTGAAGAGATT
AGCCGCCGCAGCTTCTGTAAAGGGAGCTCTACATGGACAAACCTTACGAG
GCCTGGCACTCCGTCTTGCAAACCATGGGGAGCTTACTCGACTGTCGGTA
AGCTACTCTCACCTAATAATAGTTTATTATTGGAACTTGGTTCTCGCCCA
TAATGATGATTTTCATCTGGTATGGTAGTTACAAAATGTCATGATTATGG
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GCGAGGCTCCTTGTTCATGCATGCATGCTAAAACCTGACGTTTCCTTTCT
GTTGATGTATTATATTTCGTTTATGATGATTTGCACATGTTGAAAATTTC
TTAGGAGCAACCACTAATACTGTTGCACCTTTCCAGGGTTTGGTGACCAA
TTTGATTACAGCTGGCCATGGCCGTGAAGCAGCATTTGCAGCTGCAGTTC
TGGGTGATAACGCCCTCATGGAAAAAGCATGGCAAGACACAGGAATGCTG
GCGGAGGCTGTTTTACATGCTCAAGTAAGTTTTATATTGAATTATATTCT
TTCATCTATGCTTGCTAATTTATACTATAAGAAACATGAGTTTGGTGTGA
ACCAATCAGTCTTAAACATTCATATTCCTTAGGTCCAATGGTTGAGTGTA
GAAGTTGATCCCTTACCCCTAATATCTCTCATACTTATCGTCTTACTCCT
CCATTAGTTGCTTAAAAAATTCAAAACATATTCCTGCCAATAGTTCCTAA
AACCTAAAGCACCACAGACATCCTGCCTCAGACACATGTGTTTTCTGCTC
CGGCTATACAACCTCTTCTTCCTCTCCATCCCCTAACACCATCTTCTCAA
TTGATTCTGTATATTCAAAAATCCAAATCCATCATGTGTAGATGAGAAAA
AAGAATGGAGTTGATGTGCTTCCTTGCAGTTTCAACTAGCATGAAACTGG
TCCATCTATTGTGAAGCACTGGTTCTCCTCCAAACAAAAATAATATTGTG
AAGCATTGTGGCTGGAGGTTGGGTGGTATATATTTTGTGCAAATACTCCC
TCCGTTCCAAAATATAAGATGTTTTAGATTTGTGAAGCAAATATATCTAG
ATGCCTTTTAGTGTAAATTCGGAGTGAACCTAAACATTAAAAGGGTCTAG
ATACATTCACTTCACAAAGCTAAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGGGA
GTACATTGCAAAGAACTTATAAGGTTGCTTATGAGATAAGCTAAACATAA
TGAGTTGTCCGTAACTTGAATATACATCTGGCCTTTTCATTCGGCCAAAT
GACAATGAGTATTATTGTCAAATTCTTACAAGGTTTTTCCACTCTCTAGG
CCCATGGTCGTCCATCATTAAGGAACTCAGTCATAACATGGAACAAGGTG
CTACAAAAGGAGCTGGATCACACACCAACGGTGAAAACCGATGCTGCCGC
AGCATTCTTGGCTTCTCTTGAGGACCCGAAGCTTACTAGTTTGGGAGAAA
CTGAGAAAAAGCCACCTATTGAAATACTTCCTCCTGGAATGCCGCCACTA
TCTGCACCTCCCATTGTTATTAAAAAGGCTGCTGCAAAACCTGGGCTTCC
TAATGCGGCACAGACCCCAAATGCAGCTATAGGTGCTCCCATGAATCAAG
GCACCCCTATGGCTCAAGGTACACCGATGAATCAAGGCACCCCAATGGTT
CAAGGTGCTCCAATGAATCAAGGAGCTCCCATGGCTAATGGGTCTCCTGC
TTCGGCACAGAGTACTGATGAGGTAAAACCGTCGGAGGCAACAACAGCTC
CTGACAATGTGGAGGCTGCAGCAGCTACCAGCAATGCGGAAGCTACTGCA
ACCCCTGGTACTGCGGAAGCGACAGAAGCTCCGGTTACAGACCAAACAAG
TAGTCCTGACACTGCTGCTGCTTCAGCTCCACCAGCTGGCCCCAGTGGCA
CTGATGCACCTGCTGTTCCTCCCGCTGAAGCTACCAACGATGCAGCTTCT
ACCGAGCCACCAGAGACGCAGGATAAACCACCTTCAACAGAGGCATCGCC
ATCTCCTCCACCTAGTGATTCTGCTGTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.