Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA016508

[Submit comment/correction]

Sequence	AA016508
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA016508
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	AGAAAAGTAAAACAGATCTCGCGTCCGCATATCCGCCATTGTTCGCCTGC CCTCGCAGCATGCGCGGTCGCCGTGTCCGCGTCCCTGCCCGCGCCCCTAC TTCTCCTTCCTGCACGGCTGCACGCAACCCCTGGTCCGCGCCGCCGTTTT GGCTGCGATGCCTCCCGATGCCTCCCTGTACTGGTGCCCCCCTCCACGCG ACCGCCTACGGTGTTGCTGGCACTGGCGCCTTCTCACCATCTTCTTCCAC CACCTCTTCCTCGATGCAGACAATTTCCTCAACTACGTCCAGATCCCCGT CACCGCCAGGGTAATCAATCTGTAAGTTTTTGATTCCCCTATGTGTTTGA TCAATTGCCTCTGAGACAGTGGCATGATTTTTCGTTGCATGGATGAGATG GGAAGACGGAGAAGGAGAGGCATTTTTTGCGGGAGGAGCAGGATACCCTG CACTGGGCTTCACGGTCCACCGCTGGTTTGTGCTCAACATTTTGTTTTTA TTTTCTGCAGCCATGACGCCTCCTTCACTTGTGCAGTTGCGCCGCCACCG CAATGTTCTATCCAATGGAACATTGTCATCTGTTTGTGTATATTATTGGT TGGTTTCTAATTTTGATATTTAGAAGATGTTATTTAGAAAATAATCATAT TATTTATAGATGCAAGGACTTATGCATCGTCAATGCAGTAGGGAAATACA TAAGAATCTCGGTTCAGCTAGCGGCCTCCATGCCACGGCTGTTTGACCAA CACCGGCTTCCCTCCACTGCGTGGAGGACGACCACCACGATGCTCTTCTC CCTACCTCCATGCTACACCACTTCCCTACATTCAGGATTCATGGTGATCC AAGGTTTCTGTTTACATGACAATGAAGTAATAAGCATATCGGACTAGGCG GTGGTGGTTCTGCGGAAGACGTGGTGTCGGCTGCGGCTCTCCACGTGTGC CCAGCGTGCTGCCTCCGTCATGCTCAGCGCCGCAAGATCTCCCGCACGCG TCACATCGGCTGCTTCCGGGCATCTAAACATCCGCCGTCATCCTGCAAGT TGTCAACTACCTCGACGACCACTCCATATCCTATGTAAGTCCAATTTCCG TCAAGTACTCCCATCATGTTTTACCTATCGTACATATAGTTGTGCTACAA TGCTAAGTTTCCGCTCGCTCTTGTACCCGGATCAAACAATTTGCCTTGGT GGTGGTGCGGTGAAGCAGCTTATTTACAGAATTTGAATTTGACTATATCA TTTTGACTCATGTTAGTAAAACTCGCAAAACATTCACTCATGTTAAGTAA AACTTGAATGTCAATGTGACTATCTTTTTTTACTCATATTAATTAAGTAG AGGCTGTGAAAGCATCATCCTTGTCGACGCCAATCCGGCCAGCCCATGCA ACGCACCTCTCAACACGATGCTTCTGCCCTAATCCCTATACAGTCGTCTT ATTTGCTAAATTGATTCAGAGTAACTTATGATGGTTACTTATCATTTAGG ATGGTTACTTATCATCTTTGGAAAACAACAGAGACAGTCTCCATGCACAT ATAACTTAGAGAGCTAAACTGGCTCTATTTTCCTTCATAGATTCAGTAGT TGTCATTTCTTATAACCCTTAGTGTAGGCAGCAGTTGGCCATTGGAAAGA AATTTTAGCTCTATAATTATTTGCTGGTCCTAGGGAACCAAAGTTTGTTA TGATGAACATATACAATCAAGGTAAATAAAACTTGCAAGCTTTAATATAT TTATATGTGATAAACAGATACTGATTCTGGATGAGATTTCTTACCTGCTT GAAGATCCTAAAGTATATGCGTACAGAAATCTAAAGCTAAGTTTGCTATT CTATCTGGACGAAAGATCTATGGTATCATATTGAAGCGAGGCATGCTCTT TCTGCTAAAGCATATATATCATCACCCGGTCATTAAAGTTTTAAACATAT GCTAGGAAGAGTCAGTAGTAACTCTCACTCATCTGTGTCATTACGGATAT TTCGATATCATTGCATTTAAGTTGTTCCATTTTTTTGGTATTCTGCACCA CACAATATCTGAGGCAAGCTAATCTGAATTTGGATTTTGAAAACCGCGTT AGTGAAATAATGCATCTGTGGTGATAAATAAGACCCTGAGTTATTTTGTT ATACATAATGGACCAGGAATTATTTCTCCAGTGTCTAGCGGTTGTAGCCA TGAGATTCATATTTACTTGTTTGATCTAATTTTATAGTCTGAACGATTAT CCTTCCAATTTTTCTCCCCTAATAGAACAAAAGGAAGGGGGCGCATATAC CTCCACACCACCTGGTCACCAACCAAGAAAGACCGTTGGTAATACGCTTG CAAGATGATAAAGTGTGATTCGTTTAGTTGAATTCGAGTGAGGCCCTATT ATTGTTTCCTTTTTCAGTTTTCTTGATTTACCATACTTGAACTTTAGAAA ATTTTCAAAATCATGTGATTCTTTCTTCATTTTGGAAACCTCTCCAAATA ATTTCATATGAGTTTGGGTAATTTAAATGCTCTGAATAGCTTAAGTTGGT AAAAAATAAGAAGCTTTCATGGAAGAGGTGTACCTGATCTCAGTTATCTG AAGTTTCCATGGCCTGTGAAATGTTTAATAGTACTTATGACTATATCTAC GATATTCAGAGGTATAGTATTGTGAGTGGTGTACCAATATTTTATGTTTG GATTAAAAGTTGGTACCGATAGTAACCATGTTTTTTTGATAGAGAGTTGC TTTCACACATGAACAGAAGGATTAGTTGTGCACCAATTTCAAGAAGTGGT AGAACAACAACGACGACAATGTGACTTGGGCCAGGAGCAAGGTATGGCCA CAGAGGAGCAGGACAAGCCCCCTCTTGCAATGACGCCAAACATGTTCTTT TGGAGTTGCAGCTGGTTCATTATCAACCAACTGGGGTAATGTTGTAGTAC AGTCGGTTTGGCTGCATCATGTAGTGCATATATTATTCAACACCTTCGGC ATACTACTTCTGTTTCAAACTTTAGATATTGACTTACAAATATGTCAACT ATTTACTTGAAAGTTACAAATAAAGGAATAATGTTGTTAAATAAGATCTA CGATATAGTCTGGAAAGTCACTCGCAATTGTGCCTTCCACATTTATTTTT GTAAATGCATGATATTTCCGCTTACAAATATGTCAACTATTTACTTGGAA GTTACAAATAAGGGAATAATGTTGTTTAATAAGATCTGCTATATAGTCCG GAAAGTCACTCGTAATCGTGCCTTTCAGATTTATTTTTATAAATGCATGA TATTTCCGCCTACAAAAAATATGTGCATTAGTAATACGTGCATTGCACGT GCAACACTACTAGTTTGTACAACACTAGTTTCTTAATTTTGTTTTTCTGT ATAAGAGGATGGAAACCAGCGGGCCGGGTTGGGCTTTGTCTACCTAAGAT GGATATCGCTAAGTAGAACTGAGGGGGAAATTGCTATGATCCCTCTTCCC TAAACCGTTCCTGACGCCGCCGCCGCCGACTCGTGGCAACGTAGCTGCCG TGTTGCTGGCCGCGACAGTAGGCGAATCTCTTGTCAAGGTCAGCTGCATT GCAGGTATGCGTCATTGTCCTGCTTAGCTAGGTCGTTGTTCAAATTATTT TATCTGAGTAAGGGAAAACTCTAGCAAGGGTTATTTTATCTGAGTAGGTG TGGATCATTGACGAGAATTCCTTCAGCAGAATTTAGTTTTAGCCACTTCT TATCCTATTAACTGGTGGTACCTAGTAAATCAGAGAGGGGTTCGATTTTT CTTCTACTGAGTACTGACGCTGGGTTAGAGTGGTATTTCGGATGTACTTG TGGATCCGTGATTTTGTTTGGAGTTTGGCCATCACGTACCTGTGTGATTT TGATGGTCATCAGTGTCTAGTTTCAGGAAATATCTGATCACTTGTTTTGT ATTAGGAAATCTAACAAATTAATTATTGTGCAACTAGTACGTGAGAAAAA TTGCTAATTTTGTTCTAATTGGACTTGATGAAACCCACCGAGTGGTGCAC TTTGTAGTTTTTTGTTTTGCTCGTTCTCTGTCTTTAGAAATATGTTAATG GGATTAAACCTACAGAATACTAGGAAATAGCTACTGCCGCCTTACTCTTT ATCAGAAAACGATTATGAGATATATGTTTGTGCTAGACCGTGGTTTCTTG CATTATTGCTAGAACCAAGCCGAGCCACAATAATTTTGTTGTATGACATT TTCCTGTATGGGGTACTAGTAAGTCGGAATTAATCAATTAGTTCTATGAA AGACTATCCTGCAAATTTTATTACTATTCTTATAGTACTGGCAAAGAGTA CAACATGTTGGTATTTTCTATAATAAAAGTAAAGGTTTTGTTTTCGGTAT GTTGCGCGTAGGGGCGATGGTATGAATAGCTCGTGTGCTTTTGACGTGAT GAACTGTATTGAGTGTGACCTAGTGTGACCTATGCTCTGTAACAGGTGTA GGTCCTTTCGGTTCGGAGTCCTATAATTCACAGTTTTTGCCCCACGGTTA AGGCAAGTTCATGGCCGATAGTAATTCTGCATATATCTCTTCACTTGATT TTACTTAAAAGTGCATGTTTTTATGTCTATGATATTTCCATGATGACAAT GATAATGATGATGACATGCGCATATTATGCATTTTTACATATACTCATGA TGACAATGATGATAGTGTGACCTACTTCGGTGGGCACAATGCGACCTTCA TTCATGGACTGCGACCCACTTTGGAGGAACTCTCCACGAGTTGGAGCGAG TGGATGCCGACGGGTGTTCACTCGAGCGATACCAGTATTCGCGATGATAT GAGATGAGCATATAGGCATGTAAGACATAATACTATGTTCTAAAGGATGA ATTATGTTTAATGATGTCCCGGTGTTTTGATTTATTTAAAGTTACTATTT GTTTGTGAACTTGTTGATTCTTTGTACTCACCCCTGTAGCTTTAATGTTT TTAGGTAAATCTCAAGGACGTCATTCATGGGGAATATGAGAGTAGAACCA CCACCCACTACACATCATGACCTCACATTTATCTTGGAATGATTTCTTTC TAAATAATAAGATTACCTGGTATGGTTGGGTTTTTGGAGAATGTTGAATA GTACCTTAAAACGGTTTTGGTTATCTTCTTGCGTATGGTTGATAAATTAT TATTTTCTGGTAGATTAGAGATCTGGTATATTATTGGGGTGATTAACTTG TACTATGTGGTGATATATTGTTGTTTTTTGGTATTCCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.