Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA046588

[Submit comment/correction]

Sequence
AA046588
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA046588
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TGGAAACAAATCAATTACATACTCCTACTCCATGATTATCGAGAGCAGCA
ATGGGAACATATCTGATCTGACCTGTAAATCTGAGTGATTACCGGGAGCA
GTTATTGCACCTCTGATTCGGAAACGAAACGCATCCCACCCTCCAACATA
ATGTGATCCGATGGACCGGGGAACCCTAGTGGTGCGCAGTGCCCTGCCTT
TTATTTGCCGTCGCAGCCCACCCCCATATGCCTTGGTATCTCGATCTGTC
GATCAGCGCCTCCCCAACGGCCAAAGGCACTCTTCTTCTTCGCCCGGTCA
GAAGCAGGTGGCTGTACCGAAGAAGGCCGTGAACTACCGGATACGGCGAC
CAACGAGGAGGGCTTGCAGCGGCGGGTATCCTTCTCCCTGAGTCCTCCAC
ATCTCATCTTGCACCTTTCTTCGTTTCCTTGCCAAAACCTTCTTGGCTGG
ATCTGAGCTGCGCTCCTTTTTCTTTTCAAATTCTTCAAATTGGCAGGTGC
AATCGTTCTTTATTGGTTTATTAGTAAAGATGTAGATGCAACTCTCTCCG
TTTTAAAATATAAGATATTTTAGCTTTTGTAAAAGGACTGTATCAAGACC
CATGTTAGTGCGTCCAGATTCATTCATTTCATAAAAGATAAAATATCTTA
TATTTTTTCAAACAGAGGGAGTAAATGATTGTGATCTTACGATTGTTGAC
TTGGCTGTCTTGCCCAAGTACTATAATGACCAAAAATCTTGGGAACCAGG
TATTGATTTGAGGAGTTGCATTCTGAAGGTACATGGATACCGGCGACCTG
CCCCCGGTATCTTCTCATGGAGATGATCCACACGGCGTTGAAATCGGCAT
TGGGTTCAAGCCGGTAGAGCACCCTATGGAGCCTTGATGAACTGGTGAAA
TGCCCACTTCCTAAACCATTTATGTTGCGTCCTCACTTGTTTGAGAATGA
TTACATGTTTGGGTTGTGTTTCGTAGTCCACTACAAGTAACGACAGACAA
ATGTAGTACGAGTGAACTTGTGTATCAGAAATGTAGTTACAGGAACATGC
CTGCTCTTATATACTTGAGAATTCTATGTTTTCCTTATATTCTCATCACC
ATTTACTGCTTGTAAACTGAAAACTGTATTTGATGACTGTTATGCTTGCC
ATATTTAAAAGAACAACTGTATATATAGTCTGTTTAGTAGAAATACATAA
TCGTTTAATACTCTCTCCGTCCAGAAACAATTGACTTGGGTTTGTTTAAA
TTCGAATGTATCTATACACTAAAATGCGTCTAGATACATTTAAATCTAGA
CAAATCCAAGTCAGTTATTTCTGGACGGAGGGAGTATGTAACCTGCCTGG
CGTAAGAAGTACTACAGTGGCTCCAGGACAATAGGCATTGTTAATTACCA
ACAACGTGTCTACCTGCAGTGCGAGCCTGATTTGTAGCCAAATTGCGGCC
TCTGCTCTATTTCTACACATCCATGCAAAAGTATTTCTGCAACTAATTGT
ACTTGTGACTTTTCCTTTTGTACTTCTTACAACTAACTGTTCTTTCTTGC
TAAAATACTAACTCATCTTTTCTGATAGAAACACGATGATACACTTTCTT
AGCCTCTACTTAGTTGATGATGGTTTTAACTTCATGATAAACACATTTTC
CCATTGACTCTAATCTGGAAAGAATAAATCAGAAGGTTGTATTGATGTCC
CAATAGGAATGCTGAACAGAGCTCTTCCCCTCCAAACAAAATCTCATGAA
CTATCGTCTAAATTTAAGTATATGCAGTAGTAAGATTATAAACCATAATT
AAAATATAGTGCTTATAGCTCTTTCTAATATAACATGTTGAGGTCTTGAT
CTCTTATGACATATTACAAAGATGTTAAAGGGCCCGCATAATAATTTGTC
CCATCTCTTCTGATTGCTCTAGATGTGGTGGTCCTTCAACATGAACACTT
CTTTGATTTCCTTATGTTATAGCAGTATGGTTCCAATCTCACTTAGGTCG
GGTTACGAGTGATAGATGTGGTGGTCCTTAAACGTATGATATTGTCCTTA
TGTTATAGCAGTATGGTTCCAATATCATTTAGGTCTGCATACGAGTGATG
TTACTCCCCAACAAGGATTTTCTCTCTCTAATATTGCTCTTTCTTTCTTT
GCATTATGCAAAGAAGAATACCGACTTTAGTATAGTAGACATAAAATGAA
AGAAAGATATGTTATGTCAATTATAGCCGACCATCCGTAACAAATGCTGC
TGAGCTATCTCATGTTAAGAAATGTAGCTAACTACCCGTAACATGCTGGT
CTTTCCTTCCTCAACTAACCTCCGGGTGAGCACTAATATTCTCTTCCTCC
GTCTTCTTTGCGTACTCCACTTTTTAACTCGAACAAGGTTCTAATTTGTT
TTGTTTATATGCATGTCCGGGCTCTATGATTAGGGGTCTGGTGTTTGGAT
AATTTCTGGAGTGATTGAATTGGTCGAAAAATCTGAACCACATTAGAGGG
AGAGGTACTATTGAATTACCTTGAGCTTGAGTAAATTCACATTGTTCAGT
TCATATCCGATTCCAATGGTTCTACTTCCATAATGCATGGTTGTCCAAAT
TAAGCCATAAGAGTTCACGGGCTTATCTGTCTACTGTGGAGAACACTTTC
TTTCACTGGCTCTAGATATTTTGAATATGCTCTGAGTTGGATACTTTCCA
GTATGTACATGATAGGTTAGGGTAAGACATCATCCTTATTTTTGGCTCAG
GCGTGACTAGTCCTTATGGCATCCTCTTCTTTGGCTAGTAGGTTCCTTGC
TTTTTTTTCAGTCAATTTGTAAAAAAATGCAGTGCTGTTTTTGTCGAGTA
TGTAAAAGAGTTCCAGTTAGTTTGCATAGTTTATGTTAAGAAGGGAGTGA
TGCAAGGCTCATTGAGTCAAGTTTGTTTATATTCTGATGGCTATTCGATT
TTTGGTAAATGGAGAGATGACTTTTATTGAAGATGATCCTGGTGTTGCTT
GCAACTCGTTCTAGTTCTGTATCTTTTCTAGGTAGAAACATGAGGTCGGT
TCAATATGATCCTGGTGTTGCCTGCAACTTGTTTTAGTTCTGTGTCTTCT
CTATGTGGTATTTTATGGCACAACTTATGATTTATTTTGTCTAAAAACTT
GGTCAAACTTCACATAGTTGACTTTTCAAAAAACATTACATGTCTAAAAA
CTTGGTCAAATTTCAGTTATGACGTATGAACTCATCATGCTTCATATAGC
TAGATAGTGTTAGTAGTTTTTCTTGCTTCTTTGGCTTTCTTTTCCTTTTC
TCTAGTGCCGATTAGCAATTTTCTAGTGTTTCTTATAATTTTTCCTTTTT
GGTTTGCACATTTAAGTTGCACTTCTTGGTTTTATTCTTATATAATACAA
TAGATAAACATTTCAATTTAGGTTCTAGGTAAAAATAAAATCATTGTGCT
CTGGAGATTTTGGCTTGTCCAGAACTTTCATAGGTCAGATTATTTGTTAT
CTTCAGCCACATATATAAACAGAAATTGAAGTCATTGTTCTGCTTTGGTT
GGTTGCTTTATTTTCAGAGGAAAAGAAGTACGCTAGCAGGTTCCAAAACT
GCTAAGGGAAACTTGGAGCACCGGCTGTGTTGTTTGACAGCAGTAGGAGT
TGCGAAATCAAGAGTAACATGGATGATGATTATGATCCTAGTGACAAGGA
TGGTAGTTTTGAGCCGAGTGAAAAGGATGATGACTCTTGAGACGAAGGTA
AGGCCTTGCACTAAATAAGTTTAAATTGCTTTGCTTAAGACATTTTTGTT
ATTCAAAGCTTGATGCGTGTCACACCTTTGATTTTAGAAATGCAAAAGAT
TTAGGTCTCAATGCTTAGATAGAAGAAAAGAGTTATGTATAATCCCTAAG
AAGGACCACACCTATGATTACAATGCCATGCCCTTAGGAACTAGCCTCCA
CAAACTTTTTTCTTTGCCCCCGTCCGCTGACGAGCCTCAGGCAAGCGATG
CTAGGTTGCGTGCCATCAAAGATGTATGTGTTTTGATGCTTTCAAATCAA
CCAAGCTGTGAGCATGATTGTCCATTCGTCCTACTGATACACTATGCTAA
AATATTCAGTTTAAATTCCTTTTGCCAGTTCAAATGGATTTTTTTTGAGA
ACTACTTAACCTACTATCTAAAACATTATCTCCTTCACTGCAAATAAATC
AAAACATCATTTCATTTTTTGTAGCTGAACCAAAATTAGAAGTTCTAGAA
ATAAACAAAAAAATACTCATAATAAACCCTGAAACCATGGTACGTTTTTT
GTTCCATCTCGCAACATTGATGTGCACATGTTGGAAATGATGTGCACAAA
AAACATGCTAGTACATTCACACACAAATTAACCCATCTAGATAGACAACT
AGAACTAGATAGATAGGGTAATTGCACACAAGGTGTTGTCATCATGGCGT
GATTGCCAGCTACCGCATAGGCTACTCCCTTGTGCTTGACCGTACCATCT
CCTCCATTTCCACTCTATCCAGAGCATCCTTCAGGATCAACATCTTAAAT
GTGCAAACCGAGCTTCCCTGGCGCAACTGAGCTTCTAGTAAGTCACACGC
ATTTGTGGTCTGTGATCGGCCGTCAACGACAATATTAAAGTTTCTCAAGC
TTTTTACGGTGCAAAATATATATTAGAATTTGGCATATGATTCTTTGCCA
CTAACTTTGTTAATCTATGGATCCTCCTTAGGTGACATCTTCATCTGAAC
TTTCTTGACTTCCGACGATGTAGAACCTGACACATGATTCAAAGGAGGAT
GACATTGTAGAATGAACATAATATTACTCTCAACTCTCCTAATGTGTTGT
TTTCATAGATGTGTCCAAACTGTTAATACCGAGTGTTGCATCGGTTGTAG
TGAACTCATTCTCTGTAAGTATGTATATCTGAAAATAATAGTGTACCATT
TCACTAGCAATATTCCAAAGAAACGGGTCGTGCGTTCGAAATGAAATTAA
TATTAAGGGACGATGGAGTAGTAGATAAACATTTGTTAAGCACTCGTCTT
AAACTTTATTGTTCCCACTTGTTGAGATCATGTTGTATCGCAAATTCATA
CCATCCAAAATTGAGTCTGTCTTGTTAGCTTTTTAATTTGTAACATAGAC
CTGCCTTTCCTCATGTTCCAATGCAATTATAGCGTCATGATCTGGAAGAT
TATTTCTGCAAAAACTAATTAGAAAACCGTAGGATAGGAACACAAAATGA
AAATGAAGTGGGAAAAAAGATAAACGAAATGTTGGCACATGCTTGTCTCC
TCCCCGTCCAAATCTGAATTTCGCATCAACAAACACATGTGTTCTTATGT
AGATGTAAACTTCCTTGTAGTGAGCTCTTGCTAATAGAAAATGGCAAATT
GCATCGCTTAGGAAACATTCAAAAACCTAATAAACAAAACCTACAATCAA
ATCCCCATAACAACATGAGATTTTGACATAACTTGATGAAGCATGGACCT
TTGTTGGCAGTTTCATTTTATCTCCACTGTCTGTCCCAAGTAGTGCCATA
GAATTCTTTAAATCTATAATTTGTTTGAAGATTCAAATGCAATTGTGTCT
GACTTATGTAGCTGAGTCTTCAAAGAAATTGGGAGAGAACTATGAAGGTA
AATAAGAAATTGCCAAAAAAAGGTCCAAGCTTCGTCAAGCTTATGCTGAA
ATCTCATCTTGTTAGGTTGTTTTATCTTGTAACTCTATGCTTGTTAGTTG
TTTCAATGTTTATCCCATGCCGATAAATCCAACATTTTTTTCTTATGAGC
AACACTCAATTTGCTGTTGTATATATTGGGAGGGGTTGCTCACACTGGCA
CACTCCCAAAACGGGCTTCCCAATAGATGGGTTGAGGTGAGAATATTTGG
GTTGCCGGGCTGCCAAACACACCCTTAGCCTTGTAATTTCTGTACTTGAT
GTGTCCTTGCTCATCTTATAATGCAATTTCAGCATTATGATCTGAAGATG
TTCTCTACAAAACTCAGCCGATAGACCTGTGAGAAAAACACAAAACAAAG
ACAGTTCGGGAATATAATGATAACTGAATGCTGCTCTTAAAATAATACTA
GATTATTTTGGCATTTAAGAAACATTCAAACAGCTAGTAAATTGAGACTT
ACCAACCAAAATCCTTTTACAACATGTGAGTGCATCATATCCCTAATGAA
GCTTGGACCTCCTGCTGCCAATCTCTCATGTACCTTCACAGCTCTATCCC
AAGCACTGCCCTTAACAATATAATTTGGTTGAAGATTCATTCGGGTGCAT
ATGTTAGACATAGTTGCCATCTTTAAAATGCAATCTACTTGACAAAACAA
CAAAAAATTGGGAAGTATCGTGCATATTTCTTCTAGCCATCATCGTACTA
ATTATCAATATAATAGCATACCTGTCAAGTTATAGCTTGTAAGAAATTCC
GACTCAGTCATTCATATTGAATAGTCTAAGCTATATCATATGTTCTTACA
CTTCGATTGTGGTATCACATTTTATTTTTGTACAAAAACAATCGGTGACC
TATATGAACAAGTAATTGTTCAATCTTTTAATCACAATTTTTTCTAAAAT
GAATCAGTTTTAAATGATTTTATAATTCATGTTTAGACCTTACCTTTCGC
ATGAAATCATGATCCTTTTGTTTCTTGCTTTTGGCAGATTTGGAGCCTGC
TCGACCTCCCTCTCTTCCTTTACAATATAACCAACTCGGTTAGTCTACTT
CCCCAATAAATAATGAACGTCTAACAGTTGGTTATCTTATAGAGGAAGAG
AGGGAGGTTGGCAGGCTCCAAATCTGCCAAGAGCAAGAAACAAAAGGATC
ATGATTTTGTGCGAGAGTAAGGTCCAAACATGAATCATAAAATCATTTTA
GACTTATTTATTTAGATAACTTTTGTGATTGAAAGTTTGAAAAAATCACT
TGTTCATCTAGGTTACCAAATGTTTTTGTATTAAAATAAAATATGATATC
ATAATCTAAATGTACTTACATCATGATTTACGCTAGACGCCTAGACTATG
CAATATGGATGGCTGAGTTGGAATTTCTTACAAGCTATGACTCGACAGGT
ATGTGATGATAATGTAATTACTATGATGATGACCTGAAGAAATATGCACA
ATAATTCCGATTTTGTTGTTGTTTTCGTGAGTATTTTGCATTTTAAAGAT
GCCAATTATGTCTGACTTCTTACGCGCGCCTGAATGAATTTTGAAACAAA
TTATAGTATTAAGGGCAGTGCTTGGGATAGAGATATGATGGTACAAGAGA
GATTCGCAGGAGAAGGTCTAATCTTCATCAGAGATATGATGCACTCATAT
GTTGTAAAGGGGTTTTGGTTGGTAAGTCTCGATTTAGTAGGTGTTTGAAT
GTTTCTGCAATGCAAAAATAATCCAGTATTATTTTTATTTCTTAAGAACA
ACATTCAGTTGCCTTACTTTTATGATCTGCCTTTGTTTGTGTTCCTCTCA
TAGGGCCTGCCGGCTGAGTTTTGCAGATCATAATGCTGAAATTGCACTAG
AAGATGAGGAAGAGCACATCAAGTACACAAATTACAAAGCTAACAAAACC
GAACTCAGCATGGATGGTTGGATTCGTGGAACAACATGATCTTAAGGTAG
TCGACGCCTTCGTGTTTCAACTTGTCAGGCCTAGAAGATTTAAGTTCAGT
GCTTCAATCGTCCTTCATAAAGTTCCTTTTTTTCGAATGTACAATAAGAG
CTCGTCCCTTTAAGGTCAATGCATGCCATTTTCCCTACTTTTATGAGCAG
CGCATGCTAGAATTGGAGGTCAAATGACGGAATTAGAGGTTTAGATGCAT
TTCAACTTTTATTGACAACTTTGTATGTCTAATGTTATCTTAGTGTTAAG
CATGTGCAAGATGCATCATAGATACAGAAAAAGAGTACGGAGAAATATTT
AAGAAATTATCCTTTATAAGAATAGTAGAGTAATATAAAAGGTCAAGTTC
ATTATTTCTCTGTTCAGTCCACCAATGAAAATATGAACAGTAACTAATGG
CTCCCGGGTTTTGACATGCTTGACGCTTCTTTCTTTTTAATTAAGCTCAT
ATGCACCAGACAAATTTTGATTTATTTCAACGCCTCTGCAGGGAGGAGCG
GGCATGCCCAAAACTATATATAATTGTGTTCAGAAGCTTGTAGAACTGGC
CAAGAGAGTACAACTATGTGGCCCATGGATTAGCCTAGCTTCATAGATAT
TATGGCCTAGATCCAATGCTTTCTTACTTTGTATGAACAAAGATTAGGCT
CCTCAGCATGGATTGGCCTTGCTCTTCAGTTAAGAGTCTTTCAGTTACCT
TCCATGTTCTTCTGATCTGGATACTCTTCAAATGTAGAAATGGCTCTACT
TTCATATTTTAGCTGTCCTAATGAGTAAATCCTAATAAGTCTTCCAAATA
CATAATTGTGATAGTTGCCTTCCGTAACCGCTCTCATAATAGATTCACCT
TTACATGTGAGAGCAGCTAAGTTTCCCATAATATCATGAAGCTAGGCTCA
GAAAATGTAAGCCTCCATATCTCTTCAGCTAAGAATGGTGTCCAGTAGCC
ACAGTTAATTTGTTTCACACCTTTTGGTTTATACTCAGGATATGAATCGC
AGAAGAAAGTACTCACGACATTCTACCGATTTCATTACTTCCCACTTTTG
TGAGTAGGACATTGACATTCATCAATGTGAGCAATAATTTCTTGCATCTC
ATATCCATTGCCACGACAGGGTGGCTGCACTCTTCTGTCTCTATTCCTTT
TGTTGTATCACGGCAGGAGTAGCTGCTGCTGCACCTGGAGACCTGTTGCT
TAGCCATGCTTTGCTGCCTAAGCTTCATGACACAAACGGTCCCTCAGTGA
CACGGGCTTCACAAAAGGTCAAGGGTAATCAGGGATTTAACTGTTGGTCC
GTAATTTCCATGTTTGCTTTCCATGTTTCCCTCAATTGATTGGCACCGTC
CATTACTTTCTTAACTGTTGACATGATTGTTGTTTGCTTTCCATATTTTC
TCCTAGCGTGATTTGGTGTCGAGTAATGACCAAGGCTGCAGATTCTACTA
CTAGGCGAGTGGTGAGTTCTTCAGACCATCTAGTCAAAAAATCTTCACTG
ATGTATTTATATGCGACATTTAACATGGCTGTTGTCAGGGTATCCAAAGA
ATTAAAGTTGTTCCAGCGAAGAATTCTTTTGCAGAATTTGCTGAGCAGAA
CATTCTGACAATCCTATTTGTTTCGAGAATGAATGTGTTACAACTCGAGC
GCTAATACTTGGGTATCTATATGAACCTAACCAGCGAGCTGAAAAAAAAC
ATGGTTATCGGCTGCACATTCTCTACTCATTAAATTGAAGAATATTCCAG
TGCATGACAAATTGAATAGATGATCTCCAAATTATGCTTGTAATCAGCTA
TTTTATTGGCAACAAGTGTAGCATAGTACTTATTTTGGGAGATCTTTTTT
ATTTGTTACGGTACCTTTGATGTGTGAGATGAAGACTGTAATTAATAAAT
GACGGCTCTATTTGCTAGTGTTTGGCAGTGCCCGTGATCTTCATATTCAT
GGTCTTCGATGATAAACTTTTTCTTTATCTAGAAAGGATGATCCTAAATA
CAGTATTATTTTGCCAGTGTCCATAGTATTCCTATACAAAGCATCTCACC
CAATCAAATTGTTTTTATTAACTAGTAAAAATTACCATGGCGAATCCTTA
TTTTATTTTACAGATTATGTTTGTTAGTGAAGATCATTTTCAATTTCTGG
TGATCTCAACGTCAAAGAAGTTGTTATTAATTTAGACTGACTTATTGGTA
TGGTGTTTCATATGCACTCTTTTGGTGAAAAGGTTGGAGGCAGAGCCTAT
GTCATTCGCTAGAAGTATGGTCTGTGATGGCGTGGGAACATTACTCGTGG
AGGCATACTGAAATGTTGAGTGTATAGGGGAAATGGGAAGAGAGCGGCAC
ACATGGGCGATGGAATTAATGAACTACAGTAGTACTCTTCAGTAGAGATG
GCTTCTTAATGACAAACAGCTTGTTATAAGTTGATTGTCATGAGCTTGAG
ATATTGTGTTGTAATAGTACAGAGATACTACTACAATGGCACTGGTTTGG
GGGCACCGGTGCGGGTGGTTTTTCCGGCCTCAACCCCGAAGACCGGTTTT
AGGGCCCGAGTGGAGATGCTCTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.