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GrainGenes Sequence Report: AA045411

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Sequence
AA045411
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA045411
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCGGCGGCCGTGGCGACCACCTCCCGACGCGGCCCCGGCGGTGGGGG
ATGGCCGATTGACGACGAGAACCTGAACTTCGAGACCTCGGCGAGGGTCG
AGGTCGTCGGCAGCTTCGACGCCATGAGCATCCGCGACGAGCTGCTCCGC
GGAATCTACGGCTACGGCTTCGAGAAGCCCTCGGCCATCCAGCAGCGCGC
CGTGCTCCCCATCATCACCGGCCGCGACGTCATCGCCCAGGCCCAGTCCG
GGACCGGCAAGACCTCCATGATCTCCCTCTCCGTCTGCCAGATCATCGAC
ACCTCAGTCCGCAAGTACGTCTCCCCTCCCTGATTAGTTAGATCCATGTC
GATTGCTTCGCTCGCTAGATGACGAACATGTATTGTCGCGTGCGCCCGGC
TCTTGTTAGGTAGGAGTAAAAAACATTAGTTCTAGGGTTTGGCAGCTGTA
TGTATTCTAGATTTTGTGGTGGCATGTGTGATTTTGGCATAGATATATAT
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CCCACAGCCCTCCTGGCCCACCCCAACCCCACGCACCCGACGCCACCCGC
CTCTCGCGACCCCCTCCTCTCGTCTCTCTGCTTCCACCCTCCGTCCCCGA
CCGAAGCCGCCGGCCACCGCTCCCGCCTCCCTCGGCTCCCCGCCAGGCAC
CCCCTCACCGCGGCTGCTCGTGCTCGCCCTGCTGCGTCTCCTCCTCGACC
CAGTCGCCGCGGCGGCCGCATAACCGGAGCTGTTCCGTCGCCACCGCGAC
TACCACGCTGTCAGGCCGGCGCGGGGCATCTCAGTGGTTTTCATCTAGGC
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TGCCACGCATCCCTGACGTGCTCGTGCTCGGATCCGGCCTCTGGCACATG
CTACATGTGACGGACGCCTCGCAATACCGTGATGCATGGACATCCGTTGC
AGATGCGGCCAACTCCCTCCGATCGCCGCTTCCTGTGCCTCCGCCGCACC
TGTTCGGGCACGGCCTGCCACGCCTTGTGAACCCTATGTTCAACGCTGAT
GCCAAGAAAGCGCACATGAATGACGCCAAGTACTTCCCTCGGACGCGAAT
CCCGAAACCCCGAGCCCGAAAGGTCGATCTTCGTCTTGGACCAGCAAGAT
CTCCTTCACGGACTCGAGTACCCCGATGCCTTCGACACAGAGCTTTGAGG
ATGCCGTCATGGACCCGGGGAAAAATCCCTGGACGTCAAGACCGCCACAT
GGAAAACCCGAAGAACCCGAAGACCGATCCCGCCGAACGCCAAGATCTTC
AATCGGATCCGAAGACCGCCAAGATCGCCACCGGTTCAACAAGCGCTCTG
CCCCGGACACCAATTTCTGCACCCCGAACGTCAAGACCGACTCGATGGCG
CGGACCCGACAAGAGCTTCGCAACGACAAGAACGCCAGCGACCAGGAGAA
TCCGATGCGCCCCGGCGCCGAACCAAGCCCTGCTTCCCGGATGCCGAGGA
CACCGACACAGTACAACAAGATCTACTTCGCGGACACCGTGCGACAAGAC
CTACCTCAGTTATCCGAGAACGAACCTGCCGCGGCCGAACCCCAGATCCG
AACCCCGAGACCTACCCCGAATCCCGGAACCCCAAGATCGCCGAACCCTA
ATGTGTGAACCCCTTCCCGAAAACCCTATTTTATAATATAATACAATTGT
TGCATATTAAATCATTCATCTCGCATGCATATCATGTGGTTTGGGGGCCT
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TAGTTTCATATCGGCCTCATTTAAACTTGTGTAGCGAACCGGTATCTTAT
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TGCCGTGGTATTAAATATTGCATCCGGTGTTTATTCTAGTGTTTTGCTTC
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TTACTTTTATAGTATTTATTCCCTCCTGTTGATCTATTGCTATCTGTGTT
GCGATGCTCTAGTTTTCGTGCCCGTGATATACCGTGCAGCCTATATTGCC
TTGGACACATCCTATTACCCTGTTGTTTGGTAGATAGTTGGACTTGCGCG
TCGTAGTCGCTTGCTCCAGTGCTGTTGCGTGTCGTCCAGTGCCACAGTTG
TTGATGTATTGCCGCATGTTGATGTTGGAGATGATTATAGTTTTACTTAC
CGTTCACTTTAATTCCTGTTTAACAACTAAAATTGAAGTAAGTAGAGGCA
TCGGTGGGTGATAGAAAATATTTGGTTTCCGAACGCCCACTTGTGTCCCG
TAGGACCCCGAGTACTTGATACCTATTCCTTGATTTATCGCGCTATCCAC
ATCCGGGAGGTATATGGGACCCCCCTGAGCCAGAGCTTGATTCAGTCTTA
TTTCTTGGGGCCACAAACTAGTTTGAGGTTTTATTTACGATCCTGTACTT
ATGCCATGCTACAACCTATCTACCCAGCCCTTGCCTCCACATCACCCCGG
CCAACCCCGTCGCGCCACCTCACCCCTCTCTCTCCCTCACCCAATCCCCT
TTTGCCACCTAGACTAAACCCAACCCCCACTCATCCACACCCCACCAACA
CACACAGGGTCGACCCGATGCCGAACCAAGATATCCACGGACCCGTGGAC
ATCCCCTTCACCGTTCCTCGAAGCCCGAGCGGCAAGGACGCCTTCCCAGA
GTTCAAGGACCCATCCCGTAAAGGCCTTAAACCCTTCAAGTTAATTGCGA
CAACGAGCTCGACACCGACAACCGAGTGGGACCCCGAGTACTTCGTCGCG
GAAACTAGGGGCGATGACGCCAAGTCGACAAGATCTACCTCACGGAGCGG
CGAACCCCGGACCCCGAAGACCCCATGGCCTCCGCTGCAGAACAACAAGT
CCTTCGGAGTGAAACCAACAAGATCTACCGCCGGACGCCAAGTACTCTTT
TCCGTATCCGAAGACCGAACCCCGGACGCCAAGATCGCCACCGGATACGC
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GACAACATGGCCCGACCACCGCGGATGCGCCAAGATCTACCCCGTTACCG
AGAACGATCCCGCCGAGTCCGAGCCCGTCGAACCCTGAACCCCGAGACCT
ACCCCGAACCCTCCCCGGAACCCCAAGTTCATCGAGACCCCTCAATGTGT
GAACCTTCCCGAAACCCTATTTTATAATATAATAACAACTTGTCGCATAA
TAGTTGTCTTGCATGCATACATTCATGTGGTTTGGGGGCCTTATGCCGAT
TCACCTAATAATTAAATATGGGGCCCATATGCGGGCAAATCTAGCCTTAT
ATTGGCCTCATTTAAATTGGTGTAGCGAACCGGTATCTTATCTTGCCTTG
TTATAACAACATTTAATTGCGGGGTAGCTCAACAACTTGAACCACCTAAT
TAAATTGTCGAGACCCCGGTTCCACTTAACATTGACCTAATTGCATCGCA
TCTTTGCCATGCCATACATCATACATGCATCATGCCGATCTTCTGCCGTT
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TCGACAATGTTTTCAGGCGAGCATCTCCCCCTTTCTACCTATCTTACTTT
TATAGTATTTATTCCCTCCTGTTGATCTATTGCTATCTGTGTTGCGATGC
TCTAGTTTCCGTACCCTTGATATTACTTGCAGCCTTATATTGCCTTGGAC
ACATCCTATTACCTGTTGTTTGGTAGATAGTTGGACTTGCGCGTCGTAGT
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ATTGCCGCATGTTGATGTTGGAGATGATCATAGTTTTACTTATCGCTCAC
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GTGATAGAAAATATTTGGTTTCCGAACGCCCACTTGTGTCCCGTAGGACC
CCGAGTACTTGATACCTGTTCCTTGATTTATCGCGTTATCCACATCCGGG
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GGGCCACAAACTAGTTTGAGGTTTTATTTACGATCCTGTACTTATGCCAT
GCTACTTATGTATTTAAATTGTGCGACAGATAGCACCTGTACTGTTTAGG
AATTGTGACCCGTTTACGCGGTATCGACAAGCCCAGTTTTGGGTTCCCAG
TCGCTTACAGCCGGCCCCACAAACCTTGAGTCCGTCTCGGAGCTAGCTTA
CTTCGTTGCGGGTAAGACTACAAGGGGTGCCCCCTGAAATATTTCTGAAT
CCTGTGATTGCTTTGTCGTGAAAGCCTCGTTGGGTTTTGATTTGGTTTTT
CCGAGGTTGATCGAGTGTGTGTTGCTATTGGTGCACCCCGGCCGGGTAAA
ACTTTCTAAAAGCCGTGTCCGCGGATATGGACGACTTGGAGCACAGTATC
TCGACCATAGACAAGCATAACTAAAGTTTATTGCTATAAATTTGACTTTA
TAATGACTAGTAATCAGCTTCACTATAATGGAATGGCTAATTAATACTGC
CCACAATTGCTTGTTTGGAGTGTCGCTTGCGACCATTGTACCTGACTAGT
AAGTATTGCAACTACAACGGAATGGCTGAATAAAAGTACCAACAACTGCT
GGGTTTTGGGGTTATCTCATGCTAATTGTATCTGATTAGTAAATGTCGCA
ACTACAACGGAATGATTAAATAAAAGTGCCCACTGCTTATTTTATCAGGA
TGATTATCTAAACCTGACTAGTAAATTGCTGCAACGATAACCGAATAAGT
AAAACTGCCAACTGTGTGAGTTCCTCGGTTGACTTCCTCGTTTGGTCTCG
AGGGGGAAACGCCAGGATGGGTTTGGTTGGTGGTAGTAGCAGGTTGGTTC
CGAATAGGTCTTTCTTCCCCCTCTCTGATTGCCGCCAGTTGTATCGAGTC
TCTATAGGTTGTTTAGTGCACGCTGCCGCTGCCGCTCAGTCCACCATACC
TATGTAGGCGAGGACCGCCGAATTCTAGCCTCGCCGTGTACTGGCCTCAG
TACTGACGCTCCTCTTTTTCCTTTGCCCTTTGTCGGCACCCCTTTTGTTT
AAGCAGGTTTTGAGATCGACGTCGTTAGCAGGGTTACCCTTCCGGCTTGG
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CATTTGCATCTTGTCCGTAGTCGGACGCTCTATCATTTTCAAGGTGATTT
GGTTCTTTGTATATTATATCTATATTCTTGACTCTTTGAGTCGCTGTTGT
ACATATCTGTTCTGTGGGTCCCATCGAGGATTGTTGTGTAATGTTATTAC
TTCGTTTTCCACCCGCACGAAAGTGCCTGGTGGGCACCTTTGAATCGTTT
CTATGCGGGTTTGGCAGATTTCGCTAAAACTTGCATAGGTCCGATTCTGA
GGGTGTTACACCAGTCTAGTTCTTCTGCTATAGTGTTGTGACAATGATTC
TCAATCATTTTATTACACTGTAATGCATCACCTATGTATCACAATCTGTT
GTAGTGCTTTTCAGAATTTGATAGACCCACCTGTGCTTGTATTATGTCTG
CCAGTAACCCTGTCCTAATTATTCTGCTGTGCTGCTGTGAGAATGATTCT
CAATCATTTTATTACACTGTAATGCTTTTCAGATTTTGCTAGACCCACCT
GTGCTCTTGTTAGGTAGTAAAAAACTTCGGTTCTAGGGTTTGGCAGCTGT
TTGTATTCTAGATTTTGGTCTTATGTGTGTGATTTTGGCATAGATATATG
GAACGTGTTAAAACTATTTCCTGCTTTTGAGAATATGCTAGACCCAGATG
TGCTTGTATTACGTCTGCCGGTCGCCTAGTCCTAGTTTTCTGTTGCAGTG
ATGTTACAATGATTCTCACTCTTTTTTATAACACTATATATAATGCATCA
GCTCTGTATAATGCACATAGAGCGCATGCTTCAATAGGGTAAAGCTGAAG
TTGACATGGGTAACTTTGATTTTGTAGAGTGCAGGCATTGATACCGTCGC
CGACCAGGGAGCTTGCCACCCAAACTGAGAGGGTGATGCAGGCTGTGGGA
CAGTTCATGAGCGTGGATGTGCACGCTTGTGTCGGTGGCAAGAGCATCGG
CAAGGATATTAAGAAGCGATCGGAGGACTGGGATCCCGCCAGTTAGGTCG
TCTGAGATGTCGCAGAAGTGTTGAGGCTGTTCTTCACGATCCCGAGCACC
TCAAATCTGGCACACACGCTAATCTCAACGGGGATCCCACTAGTGAGGTA
GCTGAGCCCTGCAGGGACGATGCGAAAGTATATCCTTTTATGATGATCTA
GCCTCCCACATTCCCTATGCTCAAGGATGGTCCTACAAGGTTTGCCTTTC
TCCTTTATATCATCTTCATAGTGCTCACTTGAGCTTACAAAGATATGGAG
TGTGCATCGTGTTAATCTCTTTTTCCATGTTGTGTTTGTCTTGCCATCTG
CTGTTAAGTTGAAATATGTAGCTTTGATATTTACACCATGACATTTTTTT
AGTTGTATTATGTTTCATTTTGAGTGTCACGTAATGTTTGACTTCTGTTG
TACAACCACCTATCTTTCCAATTCTCTTAATCCAGTGATGCTTAATTGTC
CCCATACTGATCCTTATTACATTTCCTTTATTGGAACAGAAATGTCACGT
GAAGAACTAGCATTGATGGATGGTATCTATTTCTGTGATAGTCTAGGGTG
CCACTAAGGATTAGCAAAGCAAAATGTAGCTTGAAAGTGCCTTAACAAGG
GCATGTCTGAGAAAACAAGGGCATATGGAAATGTTTATGCCTTAACAAAT
GTGCCTTAACAAATGTTTATGCCATATAACTCATGCATGTCTGATAAAAC
AAGGGCATTATCCCTCATATTTCATACTTTCATCCGGTGCCTTCGTAATG
CTTAACAATTATCTTACTATTGCAGCTAAGATTTCGTATTTTCTCCTGTG
AGATGTGCCAACTTGGAGACTGATGCTGAGTGCTTGGTTTTCCTTTACCT
TTTCTCTAGAGCTATCAGCTGGTATGAACCGTCTCTTTGTTATAAAAAAC
TGATCATCGTGCTCATCATGATATATCTTGTGCTATTTTCTTCACCTTAT
CCTACTTAGCCCTGAGTCTTCTACTTGGAGTTATGATCTAGTGTATTTGG
AAGCGATGGCGCAGTTTTCCTTCATGCTCGGCAGTGTCCATGCTTGCTTC
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GTTCTTCATAACTCCAATTCCATCATCATTGCCTCCCTCTGAACGTATTT
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TGCAGGAAACTTTGGAATTGCAGTTCTGAAGTATGAAATCTCATGACAGG
TTAGCCTTGATTTTTTATACTATTCTATACTGTCTCAAGTAACATCTTCT
TTTATATGATCTGTATGCGTGATTAAAGGAGTAAGCACAACCTACAATTA
TCCTCAGATTCACTACCGAAAGTTACAGCAATATGTTCCTTTTATTTGTG
GCACCCATGCCCTTCCTAGTTATTTGAAGGATTCCAATAACCCTTGCAGT
ATCAGGAGATGCAACTGTTTGGGGGGCACTTTTTAGCTGCTCGAGGAGCT
ACAGACGCACCAACTCTGTCTCTCTCTGTTTCTCACCCTCTCTCTGTGGC
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TGTATGGGTAAGGAAAACCTGGCTTGTTTTACTTGATACTGCTACTATGA
TGAGAGAGAAAAATACAATATAGCACGGAATCAATAAGGAGGTATCTGCT
ATAGCATATCGAGTTATAAATGTTACTGTGCCATCTTTTAGGTTATTTTA
TTGTTATTTGTCTTTATTATCTAGGTTCTGAAATATAGCCACCAAAGCTC
ATCTTTTACCTATGAAATAATATGCAGTATTGATATCTAAGCAGCACCAA
AGTATTTTCTCGTGTATCTAATTCCCAGTTATGACGGGCGCGGGAACACG
TGCTTTTATGGTCTAGTAGGTTGTAAACATGGTTCATTTCAGAGGCGATT
TATGATAGCGTCCATTTCGTGTTATTTTAACTTACAGGAATTGTGCTCTG
TCTCTCCTGGAACTTCATTGCTGTCATAGTCTGCTGGATCAAGGAGGAGG
GTGGGTTTCATGAGTATCTATCAATGCCTGTGTATTTTGTATGTCCATTC
ATGCTGAATGGTTGGATTCTTTATGCTTGCAGATTCGAAGCTGTTCTTAC
TTGCTATGATCTATGCTTTGCTTGGAATCCTCCTTTCTTACCTGATGTGG
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TTATTTGTCGTAGTCCCCTTTCTTACCTGTGTAAGTAAGCATATTTTTTT
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TGAAGACAGCTTTTATTTTCTAAAAAATTTATTTAGTATTCACATAATCA
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CCATGCTAATGTTTAGGTCCGTACATTGCACGCTGCTCAATTCAGAATTA
TATTACTCCCTCCGACCCATGTTAGTTGACTCAAGTTTTAGACTGACTGG
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ATAACAAATTGTAATTTGCCACTCATCATGTCTCCTCTGTTATTATATGA
AAGAACAACATAATATGAAATAAATTAAATTGCATCCTGAACAGCTTCCT
CTGTTGAGTAGGAGCGCGAGCAGGAGGGCGAGGAAGGAGGGCGAGGAAGG
AGCTCCAGTGGTGAGGCGACTTGCCTCTTGATCCCAACCAGGGAGCAGCT
TCGGCGGCCGCGGCCAGCAAGGAGGAGCTCTGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.