Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA042315

[Submit comment/correction]

Sequence
AA042315
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA042315
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATTCGCATGGGCCATCAGGACACACTCAAGTCAAGTGAGAGACCAAGGCC
CATCAATAGACACCCAGTGGCCAGCACAGCAAAGACGCCACTTCAAAGAA
ATTAAGAGAGATGCCACGAAAATCCAGGTGAGGCGGCGGCCGCCGACGCC
GCTAGGTTTTCGGAGCCGGAGACTCAGCGGGCCGGGGTAGCGGAGAGCAG
CATCCGACAGAGGTGCGTGACGCGGTGGTAACGGAGGCCGGCCAGGGAGA
GGAGCGGCCGGAGTGAGGATTCTGTGTCGGCCGTGTTCGGATGAGTCATC
TAGGCATGGAGGGGCGTTGCACTTCGGTAATTGCTCTCGATTCTTCTTTT
CTCGTGCGCATCACAGGTTGATTCGGCTTCGTTGATTGGTACTAGTTCTC
GCTGGAAATGGTGGATTTCGGTATTTCAGTCTGTTCTTAGATCGGGAATA
GTTAGATATATGAACTTCCCTTAGAAATTTCAAAGTGCATTTGGTAGGCT
TGCTTACGTTAGGGTCCTTTCAAGCATATTAATAGGGACACTTAGAAATT
AAGAAACGGCCGTATCGCCATATCCGTATCGCCATATCGGTGCTTTGTAG
ACGGCAAGCACCTGGTGTATCCAAAAACTGGATTAGATAGGCAAAGGGGC
AACATTAGGGTTTGTGACATAGATATCCCCAGAAACCATGGATAAGTGTA
GCAAGTGTGCATTTGGTAGGCTTGCTAACATCATGGATTATTTACTCATG
AAGAAACAACGGAAACTTATAGAAATTAAAAAAGGCAAGCACCTGTTGTA
TCTAAAAAACTGGATTAGATGTGCAAGTGGCAACATTAGGGTTTGTGACA
CAGATAGGGACACTTAGAAATTAAGAAATGGCAAGAACCTGGTGTATACC
AAATACTGGATTAGATGGGCGGGCAACATTACGGTTTGTGGCGTAGATAT
CCCCAGAAACTGTGGATAAGTGTACCAAAGTGTGCATTTGGTAGGCTTGC
TAACATTGATGGATTATTTACTCATGAGGGTAAAAAAGGGAAACTTAGGA
ACTAAAGGCAAGCACCTGTTGTATCTCAAACTGGAATAGATGGGCAAGTT
GCAACATTAGTGTTTGTGACACAGAGATCCCCCCAAAATGTGGATAAGTA
TGCAGAATGCCAATTCCAGTGGTTCTGTGTCAAGAGTGCGCCAATAAGTG
TGTATTTCTGTAATATACTCATCTTTTTTTTCCTTCAACAGCAGGCGATT
GATGATGATAGGCTCAGCTCGCTGACTGATGACATTATACTGTCTATCTT
GATGAGAGTCGACATAACCACAGCAACACGCAGTAGTGTGCTGTCGAAGC
GGTGGAGAAATTTTCCTTGGTTGCTTTCTGAGCTCAAACTTCTTGTCTCA
GATTTTCTGCCCACTCCATTCCCAGAACCCTTTGAGGCACATCACGTGGA
AAAAGCAATGTCATGTCTAACCAAAGCAACAAGGAGTTTCTTGGCTGATC
CCAGGAGGAAATCCACCAACATCACATGGCTATTGCTTCGGCTCTATTTG
AATAGCAATTACTCACGTGAGATTGGCCCACTGGTTCGCGATGCCATTGA
CAGTGGGTTGTTAAAAGAACTAGGCCTTGGATTTTTCCATGAGAAGAAGG
AGCCTAGACAATGCCCACACAAGGAGATGGTACAGCAAGCCCGGGATGTG
ATTGAATTTTTTACCACCTATCCCTGTGTGCATAGTTGCCTTGTAAGGCT
TTTTGTGCATAATGCGCGTTTTGCTGAGCAGGATATACACCATCTCCTAT
TTGACTCCTGCAAGGAACTGAAGCAGTTAATTCTGTTCCACTGTGATGTT
GGGGACTGTTCAGTATGGCAGATAAATGCACCAGATTCCAAACTCAAGCT
CCTCCAAGTCACCATGACCTTGCTGAGAGTTGAGGTGCTCTGCCTACCGA
AACTGGAGCGTCTACATCTGGACCATTGGTTTTATTGCGAGCCCCCCTTG
CGTTTCGGGTTTGTCCCATCTCTCAACGAATTGGCCCTTATCTGTAATGG
AACCCTTAAGAACCGAGAGTTTAGTCTAAGTGCGGTTCTACGTGGTACCA
CAAACATACATACTCTAACTTTGGACTTTGATGGAGTGGGGCTTTGGATA
CAACCTGAAGGAAAGCAACTCTGCCCTGCATTCAGCAAGCTAAGAAAGTT
GAGTATTTGTGGCATGTTTGTTGATTTTGACCTGTTATGGACAATAAATC
TCCTTGAAGCTGCTCCATCTGTTGAAATATTTCTTGTTCAGGTACTTTTG
GTCACTCATTTATACACATATATTGGAATTTAGAGCAGGTTCCCCAACAA
GTAAGTATGTGTGGCCATAATCCTCTTGTCCTGCAATATAACGATATGCT
GATGCATGCTTGATACAGATATGGGATCATCCTTGCCGAGAGGAGATGCG
GTTAAGAGCAGAAGCAGCTTATGGGAATCAAAGAACAAAACCTTCGTGGA
GCATTAATGGGTTCACAAGCTCTAATACCTGGCAACTGAAAGAGCTACTA
TTCGTTGGCTATAGGCCCCTGGAGCAACAAACTTTATTCATAAGAGCGGC
GATGAAGCAAGCTCCAAACTTGAAGGCGGTTCATCTCAAAGAAAATGAGA
AGCCATGCAGGCGCTGCAAGGCAATGTCCACTCCACGTTCTCCTCCGAGA
GGAGGCTTCTTTCCAAGGGACCAAGAGGAGCAAGGCGCAACAGTGAAGCA
AATCAGAGACGGGGTTTCTTCCTCCGCGCAGATAATCTTTTCAAGTAGTC
ATGCTACTGTTAAATGTGTCGTGTATCCTTGAAGGGAGTGCAGTTTGCTT
ATCATCACCTTTCTTCCTCTAGTTCTCCTTTCCCACTGATGGGTCTCTGT
TGTGATGCACTTATTCGTACTATCGGTTTAGTAGACGTTCTATGATATTG
TAATCATCAGTTGCCGTCTGTGTCACCTGTATTGTGTACCCTGGAATGAA
TGTTGATCCTATGTTAACAACATGCACCGGTATCTATGCTACTGTCGTTC
TTTTTTGTACCATCCAGATTTGAGTTCTACTGGGTCTCATTGACAAGATA
CCAGTATCTTGCCATGAGGGTTGGGATAAAAACGTTCTTTAGTTGACATT
TGAAAAATGCCTGGTCATGTTTCTCTTGCCTGTTCTTTCTGTGCTGTGAC
TTTTTCTAGTGTCAAAAGGGGCAATTAAGGGTTTACCTTTTAGTTGCCAC
TTTTTCTAGTGTCAAAAGGGACTAAAAGAATGATGACACTTTACAGCACA
TTTATCTGACCCTTTGACGTTAATGTCAGCTTGTAGTTGTTTATTTTTCA
TAACTAAATCAGCTTGGAACCACACTTTGAACTGGCAAATTGTTGCCTGG
GCACTCATTCATGCACCAGGAGCAGGGCAGACGCGTCAGGAATCTTCCTT
TGCAACAATTGCCTTCACAACATTCACATGATGAATGAAGTAGTTTTAGT
GATTGATCGGTGCGGAACCTGGAAGAAGCCCCACTCCTCTTGCATGATAC
TACTGCTATCACTTCATTTGTCACTCTCTAGCCCAGTGGTTTCCACTCAT
AACTTGCAATTAGCAGCAATGATCTAATGGTTTTTACTTTTGTTTGTTAT
TTTGCACCATTATCGCCGACTTTATGATGCAGAAGGCTGAGTCGGATGTT
TGTTTACCAAGTTCGGAGGTCGAGATAGGCATAGACTTGGGTCAGTGTTG
GCACTGGTGGACCTTAGTGGAGGTGAAAAGGGCCATCGCCCCCCAGCCCA
TGTAGAATTTGACAACTGTTTACAGGTATTTGACTCATTTATCAATTGAA
AATCAGACTGAAGCCCATATTTTGTCCCCCAGCCCATTTTGCCCCCCCCC
CCCCCCCACCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC
ACACACACAAGAATTTGGCCCAAGGTCCGCCACTGAGTGTTGGGTTAAAT
GAAATTAAGACATCTCACGATGATTGTTGCAGTTCATGATTCATGTAAAC
CTTTTTAGCGTCATTTTAGGATCTCTTTTGCATCGAAGATGTAAATTTAT
AGTTTTATTCAGAAACGCTCATTTCAATTGTATTAGAATTCTCTTTTTTA
CGCGACTCTTATATCATGTTCTTAGGGGAATTTGATTCAGAGTTCAGATC
ATAGTTTTTGTCAGGGGGACTAGATTCCGATTATAGATGGATGTGTAGGA
GACCATGTTTTGGGCCTCATGTAGCCCACTTGATACAGTAGCTGGCCAAC
CGAACCAGAGAAACCAGAGACCATGTTTTCGGCCTATAGGTCAACAAGTC
CACGGATGAATCAGCCGGCTTCGGAGGCCCAGCAACTGGGCGAAAGTATA
AAGACAGAACGAGAGAAGCCAGGAAATCCAGGCGCAGCGGCGGCCGTCGA
GGCGCGGGGAGCAGCCGGCGAATCCACGAGGAGTTTTAAGCCGGCGATTC
GCAGCGAGGCCCCAAAGCAGCGCGCTAGCGGGGAGCAGCGTCCGAAGGTC
GGCCGGAAACGCTGGTTGGCTCGGAAGAGGAGCGTGGCGGCTGCCGGCTG
TTATCCGCGTGCCCTGCGCCACATTGCTAGGGCAGGAGCGACCTTACGGC
GGCGGGCCTGGGATGAGCCAATTAGGCATGGAGCCGCATTGCCCTCCGGT
AAATCCTCTCCATTCTTCTTCTACTGTGTGCAGTTGTACGTTCTAGCCGT
TCGATTTGTACTCTGTAGCTCGTAATTTGGAGCGAATGCCAGTACAGTTT
ATTCTTAGATATGGAAAAGTTAGATATGAACTTACTTTAGATTTTTCACT
AGTAATTTGTGAGTTTGCCTTTAGTACGCTTGCTCACGAGTCATGTGATT
ACATACCAAAAAATCAGAGCTGGATGATTTTTTTTTTTGAATCCACTCAT
CTTGTTCTTGACAGATTTAGACGTCTTAGCTTTTCTTACAACGTGCACCC
ACATAACGGGCACTTGGTTATTGGCATAGTTAGCCGGATTGCTCATGGAA
TCAAATGATTTGCAAGACCACATAAGTTATTTTTCTTAGCCTCTGTTTAG
GTTTCAGTCTACTGCAGTAGCTCCTTTTACTTATTACTATTGGATTTTCC
TTTACTCCTTGAATATCACGATTTACGCAACAAGGTCATTCTCTAGTTGC
TCATCTATTTTTTTCCTTTCCAGGAAGCAAGGCATGAAGATCGGCTCAGT
GCGCTTCCTGATGACATTATATTGTCTATCTTGTTGAGACTCGACACAGC
TATAGCAACACGGACTAGTGTCCTGTCAAAGCGGTGGAGGAATTTGCCTT
GGTTGCTTCCCGAGCTCAACCTTTGTGTCCGGGATTTCCTGCGCTCCTCG
CTTACGCTACCCATTGATGCACATCAGATGGATCAAGCTATGGCGTGTCT
AACCAAAGCAACTAGGAGTTTCTTGGATGACCCCAGCAAAAAATCCTCCA
TCACAAGGCTAAGGCTTCAGCTCTGTCTGACCGGTGATTACTCGCATGAG
ATTGGCCCCCTGGTTCGTGACGCGATTGACAGCGGGGTGGTAAAAGAACT
GGACCTTTCTATTGTTGATGAGAAGGAGCCTTGTGATTGTGAACATGAGG
ACAGGCTACAGCAAGCCCAGGCCATCGATGGATTTTTTACAGCCTATCCT
TGTGTGTTTCGTTGCCTCACAACGCTTCTTCTGCATAATGTATGGTTTTC
TAATTGGGATATGCATCACCTCCTATTTGACTGCTGCAAGCAACTGCAGC
ACTTAAGTCTGGACCACTGTGATGTTGGCGGTTCAGTATGGCAGATAAAT
GCGCCAAATTCCAAGCTCAGAATCCTTGAAGTCTGCATGTCCTACTTGGT
GACTGTTGAAGTGCTCTGCCTTCCAAAACTGGAGCGGATCCATTATGATG
AATGGTTTTATTTCGAGCCCCCCTTGCGTTTTGGTTCTGCCCCATCTCTC
AAGGAATTGGCTCTTTTGTGCCGTGCAACCCTTGATCATCCAGAGTTTAG
TTTAAGTGAGGTTCTACGTGGTACCTCAAACATACACACTCTGACTCTGA
ACTTCCAAGGAGAACGGCTTTGGATACAACCTGAAGGAAAGCAGCTCTGC
CCTGCATTTGGCAAGCTAAGAAAGCTGTCTATTTGGGGCGTCTTTGTTGA
GTTTGACTTGTTATGGACAATAAATCTTCTTGAAGCTGCTCCATCTGTTG
AGATATTTTCCGTGCAGGTACTTTTTCAGCCATTCTTTCTTCCTTTAGTT
TAATATACCATATGTATGTTTTGGAATTTAGAACAGGCTCTCAAAACAGA
CAAGTATGTGTGGCCATGATCCTGTTGTACTGAATGCGTTGATGCTTTAT
GTAGGTATGGAATCATGCTTGCCTAGATGATGACGAGGATATAAGAGCAG
AAATTTTCTGGGCTCAGAGAATAGAGCCGCGATGGAGCACCCGTAAGTTC
ACAAGCTCTAAACCATGGCGATTGAAAGAGCTTGAAATTGTTGGCTTTAG
GCCTCTAGAGCAACAGTTTCTATTTGTAAGGTCTGTGATGCAGCGAGCTC
CAAACTTGAAGGCAGTTCTTCTCAAAGAACATGACAAGCCATGCCAGGAC
TGCGATGCAGTGAGCAGGCCACATCCTCCTCCAGGAGGAGGTTTCTATCC
GAGGGATAAAGATGAGCAAGAAACAGTCGTCAAGCGGCTTAGAGATGGGG
TCTGCTCCTCCGCACGATTTTTTTTTTATAAGAGTTGTTATAATTGAATG
TGAATCGTGGTAGTTGGATGTATCTGTGTTGTATTCAGTGTTTCTGTTCT
CTTTTCTAATTGGAGTCTGTCTTGGAGAGTCTGTTGGGAGTAGGGAATCT
GTCTTGGAGGATTAACATATGGAAATGGCCTTGGGCATAATTAGTGTGTG
TTGTCTTATTATAACGATGAATGTATCATGGTTTCAATGTATGTTTTGAA
GTCTTTTTACTAATATCTGTGCAAGCATATGTGCATATGTGCTACAAAGA
TGCTCTTGGTGCCTGTGCCAGCATATGTGCTACATGCACGAACCTTTTAC
TAACCAAGGCCATTTGTGTGGTTAGACTTGTCACATCATCACAATAATTT
GCATCTTTTTTCATGAATGTTAGGGTTCTGTCTTGTTTATATTCCTCTAA
TGTTCTCCAGTTAATGGTTAGAAAGATCAGATGAGATAATAAAGTTATAT
TCATTTATAAAGTTCATCCAGTTTATTCAATTTTTGAAGTTGTATCCCTT
CATCAATTTTATTTAACCTTAGAGTTGTATTTCAGAATTAGAGTCTGCAT
GGATTCATGGGAAGGCAGTAGCAAATAGAGCAATTTTTGGCATGTACCGT
GTCAGGTATTCTGATTGGTCCGTTCTTTATGACTTAGTGAAATCCATACA
ATTTACTACTACCAGCCATAATACTCCTTTCGTCCAAAAATAACTGATTT
GGTTTTATTTAGATTTAAATGTATCTAGACGCATTTTGTAGATATTCAAA
TCTAGACAAATTCAAGTCAGTTATTTCTGGACGAAGGTTATTATTGGAGG
AGGCCGCCGCGAGTACGCAGCGGGGAGGCCGCCGTCGACTGCTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.