Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA028569

[Submit comment/correction]

Sequence	AA028569
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA028569
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GTGACATACTGGGTTTTGACTTGAGATTTAAAAAAAATCCCATCTTTCCA CCCGTGCGCCGCCACTCCCATCGAGCAAAACCGCCGCCGCCGACGCACCT CCTCCGCAGCTCGCCTCTCCAGCCGGCCGACGGCTCCATCTCCGAGCCAA GCCTGCCGACGACTCCAGCGTCGATCCAAGCCCGCTGCCGACCTGCAGCT CCGCCCCGCCGTCGCGTCAATCTGCAGGTGGCAGAGCACCGCCGCCTCGT CACACGCAGGTCCCAGCTCGGCGGCGTCGACGGCCCGCAGCTGAGCATTG ACTTATCAGGTATTCCAGGCATCTCCGCTTTGCTCCGATCTGAATTGCCT CGTCAAGTATTTCGCCTTGCCCACTAATCTTCTACACTCGATTAGGTCTT CTGCTCCATAGTTTTTTCCTAATTTTCTTGTAATGATCACATGGGTGGAT TCGTATGTATTACCTTTTAGTCAGATCTTGTGGTACACGCCATGGAATAA TTCCTGATGGGTTGTATAACCTTAATGATTTGGACGCTTCAAGCTTAGTT ATGCTCATCATCCTTTTAATTAATGTCACTTGTGCTGTTAAAAGGTAACT CTGTTATAAGAATTGATTTGTCTCATCTGATTTCACCACCTGTGCTTTTA AACTTGGCATGGTACTCTAATGGACTTCAATTAAGAGTCTCATTAATTGG TCTAGTTTCACCGTTTACCTATAGTCATGTTCAGTTTACATGCCGTTAAC TGTTGTACTCGATGGGAGTGGCGGCGCACGGGTGGAAAGATGGGATTTTT GAAGATACCAAACATGCTGAAAATGCTGCTATGATGTTTTGCTTTCAGGA TAAACCTTGAAAAATCAAAGGAATTGAAGATTATACTTCTCCTGAAAATG CAGCATTTTCAGGATAAACCTTGAAAAATCAAATATACCGAACAGTTTTG AAGATTGTACTTCTCCTGAAAATGCTGCTTTCTCGCATGCCAGAACATGC AGCAAGGAATTTTTTTTATGTTCGGGGAAATTGTTTGAAAATTAGCTGCT ACGATGTTTTGCTTTCTCCTTGTTGAGAACATGCAGCAAAGGAATTGCTA GTTAGCTATTTACCCATTCTCAGTGCTTCTTAGTTAATCTCCATGTCAAT CGAAGGGGACAGAAGATAAATATCATCAGATCAGTGTACATGGCCCAGTT GAGTCCTGTTGAAATCAGGAAAGGTAGTATAGACTTTGCACAGAGGAACA TAGATGATCAGCTCAAAATGCATAAGCTGAAAAGAATAGACAAACCAACT TCTCAGAGCTTCTCCTCCTTATCCTCACTGGAATCCACAAGCCGGCTTCT CTATAAGCATAAGCTAAAAAGAAGTGGCCTGAGACCTAAACATTCTCAGT TAACTGCTCCGAATAGTTCAGGGCTTCAGCCCATGAGGTAACCAAGTCAT GTACTAAGGAGTAAGGAAAACTGTCCAGCCTGTTTTGGATGACAGGCATT AATCCACTACAAGAAGAGCAGAGGTATACATCCCTGGAGACTGAGCTAGT AGCTCACAGGATCGGAACAGGCGAAAACTAATGATGATTCCTGCTGCTAC CTATCAGGGCAAACTAGGAAGTGTAACTTTTTCAAAGGAGAGAAAGCTGT CGCAACCATTCTCAACATGACAAAATTTAAGAGGAATGCTCTCAAAGTTG TTTTAAACTGTTTCCAGTTTATCCCTTGAGGGAGGCTTGTCTCTGCGCCA AGTTGAACAAACAAAAAGTTATGATGGAAAGAATTGTCGACCAGCATATA CTATATGAACAAACATAACCTGCTAACCCCAAATTCATATACGGTGACCT TTTTTTTTGCATCTCCTTACCTGTTTATAAATTCTAGGATAGTTTTTTCT ACAATTTAGGGCTTTATCCATCTCATTGGTGCCTATTGTTGCTTAGAATC AGATTTCTTTCTTCGGGTAATTGTTGGTCAAGAAAACAATGAGAATTGGT GACAAGTCGCAAGGAATGGACATATGTAAGCATGCGAATAAAATCATGAG TGATTGTGCAATTTGACTGCAATTCAGAGTTCAACGGTAAAACGGTTTAG AAACCCAAAACTTCCCATCAGTTTTGATATTAACCTTAAAATACTTGCAT TTATATAGCTCAAACATGATAACCACTGAGTATTACAGAAAACACAGTTA GATCTATGTGCACTTCAACAACACAAACAGATATATCTATGTGGACAGAA ATACAACCAGTATGTTATAGACACATCGCTTGCCTAAATGTACGGAAGTT TCAGAACATATCTTTGCTACAAGGGGTAATCATATGCATTTCAAACAAAA CATTATGAAAATCATATCGAATACATGTGATCCTGGCTGTGGGATTCAGC AAGTTGTTAGGTCAAGTTTGTTACTGTTTGCGATTCCGGTTCAGTCTTAA ATGTTTTTTTTGCGTTCACTTCATATCATCATGAACGAGTAGCCGTATTT GCATGTTTGGTCTTTACCGAGATGGAATTTTGATCCAAGTGCTTGTTGAC AGTTGAAACTTGACAGATGCAAGTTGTCTTAAAAGTAGGTAACTGTTGAA TCATATATCTTTCAGTTTGAGGTTGACCGGAGCTGAAGGGAAGTATGGGT ATTGGTAGCAGTGCACTACTTGCCTTAAGAAGGCAATCAGAAGATGAGTC TGTTGTGAACCTGGTTGTAAGCTCCCCAGCGCCAGAAGCACCCGGAGTAT CAGCCTCTCACGCTGGCTCGCGCACCTCACCCATTGAAGTGGAAGATCTG GATGATGAAGTGCATGATGTACCAGCTTCAGAAGTGTCTCCTCTGGTACG TTGGTTAACATTTGAAGGGCATGTTATTGTGTGTAACTGATCTCATGCCA TTAGGCCATATTGATGTTTAGGAAGCATTGTATATATATGTATATATGCA CTTTTTAATAGGTTATTTACTTGCGCTTGTGAGGCGCACCAACTTTTCGT ATTAAGGAAGAGTATTATAAGTTGGTCATAACACTGAAATGATGTAGCAT TTCTGGTATTTATACTGAATCATCTTGAATATTGCAGAGGAGGAGTCAAA GAACCAGGAGACCAGCTGTGCCAGTTGTTGATGAACAGCTCCGTGCTCCC CGTCAAGGTTAGTTGGTTACTACTACATACATCTAATTCCATGAGATTGT TTTGGCTTCTAGATTACAGAAATTAGTTGGTAAACTTTTCACTAGTCTAT TATGATATGCCTTAATAAGTTACTATATTCTTGTGGAACTGTTGAATTCA TATATAACAGACATAATTCTGGGGAAATACCTCTATTATGCTGCTAAGAT TACTGACTCTTAGTGTCATCAGACAACTTTTTACCATGTAACCCTAGCTG ATACGGCTGCATATATATGCATTGCGTGCGGCTCCTAAGGGAGATATGCT TTACAAATCAATCTACTTGATTCATCGGACATTACCTATGTCTTGCTACT AAGCGGACTGACTCTCTAGTGGTAGCAGACATTTAAGCTTCGCTGAAAAT TGAACTTGTGACTTTTTTTTTGCTAATTTCCTAGATAATAATTTGTCGTT ATAAGGTGATACTATATATTTACATTGATGACGACTCTGTAAACCACAAT AGAAGGTGTACCTATGTTCGTCAATGTGATATCTGACTGCTCCCTCCATC CGAAAATAAGTCAATTATTTTCGGACCGAGAGAGTATATTTTTTCCCTGT CATTTAAGCTTCTTTACTTGCTGCATTATTTATTCAGTCAGGAGTGTTTG ATGATGATAATGCGAGAGTCCTTTCTCATAACACAGGCTACAAACGTCGG AGAGTTGCAGCTGTACCAGATATCTCTCAGGAAGCAGGAGAAGGTTCCAG CTTGCAGGTATTTGATTTTAGAACTTTGAAGGGATTAAACTGTCAGCCAT AAGGTCCAGTTTCAATACTGTTCTACTTATTAGTTGTTTCTCTACTTTGT CCTCCTACGTAAAATAGCAGCCGATATAATGTCCATCCTATATAGTTTTG GATTATGCTGTCCTTTCAGTAGACCAAGGGAGTAACAATGTCAGGTCAAA TTGAACACATTTTTCTTCGTCCTTTCAAGTCATAGAGAACACTCATACTT ACAGTTCTGCGATGATCTCATATAGATACTTCATAGAAGCCAACAATTAA GATTCTTGGTTAACATTGCCAATTTCGCAATACCTAACATGTTTATGGCA TTCCTTTCGCTATGTAGGTGCCATGTACTAACATGTTTATGGCATTCCTT ATGATAGAGGATATTTCCACCTGAAAAATCTACTCTCTACATTCAATCCT CGCATCCTCCTACTAGCATGTTGCCTCGTGATTTGTGCTAAATTCTGGCT GCATGTTTCCGTTCTTGGCGAAGGTGCCTCCAAAGGAGCCCATCTTTATG TGCCTGGTGTGCTGGGACAATATGGATGAACCTGCTACAACAATTTGCGG CCATATCTTCTGCACGAAATGCATCAAGCAAGTCATCCAGACCCAAAACA AGTGTCCCACTTGTAGGAAGAGGTTGAAGATGAGCAATTTCCACCGGATT TACCTTCCTGACATTGCCGACTAAGGTGAGCCCCTTCAACTTCCTGACAT ATGCATGATTGAATACCACTGCAGGGGTTACTCCCACAATGGCCCATATG AGAATAAGACCCTGTTGTCTTTCATATCGTCCCCTTTCTCTCACTCTCTC GTTGTTGCAATCTCTTCCTTTCTGTGGACTTTATGTATAACCGACCTCAC AAAGCAGGCCATGCTTCTTTAATTTGCGCTAATACAACATCTTAGTAGGT ATCAAATCTGAAACACAACAATCTTAAGTTGTTTCAGCTAGAACAATATA ACCAATTTGAAATGCTATGGGACTTTTTTTTTTGTCAGTAAGCCGCATGC TGTTCTGTTGTACCTTGCTGAGTCCATCTCTGATAAGCAATACCTGATGC CTATTGTTTTGTTAGTGCATTTTCTTCAAAAAAAAAAAAAAACTGATCTG TTTTTTTCTTGTCTGAACCAGGCTATAATGGAGGAACGGAGATCGGTTAC GTTGATGTATAACCACGGATTTTGTGCATGGAAGCTCTCAAAATTCCATA TACCATGGAGCGATAGAGAAAACCTTCAAAAACTGTGACTTCGTACGTAG CGTGCTAGTGAAATGCATCCAGCAGTTGATCTAGAGCTATTTCAGTCTGT CTAATTTCTAGTGTTCATGAGCGGACAGGCTGCTCATGTGTAGTTTGATC CGACCCTGTAAGTAAATTTGCAAAACCACAATGTGAGGTTTGAAGGATAA AAGGGCGTCCATCTATAAAGCTCGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.