Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA021470

[Submit comment/correction]

Sequence	AA021470
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA021470
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	TATGGATCCGAGGAAGTAGTACAAAATAATATCGCCGGTGAGCTACTCCA TTGATCTCAAAAAACAACAACCCCTATGTTTCGGCCCAAAGTAAACCTGT AATTTCCAGCCCAGTCAAGCCCTAGAAAACAACCTGGAATTCTTGGCGAG GACCGACGAGCGACCACACCTGGAGACCTAAACCAAACGGGACGGAGGAG AGGGGAGGGGAGCGGAGGTCCCGCGTGCGCGAGCGCGAGCGCGAGCGCGA TGGCGGCGTCGCTGGGGCGGCTCAGATCCGCCATCTACGACAAGGAGGAG AGGAAGACGTGCGTGCGCATCCTTCCCTCTCTATTTACCTCCAGTCTCCC CAGTTTCTTCCGCTGTTTTGCTCTCCTTCTCCTGCGCTTGTGCGGCACAA AATTCGATTTGCTTAGATGATGATACCGTTGCGACACATCAGTTTAGCCA TAGTTTATATGCTCAACTTTGCTGTTAGACCATATGTTCATCATTAGAGG CAGTGAGCTTCTTTGCTTTTGATATTTTAAGGCTAACCGGCCTCTTGGAT TGGGTGGATGCAGGCAGTACCAGTCGCACATCCGGGGGCTTAATGCGTAC GATCGCCATAAGAAGTTCATGAATGACTATGGTAATAGTTTATTACGATT AACTTCGTTTCGCGGCTAAAGAATTTTGTGGCTGTGTTGTTGATTGGCTC GGCGAGGCTAAGGTCGTATTTCTCTGACGGTGGGCAAAATTGGCTGGGGG AGAGGCTAAGGTCGTATTTCTCTTGAGGATGGACAAAATAGTAGAGATAG AATTGTAGCAGGATAAATGAACTGTGATGTTAGGAAAACCTAATTAAATG TAGTAGCATCATCACAATGCTCTAAGCAAAAGGGAACACGATAAACTTTT GATTTGCAACTTCATCAAGTTCCAGTTGTGTTGTTACACTAAATGGCACA TGTACAGATGTGCACATTACTACGTTCTCAAATTGACTCTGGGAGTTGGT TGCTGTTTGTAAATACAGGTTATATGCGCTCTGTATGTAAATTGAGTGCA ATCGTTTATAAATAACTCCCTCAGCCGAGGAAGATTCAAGATACTCTCTT GAAAGCTTCTCCGGGAGGAATGGGAGGTTCTGTCACGGGAGAACTCTGAG CTCAGGACAGCCTGCAAGCTCCAACTTCTTCAAACAGGCATTAGCTACAT TCTTGTATACAAGGCTTACCTTTCTGCATTGTAGCAGCTTTTGTTGCTGC TGCTGTTGTATCTTCTTGGACAAAGGATTGCTCCTCCCAGTTAAGTCATA TCATTGATGACCAACCAACACAGCCTGGGGAATGCAAAGGCCCACAATTT CAGATCATTTTCTCCAGTTATTATTTCTAGATATCTCATGTTGGGTAGCT GCTGAGCTTTTCGATCACACATTATTTGCAGTTCATCAAGTTCAAAATTT ACTGAAGACAAATGGGTGCCGTCATTCCAAGTGAAATACCTTCCACCAAA GGACCCCCCAACATGTAGATCCTCCAGGTTATCTGGAGGAATTAACTGCT GAAGGACCTTTTTTCACTATAACTAGCATCTGCATCTGGCTTAATAGTAC CTATTTGTCTTGAGTTAAATTGGATCTCACCAATTGTAAATCATATGCAT TCCATCAATTAGGAAGCTACTCAACTTGAGCTATATTTAAATAGTTGGAC CAACTACAGTTACCATGATTGGATCCCGATTTATTGGCTGCTGACCTGTA CCAATTTCTCCAAGATTGAATGGTTGGTCATCGATTATATGCCTAACTGA GAGGAGTGATCCTTTGTTGAAGAAGATGCAATACCGGTAGCAACGGAAGG TAGACCTGTTTGAAGTATTTGAGCTTGTCGGCTGCCCTGAGCAGAGATGT TCCATAGCAACTTGGACAGGAGGTCACCAGTTTGAAATTTTCTGTGCAAG AAGAACAAGCTGCTTGGCGATGTCAGAGAACCTCATGTTCCTCTCTGAGA AGCTTCACTCCAAAGTTGTCAAGTTCTTGAGAGAGGTCTCAAACCTTTCT CAACCGAGGGCTGTTTATACTTCTATAAATGATTGCAGCACAATAAATTG GTAGCACTTATAATTCATAGAGATCTCCCCTTAGAGAGGTCACAGAATTG ACCTTCTACAGAGAAAACAAAACAAGGATAGCCGCCTATAATGAGCTATT TATTTTCGTCTTCTTATTTTCCAGAAACTACCGAATAGTACTTTTGTCAG GATAAGTGGCAGCACTTATAGATGTACTCGTCATGATGCTCATAGATTGT TGTGGCAGGCTACTTTGCGCTTTATAATTAATTAACATAACTAATTAGCT GAACTTTGATGTAATTGAGTAGCCACCACACTTTGTAATCTGCTTGATGT AATCATTAGCCAGATAGATGGTGGTGCAGCCTGCTTTAGGAATACCTTAA TTTCTTCTATTAGCTCAGCAGAATAAAAAATTTCCACAACTGCTGATGCC TGATGCAATCACATGATTTCCCTTCTCTCTTGAAAAGGAAACCGGGACTG TGGCTTATAATGAGTCTTTATTTGCTTTGTCTTGGTTTCCAAAAGCAACT GAATGATGAACAGTCCCCTCTACTGTAGAAAGAATTGGGGGCTACCGTCA TCCATACATAGATTATGGATATTTATATACTAGATGTTACTTGCCACCTA CCTTGATGTGGAGCAGATCCTAGTTTGCCATCTTTTTCACTTGGAAATTA TTGTCCTGGTTCTCAGTCTAATGAACAATGTTGATATTTGACTGGCAGTC TATTTATTAACTTGACTGTGGACATTCTGGAACTGTTAACCAATACAAAC AAAGTGCCTCTGATTTTTTGGGGTTCTTCAGCAATCGGTTTTGCTGGTGG CAGGCATAATGAATTCCTAACGGTTGAATACAAATAGAAGACTTTGTTGT ACAATATATAAATAGAGAACAACGAAAATGGATTTACATGTAGAAAGTAG TGAAATAAGGGACATACAACCACCCTCGTTGTAGAAAGATTTGGGTACCA CACTTATCTTTACAAATTTACTCTTTCAGCGACTGACTTTATTATATTTG TTGATATGGAACTATAGATGACATCTTTTCTTTATGATGCATGTTAGATG TTAACACTCAAAAAATTTAATATGTTCAACAGTTCAGTTTTATGGCCATG GGAAGAATGTGGATAACAGTTTACCAATCAGAACTGATAAAGATACACTG AGAGAAGGATACAGGTAATATCCATCAGTGTCCAGTCTCCATTGTTAAGC ATTCATAATAAAATATGTACCAGTGGTTTGTTGAACACTCACTAATCTGC TCTTGAATTTTGTAAAAGATTCATTGTTTCTGACGAAGATGATGTGGACT CTACCTGGGGGAAGAGGCTGGTTAAACGTTACTATGACAAGCTTTTCAAG GAGTATCCTTTTAAGTAGATGTGATATTTAAATTGTTTTATTGTCTGGGA AATGCTAATATGTGACATATTTGCTTATATTTTTTTGTACAGTCACATGT TCGGCTATGTGTGGAAGAGCCTTATATCAAACAAGTTTCTCACATCTGCA TCTTTATCTGATAGCGTAATTAGCTCAACTTTACAACAATACTAGATATC AGACAAGTTTCTCATATCTGCAAATCTTTATCTGACAGCCTAATTAGCTC AACTTTACAACAATACTAGTTGTAAGCGTAAGAGTCTGGTTATATATGTT GGAATAACCGCACAAGGCATATGAATACATTGTTATGCCAATATAATATA TCTATTATTTATATTTATCTGCCGTAGCAATATATATTTTGTGGTTTCTC CCAACAGTACATCATGCCCTCCTTAAAAAAAAGTTTCGCAAGGCTCATTT ACAAAAGAATACTGTTCACGTGAATACTGCATGACTGCATAGAGTTTTTA ATTTTCTTGTATTTTATTGATGTCTAATTGGACAGCCATATGTTAATCTA AAATTACTGTCTCTGAAGTTCTGAACTCCTATTTTTGAAAATGGGAACAT GAAGCACGAAGAAATTATGACTTCGGTGTTGATTGTGTTCCATATTCACC ACTAAAAATCTTTCTCATAAATTTGTTGCCCCTGTTTATCAGGAGTACGC AGTCCTTGCATGCATTGACGTTGTCTTTGATGTGTGATCTACTATTCTTG TAATGTTATTAACCTTAGGTTTATTCTGCCTAGAATACTTAACTTGATAT AGATATTGCATTGCTGACATGTCCCAGTATAAAAAAGGCAAGGTATGGTG CTATGATTCATAGCCATATGTGCTAATCATTCATGTCTTTTTACTGGGTA TGATACTCTTTTTCTGTATTTCTCCTAGTTGCTCTTGTGTGCCATGAACA AGATAGTTACTCTTATTACTCAGTATGATACTCTTTTTCTGTAATTTCTG TCAAATATGATTTGGATTCTATAAGTATCTTCATCAAAAGGAAAGAACAA TATCCAACCAATTATGATATTCTTTGTCATTTATTCCATATTCATAAGAT TGCATTGGGTGTGCCTGTACAGCATTATTGAGTTAAGTTCAATGTTTTGG GGTCATAGAACTGCACAGGGAACTTTGCTTACTAGCACATCCATGTTTTC ATTACATAGGTCTGGCGAGCACACACATGGACACATAGATATCCAACTTG TTTTTTTAGTTGAAATCATCTTGTTTGTCCTTAGTAAATAGAAATGAACT GAAAATACTCATTTTGTTGTTGAAATTATTTGTGTTATCCTTGGAAATGA ATTGCAAAGTCTAAGTATCTTATTTTGTGCAGATTGGATTGAGATGGAGA ACAGAAAAGGAGGTGATATCTGGGAAAGGTATCCCCTTCATATTCTCATC TTTAAGATTCCATGTACAAGGATCAAGCTGAAAAATGTGACTGAAATTTA AACTTACATGTATTTATCTATCTATTGAGTATTAATAAACCATCTGGAAC CTAGCAGAGGAAATGTGAGAAATTTTAAGTAGATTTACCCAAGCTGACAG ATTCTTCCGTTTAAATTATTAGATGGCTGGACCATTTTTTTAGATGTACC TCTTGACATGCACCTTATATCTTGCACCAAACAGACTTTGAAATAGGATA GAGCTGAATTTCTCTGTCAGAGATGCCCATTCTCTTAAGGGGATTTTCTA TACATGGTTTGTCACTTCTTTATCAACATCATATAAATTTCTTACTGATG TCCGGCAATTGCTTTTACTCAGGGCAATTTATCTGCGGCAATAGGAAGTG CGATGAAAAGGTTGGGCTTGGTAGTTATGAGGTATGTTCATTTAGTCTTT TCTATCTCGTTGCTGATTCAACAATATTTTAATCCTTTTGTTCATTTATG CTTTGTTCTGTTGTATATGTATTACTTATTTATTTCCTTTTTTCAGGTGA ACTTTTCTTATGTCGAAGCAGGGGAGCAGAAACAAGCACTTGTGAAGTTG GTAGCTTGCAAGGGGTTAGCTACTCCATATTACACTTGTGAACCCAGTCT TTATCCACTATATATTGATTACTTAGCTTGATTGCTGTACATTATGAAAG ATGTGCAGAAAAGCTTGCTCATAAGAGGCAAAAGGAGAAAGAAAAGGAAA AAGAGCTTTCCGGTGAAGAGGAACTGGATCTGAAAGGAAGAGACAAGAGA AAGAGGTACATCTAGTTCCTGTCCAACCTCTGTATTGTATTATCTGATGG TATTTCACATGCCTGTTCACACTGTAGAGAGCATGACGACGAAAGTGAAG ATACCACGGAAGATGAATCGGCCGAGAAACGTAGGAGAAAGAAAAAAGGT AGAGCCGATTGGATTACCTCTTTTTAAGGCGACATACAATGCTTGTAGTA CTTGAAACAGTAGATCACGGTGTGTGTTTATGAATTATAAAATGCTATTA GCATGTAGTTGTAGTTCACTGAAACCTATTTCGCTGTTGGGCCTATTGTT CTGTACACAATACACATAGATGCTAATCTGGGTGTTTTTCCTGGGTGCAC GCCCTGCTGGTTATACAGTCTCAGGTTAGTGAGAGCAGCCGGTGGGCACA TTACATAGTGTTATTATCTTATGCTATGATGCCTTTATCAGTTGGTCTGT TAGTCGGCTTTCATATTTGCTGTCTGCATGTTAAATATTTGCATATGTTG GTTGGTAGAAGGAAATAATAAAACATGAATCCTCTCCATTCTATATCTAA CGATTTGCGAAATCCTGTAGACCGCAAAGGAGCTTCGAAGATGAAAGTGG GCAAGAAAGATGACGACTTTGAGGAGTTTCTTGAAGGCATGTTCCCGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.