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GrainGenes Sequence Report: AA002372

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Sequence
AA002372
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002372
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGGCACCCGGGAGCTGTCGCTGCCGTGCCAATTCGAGCTCCTCCTCGG
CAAAAGGTGACTGGGACTCGTCACCCTAACCCTACATCTTTCCCTCCGCC
GCGCTTCTAATCATTCCATTTGCTGCTTGTGCAGACCGCGACCGCTGGCC
GCTGGAGGCCAGGTTCATCGAGGGACCCACCACGGCAACTTACACGCTTA
GGGTTTAGGAATATCGGTGATTTACTCCTCCCAGATGTCGATTTCGTGTC
ATTTGCGCTGGAACGCTGGGGCTTAATTCCTCGGGTTCCTGGGGCAATTT
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CACTGTACTATCTATCCTTATAGTCTATGGAACTTCTCTCAGGATATGTA
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TGCATAATTAGTATGATCTGCGAGTTCCATTCACCATTTTCCTCACAAAT
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TCAGTTCTCTCTTTTGCTAGATGTTTGCTACGTTCTCAAATTGTTCCCAC
CTGTACTCAAGGGCATTATTGGTTGGTGACTAACCATGACACGCCAAAAG
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TCCCTTGGTAACGGCTGTAGAGAAGGGCTTCACTGAAGCTATCAAGTGCT
TGCTGGAAGCTGGCTCAAATCCAAATGTTCCTGACAAGGTCAGAATGCTC
ATTTTGTCATATATTTTTGTGTCTTGCTTGGCTTTGTAGTGATATGCAAC
AACTATATGAGTTATAGTACACGTACATGAATCTATATGTAATGTAAAAA
TAAAAGGCTGTGCTAAGTTACCTTTCTTGCATAAGCGTGCCACTGTTTTG
CCTTTCCCCTCTGTGCAAGCTCTTTGTTATTGGTCAGATAGTGAATCAGT
AGACTTGTCTTATACTGATATGTGATGGCTGTACGAGTTATGATATAAGT
GCACCTACATGATGATATCTGTAGTATAAAAATAAAAGGCTGTGCTAAGT
TAACTTTTCTGTATAAGCTTGTTACAGTTTCACCCTTTCTCCTTTATGCC
ATCTCTTTGTTAATTTGTCCAGATAGTGAATCAATATGGTTTGCATGGAG
AGTGTCAAGAACATTGCTTATTTCCCCATGTGGAATATATCCTTGTAAAG
CTTTCCTTGTTCGTTAACAGTTTTTAAGATTACCAATAGAGTTGGCTGCT
GAGTATGGTGCCCGGGAAGCCACTGAGGTTCTCTTTCTTTTCACCTCTTC
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TTGATGTTTAACTAAAACTTCATAGATCAATAACTCGTCAAATGCACATG
TGTTTTCTTGCATCTGCTTAGCTATTTAAGATTTGTTTCTGAACTTATCA
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ACAGTTTCTTGTCTTTCTCCTTGAGGAACTGTTAACCAGTACATTGTACA
TGTTATATTGGTACCTGTAATCATCTGTACTCGTAGTCTTTAGGCTAGTC
CTGTTCCCTAGGATCCACCACGGCGACATCCACACATCAAGAGTAAGGGC
CACCCGCACCTCCCTCTCTCTTTCCGGTGTCAGTTCGCCGTGCAGGTTCC
GATCTGGCTGCGGAGTACCGACGTCAGTCCACTCGGTGTTCAGTTTGTCA
TGCAGGTTCTGATCTGGCAGCGGAGTACCGGCGATTTCTTGCTTCCGGAT
GTCGATTTCGTGTGTGATTCCCCAGGTTGGAACGCTGGGGCTTAATTCCT
CGGGTTCTTGGGGGAATTTTCTCGTCACAATTAAATGGGGGATTTCTGGT
AGCTCTTTAGAAGGACCGGTGCCGATTACTTCCTGATTTGGGGTGGAAGT
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TCTCCTTTGTGTGAACTTCAGAGTTTGCAAAGGAGCTGGATGTGCACTGG
CACAGGATCCCAGTGACAGTGGCCAACACGACCTACATGGGCATGGACAC
ATTACACGCCGCCCCAGGCAGTGGCAGGCTGCCCGCCTACCAGTACCTCG
TCGAGGAGGTCAAGATGGACATCAACAAGCCTGACACCTCTCAGGGTAAT
TGTTCGTTCATGCCTTTCTTATCCTAAAATATTGTTTTATGACTTGATCA
TCATCAGCTTTAACTCGGCTGTTTGTGCAATGTGTGTGTCGATCCTGTTG
CTAGATTATTCACCTGTGGAGCATGCCGTTACCTACAGCAACCTTCCTGC
TGTCAGGTACCTTCTTGATCATGGCACCGATCTGCATCAACAACATTCAG
GAAACATAACTCTTCATTCAGCTGCAGCTCATGGTATAAACAGAACGATC
TTCCCTTCATTGTTACGTTCCTCTGCCCCAAGAGGCCAAGACTATGCCTT
AGGTTCATGCCCAGGTTGCCTTGCTCCCTTGTTTTGTGGTGGACTTTTTT
CTGCTTGAGAATTATTTTGTGTTATACAGATCATGCATGTAGCATGATAT
TTTAGATTGGAGAGCCTTTAGCTGAATCTGGAGGGAATTCCATTGCGATA
TATATAAGTTGATTTATTTTACCAAGAGCCAAACCAACCTAATATAGCGA
TTTGTTTTATGAAACTCTAAACATAGCTGCATATTAGTTTGAATTTTCTG
CTCGCATATGTGTAAAAAGTCAATGTGCCATCGTGCTGCGACAAATCTAT
TTCGGCACTGTACTATTTATCCTTATAGTCTGTGGAGCTCCTCTCAAGAT
ATCTACTTCATATGTTATTTTGTTTTAGCCGTTGAAACTAGTATCCCAAG
AAATGCCTGCTTACTTAGTATGATATGCAAGTTGCGTGGGATACCTACTT
TATGCACTATTTTCCTCACAGATGTTCTTCATTTTGTATGATTAACTGAT
TCTTATGGTAATTCCTTCCATGCACCTGTCAGGGAAATGTGAACCAACAA
AGATGCTTCCCACCAATAGTTATTGAAACTTTGTTGCACAAAAACGTTTT
TGTTCATATACTGTTCATAGTGGTATGACCTTCATCTTTTTTTTCCTTTT
TCAGGGCGCTCCGAATTAGTAAAGTATCTTCTCTCCGGAGGAGTGGTTGT
TGATGTACTATGAATTATTGGGACACCACTCCTCTTGCTGCTCATGAAGG
ATATGCTACTATTGACGTGAAGATACTTTTGCAGCACAATGCAGATGTAT
GTTTAAATCTTTATTGATCTGTTGGCATTCAACTTCAATTTTTCTTTTGC
TAGCTTTTTGCTATGTTTTTAAATTGTTCCCACCTGTATTTGAGTTTGAG
GGCATTATCGGTTGGTGATGACTATGCCATGCCAAAAGTTACGGACATGT
GACTAGGTTGGTTGTACGTTTGGTTCACAGCCACACTTGTGGCAAGAATC
CTTTCCTACAGCTTAGGTCCCATGTGTCACTGTCTCACAAACTGAGTGAT
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AGCTGTTAATATGTTAGCCACATGAGGCATGCTAGGACCGGTGATCCACA
CAACAATTCTAAGGAATCAGGGCAACAAAGGGACATATCTTCGTAAGCTA
ACTCTTAGAAAAAGGGACATATTTTGGCATGAAAATGAAGTTCTTCATTT
ATTTTTCCAGCCAACAAGGGTACCAGTGTGCTTGGACCCATAGACATGGC
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ATCATCTATTTATATCGCAGTAGGAATTTAGATTTCTGTAAACTGATGTT
TGATTTAGTCATCTTTGTATTAACAACTAGATAACTGTATGATTGGCTTG
TCTTCTATACTTGCATCAGATAGACTGGAGCTAATGTGAGTGGTGCTGGT
CCTTGTTATGATCCCTTGGTATTGGCTGCGGAGAAGGGATAAACTGAAGC
TATCAAGTGCTTGTTGTAAGCTGGCGCAAATCCAAATGTTCTTGACAAGG
TCAGAATGCTCATTTTGTCACATATTCTTGTGTCTTGCTTGGCTTTGTAG
TGATATGATCAACTATATGAGCTATGCAAGTACACCTACATGATGCTATC
TGTAATATAAAAATAAAACAGTGCTAAGTCACCTTTCTTGCATAAGCTTG
CTACTGTTTCTGTTGTGGCTGCTTGGAGCTTCGGAGGTGATACGGGTGTG
ACACAGGGGGACGAGTTCGTCCTCTGCGTTTAGGCACCGTTGCCGGGGAT
TCGATAGGATAGCAGGGGTTAGGGTTTGAGAGAACTCAGAAGGATCGGGA
AGAGAAAATAGAAGATACGGGATTGTTATTGCTTGATTCCCAATTACATG
AGACGGCATGCTTATATATGCATTGCCTTGCTACAGTTTAATTCAACTAG
GACTCAGAGCCAGAGGTCTAATCTAACTTGGATTCTATCTGTTAGATGTA
CATATCTGTATATTGTATTTTTCCCATATGTTAGGGGACTTCCTACATAT
TTGCCCTGTACCTGTAATATATATTGTGGCCTTTGGTCTCAGAGGAATAC
AACTTGTCTATTCCTAAATGGTATCAGAGCTGGTTTTAGGGTTCCCATGC
CCACCGGTCCTCTGCTTGTGACCGCCGCCGCCGTCAGCTCGCCCTGGCCA
CCGCCGGTTCCCGTTCTGGCCGCTTGCGTGGTGGTCCTCGTCCTGCTCAT
CTCTCCCCAGTGGTCCTCTGCTTGGCCGCTCGTCCCCAGATCGATCTCTC
AGATCAGATCGAGCTTATGGCCATCACCTCCTGCTACCTAAATCCTCCGC
TGGACGCCACCTCCTGCTGTGGCCCGCCACCTGCTGTCCTTCCCGACGGG
GCCCCCTCTGCCCGCCACCCCCTGCCCGCCACCTGCTGCTATACCAGGGA
CGGGCCACCCCTGCCCGCCTGCGCACCGACGGGCCACCTCCGCAGCGCCT
GCGCACCGACGGGCCACCCTCTGCACCGATCCGCCGCCACCACAGCGTCC
GCACACTCCGCCTCGCCACAGCGTCTCCCCGCCCGCGTCAGATCTTCTTC
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CTGGCGGCTTGAATTGCGCTTCCCCGCCCCTTAGGCGCTGCCTTTTCTCT
CGGCTGGCTGGAATTTCGCCGGCCTCTGCCTGCAGCTGCCGTTGACCAGA
TTTGCTTCAAAAAAAGAGAGAGAGAAAGATGTCTTCTGCATCGGGCTATG
TTGCGATTCCTCGCTGCCCGGTGATCTTCGATGGCGCGAATTATCCTGAT
TTCGCTGCCTTTATGCGCGTTCACATGCGCGGTCTCCGTCTTTGGGGCGT
GCTCTCCGGCGAGGTCCCCTATCCGTCGTGATCCCCTGCTCCTGTGGCTC
CTCTTCCGCCTACGCCGATTGTTCTCGGCGCTGATGCTTCTCAGGAGGCC
AAGGATGCTGCTCAGAGTGCTGATGATAGTGCTGCTGCTGCTTATGACCT
AAAGCTCAAGCAGTACTCTGCTGATCTCGAGTCCTATTGCCACGCTCTGA
CTGCCTACACTCAGTGGGTCGATGAGGATGCTCGTGCTGCTGCTGTTCTC
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TGTTGTCGCTCAGTGGGCACATCTTCGTCAGCGCTATCAGCCGTCTGGAG
ATGCTCTTTACCTGTATGTGGTTTGCCAGGAGCATGCTCTTCAGCAGGGT
GATTCCACTATTGATGAGTTCTATACTCAGAGTGCTGCTATCTGGCGTCA
GCTTGATTCTCTCCGTACTGCTGTTTGTGGCACATGCTCGTGCTGCCAGA
TTGTGCGCTCGGATTTGGAGTTTCACCGCATTTATGAGTTTCTGTCTCGG
CTCTGCCAGGAGTTTGAGCCCCGGCGTGCTCAGCTCAATGCTCGTGGTCG
TGTTCCGCTCTCTGAGGTGTTGTCTGAGCTTCTTGCGGTTCCGTCTCTGA
CCCGTCTCCGTGGTGCTGGTCTTCTTGCGGTTCCGTCTGTGTTTGCTACT
CGTGGTCCTCCTATGCCGTCTGCTCCCTCGACTTACCTCATCAATATTCA
GCCTTCTGCCGCTCTGCAGGGTGGTATCCCTCTTGAACGCCTATCTGGAT
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TTCATTGCTCCTCACGAACGCACCAACTGACCGCTCAGTCTGTTGAGTGT
GTCTTCCTTGGATACAGTGATGAGCATAAGGGCTATCGCTGTTGGGACCC
CGTTGGTCGTCGGATGCGTATCTCTCGTGATGTTACTTTTGATGAGACAC
GTCATTTCTATCCTCGTCCCACGCTGGTACCTACCCGGTGGAAGATATCT
CTTTTCTTCTCTTTCCTGACACACCTCCTTCTACTCCTATTATGTCTTCT
TCAGGATCTCCTTCCCCTGATGTCTTTTCTTCGACACCGTCCTCCTCTGC
TCCGTCTAGTTCTCCTAGTTCTCCTCGTTCTCCGGAGTCTTCCTCTGCTA
TTCCTTCTTCTTCATCGTCGTCTCCTGAGTCGTCTTCCTCTGATGAGCTT
CCCTCTACTCGTCCTATTCGTCAGCGTCGTGCCCCCAACCGTTACTCTCC
TAGTCAGTATGGTCTTTCTGTTGCCTCCGAGCCGACTTCTTATCGGGATG
CTGAGCATCATCCTGAATGGCAGCTAGCCATGGCTGAGGAGATTGCTGCG
CTTGAGCGCACTGGCACCTGGGATCTTGTTTCTCCCCCTCCCGGTGTTCG
TCCTATCACGTGTAAGTGGGTCTATAAGATTAAGACCCGCTCTGGTGGAT
CTCTTGAGCGCTATAAAGCACGTCTTGTGGCTCGTGGTTTTCAGCAGGAG
CATGGTCGTGACTATGATGAGACCTTTGCTCCTGTGGCTCATATGACCAC
TGTGCGTACTCTTCTTGCGGTTGCTTCTGTTCGTCACTGGTATGTGTCCC
AACTTGATGTTCAGAACGCCTTTCTCAATGGTGAGTTGAGTGAGGAGGTT
TATATGCAGCCTCCTCCTGGGTATTCTGTTTTCGAGGGGATGGTTTGTCG
TATTCGACGTTCTCTTTATGGCCTCAAACAGGCCCCTCGTGCCTGGTTTG
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CCTTTGTTAAGGCTCGTCTTCGTGATCAGTTTCTTATGACTGATCTTGGT
CCTCTTCGATACTTTCTTGGGATTGAGGTTTCCTCCACTTCTGATGACTT
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TTGGGGATGAGCGCACTGTTGAGACCCCTATGGAGCTTAATGTTAAGCTT
CAACCTACTGATGGTGATCCTCTTCCTGATCCGACGCGTTATCGTCATCT
TGTTGGGAGCCTTGTTTATCTTGCTGTCACTCGTCCTGACATCTCTTATC
CTGTTCATATTCCGAGTCAGTTTGTTTCTGCTCCTACCACTGTTCACTAT
AGTCATCTTCTCCGTGTTCTTCGTTATCTTCGTGGTACGATCACTCGTCG
CTTTTTCTTTCCTCGTTCCAGCTCCCTTCAGCTCCAGTGCTATTCGGACG
CTACGTGGGCGAGTGATCCTTCGGATCGCCGTTCCCTTTCTACTTACTGT
GTGTTTCTTGGTGGTTCGCTCATTGCTTGGAAGACGAAGAAACAGACAGC
GGTTTTCCGTTCGAGTGTTGAGGCTGAGCTACGTGCTATGGCCTTGTTGA
CTGCTGAGGTGACCTGGTTACGGTGGTTACTTGCGGATTTTGGGGTCTCT
ATTACCACACCCACTCTGGTTTTGTCTGACAGTACAGGTGTTATTTGTGT
CGCACGTGATCCGGTCAAGCATGAGCTTACCAAGCATATTGGTGTTGATG
TTTTCTGTACACGTGCTCAGGTGCAGGCTCATGTTGTTGCGCTTCAGTAT
ATACCTTCAGATTTACAGTTGGCGGATTTCTTTACGAAGGCACAGACCAG
AGCTTACTCTCCAAACTCAGTGTTGTGGATCCACCATGAGTTTGAGAAGG
GGTGTTAGATGTACATATCTGTATATTGTATTTTCCCCATATGTTAGGGG
GCTTCCTGCATATTTGCCCTGTACCTGTAATATATATTGTGGCCTTTGGC
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TACTCCCTCTCTGGAGAAACAGCTCGTCTTCGAGCTGGACATCCGGATAA
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GAGTCACTTTAGCCGGAGTAGGTATTTCCCTGCCATGGGAAAGTGGAGGC
AATTCTGGAGTAGCTGTAGGTGGTTCCCAATGAAACTTCTTGAGAAGACC
GACATGAAACACATCATGAATACGAGCAGATGCTGGGAGCTGGAGCCGAT
AAGCAACATCACCAATTCGTTCCAGAATCTGAAATGGACCGTAAAACTTG
GGTGCTTGGAGCTTTGGAGGTGATACAGGTGTGACACAGGGGGACGAGTT
TGTCCTCTGCGTTTAGGCGCCGTTGCCTGGGATTCGATAGGATAGCAGGG
GTTAGGGTTTGAGAGAACTCAGAGGGATCGGGAAGAGCAAATAGAAGATA
CGGGATTGTTATTGCTTGATTCCCAATTACATGAGACATCATGCTTATAT
ATGCATTTCCTTGGTACAGTTTAATTCAACTAGGACTCAGAGGTCTAATC
TAACTTGGATTCTATCTTCCTATTATGGGTCATGTACTTCTGCAGTTGCC
ATATCTGACTCTAACTCCTCCCTTACGGCAGCTGTGCTTCATTGCCTTCT
CCTTCGATATGCCTGACCCCAATATACGTCCACATCAGTTTCACCTTTCC
CCCTTTGTGCCCTCCCTTTGTTAATTTGGTCAGATGGTGAATCAATGACT
GTCTTATACTGGTATTCAACGACCTTAAAAACACCTACAAGATGCTATCT
GTAGTATAAAAACAAAAGGCTGTGCTAAGTGTACTTTTCTGGATAAGCTT
GTTACAGTTTCACCATTTCTCCTTTATGCCACCTCTTTGTTATATTGGTC
AGATAGTGAATCCATAGACTTGTCCTATATTGATATGCAACGACTGTACT
GAGTTATGATGTAATTATACTTACATGATGCTTTCTGTAGTATAAAATAA
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CCCTCAACAGTTTGTTGCTGAGTATGGTACACAGGAAGACGTTGGGGACC
TTGCCAATTTCAAGTGTAACAAATTGGAGCATCGACGGAATCATTAGTCA
TGTGAAGATGGAAATCAAGCAATTTGAGGTATGTCACTGTAGCAAATTTT
CTTGCACAGTAACGGCAGTTTTGGTCCATGTTAACTCTCTAAGCAATGTT
GGCATCGACGATTAACTAAACCTTTATAGATCAAGACCTGTACAAGAATA
GTTTCCTATTCCAGACTCATTAAATGCATATGTATTTCGTTGCATCTGCT
TGCTGTCCAGGATTTGGTCCTGAAAAGTCGTCTTAACTGAATGATGATTT
TTTGGATAATATATTTTGCTCAAAGGGCAGTCCAATTAATCTAATTTTAT
TAAAAATAATAGGTGTAACAATTAATTTCTTGAAGAGCCCTCTTCATTTC
CCGTGTGTATATCATGTGCGAACTGGGATTTTAAAATATTGAATTGATGA
AGACTGTTTCATGTACTCATTCACTTAACCTTGACATTTTTGCTAGAGTA
CTCTTGCACCCTGACACAGACCAGACCTCTTAATATATAGAAACAGGAGT
CTTTGCTGGCTTCACATGGGTAATGGGGAAAGGGCGTTTGATGATGCACA
CGAATGCGCAGAGATTTGCCCAAACCGGGCATGGGCACACTATCTGCTAG
GCGCAGCCTTTATGTTTACGAAGGCGCGATAGAACCATCAATAATGTTGC
TTGTTTCATGTCTGTTATTTGGTACCCAAAAATGTGCTTGCCTTTCTTTA
GGATTATAGTGGTGCATACCAGTCTCTCTCGCATGCTTTAGAGCTGGACC
CTGAAAGTGAGGTGGTCGAGAAATTATTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.