Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA037972

[Submit comment/correction]

Sequence	AA037972
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA037972
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GCGAAAGTCATCACGGTCTCACACCCGTTGGCCGCGGAAGTTCCAGGCCC GACGCCGGCCGATCTGCCGATGTAGGGTCCTGATCGGCACCCTGACGTTC GTTCGGCCTGGCCTGCGACTGCGAGCACACCACTGACGGAGCACCGGAAC ACGTCGGCCTGGGGGATATGGTCACAGCGGGCTGCTGGGCCACGGCCGAG CTCCCTTTCTTTTACCTCCCCCTAATTAACAGACCACGCGAGGTTCCTCC AAAAAGAAAAAGAAAAAAAAGGACCACGCGAGAGAAATTCTATCTTTTTC TTCCTGTCTCGTCCTCTCGTGCTGCGGCGGCAGCGGCCGGAGCTAGGACA GCGGCGGCGGCGGCCCCTCCACCCAGGTAGCTCCTCTCTCTCCATATCTC CCTTGCAACGGCGCGCGGCGCGCGTGTGTGCGCTTTGGGGCGGCGGCCTG AGGGCGTTAGCGGAGGTGGCCTGAGCTCACAGGGCAGCAGCGCCTCCCTA GTCCCTCCTGCTCTGAACGCAATTTCCCCTCTGCACTTTGCTCAGTTTTC TCTCCTCCCATTGCAGGAGCACGACCAGGAGCAGCAAGTTTTCGTATTTG ATTATTATGCTCCCCTGCAGGGTCACACGCTAGAACAGGGAGAGCCTGGA AAAATGGCGTCCGCCCTTCTCCCGATCTTATCGCCGCCGGTTTCACGTGC CGCCACCTTCCTCCTCCGAACCCCACCAATACCCTTCCGCTCCTCTCGCT ATCCTCTTCTCCGCAGCCTCCTGGCCTCATCTTCTTCCCCATCTTCTCCT ACTCCCCGCTCCCTCGCCACCATGGCCTCCAATGCTACCCCCACCCGCCG GGACCTCCTCATGCTCGGCATCGAGACCAGTTGCGACGACACCGCCGCCG CCGTGGTACGCATGACTCATTTGTTGCCCCCTTTATGTCCAGTCGCTTCT ATTTGTGGTCGAACCTTCTAGGTTTTATGCTTAATGCCTGGCTCTATGAT GCTTTCGGTCCGTTGCAGGTTAGAGGCGACGGGGAGATTCTTAGCCAAGC AATTGCTTCCCAAGTAAGGATTTGCATTTCGGTTCACGTTCTCTCCAGAT TTTCCATGTCTAATTCTATTGCGGTCAGGATTTTTTCGCAAATGTAGCAT CATTTACACATTGCTGATCGTACTGTCGTGTGTTTGGAAGTCAGATTTGC TTGTGAAATGGGGCGGTGTCTCTCCTAAGATGGCGGAGGAAGCTCATGCC CTTGCAATTGATCAGGTTTGTCTTCCTTTAAGAAGATGGATCACTTTAGT TCTTCTGCGTCTGTGCTAATAGTTTGCTATGTCTTTGTCTTGCAGGTTGT TCAGAAAGCACTCGATGATGCAAATGTGTCAGAGAGCGATCTTTCTGCTG TGGCCGTGACGGTTGGACCAGGACTTAGTCTATGCCTTAGAGGTTCCCTT CTTTTGCTATTCTGATCTTGATTAAAACAAATACGAATTGCTGAGGTTTA CCATTACATGCTACTAAAATAGGGAAATGTCTGATTGTTAGTTACCAAAT TCAACTCTATTTGCACAAAAGAAAAATATAAATTTGTAAGTAACGCACAT AGGATACCCTTATCAATTAGGTTTTAGGCGTGGTGAGAGTGGTCCAAATG AGTTAAATCCAACAAGAACGAAGAATCTTGTTATTCACTTAGATAACTGT TTTGGAGAATTTAGTGCTAACTTTCTTGAAGTGTGCATGTTGTGTCAAAT GTTATCATATGGATTTTTTTTTCAGGGAAATGTTTTCATATGGCTTGTGA TTTGCCTAGGATGAATAATGGTAGAGTGTGTGATTATCACGATTTGGAAA GCCAATTTTTGTTGCTTCCATGACCTATATGTTTTACACTGTGTGTACAA GGGCCTACTTAAGCTTCATCTGTCGGATGTGATCTTCATTTTCTTTCTTT GTGGTATTTAAGTCAAAGTTTTAGGTGTAGTGCATTTTTATCACTAGCCT GTCAGCCCTTTAGCTTTCCTTGTAACTCCTTACATGCAGACAGTCTACTC TTCTGCCAAGTTGGTCTTTAGTAACTATCTGATTTCTCGCGTACTGAACT GACATATTACATAGGAAAAGGTACATTTTTTGGTTCCTCAACTCTATACC GGATAACGTCGTCCCTCGAATGTCTAAACTGTCTAGATCCCTTGCCAAAC TGAAAGGGATTTCGTAACAATGACTTGGCTGTGGTTTCACTAACGTGACA GTTCAATCAGCAAAAAATATATAAAAGAAATTCCTGAAAGTTTATTAAAT ATTTTAGAAATTTTTAAAATGCATAACGTTCATAAATATTCTGGAAAAAA ACCTAGTATTTGACAAAATTCAAAAGCATTTTTCTGTTTTCCGTCTTTAA AATTCTCATATTTTCGGTAAATATTCATTGTTTTATTAATCTCCTGGTGT TTTTTAGAAGTTTCCAAATAATATCTGTAAAAAGTTAATCTGCTTTCTCT GATTTTAATTTTTATCTGAGGTTCCAAAATATCTTCAATTTTATTCCACC AAAATTTCCCCCAAAGTTTTGTGCTGAATGGGCTACCATGTTTGCGAAAC AGCACGACATCATTATCAAAACCGCTTTCGGTGGGGCAAGGGAGACAAAT TGGAAACAGTTTCGAATACTTGAGGTTGAGGGACCAAGCTTATCATGTAT AGAGTTGTAGGACAAAAACTGGACTCATCCTATACTACTTCCAATCCTAA ATAAGTGTCACTTTTTTGAACTAGAGCTAGTTCAAAACAGTCACACTTAT TTAGGATCGGAGGGAGTACTATTTACTTACCCACTAAATCAGAATTGGTC ATGTTGTTTTCTTTTTTTGAGCAATGCTGAGTGGACCACTGCGTCTTCAG TTTTATGTGGGAACACCCTTGAACCCGGAAGCATACCATCTTATTGTTTG TTCTACTGTTTTGTGAGTGCAAGACTTTGGTTAAAGCTTGTAATTAAGTT TAACTTTTTCTAATGTTTTTTGTATGTGAGTGTAATGACCTCTCTATTGC AGTTGGTGTTCAGAAAGCTCGAAAAATAGCTAAAGTATTTGGCTTGCCCA TTGTTGGAGTTCACCATATGGAGGCACATGCATTAGTTTCCAGGTAATCA CTGGAAGTCTGACATCTTTTTTCAAGAAAAAGCAAAAAACCTCTGCATTT TATTTCATTGGAAAAGTAGAAGTTTGGTTTATTTAAATGATGCACAAGTT ATTTGATGAGTTCAACATCACACAGAATAAGCTATAGAGGATTTTTTTTC GTTTGAGGACACAAGATTAGATGCTTTCATGCATTTTTTATCAGATCCAC AAAGTGTTTATTTGTGTGTATCTGCTTTTATAAACTATTTGCGCATCCTA CACTATGTTTCCCCCTTATAATAGCTATGGACTTATCGAGACATTGAACT AGGTTAGCAAAACCTGTGAAAACTGAACTACTTTTAGTGATATGATCTTC AAAGATTGAACTAAATTCTACTCTATAAAAACAGCATACATGTCTCCCCA TGCTTCTAGCGATATTGCATTCACTGAATTATGGATTAATGTGGTTTGAT CCTTGTCAGGCTAGTGAAAAAGGACCTCGATTACCCTTTTTTGGCTCTTC TAATATCAGGTATGTGCTAATTACAGTACTATGTCTCAGCATTCTATACT GTGATCTAGCTTAATCATCTGTGATTCAATATAAGCTTACAGTTGTAAAT TATGATAGAAATAATGCCATAGAAGATATGAGTTCATTCTTTTCCTGCCT GTTGGAGTCTAAAGCCAGCTATCATAGAAATGTGATAAATATTTTCACTC ATATAAATTGAACTTCCATCCACTATTTCTGAGTTTTGTACTTAAAATAA TGTAATGCAAAAGTTCTGCAGCCTAAGTTCATGCATGATATGTCCTAATG TAGCAGATATGCTCACTCTGATACTGACACTGTCACAATTGTGTTTGCTG AATTTTCTTTATGACGTTGTGCTAACTAGTCAATATGTTCAGGAGGACAC AATCTTCTCGTTCTTGCTCAGAACCTTGGTGAGTATGTTCAACTGGGGAC TACAATAGACGATGCAATTGGCGAGGCATATGACAAGTCAGCAAGATGGC TGGGTCTTGATATACGGAAAGGTGGTGGGCCTGCTCTTGAAGAGCTTGCC CTAGAAGGTGATCCAAACTCTATTAATTTCAGAGTAAGTTTGTAGGTGTA TTTTTTTCCACAACAGCTGTGGAGCTAAATTGTGTCTACTTAACATGAAT CTTAGTCTAACATGATATTCTTACTTATCGTTTTCTATACGTCAAGGTTC CGATGCGACAACACAAAGATTGCAATTTCTCTTATGCTGGTCTCAAGACT CAAGTTCGATTGGCTATTGAATCCAGAAATATGTATGTATATGCCATCCC TTTTAGTTGCACTGTTTGTTTACTCTTCTTCATAAGATGAACACACCTGC TGGTGTCTTCAATAGAACCTCGCCTTTTGCCATTTACTATACTGTTTATT CCTTGTTTATGCGTCCTTGTAATTCATTCATTTTGACATTACACCTCAGG TTGACAAAGATAACTTCATTTGTAACTCTCAATAGTAATACATGTATTTC TCAGTTAACTCTTATTCACGTACACTGATCTGCGGTGGAAATGTTTGCTA AGCAAGATTTACATTTTATTGGAACTGGGAATCTTTTCGTGCTAATAATG CCATACATATGTGGTACTCCCTCTGATCCATAATAAGTGTCGCTGATTTA GTACAAGAGTAGCATTCTTTTGGACCAAATAACAACAATACTGGTGGGGA GAGTGATGTAACTGACGCTTAAAACATTGTAGAATATTTTGTTACTGAAA TCATCTTACATCTTTCAAGCAGTTGACAGTTTGACACAGTTAATTTATTG AATACATTATGCCTTGATACACTGAACATTTCCAACGTGCCCACATACGA AGTAAGCTAAAAAGTTAACCAAATATATCAGTTTGTTTCAAACAAATGAG GTATAAATGCCTTAATGTATTTATCGCCGAATGAAGAAATCTGCTTCACT TAAAGTTGGGTGGGTGTTCAGCTATCCTGTGATTATTAGTTAACTGTGCT GCCGTTTTTACACCGTTGTAGGTGCACAGATGATATCCCCATTTCATCCG CCACAGAAGAAGACAGACAACTAAGGGCAGACATTGCTGCCTCTTTCCAG GTTCAGTATCATGGATTTGGTCCTCATTATCTATTAGGACTCTTGTAAGT TTCTGATATTTTAATATTTTCAGCGAATTGCTGTTCTACATTTGGAGGAT AGATGTCAGCGAGCAGTCGAATGGGCATTGAAGTTGGAACCTTCGATTAA AAACTTTGTAATCCAGATATCTTGTTCCTGTTAAATTCAATTACCTTCCT TAATTCATCCAGCGCGTTAATCGATTCAATTGTTAAAGGTTGTTTCAGGT GGTGTTGCATCAAACCAGTATGTTAGGGCCCGCTTGAATCACATTGCTGA GAAAAATGGCCTACAGCTCGTATGCCCTCCCCCAAGTCTTTGTACTGACA ATGGTAATGAGTTTGTTGTTTTGAGCTATAGTTAATAATGTTCAATCATA CTGCCAGTAAAAGCATCTAATATGCAAGATCTATTTTGATGCAACTCAGC ACAGTTCTTTGTTTTTCAGTCCAGACCCTAGGTTGTATCCCCTTTTTGTT TTGAAGCATGTGACTGAATTATCCTTGACCATTTGTGCTATTTTTTCTTT CAGTTCTTCATGTAATTGTGATAACTATCATATAATTCTATAGAACTAGT AAGATATGCTATGTTCCTTTATTTGCGTAGGTGTCATGATTGCTTGGACT GGAATTGAGCACTTTGTTGCTGGTAGATTTGAAGATCCACCTCCTGCTGA TGAGTCGGATGATATGCAGGTAACCTAACCAAACAGTATGCACAGCTGAT AGAATCAACTGCATACTGGATTAGTTCAAAAAATAAGTGTGCAAAGTAAC TGATTAAATTGCACTAGAGGGAGTTTCATTATGTTTTTTGATAGCATTAT TCTGTTTCTCATTTTAAGCTCTAAGAGTTTTTACATCACATTATTTGGTG GTCTTGTTAATTTTGATCTACAATCAGCTCATTGTCAAGCTTAATATTTC TTGGATAAAAATATTTGGTATGTCCATAAAGAATGTAAATAGAGAATTAA TGCTAATCGCATCATCATCAAAGTTTGAAGATTTAAAATAAAGCACGACA AATCCTTGAACTTGGTTTGAATAGTGTTTGATAAACTTAGGGTCTTAGTA GTAGAAAAACAAACAAGTGAATTTGCATGATTGTTGAAGCCTGGTCATTT AATTTAGCGACTATGAGCACCTGGCTTTCTAGTTACCTGGGAATGGTAGG CACATGCACATCTGAATCAGCCTGAAAAGTGTGTTGCACTGGGTATTAAA AACCTGGTGCGGAACTTGCAGGTTTTATTCTGGCTGTTTTGCTAGTTCCT CCCTGACCAGTTTCTTGTTTGCTGCAGTATGACTTGCGACCAAGATGGCC TCTTGGTGAGGAATATTCAGAAGGAAGAAGTGTTTCGCGATCACTTAAGA CCGCTAGGATCCATCCATCACTTACATCCATGACACAGAGCGCTCTCCGC AACTAGTTTGGTCAGATCATCGATCTTCGCTGCTTTGCTGCCATTGAGTT CCACATCATTCCTCTTTTGGGGCCATTACATGGAGATTGCCTTTATTTGT CATTGCAGAATTGCAGTAATTAGCTGCAAAGACGATTGAGCTCACTAGCT AGCAGTTCATTATACTTCTTAGAAGCTATAAATTAGCCCTGTTCATA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.