Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA042786

[Submit comment/correction]

Sequence	AA042786
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA042786
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCCACTTCCAGGTGGACCCGAACACCAGCACAGGCACCCTACGCATCGCG CACGCACACAGGAGGCTCCTCCACCAATCAGAGGAGCAACCATCCCCAGT CCAGTAGTCCCACCCAGTCGTCTCGTCTCCTCTCCACCCCGAGTTCCGAC TCGTCTCGCTCCTTTCGGCCGCCGGTCTCTCCGCCGTCCGCGCGAGGGGA TCGCTGGCACAGGATGGCGGCGGCGCCGGCGTCGGGATCGTCCCGTGCGG TGGGTTCAGCGCCCAGGGTAGGGCTGGTGTACGACGACCGGATGTGCGCG CACGCGACGCCGGATGGGGACTATCACCCGGAGAATCCCGAGCGGCTGCG GGCCATCTGGCGCAAGCTCGCCGCCGAGGGCGTGGCTTCAAGGTACGCGC CTCCCGCGACTTCCTGAGCGAGAATAGCATGATTTTGTGTGGGGATCGGC GAGGAGGCGTTCGTATGTGCCTTTTTCGCGTACGATTCCATCGAATCGCC GGAGAGGCGAGGTCCTCGTGCGCTTTGGTTTGGCTTAATTAATTTACTCC TTTACGACTGTATCCATGTCAATTTCGATCTACTTGACATTGTATTAGTG ATTAGTATCCATGATTTTAACTGTCTGCTTAGGTCTTGATTATTTGAAGT GTCCTAAGGGTCTTGACTCGAAGTGTGTACCGTGTGGTTGCTATATTAAT ATTAGCGGGCGAAAGTCTGTTTCGATGAGGATAGGAGAATAGAGAAGCTT TATACTAGTGGTTCAAACGTTCATGTACTGTACCGCTGGATAAATAGAGT CCTAGATTTGCACAATTTTGGCTAGCCAAGGTCTTGCTAGTGTACAGTAA CTTGGATGCTAGTATACTATTTTTAACTTTAAACATTAGCATTATAACTT AAGTTCTGTGCATTACTTTGATTAGCTTAACTGCATGCTTCAAAAGGTCC CGCGGCTGTAGTGTGACATAATTTTCTTCAGGTGTTTGGTCATGAAGGCG AAGGAAGCCAAGGAAAAATATATAGCCTCTGTCCACACCAAGAACCATGT AAAGCTGATGAAGAATATCAGCTCCAAGGAATATGATTCCCGTCGAAATA GGACTGCTAACAAATTCAATTCCATTTATTTCAATGAGGGCTCCTCAGAG TCTGCTTTCCTTGCAGCTGGTTCTGTTATAGAGGTAATTTGCAATGTACA TTTCCCGCTTGTGTATATGCATTTTCTAGTGTAGTACAACAATTTTGGCT CCATCAATCCTGTTTGCTGACAAAATGACTTGTTTGGGAAGTAGGTTTCT GAGAAGGTGGCGGCTGGTGAGTTGAATTCCGCTATTGCTCTAGTCAGACC TCCAGGCCACCATGCTGAACATAATGAGGCAATGGGATTTTGTCTCTTCA ATAATGTGGCTGTTGGAGCTAATTACCTCTTAAATGAGAGGGTGTGTAGT TGAAATATCCTTGCTGATTTTTCTCTTAAAGATCAGTATGTGCTACTCTT GTTCATCATTTCCTTTTTGTTGCAGCCTGACTTAGGTATCAAAAAGATAT TAATCGTCGATTGGGATGTTCATCACGGAAATGGCACACAGAAAATGTTT TATAGTGACCCCCGTGTATTGTTCTTTTCAGTTCACAGGTATGGCAGAGC ACCTTGACACTGATTTGGTAGTTTTGTTTAGGTTTCACCATATGATATTT GTGAAGTCATGCTAGTTCTGTTCCCTTCATTTTCAAGGTTTACAGCTCTT TGAATGGTTGTAGCGCGTGTAACACGTTTTGTAACACTAAATACTCGCTG TAGCAAACTCACTTGTATAAGACTAAGCTGGCCTCGCTGTAGTGCTGTTG GATGTTTTATATGTAACGATTGACATTAAGTCCCCACGTACCACCAATCC ACCTTTATTTACATTATATGTTCTTTAGGATATGAAGAAGATCAAATCAA AAAATTTGTCACTTCTAGAGTATCTATGCAAGTGATGCACTGCTTGTTGA TTCAATCGGGCTGTATAATACAATATAAATGCTTGAGCCTAGTTTGTTAG TAATGTGCAAAGGAACCTATTAGGTATTAACCCAATAAATACTTTGTCAG TGGAAGGATCTATAAATGATAACCCTATGTTGTTGCATGGTTTTAAAGGC GTCGCCTAGGCGACGCTTAGGCGTCCAGGCGCTCCTCCTCCGCCTTGAAA AAATGGGCGCCTTAGGCGTCCAAAGTGCCCGCCTAGGCGTCAGAGCGCCC CTGCATCGCCTTATGACGCCTTAACGCCTTAAAAACCATGTGTTGTTGGC TTATTCAATTTTCTGTTTCATCATGCTCATTTACCGTTATACTTTCTAGA TCAACACTAATAATACTGGATCGGCTTTATCTGTTCCAATCACCATAGTA TTTTACTTTCTTAGTCATTTGAGTATATTATATTAATCAGTTCATATCTG TTACTTATTATTTGCTAGCTAAGTCTCCATGCAACTGCAGGGCTATATAT ATTACAATGCCTGCTTATGTTAGAAAACAGTGTTGTTTGTAATGCATCTC CAATCAATTCTGAGAATGCAAAACCTCAAACGTATACGTCATTCCATTTC ATGCTTATAGAAGCCAACTTTTCTGGCCCGTGTCATGTGGTATTCTCTTC ATGCTTCAGTAATGTGTAACTTATATGTTACTCCAATGTTTGCTCTGTAG ATTTGAATATGGAAGCTTCTACCCTTCTCAAGGGGATGGATCTCACTGTT TCATTGGGGAAGGAGCTGGTCAAGGGTACAACATTAATGTGCCCTGGGAG CATGCTGGATGTGGTGATGCAGATTATGTTGCTGTATGGGACCATGTACT GCTTCCTGTCGCAGAAGCATTTGATCCTGATATAATATTATTGTCTGCTG GGTTTGATGCAGGTAGACAAGTTAGAAATTCCTAGAAGTTACCTTGTCCC TTGAGTTTAAACATCTAATTAAATCTAGGCACTTCTCATGAAGCTTGACT GCTGATGTATCTGACAGCCTGTAGTTTATTTCTGTGAGCTAGATGTGCAG TGCTTAGACTAGTACACCTCATATAATTGATTTACATGTTGCATAACATA TGAGATCTTAACTGAAGATATTTTGACAATCTCCTGGACTTGTATTATAT TATGCTACCGTTACATGCCAATACTCCTGATTCATACACTTGTTACTCGT TTGAATTTCTTTTCCCTCACTTTCTTGGTAGCAAAGGGCGATCCTCTTGG TGGTTGCTGCATCACTCCAGATGGATATGCACTGCTGCTAACAAAGGTAT GTACTTGCAGGATTGCAGCAAAATGACCTTTTATTCAACTAAACTCACCA CACTACACACTCTCCTGTACTTAAAGAAAAATTGAACATGCTCGATCCTG GAGTCCAGATTTTCTGGAGTAATGTTTATCTCCTGTGACAACCATTTCTC TTTGTTTTCATGCTTTGGTATCACCTGTTAGAAAATTTCCATTTGATCTC GTCAATTTCTTAATATCTCCTGTCTCCTATGTGTCTCTTGGACATTCTAC TCGGTTGATCTAAGCTTATTCTTATGCCTCTTTCCTGCAGTTGTTAGGTT TTGCAAAAGGAAGGATTGTAATGGCTCTTGAAGGAGGTTATAACCTTAAG TCCATAGCAAACTCAGTTTGTGCTTGTGCAAGGGTTTTGTTGGGAGATAA GTTCACATTCAACGATCCAGAGATGCAACCATTTGAAGCTACGTGGAGAG TTATGGAAATGGTAATAGTCTGCACTATACTATTTCTCTCTAATTCTATC TCCCTATGGATACATGTAATTATGTTTTCATTCCTCCACACACTGACCAG GTACGCGATGAATTAAAGACATACTGGCCTGTTCTGAGCAGTAAGCTTCC GGAGAATGTACCTTTGAGGAGTACGCCCTCACATATCGAGGTAATTTTTC TCTTCTAGTTTTTTTCTTTCTTGGAGACTTTGAGTTGGGGCCTGCTTGGT CTAACCTCTAACTAATGAATTGTGCCGATATGTACGAGATGTGGATCACG TTGTTCCAGACCAAGTTATGTTTTCTGGGAAACTTGGCATCCTCTTTTAC TTTCTACAGACATGTCATATCAATAGTTGCAGCTCTCAAACCACATTTTA ATGGAAAATTATTTTTTGTTCCAGGATTTTAATGAAGTACCATAATGTAG CCCAATTCCATAGATGAATGCTTGTTCATGACTCATGAGTAATGTGGACT GTGTTACAACTCAGTTGATAGGCTATTTCCATATTATCCGCAGACAGCCC ATACTCGATGAATCTCTCTTTGTTGGTATTGATAAATGTGTCGTGTATAC ATATTCTTATGTTCTGAGATGCCTATCAAGTCTTAACTCTTGCAAAAACA CAGAGTTATACAGCTCAACTATATTCATATTTTGCATCTTTAATTGTCTT GTGCCACCAGTCTCGTGTTTGATTTACCATTTATGCGGCTCGATGCATGG AGGCTTATGTATAGCTGAGACGATTTATAGGGGATAGTTGGAGCCCTTGA ATAATTTATCTTCCTTGTTTTCCCCATTGGGGAATGAACAGCCGTATGCT TCCTCTGGTTCTGAGTCTGATGTTGAAGATGTTGATGAGCTTCCTGATGC TGTTTCCTCTGTCAATATTATTCAACTTGTTGATGATGGTTTAAGTGAAC GCATCACAATGTTGAAACTTGACCAAGAGAACCTTGCAACAAAGAAAACC TCAAGTTGCACAACAGTTGAACGAAGTCCAGCTAATTCAACTTGGAGATC AGCATTGTCAAAAGTTAATGTTTGGTATGCCAGTTTTGGTTCCAACATGT GGAAACCAAGGTTCTTGTGCTACATTGAAGGTGGGAAGGTAAAGTTGAAA ACACATTGTCTCATATATCTTGCAAGGAACATTAGGTCCCTCTATTGGAA TTTTGTAGCCTGACACTGCATTAATCACATCCACGATTTCTCGGGGAGAT TTCATTCGGTACATCACTTTGGAAAAATAGTTTATGATACTCAAATCACT TAAGGAGGGTACTAATGAACCTTTTGCACAAATCGGGAATAAATATTTCT CTACCCGTACGTTAGTCTTCTACACGATGGTGGATCAGTTTAATTGGAAA AAACCGTTGCTGCCCAGAATGATGGCTGCTCATGCTTGCTCCACGACGGT CTAACAAACATGCTCTGCCCCATGGCTCTTCATCTCTTCCCCGCTGCTCC TCTTAGTTGTTTTCATCTAGCACTGAGCCACAATCGTCGTCATGATTATC GGTGTCTGAATGTAAAACTTCACGAACATTGGCTGAAGCAATGACGGAAG AAATTATACTCTGCAGCTCCTTTCTGTATCTTCACTCCTGCCTCTGGCAT ATGGGGAGCACGTCGTGATGGAAGGAGATGAAGATAGGGGTGACACGGGG TTGGCCTGAATGCGGGCTGCATGGGGCCGTGGATTGCACCATGCTGACTA ATTCCACCACTTGAAACCGACTATTTATTACTCTATGGCGTAATGACTTG TTCTAATCCCCACCACTGATCCACACGAATTGTGTGAAGTTTCCTGAATG GTTGTACCAAAGAAACCTTCTTTTGGGATATTTTGGTCGGAGGGAAGTGT TTTAGTGCTTTCCACAAACGTGAAATGCATAAGCGCGTTCTTATTAGTTA TGATCATTAATGCAGTATTTTCTTTTGGCTTATTATAACCCTTGGTTTTC TTTTTCTGGTAAGCCGTATGCTTTGTCTGAAAGATTGTTATTTATTTTGA TCTGTTGCAGGTTGATGGTATGAGTATATCATGTTCTGGTTCACAGGACA CAAGCCCACCGCAAGGTACCATGTGGAAGACTGTGCCTCATAGATTGTTC TTTGGGAGATCCTCTACCCCCTGCTGGGGCACCGGTGGTGTTGCTTTCCT CAGCCCTGAGATAAACTACAATGATAAGTCATACATCTGCATGTACAAAA TAACGTATGTATACTGTAACCACATTTACGTTTATTGATCCTTGAATCAG GGCTGGTGCTCACATGATCTTTCAAAAGTGCTATGATTCCATCATAAATT TCCTCTTTTTGACAGGCTTGAGCAGTTCAATGACGTGTTGTTTCAAGAGA ACCGTTTAGTGAAGGATAACAGTGAAGATGGGAAAATCGAGTCTCCGGGC TCTCCTTTGATTGCTTTGCCAGAAATGGAGTCCATCTCTTCAAACAAAGC TCTTCATCTTGAACCTATTAAGGTTGGGTTTGCTTCTTTCCATATCGACA GGCATACTCTAATCTTCTGCATACGATTTTCTATATGATTATTATCGAGA ATAGATAATATTGCATCTCTGAAAAAAAAAGCTCTTAGATGTGACTGTCC TTGTGGCACTTTGATAAGGGCACTACCAACCTCTTCCATGGCTATCACTC TTCCAGATGAACTCTTAAATTCAGAGGCTAATGCCTGCTGTTAATGGTGG GCCCTTTGGTAAGGAAATGCCATTTCCTTTTGCCTCTTTGGTCTGACAGG TTCATCTGAACTTAGAAGATTTAAGCGCCTATATCACCTGGGACCTGATG GCTTATTCAGATTGCAATTTGGACTGTTGTCATAGATTTGTAACCCTTTT GAACTAACTGCGGCAGCTAAAAGTCTCGTATCAACACATTACAAACTAAA AGAAAATCTAACATTTTCTTCGCATGAATGGACACATTTCTAATGGCACT TCATTCATGGCCATATAGCTGACACTAGTTAGCTTTAAAAATAAATCTGA CACTACTGATGTTTAATTTCAGCCGATCATTTTCTGCAACTTATTAGTTT TATACATTCTGGAATATTATTCATGTTCGATATACAAACCTCCTGCAGGA TAGCTGGTACTCCAATGTACTTTATCTCGGAGAGGAGGATGGCCTTCCAA TTCTAACAATGACGTAAGTTCCAGTCTTCTCTTGGTAATTTCCTTTAGAT ACTATCCGATGCATGCTTGAAGGGAAGTGGCAAGAGAAGGCCCATACACA TATCAACAACTTTTCGTGGATAGTGTAAACTCTTTTTTTTTCAATGCAGA TGCCCTGCAACAGATGTAGCACGACACAAATCCGGCGAGCTGCCGTTAGC TCCTCCATCTGAGACCTACTCCGCCACTCTGATCAAGGGGATCGTGGAAG GGAAGCAGCTGGACACGAACGAAGCTGCCAATTACATCAACGCTGCCGCC ACAAGGGACCTGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.