Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA012439

[Submit comment/correction]

Sequence	AA012439
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA012439
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTTTTCCCCAGTTCGCACCTGGAATTCTCGGGGAAAAAACCAAAGTGACA GGGAGGAATCCCATTATCGCAAAAACAATTTTAGGATTTCGATTTTAGTT TTAGGCGCGGCGCGTCCCCCGATTAAAGAAAGCGAAAGAATTCGGGCGCG GCAGCACCCCCGGAAAGGCGAGCCCTCGCGCACCGTAGAAATTGGCCACC GCCAGCCATCCCATTCACGAGCAGGGCCGAGCACCACCCAGCAAAGAAGC TTCCCCCACTCTCTCCCTCCCTGGGCTCTCTTCTCCCACTGCCACTGCGC CGTGCTGCGATCCGCGATTCGGTCCGAGGAGGAGGTTCCGGTGATCGTCT CTCTGGTTTTCTTGGAGGAGCCGGAGGTACCGGGGGCGCTGGGCGGGGTC AAGGGGCGCTTGCCGGCCATGGTCGACGGGCTCTCGGATGGATTGACGCG CGGGGGGAGGGGAGGCCTGCTCCCTCTTCTTCGGTGATCGCTTCTGGGGT CCATGGCGGCGGGGTGGGCTTGGCACAGGTACTGCCGCTTCCCTCTTGAT CTTACCCCATTTCTCTTTTTCCTGTTCATTTCGCATTGCGGTAGAGGCGC CGCCGCCTCGCCTCGCCTTCCCGGACGGCGGCCGCGCACCGCCGCGCTGC CCCTGCCTTCCAGCGGCCACGTGCTTGTTCTTAAAGAGGACGCGTGTCCT CGGAGGCGAACATCTCGTATGAAATCCGTTCTATCAGTATCACGTTTGCA GTGTAAAATTTGGCCAAAACATGGCTGTCAAGATTACGCCACTCGATTTC CAGTCTAATTCCGACCAATTTACAATTATCCAGTCCTCGACTAGATTTGT CACCCTGTCCTTGTCTTGGCTGTGTGTAACCAAACACCATTAACTTTGGT TAACCCAAATCGACAAGGAGGCTCCAGTTGAGCAGCATGCGACCGCAGCT TATCCCAGCAGTGGCGCACCCCGGCCGCCTATGGTGGTGAAGGCGAAGGT GGCTTTGACTAGCAAAACATCTGGATTTTTTCCCAGCCGGCATAGTTATT TTTGGAGTGGATGAATTTTGGCCAGGGTAGGTGGTATGGGCTGTTAGGTG TTAGTTTGGTGCTTTCTTTTTTTGCCGGTTTTAGGAGAACAGAATTAGCA CGGAAGGTGCTGTTTTGATCTTATTTGTTTGGCAGGCTTATCCACAGATG GGTTGTCTTTTAGCTGTTTTCGATCAACTATGGTGCGCAATTTGTCGTCA TCGTTGTCTTTGCTGTGAAAAGATCCAAAACTTCTGTGTCGAAAAACAAG AATCGAAGTTTGCTAACAAAAATCAGGTTCCTCAACTGATTATACCCTAT CATGTAACTAATTAAATAATATAATACATGGTTTCGATATTCCAATCTAG ATTTATTTTGTCATGCTTTAGCATGAACTTTCAGTTGTTTCATTTTCACC ACTTCTGATTTGCCCTGACCTTAAGCATTTTAATTACGTTTTGGCTAAAG AAGCAGCCCTAATATTTATTGGTGAAACAATTCCATGCCAGTTTATGTAT GCAACTTTTACTGATGTAAATTATAATCTCAGATCTCCAATTTCTGTTGA TGATTTTGTACAATGATGTCTGCTACTTGCTCTCTTGCTGTCTTGCATCT AGTTTGAGTTTATCCCCACTTTTCTTACATATAAGCTGTTGTCAATAGTA TTCTACGTATAATGGGATTTGGTTGTTTATTGCAAATGGCTAATAGTGTT GATGATCTATCTATTCTGAAACTCTATACCTTACTTGAGTATTTGAATCT TGTCCTTCGTATGTAGAATGCTTACCACTAAGCTATCTGTAGGCTGTCCT TATGTATAATTTGGCACTCATCTGTTTCTCTCTAATAAAGAAGTTGGGGG TGGCTGCCGGGTTCTTTGAAAAGCATGCTAGTGGTATTAATACATAAACA CACCATTTCGCACAAATATAATTCTTGTTAGTTGTGGATTGATCCTAGTA ACACAAATTGTCACCTTTTACATATTTGTTGGAGTAATCAGAGATGTAAT CAGCCTCTCTAGGCTTGTAAATACTCTATACGCTTTTGGCCTTTTCAATA AAACGAGATGCAACCCTTTTACGCTAAAAAAAACATATTTGTTGGAGTAA ACTTCACAGAAATGAAGCATAGTGACTCTTCTCATTTTGGGTCCAACCGG CATCTGTTTTGCTTTTACAATATTTTTAATTTATTTTTGAATAAATCATT GGTAAGATACATAGATGTTTCTAGGATATGCATAAGATATCCCATGCTTA TTAGCAGTTTAGCACTGTTGGGTGCCGAATCTTTGGAAAGCATTAGACTC GGTATGCTTTATATTATTAGATATCATATGTATCTCTACTGTCATAAGCT TGAATGTTGCAAACAAATAAACAATCATGATCCACAGTCTCTTTTTTCAC CATGGCCTGTCAAGCATTCGTTTAACTTACAACCGTGTTTATTCTTAACA CACTTCAGTCCTGGATATTACATATTGCTTCTGTAAAGTCTCATCTTCCT TTATCAGAGTATTTATTGAACTATGCAAATACATTATTACTCTATTTCTG AACCTGACATGTGTTGTTCTGTTAAGATGATGAACAGTTAGCCTAATTTC TTCTAATATGCTTGCAGGATCAGTTAATCCCTGTAGAAAAGTTGTCGGTT GCTTGCTTGATGAATGTTATCATTGGGCGGTGGTATATTCTCTGATGACT AATGACTGGTGATCATTGAAAGCGATCGAATATTTCGGCTGGGGTTTCCT CTCTGGGAATTATCTCCTGTAACAAGCATTTACTTGTTTAGGGCATATCT CCTTTGGCACTGATAGCAACCGTCCTGTAGTTCTCTTGGGCAAACCTCCT TTGGCAAAACCTACCTATAGTTCTGGGCAAATCTCCTTTGGCGAAACCTA CCTATGCTCTTCTGGGCAAATCTCCTTTGGCAAAACTACCTATAGTTCTT CTGATCTCCTTCGTCATATACTGTCAGCTTCCGATTGCTCCCTGGACAAA TCTCCTTTGGCATTAGCTTTAGATATAGGTTGCTATCTGTTTGGCACTAC CTTTAGCTTCATAGTCCTATCTGGGCAGATCTCCTTTGGCACTAAGTGTT ACTGTTTTTCTTTCCCATTTGGGCAAATCTCCTTTGGCGGTTACGGGTAC TGTATCAGGGAATTCTCCTTTGGCATTAGCACTCGAGTGTGCTGACTGTA CACATTGTTCCGAAAGTCAACCTGCTGCTCAAAGGTTGTTCTTCACTTTA TCAGATTATCACAGAACGCAGTTTGTTGCAAAAAGGTGGGCACTTATTCA ATCTAATATTTCTTTACACCTTTGTTCATTTCATATCATTCGAAAATGAC CAAATCTGGTGTTGCAGGGTTTGTAAACATGGATTTGTTTGTAAACGATT CAGACAGTGAGTCATACACTGGAACCAGTGACAGCGAGGACCAAGAAGAA TGTGAATTTACGTACAGCGACCATGCGCAGAGCATCTTATCAAGCTTGGA TGAGAGCATCGGCAAGATTGATGATTTTCTTACTTTTGAAAGAGGGTTTC TTCATGGGGACATAGTCTGCCCTATTTCTGATCCCTCAGGTCAGTTGGGC CGTGTTGTTGGGGTTGAAATGCTTGTGGACTTGGAGACAAACTCTGGTGA TACAATACAAGATGTCAACAGCAAGCAGCTTTCAAGAGTGAGATCCTTTG TCTCTGGTGACTGTGTGGTTATGGGACCATGGATTGGACGGGTGATCAGG GCATTTGACCTTGTTACCGTTGTGTTCAGTGATGGGGCAAAGTGTGAAAT GCTGTTAAGGGACTCTGAGGTACTGAAGCCTATTCCCCCAATCCGTTTTG AAGACGCACCTTATTTCTACTATCCAGGCCAACGTGTGAGGATTGTCCAT CCCTCTGTTTCCAAGTCAGGAACATGGTTGTCTGGATCATGGAGAGCCTG TCGAGATGAAGGTGTTGTGTCTCATGTTGATGTGGGGCTGGTGCATGTGA ACTGGATAACCTCGGTGACAAATGTCTGGGGTGACCGATCGTCAAGTCCT CCAAACTTTCAGGACCCAAAGAAACTCACTTTGCTGGCATGCTTCCCTTA TGCTAATTGGCAGTTGGGTGATTGGTGCACTTTCTCTGCTGGCCGTGATG GAAGTCTCGGGGTAATGGATTCTGTGAAGTCTTGTTTCCCAAGTGAAGAC CGTAAATCTTGTTCTCGATATTCTCAAACATATGTCGTTGCCAAGACAAA GAGCACTTTTGATGTTCTATGGCAAAATGGAAATATATCTCTTGGGCTAG AACCCCACAACTTGGCTCCTGTCAGCACCCCTGGTGATCATGATTTTTGG CCGGGGCAATTTGTCCTGGAGAAAATGGCAGTAGAGGAGGCTGCCGAACA CCAGCGGATTGGGATAGTGAGGAATGTGGATGCACTTGAGCGCACTGTAA ATGTGAAATGGATTGTTCCAGTGGATGACGACACTGTCAGATATGGAAGT GGCCCCACTGAGGAGACAGTGAGTGCTTATGAGCTAGTAGAGCACCCAGA TTTCTCATTTTGCACTGGTGAAGTCGTTATTAGATCAGCTCTGAACATTA ACAAGTCTGAAGCAGATCTCACCAATGGAACAATGACAGTTAGCAGGGAA AGTTTGGATACCTCCTTTGGCTTCTTATCATGCATTGGCAATGTTGTTGG GTATAAAGATGAAGGAATTGAAGTTCAGTGGGCTAGTGGTGTGGTATCCA AGGTAAGCTTATCTTTCAGTTGGATTTCTTCATTTTTTGGTTGTTGTGTT TTATTATCGCCTTTTACCGATCTTTTCTAACTACATGGTAGGTAACATAT CTTTGTCCTATGTATCAATTTCAGGCGCAACATTTTGAAATAATTGGTTT AGAGAGGCTTCTAGATAGTTCACTGGAATCAATGAATGAGGTGCATATTT CTGTTGATAACGATGCTGAGCAGGACAAAATTCACCGTGAGAGTACAAAG GTCAGCTTGTGTTTGCATCTTTCCTTTAACTCTTTGTTAGTAACATGTAG TGAAATTTAAGCAACAACTTAATGTTTTCACCCAGAATGCTCCGGAAGAA TATGCTGAAGACTGCTCTGGTTCATTGCGCAATGCTTTCATCTTCTCCAA AACAGCTTTTGATTTTCTGACAAATGCGGCTTCTAGTTTGTTTGGTGCTC ATGGTTCTACATCATCTAGCTCAGTAAGTTTTATATCTCGCTAAATAGTT TATGTTTAATATTTCACACCTCTAAGATGAAGTTGTTCTCCCAGGTTACT GCATATCCTCAGTACCAAATTGTGGAGACAGCAGAACTACATTCATCTAC AGAAGATTTTCCTGAAGAAAAACATATCATGGAGTTGGTGACACAGATTG AGAAGCCACGGTTATCTTCAGGAAATGACATAAAAAGATTTGATGTTGTG GTGGACTGTTCTGATCATCACTTTGTGAAGGAATGTGGCCATGAAAATGT AATACTTTACCTAATGCAACTTTATTTACTTATACTGAAACTGTAGTAGC TCTTGTAGTCTGCACAAATTCTTATAATCGCTAATCCTTGATATGTTAGG TTAAAAGAGGTTGGCTAAAGAAGATACAACAGGAATGGGCAATCTTACAA AATGATTTACCAGGTTTGCATCTCTTTATTTTATAGTCCATTACAAGTTT ACACATGAAACTTAATCTTGTCATTGATCCATTGGAACTAAAAATTTGGC GTATGTTTATTATAACTTGCCATTATGTTTTAGCACAATATCATAACATA ATATTAATGATCTTATATACCATCACTCAATATTTTTTTTTTGTATTGCA CATACTTGTGAATCTGTCATTATGCAAACTTATATAATTGATTTGAGGTT TTGAATAAGTTAAATGATCTAAACTCCACAGGATAGCATAACATGTCAGC AGGATGCCTTTCTCAATTTTTTTTTTGTGTTTTTATGAGATGATTGAAGT TAGAAAGGCCTAGATTATTGCAGCTGTACCATGTATATGGCATCTTGTCG GTTATTTTTTCAAGTCTGATAAGTTAATCAAGCTGTTAAACTGTCATAGA TAAAAAAAAGGAATGTCTAAACAGAACATGCAATTCTCTTGTAAGCTGTG AGAGTTCTCCACTTTATTTGCTGATAAAACTAACAAGTTCATAACATTAT ATCTATAATTATGTAAACCATAGTAAGTAGAAACTCAAAATTTAAATTAG TCACACCGTTTTGGAGAAAGTTAGTGTACATTGGCCTTTTTGTATGTTTA ATAAATCTTTCCAATGTTAGCTTTGCTTCAAAATCACTTGTATGCAAGGA GAACTTATGTAGTAAAACAAAACTCCATCGGTTAGATTTAGTAGAAAGTA TCATTTATGAAATAACTGATGGAAACATGAAACATGTTTTCTGGTACAGC ACTTACATGGTGTTCTTTGTTTCTATGCAGATGATATTCATGTTAGAGTT TATGAGGAAAGGATGGATCTTCTGAGGGCTTGCATTGTTGGGGCAGCTGG AACGCCTTACCATGATAATTTGTTCTTCTTTGATATTTTCTTCCCCCCAG ATTATCCTCATGAACCACCTGTAAGTTTTGTTTTCTGTTGCTCTTGCGTG TATCTTCCAGTTGAGATCGTCTGGCTGCTGAACAGTAACTTCCTGTTTTC CAGTCTGTGCACTATCACTCTGGAGGTCTCCGCCTGAACCCAAACTTGTA CGAATCGGGCAAAGTATGTCTAAGCCTACTCAAGACATGGGCAGGAACTG GCAATGAGGTGTGGAATCCAGAGGGCTCGACTGTTCTTCAACTGCTGCTA TCTCTTCAGGCTCTTGTTCTCAATGAGAAGCCTTACTTCAATGAGGCAGG CTATGACAAATTTGTGGGGAAAGCTGATGGAGAGAAGAACTCCATCACTT ACAATGAGAATGCATTCTTGCTGTCGTGCAAGTCCATGATGTACATTCTG CACAAACCACCAAAGGCAAGTCACCAACTCTGTAATTCTGTACTTAACAA ATAATCTGAATATCACGTTACACTTTGAAAAAACTGATAGGGCTCCACTG AGTTTTGGTAGCACTTACTAAATTATAGACCTAGATGTTGTCTACAACTT ATAATCTACTCCCTCCGTCCCAAAATAGATGTCTCAGATTTGTCAAAACT TGGATGAATCTAGACACTATTTAGTATATAGGTTCATTCAAATTTTGACA AATCTAAGACATCTATTTTAGGACGGAGGAGTATGGTACATCTTACATGC GCCCGCTAACCAACCTGTAGCTTCAAATTTGCTTACGTTCAGATGTACCT TGAGTATTAAGAAATAATGTTTGTACTGAATAATATTTGATGGACCTCTC CCCCCTTTATCTTCATCCAGCATTTTGACAAGTTTGTCAAGGAGCATTTC GCTTGCCGCGCACCGCACATCTTGGAAGCCTGTGACGCGTACCTTGGCGG CGATCTAGTCGGCCATGCCCGCGATGCCATGTATGTATCGGACGACGGCT GCAAGAACTGCTCCACCGGATTCAAGATTATGCTTGGCAAGCTACTGCCG AAGCTCGTCGCCGCCTTCTCTGGAGCCGGCATCCCCTGCAACCAGTGACT TCAGACCAGACGTGCCTCTCGCACCGTTGGCGACGACGGCACTCCACTAC GACACCGGTATTGTATAGATTTTTGAAATAAAATGCTGCCTGGTACATGA CACTTGTCACGTGTTATGTAAGCTGTAAAAACGTGTGCATGATTGCTCAA CTGGAACGGTGCCAGATGAGAGAGGCAGCTGATGTGGTTTGCTTGCACTT GGGTTTGGTTTGGTTTGTATAGTTTGACACGATACACAACATTACCCTGA GTGTGTGTGATGGAAATATGTAAATTTGTGTGTGCTCAGATTGCAAGTAC CCTGTCCCTGTATAGTTTGACAGAGAGGCTACCTGAGTACTAGTACAGTG TGATGAAACACAAACATGGGTAAAGTACTAATGTTTTGTAAATTTTCTTG TTTGTAGTTGGCTTATTATACTCTCTCCGTTCCAAATTAATTGAGGTCCT AACTTTGTTGTAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.