Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA025340

[Submit comment/correction]

Sequence
AA025340
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA025340
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAACGATCCATCCATTCCCTTTGCATAAACCCTAGCCCACCAAAACCTCT
CGTCCATCGCAACACCGGAGACCCACAGCTCCTACGGCCGTCCCCCCCTG
CAACGCACGCCGGCGATGGGCAAGGGGAAGCAGCGCGTCCGCCCCGGCGG
CGGCGGAGAAGCCCCAGCGGAAGGTGACGCTTCCGCCGCCGGAGGTGGCG
GTGCGGCCGGGGGGCACAGCCCCTCCACCGTCTTCGTCTCCAACCTGCCG
TACACCTACAAGTCTTCCGATGTAAGGACGAGCTCGTAGCGCCCCGCCTC
TGCTAAGCTAAGAGGTTACTTGGGGTTCAGCGTGTAAGTATTCCGGGTTT
TGATTTGCGGCTTGTGTTGTTGCTGTGCAGCTCGAGACGGTGTTTAGCGA
GGTCGGGCCGGTGAGGCGCTGCTTCATGGTCGCGTCAAAAGGTAAGCTAA
TGGCCGAACGAAATTGATGGCCGTATGGTGTTTACTCAGGAGTAATTTCC
CGCTGCTTATGACCAATGCCTTCTGTCTACGTGTGTATTTGTGTTTATTA
TGCAGGGTCTGACACGAGTCGAGGATTTGGGTTCGTGCAATTGTAAGTTT
CAGAACTTGTCCTTGTGTATATTTCCAGCACTCATTCTTTTCATGCAATT
TCGTGGGAATGTGATTTTCATGTGAAGCAACTAAGCGTAAGTTAATTTCT
GTGTGGATTCTCTGTTGGCTGAAACCTCAGAAACTTGCATATTGTGGTTA
GCCTAGTTATTGTTATGACTTATTATCAGCCCCCTCACAGCATTAGCCTT
ACTGAATCAACTTTCAGTAGAAGTATATTATTCACTAAGTGCCTGACCAA
TATCATCCACTGGATTTTACCTATTTGCATTCGTATTTAAATCCTAAAAT
TGGTTAGTTATTAGTTTTCCAGTAAGAAAATAAAATCATCCGTCAGACCA
ATGGATGAACCAAAACCATTTAAGCTTGGTGATGCTTAGAACTCGATCCA
TCTGCTGGTACTAGTGTATGGATTGTTCAGAGAAGAGTGTCTCTGCTGAT
AATTGCATGTGTTCAAAAGTGACCTTGACCCTGTTGCAATGTTTGACTTA
AACTGTTTTACATTGGTATCAGTGCCACTGTTCAAGATGCTGAGCGAGCT
ATTCAGCAAAAGAATGGATTTTCTGTCGCTGGTAGGAAAATCAGAGTAAA
GCTTGCCATTCAACGTGCTCCATTGAAGGAACGTTTGCATAAGAAGAAAG
AGACCGGTAATTATCAATAATTTGTTGCTTGTGAAATTCAATAGATTGGG
ATTCTGATGGTCTGTCTGTTTTTGTTTATAAGCAGTGCAAGCGGAGGACT
CAATTGCAAAAGATGATGAAGATGATAATTCTACTCCTGTAAAACAAAAG
GAAGCATCTCATAAAACAGATACAGGTTTTCTTTGAAAGTTCTATAACTA
TTTTGCACTCTTTCCACTGTTCAGTTTTCCTAGTACTTAATTTTTCTGAT
GCTAGATCTTGTGTTTAACTAGGACCACCACAATTATTGGCCAAGGATAC
TAAAGTAGCGAAGGAAGTTAGCATTACGGCCACTGATAAAGTGATAAGTT
CTGAAAAGCAAAGGTATGTACTGGAATATTTCTATATTTACAGGACAGTA
CTGCATTACCTAAAATATAACATGCCATATTTATACATTCCCATATTATT
TTAGATCTTGCCTTCTCATGCACTTGATCTTAGTTTTTTGCTCAAGGATA
TAATAGTTTTTTTACTCTGTTCCTGGTTAATTCAATGCAACTGGTAATTT
TTATCTCCCAATGATGTAGGATCGCAAAAACTGTCATATTTGGTGGTCTT
CCAGACTTTTCTACGGCTAGTGAAGTTTTCCGTCTTGCTGGAGAGATTGG
CACGGTAGTATCTGTAAATTATCCACTTCCAAAAGAGGAAATGGAGCTCC
ATGGTATGCTCTTTTTATGTTCCTCGTTTCTCTTCCACGCTCCCAACACT
CAGTTTGTACCAAGTCTTGATTGATATTACGTTGTTAACACATGATTAGT
TTTTTGAGTAAATGCTTCAACAGTAATTCGAATCTCTTCTGATTATTTTG
TAATGAGATAAGATAGGGGCCCTTAGGCCTAGCCGCCTAGTCAAGGTTAG
GTACCGCTTTACCCTGGTGGTGCAACGGCGCCGTGGCAGCAGTTGCACCA
CAGGGCCAGGGAGGAAGGAGACTAGAAGTATTTCTGTTAGGCCTTGCTTA
ATCTCAAACTACTACAAGGGACCTCCCTATGCAGAGGTGTTTTCTCTTAA
GGATCAAGAAAATTCTCTAAAAATAACAACAAATGATTAGTGCCAGCTGC
TGGCCATATTCTGCTGGGCTCTCGTTCTTAACACCTCTTCATATCTGCCT
GTTGATATGAAAGTTCAAATAATTATGATTGTGCTGAATCGGATTTTGAA
GCTGCACGCCTGCACTTCTCCAGCTAGTGTCTCAGTGAACCATAAGGCAT
TACTCTACCTCAAAACTGTGCCCCTTATGTACTCTATATGTTCTCATACA
ACTTAGCAATGTCAAATGGCCCATTCTTATGCCCATTGACCGATTTCATT
CATGTATGCTAACGAAGAACATGTCGTTTTTGTTTTGAGCTGTTCTCTAA
CTGACTCGTACCCCTAAGCACTTATATACATGTGACGATAGTTCATAACT
TCATATTTGATATTTGCACAGTGCTACCATATTTTTTGAGTGACTTGAGG
TAGGGTGTATAACTTTTGAGATCATAACCCCACTTCCAGCGGCATGGTGT
TCTTCTTGCTGAAAAGAATATTGTTGATTTTTTTCTTGTAGCTATTGGCA
CATATCTCATTTGTCCATTAAATTCTCGTTCATCTATTCCTTACTGGAAG
ATGTTTAAACTTCACCAGCGTTTGAGGTTAAAAGATAGTTGTGGCTGGCT
AAATGGAGGACATCAGTATTGCTTATCTGTTTACCCTTTTGGGGGACTTT
CTCTTTGTCAACTTAAAATATGCCTGAAAAACAAGAGTACCACAATAAAG
GTTGTAGCATTTTAGTAAGAAAATGGAAGGAATCTTGCATGCTGCAAGAC
ATGTTTGAATCTTCATTTATTTACAATTTGCTTCACCAGGCACTTAATTC
ATTTAAGACAACTATCATGTAAAGTACAGTGTTGATAGTAGAATATGTCT
GGCATCCCCTCCAGGGCTTGCACGAGATGGATGCACATCGGATGCAGCAG
CAGTACTCTTTGCAAGCGTCAAATCAGCTTGGGATTCTGTTGTTCTCTTG
CATCGTAAGGAGGTCAAAGGAGCAACCGTTTGGGCTCGTCAACTTGGCGG
AGAGGTAAGCTGTCTTCTTTGTGTTGCATTTATCTTGATATTCTGCTATC
ACGCCATTATTGGGTTTGATTGTCCTGTTCTTTTTTTGCTACCTGTTTAG
GCTATTAGTACACACTTCTTTTTTGCTACCTGTTTAAGACATTAGGTTAT
AAGTATATGCACTTCAGCATTCAGTTGTATATATTTTTTAGATTAAAATT
CAGTTGTATGTTAATGCCATGTATATGTACTTACTCTTAATTATTTAGAT
GTCATATTACACCTTGGTATAGTAATTAAAATGGTGGATGTGCGGTAAAG
AAAAATGGTTCCAAACCTTAAATTCCCATCTCAAATTCTGGTACCTTTCT
TCTGCTATGCTTTCTGGGAGTGTCTACGTCATCACACTTTTTAAGGTCTA
TCGGCTATAATTTCAGATAACTCGGTTGCAGCTTGAGAGTTTCCTGTAAG
TACATATTTAGTCATAATACCGAGCAGCCTTTTATGTTGCGCAGTAAACT
GTGGTTATAGAGTTTAACTGGTCAGGATCAAGGAGTTTTTGCTGTCACTG
CCAGTGTCTGAGTTATCTCACACTGTTTTTCTTGCTAGTCGTACAAAATG
GTTTTTTACCGTGAAGTAACCAAGCTGAAATTTTGTTGCTGTTCAGGGTT
CGAAGATCAGGAAATGGAGAGTGATAGTCAGGAACTTGCCATTCAAGGTG
CTTGGTTAAATGCTAATTCGCCTGCTCAAAACTTTTTATTGTAGAGCAGA
TAAAAGTGAAGCTATATGGGTCATTTTTACAGATTACTATAAAGGAGGTT
ATGGACATGTTCAGCTCTGAAGGATTTGTCTGGGATGTCTCCATTCCACA
AAAGTCTGATGATGGGTATGTTTTTTATCCCTTTATATTCCCTTCTTTAA
GCACCTCATAATATATGATATATCTGTTACTTCTATTATTTTTACAGGAA
ATCAAAAGGCTTCGCTTTTGTGTCTTTCACACGTAAACTGGATGCAGAAA
ATGTATGTTCAGTATTTTATTCGGTAACAGTAAATATTCATTGAAGTCCT
AATCCCACGATTTTCCTCCGAACCAGGCTATAAAAAATGTTAATGGGAAA
GCTGTTGCGAAGAGACCTGTAGCTGTCGATTGGGCTGTTCCGAAGAATGT
ATATGCTGTTGCTGCAAAGTCTGATGCTAAGGATGATGGTAAATTCGAAC
TCCTATCAGTTAACATTGTCAGTAGCTTCATTTATTCAAATGCCTGCTTC
TCGTAAAGCTAGAGTTATCTCAAAAGCTAATGCAAGATTTATACTTGCCT
GAATCTTAATGATATAGTAAACCACTATATTGTAAATCTCATGTCTTTGA
CACGTGACTAAATATCATACTGGCTCCTTGATATAGTTTCTCAGGAAACA
TGATTATATTCTTCCTTCTAAAACTAAACCAGGATGATACCATAATTGAC
GAACTATTTGCTTTAGTACACTGCATGCTATCTCACAGTGTTATCAATCA
ATGCTCTGTGTTTTATTGGTTACTATTGTGAGAGCTGTCCTTTTCATATG
TGTTCTGTACTTTCAGAGTTGGCAGGTGTCTCCGACGAGGGCAGCGATGA
TGAATCCTCTGATGATAATCTTGTTGGGGGAGATGACAGCGATGATGGTG
ATGATCTGGAGACTGCCAATCGTCTTCCTGAGGACGATTTCAAAAGCGAG
GCAGAAATTTCTAGAAAAGTTCTTGAAAATTTGATCAAGTCATCGGAGAA
GCCTGAACCATCTGGTGTTGAGGTTTCTGATATTGATACAGATTCTGAAG
CAGAAAGTGATGAGGTTTCTGATATTGATACGGATTCTGAAGCAGAAAGT
GATACATCAGAAAAGAAGAAACCCCACTCACCTGCAGCTGTCAAGTTGGC
AGAATCTAAACATGTAACGGAGGCAGAAAATACTGTTCCTCCTTCGAAAC
CTGCAACTGCCATGCCGGTAGAATCTAAACATGTATCAGAGGCAGAAGGC
ACTGTTCCTGCTTTGAAACCCAAGAAAGAAGATACTAGCCTGGATAGGAC
GATATTCATAAGCAACCTTCCTTTTGATATTAAAAATGAGGAGGTAACAG
AGCGGTTCTCATTATTTGGGAAGGTCCAATCTTTCTTCCCAGTTCTGCAT
AAACTCACAAAGTATGTTTAACCATCTCACCAGAAATACTTTATGTTGTC
CATTTCTCAACCAGTTGTATCGACAACAGAATGTTTACTTGATGCATCGT
CCAATACTTTTTGTTTCGTCTGTGCAGGAGACCTAGAGGGACTGGGTTTC
TTAAGTTTTCTACACCAGAGGCAGCTGATGCAGCAGTTTCTGCTGCTAAT
GCTGCTCCTGGATTAGGAATTTTTATTAGAAGCAGGGCACTTAATGTTAA
GAAAGCGCTAGACAAGGAGTCTGCTCACAAAAAGGAACTAGAGAAGGGAA
AGAATGAGGTCGAAGATCGGCGCAACCTGTACTTGTCCAAGGCATGTTTG
CCCGTTACCCCTTATTACCTGCACTTCGTTATGTCTATCTCTTCCATTAT
TTTCTGTTCCTGAAAGTTTAATGCGATTGCAGGAAGGTGAAATACTCCCT
GGAACGCCAGCTGCGGAAGGTGTATCAGATGTTGACATGAATAAACGTAA
TTGGTAAGAGTTAGCCATTAGCACTTGTGTCCATTATTTTATGCACCGTA
GCCACTGTGTTTATTTTGTTCTGTTGTTTTTAAAAATCTACCTGTTATGT
TCATGTTAATTGAGAATAAAGGACAGAGGAATATTGTGAGGTTTTAAATT
TACCTGAAGACAATGCTTCTTTCCCTTTTGTAGAATTTCCAAATCCATAG
ATGTATCCTTCATGCTTGCATGGCAACACATTTCTTACAAGTATCAGAAC
CTCACTTCCGGTTGTTAACTGCCTTCTGTTATCTATGAATCTTCCCAGTT
GTGTATTCGGTCAGATCCTCCTGGTGATATGCATGCAACTATAGCTCCTG
GCATGATTTGGATTTGTTCATTTTATCAATGGTGTCATGATGTCTTGTTT
ATTCTCTATTTTTGGATGTGCTTTTGTTTTCTTTTATGTATTCGCCGACC
TTCTACTCCTCCCTCGTTTATTTTAGTATGTTTGGGACTATCTTCTCAGA
TCTTGTGAATTGTCACATCTTATTACACCCTCAATCATATGTATGAAATT
TGTGAACAATGAATAAGAAATGATCGTGATTTCATCTTGCAGGTTAGCTA
AAAGGAAAGCTGAAATGCTGGTATCTCCAAAATTTCACGTCTCCAGAACA
AGGCTTATCATTTACAATTTGCCGAAGACTATGACCATTAATGATGTCAA
GAAGCTTTGCCGAGAAGCAGTAATTTCTCGTGCTACAAAGCAAAATCCTG
TCATCCGGAAGGTTTATTTGGGGTTCACAATCCAAGTTTCTGCACATTAG
TTTTTAGGTATCTTTTCGAAGCTTAGCATATGCATTTGTCTTGAGCAGGT
GAATATCCTGAATAATGAAAAGAAAGGCAAGGGTGCTGCACAGAAGCATT
CCCGTGGTGTAGCCTTTGTTGACTTTCAAGAACACGAACATGCCCTTGTG
GCTCTAAGGGTCCTAAACAACAATCCTGGTACTATTTTATACACCCACCG
CTTTTAGTAGATTGATCGAAGTCATGTTGTGGCATTCCGCTGCATTTTCT
TTCTACTCTCTGATGTAGCATGATTATCTCGAATAGCATTTTGCAGTCAG
CTGATTTACTTAGATTGGATCCTTGCGTCTTCACCTTATTCTACTGGTGA
TGTATGTCAGTGCTGCATATCTTTACCCTTCAACAATGATGAGATGTTGT
TCTTGCTGCATTTTCTTACTGCTGTTTGATGTAGTTCATTGTACATGAGA
ATAAGAACATGAAAAATAAACTGTTTGTATCTCTGACATATTCCATTTCT
AACTGACATGTTGCCTGTTGGCTTCTGCTTTTTATTTTACTATATCCTGC
TGAACACGGTATGGTTTGGTCTGTGTTATCATTTCTCATTCTTTACATCT
TTGCAGGAACTTTCGGTACAGAACGTCGTCCAATCGTGGAGTTTGCACTT
GAGGATGTTGAGAAAATGAGGCTCCAGAGGATTCGAAACGAGCGCAATGA
GAGGGCGAAAGAGGCTGCACAAGAGCGGAGGACTCTGGGAGATCAGTCCG
CAACTGACGGCCCTCGTCCAAATAAGAAAAGGCCTTTCGGAAAAGGGAGG
AAGCAAGAATCGGATGATGTACCCTCTAAATCATCAGATTCCGGCAAAGA
GCCTTCAGATGACCTGTTAGCCCCTGCAGATCCTAAACCGACTGGAAGTA
CAGAGGGAGACAAAAGGCCGCAGTTTCAAAGGCCCACAAAACGAGCACGG
CAGTCAACTAAGGGTGCCGTGGTGTCAGAGGGAAACCAAGCAGATGCAGC
CCCGAACGGAGACAAAAGGCCGCAGCCTCAAAGGCCTGCAAAACGAGCAC
GGCAGTCAAATAAGGGCGCCGTTGTGGCAGATGGAAATCAAGCAGATGCA
GCCCCAAAAGCTGTGGCGACTGTAAGTCCTATTATCAGTACTACTACTAC
ACAAATGCCCCATTGTGATGCAGTGAAGTAACTCCATGCTATATCTCTTT
TTCGTTTGATGCAGCAGAAACCTTCCGCAGCGCATGAGCAGGCGGATGCG
CGGAGAAAAAGAAGAAACGCAAACGATGGCCAGTCGGAGCAGAAGAGAGG
GAAGGCTACAAAGAGGGCGAGGAAAGAGCCCGGGGTGCAAGGAGGCGTGG
ATAAATCTCTGGTGGAGCAGTACCGCTCCAAGTTCTTGCAGCACGGCGTG
AACAAAACCAAGGATAGTTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.