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GrainGenes Sequence Report: AA023287

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Sequence
AA023287
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA023287
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTTCATACCCCTCGTCCTCTTCATTGTCATCTTCATAGGTATATGGAT
CTCCCTCAAGCATCGAGGATGCCACCAAAGGTACACAAGGCGATGATGGA
ATGTTGATTGGCGAGACAGCTACAAACTCTTCCTCGATCGGCTCTAAGGT
TTCAACATTCATTTTCTCCTCGATGATTTCTACTTATTCTCTTTCAACAT
AACTAGGCTCCTCCATAATCTCCTCTAATTAATCTTCATCTTGTTGATTT
TCTGTGTCCCACACAGGCGGTTGGCTTGGACCCGCATCATACACATCCTC
ATGACGGTCATCGTTGCTTCTTTCGATAACCGAGGGCCGCTTGTTCAAGT
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GATTTTATTGGCGAGTTCTCCACTAGCTCTTTGTATAGATCCCACTCGTT
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TTACTAACACTTGTATAATTACATCATATGTTACAATGATTCATCTAAGT
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ATTACAATTAACTAGAACATGTGCTTCACAATGTGCAAATTATTTTACAT
ACAACATTGTATAATTCATCTAAGTTGAATAATTACAATTAACTAACACT
TGTATAATTACATACAACATTTTCACAATGTATGAATTATTTTAGAAAAG
GGGGAGGGGATTTGAGAGAGGAGAGGGAAGGGGAGAGGTACCTGCGGCCG
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CTCCACGCTGGAGGGAGGCAGCCCACCGTCGACGCTGGAGCGGCCGACGG
CCTGCGTGCGTGCGTGCGTGCGGCTGGCGTGCGGGCTGGTGGAGGAGCGG
AGGAAGGTGGTCCGGAGGTGGGCGGAGGTGGAGAGAACGGAGGAGGAGCG
GCGGGAGGTGGTGCGGCCGTCCGGCGTCGCGAGGAAGGGCGGAGGCGACT
ATGGTATGACTGGATCGGGGAGAAAGGGAGACTGGTCGATTGGGTATAAC
CCTAGGGTCGGCGCCGACATAGCGGCCACGTCAGCCAGGTGCCCACCCCA
GTGGCTAGCTCGACGCCATCACCGACATATATTAGATCGGCGCTGTTTGA
AGTGGCACCGACGTGAGGGGTCAGATTCCAAATTAGTTTCGTCTGGTTGA
ACTGTTCAAATTGGTCAGATTTGTAAAAAAAAAAAAAAAACCAAATCAGC
GCGCACACCACAGAGCGGGCAACCCTACGGCAGTACGGCGGCGGCGCGCA
CACTCCACACAGCGCCGCTGCGTGGGCAACCCTAGGAGGCGGCGCGACGC
GGCAGCAAGTCAGGCGAGGCGAGGGCGAGGGCGAGCAGACGTCAGACCAG
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GGTGAGGCCAATCAGGATTCATCTCTAAGACTCTAATATAGTCTTATTCC
TCTCAATTTCTTCAGATTTCGGAGTCAGTCTAGCAGATTAGCTGTTTAGG
AGAGTACTCGACCCATGGATTTTAGCATCAATCTAGCAGATTAGCACTTA
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ATCCTAGACTATTTTGTGCTAATGCTACCAATTTGTTATAGTTCATATTG
TGCATTCCGACCTTGCCGACGCCGGCCCCTTCCACCTCGACCTCCTCCGG
CCGCCCCGACCTTCTCCGGCGACGAGTACCTGCTTCCCCGACCTCGCCCG
GCCGCCTGTCCCGCGCAACACCATCCCAAGCCGGAACTCTGCACGAGCCC
ATCACCTCGCACGTGAAAGGTGAACACCCCTGTTCGGTAACTTCAACTCC
TCGGCTCCTGCCGCCTTCTGCGCAAATGGATGGTTTGGAGCTTAATCTGA
TGCGTATTTAGTTTCTTATCAGCTTGAGTCCAGGAAGAAAGGAGGTCCAT
GGCATGTGCTGCTTACAGTATCAGGGGCCATGTCAAGCTTGCCGCGGGGC
ATGGCCCGTATGCGCTGGCCAATAATCACATGTGCGGCAGCTTGAAGCCT
TCGGTATCCTATTCTATTTCTCGGTCGTGGAGTAATATCTCTAGTACTGC
ATCTCGACACGCCGCCCACCATTCTCACTTGATTGTCGGCAACCCAGAAA
GATGGCGCTCAAGCTTGAAAGCTTCACCGGTGGATGGTACCGTCGTTGCT
GGTAAATTACTTTTTGATCGGTTGGGTGTGAATTCTTTAGGAACTGCACT
TTGAGACAAATTGCAATGCCAAAACTTCTCTTCTAGTTAATATCTGGAGA
CAGTTAAATTTGAAGTGTTACACTAGTCTTTAATATTTGTCTGTTTTGTT
ATCAGAAGGGAAGATAACTGTACTGGTCATTGGTGGTGGAGGAAGGGAGC
ATGCACTTTGTTTTGCTTTGAACCGTTCACCTTCTTGTGAGGCAGTTTTA
TGCGCCCCTGGTAATGCTGGTATTGCTCAATCTGGAGATGCGGTCTGCAT
ATCGGACTTGGACATCTCCAATGGTGATGCTGTTATATCGTTCTGCCAAA
AGAGGGGAGTGGGAATGGTGGTAGTGGGTCCTGAAGTTCCTCTTGTTGCG
GGTCTTGCGAATGACCTTGTCAAAGCTGGGATACTAACCTTTGGTCCTTC
ATCAGAGGCTGCAGCATTAGAGGGATCAAAGGATTTTATGAAGAAGTTGT
GTTATAAGTACGATATCCCGACTGCTCAGGTATTTCATTTTACATTTGTG
TTAGTACTGTAGTCTTCCAGGAACTAGGGGGTTTGGTTCCATGGGATGCC
TGCATATGGTTGATGCTATTGTTCTCCATGTTTCAGAAATACTAGTACAT
TATTTTAGGCTTAAGCATATTTCCTTCCTCCCGAGTCAATGTGCTAACCA
TGCTCATTTTGTACTGATTTGCTATTACTAGTTACAATACGCTAGAAGTA
TCGCCACAAGCTTGGACTTTCTGCTGGAATAACTCTGACTGTGACTGCAT
TATTTCTAATCATTCTTCATAGTTCTTGACATTTTCCTGAAGATAATTGC
TTTCTGAAATGATTCTGTCTTATTACTGCAGAAAGAGACTGTAAAGTTAC
TCTAGCAAAAAACTGTGAAATTGATACTCCTTTATTTTATACTTAGTTGT
AGTTTCAGATGCTAAGGCATAGAAATGAACCTAATGAGTACATCTCTGTC
TCATGTAGTATTGCACGTTCACGGATCCCGAGAAAGCTAAACAATACGTC
AAGGATCAAGGGGCCCCTATTGTTGTTAAAGCGGATGGATTGGCTGCTGG
AAAGGGTGTAGTTGTTGCTATGACTTTGGATGAGGCATTTGAAGCAATAG
ATTCTATGCTGGTTGACGATTCATTTGGTCTTGCTGGTTCACGGATCATC
ATTGAGGAGTATCTAGAGGGCGAAGAGGCCTCTTTCTTTGCATTGGTAGA
TGGTGAAAATGCTTTGCCACTTGAATCAGCACAAGATCACAAAAGAGTTG
GTGATGGTGATGTTGGCCCAAACACGGGTGGTATGGGTGCATATTCCCCT
GCTCCGATAGTGACGGAAGAACTTAAGCACACGATCATGGAAACCATAAT
TATTCCAACGGTTAAAGGTATGGCTGATGAAGGATGCGAGTTTGTTGGTG
TATTATATGCTGGGCTTATGGTAGAAAAGAAATCTGGGCTGCCTAAGCTT
ATCGAATACAATGTGCGATTCGGGGATCCTGAGTGCCAGGTTAGTGATCA
TCTGTCATCTTCCTCTTAAGATATCTATATTTCTCAATTCAAGCATTACA
AGTGTGGTTTTGTTTTCTTAGTCAATGTATGTTCAAAGTTTTCTTGATGA
AGTTGGACAAGTGATTGCAATGCCTTTGAATTCCTTTCCAACAGTGTTTG
TCCTTATGCGTAAATGAAGTTCTCTCCATAGTTCCTGTAGTGATGTCTTA
ATGAAGTTCTCATACTTTAATGATTCCCTAACGATACTCTCCTCATATAT
ATGTCTGTAACAGTTCAGTTTACTTTTAAAGGAGTCTAGTGCTTTTCCTG
GTCCATCTTCAAGTGCAGAAAAGTGAGTAGTTCCTGTAGTACAGTGGCAG
TGGTGACTCTGGGTCTCTAGGAATTGGAAAGATGCTGTGCTAGGAAAGCA
AGTTCTGATGACAAATAGGAGTGCCTAGCTGCCTATATGTAACTTAGTTG
CCCTGGCCGGCTGGCCCTGGGTCCTCCTCTTTAGAACTACTCGCCCACTC
CAACTCAACCATTTTAGCCTCTAGGGCATTGCCATGTTTATAGTTTGAGT
ATAGATGAGATAAAGTATCTGATACGTATTAGCAAAAACTAGCAAATTTC
TTAAATCATTATCATACTGTGTTTTCATAACATTTTAGTAGCATATTGTT
GTAGAATTGGAAAAAGTCCATAATTGGCCCCTTAACCTTCGGATGAAGTC
CAAATATGACCCTAAACTTTGGAAAGGTCCAAGTTTGGCCCCTAATCTGT
TTAACCCGTTCAATGTTCTCCCCTACCGCCATGAAACCACCGATCGACTA
TTCCACATCACCGGTTTAGGCTGCTAAGTGCTAACCCTCCACATAATCTG
ACCACCCTGGCAATTTAGACACGTCGGTAAACAAAGAAGACGGCAGATAC
TCCTGAAAAAAGGGCAGCTGAATCTCGGAGCGGTGAAATTTCCCCATTCT
GTTAGAACCCTTGCCTTCTCCGGCGGCATTGGCATTTGTGTTGACGCACG
ATGCGACGGTGTTGGCGGAGGCGACGCTGGATGGCGCGCCATCATCGTCG
ATGGCACGTCCAGCGCTTGCATGTGTGAACTTTGGGACTCCGTCACGGGC
TGTAGTACGCCTGCCTCGTCTGCCATGCCGACGCCGTGCGGATGCTGGTC
GACGCCACCGCCATCTGGGGCGGGCTTTCCAATCCACATTCCTGGCGTGC
CCCTCCAACAGGGTCACGTCCCTCGAGATGCTCTAGGACAGTGCTGGCAC
CAAGGCCGCTGCACTCGCCATGGCGCATTCCTCTATTTTGTGTGCACTCG
ATTTTGGTGTCGAGTCTGCGACGAATTACTTCTCGGAACTGAATCTCCTG
GGGAAGAACAGCTGCAAGGGCAGCAGCACTGTCAGCGGGAGTTCAACTGA
TGTGTGAGATGCAGTCTTGTGGATTCAGTCTTCAGTTTAGTTGCAGGCTT
GCAGCAAGTAGAAGCTACGATGTCCTGTAGAATGTGTGTTTTGACCTAGT
TGGTGCCTTAGCTAGGATGGTGTGCGTGCTCTGTAGTATGATCTCCCTGT
CTGTAATGCTACATGTAGCATCTCTGTTGTTTGGGATCTCAATGAAAACG
AGCGATCTTTGTTTTCTTATGAATGTTGCAATGCCAAAACGCACAAATTT
GTTTGGAAACATGACAGTTAACAGGAAATACACCATGACCATGAAGAATA
TTTCTGGAGTTCAATTTTCTTAGAAAGGAACTAGAAGGGATAGTCAAACA
TGTGAGTTCAAGGACGTAACTAGCATAACAAGTGACCATACTTCAGAGCA
TTGTTACATGAAATCCCCAACATGTAGAACACAAAAGGAATAATTAACTT
GACACTTCAGAAGCTGTTATGCTGCATATCTGGAATTGCTTTGGAAGTCT
TGCTTCCTCCAGGCTTGGTGTGCCTTCCACCAGGTTCTTGTACTCCTGAA
GAACCTTCTGCATTAATGGTTACTTTTGCTCCTGCACCTGCACTTGTCTT
CTGAGGCTGTCAAGTTTATAAGTAAATTGTTAGGATTTATTTATGTTGTA
CAGAATTGTACTAGAGCGAAATACACATACCATATTACAAGGGCGTGATT
GAGTTGAAAGTATGTCGTTGTTGCTTAAAACACCACCACTACCTTTTCTT
TTTCTCACAACACTTGCAGAGCTTCCCCCTGTTGTATGGATCTGCGCCAT
AATATATGTTGTAATGAAATAGGGTAGATGATTCACAGTTCACAAACTAG
ATCTAAGTAAACTTACCATATTCCGTGGTACCTTTGATTGGGTTCCACTA
CTACCAGCTTCACCACGAACACCACTACTAGCTCCACTTCCATCTCTACC
TTGAGCTCCATTACCACCTCCAGCGTGAGCACCAGGTGCATACTGACCGG
TTCCATTGATCTGATCGCATTTTCTTTTGTTGTGACCACTCCCTTGCATT
TACTGCACCTAATGACAGTCCCAACCTTGGAAACTTTTTTGGACTTTGGT
TTGTCTCCAACCTCTCTTGTCCTCCTTTTTAGGCCTCCCAGGCATCTTAA
TGTAACCTGGAGCTTTTGGTTTCGGCCTAGTTGACACTGGCCATGCAGAC
ATGCCCTCAACAGGTTCTAGCACATGGTCATATATCTTGTTGAACTCGGT
AATTTTGTAGCAATTGGCAACATATTCTTCAACTGGTATGGTATCATAAG
CAATGCACGCAATAGCATGACAACATGGTAAACCCGAGAGCTCCCAATAC
CCAAATTTTTTGTGGCAAATTCACTGTAAACCTGTGGTCAAAATGCTTAA
CCTCGTATCCATCTTTACCATTCCACACCGCATGGCAGTCTGCAGTATGT
TTATTAAATAAATTTAACTTCCTGATATTTGGGCAAATAGTGCCAACCCA
CCTTGGAGACTTTGTTCTTTGCTCCTGGATCCTAACCATGACTTGTTGCC
TAATGGTCTCTAGCATTGTAATGATTGGGAAAAATCTAGATGTTACTGTC
CAGTGATTGAATGACTCACATATGTTGTTGTTGACCGAATCACAATTACT
TCCTGCCTTGAAATAGGCTCTACTCCAATGCTCTGGGTCAGTTCTAAGGA
TGGCTTGTGCTCCATCAGGAGTTTTTAGTGCAAGTCTTGCTCTCCAATAG
TTGAAAGCATGTTGCATGATGATTTGGCAACCATCCAAAACCTTTTCTGC
CAGTCCTTGTCCTTGTAGGTCTTCTTCCAGTTTGCATATATGTGACGTGC
ACACATGCGATGCTCACATCTGGGTGCCCATTTATCCACAGCGTTCAGTA
TTCCCTTTTGTTTGTCTGAAATAATAACCCAACCATCTCCATCACCTAGG
CGAATATCTCTGAACAACAGATCACAGAACCAGTCCCATGTATCATTTGT
CTCCTTGTCTACAACAGCCCATGCTAATGGATACATCTGGTTGTTAGGTG
TTAGCATCTCGTCCAAGTGCATATAAAAGCTCCCCATTGTTAATCCCTTT
GAAGAAACAACCATCCAGTCCAATGACTTTTCTGCAACCAGCCATGAATC
CCTTTCTGAGAGCAGCAAAGCAAACATAGAACCTATTGACTTCACAGTCG
GGAACCAGCTTAACTACAACTGTGCTACCAGGATTACTCCTCAACAATTC
TTGCTGGTAGTCAAAGACTTTAGAGTACTCACCCTTAGTTGAATCATACA
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TGTAGGATTAGCTTTTATCATCTTCTCATACTTATTGGCAATCCTCAAAG
CAGTAACAAGTTTGTTATCTTTCCTTGGTGGACAAGTGTGGTTGTTGTTA
AATGTTGAGATCTGCCAGCTAGTATGCCTTGTTGTTTTGGATAGCAGGCA
ATACCATGGACAATTTTTCCAAGTGCATACAGCTCAGCATCTCTTCTTCT
CATTCTTCTTGAACCAGATGCACCTCGTCTCTACCACCCCAAGCTCTCTT
GCGGCATCTATGAACTCACCCTTGCTGCTAAAACGCATGCCAAGACTGAA
TACTGGCATTTCAGCCCGGGAATCAAACCCTTCATACATTTCCGGCCTTC
TAACAAGCTTGGTACTATTGTCTTATTCATCAAAAGAATCTTCATTATCG
CTAGTGTCATAATATGGAGTGTCGCTGCCATCATCCGATAGCGCCTCTTC
ATCTACATTATGCCTCTACTATTTTGTCGAACATCAAACGTCATGTCATC
TAGAGATGGCATTTCCATGGCATTAAACTTCTTCTTGAATTCCTTGAATT
TTCTCCTCAATTGCATGGCTTCCTCATCTTCATCAGATGCATCTATATCA
ACAGCCAGGTAGTCATCATCCTCCTCGTCAGACTCATCATCTTGACGCTG
CAGCACCTCTGCCTGCACACTGTTGTGATTATTTGTATTTTCTGTCATGC
ATGAAGTTTGTGTTGTAACATCCTGAGTTACAACGAATTCTCCGACTTAA
GGAACAATTCCTTGCTGTTGCGCCATGTTAATGGCAATAGAGTTCTGTGT
AGGAATGACCGGACCTATCACCTGCACATCACTATCATAATCCACAATTT
CTTGCTTACCAACTGGGTAATATTCTGCAGCAAAAGACTCTACATATATT
TCCGCAATGGCACCTTCAATTCCTTGCATCACACTACCCATTGATTGACA
TGCCAAGTCATGGTTCAACACAGTCAATCCATCCCACAATTTTTTCCTTG
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AGATGTTCCCTCTGATCCACCCACATATGTCAGCTCCTTTCCATCATTCC
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CATCAACTAAACAAGCGACAGCACTACTTGGCTATGGTACTCACCGACTA
CTTCTGTAGATTATGGACATGGATTGCAGCCACTGGATTGCCCGCAGCCG
CCACCAGTCTCGCCTCCGCTAGGGGTTCTTCGCAGGGACAGAACAGGATA
GAGAAGCGAGGGCAACTGTCAGCGAGATCTCTGGATTGATCTGCATTAAT
CCTGCCCGCCGAAGATTGTGTTTGATAATGTTGCTAATTGACATCAAGGC
ACGATGATGTGTTAGATTACGTGGAGGGTTAATAGCCTAAACCGGTGATG
TGGCATGGTCGATTGGTGAAAACCAGGTTTCGCGGTGACAGGAGCGAACA
CTGAACGGGTTAAAAAGATTAGGGGCCAAAGTTAGACCTTTCCAAAGTTT
GGGGTCATATTTGGGCTTCATCCGAAGTTAAGGAGGCAATTATGGACTTT
TTCCAGTAGAATTGGCGATCTGAGGTACATATCTTCAAGAACGCGATCAT
GTCCAAAACTATGTACATTTGTAAGAGGGAGTGCCTTACAAATGCCATCT
GAACTTTGCGCCTTACTTTCATTTACATTACTTGCGACACACAAGCGGCA
CATCCTGCTTTTGTTGACTGCTCAAGCTTTATATTATTGTTCCATGTCAT
TTACATTACTTGCGACACACAAGCGGCACATCCTTCTTTTGTTGACTGCT
CAAGATTGTTCCATGTAATTCTAGAAGTGCTTGAAATTTGTGGATCTTCA
ACTTATGTAAGCTCTCTGCTTAAAGGCACATGGACTTAGAACTAGTGATC
CAGATTTAAACTTATAGTTCAATCCAAATTCCTTGTTTTTTTTTTGCTTA
TCACATGTGTCATAATGCTTTTTTCTGAGCACATTTCTAATATGTTTCTT
AATTCTCCCAGTTAACTTGTCACATGTTTTTTTCCATCAAATTCTGATTG
TGCATTGCTCCTGTTAATCCATTTTCTTTCGCTCAGGTTCTGATGATGAG
ATTAGAGTCCGATCTCGCACAAGTTCTGCTATCTGCATGCAGAGGCGAAC
TGGGCAAGGTTTCACTAACCTGGTCACCTGAAATCGCAATGGTGGTTGTG
ATGGCAAGTGAAGGATACCCTGGATCTTATAAGAAGGGAACTGTGATAAA
AAATATCAACAAGGCTGAGCAGGTTTCTCCAGCTGTTAAGATATTCCATG
CTGGAACAGCTTTGGATGGAGATGGCAACCTTGTAGCTGTTGGAGGCCGG
GTTCTTGGTGTCACTGCAAAGGGCAAGGACATTGAAGAAGCGAGGTCAAG
AGCATACGATGCAGTTGATGTTGTTGACTGGCCAGAAGGATTCTTCAGGC
GGGATATTGGTTGGAGGGCACTGAAACAGGAGCAGACAGCTAACTACTGA
TGAGGTTTTCTAAAAACTATGGTGGGCTTCTAGTGTCAAGTGAAATTAAG
ACAGAATAGTCATTAGTCTTGTGGCTGTAGAATGATAGAATCATAGCTCT
TGGCACATTAGCATTTTGAACCTTGAGCATTTTTAGACCGTGGTTTGCTT
CTCAGCTATTTGTGGTGGTCTGTATTTTTCACATGGCAACATGTCGAGTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.