Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA021941

[Submit comment/correction]

Sequence	AA021941
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA021941
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGACAGAGGCTGGATTATGCGAGGAGTTAGAAGGCTTTCCACTGAGCA TCTAAGGGGAGTGGACGAGTTCATGCGATTTTTTCGCAAAAGTGCTGCTG AGGATGCTCAAGTTCTTTGCCCATGCCATAGCTGTATGAATCATGTTCAG CAAACATTAGAAGATATCGAGTCTCATCTGCTGATGCATGGGATGTCAAG CACATATGATAGGTGGATCCATCATGGAGAGCCTTTACACACAGAACCTC GAATTGAACATGAACCTAATGAAGAGGCACACCATGCTAGTGAAGGCGGT GATTTTGTAGAAGATGATATTCCACAAAAGGATGATGATTTTGAGGAGGA GGATGGGTATGAGGATGAGAGGATTCCTGATTTGTTTAAGGATTTGTACA AGTAAGAATGTCACATCCCAAGATTTTCCAAATCTTGTAATGTGAAAATA AATGAATAAAATAAAACTTTGCTTAAATTTCAGAGCCAGAAGAAACTTTT TGAATTCAATTGGAACTTCAGACCCATTTGAATTAGAATAAACCTAAAGG GATTTAAAAAGATAAACATTTAATAAAAGAAATTAAAAATGTTTTGGAAT TACTATTATTGGATCCTTTAATAAAAGATTTGGTTTTCAAAAAGAAAAGA TGGATTTATAAATAAAGATTATTTTACAGAACCAAACCTTTGATTTAAAC ATTTTGTTTTGAATGAAAACAAGGGTTTTATTTAAATAAATTAGTAAGGA TTTGATATCCAACTTTGTTTAAATAAAAGGTTTTATCATTTAATTAAAAT ATCAAACTTATTAAACTATTTTAAATAAGTTTTCCAAGTATTTCATTTTC TTAAATACAACCTACTAAGGTGTTTTAGCTTTATTTTAGATTTCAAAATA AACATCTCAAATAGAACAAACCCTACTTGATTTAATAATGGAAGTCTATT ATAATAATTAATAATGGACACTAAAATAAAAGGTTAGTTTGTTTTAAAAC AAATTTCCCAATATTATATATTTCCCAAATTAAACTTACTAATTTGATTT TGAAAATATTTAGGTTTCAAATAAAGATTTTATTAATAAAATCAAACTCT ATTTGATTTCATAACTAAGACCCATTTTTATTTAATTATTAATGGACCCT AAAGTAAAAGGATTATATTATTTTAAACAAGTTTTCAAAATATTCTTTAT TAAACAAATAAAACCTACTGATTTGGATTGAAAACATTTGGATTTCAAAT GGAAATTTTATTTAAATAAATCAAACCCTATTTTACCTAAAGATCCATTT TCTTTAATTATTAAATGGATCCTAAATTAAATATAAAAATATTATTTTAT TCTGGAATTTGGGTATGTTGATAAACAGAATCAAATTCAAAATTACAAAG CTGAATGATTGTTTGAATTGATTTGGGTGTGATTTATTTGTTTAGAAATT CAAAACAGAATTCAGAAATATAAAAAGAAAAGGATACATAATAAAAAAAA AAGTGGACAGACCCAACTACCCCGGCCCAAACAGCCCACTTAGCCCAGCT TCCTCCCTCCCCGAAGAAAACGGTTTGCACCCATAATCTGACCCGCGGAG CAACAGACAAGTGGACCCCGTTCCCTTTTCCTTTCCCACTGACCAGTGGA TCCCTTTCCACTGTTTGTCCTCCCCACCCGCACGACCTTCTCCCCCACCC CTCGCCGGCCGTTGCAGGAGGATTAACTCCGGCGTAATACGCCTTAATCA CGCAATGAATCTGCCCCTTGACCACTCAGGATAAATCGCCAGCACCCCTT CTTCATTTTCCCCCTGACTCCTTCCCCGAGCACGCCTCCAGGCCGTCGCA ATTTGTCCTCGAACAGCTCCGTCTCCGACGAGCTTCCACCGACGAATCCA GCAGCCCCGAACCACCCCTTGCCTCCCCGACCATGCTCCTGTGATCCCTA CCTCATGGCGATCATCACCGTAGCGCCAGCTCGCCCCCGAGCGCTCCAGA ACGTCAGCAATATCTCCACCTGCACGCCACCGACGACCCCGCAACTCCGG TGAGCTCTGGCACTCGACTCCGTTCGCACCTTGATCAGTGAAGCATGCCG CTTGATTAGTCTGTGTCCTCTGTCTCTCCAGGTACTCGCCAAACACTTGC GCGTGGTCTGCAACCCCGTCCCCGTCGACGAGCAGAAGCTCCTGGCGCCA GTAGAAGCTCCGGCGAGCAATTCCCCAGGAAACCGTGCGCCCCTTCACCA GCCAGTGCCTCCTTGAGCTTCCCCAGGCATCTGCGAACACGGTTAACATC CTCTCCCTCCTTCTCGCTTCCTGTAACGCCGGCGACACCACTGACAAGCC CCGCCGCCGCGCGTCAGAGCCCAGCGCCGCCAGCTTATGGTCGGGGCACT GAGAGCCGTCCGATTTTGATCCGTTGGATAAGATAGAAGGTAGAGCGAAG GGGTATGCATCGATCTGAGCCGCGTGTTGATAGTCAGATCCAACGGCCAG CGTCGCCCGATCCGGCCGAACCGGTATCGGCCAGTAAGAACACGCAGCGT GTCACCTGTTCGATTTAAAACAGATTTGAAATCTGATTTAGATAGGATTT TCAAACCCTTGTAACTTTTGATCCACACGTCCAGATTTGACAAATTTTAT ATCAATAAAATCAGGAAAACAAGCCCTAGCCAACCATGGCCTTAGTTTAG CAAATAGTATTTGATAGATTGTTTGAATTTACAGAAACATTTGTGTACTT GTTTAGAGTATAAAAATTGTTTAAAATTGATGTTAGAATTAAATCTTTAG CAAAATGGATTTGTGTGACCTTACTGACCCTAGGAACCAACCCATAGTGT TAAAAATGATTTTTGTGAAATTTAAGTTGAATTAGTTAACTTAGTCATTT TCTAGCCAAATAAACTCATTAAATTGTATTATGGAAAAGTTTTTGCAAGG AAAACTTTGGGAAAATGTTATGGACCAAGCTTACTGACCCAAAACACCAA GCCTTGCCAAGGGCAACTCACTTGGTGAAAAACATAAAGTTTTGCTTTGA AAAGAATAATTTTCACCACATAAAATGTTGAATGGATTTTAAAATAGATT TTTGAGCAAACCGTCTAACTAAAGACTTTGCCATTTTGGTAAATGACCAA TGTGGACCTTACAAAGTTTATAAACCTAGTAGAGACCAACCTTGCAATAG AACCCTCTTTTTTTACAAGACTTAGGAACCATTGCTTTGTGTATGTAAAA TATTGATTGAATGTTGGTTTGGAATGTTACTTGATACTATGCTTGTTTGA TTGTAGTAAAATTAGCAAAGTGTGAGACTAGAAAGATCAAGAAGTGACTA TCATTCCCTAACAAAAAGGCAAGTGACACTACCATCTAAAGTCCCACTAT TTTTATTACACTTAGTGGATTTTGTATACATGCATGAAAATGTTTTATAC TTATGCTATGCTAATCCTAATAGGATTCCCTACACATTCCTTAGTAAAAT ATTGAAGTTGTACATACTTAGCCATGCTATGTTTTGAAAAGAGATACATG TTGAGATTTTACAAAGGTTGAGAAAAGACTTGTGTTTTTACATAATAAAA CAAGGACTCAATGAACCACCTAGGTGGTGGACACTTTATGTTTTGGAGAA GGTGGCAACAAAAGGGAACCATGTCTATGGCAATCACTTTGTGTTGTGCT CCAAATGAAAACCACCTAGGAAACTTAGAGATTGAACATGTTTCTCCAAT TGTGGCTTTCGTGTACAACCACATGCTATTATGGCTCTGGCTTAGTCAAT TACATTAGGAAGACCCTTACATTGTCTTTAGTTACCGGACATGGAGATCT GGAATGCTTCATGGGGGCTGAAGACAAGCTAGCAATGATGTATGGGAGGA CCTTTTGGAAAGACTTCGTCACATTCTCAGTCTGCCAGTACTCCATCTTG GTGAGCACTAATCCAGTAGGCCACTGGTGGCAACAAGATGGGATTGTGTC ATGTGGGTAAAGTGTACTCCTTCTGCAGAAGTTAACAAAATCTAAGTACT TAGCCGTGTCCCCGGTTATGGACAATACTGAGCAACTAAAGTTTGAACCA TGGGAGATCTCGACATTCCAACTTCTAATATAAAAACTTGATGCACTTGG GGGTACCAAGGAATTCAAAGAGATTTTGTTAAGCTTGTTGCACTTGGGGT TTACCAAGGTGCTCAAGAGCATGATGTACTTGGGGTTACCAAGGGACTCA TGAGATTTTGATAAGAACTTGATGCACTTGGGGTTACCAAGTAGCTCAAG GGAATTTTTGACAAGGACTTGAACACTTGTGTATCTACCAAGGAGTTCAG GGAACTTGGAAAAGAGAATTGACAAAAGATTAAAACCATTTTGAAATGAT AGGATAAATGTTGCTTTATGCAAATAAGCCTTAAACTCTACTCAGCCAAA TATGCATGTGTTGATAGGATCCACTCATATTGTACATAAAAGTGAAGCTT GCCAATACAATTCAAATGTATTGACCCTTGTGGCTGTAACTTGTAATGTT GTAGGTTGATTGTTTTGTTATATGAAGATTGTTAGATTGACTAGGACTAC AAAGTCTACAACCAACATCTGCCTGTGGCACTTTGAAGATGAAGGACCCA TGACTATGTTTATTCCGCTGCAATGTATTGTAATAGTCATATGAGCTATG TATGATGTAATAAAATTATATTATTCCTGGTTATAAAGTTATATTTTGAC CTTGTTTCTTGATATTACATCTTACTGTGGATGCTAGCTATTGATCCAGG GACTAGCATTGTAAAACACAGGAGGGTTCTACCTTATTGGGTAGGGACCT CTACAAAGAACCGCAAGGTGATGGACAGAGGACAATCTATGCCGAGTTGA TAGAGGATGCAAAGCGCGCAGCTAGTGATGGTGGGACATTGTCCAGATTT TCCTTCACCGTGAAGCTACTCCACGTCAAGTCCTTCTACCGGGTAAACAA TGTTGCCTTCAACGCAATACTCCATATCTTGACCACCCAATACCCTAAAA GCTCAATTCCCAAAACTTATGATGAAGCATTGAGTATAATCGGCAGATTG GGGCTTGGTTATGAATCAATCAACGTCTGCCCAAACAATTGTATCTTGTT TTGGAACACGTTTGCCAAGCATGAAAAATGCCCAAACTGTGATGCCTCTA GGTGGAAAGATGCAGATGGGAGGAGACAGATACCGGAGAAGGTGTTGAGG TACTTTCCTTTGATTCCAAGGTTACAGAGGATGTTCATTTCGAAGCAACA GTCGAAGGATGTACAATGGCACAAGCTAAAGCGGCAACCCGTGGATGATG AACTTAGCCATCCAACTGACGGAAAGGCATGGAATGATTTTGATGATAAA CATAAAGAGTTTGCCGCTGATGCAAGGAACATCAAACTCGGCCTTTCCAC GGATGGCTTTAATCCATTTGGAATGAGCTAAAAATATAGCATGTGGCCGG TATTTGTCGTGTCGTACAATCTTCCACCATGGGCTTGTATGGAGCAGTCA AACTTCATGATGGCTTTGTTCATCCTGGGTCCAAAATCTCCAGGAAAGGA TTTTGATGTCTTTATGGAGCCCCTAGTAGAAGATCTGCTCAAGCTATGGG AGGGTGTCCGTACCTATGATGCCCTGAGTCCTGATAAGTTCGATCTCCGT GCTGCGGTAATATGGTGTATCCATGATTTCCCGGCGTTGCACACTTTGTC AGGGAGGATCACGTCTAGTTATCAAGCATGCGTGCATTGTGACAAGGATC CGTGCTCAGAAAAAATAAGGAACAAGATATGTTGGACTGGGGCCCGCCGT TTTCTTCCTCGCCACCATCCTTGGCGAAAAAGCAAGGATTTCAATGGAAA AACTGAAACCCATGACCAGCCGGCGGAGTTCATTAAAGAAGAGCTCGAGC AAAAGCTTCACAATGTGAAAGATGTGAGACCTGGAAAACATCAAGAGAAA AGGAAGCGTGAGGATGGTCAATGTTGGGACCGGAGGGCTATTTTCTGGGA CCTCCCTTACTGGGCAGATCTCAAGTTGAGGCACAACCTTGATGTAATGC ATATCGAGAAAAACATATGTGATAATCTTCTTGGTACATTTATGAACATC GATGGGAAGTCAAAGGATACAGTTAAATCTAGGCTTGATTTGGAATACAT GGGCATAAGAAAAGATTTGCATCTACAGCCTGTTGAAGGTGGACAGTCGT TTGAGATGCCAGAAGCATGGTATACAATGAGTAAAGAAGAAAAGCTTGAA TTCTGTGAACTTATAAGAGCGGTGAGATTTCCAGATGGGTATGCCGCTAA CCTAGAAAAATACGTGTCTCCTGATGGATGCAAGCTCCAAGGATTAAAAA CTCATGATTGTCACATCCTCCTCCAAAGGATTTTACCGGCTGGACTCCGT GGAATTTTGGATAAAGAAATATATGAAGCTGTTGCTAAGCTGGGGAATTT CTTCAAAGAGTTGTTCTCCAAAACACTCAAGATATCTGTTCTTGAAAGAC TCCAGAAACAAATCGTAGTTATCCTTTGCAAGCTTGAAAAGATCTTTCCT CCGGCCTTCTTCACGGTGATGGTTCATTTGACCGTGCATTTACCCAAAGA GGCAATGCTTAGAGGCCCCGTACAATATAGCTGGATGTACCCTGTCGAAA GAAGGTTGCTTACATTTAAGAGGCATGAAGGGTCGATTGCCGAGGCATAT GTTGTTGATGAGTGCCTTACATTTTGCTCGAGGTACTTTGACAATGTGGA AACAAGATTCAATCGGCCGGGCAGAAATAGAGAGCGGGATGATTCGCACA TTGGTGATGTCTCTATTTTTAACCATGGTGTGAACCTTCTTGGAGGGTCA GAGTACTTGGAGGCTGGTGATGCCTATGACAAAATGCATTGGTATGTGCT AAGGAGTTGCCCTGAGGTTCTACCATATATAGAGTATGTCATCTCTTGTG CATGCACCCTTATCTCTTTCCTTTAGTTGGAAGGAACCCATTTGCAAGCC CGATGATTTAATTAACTTTATGTTTTTGTTGGCATTGTAGGTTGTGCAAA GAAGAGCTGAATAAGAAAGATTGCGGCATCAATGTTGATAGATGGCTTGC GAAGGGGTTTGCTAAATGGTTTAAGAATCATGTGAGATCTTTAGTCTTGG AATCAATTGCCACATGATTAGTTTGTGTTTTTGTTATTAATCCTGGTTTA TTTGTGTAGATATTTAGTCTTGGAATCAATAATGTCAGTGCTGATATTTT TGCTTTGGCATGCGAGCCGGATAGGCGAGTGAGGTTGTATCCAGCATGCA TTGCTGACGGTGTCCGCTACCACACTGTTGACCGCGAGAAAAATAGAAAC ATGCAGAAGAGTGGAATACTTGCTGAGGGAGACCATGATGGTGAAGACAT GGACTTCTATGGTCAGCTCAAAAGCGTCATAAGGCTCCAGTACAACTCCA GCAGAGGAGTCCATCGATCGGTTGTCTTGTTCCGTTGTGATTGGTTTGAT CTTGGTGGCAGAAAGAAGACAGGGATCCGAGATGACGGACACTTCAAGAG CATAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.