Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA006675

[Submit comment/correction]

Sequence
AA006675
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA006675
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CATACTTTTAAAGTTAAGTGGGGATTCGGGGTTTGATGGGGATTATCCCC
ACTAATTCCCACAAAAACTCTAGTACCAAACAAGGCCTCAAGGATCTATA
CTTCAGTACGGAATACGGGGGGAGTACACGACTTCACCGCCGGCGGCGAG
GGTTAGGGTCGGGGAATGCTTCGTCCCCGCGGCCTCGCCCCCCCTCCGCA
ATGGCACTTCCCTGTCCGGCCAAGTCTCCCCTCTCTCTCCGTGGCCTCGG
CGGAGCAGACTCCCGGCTGGTGGCGGCGCCGACGAAGAGGTAAGCCAGCC
TCCCAGCTTCCCTGCTAGCCAAGTCCGCGAATACAGATATCCACGCCATC
ATTCCTGTGTCGTTCCTAGGACGTGGGGCTGGGAATAATTTGAACTCGTA
ATGTCACTGAATCTGAACAGAATCTCTGAACCTCGATTTAAGCATCGGCA
TCTTGAGTTGTTGACTGACCTCGACTGCCAGCCTTAGCCAAGGGTATCTG
ATTTGGTATTGCTCTGCTCCCACTGACAAAACGGTATGTGACCAACTTGG
GGACAAACCAAATGCTATCTCCAGGAAAGGCGCAGATACCCGTCGCGAGC
ACCCGTTTCACGCCAAAAGTTTTAAAGAGAAACATTCACATTTTTAGTAG
TATCTAGCAACAATTTACCATTGCGACCCTGTTCGTTCTGTATCGCTTCA
ACTGTTAATATGTCTCCATGTATGAGGTCAGGTTGACCATATCAGCCTGC
CAGCCAGCACCCACTATCTATCATGATTAATTATTGTCACGGATTCTGAC
TTGTGTATTTAGCAATAATTTCAGTATTGACTTGTGAGCAGGTATCTGAT
ACTACATCATAGGTGACAGCACACGATACTAAAGATTTCTTCCTTACTTA
ATCTTCACATTGATAGCCACACTATGTTTTTTCAGAGTTCAGATTAACAA
GTCTCAGAGAGTTGAGGCAAAAGCAGGAGGAATGTTTTGTTGTTAACCAG
CTACAAGGTGTGTATGTAAGTCTAAAGAGCCTTGTTTTCTCTCGCTGGTT
TCTGTTGGCTTCAGCAACAAGATTAGCTGCTCCCCACTCACGAATCCATG
ACACTGTTTTGATGATTCCAGATTCTGAAGTGTCCAAGGAGGTCGCCACT
GACCCAAATCTGGCTGGATCTACAACTACTTCAAGCTAGGTGTGCTGAAC
TTAATTTGGTTTTCTTCCTAATTCTCTTGTCAATATCGTAGGTGGCACTA
CTAGAACTATCGCTCTACCAGATGCACAAGTAAGCAGTTTTCCTTGTCAT
TACAAGCCAGTTAAGTGGTTGTTCTTTCATTTTAATGTGTAAAAGGAACA
AGGAGGACACCTCAAGTTGAAGATCAGATCCAGCTACTTTTCAGGAGCAA
GCTAGCACACTCTCAATCATACCCATGCTTCCATGGTAGTTCAGGATCTC
CATCAGGCTATTATTCTAATGGTTTCAGATTCTGAACTGCAATAGGAGTT
CACCAAGATCGATCGAATATTACAAGACTCGTGCGTCGTTCTTCCCTAGT
TTACTTTCTCTTTTAGTTTGTACTAGGAACAATCTCCCTTAATGCAAACA
AAAAAAGACTCCTGCTGTATCTTTTGAAGTTGGCAAGACTCGTATACTTT
GTGAGTAATGCATTGTCATTTCTTCCAGCGCCATAAGTGCAAGAGAGATA
TTTCTTCTCGAAGAAGAACGAGCTTCTTAACTTGTGACGTCCCCATGGTC
TGGTGAGCTAGCAAGTATGTTCAAGCTTTAGTTCAGATCCATTGTTTCCC
TAGGATTCACAAATAATCGAGAACTAATCTGCAACATAGTTGTTTATAAT
GCTCGCACTGGTCACATACTAGCACAAGATTGAATTGTACTGAAATTTCG
ATAACGTGGGAATTTCTAGATTCAAAATTCGGATCTTCTAAAGTTCCAAC
AACCTGGGACGTCCACTGATGTATTTTGCATTTTCTTCTCCCTAGGGAGT
CTGTAACCAAATCTTCTACCTGTTCAATGCAACGAAACGCAAAGTTTTGC
GTTTTCTCGAAAAAAAAGGATCTCCTAAAGTGAACAACGGCTCCTGTTAA
CTCAAGCCACTTTAGGTATGGTATAGCTTTGCTTTCTTATTTATTTTCTT
CATTCGGTACATCTCCATTTTACTCCTTAATCAACAACTCTAGAAATTTG
CTTCTGCATTGATCTGGAGAAACTATTAGGCTGATGTTGAGGAAAATAGA
AGTAAGTTGCCGGAACTGTCGCATTAGCTAACTCGCTGAAAGTAGAATAT
TGGCGGGTGGCAGAGTCGTTGTCTTGGTTAAAACTTCACTATCCAGGGAG
TTTTAACCTGGGATCTCCCTATACAGAAGCAGAGCATGCATGATCAGTTA
TTTGATGGAGCGTCACTCATTCTTGTTAGTCCATAAAATAAAGTTTGCTG
CATTTGACTACAGCACAGTCCCGAGTGTTTTAAAATTATCATGGACCTAC
CTGTTGTAAGTACTGTTTTGTTTGATTTCTCGTTTTAGAAATTGACATGT
TAACACTTGACAGTATGAAATAAATAAGAGTTTAGGAGGATTACATTGAA
AGGTTTTACTCATTTTCACATTTTTATAGTTTTTGCAGAGTTTTAAAGTG
CTAGCAGAATACACGAATAGTTTAATTAATACACCAGTCATTTCATTTTG
CAGTGGTCGTTCTAATTATATTAAGGAAAGAAATATACAAATAGATTAGC
ACCCAACAGTGAGACGTCAGCAAATATCAGAAAGTATGGCAGAGATTGTG
ATTCTTTTAGCCATTAAAAAGATCGGAAACGCCTTGGCAAATGGAATGGC
GGACCAGGCCAGTAGGCACTTTGCAAAGTATGGGATACAACAACTAGAGC
TACGAGGCAGCATGAATCGTGTTGCTAGGGAGCTTCGCATAATGCATGAT
TTTCTCTGTCAAATGGATATTCGAAACCACAGCAATAAAGCATACGAGGG
CTGGTTGGAGGAGGTACGGAAAGTAGCACATCTGATGGAGGACATGGTGG
ATGAGTATTTGTATCTAGTTGGTCGGAAACATGATATAGGGTGTTGCTTT
TACCTGAAGAAATGGTCCAGAAAACCAAGATATCTACTTTCTTTGAGCCG
GATAGCTTTCAAGGTGAAGGAAATAGAGAAAGACCTTATGCACCTGTCAG
ACACAAAAAGACGTTGGGTTCCCGTGAACGATGGGGACACTAGTTCGAAT
TACATTGTCAAGAGGGCTCAAGATCTAGCAAACATTTCACGATCCCTTGA
TGAAGAAGATCTAGTGGGCGTGGATAAAAATAGAGCAAAACTTGAGCAGT
GGTTGGTAGGTGATGATTTGGAAAACTCTGTGATAGCGCTGCTCGGAATG
GGTGGGCTTGGCAAGACAGCTTTAGCTGCAAATGTCTACAGGAAGGAGAG
AGATAAATTCCAGTGCCATGCCTGGGTCTCCATCTCTCAAACTTATTCTA
CAGAAGATACCTTGAGGAATATTATCAAGGAACTTTCCAGAGATAAAGTC
AGTGTTCTATCTAACACTGAGGCCATGGACATCACATGTCTTGAAGGCAC
ACTGAAGAGATTTCTGGAGCAACAGAAGTATTTGATCATATTGGATGATG
TTTGGACACCAGAAGCATTTGATGACTTGTCTAGGGTGCTTATTCATAAT
GATAACGGCAGTAGACTGATGATCACAACAAGGGAAGGCGATGTTGCTGC
ACTTGCCTCTCGAGGACATATCTTAAAACTGGAACCTTTACCAGAAGATA
AGGCATGGTATCTCTTTTGTAAGAAAGCCTTTCCAAGAGATAGACATCAC
GAATGTCCTGCAGAATTGAAGCCTTTGTCTAAGCAAATAGTTAACAAATG
CAAAGGCTTGCCTCTTGTTATTGTGTTAGTAGGTAGCCTCTTGCGCGTGC
GTGAAAAAACTGTGGAAGAATGGAAAAGAATAAATGTCCAGTTGAGTTGG
GAGCTACTTAATAATTTGAGACTCGATCACATAAGGAATGTTTTGCATTT
GAGTTTCATCTACCTTCCAACACACTTGAAATGTTGTTTCCTATACTGCA
GCTTATTTTCAGAAGACTATCGTTTCAAAAGGAAACAACTTATACGATTA
TGGATAGCAGAGGGGTTCATCGAGGAGAGGGGTGAAAGCACATTAGAAGA
AGTGGCAGAGGGCTACCTGAAGGAGTTGATAGACAGAAACATGCTACAAC
TTGTTGAGAAGAACTCATTTGGTAGGATGAAAGAATTCAGAATGCACGAT
ATCTTGCGTGAATTGGCAGTTGACTTATGCCAAAAGAACTGTTTTGGTGT
TACATATGAAGACAAGTGTGAGGGGTCTTTTGAGAAGGATGGACGTCGAT
TGGTAATGTACAAACTAAAGAAGGATATTCAACACTCATTTACTAGTGTG
CACCAACTTCGAACTTTCATTGCACTGGACAATAACATGCTATCATTTAC
TCTACTGCCTCTGCTATGTAAGGAGTCAAGATATATGACGGTGCTAGAAT
TAAGTGGTCTACCTGTTGAGAATATCCCAGATGCTATTGGAGATCTTTTC
AATCTCCGCCATTTGGGTTTGCGTGATTCAAAAGTGAAGATGCTCCCAAG
GTCTGTTGAGAGGCTTTCAAATTTGTTGACACTTGACCTTTTTAGATCTG
ATATACATGAGCTGCCTAGTGGGATTGTGAAACTAAAGAAGCTTAGGCAC
TTATTTGCTGAGAAAAGAATTAATACAGGTTTGAGAGGGATTACATGTTT
TAGTGGTGTGCATGTCCCCACTGGTCTTGAAAATCTGATAAACCTGCAGA
CGCTACAAGCATTGGTAGCACAGGATGAGTCTGTTAGACATTTAGGGGAG
CTGAAGCAACTGAGGAGCTTGAGGTTATTGAACGTGAAGGGAATATACTG
TGGACACATCAGTGAGTCTCTAGTTCAGATGCGGTGTTTGTCCCATCTAG
ATGTGAATGCAAGTGATGAGAACGAGGTTCTCTTGTTGAATGCCTTCCTG
CCAAACCTGCAAAAGTTACGTTTGGGTGGACGACTAGCCGATGGGGCGTT
GGACAAGTCTCCTCTCTTCGAAGCTGGTGGTGGGCAGAACCTGTATGAAT
TGAAGCTATATTGGTCACAACTGAGAGAGGACCCCCTCCCATCCCTTTCT
CGGTTGTCAAATTTGACACGTCTAGAATTCACCAGAGCATGTAACGGAGA
GCAGCTGACATTTCTCACGGGGTGGTTTCCCAAGCTAAAGATTCTCTATC
TAATAGACCTTCCTAATCTGAATCAGCTAGAGATACAACAAGGTTCCCTG
GTGAGCCTTGAAATATTATACTTGGTCAACCTTAGCAGCATGATTGAGGT
CCCATCCAGCATTGCGTTCCTCATGCCCATACAGCGTCTAGGCTTCTTCG
AAATCAGCAGTGATTTCTTCACGGCGCTGTGTGAATGTTCCACAATTGGA
GATAATTGGTGGGTATACTCTCCGACATTGACCTCCCATAATGGTTTGGA
AATTTAGATGTATGTAACTAGCTAGCCACTCACCTGCCAACCTGTACCAT
TACTTGTTTTCTTCCTTGCCTCTGATCTTACTAGTTTAACATGTTGATAT
GATGTTGGTTGTGTAGGTCAACGTCCGGAAGTAAGGTGCTTCATCATTCG
GATCGCATGGAGTGAAAGAAAAGGAGGGGTGCAACAATGAGTGAAGGCGT
GAACGCATCTGAAGATGCATATCGAGTTCTAGATACTTGGCTGCTGCAGC
TGATCTACACACCGTCTAGGATTTCCTCTGTTCTGCATTGCTGCTAGCCA
CCTCCACCTACAGTGCTCTTCATTTCTCGGGTAATGCATGATGTTCTTTA
TGAGGGCTGGTTGGAGGAGGTACGGAAAGTAGCATATGTGATGGAGGACG
TGGTGGATGAGTACCTGTATTTAGTTGGTCAGGATCATGACATAGGATGT
TGCTTTTACCTGAAGAAAGGGTTCAGAAGACCAAGATTTCTTCTTTCTTT
GAGCCAGGTAGCTTTCAAGGTGAAGGAAATAGAGAAAGACCTAACACACC
TGTCAGAGACTAAAAACCGACGAGTCCCCATGATAAACAATGGGGATACT
AGCAGCTCAAATTATATCGTAAAGAGGTCCCAAGATCTAGCAAACATTTC
ACGTTCCCTTGATGAAGATCTAGTGGGGGTGGATAAAAACAGAGAAAAAC
TTGAGCAGTGGTTGGCAGGTGATGGTACTACTGCCTGTGCTAGTTTCTCC
TCTTTTTCAAGACGTACTGCTGCTAGTTCCACTGCCTGTGTTAACTATGA
TGATTTTACTTCTCCACAATCTACTGCCTGTGTTTACTACTGCTGCTACT
GCTCGTGTGCTTTTGCTTGTCAGGTGTGATAATATTTGCCTAGCTCTTAA
TTCCGGTTGTGGCTTTTAAACAAGACTGCAATAATTGTAATTTGTTAGAC
TGAGACTGAGTTGTGTTTCCATGTTCAGACTCAGAAGACTATGGGCGAGT
TTTTGTTCCGTATGCAGACTAATTTTCGTGTTGCCTATTTCAGTTATGTA
CTGCTAGTTATTTGTGTGTGGCTGTTGTGAACTCTGTATGGAACATAGCT
TCAGCTGTAGCTGTTAAATAAGCACAGCTGGTTTGTGATTGATAATTCCC
ATATATTCATTTCCTTTTCAAAGAATTGGTTTGCGATTCATAATGCTCAG
ACATTCATTTCCTATTCAAGAGAATTGTCTTGTTGAAAATCCTTGAAATG
TTATATCAGCATGTGTGCCTGTCTGTTTTGTAGCCATCCTTCCTCTGTTT
AATTTATTATCTACTTTTTGGGCATCTTTCCATGATGCTTCTTTTCTAAA
CTAAGCTCCTGGTTTTCTTGAGCGATGCATTGATGCAATGAAGAGATGCG
CTTGATCATCATGACAATGTCTAGGAAGTGCTGAGATAGAAATGAAGGGC
TAGACCATGCTAATACCCAAAATACAGTTTTTTTTTCCGACCATGCACTG
CTATTGGAGTGTGCTTGTTGTGAATATTGTATACACAATTTTGTCTATTT
CAGCTTGGGCTGTTAAATAAGATACTTGGGTTGTGATTTGCAATGCTTAG
GCATTCATTTCCTTGTCAGCTGATTGGTCTGCAGTTCATAATGCTCAAGT
ATTTATTTTTGTTTTGAAAGCATTGCCTTGTTATTCATGATGCTGTGATG
TTGACTTTCATTGTCATATGGTCGCTGTCTTTAGTTTGTTTAAAGATGCT
TTGTGCTGCCTTGCTTAATCCGCCTCACTGATAGCCATGCCATAATTTTT
AAAATATTATGTTGAACAAATCCCAAGGGCTGGTAAAAGAAGCAAGAGCA
ATGTTAGGTTACAAACCTGCCAGAAGGTCTGTATGTAAGTCTAAACAGCA
TGAGGATTCCTTGTCTCTGAGATTCACATGAGGATTAATTTGCAGAAGCT
TCCGCAAATAACAAGACTGCTAGCATTTCAAACTCACCAATCCATGACAA
CGTTTTGATGATTTCAGATTCCGGAGGGCACAACAAGGTCACCAAAGGTC
ATAATCCTTCCGGATGCAATTCATCACATGCCAGGTGTGTTGCCCTTAAT
TTGACTTTGTTCCTAGTTGTCTTTTCAGAATCCTAGGTTGTAATACCATC
ACGAGACTGGTGCTTAGAACAATCTCCCTCAGACCTCAGTGCAATCAAAA
ACTACTGCTGTAACTTTTCAAGTTGGCAAGCCGTGTATACGTTGTGAGTA
ATGCATTGCCATTTCTTCCAATAAAGCATTGCCATTTCTTCCAATAAAGG
TTTCTTCTGGAAGAAGGACGAGCTTCTTAATTTGTGACCGCTCCAAGGTC
TGCCTAGGTGGCAGGTATGTTCAGGATTTATTAGTTGTCATCCATTATTT
TCCCTTGGATTCACAGAAGTATCTGGAATCAATCTATAGCCTAGTTGTCG
GTAGAGCTAGTTTTTTTTTTTGAGCTGATTACTGTAGGAGAGGCCCGACA
GTAAAAGTTTTATTAAAGAGAACAAATATTTACAAGATGAAGGAGAAAGG
GTGATGTTTATAGAGTGCTAGTTATTGGCAATATACTTAGCACATGATGG
GCTTGCGCTGAAGATACTACTAATGATGGGAGGTGGTGTTTTCGCTCCCA
TGTGCAAATAAACCTATTACAGAAAATACATAAAAAATAAAATATAAATT
GTCAAAAAAATCTGAACAAAATTTTCGCATATACATCGGGACATTCTATG
CTCGTACACACGTTTTCAGAAATAATGAACATTTTGTGTGGCTTGTGTAA
AAAAGACAAATAACATATTCGTGAATAGACACGTTGGAGCACCGAATTTG
TCTTTTTTTACATGGGGCATCTAAAATGTTATTTTCACCCGCAAACTTGT
GTACGGACATTTAGTGTCTGGATGTACATGCAAATATTTTTTAAATTTTT
TTTTTGACAATTTAAAATATGTTTTTACATAATGGGTTCATTTGCACCTG
TAAGCCGAATTGGATTTTCCCTAATGTTTGAATTTCTCTACCCTCCTGAA
GTCAACGTTCTTATCATGTGAAGGTCTCCTAAGTGAACATGGCGGCCTCC
TTTTAAACTAAGGATAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.