Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA003381

[Submit comment/correction]

Sequence	AA003381
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA003381
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTCTCAAAACCCTCGGTCCCATCCGCCGCCTCCGCCTCCGCAGCCGATCT CAAGCAAGATGAGGTGAGCTGAACCTGAGCGCCCCCTCCCGATCTTGCGT CTCCACACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGCCCCCCCCGCTCTCCCGTTCT GATTCGGCTTTAGATTCTGTGCAAAGTGCGGAGGTCGTATTTTCGAACCG CGTGAATGGATCTGGAGGACTCGCGGCTCCGCAGGATTTTTCGCTCCCCT GTGTTTAGTTGGTCAGTTTAGGCAGTCTGATATCGGCGTTCTAACGGTTC TCGACTGGTGCGTTGTTTTTTCTATGGCGTCTTTAGGGTTGGAAGGTTTT CGGATTTGACTGTCTTACTGGCGGTTTAGGCGATGCGGAAAGTTTGAGCT ATTTTGTAGCCTGAGTATAGTTTAATTTAATTTTCTGAGAAAATCTAGAT GAATTCGATTTTACGGCAGTTCAATGTTGTTAACTGTTTTATTTGTGATT TTAATTGTTGTTCTGCTGCCATTTTGACCGAACGTGATATTGGTAATTCT GGGACTCTGTTTCTTAGCGTGACTTGTTACTGCTGCTGTGGGTAATAGAG TTAGAAGCGTGATCTCCTGGTATTTGAGTTTTTTAGTTGTGTGTGTTCAC TGTTCAGATCTTGTGGTAAGGTTCTTCCAAAAGAATCAAATAGTTCTCTT CTGGCAACATTTGGTTTTATTCCAGGTTTCTGCACGCAGTTTGTTATTGC ATTTGTTACTTGGTTGCCATCTATGGAAGTGTCTCTGACTAATAGTTTTG CCTAACCCTGAGGTGTTATTGCATTTTGTGACCAAATTATTTATCATCTA CCAGGATTATATTATATTTTTAATCAATTGTTTAACTGGTAATTTGCTAG CGAAATTCCAAATTTGTTTTTGTCATTGTGAATATTTCTTATAGTATAGA TAAAGTAGATCATGGTTGAAGATTATATTATGCACACAGGTACCATTATG TTATCTTTCTATATGGGCTGATATGTAAACTGTGAAGGTATGGTATAGTT GGCTATCTCACAAAAGCTTCAATACTCCCAGCGTCCTAAATTAACTGACT AACTTAATCTAGATAAGCATGTATCTAGACAAATTTGAGGCAATTAATTT GGGACAGGGAATATATATAATGATTGTTACTAACATGTTAATCCATGTAG CAATTTGTTAATGAGGTTAAAGAACAAGTTGATTTTAAACGGTATAATTT TATGCTTTGTCATCTTGATTTTTATTAAATGGTAAGAGTAAATGTGATAT CTAACTGTTCAATATCTCCAGTGCAATATTTAAGTTTTAATATGTGGTTT AACAGCTATATGTGTGCATTCAGCAGAGTACTTGTTGATTGTTCTTTTTG TTTGAATGCATTGACCTGCTTGGCCGTGCATCATATTGTTCTACTAGGAA TATGATTGATATGATGCAAGCATTCAAGTGTGCCGTTATGTTCTGCTTTC TAAGCACATATAGAATGCACTAGAGGCGTCAGATGTACTAGGATAGTAGG CATTCACAGCCACACGATCGATAAATAGGTGGCCCAAATATAAAGATGTA CAACTCATGTACACTTTATAATAACCCCCTGCAGTTGTGCTATATCATAA AAAATTGAAGGGCTCGCAAGAATTTCACCTATGGTTGAGCATAGTTGAAA AAATATTTTACAATTTTTTTGTTAGTTTCACTATTTCTTTAGAAAAATTA GGTATATTCCACACTATTAATTTTGCATAATATTTAGCATTTCACAGTAA TGTTTGCACAAATTTGACATAGATTTCGTTCATGTTTCTTATCAGGGCAG TTTTTCACACAATTTTCTCATAGGTTTTGTTCATGTTTCACATGTTCATC TGAGTGAGACACAAACCACTATAAAACTTTGTTGTAGCATGTCTGGAAGT TTAAAAAACTGTACCGAAACCTACATGTACGAAGTTATGGTTCTGATAAG TTCCACAACTTCCATTCAAGTTTCAACAAATTAAAATTTTAGTTTTCAAG AACTTATTCAAGATTGATCTTGTTTCTAAGAGCTCATCAGGACGAAGATG ATGGTGAAAACTGATCCTGAATCGGGCACCTGATTCAGAAGTCTTCTCTT TGTTGGGCTATACTTTTAAACACATACATTAAATGATGGGAACAAAGGGA GTGGACTGTGGGTTGAATTTAGTAAAGCTTAGGGTAGTGCAAAACCAAAT GAATGACGTACCTACATATTATATGTCCCCCTGCTATCTATTTGTCTATG GTTGAATTTCCCAATGCTCATTATTGCGTCTTTTGTTTTGCCTAATTACT GCACTTAAATTTTCTCGAGTATATAATTGTTATTCCATCTATTCTTAACC GGTTGTCAACATTATTTTAAGTAACTTTTGGGAGAGATATTTCACATCCA ATGTGGGTTTCTTGATAATTAGTATTATCTTCTGTAGTCGGCACCCTGAA GTTAGGTGGGCCCAGAGGATTGACAAAGTGTACATCACAGTACAATTGCC TGACGCAAAGGATGCCAAGGTCAATCTGGAACCTGATGGTGTATTCTGTT TCTCTGCCACTGCTGGAACTGATGGGAACTCCTATGAATCAAAACTAGAT TTGAATGACAAAGTAAATGTCGAGGTAATAAATATCTATATTTTATACTA TACTGCAACTTCTGATACACTTTAATTGCCGCAGGTTTAGGCACCTAACC AGCGGCAATTAAATTGGATCGGATATAGTATAATATTAGTAACTATGGTT GTGTATGTTGAATCTTCAGTTGTCAAAAAAGTTGTGTTTTTTCTTATCCA GTAGTCCTTTGGTCTTGTACTATACAGGCAAGCAAAATAAGTGTTGGTGT CAGGTCCATATTCTGCATTGTCGAAAAAGTTGAGGCCAAATGGTGGAATA AACTTGTTCGTGAGGATCAAAAGGCACCACACTTTTTGAAAGTTGACTGG GACAAATGGGTCGATGAGGATGATGATGGTATGCTACTTACCAGAAGTGT TTACAGATGCAATAAGTTGGTATTAGTGATAATAGTCTAGTTTAAAACAG CCCTAGGGCTGGTAGCGAAGGAACGTTCTTAATACCTGGTAAAACATTGG ATGATCCTGCAGTCAGATCTTTCTCTGATGTTATGTCACTATAAAAGCTT CATATTCAAACTCACTTGATACAATAAAACGGTTTTGTGCTTCTTCTGCA TCTTATTACTTACATACTTATGAAGAAGAAACAATAATTGTCTGAGGTGA GAAGACCCTAAGGCCTTGTTAATAGACAGCTGATTTTTGCAACTTCAATT TTCTATGGTTAAGATAGAGAACATACTTTTGTATAGATTTACTGCTGAAT TTGGTAGACATTATCGCTTGTCCCTACAAACATTTTGACATTCATCTTTT GTTATCTTAGGCGCTGATATAAATGTTGATGGGATGGACTTCTCGGTAAG TTCTTTTTATGGTTTTTCTGTCGATTGATTGAGTGATATGCTTTGTTATG GTGTTCTTCATCTCCTTTCTTGTAGAATATGGGTGGCATGGGAGGTATGC CTGGCATGGGAGGTATGCCTGGCATGGAAGGTTTGGGTGGCATGGGCGGT ATGCCTGGCATGGGCGGTATGGGTGATTTGGCCAATATGATGGGTGGTAT GGGCATGCCACCTGGCATGGGTGGTATGGGGATGGATGAGTTCGACGATG AGAGTGATGACGAAGGTTGGTACTCCTGTACCTGTTCTCAGTTTCAAATT ATGCTTGATATGTTCCTTAGCTACAGGATATCAGAGACATGTTTTCTCAC ATATCCAAATTATGATGTGTTCTTGGGCATATTATTTTGGTATGGTGGTT ATATATAATTGAACCTACTGATAAGTCGATTGATTATTCTCTTGTTTTTC ATTAGAAATTGCCAAATTGGTTGCCACTAAAATCTTTGATCTTATTTCTT TCTTGTGTATTGCTTGGCAGTAAATGAGAGGCTGTGCCTTGAATCCACAC ATTCTTGGTACTAATATAGTAATAGCAGTCATCATTGTAATTAATAAAGT AAATCTTCTAATGTCAGTGTCCTGGGGAAATATGTTATGCCTGCTGTACT TGAGAAATATTATCAAATGCACATGACAGTTTAATGTTTTCCCAAGAAGA GATCATCATAATGAGTATTTAAACCACAATAGGAAGTGAAATGACCTTAA TTAGACAATTAAATTTTGAGCTAAATACTGCTGTTTACCCAAAAATATGC AATCGACTGTTGAATATTACTATCATTGAAAACTTGATTGTTCCCGATAA TTTGTGAGTGGATTTATACCAGTAAGACTAAGAAAAACATTTTGCTTGGC GTGTAACTACATTAATGAAAACCTGTACTATGTAATTGCTGTAATTCCTG CACATGTGGTGGAGAATACAAAGACAGGTACTTCTGATGCATAGACTGAA AAAAGAGGGTGAGGGTATGCTCTGAATTTGACAACTGCTAGAAAGCCTTT TGTTGTTTAAGTATAGCAAGAATGCCATTTAAGTGATGTCAAATCAATGG GTTTAAGTGTATGCATATTGATGAAAGGTGACGCCTATAATAATACTCCT TCCTTTTAAAATATAAGATGCTTTAGGTTTGTGAAGAAAATGCATCTAGA CTTATTTTAGTGTATAGATTCATTCTAAACATGAGTGAACCTACATGCTA AAACTAGTCTAGATACATTTGTTTTACAAAGCTAAAACATCTTATATTTT GAAACGGAGGGAGTACATTTAGTACATATTCTTTAGATGTCCTGTGAAAT GGTCCTGATATTGCTATTTTTCCTCTGTTGCCCGTACTTCAGAACTGTTA AAACCTCAAGACGAAGGGAAGGCAGATGCAGCCGAAAAGCCCAAGGAGGT AGAAGCTAGAGCTGACACAGCTCAGGGCAACTGAAGCCTTCCTACTCAAT AATCCCTACTCAGATTGTATCCTCATGTTTTTTATGAATCTGCTGAACTG AAGGACACACTTTACCCCCTGGTAGGGACTGGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.