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GrainGenes Sequence Report: AA009919

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Sequence
AA009919
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA009919
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCTACCCCAATCTCCACCGTCGAAAGGGCCCAAGCCCACACGGCCATCA
TAGTAGCCACCACCGCCGCCGATAGCTCTCCCTCTCCGTTCCTGTCTCCT
TCTCGTCGCCGGGCTAGGGTTCTTGCGACGCCGCCGGGATAGGGTTCTCG
CGACGCCGCCGGGATAGGGTTCTCGCGACGCCGCCGCTCGCTTCGAGGGG
TAAGTGGACAATGCCACCGTAGTCTCTCTTCTGCGCGATTCTATGTTCGC
TCCGCCGCTCGGGTGGTGCGTAATCTACCCGGCTTTCGGGTTCCCGCTTG
CGTTGCCTCTCGCATTTCGCGTGGTGTTCTGCCGTTCGGCGCGGGCGTAA
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TTGGTCAGTAGCAATAGGTTATACCTTGCAGCCACATACTAACAGCCTTG
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TGATATGTAGTTATTGAATATGTAGCAACCAATTCTGGTTATGTCCTTTG
TTGGTGATGATAAGTCCCATAATTTGATGGATGCTACTGACACATGCACA
GAAACAAATTGACTGCTGTGTAGAATTGCTCCAGGAGTACTCTCAGTAAC
TTTGTATAGCATGTGTGATTTTTCATTCTTCCCTGTTGAGTTTCTTTTCC
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TTCAGGACCTTACCCAAACCATGGGCTGTATGTTGCACCGGTGCTACCGC
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TGCTCCGCCACACTTTCATCCACAGTTCAACGCAGCATCACTGCCTGCTC
CGCCACACTTTCATCCACAGTTCAACGCAGCATCACTGCCTGCTCCGCCA
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TCATCCACAGTTCAACGCAGCATCACTGCCTGCTCCGCCACACTTTCATC
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CGGCACCACGGCCTGCTCCGTCACACTTTCATCCACAGTTCAACATGGCA
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CCAGCACCACCTCGCCCCCCCGCTCCGCCCAATGAGCATGCGTGGCATCC
CTACTTACAGTTCCAGCATCATCAGGGGGGGCAATTTGTATCACTTGAAA
GAACAGCCCAACAACCAACAGCCTTTGCAGATGGTGCGTCATCACAGGTG
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CAACGGAGGCAGTTCTCAACTCCAGCAACACTCCCAACAGCAGTCGTACA
ATACCATACCTCAATCTGGAGTAGTGGCGCCTCAACTGCTGTTGCAAAAG
AATTATACATCGCTTCGCGAGAAGAGGCATTTGGAAGATGGAGAATCATC
TCAAGAAGTTAAAAGAATCAAGCTGGCTGTGCAGATGGAATATGTATCAG
TCATGGATTTCCTTGAAAAAAACCCGCCCATCAAGCCCTATAAGTTTGGA
GTTGGGTCTACTTTTGGCAGCATTCCAGCAGATCATGAAGATGTGAAAAT
AACTGAAATTGGAGAGATTGTTTTGGATGGTTTCATTGGAATGCTCGGAG
ATATGCACAAAACGGGTAAAAGCTTTGGTGGTGAATTTGATGAGAATGAC
CTCCTCTTCTCAGAAAGCCTATGTTCTGTCACAATTGACAAAGGACCCAA
GTATGAAGCCTTCTGGGTGAACATATCAAAGGATTACAATAAACTGGTGA
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TATGCTGATGAATTTATTTCATTGGTTAAGAAACTACGAAATATAAAGCC
TGCACGGCGAGAAATAACCCTTTGGATAATCAGGCACCATCCATTATTCA
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AAGACATTGTCTGCTCTTGAGAGGGATAAGCTTTTTAATGAGATAAACCG
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TCTCCTTCGTGTACTGGAGAGGGGAGATCCCACCTGGTTATCTTGAGAAA
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CGGGCTATTTTATCCTTATACCGATGCTGATGGTTACCTTGCGATATTGT
TGCGGACTTTACTTGTACATGGCCCCGAACACATCGTGTTAACATTGAAG
TTGTTAAATGATGTTGAGTTGGAGGAATTGGATCTTATAATTGCATATCA
CTTTGGAAATTTTTTGCCAAAATTTCTTGATGAAATTTCAAGCATCACAG
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ATCCTCACTACATTTTCATACCGAAGATTTGTTCATCGAAGAGTTCCCAA
GTGAACGATGGAGGATGGCTGCCCATCTGATCGGATTTACCATTGCAATC
CTTAAACGGGTGCTGATTCACTAAACTAAATCCTGAAGGTTGAAGGCTGT
TTTTTAATTCTTATTGTTTTGTTGACTGGGCATATTTAGTGATAGTATGT
AATTTTCGAGTTTCTGAGCTTAGGTTGCTATGCTAAATAAGTTAATGTAT
TTTTGTAGATGAATGTGGAAGATGTGAGAGAGTGTCAAAACCGTCTTGCT
AAAATGCGCAGCCTTCTATTTCGTCATGAGATGAAAGAAAAAAAATGTGT
GAAGAAGATTAAGTCTAGGACATAACATCAGTTGTGAAGAAGGACAAACG
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CTGCTATGAAACTAGAATTTAAGCGTGCAGAGGTGATTTGTAGTTTATTT
TGAGAATTCTCTCGTATATCTCCCTAATAACTTTGCTAATCAATCTCACA
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TGCTATTACAGCACAACTCCAGCAGCATGCTCTTCTTACTAGAAAAATGA
ATTCTGTGAAAGATGATTCTAGTAGCAGTGATGAAAGTTCTGATGATGAT
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AGGGAAGGAAAAGATTCGTGAAGTGGTTGAAGAAGATAATGAGATCCTAA
AGTCCGGAGTGTTTTCCATTGCCTTTCACGGTGCGTTTTCAGTTTTACAT
TCTGTTTCTGTTTCTGCATTTGCTTGGTGCAATATTGCCTGCGTTTATAT
CATGCCATCATCATATTTCTTCTCTTGTCTACAGGAGTGCTATGAAAAAG
CGTGCAGATGCAACTTACGAGGAAATACGGCTAGATTATGAAGAATTGAA
GGAATCCTTGAAGAAACTGGAGGATGACAACACGGAGGAGAATGTGGATT
TCATCGAGGTGACAGGTAAAAGGACTTTTGTGCCTGTCAAAGGGGCACAT
GAAGAGGCCTAAATTAGCTGGCACTGACGAGACCAGTGATAGTGGGCATG
ACTTTGACTGTGCCCAACATTTCAACAGCAGTGAAGAAAGACAGACTATG
CAAACAACAAGGCAGATGATGTCCAACTCGGGACTGCATAAGGAGGTAAT
TGTACTGTCACCTTGTGTTGAAAGCTCTTTGATTCCTTGCCATATTTCTT
TTCTATATCTTTAATTTTTGTCCTTGACCAGGTCAAAATAGCAAAGCAAA
TGGTGATCACAATATGAAAGAGAGTAGAAATAAATCCAAAGTGCAGATCC
CTTCAGCTGTGGATCCAAACCCCACGGTTTGCCTTCAGCACAGAGGTTGG
TTCTTAATCAAGTTGATTACTGTTGCCCATTGTTTTTTCTGGGTAGCAGC
TTAACAGTCGTGATTCAGATTCCGAGGAAGAGATGGTTGACGGTTTCTTG
ACTATCCCTGATATAGAAAGGAAAATTCCGAACTTCCATCGCAAGCTGAT
CTTATTCGTCAAGTCTTTGCTGTTGATGATGTTGAAGCCGAGTTTGAGAA
TGACAAACTGGAAGCTTTAAATGAAGAGAACCCTGAACCTGAAGAACCCG
CATTTGTTCCTGGTTGGGGACAATGGACTGACATACAACAGAAAAAAAGG
ACTTCCTTCTTGGATGGTGAAAGAACATGAAGGTGCCAAAAGGAAGAGGG
AAGAAGCCTTAAAGAGGAGAAAAGATGCAAAGCTAAACCATGCGATCATT
TCTGAACATGTTGACAAGAAGGTAAAATATGTTCCTTGTTATATAGCATA
TCTGTTACTAAGGTGTTACTCGACCTTAGACTTGCTATTAAGCAGTGAAT
TTGACTACTTAACTGTTTGCAGGCTGAAAAACTTTTAGCAACGAATCTTC
CTTTCCCATACACCTCAAATGATGTGTATGAAAATATCATACGTATGCCT
CTTGGACCTGATTTCAACCCAGCAATATCAGTTTATGCTCTCAACTGACC
TGCGGTACGTACATCTAAGATTCTAAATTTACCTGACGCATGAAGCTGTT
AAGAATTTAATATTATTAATAGGTGTATGGAGTTGTGTACTCCCTCCTTC
ACGGTTTGCAGGGCGCTCTACAAAAATCTCACGGACCTAGGCGTAAACGT
ATTGGCTGACAATTAGACCTATTAGTGAGCGGTTAATGCGCATGCAGTGG
TGGGAGACTGTTGCATGCATAGAAAGTTGGGAGAAAAGCTGCCATATTAA
TCAACAATTAATGCTTATGCGCCTAGGAATGTTGTAGTTTTGGAAAAACC
CAAATTTGATTAGGCGCCCTGCAAACCGTGAAGGAGGTAGTAGCTTAAAT
CAACTAGGTGATCCAAAACTGCATTCTGGAAGTTACTGACCTTTCCTATT
CATCCTACTGCAAGTACACTGAAAATTTATTTCTTCTGCATATGCAACCA
AGGTGTTTATTATACTGCTCCTTTAGGATTTTCATTATGCTTATAAATTA
ACTTTGTAAACAGGAATGATAAGTGCAGATATTTGTGTTGATTAATGATT
CATGATAACTTTGTGTATGCTATTGCAATGGCAAGAACTCTTTGTCAGCA
TGGACTGCCAGCTATTTTGCTTAAACTTGATTTGACGAAGGCCTTCTTCA
CAGTAACTTGGCAGTTTCTGATCAAGCTGTTGGTTGCTAGAGGATTTGGA
CAGAGGTGGTGCAATTGGGTTTGCTAACATTCTTATCACTAGCTCTACTT
GAATCCTTGTCACTGGCTGGCTTACTGATGTCATCCATCACCTGTTATTT
GTCCTGGTAATGGATTGTCTGAGCGTTCTGTTGCAATAAGCCCAATCTCT
GGGCCTGCTATCCTCTGATGACGTAATCATCTTCCTCGTGCCATTGGTAT
CGGAGATGGAGGTGATCGTGGCCAGTTTAGAGCTATTTGGACAGGCCTCT
TGGTAGCACACAGCAAAAGCAGTATAATCCCAATAAAATGCAATGCCATT
GATCTCACCCCCCCTCCAGATGGCCTCTGGATGTGCAACTAAGAGATTCC
TATGTATGTATCTCGGCTTGCCTCTCTCTGACAGAGCTCTCCAGAAGTTG
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TCTAAGTTCATCTCCATCACTGGAAGACTGATTCTGGTCACTGTGGTGCT
CTTCGCAATGTTTCTTTTCCAGCTTTTGGTGCTTAATTACCCAAATGGTT
AGATAAGCTGATTAATAAGTTGCGAAGATCATTCCTCTGGATGGGCTGGA
GGATTGCTCAGGGTTAAGTGTTTGGTCAAGTGTTCTATGATCTGTTGGCC
CAAGTGGTATGGCAGCCTGGGAATCCCAAACCTTCAGCTCAAGTGTTGCT
CTCAAGCTCCGATTGCTTCGTCTCTTCCATACGGACCCTGACAGGATGTG
GCATGATCTCCCACTTCAAATTGACTCCAATACTCTGACAGTTCTTCATC
GCCCCCACCACTATCACAATTGGCAACGAGCTAAGCTTCAGATTTGGGCA
TGACCATTGGCTGCCTTGGCTCGTCCTCAAGACCCATCTACCACAGCTGT
ACTTGCACAGCCATACGACTGAAATTGCTCTATTTTGGTTGCCCTCTCTT
GAAACAATTGGATCTCCAATATCTGGAGCAACCCCTTCATTGTACTGTTG
CAGCAGTACTTGTGGCTTCATATAGCCTGGTCAATATCACTCTCAATCCC
AACCTCCAGGATCAGATAAGATGGAATTAGACTGCCACCAGAATCTATAC
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CCTCTAACCTCATCTGGAAGTATCAGCTGCCGGCAAAATGCAAATTCTTC
TGTTGTCTTGCATTGCATGGTAGATTGGCTCACAGTTGACAACCTTGCAA
AATGAGGTTGGCCTCACAACCCAATATGTCCGCTCTGCAGAATTCATCCG
GAAACTGTCCCTCACCTCCTGATCCACTGCACCTACACTTCCTCAGTCTG
GGACAAGGTAAGAAACAGATTCAGTTTGCCACCTTCCTCGCTTCCAGCAG
CTGCATGCTCGCTGCCTGACTGGTGGACGCTCTGTCACGGATAGCTCACC
CCAGACGCAAAAAGAAAAACTCAATGTGCTCCTTATGCTCACCTCGTGGT
CAACATGTGAGGAAAGAAACAGCAGGATCTTTAACTCTGCCAGATCCTCT
GATGCCATTTGGGAGGAGCTTGTTGCCTGGAAGCTTGCTGGACCAAAGGC
AACCAAGTGGTTCGACCCGTCATGAGTGCGTGCTATCCATCTTGGTGATG
GCTAGAATAGCTGTATCACAACACCTAGCTTTTTCTACTGCTCTTTTATT
TTTTCATGTAACTTGCTTTACTCTTGAGTAATGAAAAGAAGCGCTGGCGT
TTCGTCAAAAATCATGAGGATCTCTGCTCAGTGATGTAATTTTGGCATAA
TATTGATGTGCTTAGCATATTTTCCTAGATAACACTGACCGTTAAATTCA
TATGGTGGCATACTAGTCGACACACAATTTTTCTGTTTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.