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GrainGenes Sequence Report: AA009515

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Sequence
AA009515
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA009515
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCGAGGTGAAACGAAGAAGAAGTCGAGACATGGTCCTACAACGGTTAATT
AGGGGGGAAGTGGGGGACGGAGCTCCCTTCTGATTGGCTACATTTTCATT
TGACAGTACGTTGCACGCTACCCCCTGTCACGGCGTCAGTCGTCGTCTCC
TCTGTACACCCAGCCTCGCCGCCACCACCGTGCTCCGTCCACCCGCGCTC
CCCCCTGCTCCTCCCAACCTCGCAGCTTCCTACTCCCCGGCTCGCCGCCT
CCCTCCCTGCTGATCCTTCGCTGCCCCACCGACCACCTGCACATCTCCCG
CTGCCCCGCCCTCCGTCAACGACGACGTCAATGGCGGCAGGACGGTGATC
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GACGGCACACATGGTACGTTCCTTCTGTTTTGCGCGAGTGGTGGTCGGCG
AATCAGGGGAGCAAATTCGAACTCCGATCTGGATCAGTCGATCAGGATAC
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TTACTAGTTCTTTATCTTGATATTTTACTAGTAAGTTGGAAACTGACATA
ATGGAACTGTAGCACTCGATATTCCATAATTTCTCAACCATCTGTTTATC
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TTTACAGTGGGTTCTCATGTTTGGGTCGAGGATGCTGATGTCGCTTGGAT
TGATGGCCTGGTGGAGGAGGTCCATGGGGAAGAATTAATTATAAAATGCA
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GCACATTTAGTGTCAAGTTTGTTATCTTATTACAGGTTACTGCCAATTCG
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TTCTAAGAGAAGCTGCAAGCTCCATTGACATTTGCATAGTTCACACATGT
TCTCTAGGCTGATAGTTGATTTTTTTATTAATTAGTCCTCCTGTACAGTT
GTCAATTTTTATGCCTCGTATCCTAAAATATTTCACATGTGTTTGCTTTT
TCTTGTTTGTAGTTTCTACATCTTAGGAATTTGGAATTTATCAGCACTAA
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CTGTCCTAACTTAATTTAATCTTTTTCTTTCAGACTTATACCGGGAACAT
ATTAATAGCTGTAAATCCGTTTCAAAGACTTCCTCACCTTTATAATGATC
ATATGATGGGAATCTACAAAGGAGCTGAATTTGGTGAGCTGAGTCCCCAT
CCTTTTGCCATGGCAGACCGTGCATATAGGTGTGTTTTTTTTTTTGCAAA
GAAAGAGCTTTTGAGTTTTTTGTGCTCGAATTTGTATATATATCTAAAAT
ACCCATGGTGCAGGCTTATGATGAATTATGGTATCAGCCAAGCCATATTG
GTGAGTGGCGAAAGTGGAGCTGGTAAGACAGAAAGCACTAAAATGCTTAT
GCAGTATCTTGCTTTCATGGGTGGCAAAGTTGAATCTGGTGTAAGGTCAG
TGCAACAACAAGTGCTGGAGGTGAGTTCCTCATTAGCACTTTCTGTTGCC
ACTTTTGGCGCTCTATTTCTCTTAAACAACCTTGAAATAGTGGATAGGTG
GATTATGAGCTATCATTTATTATTATTTTGTAATCAAGCCCTTTCTCTCA
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TTTGATTGCACAGTCCAATCCTGTTCTTGAGGCATTTGGAAATGCAAAAA
CTGTCAGGAATAATAATTCGAGGTAATGAACTTCAGTAGAACTATGATTC
TATTGGTTTACCTTGTTTTCTCTCGTTAGTATTTGTTCATTCAGTAGAAG
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AAGATCTCAGGAGCTGCCATAAGGACTTACCTTTTGGAAAGATCTCGTGT
CTGTCAAATATCTGATCCAGAAAGAAACTATCACTGCTTTTACATGCTAT
GTGCCGCACCACTAGAGGTAACATGGCAATTACAATTAAATTCCTGAATA
TGATATTGTAACAATATTTTGTGGAATTGCTATCTTTTATAACTCTCTAG
AGGCCATCAAATGGGGTCTTTGAGATGTTTTATGCTTGCAATTGAACAGT
CGAGATGTAATTCATTTGCTATTGCATTCTTGAGGTGTTTAATTGCAAAC
ATAAAACATCTAATACGCTGTTAGTATTGCTTCTTATTTGCATTACTGTT
TCAGTTAGGTAGCCATTGTAATTTGTGACCCTAGTTACCGCTTATCTTTT
TTGCGAACTGCATTAACTCAACTTCTGATCTGTACTCCAATAATGGTGTT
TCAGGACCGTGAGAGGTATAAATTGGGAGATGCAGCATCATTTCACTATC
TCAACCAGTCTAATTGCATTAATCTTGATGCAATGGATGATTCTTCAGAA
TATGTAGCAACCAGGAGAGCAATGGATATTGTAGGCATTAGTTCTGATGA
GCAGGTAAGCCTAAGGTTATGTTTGAAACTACTTTACTTCATCATAAAAC
CATCTTTGCTTAATATTCTTATTGCATACTTTTCAGGATGCCATATTCAG
AGTTGTTGCTGCTATTCTTCATCTGGGCAATGTGGAATTTTCCGAAGGGA
ATGAAGCAGATTCTTCTGTACCCAAAGATGAAAAATCCAAATTCCATCTT
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AACACGTGGGGAGAGTATTGTAAGAAACTTGGATTTACGAGCAGCAGCTC
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TTCAAAGCTTTTGATTGGTGTGCTGGATATTTATGGATTTGAAAGTTTCA
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GCTCAGATTGCAGTAGCTTAACCATGCTGTGCTGAACTTGTTTTATTTCC
TGTAGAAAAATAGCCGCAAAAAATAGACAAAATCTGGTTAGCCACATAAA
ATAGGCAAAAGCTGGTTAGACAAACAAAGATTATCACAATCCACCACAAT
GCCAAATGCAGCTTTAGTCTTGTGTACTTGTCCAATGGCCAATGGCTATA
GTTTTATTTTGTTTCTCTTTTAGTTAGCTACCGGATTTTTAATTGTTTGT
TGGGCCGTGGCCAAGTTGTGTGTTGTATACATGCGCCTTTTTGGTATTTT
CTTCTTATACAAAAAGATTTGTTCTTTTGGCCATATCTAGAATATCCCTA
ATTCCGAATCAAGAGATTGTTATTGTTGTGGAATTTGTCAATTAAAATCC
TTGATGTACTTATAAGTCACAGGGCACACATACTACTGTCTTGACTAGAA
ATATATCAGCATATCACCCAGGGACTTTTTTTTTCAAATCTTTGTTTCTT
TGGTCTTTTTTGGCTAGGTGTGTTTATCTGAATTTGTACTTTCGGTTTCC
TTTTTGACGGGCAAGTAGCTAGGCACAGATGAATCATCATCGACGACAAC
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GTAAACGAAGCATGAGTAAACTAAGATTCCGGCACATAGATTGCTGACAG
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AAAAAATTACCCCCAAGAAGAAAATATTGATGGACTAAACATCTTGTAGC
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TTTTTAGGCATGGAACAATCAGTACACTAGTATAGAGCTTAACAGTGGAC
TCTAATATTTTCAACTCGATGCTTTTATAAAAAATCTCTGAATAGTAATT
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TCTAACTGATAAAATGTTCTACTCCCCCCGGTCCATAATAAGTGTCGTTG
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TTGATTGGAGTTACATCCAGTTTGTGGACAACCAAGAGATTCTTGATCTC
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TCTTGTATATAGTGTTAATTGCATTTTCTTCATACCCTTGTACATGTGTA
TATCCTGGCCTTTTGGCCCAATAGCAATCGAAGGTCTAATTGCCAACATT
TGGTGTTTGTTGCAATGCCCTTCTATTACCCAGACAACTCTTTTCTATAT
TGATACAGTCTGTTCTAGGCACACACTAATCTGAAGTCCTCTACATTTTC
TTTCGACTAAGTTCACGTAATTATTACATGTTTTGCTTCCATAGGGTCAA
GGTAAAACCCAGAACTGGATGGAAAATTATCCTTTAGTTAGGATTAGCAA
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TCTACTGGATGAGACTTGGTATGTACAAGTAATACTGCCGGTTCCTTTTC
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TGACTGAATAAATAATTCTGTGTAGAACACATATTGGCTTTGTGCTGCGA
TTCATTGTAGTGAGAGCAAAATGGGGAACCTCTGCCTATACCAGTTTATG
CTCGCTGAACGAAATGCAGCTCTAAATCGTTGAAGCTCTGAATAGATGAG
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GCATGGTGAATGACATGCTAAGTGTAGACAGAAAAAGGGAATTCTCAAAA
GCAATCCTACAGTATACAATCTGTACATCCACACAGGAGGGATTAATTTG
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TTGGTGGACCTAGAAATGTCTCTACCCCACATTGGCACCATGATCTATCC
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TATGGATAAATGATAAATCAGACTGACAAATGGTTTCGCTAGTAAATTTA
AGAAATAGGAAACACATCAACAAGTTCTTGTTCCTTTTGTGTCTCTTGTC
CCAGCTCTAAGTTTGCTCATAGCAATCTGCAAATGCAATATGATATGGAT
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GGAAACACATCAAAGTTCTTGTTCCTTTTGTGTCTCTTGTCCCAGCTCTA
AGTTTGCTCACTTTAGGATATGAGGTGCTTTGTACTGAGCTACAACTGTT
TCTTTTCTTTCTTTATTTTAGATATTTCGACTGCTCCATCATTGGAAATT
AAAAAACACGCAAGCATACTTTGATCACGAGCTTACACTTCATTTTATTA
CCACAAATTTCTTCCTCTGTAAGTCACCTTGTAGCAGTTACTATCCATCT
TAAATCTTCTCTGTAGTGTAGAAGTTATACATAAGGTGTAGCTTTCCTGT
TTACAAACAAATACAACATCTGTTGGACAACATGAGGAAAGAATCAGAAG
AGGCATAGGCACCAACGGTGGAAGGGTTGATGGAAGGTGCACCTAACTGC
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TTCTTCCACTGGATCAGGATCGCTGCTGGACTGCAGAGTGATGCGCGCGC
CATGGACTTCAGCATCATCCCAGATGTTTGCTGTGCGTTCAGATGCCGGA
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ATGACATCCTTGCGTGGCTGAGGGTGCCATGTCGCCCGCCAGATGATGGT
GACACTCTGGACGATTGGTACCGTTCCGCGAGGCATGACATACCAAAGCC
CATGCATAAGGGTCTGGCCTCTATCGCATTGCTCGTGCCATGGATGACCT
GGAAGCACCGCAATGATTGCGTCTTCAACAATGCCTGGCCCTCGACACTA
GACGTGGTGAACGCGATCAAGGACTAAGCACAGCAATGGGCAAGAGCTGG
CGCCAAAGGCTTGTGTGTGATCCTGCCAAGCACATGGGACGTTCACTCAT
TGTATTTTTCATTTTCTGCTACGTGATTTCCTCCTAGGAGGACTGTAAGC
AACAGCTCCTACCTATCCAATGCAATGAAACACAAAGGGCTTTTGCATTT
TCCTCAAAAAATAATCCACATATAGTGTAACATGTGGTACATTGGGAGAG
TGGGAAATGAAAGTCGAGGTGTGACGTATTGGGAATTAGAAGCAATAGTG
TGCTCATTCGTGAGGGTGGATTTGTGTGGGCCTGCAGGGTTCTGGGCGCT
TGGGCTTCAGAAATTCGAGCCAACTATGGCAAAATTGCTCTCTACCCCTA
TTGGCCAAACTATGACAAACTCAATGCATCTAAGAACTAGCTTGTTGAGA
GTGACACTGTTATATTGTTTATACAGGGGGTGCTAGAGGCAATAAGAATA
AGCTGTCTTGGGTACCCGACAAAGAGGACATTTGAAGAATTTGTTGATCG
CTTTGGTGTTCTACTACCAGAAGTTCTCCGTGAATGGTAATTTAGGATAT
TTTGATTCAGGTTCTTGAACCTTTTCTTTGTGTTTAAGGAGTCTAAACAA
ATCATTCACTGGCAGTTATGATGAAGTTAAAGCTACAAATATGCTCCTTG
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GGTCTTTCTTTGGCTTCTCAAATCTTTTCCTCTAATGTCAAGATGTGCAA
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ATAGATAATGGTATATCTTGTAGCCATATTATTTCATAGTTACTCTTTTG
AAGTAGTGTTATTCTTAGTTTCAACGGCGAACCAGCCTTTGCCAAAGCCA
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CCCTCTGATCCAAATTAATTGTCGCAGATTTAGGCAAAATGTTGCTAAAC
CTGTCTAGGTTCAGTGAACCTGCAACAACTAATTTGGATCAGAGGTACTC
CCTCCGTTCAGAGATATAAGACGTTTTAGCTTTGTGAATCGAATGTATCT
AGACGTCTTTTAGTGTATAGGTTCGTACAGGTTCGGAGTGAACCTATACA
CTAAAAGGCGTCTAGATACATTCATTTCACAAAGCTAAAATGTCTTATAT
TTCTGAACGGAGGGAGTAGTACCAATGTTCTCCAAAAAGCATGAATCACT
GACCACAGTGTCTTATGCATATTTTGTCAATAGACCCAGCAGAAACATTT
TATTTGGAGGAATAGTAAGTTTAATGTGGTATCTCCATCCCTATCTGCAC
AAGTTATTTCTTCTATAGTTCTAACACTGATGTTGGTTTTCATTCCTTTC
GGTTTATCCTGCGGTCTGATGTCCAATCTACAGACAGGGAAAACAAAAGT
GTTTCTGCGTGCTGGTCAGATGGCTGAACTAGATGCTCGGAGGACTGAGG
TTTTGAGCTCTTCTGCTAGTAAAATCCAGAGAAAAGTTCGGTCATTCCTG
GCTCGCAGAAGTTTTGTTCTGCTGCGAATGTCTTCTATTCAGCTTCAGGC
AATGTGCAGAGGTACATATTCCCTGTTTTATACTGGAAAAAGTATCATAT
TTCAGTCTCTGATTTTATGTGGAGATAATGACTTCTGAGCTGTGATAACT
GAAGGACAAATTGTGAGGCATTATTATGAAGATCTCCGTAGGAAAGCTGC
TTCGTTGAAAATTCAGACCTGCTATCGTATGCACTTTGCAAGGAAACACT
ACAAAGATCTCTGTTCTGCATCAACTACTGTCCAATCAGGTCTACGTGGT
ATGGCTGCTCGCAGTGAGCTCCATTCCCGTCAGCAAACAAAAGCGGCAGT
AATTATTCAGGTGCGTTTTTGGGTCTCATTTTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.