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GrainGenes Sequence Report: AA027089

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Sequence
AA027089
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA027089
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGAGTTTGCCTTGCTCTGACCAAGATTACAGGCCGAGAAATATGAAGGA
TGCGAGTCTGCCTCCTGGTGTGAAACATCTTCGGTGTTGGTACAGGACAC
TTTGCAAGGTGAAGGAGTCCACAGATTTTTCCGATAAAATGGGCATGAAG
TTTTTCATGTGTCCCAATTATCAGTATGATCCAGCTCCCTGGAGTTACAA
CAGGCCTCCGGTATGTTTCATCTATAACAAAATGATATATTTTTTGTTTT
GTGGAATATTTACTATGTTTTTATTTGTGATGTAGTCTCCTCCACCCTTG
TGCATATGGTATCGTTGGATTGGCACGGAGCAGCCTGAATGGGAGCTTCG
TGAGATAGAAGAGAGGAGTCGCCGTGCATGTCAAAACTTTCACGAGGACT
GAAGGGAATATGCCCTGAGAGGCAATAATAAAGTGTTTATTATGTGTATT
CCAAGTATATGATAGATGTTTATTTTGCATGCTATAATTGTATTAATACG
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ATGATGTGATGAACACTCATCCGAAGTATAGCATTACGATCAAAGTCATT
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AGTATGGGTCTCCAGATCCCGCTTCTGATTATTGATCCGAGAGGGGTCTC
GATCATGTCCGCATTATTCACGAACCGTAGGGTGACACACTTAAGAGACA
CCGACATCCAATTGGAGCAAAAGTTTCATGCCGAAAAGAAAAGGAAAGCG
CAGGAATTTATTTCACTAGACACCGAAACTGTTTCGGTTGAAATTGCTGA
AACTGGTTCTGCATGTGAAATGGAATACTAGCAAGGGGTTTTATGTGAAT
GTTTGTTAATTAAAGTAATTAACAAAATTCTGAATAAATAAATAAAAGAG
TTTTATTTAAATGAGAGCTTGCATTAAATTTGGTGGAAATTTAATGCATG
TGAGTGGATTTTTGAGTGGAGGCTTTTTAATGGGAGTGGAGGCTTTTCAT
TTTGAGTGGGAGCTCCACCCACATGAATGTGGAAGAGGTGGGGGCAGCCC
CATGGCTGGGCGCCATGCCCCTTGGGTGCCCCCCTCTCCCCTATAAAAGG
CCCCCCTCTCCTCCTCTCACACTACACCTCCTCGTGAAGGATCTCTCTCC
CCCTCTAGAATTTATCCCCCATGGTCTCGGACTAGCGAGATACATGTTCC
CGGTGGCTATTCGGCAAGAAAGAGTTGTGCTTCCGCTGCATCGCTGGAGC
GAGGAGGCGGAGGTTGCTCGGTGCCTCGAACGTGTGTGCGAGCACGGATG
CGCTGCTGATTTGCGGCGCTAGGACTTCCTCTCGATCTTGAGATCGGCAA
GAGATCGTCTACATCAACCACGAGTTGAACTCGTTAAGCTTTGTCGGTCT
TCAAGGGTATGTTCTCTACGGATATACATCCGCCCGTTGTTTGTATCTAG
TAGATGGATCTTGGTATTTAGTTCACATCGTAGGAAATTTTTTGTTTTCT
ATGCTGCGAACCCTACAGTGGTATCAGAGCCGGATCTATGCGTAGATACT
TTACACGGGTAGTACACATATGAGTATGTGGGCGATGATGATCATGTTGT
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CCCGGACAAACTTTACATGTCCTCGCACATGAGACCTGTTCCACGCTTGA
CATGCAACTAGTTTGCATAAGTGGCTAGCGGGTGTCTGTCTCTCCTACTA
TAGTCAATATCTATTTTGCAAGCGAGTTGTCAACAATTTGATTATCCTCG
TTGTGGTTCATGTTCGTAGGTAAGAACGGTTCTATCTCGAAAGCCCTAAG
CCACGTAAAACTTGCAATGGATAAATTAGAGGCGTCTAGTTTAGATTGTT
GCTGGGCTAGTGTTATGATATGGTAGTGTTGTAAGTAGAAGTATGAGATG
ATACTCTTACAACACACATAGCGTGTAAAATCCATAGACCTTGGATTTAC
ACATATAGGTATGATAGTGATCATACCACGATGCACATGATAGAGGTCAT
CTGCGGGAACCATATAATTTCACTAATAAACATATGATGTTTGATTACAT
CTTATATTGCTTGTTTAGCGCTTTGTTAAGCATAATAAGATGATCCCTCA
TTTAAATATCAAGATAAGAATGTGTTCTTCCTTTAGTATGCACCGATTAT
GTTTTCGTCGCTCCAAGACATCACGTGATGATCGGGTGTTCTTGGATCCA
CGACCATATTTCGGGTGTAAAACAGTTACACACGCAAATACTAAGGTTCT
AACTTGGCGAGCCTAGCATGTACAGACATGGCCTCGGAACACAGACCGAA
AGGTTAAGCATGAGTCATATAGTTGATATGATGCCCATTTGATGCTCGCC
TTTGAAGCTATACCGACTCACGTGATGATCGGACTTGGTGTAGTGGATTT
GGTTCATGTAATCACCAAAAGGACACGAGGGATGTCGCTTTTGAGTGGGA
GTTCATTCGTAATATAGATTAGTTGAACTCGATCTATCATACACTTAGTC
TAAACTTTACAAATTCTGTTGTAGATGGCACCACCTGCTTTTAATTTCAA
TGCGTTCATGGAGAAAGAGAAACTAGCAACGAACGGTAGCAACTTTACTG
AATGGGCCATGAATTTGAGGATTCTCCTCTCTGCTGCACAAAAGAAATAT
GTGCTAGAAGCGCCGTTAGGCCCCCCACCTTTTGATGATGCCCCTGACGA
GGAGAAGAATGTCTATCAGACTCGTCAGGAGGACCACAACTTAGTTCATT
GCGGCATATTGTATGGGCTGGAGCCGGAACTTCGAAAGCGTTTCGAAAAC
GGCAATGCATTTGATACAATGGGTGAGTTGAAAATGATTTTCGACACACA
TGCTGCTGTAGAGAGCTACGATGCTTCAGAAAAGTTCTTTAGCTGCATGA
TGGAAGAGCACAGCTCCGTTAGTGAGCATGTACTCAAGATGTCGGGTTAC
GCCGATAAGCTTGTGTCCTTGGGAATATCGATTCCCATTGACTTAGGCAT
CCATCGTGTTCTGCAGTCTCTGCCACCTAGCTATAAGAGCTTTGTGATGA
ACTATAATATGCAAGGCATGAAGAAGTCTCTCCCCGAGCTTCTGTCAATG
CTTAAAACTGCAGAAGTGGAGATCAAAAAGGAACATCAAGTGTTGATGAT
CAATAGGAACACTGGTTTCAAGAAAGACAAGAAGGGAAACGGAAGGGAAG
TAAGGGCGGCAAGCCGGTTGCCGCACCTGAAAAGAAACCCCGAGTTGGAC
CTAAGTCTGATTTCGAGTGCTACTATTGTAAGGGGACTGGCCATTGGAAG
CGCAACTGCCCCAAGTATCTGGCAGACAAGAAGGCCGGCAAGGCAAACAA
AGGTATATATGATATACATGTTATTGATGTGTACTTGACTAGTGCTCGCA
GTAGCACCTGGGTATTTGATACCGGTTCAGTTGCTAATATTTGTAACTCG
AATCAGGGGCTGCGGAACAAGCGACCGCTAGCAAGGGGTGAGGTCAAGAT
GCGTGTCGGCAATGGATCAAGTGTTGATGTGATCGCCGTCGGAACGCTGC
CTCTCCACTTACCGTCGGGATTAGTTATAAACTTGAATAAATGTTATCTG
GTGCCTGCACTGAGCATGAACATTGTATCTGGATCGTGTTTGATGCGAAG
TGGTTATTCATTTAAATCCGAGAACAATGGTTGTTCCATTTATATGAATG
AAATCTTTTATGGTCATGCACCGATGATGAATGGTTTATTTCTATTAGAT
CTCGATGATAATGTTACACATATTCATAATGTTGATGCTAAAAGGATTAA
ACTTAATGATGATATATCCGCATATATGTGGCACTGCCGTCTAGGTCATA
TTGGCGTTAAACGCATGAAGAAGCTCCATTCGGATGGACTTTTGGAATCA
CTTGATTATGAATCATTTGATACATGTGAGCCATGCCTTATGGGCAAGAT
GACTAGAACGCCGTTTTCCGGTTCAATGGAACGGGCGACGGATTTATTGG
AAATCATACATTCTGATGTATGTGGTCCAATGAGTGTGTCGGCGCGAGGT
GGATATCGTTATTTTGTTACTTTCACGGATGATTTGAGTAGATACGGTTA
TATCTACTTGATGAAACACAAGTCTGAAACCTTTGAAAAGTTCAAGGAAT
TTCAGAATGAAGTGGAAAATCATCGTAATAGAAAGATCAAATTTCTACGG
TCCGACCGTGGAGGTGAGTATCTAAGTTACGAGTTTAGCACTCACATGAA
AGAGTGTGGAATTGTTTCACAACTCACACCTGCCGGAACACCACAGCGAA
ATGGTGTGTCGGAACGTCGTAATCGTACTTTATTAGATATGGTTCGATCT
ATGATGTCTCTGACAGACTTGCCGTTGTCATTTTGGGGTTATGCACTAGA
AACTGCTGCATTCACTTTAAATCGGGCACCATCTAAATCCGTTGAAAAGA
CACCGTATGAATTGTGGTTTGGAAACAAACCTAAGCTGTCATTTCTTAAA
GTTTGGGGATGCGATGTTTATGTGAAGAAACTTCAACCGGATAAACTCGA
ACCCAAAGCGGAAAAATGCGTCTTCATAGGATACCCTAAAGAAACTATTG
GGTATTCCTTCTATCACAGATCCGAGGGCAAGGTTTTTGTTGCCAAGAAT
GGATCCTTTCTAGAGAAAGAGTTTCTCGCGAAAGGTGTGAGTAGTCGGAA
GGTAGAACTCGAAGAGGTTGTGGAACCTTCTCTTCAAAGTATGGCGAGTA
GCGCAGCGCCGGAAGTTGTTCCGGAGTTGGCTCCACCTGTTGAAGAGGGA
ACTAATGATAATGATCATGAAACTCCAAAAGAGAATACTACCGAACCTCG
CAGGTCAAACAGGACGCGTGCAGCTCCCGAGCTGTACGGAAATCCTGTCA
TGAATTTCATGGTTGATGAAAATGATGACCCTGTGACGTATGAAGAAGCG
ATGATGAGCCCAGATTCCAACAAATGGTTAGAAGCCATGAAATCCGAGAT
GGAATCCATGTATGAAAATCAAGTTTGGAACTTGGTGGAATTACCTCACG
ACCGAAAGGCCGTGGAGAACAAATGGATTTTCAAAAGGAAAACTGATGCT
GATGGTAATGTGACCATCTATAAAGCTCGACTTGTCGCAAAGGGGTTTCG
ACAAATTCAAGGAGTTGACTACGATGAGACTTTCTCTCCCGTAGCGATGC
TAAAGTCAGTTAGGATTATGTTAGCAATTGCTGCATATTTCGATTATGAA
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AGAGTTGTATATGATACAACCAAAGGGTTTTGTCGATCCTAAGGATGCTA
ACAAGGTGTGCAAGCTTCAGCGATCCATCTATGGATTGAAGCAAGCATCA
CGAAGTTGGAATCTCCGCTTTGATGAGATGATCAAAGAGTTTGGATTTGT
CCAAACTTATGGAGAAGCTTGTATTTACAAGAAAGTGAGTGGGAGCAATG
TGGCATTTCTGATATTATATGTGGATGACATATTATTGATCGGAAATGAT
AAAGAACTTTTAAACAGTGTTAAAAGTTATCTAAACAGCAAATTTTCAAT
GAAGGACCTAGGTGAAGCGTCATACATATTAGGCATAAAGATCTATAGAG
ATAGATCTAGGCGCCTAATAGGGCTATCGCAAAGTACATACCTTGATAAG
ATTTTAAAGAAGTTTAAAATGGACGGAAGTAAGAAGGGGTTCTTACCTAT
GTTGCAAGGCAAGACATTGAGTAAGACTCAAAGTCCGGCTTCGGCGGAAG
AAAGAGAGATAATGGACAAAGTCCCCTATGCTTCAGCCATAGGCTCTATA
ATGTACGCCATGCTATGTACAAGACCGGATGTGGCACATGCTATTAGTTT
GACTAGTAGGTACCAATCGGATCCAGGTTCGGAACACTGGATAGCGGTCA
AGAATATCCTTAAGTACTTACGAAGAACTAAGAATATGTTTCTTGTATAC
GGAGGTGAAGAAGAGCTCGTCGCTAAGTGTTATGTTGACGCTAGCTTTGA
CACCGATCCGGATGACTCTAAGTCTCAATCCGGATACGTATTTCTCATGA
ATGGCGGAGCGGTTAGTTGGAGGAGTTCCAAACAACCTGTGGTAGCGGGA
TCAACAACGGAGGCCGAATATGTTGCTGCTTCAGAAGCGGCTCAGGAAGC
AGTTTGGATGAAGGAGTTCATATCCGAACTAGGAGTTGTGGCAAACGCGT
TGGACCCAATGGTGATCTATTGTGACAACAATGGTGCCATTGCCAATGCC
AAAGAGCCAAGGTCTCACAAGCATTCCAAGCATATTAAGCGCCGGTTTCA
CTCCATCCGCGAGCATGTCAAGGATGGAGATATAAAGATTTGTAAAGTAC
ATACGGATCTCAATGTAGCAGATCCGTTGACTAAAACTCTCCCTAGAGCA
AAACATGATCAACACCAGAACTCAATGGGTGTTAGATTTATCACTATGTA
ACTAGATTATTGTCTCTAGTGCAAGTGGGAGACTGAAGGGAATATGCCCT
GAGAGGCAATAATAAAGTGTTTATTATGTGTATTCCAAGTATATGATAGA
TGTTTATTTTGCATGCTATAATTGTATTAATACGGAAACGTTAATACATG
TGTGTTTAATAAACAAACAGAAAGTTCCTAGTTATGCCTCTCTCATAAAC
TAGCTCGTTGATTAACAAGATGATCAAGGTTTCCTGATCATGGACATTGG
ATGTTGTTAATAACGGGATCACAACATTAGTGTAATGATGTGATGAACAC
TCATCCGAAGTATAGCATTACGATCAAAGTCATTGAGTTTATATTGCTAT
AACAACTTACGAAGTGATCCTAATCCTTAGACCATGAGATCATGTCAATC
ACTAACACCGGAAGAGTTTCTTGATAACATCAAACGTCACACCGTAACAG
GGTGATTATAAAGATGGATTCAGAACTAATAAAGTGTTATGTTGAGGCTC
ATGGATCAAGAGTGGAATTTGTTCATCCCGATGACGGATAGATATACTCT
GGGCCCTCTCGGTGATATCACATTGATTAGCTTGCAAGCAAGTGATTTGA
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GAGATCAAACTAGGTATGGAGATACCGATGATCGAATCTCGGACATGTAA
TATATCGTGAAACAAAGGGATTAAGATACTAGCGTAAAAGGTTCCGACGA
TCACAAGAAAGTCATCGTTGAATGTGTGGGAGTCAGTATGGGTCTCCAGA
TCCCGCTTCTGATTATTGATCCGAGAGGGGTCTCGATCATGTCCGCATTA
TTCACGAACCGTAGGGTGACACACTTAAGAGACACCGACATCCAATTGGA
GCAAAAGTTTCATGCCGAAAAGAAAAGGAAAGCGCAGGAATTTATTTCAC
TAGACACCGAAACTGTTTCGGTTGAAATTGCTGAAACTGGTTCTGCATGT
GAAATGGAATACTAGCAAGGGGTTTTATGTGAATGTTTGTTAATTAAAGT
AATTAACAAAATTCTGAATAAATAAATAAAAGAGTTTTATTTAAATGAGA
GCTTGCATTAAATTTGGTGGAAATTTAATGCATGTGAGTGGATTTTTGAG
TGGAGGCTTTTTAATGGGAGTGGAGGCTTTTCATTTTGAGTGGGAGCTCC
ACCCACATGAATGTGGAAGAGGTGGGGGCAGCCCCATGGCTGGGCGCCAT
GCCCCTTGGGTGCCCCCCCTCTCCCCTATAAAAGGCCCCCCTCTCCTCCT
CTCACACTACACCTCCTCGTGAAGGATCTCTCTCCCCCTCTAGAATTTAT
CCCCCATGGTCTCGGACTAGCGAGATACATGTTCCCGGTGGCTATTCGGC
AAGAAAGAGTTGTGCTTCCGCTGCATCGCTGGAGCGAGGAGGCGGAGGTT
GCTCGGTGCCTCGAACGTGTGTGCGAGCACGGATGCGCTGCTGATTTGCG
GCGCTAGGACTTCCTCTCGATCTTGAGATCGGCAAGAGATCGTCTACATC
AACCACGAGTTGAACTCGTTAAGCTTTGTCGGTCTTCAAGGGTATGTTCT
CTACGGATATACATCCGCCCGTTGTTTGTATCTAGTAGATGGATCTTGGT
ATTTAGTTCACATCGTAGGAAATTTTTTGTTTTCTATGCTGCGAACCCTA
CAGTGGTATCAGAGCCGGATCTATGCGTAGATACTTTACACGGGTAGTAC
ACATATGAGTATGTGGGCGATGATGATCATGTTGTTGCTCCTTTGTTGTA
ATTTTGGATATTGGTGGCATAGTGGGATGAAGCGGCCCGGACAAACTTTA
CATGTCCTCGCACATGAGACCTGTTCCACGCTTGACATGCAACTAGTTTG
CATAAGTGGCTAGCGGGTGTCTGTCTCTCCTACTATAGTCAATATCTATT
TTGCAAGCGAGTTGTCAACAATTTGATTATCCTCGTTGTGGTTCATGTTC
GTAGGTAAGAACGGTTCTATCTCGAAAGCCCTAAGCCACGTAAAACTTGC
AATGGATAAATTAGAGGCGTCTAGTTTAGATTGTTGCTGGGCTAGTGTTA
TGATATGGTAGTGTTGTAAGTAGAAGTATGAGATGATACTCTTACAACAC
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TAGCGCTTTGTTAAGCATAATAAGATGATCCCTCATTTAAATATCAAGAT
AAGAATGTGTTCTTCCTTTAGTATGCACCGATTATGTTTTCGTCGCTCCA
AGACATCACGTGATGATCGGGTGTTCTTGGATCCACGACCATATTTCGGG
TGTAAAACAGTTACACACGCAAATACTAAGGTTCTAACTTGGCGAGCCTA
GCATGTACAGACATGGCCTCGGAACACAGACCGAAAGGTTAAGCATGAGT
CATATAGTTGATATGATGCCCATTTGATGCTCGCCTTTGAAGCTATACCG
ACTCACGTGATGATCGGACTTGGTGTAGTGGATTTGGTTCATGTAATCAC
CAAAAGGACACGAGGGATGTCGCTTTTGAGTGGGAGTTCATTCGTAATAT
AGATTAGTTGAACTTGATCTATCATACACTTAGTCTAAACTTTACAAATT
CTGTTGTAGATGGCACCACCTGCTTTTAATTTCAATGCGTTCATGGAGAA
AGAGAAACTAGCAACGAACGGTAGCAACTTTACTGAATGGACCACGAGTT
GAACTCGTTAAGCTTTGTCGGTCTTCAAGGGTATGTTCTCTACGGATATA
CATCCGCCCGTTGTTTGTATCTAGTAGATGGATCTTGGTATTTAGTTCAC
ATCGTAGGAAAATTTTTGTTTTCTATGCTGCGAACCCTACAAGGACGAGC
GTCGTGAGAAAGAGGCGGAAGAGTGTAGAGCGGCGCAACAGGAGCAACGA
CGTCGGTTAGAGGAGCTACGGAGGCAGAGAGAGGAACAACGACGGCTCAG
GGAGGAGGAGGAACGACAGGCTAGGGAGGCATACAGACAGACTCTGAGAG
AAAGGGCTGCTGAGGCAAGGGCAGCTGAAGAACAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.