Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA025844

[Submit comment/correction]

Sequence	AA025844
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA025844
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGAAAGATTTTCTATCCACTTCCTTCGCTCCCTCTCCTCTCCTCCGGGCT TCCCGGGCGGGAAAAATCGAGCGGCGGCCGCGGAGTCTGTCGGATTATCG GAGGCTCCTCGCCGCGCTTGGAGCTCTGGACTGGATTCGCAGACGACGCC ATGGGAATCAAGGTACTCTCCTCCGGTGATTTTCCGGTTCGCGCCTCCCG TTTTCGCTCTCCCCGTTGTCTCTCGATGTGACGGCCCCTCCCTCCCTCCC TCACTGTCTCTAGGGTTTGACGAAGCTGCTAGCGGAGCACGCGCCGAGGG CGGCGGCGCTGCGGCGGGTGGAGGACTACCGGGGTCGAGTCATCGCCATC GACGCCAGCCTCAGCATCTACCAGTTCCTGGTGACTCGCCCGCTTCCATC TACTCCACTGACTGGCTTCCGCTTCGATTCGGGTGCTGCGCATTGTAATT GTGGAATCGGCTTGGTTCGGGGACACGGGGAATGGTTTCGGTTCATGCTT GCTGCCAATGCCATTAGGTGATGGATTGCGCTTGGGCTGGTTCACATAGG GGCATGATGCCTGCCAAAAGTTTGAGCAAATGCCAACACATGTTCTATCT GGTGCACTCTGTTTGTGTAGGAGGTCAGTGGTTGCCACTAGCGGAATTTA TGCCGGGGAGTGTAATCTAATGTCCACGCCATTTTCTTCTAAGCGCAATG TTGCTAGCATGTGCAAGTTCCCCATCTGTCAACAAAAGGGAATGCTTATG ATATACTGTTAGCATGTGATTTCACAAGAGGGATGCTAATTGGTCAAAAA AAGTTATAGAAGCTTCTTTTAGCAATTCCATTTGCGTCACTTGCATGTTT TAGTATATTATAGGAGCATTCCTAAACCATGTGGATTGGCTATCTAATTG CTTTATCTTCTGTGTAGTACTAATTTACTGTGATCCATTCTGTAGGTTGT GGTTGGAAGGAAAGGAACAGATGTTCTGACCAATGAGGCTGGCGAAGTCA CGAGGCAAGGAAAAAGAAATTTTACATCATTGTTTGTCCATTGATTTTGT ATCTGTCTGGTCATGAACTGATGGTGTTTAGTAGCTCATATGAATTTTTG TTTGTAAGTTGCAGTCATCTGCAAGGCATGTTGAACCGGACTGTAAGATT GCTAGAAGCAGGAATGAAACCCGTGTAAGTTTGATCCGTTTCTGTGGTCA CCTGTACTATATTTGACACCCTGACAGGGGTTCACTACTGAAATTCTATA CCAGGTTTGTGTTTGATGGTGAGCCACCTGAACTGAAGAAAAAGGAACTG GCCAAAAGGTATGCGCTGAATAATATCTTTGCTTCCACGCTTCACTCTCA TTTGCAAGTCTCAATACATGCTTGCCATATGTTGTTTTCTGTTTATTAGG TCTTTGAAGAGGGATGATGCTTCAAAAGATCTCCATAGAGCTATTGAGGT CACTTACTCCCCACCTTAGTTTGCGTGTCTCCCACCCTCCTCCTGACTCT CTATGCTTCTGTATCTGTTGTGTTCCTGGACCTCTGAGGTGGCAGCTGCA TTACAGGTTGGAGATGAAGATTCAGTAGAAAAATTTAGCAAAAGGACTGT GAAGGTAATTGTTACGATTTGGGGAAGGAGCCAATAATTTTGTGTGTGTA TTAACTTTACAAAAGAATACAAGTTTAGATTTTTGTTCCGGATAAAGTAT TCTCAAATCCATTCTGCCATTTTCTGGTTCTAACTTCCAAGCATGTATTA TGATCTTTTTGTTCCTTTTCTTTCCAGATGACGAAAAAACACAATGATGA CTGTAAGAGGCTGTTAAGATTAATGGGTGTCCCTGTAGTTGAGGTATCAT TGTTCTTTAGCCCATCAGTTGCTACAAGTATTTTTATACATTGCTCTCAC AGATGAGTTAGTTTCCTAATTGAGGTGCTTTTTCTATGCCGTGGAGATTT AGTAGAACATTCAGAATCTTTCGCACAGAAAGAAGGAATCACCAGGCCTT CACTTCAGAACATAACATCAGCCTCACTTACGTGCCTGCTTGGGAGGCCT TACCTCAGATCTAAGTTCTCCTAGATAGGGATATACAAATTCCGAAAGTA ATATTCAGGTGGGAGCCTTTTCCCCCTGGTGATTGTTTCAAAACAAAGTC TAAGTTCTCCTAGATAGGTATATAAAATGATTTCTCTGTTGCTACGATCC TTTCAGGCCTAGAAACTGTTCAGGCGGGCTCAACTTGCAAGCCTCTGCAA AATCTGAACCTTAAGCAGCAAAGCATTCCCTGGTAGTCTCATGTATGTTT TCTCTTTAGGTTGTCTGTTTAGCTAAGCTTTGAGCGTAAAAAAAGGCCTG AGCTTAAGCAAGGACTCATTGGTATACATACCACATGAGGATAGTGCTAC TTTGGCCATCAGCAGGTGTTCCCCATGGTATAAGCAATATCATGTAATGG AAAGAGACTGAATTGGGCTTTGCTTCTGCAGAGAGAAATTCTTCTAACTG AACAACATGCTGTACTGTAATTTCATGGCAACGATGAAAACTTGTTAGCT CACCTTCATGAGATTATACTGTTTATATGTATATACCTAATCACTTTGTC TGAGTAATTACGCACTCTGCTTATGCAGGCACCAGGTGAGGCAGAAGCAC AGTGTGCATCACTTTGTGAGAACCATAAGGTGTAACACCCAAACGCCTTC GTAAGAACTATCTTCCTTACCCAACAGCATGCTAAACTATATTTCATTGT GAGTGTCAGGCGTATGCTGTTGCTTCAGAGGATATGGACTCACTGACTTT TGGTGCTCGAAGATTTCTTCGCCATGTAACTGACCTTAGTTTCAAAAAAT CTCCTGTAACCGAGTTTGAAATATCAAAGGTAATTTCTTCTAGTTTTTAT GTAATGTTATTTTCCTTCCGAGTATCATTTCCTCTCCTCGCTATTTTGCA GGTTTTGGAGGAACTTGGACTCACAATGGATCAGTTCGTTGACTTGTGCA TCCTTAGTGGATGTGACTACTGCGAGAATATTAAAGGTTTTACCGCTTCA TATATTCTCTTACACAATTTTGATACTAGATGGCCCAGAATATGATGCAG TACATGATGATTTTCTTAAAGATGACCCAACTCTGAAAATGTTAAAGCTG CCACTTTTTATAAGTTGCTCATGTCATGGGTGGACACAATACTCAATTCC AAAGCTAGCTCCAGCAGAACTGTGGAAGTGTAATGTCTCGGGCTTCAGAT TCAAAATATATTTCTGTTAGCTAAAGGTGAAGTTTAAAGTATGTTGAGGA GGGGCTTTGTTTATAGTGCAGTGAAATTGGCTGATGTGATGTTGTTTCCA CCCATGAAAAATCTTTGCCATAAATTAATAAAATCGGTCCGAATTTTACA GCCTTAACATTTCTAGTTCCTCCATCTTTGTTTCCACAGGTATTGGGGGA CAAAGAGCCTTGAAACTAATACGTGAGCATGGTTGCATAGAAGAAGTTGT GCAAAATCTTAACAAGAGGTATATTTATCATTGTTATTGATCTATGCTGG TATAAAAGTATTAAGACACTTCAGTCCATTAATTCGATTGTGCATTTGAA CTCCTCGTGGAAAAACTATGCAATCGAACATTATGCACGCATTTTGAATG GTTGTAATGATGTTTCAGTGATGATTTTTCCTGCGAACATGCTAAAAAAA CATGCTTAACATGGATTGAGTATACTACCATACATGCCTTTGAGTTTTAA CTGTGCTGTCACTTGTCTAGAACTCATCCTTCCTAAATTCCTAAACAACT TGTGTCACTTCCCCACGCTCTTGAACTGCTCATGTTGCCATGCCACTGTG CTTCATGTTCTATGACACTGTTATATTCCTGCACATATGCTACTATGTTG CTCCTGTGCTACTGCTCTATCATTCTGCCTACTGCTGTTTGCATTCACCC CTGGATAAGTGGTGACAATGGTGGCTGATTTTTCTTGTGAATGGCATGTT TTGACTTTTGAGGACTAGTTTGTGATGAATGCATTGAAGGTGTCAAGGTG GTAATTCTCAGTTTTGTTGCGGGCTGGAGGCAATCCATTTATTTAAAAAA ATTAAAATCTTACTAGAATTTGGAATTCCTTGGGCTCAAGGGTAAACAGT GACAACATATCTAGTTTTGGCGAGGTACTAGTAATCTTGAAATGCTAGGT TTTACTAAGCATACTCATATTTGATCCATAGGTACACTGTTCCAGAAGAT TGGCCTTACCAGGAAGTACGGACTTTGTTTAAGGAACCGAATGTTTGTAC AGAAATTCCTGATTTCCAGTGGACCTCAGCAGACAAAGAGGTTATGCTTG ATAACTCATGTCATATGATCCATACTTTTTCGCACTGACACTTCTTTCTT TTTTCAGGGCCTTGTGAACTTCCTGGCATTTGAAAACAGTTTCAGTTCTG ATCGAGTAGAAAAGGCATGAAAGCATCTTTATGTCAGCTATCCACTCTTA TTGATCTCTTGTAATTTGAATTATCAAATGATTGATTTGTTGAACATTTA TATGTTTATTCACTAGGCGGTAGAAAAGATAAAGGCTTCTAGGGATAGGT ATTCCCCAGAGCGGTAAGTGTAAATCTGCCTTGTATCTCATATAGATAAA CTCATAAACATCAATGCACCTATAATATGGTATCTTTTTATCGTCTCAGA GTGAAGCTTTTGACACCAGTAGCTAATCTACAAGGATCTACTACAAAGAA GGTGCGGTGCTAGTCCTAGACTTGGTACTATTTGTCGTGCGTACTTCTAA TCGACATCCCTTTCCCTTTCTCTTGTATTATTGCTTCACATTTTTTCAAA CAGTAGAATACATTAAAGTAATACAAATAAACAGCACTCCACATCCACTC TCTTCTCACTCTCTGTTTTTTTTTCTCTTCCAGTATTCTGTTTGCTAACT TTTTAGATTTCCTGGATGTTACATTTGATGTCTAGATTGAATGGTAATTT ATGAAAATTTGGTTGAAAAATTATTTTGAACAATTGCTCCATCTGTTTCA TCTCCTTCCTTTTGCTCCATTATTATGTGCATTCAAGTGAGCCCTCTCTG TAGATGGAATCACGGCACTGTGATAGTTCATGAGTGGGGCAAATACTGCT TAGGGTGCAAGCCTATAATGAGCTATACAGAAGGGGGCTGTGATAGCACA CGTGAAAATGGGATACTAGAATAGGGAGAAATAAACCATGAATGAGAGAG AAGACTTTCGAGCATATAGAGACTTAATTCTTCTTGCTTGCGTAGTAGCA TGTATATTTTGAAACCCAAACCATTCATAAGCTGTTGAGTTCTTTTGTCT AATGGTGTCCCTAACGAAAACGGCTGACCAACACAACTCAAGACTCATCT GTATCTGCTAACACAGCTTGGACTTCAACAACTAAAAACTAACAATTAAA GACATGGCATATGATGCTACATAAAGTAACACTAATGCTGACAAAAGGTA TCTATCCATATTGGACTCTGCTCACACCTGCAGGCTCGTTATCCATGAGT CTTTGCGCTTTGCGGTCGCTGTGCACTGGCCTGGCTTACCCGCGCAAAGA CTTACAGTCCACTCCATCGTACCTCACAGAAGGCACTTGATAAATGCAAG TTCTCAGTGGTAGATTGTCTCTTCATAATGTGTTTGCCTTTGCAATGAGA AAATGAAAACATTCCTGTTTTCTTCAAGTATTTTTGTTCTGGTGTGGAGT AGTCTAGTGTTGCACTATTACCTAATTTCTTTCTGAATGTTTGTTTGGGT ATGCTTTGTACGAGTATGTTATTTGGTTGGATACAAATGTATCAGTATAC AGCTGTGTACAATTCTTAAAACCAAGAAAGACTAATGTTGATCCTTATCC ATTTTTATTTTATTGATAACAGGAATCCAAGTGCGTTTTAGGTGCTTCAG GACAAGGTCTAAAAGGCAGGTCTGCTCTACAAGTATGCAGGATCTCAAGC TCAGATTTCAGATATGGCAGTTCTTGTTCAAAGCCATTGGTGATGGGAAG GCATTCAGGATTTCAAGCGATGCCTCACGCCTTTTCTTTCATC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.