Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA020780

[Submit comment/correction]

Sequence	AA020780
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA020780
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGACCCAGCGGATTCGATCCCCGGAGGATGTGTATCATTTTCCATAGTT TTAAGGAAAATATTTTTTAATTACTCTCATAGCGGAACATTTCCAGTTTT ACCCTCACTGCTACAGTCAACGAGTCGCTCCTTTCTCTCTGTATCAGATC CAGCAAACATCCCCTTCCCTGTTCTCGCCGCAGTCGCCAGCGCAGCGCCT CGCCCCTTCGCCGCCGCGCCTTCATTTCCCCTGGATTTAGGGGTAACCAC CTGGTCTCGCGCAGCAGGAGGCCACCGCGCGGGAGCTCCAGAACCTACAT CAGGCGTCGCGGCCGTGTAGGCGCGCCTCCTCGATCTCAAGGCAGCAGAG CTAGCGAGGGCGAGGAAGCCCAGAGCAAGGCGGGGGCGCTCCGGGAGAGG CGAGTTGAATGTGAAAGAGCTGGCGGCAGAGGCGGCGTCGCTGCGATAGG GGATAACTTCTACTGCTCTGTCTCCCATTCCGTTGGTCTAACTCTTCTTC CACCTTCACAGCAGCCCAGTCCAGGTACTATTGCTTGGGTTATGCTCTGT TACCTTTCTCCATACTTTTTATTTACTGCTTACGTTTTCTTTGGTTTGAT TCATTAGTATCTTCTTGCTGGACTCGCAGGTTTTTGTATGTCAGGGAACT CACCTGTCTCAGTACATATTATACCAAGCTTTATTGTACTTAATAATTTG CTGCTGCTAGATGTGTATTAATTGCTGATGAGTTACTTCTTTTTTAAGCT ATTGCGGCATGCCAGTTATTTCTTAAAAGTTTCCGACAATACATTCATTC ATTTATCTATTCTTTGTAAAGGTTAGGCATATCCATTTACATGAACTAAC CGTGTGTTAAATGTTTTTGTGGTACCAGGTGATGGATAATACAATGTTGC ACACGTCACAACACACAAGTGGGGGGACATCACAATTCAAGTTCGAGTTC TTAAAACAGATTACTAAGAATTTTTCCGAGGACCGTATAATTGGTGATGG TGCCTATGGTGTGGTTTACAAGGTATCGTTGTTATTTGCATCTTTTACTT GGGCTCTTACTTTTGAAACAAGAAAAGATAACCGCTAATTACAAGTGCAC TTAGTCGGTATTGATTAACATCGATTCTTCTATAGGGAGTCATGGACGAT GGGCAAGAGATTGCTGTGAAGAAGCTTAGAAACAGGCATCTAGACCATGA CAGCGAGAAACAATTTCACAACGAGTGTATTAACCTTATGAAGGTCCAAC ATCAAAATATTGTGCGGTTGGTTGGCTACTGCGATGAAACCCATCGTCAG TGTGTTGAACATGGTGGAAAACTTGTTTTTGCCGAGGAGAACGAAAGATC ACTCTGCTTTGAATATCTGCAGGGTGGAAGCCTTGACAAACACGTCTCTG GTAAGATAATGTAGTATGTACCCAATATTATTTGCGTGAAGAAAAATGTT ATCCCTAAACTTGTGATTTTTTTAATCAATCCCTTAATTCTCGTCTTCGT AATACATTTCATGTCTATGTCCGCAGACGAACCATGCATACTTGATTGGG ACATCTGTTACAAAATAATTAAGGGAGTCTGTGAGGGACTAAATCATCTT CACAATGGATATAAAGAATCTATTCTCCATTTGGACTTAAAACCTGCAAA TATATTATTGGATAACAACATGATTCCGAAAATTGGAGATTTTGGTTTAT CAAGACTCTTTTCTACAACAGAAACATGTTCTACAGCAACACCTTTGGGG ACAACGTGAGTTCATACCTGACTGAAGTAATCAAGTCCTTATATAATTTT GTTACAATGTAATTATATTTGATACCATGCAGGGGATACACACCACCAGA GTATGTGGACAAGCAAGAAATCTCACCAAAATTTGATGTATTCAGTTTGG GTGTTGTAATAATACATATAATGGCAGGACGCAAGCACTATTATGACCAT GTGGATAATCCATCAAAAATCATTGAGCTTGTAAGTAAACGTTTCTGAGT TATGCTGTGTCTTACTCATGCTCTGAACTTACGCAGCGTGTCAACATTTT GCTTCCATTTTTGCAGGTATGTGAAATCTGGGGAAAAAAACTACATGCAA CGATGTGGTCACATGGATCACAAGAAGTTAAGACTTGCATTGAAATAGCG TTAACATGTGTGGAGTCTGACAGACAGAAAAGGCTTACTATACGCCAGAT TGTCGATGAACTTAATAGGATTGATATTGCAAAAATGCCACGTACACACA AGGTATTGAGAGATCATTGATATTTTTTCATTCTACCTATGTCAACTTTT TTTGAAAATACAATAGAGCTATAAGCCAATGAAAATCATCATTGATCTTT TTTTCATATTGCATTTAATGAAAGGGTCTTAGGGGATTTGTAGCTATAAT TAAGTACATTGTTGGATTTGTACTAATAGTTCAGCATAAAGTTTCTGAGA TGACTAAATTGTCTATCATTATCATTGCCCATAAAGAATGTATCGAATAG TAAACCGCACTATATATATGTACTATGAAGACAAAAAAAAGTTATGTTTG ACAATAAATATTTTGTAATTAGTTCGTTAGAAATTGTTTCGTGCAGTAAC TCCCTATCAATAATTGATCGAGATCTAGTTTATGTATCTTTTGAAATGTT GGGGTACAGGACTTTTTTTTTTCAGATACTGCCACAGGAGTTGCCTCCAT AAATATGGACTAAAGCTCCACAAATTTGTTGTTGTAGGCCACCAACTTAC AAAGCAGGGAGGCCTTGGTCTACAATGAACACACCAACTCAGGTCAGTAT CTCAATTAAAACAAGATTTATGCGTTTTGAAAAGTTTGCAAATTTCAGTA TGTTTCATATGGATAAATGATGAAGATTCGAAATAGTCTCATTTTTCATC AATCATAAAGAATTGGCTCCTAAGGATGTCTGCTCTTGAATATAAGGCAG CCAAGTTTGCACGGGAATCAGCATGCAAGCAGAAGGAATATTTTCTGTAA AGTTAGAATTTAATCCATATCTGTGTACATTCTAAGAAGTGAGTGGAGAG GGTCGTTGTACATAATCCGGTGTTCTTTAAATGCAGACATGCATGCATTT CTCCAAATTAATAAAATGCGCAGGGTAAAAATATAAACATTTATTTCTGT ATTCCTGAATATTACAATTGCATTTCTGCTAATACGAATTCCTAATGAAA ATCCTAAAGGATGAATAACTTCATTTTCGGGCTTTGTGTTTTTTAAATTC CTTCAAAACCATCTATTTGTAATAATCCATTTTGGTTGAGTGTACCTTCT GGTGTGGGATAGTGGGAATGATTGTTTTACACAATTTCTCCACTGTGTTG CAATAATGTAGATCACTGTTTTTTGTTTATCTAAAAAGTTCTGATGTATT TACTATCTTGTCGGTTTTGATGGGGTTGCATGACAACGCCAACCGGTTTG ATTCAATGGTGGGTATAGACTATATACCAGCAGTGTTGGATGAGGTGGGA AGCGAAGATAGGTCGATGCATGGCACTATGTACCAGGATGCTGCCGACCG CATGGGTTATGTGCACAAGTTCATCAATAGGTTAACATTTATATTTGCCC GTTTTCATTTTCAAGAACATATTATGTGCTTTTTTACTTAGTATAGAGTT GTCATTTGAATTCTTTAGGTACCCGGCGTCCCGCGCTATTGGAGGGCATG CATCTAGAGCTATTTCGGAGCATCAACATGTGGACCAGATAACCGAGGTC GACATCCCTGGTGATGGACATCTTAAGAGGAACCCGTATCTAAGGTTTAT TTTTCATTTATTTTTGCTTGGGGCGCTCTGCATTGCTGGTGCCAAATACT ACTATGTGTGTATTCGCAGTGATATAAGGTTACATGTTTAGAGCCTTCTC CTATTTCTGCTATGGTGTGTGCATTCTTTCACACTAAAAGGTGTTATTCC ATCTATTTTGAAATAGGTGACGCTTATTAAATCATGTACTTCCTCCGGTC TGGTTTATTAGGCACGCACGTAGTTTAAGAACAACTTTGACCAATAATTT TGATCAACAAATTTTACATAATATGTCACAAAAATTATACCATCGGATTC ATCTTCAAAACTACTTTCCAATGGTATATTTTTTTGGAACATATGTTGCA TATTTTATTGGTCAAAGATTTTTTTAAACTATGTGTGTGCCTAAAAAACT GGACCGGAGTGAGTAGAACTATAGAGGTTCATTACAGAAATAGTACTGCC AGCTATTTATGAAATTATAAGTTCCACAATGGCTGTGTGGCACATGCGTG TCCTCGCTTGCCTGGGGCGCACGTGCATTACGCGCTGCTGGAATTAGCTA ATGTGTGCAGTGGCCCCCATCTAGTACCGGTAATTAATGGTGCCGAGTGA GACCCCAGTTTCATTTGTTTTAGTAGTCATGGCGCACAGCAAGTTGGCAT GTATCTTCTCTTGTTTGTTTAGGAACCGACAGGTAAAAATACATATATAG AAAGTTATGCATTGTTTTAATCCAAGCCGTTATAAATCAGGCCACATAGA TGGAGGCCAATTTTTTCTCCGTGGAACTTTTGGAGACTTTATAATTAATA TTGTAATAGCCATGTGCGACTTATTGTAAACGAGCATTTTACTACTCCCT CTGACCCATATTAGTTGACTCAACTTTGTCTAGATTCATCCGTATCTAGT TAAGTATTAAGTCTAGATTCATTCGTATCTAGACAAAGTTGAGTCAACTA ATATGGGTTGGAGGGAGTATAAGTTTAAGGGCCTAGAGTACACCATAAAC TCTTTATGAAACAAATAAGTTTAAGTGCCTACAATACACTATTTTGAGGT TAACTAAATCAAAATGAGACGCATCAACTTGGAATGATATCCTTTTTATT TTGTTCCAAATTTGGACATGTGTGAGTGTTATGATTTGGTATGGCAGAAA ACAACACTCGGCTATAAGAAAAGAATAATTTAGTGTTGAATGTGCTTATT ATTATGCTTTTACATTAATATTAGGTTAGAATGAGTTTACATTACTACTA CTTCGGGTTTGCTTTTACGAATGCAAATCTTTATTATTAAAAGACATGTT GATTACTTGATTATCAAGGACTTATTTTAAACACACTTTGAAATTTCATT ACTCTTTCTGAACCTGGCGATAAGTTATACATGGAAACTGGTTCAAAGAT CAATTACAACTATGATTTTTAATTAGAACCAATGTGTGGACAATATAATT ACATCACACCCGGCTTATCATACCTATACCTTTAACTTTAATATTATCTA ACCAGACAATATGCTATGCTCATTCTCTCCACCTTGTCGACAGGGCGGAA AGAAACCTTCGTACTCCAGACACCATGGGCATAGTGGATACTATTGGGGT TACAATTGGTTCCAAATTGTGTGACAATCTTTTTCGGTGGGCTAGATCTA CTATTTCATCCCAATGGAGCGGCACTGAGAGGCAAAGGCTTCATCAGGAA TTATTATGCCTCAAAAGTGGCCTAGAATACCTTATGGATACTCTTCCCGC AATGTATGACCTCATTGATCGAGCAGAGTGGAGAAGCCACAAACGTCGTG TGGCTGAGCTCCTTCCGAATCTCAAGGATGCAGTGTATGATGCTGATGAC CTTCTTGACGAGTTCAGATGGTATATGCTAAATATGGAAGTGGAGGGGAA TGAAAGCCAATCTCTTTCAATGGACTTCTTCAATGGTGTCATTCAAGGAA GCTTTATCAAGTCAGTGAATGGTATCCGGGATAGACTGGATAACATATCC ACTTGCCTTATAAATATGGGGTTACATGAAGTATCAACGCGGTTTGAAAA ATCTGTCAGGCCAGAGACTAGCTCTTTCCCAAGTGAAGAAAATTTTACTG GCCGTGAGACGGAGCTAAAGAATATAATTGAATTTCTTTGCGAACCTAGA AATAGTAGCAGTGCTAATTCCAAACGTCAGAAAGGAAATAGTGCAGTCGA TGTATCAACAAGCATATCAACACAAGTCAGCAGTCAATCAAGCAAAACAT ATCTTCCTGTTTTACCAATAGTTGGAATTGGGGGTGTTGGAAAGACCACT TTGGCTCAGCATATTTGTAGTAATGCACGAGTGAATTCTCATTTTGATAA AATAATATGGGTTTGCGTTTCAGATGACTTTGATGTGAAGAGGTTAACTA AAGAGATCATAGAGTCCTGTCCTGGAAAACAAGCAACAACTGAAAATTTG AATTCTCTTCAAAACATTCTTTCTGATATTGTGAGTAGTAAAAAGTTCTT GATTATCCTTGATGATATGTGGGATGATGCTTTGAAGGAAAATGGGCAGT GCTGGAAGAGGTTTTGTGCACCTTTAAAGAATGTCCTACAGGGAAGCGTT ATGTTGGTCACTACTAGATGTCAGAAGGTTGCTGAAAAAGTTGGCACGAG GGATCCCATTACATTGGAAGGTTTAAAGGATGAAGTCTTTTGGAATTTCT TCAAACTATGTGTGTTTGAATCTGGGAGTTCCAATAATAATGATCCTGAG TTGGAACACATTGGCAAAAGCATAGTTCTTAAGTTGAAGGGTTCTCCTTT AGCCGCCAAAACTCTTGGACGAATATTAAGAATGAACCTTCAAGTAGAAC ATTGGAATGCTATACTAGAGAGTGAACTGTGGAAGTTGAAGCAAGAGGAT ACTGAAATTTTGCCAGCCCTTCGGTTGAGCTACATGTATTTACCGTTCCA TTTGAAGAGATGCTTCTCACTTTGTGCCCTTTACCCCAAAGATTACAAAT TTCAAAAGGGTTGTTTAGTTGAAATTTGGGTGGCGGAAGGCTTTGTGGAA CCTCAAGGCGGCATTCCAGTCCAAGATATTGGTTGTGAATACTTTAATGA CCTTTTACATCGGTCCTTCTTTCAGAAAGTTCAAGATGAATATGTAATCC ATGACTTGCTGCATGATGTGGCACAAAAAGTTTCGGAGTTTGACTGCTTC ATTTTAAGAAGAAGGAGTGACTTCAATATTATTCCGCCGAATGTTCGCCA TTTGTCAATACTCTCTAGCACAGACGTTGACTATTCCAGTTTGAAGGGTC TAAGCTGTTTCACAAAGCTCGGTACCCTTATTTGCAACAAGCCTTTAGTA AAGAAGACAATTCCACCTAGTTTGGTGGCAACTTGGTGCAGTGAATTTCC TCGCCTGCGTGTGATTGTTTTTGCCACTACCTATGAGTTACCACCCGGTA TTGGCAACTTGAAACATCTTCGGTACCTTCAGATCTCCAAAGCATGCGCT TTCAAGAGTCTTCCAACAGAGTTCTTTTGGCTCTATAATCTGCAGATTGT TTGTGTCCAAAAATGCAAGCTTGAAAGCTTGCCTACTGACTTCAATAAGC TAATATCCTTACAGAGATTTGAATCACATGGATTTGTCTGTGATTCAAGG TGTAGAAGATTTCAGGGAGAAGAATTTTATTATAAAGTATCGGTTGATGC AGCAAATGATGAGCATGGACTAGGATTTAGGTTGATAAAGAATATTAACC AAATCGGTGAACTAGTGATATATATTGGCAAGCCAATAAGCAAGGAGCAT GCAACAGAAGCCCAACTACATAATAAGAAATATCTTGAAAAGCTGAACCT GAAATGGTATTTGTGGAGGAATCCAGTGGACAATGTCATAGACGTGCTTC AGTGTTTACAACCTCCCACCTGCCTCAAGTCTCTGCTCCTTAATGGTTAT CGAGGTGTGTCACTTCCAAGCTGGTTTCAGCCACATAATTTTCCAAACTT AATGCCACCTTCCTTTATTAGCGTTGATGGACTTGGGAGCTCATCGGTAC CCAGTATCACAGATCTGATCATTGATCGTTGTGAAAATTTATCAAGCCTC GACCATGTTATACATCCAGCTTACATAGCGTCCCTCAAGAAAATGACAAT TAAAAATTGCAAGAATTTAGTGTCAGTACCGGCTGAAAGATTTGGGGACC TGCGTTGCCTTGAAGAATTGGAGGTGGAGGCATGTCCAAATATATATTCC CAAAGTTTGGTTGCACCTTCTCTCAAGAGGCTTGTGCTATCTGCCTGTGG AGATCTTGCAGAAAACATTGACTGCTGCTCCCTCACCTACTTTTTCCTGT CATCCAAGCAACTCACATCCATCCAACTACAGAATTGGAATCTTCCAGCT CTAGAGGAGTTGCACATTTCAGCATGGCGATCTCTTAGATCTATTGTTGG ACAATCTGAACAGGTCACCATTAGAGGCACTGTCAGCGTTAGAGCATTCC CATCTCTTACTTCCCTAACCATTGAGAACTGTAATGGGCTGTCAACCATT GATGATCTCTTAGCTGAAGAATATCTACCCGCCATTGAGAGAATTCATGT TATATATTGTCAAGGGTTAGTGTCCCTGCCTAGTGAAAGGTTTGGTAGTT TTTCATCTCTAAAGGCTTTGGAGATCAGTGATTGCGATAGTCTCAGCTGG AGGAGGGGATTCGTGTTACCATCTTCCCTCCAGATTCTGTCCTTGGATGC TTGCGGGGATATCTCTGCGTGGGTTCCCAGCTGCCTACAAAACCTTGCAT CCCTTATCGCGTTAAAGATTGGTCGGTGTCAGCATATAACATCCATTCCA GGCAGCCTTTGGAGCACTAATCTCACATCACTTGAGAATTTAATGATTAT GTGTTGTTATAACATTATATCAATTGGGGGAGAAAACGCAATTTCGGAAA TAAAAAATGTCAAGATTTGCCGCTGTCCAATGTTGGAGGAACTAAAGCAG CCCATGTTCAGAGGCAGCTACTTAATACCAGAGTATGGAGTCAGCTGTCC TCCCCTACGGTACGTGCACTCTTGTGATCGATGTACGATTAGACACAAGT ATATTAGGTGACATTTTTGCTCATAATTATATGTGCACATGTATTTCCCA AAGTTTAACCACCCTTGACTTTACCGATCAATGTTTTTTTTGGTGTAGCT TCTCGAGTCTACGACCAACTGGGGAGAAAAATCTGAGCTCTTGGCTGAAA CGACGACGTTAAACCATGACAGTCCTTATTGCTCAAGTCTTACTCTATCC ATCACTCTGTCCGCAGTCCATATCTACGCTCATATATAAGTTGTGCTATT TCAATTATCACTTGGCTGGAGCTTGTGAACTGCAAGGAGTTCGGTCTCTC CAGATTCGGCATGCTCCATTTCTGCAATTTCTATAAGCGTGGAATGTGTG AGGACAAAACATGTATTTTGCTGGGTACCTTCTGTAAGCGTGTATGTGTG GCATTGATTTTGCTTTGTGCTAAGCCGGTGTAATAAGTACAGTTTTGATC AGGATAATATCCTCCTCCTGTGGGAAGTTAGTTTATGGCCGTTCTCTTGT CAAGGCTGTAGCAGTTCAATTCCTGATGCGGTTGCTGGTGCCTGATGTGT GATAACTGAATGTCTGAATGATCGTTGAGCATTTGCAAAGCCTTGGCACC AAAGATGATCCACAGCATTATTGCTTGTATTTTGAGCGCTGATCTCATTG TAGGTGAGGCGCCTGTAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.