Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA017853

[Submit comment/correction]

Sequence
AA017853
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA017853
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TCAACGCTGACATACGGGGCCCAATGGAAGGCGACCTACCTGTAAGTGAT
ATGTCGGCGTGGCAGCAGCATCTTACAGGGATGGCAATTTAGGAGCCCGA
GGCGTCGTCACTCCATCCGGGCTCCCGGTTCCCAAAACACACGGACCCAT
GCTCCGCGCGGCTAAACCCCACGACCGAGCCGTCCGATCGGTATCCGACG
ATCCACCTCGGCCGTCCACGTAGGCTTCCGTCTTAAACCACAGCACCCTC
TTCGTCCCCCTCCTCCTTCCTTCCCCATCTCTCTCCCAGGGACCAAACGA
GAAACAAACGCCTCGCTAAATAGGACTCACGAGTCTTCCACAGTCCGCAA
CACTCCAGCTCCTCCTCAACTGCCCCCGCTGGCCATGGTCTCTACCGGCG
CGGCCGCCCCGAAACCCTAGCCTCAGTGGCCATGGGCTCCCTCGACAGCA
CCGCCGGGTCGGGGAGCTACAAGCGCGCGACGGCGGCACCGGCGCCCCTG
CCGCTGCCGCGCGCCTCGGCGGGCGGTGGAGCCGCGGCGCGGAGGCCGAG
CGTGAGATCCAGGCTCGCGCGCTTCCTGCTCGTCGACAAGGTGGACTACC
TCCAGTGGATCGGCACCGCCGCGGCCTTCTTCTTCGTCACCATCCTCGTC
GTCGCCTTCTTCCCCGGATCGGTCGTCTTCGAGAATCCCACCACGCTGCT
CCCCTCCAGACGCGCCAGCGCTGGCGGGGGCGTTGGGAGGGGCAGCAGGA
CCGACCCCTTGCTGCCTCGCGGGCTGGAGAACGGCGAGGGCCTGGCGTTC
GAGCCGACCAGGCTGCGGGAGAAGTGGGCGAGGGAGCGTAGGGAGGAGGC
TCAGAGCTTGGCGGAGCTCGGGAGGCCCGTCAAGAGGGTCGGGGTCCGCA
AGCCGCGCCTCGCCTTGGTGAGTTGCTGAGCTGGGTGGCGTTCAATATTG
GTTTCCGTTTCCTCGCGATTTTGGTTTTAATTTGTTCCATATCTTCCTTC
GCACTCCGTCTAGGTGTTTGCGAATCTCTCTCCCGGCGCAATGCAGCTTC
AGATGGTTAGCGTCGCATCTGTGTTGGAGGCGATGGGCTACGAAATGAAG
GTGCGTCGCTCCCAACTGATTTGTTCTCAATGTACTGTCCAACGATTGAA
CGAAACACGTGTTACCGTGTCTTCTGTTTCGTCGATTTGTTTGCTTCAAC
AAGTTTGATATCCCTGGACTGGACTGGATGGTTTACCTGTCGTGATCACA
TAGCAAGTTCAGATTCCATTTCTCAAGTATATTCAGTAACTCAAAAGAGC
TGCATTGCTAATCTGTTCGTCTTACTTCCCAAGCAAAAACTTGAATAAAT
ACGCCAAGTTCTGACTTACATTGACATGTAGTATGTACAAGTGCTCCAGT
GTTCTCACTTCCCAGTGTAGCAGTTTCATGATAGGTACCACCACGAGGTA
TCAGAACCTCTTACTTTCAGAGGAGGTAACAATCAAATATATGCCTTGTT
TTAGCAAGGGTAAGTGTTAGTGATGTGTTTGTTAGCCTAACCGAGTATAT
CTTACCTACATATTCTAATTACTATTATGGGCTTAATTTGGAACCCTGTC
GCATGCTTGAACCTAGTTTTCTATTCCCCAAACCTTCCTCGTAGGCTGCT
ACCTCCCTCAGCAAGATCGACAGTTTGATTACCAGCCCTTAGAGATGAAA
TAGGACGTGGATTTGAAATAAAACATGTACTGTATGCACCCATTGTTCAA
ATAGTGCAGTTGTAGGACTATTACTTTGTCTAATATGTACGGTGAATATA
TGGTCATTATGTTGCACAAACATTTGCATATGTTATAACATGATGATGTC
ATTGGTCTAGAACTCAAAGAGTCCAGTCTACTCTCTGGTACAAATGCATT
GTCTAGTGGACCATACTTGCTACAAATACCACACTACTAGTTGATTACAA
AAAAAAGAAAAGACAAATGGAGGCAGGGAGGCAGAAAATACATGACTACA
TGCTGAATCAGAAGCATCGCATCTTGCCATAAGGTTATTAGAGGCAGGGA
GCTAGGGTTCATCTGTTGGGCTTACAAGGATGTACATTTCTTTCAAAATG
GACTCGATCTGATGGGAGCTAATTCTCATAGTGGTTTGCACCAATTAGTT
GATGTTTAACCCAAGTACCTAGTTATAGATTAGTTGAATGACTCTTAATC
ATTGTATATGCACAAGTATCCAAACCAATAATGGATGCACATGTTTGGCA
AATCATAAAGTTCCTGTCTGCCAATTGTTCTTAATCCACTTTGCAAATCG
TCAATGCAGGTTTTCTCATTTGAGGATGGCCCATGTAGTAATATTTGGAG
GACCATTGGCATACCAGTTAAGATCTTACCTGTGGACACAAAATTACTTA
CTTCTGTAGATTGGCTAGAGTAAGTTTCTAAATCTATCTTGTCAGTTCTC
TGCTTACATTACTTACTGCATATTGTCTCGTAATGAAACATTTGTTTCTT
ACATAATATGTGCCCTCAGCCTTGCTTCCTAATCATTTCCTCATCACCTA
CATTTGCATTTCTGCAGCTATGATGGCATGCTCGTAAATTCAATTGAAGC
AAGGCCAATATTTTCAAGGTAGTTTTGAAACAATGACTGTATGACTATCA
ATTTCAGATTATTATAAGATGTTTTCCCAAATCAGGTGTTTGATTTTGAC
TGTGTACCGAATGTTTTCCCTAAAGTTTAGTTCTGATTTTGATGTCTCCT
TCTGCAGTCTTCTGCAGGAACCCTTCAAATCCATACCTGTCATCTGGAAT
GTGCAAGGGAGTTCCCTTGCTCATTGTGTTAGTGAATATAATTCTAGTGG
AATGATTCAGATCCTAGATGGTTGGAAAGAAGTCTTCAGCAGGGCAAATG
TTATAGTTTTCCCCAACTACATATTGCCGGTATACAGAAATTCTCATACT
AAATTTGATGTGTTAATTGCTGTTTTGTGTTTTGATTTAGAGCCTCCAAT
CTGACATTTGATTATTTAATTATATTTATTCCTGCAGGTGTTGTATGCTC
CATTTGATTCTGGTAACTATTTCGTGATTCCAGGTTCTCCTGCAGTAGCC
ATTCAAGCTGATAGATTCATTGTCAAAAGCTATGACCAGGATGTGAGAAT
CAGGCTGAATTTAGGTTCAAGAGATTTTGTAATTGCTTTAGTTGGTAGTC
AATTTTCATACGGTGGGCTTTTGATGGAAGAGGCACTTGTGTTGCAAGCA
GTAGGGCCTCTTTTACAGCAGTATCCTTCTGAGAATAGCACACATACTGC
TCTGAAAGTGAGAATCTTGACGGCAAACGTGACTGATAAGCATAGGATGG
CCCTTGAGGTTATGATCTACCACCGTACTCTCTTTCATCATCTGAATTTG
CTATTTAGATGCCATAAACCTTTGAATTGCATCTAACTGCTTTGTACTAT
TCTGATTATCATAGGTCATCGCTTTAAATGTTGGCTTCCCACGAGGTGCT
GTGGAGCATGTTGCTGTTGAAGATGCGGACGATCTCCTTGGCATAACTAA
CCTTGTCATATATGGTTCTTGCCTTGATGAGCAGTCCTTCCCCAGTGTGC
TAGTCCAAGCCATGATTCTTGGGAAGCTGGTTATAGCTCCGGACCTTGGA
ATGATAACGAAATATGTATGCCCACAACATCTCATATTTTTTTGGCATTG
CATTTATTAACTGAAATACCTAGTACTGCATATCTTATCATAAGCTAACA
CAGTTTGTCTGAATGGCTTAGATTGATGATGGGATAAATGGTCTCCTTTT
TCCAAGAAAAAATGTTCCCATGTTAACTGAAGTCCTACTGCAAGCGGTTT
CAAACGGGAAACTATCCGTTCAGGGGCAAAAAGTTGCATCAGTTGGTAAA
GCCCGTGCCAAGGATCTGATGGCTTCTGAAGCCATTGAAGGCTATGCTGT
TCTGTTGGAAAATGTTCTCAAGTTTCCTGCTGAAGTACTAACCCCGTTAA
CCTCTGGAGAGATACCTTTGGCTTTGAAACAAGAGTGGAAATGGCATCTA
TTTGAGGATGTGAAGCACTTGTACCATATGAATGAGAGTTTGAATGACTG
TAAGATACTCCAGAAAATAGAGGATTGGCATACCAGCCAAAAGGACGATC
CTCGCAGTACTACACAAAAGATTGATGAAGCGTTCTCTGCTATTGCATGG
AATGAAGAACGGGCAAATGAGATTATGAGCACCAAAATGAAATTGGAAGA
AGAGGAGGTAAGTATTGATGCAAATTTGATGTTTGACACGTCACTTCTCA
CCTTTTGAAGAATGCTTTTTTGAGTAATTTGAGTGGATTGTTATGCAGTT
GAAGGAGAGGAGTGACCAGCCTCATGGAACATGGGAAGAAGTGTATAGAA
ATGTCAAAAGGGTGGACAGAATGAAAAATGAATTGCATGAAAGGGATGAA
AAGGAGCTTGAACGGACAGGTCAGCCACTTTGTATATACGAATCCTTCTT
TGGTGAGGGGACTTGGCCCTTTCTACACCAAGACTCTATGTATCGTGGAA
TTGGCCTGGTAAGCTGTTGTCATCGCTTAGCACCAACCAAGTTATTCAGA
ATCTTAAATTGCCAGCCTGAGTGTTCCAAACGTATATGTTCCAAAAACAT
TTATGATGCTATAAACCAATAAATCAGTAAAATTTGTTGTGAGGTTTAAA
ATAAGTCGCTGACTTTGTAAAATTTTTGTACACCTTGTATCATTCCTGGT
TGTACATGTTAGATGGGACGTCTGACTTTCTAACTTTTGGTAAAACAAAG
ATTGCTTCCTGTCATATAGCGATACTTTTAAATGGAGAAATTGTCTAATG
GAGACGAGACTCATCTAGGAGTTAACATAACTGCCATGTGTACCATTGAA
TTCAGATTTGAGTGGCTCGGATTTGGAGTCATTTGAGGTGGATTAGAACC
CCTCATATTTTCTCAACATGGGGATTATATTCTGAAAATATTAATCCATT
TAAGCCTCAAATAACTTCAAATCTGATCCAACTAAACTTAATCTAAACAA
CCAATGTGGTCACTTAGACGCAAATATGGGTTCACATTACGTACATGTCT
TTTGTTTCTAAATTATCGTTTGCTACGGAGTTGGTATAGACTGGAAAGCT
GTTAAATGATACTCTCTATGTCCCATTATATAAGATACTACAACTAATAT
ATTCACATTGTTTGTAATAACATCTTATATTATGGGATGGAAGGAGTATA
TCATAAAATTCTACTAATAGGGTATATGGGTACGTGGCTAGTCGGAATAT
AAATGATTACTTCTTGCGAATATTCCAATGGCTCAAATTGATCACATGAA
GTTTGCCTTGCATTAGTCTTCAAAAGGTCGAAGACCTGGAGCAGATGACA
TTGATGCTTCTTCTCGTCTCCCACTGCTCAACAATGGGTACTACAGAGAT
ATTCTTGGTGAATTTGGAGCTTTCTTTGCACTGGCTAACAGGATTGACCG
GATACACAAGAATTCTTGGATAGGATTTCAATCCTGGAGGATGACTGCAA
GAAAGGTAATAGATCATTTTTTGACCTAAGGAGGTCCTTGTATTTCGATC
TTTTTAATAATTAGGATCAATTTTCCCAGAAGATGATATATGGAATATTT
AACTTGTACTCCCTCTGTCCAGAAAAGGATGCCGTAGACTTGTCTAGATT
CGCATGTATCTAGACGTGTTTTAGTGTATAGATACATGCAAATCTAGACA
AATCTACGACATCTTTTTCCGGACGGAGGGAGCTAAAAATGATCAGCGCA
GTGTTCTTTGTACAGAACCTGTCATTGGGTGTCACTGAATGTTAGCCATG
CTGTTCATACGAATTTTCCTTTCAACGAGGCAATGCAGAGGGAGGTAACC
AGGTCTTGCATAATGGTTAGCATCTAATTTATACTTACTCCAATTACCGA
AGCAGGTTACCTTGTCAAAAAATGCTGAATCTGCAATATTGGAAGCTATT
CAAACCAAAAAGCACGGAGATACCTTCTATTTTTGGGTTCGGATGGACCA
AGATCCAAGATATCATGCCAATCAAAATTTCTGGTCCCTCTGTGATGCAA
TTAATGCTGGGAACTGCAGGTTATCCATTTAGCCAAGTTTCATAGGTTGC
ACTGTTTTATTAAGTTTCATTGTGTTATACAAATGTTCTACTCCCTCTGT
CCCGAAAAGGATGTTGCAAGTTTCTCCAAATTTGGATGAATCTATATACT
AAATAGTGTAGATACATTCGAATTTAGACAGATCTGTGACATCCTTTTCA
GGACAGGAGTAGTTTCAACATGTTAAGTTATTCTAGAAACATGTTACCAG
CCATCATTTCTTACAGAGTAATATTCAAAAGATACCTCTTTTGATGTACC
GTGTTTTTTTTTCTTTCAAAAAGGGGCATGGCCCTGGCCTCTGCATCCAT
GGATGCACACAGCCTTTTATTGCGAAGTTTCATATTGACAGAACTAAAAG
TAAATTTCAGTAATGGTTTGTTGTAGAGTTTTGGCTGTGCTACCAAACTG
AACTGCTTTGTTTTACTACACTAATCTACTTCATATTTATGTCTTGAAGG
TTAGCTGTTTCGGAGGCTTTTCAAAGGATGTATGGCTTGCAGCTTGATGA
AGATTTGAATTCTCTGCCACATATGCCTAATGATGGAGGCACATGGTCTG
TGATGCAAAGTTGGGTTTTACCTACCAGATCGTTCTTGGAATTTGTAATG
TTCTCAAGGTAAGATTGTGTTTTCGAAGTACTCCTATTATAATTAAACCA
TGGCTTGGCTTGTACTCCTTTTAACTAGATAAGGGAAGCCCTGACTCGCT
ATTGTTCATTTCTTGGTATATGGGGCTTGTACTCCTTGTAACTAGATAAG
GGAAGCCCTGACTCGCTATTGTTCATTTCCTGGTATATGGCATTTCAAGT
GATCTCTTATCATGAGTGCCAAGAAGTAGCTGATCTAAGCCTGTATATGT
TAATATTGCCGCCAACATTGCTCAATGATGTTTAAAGTTGTACATGTATA
TTTTTTATTTTTAAAGTATATATAGCCTTGCTGTTGCATATGCAGACATT
GAGCCATGGTCCAATGAGAACTGTGTTTCAAGTTTTAAGCCTGATATGGT
TGATTCTTCTATATGTATACTCGATGTTACAGATACACTATTTTTCAGGA
TGTTTGTAGATGCACTGGATGCACAAATGTACGACAAGCATCATCAAACT
GGGCACTGCATCTTGAGTATCCACAGTGTGAGTGCCTCTTTTACATACTC
AGAATATCGTTACCTGTCTCATTGGCATAGAACAGCTGAACACTTCTGTT
GAAAGGAAAGATCAGCTGTGCACTTAATTTGTCTATTGAACAGATCCTAG
AAGAAACCATAACATAAATCTTGCCAGCATAACATGGTCATCGTGCCACT
ACCTCTAGCCACTTCTTCTACATGCTTGTGATAAATGATATTAAGTGATA
TTTCTATCTCAAAAGCTTGACACTGTTGCTCTCTTGTTTGACATGTACAG
GACAAGCACTGCTACTCTCGTGTTCTTGAGTTGATTGTGAACGTCTGGGC
GTTCCACAGTGCACGGCGGATGGTCTATGTGAACCCAGAGACTGGTGCAA
TGCGGGAGCAGCATCCGCTCAATGGCAGGAGAAGTCGGATGTCAATCCAG
TTGTTCTCCTATGCGACTCTGAAGGGCATGGACGAAGACTTGGCGGAAGA
GTATGATGCAGATCGCCCCAACAGAAGGTGGCTCTGGCCACAAACCGGCG
AAGTGATGTGGCAGGGTCTGTACGAGCGGGAGAGGAACATGCGGCAGCAA
GAGAAGGAGCGCAGGAGGCAACAGACCAAAGACAAGATCCAGAGAATCAA
GAAAAGAGCTCGGCAAAAGACGATAGGGAGGTACATAAAGCCACAACCAG
ATGATGCCGGTCGCTTAAACGACACAATGACAGTAGATTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.