Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA015800

[Submit comment/correction]

Sequence
AA015800
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA015800
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGATACGGTATCCTAATAACAAAAAAAAAAGAATCCCGCAAAACCCTAGC
AGGTAACACGGCCACGCTCTCGTCTCCCTCTCTCAGCTCTCGCCGGCGCG
CGTCCTTGGCGGCGCGACCAGCAACCCCCCCGATCTCTCGCCATGGAAAA
GGTAATCCAGCGCTCCGCTTCTCCCACCGACGGATCTCCGTGCTGGTCCG
ATGCCGCTGATTCGATTTGTCTTTTGCCTCGTGCAGCCCGCGGCGCAGGC
ACCGGAGAAGGCGGCTCCTGTGGAGAAGGTTCGCGCGGAAGCTGCTGCGA
TGACTTCCTTAATTTGCGTTTTCTTTTTTTTTTATCATCAGCGGCTCATC
CGATTTCTCACTTTTGTTGGTGATCCTAGCAGCAGCTTGACGAAAAGGAG
CTGGAGCTCGAACGGGAGCGGAAACAGAAGAAAGAGCAGAAGGTATGCCT
TGCCCTTTTGTGAATTTCCTCACCCTGTTGGTGTTTGCTTTGCCCTGCAT
TGGTAATTGGTAGTCATATCCTCCAGATTGGTTGGTCAAACTGTAGCCAT
CTGTGGTTTTTGCCGCTATTAAGAGCTTAGTTCAAACCTAAGGTGAAATT
ATTTGTTGTGCGCATGGGATAAGGTCGCTTATGGGTATGATTGTTCTACT
TGCAGGCAAGAGAGAAGGAGGAGAAGAAGCTCAAGGCAAAGCAAAAGGAG
GCCGCCAGGCTCCAGGTCGCAACTTCGTCACCAAATCAGTTTGGTACTGA
AACGCTTAATTGAGATGGTTCCGTGCTGATTTTGGTCTTCTCTCTGTATG
TAGGCTCAAGCTGCTTCCGATGGACCTAAGAAAAGTGAGAAGAAGCAAAA
GAAGAAAGCTGCAGAGGATGAAAATCCTGAGGATTTCATTGACCCTGAGA
CCCCAAGCGGGGAGAAGAAATCACTTGCACCTCAAATGGCCAAGCAATAT
ACCCCAAGCACAGTTGAAAAATCGTATGCTGCTAGTTCGCTTCTCTCCAA
CTTAGGATTCATAGCATCTGAATGCCTTAGCTGGACTCTGTGCCTTCTTT
TTCATAATGTAGGTGGTATTCATGGTGGGAGTCAGCAGGATATTTCGGGG
CAGACCCTGCAAGCTCAAAACCACCCTTTGTTATAGTAAGTGACTCACAT
CTCATGAAAGTTCACGCATCCTGTGCGCTGCGACGTGGGTTAGCAAACTG
CATCTTAGGGAATCACTAGTGTTTTTCTACAAATAAGATATAACAACTTG
TTTCATTTCAGGTTCTACCACCTCCGAATGTAACTGGAGCTCTTCACATA
GGTCATGCACTTACAGTGGCTATAGAGGTATTCGTCGTTATGCTTGTAAC
ACTTGGTCATTCAAGAATGACGACACGATGATTTTAATCTCCTTGCTTTT
CCTAACAATCCAGGATGCTATGATACGCTGGCGGAGAATGTCAGGCTATA
ATGCTGTGTGGGTCCCAGGAGTGGACCATGCTGGCATTGCTACACAGGTC
TGCATTTTAGCATTTTAGCTTTGGTTCACTATCTGCTGAAGTTCATCTTC
TGGAAGACATACACTGATAATTGAGTTCCTTATAACTTCTTTTTTGAGAA
AATGCAAAGGACCTTGCTGTCAATCAACTTACGGACCATGCTGGCAGTGT
TAGTTGTTGATGTCCCACCACTAAAATAAAGCTGTCAACAGTGGATTTAG
GTCCTGTTAGTAGATGTTATGTCTGCAATAAGACCAAACAATTCCACCAT
AGTATTTGCAACACCTTTCCAACCACAAGATGTTTCTTACTGTTCTACTG
CTTTACTTTACTGGTTGCCAATTTCGCATGCACCAAAATAGAAGAAATGG
CCACATGGATATTTTAGTTTTTGTGAAGATCTTGGCAGAAAGATGTACCT
TCTCTTTTACTTTTTTACTTTTAGCAAATTAAAATAAATATTTTATGATG
TTGAACATATTTAATTATTTTGTGTTGACTTCAACTTGCATTATCCTCTC
TGGACTAAGCTAGCACTGTAGACCTTGTACCTCTGAGTTTTGTTTTGTTT
GCACTTCACATGTGTTTGGAGTGATGAATTTAATTTTAACAATCTGTTCT
GCTAAGCCAGGTTGTAGTTGAAAAGAAGCTAATGCGTGAAAGGGGGCTGA
CGAGGCATGACTTAGGTCGTGACAAGTTCGTATCTGAAGTAAGCACCTTT
TCCCTTTAACAGATGTTTATTTTTTTATGTTGTTCTGTGTCCTATGTCCT
TTTGATCATAAATCATTGAAGTGCTTAGCTATTCCCTTATACTTTGAAAT
ACTAATAATGGGCGCTGCATCTGATGTAGTAATGAAAATCATAGTGGACC
TGTGTGGATGTGAGAATCATAGTGATCTTAATGTGATTCCAGTTTGGTGT
ATTATTTCCTGCTTATTCAATTTTTGTTATCATCTTCTGTACAGGTTCTG
AAATGGAAAGATCAGTACGGTGGTACCATATTGGGGCAGTTACGTAGGCT
TGGGGCCACACTTGATTGGTCCCGGGAGGTAAAGTTCCTATTTGTTGTAG
TTAAGAAAATGTACATGAGTAGCACATTTCTTATACTCTTTTATTTCTTA
CTCTGAAATTACAACTTTAAATTGTGCATCAGTGTTTCACAATGGATGAG
CAAAGATCAAAAGCTGTAACTGAAGCTTTTGTTAGGTTGAACAAAGATGG
CTTGATTTATAGGTTAGTTTCCTCACCTTCTGTTTCTGTCAGTGTTAGTT
TTTTTTTTACTATCACCTCTATGCCATTCAATGACCAACGAAGAGCTTTT
AACCTCCTATATATGATTTGGTACTTTGCAGAGACTATCGCCTTGTGAAT
TGGGATTGCACACTTCGAACAGCAATATCGGACATAGAGGTTGATGAAGC
TTATTATATTGTTGTCTAATATTGGTTTTATCCCACATACACGACTATGA
TCAACCTCTTAATTTAAAATGCTGTTTTCCCAGGTTGATCATTTAGAGCT
TAAAGACGAAACTATGCTGAAGGTCCCTGGTTATGGCATTCCTGTACAGT
TTGGTGTGTTGATTTCTTTTGCCTATCCTCTTGAAGAAGGACTGGGTGAG
ATCATTGTTGCAACAACAAGAATTGAAACAATGCTTGGTGATACCGCAAT
AGCTGTTCATCCTGAGGATAAAAGGTATAAGCATCTGCATGGAAAGCATG
CAGTTCACCCCTTCAACGGCCGAAAACTCAAAATAATCTGTGATGCTGTG
TTAGTGGATCCCACTTTCGGTACTGGGGCTGTCAAGGTAGGTCATAGTGC
CAAGGGCTGACTTAATTATCTTTATTTTTTTCCTAGTTGAACCTTCTGCA
TATGTACTCCCTCTTAGCTTTTGTTGTTGCGTGCTCTTTATGCAGATTAC
ACCGGCCCATGATCCAAATGACTTTGAAGTAGGAAAGCGACACAACCTGG
AGTTCATCAATATCTTAACAGATGATGGGAAGATAAACAGCAATGGAGGT
GCACAATTTGAAGGAATGCCAAGATTTGCTGCTCGGGTTGCTGTTATTGA
TGCACTGAAGGAAAAGGTATTACTTGTTTCATTTAGCTAATGTTTCATAA
AGTTTATGATTTAGTTCTTAAAAATGGTTGCTGGATTATTGTGTTGATTT
AGTGTATATTTATGTGATGTCATACAAATTTTCATTGGAATGGCAAGGAC
AATACATTTTAAATATATGGAATTTTGTAGTGTAATATTCACATTTCTAT
TTTGCTAACATCTGTTACAAAGAACAAAATTGCTAAGTAAGCTATATTGA
TTCTTGTATAAACATCTCTACTTTTGACATGGTTTTCCTTCAACTGTTTT
GGTTAAATTAGTCAATGAGTCTCAGTACCAGAGGAGTATGTGTTTTGGTA
CTTTAAGTATATGTTGCTTGGAGACTTCTTCAGTTACACCATTGTGATTG
GATATCCATAATAATGCCTCTCATTTCGTAGAAATATAATTTGCATGCCT
GTTAAAACCAGTGATCAACTATTATCTTTACTTGCCTTCCCCGATTCTAT
TTCATTTCAATTTGGCTTTACTTGAGTAGTTCTGGGTTCTGGACTAACAA
TGTTTTGTTCTGCTAACTAAGGCTGCTCTCATTTCATAGAAATATAATTT
GCATGCCTGTCGAAACCAGTGATCAACTGTTTATCTTTACTTGCCTTCCC
CAATTCTATTTCATTTCAATTTGGATTTACTTGAGTAGCTCTGAGTTCTG
GACTAACATGTTTTGTTCTGCTAACTAAGGGCTTGTACAAGGAAACAAAA
AAGAATGAAATGAATTTGGGCATTTGTTCAAGAACTAATGATGTAGTGGA
ACCTATGATAAAACCCCAATGGTTTGTTAATTGCCATACAATGGCAAAGT
CAGGTCTTGATGCTGTAAGATCTGGAAAAATTGAGATTATTCCGCAACAA
TATGAACAAGACTGGTACAGGTATATTTTTGTCTTCTTTTGCCTAGTTGA
GGAATGTGCTACCTTTTGCAGATTTCCTGAAAAAGTAATGAAATATGAAG
AAACATGATCCATCCACCATTGTCCTTGCAGATGGCTTGAAAATATACGT
GATTGGTGTGTTTCGAGGCAACTCTGGTGGGGACATCGTGTGCCTGCTTG
GTATGTGACACTAGAGGATGACCAGTTGAAAGTTATGGGATCCAACAATG
ACCGTTGGATAGTTGCACGAAATGAGAATGATGCGATCCTTGAGGCACAG
CAAATGTATCCAGGGAAGAAATTCCAGTTAAATCAAGACCCTGATGTGTT
GGATACGTGGTTTTCATCTGGTCTTTTCCCCTTGACAGTCCTTGGTTGGC
CAGACGATACAGCTGATCTTCGTGCTTTCTACCCTGGTTCAGTACTTGAA
ACTGGACTTGATATTCTCTTCTTCTGGGTGGCACGAATGGTAATGCTGGG
TATGCAACTGGGTGGCGATGTGCCATTTCAGAAGGTAATTTCACAAATGC
TATTTCTGCCAATTAAACTGTATTCTACAATTGTAATGGTGCAATGTACA
TGTGTCATCCAGGCTGCATACTATTTAGCCGATAGCTATCCCTGCCTTGT
ATGTCCCCTTCAGGCCTTACATGGTGAAACCGTGCTTTAGTGTAACAGTA
CAACTATGTTCAAATCTCAAATGTCCACAATTGAAGCAATCTACATCAAT
ATTCGCAGTTTGAACATGTGGATGCTATTAACAATAAACAGACAAACAAA
TGTACTTCTTGAATGGACCAAGGAACTACACATTTTGAATTATTGTGTGG
CTAGTTAATTTTAAGATACTCCTCGTGTTCATCATCATCCTTTGGCGGAG
GGTACTGTATGCTTGAAACTATCATGTATATCAAATGCATGAACTCATCA
GCGTTACCTTCTCTTTCTGAAGTTACGTATAAACATACCTAAACAAGCCT
AAGTTTATCTTCAGTTCAGTTTTAAACTATACATTACATGGGAATTCTAG
TCGAATATATGCCTTTGTTGTCTTGCGTCCTGAGTCATGATTACACCCTC
TTTTGTAGGTATATTTGCATCCTATGATCCGTGATGCACATGGCCGGAAA
ATGTCCAAGTCACTTGGTAATGTCGTTGACCCCCTCGAGGTGATAAACGG
TGCGACGCTTGAAGAGCTCCTCAAACGTTTGGAAGAAGGCAATCTGGATC
CAAATGAATTAGTTATTGCAAGAGAAGGGAAGATAAAAGATTTCCCTGAT
GGCATTCCTGAATGCGGCACTGATGCACTACGTTTTGCACTGATTTCTTA
CACTTCTCAGGTTATAGGCACAGCCATTTGAGTTCCTGTTGTATTAAGTT
TCTGGTTCATCTTTTTATAGAATCTCTCTTGTTTTGCAGTCTGACAGGAT
AAATCTGGATATCAAGAGGGTTGTTGGATATCGCCAATGGTGCAATAAAT
TGTGGAATGCCATTCGATTTGCAATGGGCAAGCTTGGTGATCATTACACT
CCACCGGCAACTATTGTTGTGTCTTCTATGCCTCCAATCTGCAAATGGAT
ACTGTCAGTACTTAATAAGGCTATTGGCAAGACTGTAACCTCATTAGAAG
CATACAAGTTCTCTGATGCTACATCTGCTATATACTCATGGTGGCAGTAC
CAGCTATGTGATGTATTTATAGAAGCTGTAAAACCTTACTTCTTCAATGA
CTCTCAAGAGTTTGATTCAGCAAGAGCTGCTTGTAGAGATGTCCTATGGG
TTTGCCTCGACACTGGTTTGCGCCTGCTCCACCCGTTCATGCCTTATGTA
ACAGAAGAACTCTGGCAGCGTCTTCCTCAGCCTAAGGACTCTTGCAGGAA
AAGCTCCATTATGATAACAGAATATCCATCTGTTGTTAAGGTAATATTCA
TGTCTTAAGGAAAATTGTAAATACAGACAACTTCACATTGGAATACCTAT
TTACTAGTGGTTAACTTTTTGTTTTCTGTGACAGGAATGGGCGGATGATA
AACTTGAAAGTCAAATTGAAATTGTCTTGGAAACTGTGAACAAACTAAGA
TCTCTGAAGCCATCAACAGATACAAATGAGAGGTGTGTATATATGGTCAT
CTAACTGGGCTTTTGTCTTTATTTTTTACTATGCATGATATATGTCTGCT
TGGTTCTTGTTCTACAGCTGGCTTGCCAAAGTAAAACTTTCTTATTCCTT
ATCTTTCTCATGAACAGGCGTCCTGCTTTTGCACTTTGCCGAGGACACGA
TATCGCTGCCACTGTTCAATGCTATCAATCTCTAGCTGTGTCTCTTTCTT
CTGTATCATCGCTCAAGGTTTTTGCCTTACATTTACTAATTTAGTTATGT
TGTTTCTGTTTTATTAGTGAAATGTCCGGGCATTCCTTCTTTTACACCCT
GCAATCAATTTTTCTTTACGGATTCAAATTTATGCTGAAACCTGCAATCA
AGCATATATTATCTCAAATAACTTGGTTATTGCTGCATAATCAATCTTTT
ACTTGACCTCAGATTTTTCATGTGTTCAACAAAAAATACTGATCTGGTGT
GGCTGGAAATTTTCAGATCTTGACAGAGAGTGATGAAACTCCACCTGACT
GTTCAACTGCTGTTGTAAACAAGGATCTGACCGTATACCTTCAGCTTCAA
GGGGCTCTAAATGCAGAAGTGGAGCTCGAAAAACTAAGGAAAAAGAGAGA
TGAAATTCAAAAGTAAGCCTTCAGACCTTGTCTTTGTCCAATTGGTTTTG
ACAATACAGATCACTAATAACATGGTTTCTTATCCGAACATACAGGCTTC
AACATGCCCTGTCCCAGAAGATGGACGCTTCAAGTTACAGAGAGAAGGCT
CCGCCGAGTGTCCAGCAGGAGGACATGAGAAAACTCACTGCTTTCCTCGA
GCAACTGCAGGTCATCGGTGAAGCTGAGAAGAAACTAGACGTGTAAAACT
GGCAATGCTCAAGTCGGCTTTTCCATTGATTGTGAACAGGCGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.