Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA036154

[Submit comment/correction]

Sequence	AA036154
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA036154
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CAAAAATCATCCCCTCCCGTACGATTCCCTTCCCCGTTCCCGTCACGTCT CTCCCGAACACGCACCGCCTCCGTCTCCCTCCTCCTCGCCTTCCCCCCCC CTCGTGCGTGCGATTCCCCTTCTTCCCCTTACCAGAAGCCGCAGTCCACC GCAAGTCACCTCCGCCCGCGGAACCCTCGCCCGCCCCCGCCCCCCGCCTC CGCCTCAGCCTCCCGCAACCCGGCCTCCATCGTGCTCGCGCGCCGCCGAT CGCCGATGCCCATCAGGTCGGTCCTGGACTCCGCCCCTCCCCTCCTCTTC CTTATCCGCGCGTAATCTGTCTTTTTTTTTGTGATTTTCCGATGAAAACA AGCTCTAGCAAACCAGTTGATCTAGGTTCGGGTGTTTGCTGTTAGTCGGA CGAAAACTTTAGTAGTTGTGATGCTCATGTGTTCACATGGTGGTAAGGGC GCTGGCTTGTAGGGATTTTGCTAGGAGTTAGCTGGGACGTGCTGTTCAGC TGCCGGCCTTGAGGTCCAGAGCCCTGGATTGCTTCGCTTGATGATAACGT AGAAGATGATAGTTACTGTACAGCTAGGTTTGGGCCTTGTGGCAGCGGTT GATTGACCAGAGCAAGGAATTTCAGTCTTCCTTACTTTGAATTTGTGCTT AACGTTGCGGAATTTCATCTGTTCCTTAGTTTGCAATGTTTTTCCAATGT ACTTGTCTTGTTAAGTCCGTTGAGAACTTGACATTGGATTAGCCCAAGTG TCGAGGATGGGAATCATTAATTAATTTCCTTGCACTTTCACTTCTTTAGA AATTGGTGGTATGTAAAATGCAAGTATTAAATTCCTTTTGGTTTTGTTTA CAGGTGATTTCCTGTGGCATGGCAAGGATACCAATTGGTCATTGCTTCTC CTTTCATGAATGATGTCCTTCCCTTCGAAGGACACTAACGCACAAACAAT TTTTAAGTGGCCCTGGAGAAGAGAATCGCCATTATCAGCACAACTTCTCA TTGACATTCCACCCGAAATTGAGTTGTCGGACTACCATAGATTGCCAAGT TCTAGAAGTGAGAGCCCATCTGGACTTCTCCATGGCGAAGGCGTCAAGGA AGAACCGATCCCTGACTTGGATATTTTCTTCGAAAGGCTTTATGAATATT TCTGCGCAAAAGGACTAAGGTGTATCGTTACCAAATGGATAATCGAGATA CTTAATGTACTATTTATGGTATGCTGTATTGGATTCTTCTTCTTGTATGT CGATTGGAACGCCCTTGGCCACTTGAAGTGCGGTGTGGAGGCACTTGAGT CTGGGGAAAAACCATGTGATCTGATGGAAGCTATTAAGCGCAATCCACTA GTGCCCTTCACCTTTCCCAAAATGATCACTGTTGGATCAATGGTTATATT GGCAACCTATGGACTTATCAACTTCCTCAAGTTCTTTGTGCAACTGAGAA GTACACTGAATGCACGTGACTTCTATTATAACAGGCAAGTTTCAGATTAT AACGTACTCATGTGTGTTCTACCTCACATCAATTAATAACTATACCCTTG TTCCTTTTCTGTTCATGTAGTCTTAAGGTTACAGATATCGAGATTCAAAC AATATCATGGCCCAGAATAATCGAGAAGGTTGTCCTGCTACAAAAGTCTA AAAAGCTTTGTGTTGTTAGGGATCTCTCGGAGCATGATATTATCATGCGA ATAATGAGGAAAGAAAATTACTTGATAGGGATGGTGAATAAAGGCATTAT CTCATTTCCAATTCGGCCTTGGCTACCTGGTGCTGGTCCAACTGTCAAAT CTCATGTGCATGATAGGAGAAACTACGTGATACTTCCAAAAGCACTAGAA TGGACCTTAAATTGGTGCATCTTCCAGTATATGTTTGACAGGTAAGGCAG TCAGTACCTTTATTTTGAAGCTATAACTACTATTAGTGATTGATTTATTT GGATTAGCATTTAACTATTCCTATTTAATCGGCAGACGTCATTTTCACTA TCTAGATGATTGAGCTATGTATTTTCTTTTCTACATTGCACCCCTGCTTT CTCTAGGATCTCAAGCAGGGCAAACATGCCCTGAAGCAGTCCTTATAAGC TGTTAAGCTACTGCCCAATTAAGCACTGAAATGCACAATGGGGCGCGAAT AATCCAGATGTCCATGCCAGTCTTGATATTTGCCTTTTCTTTTAATGGTA TTAAACCCATGTGGCCAAAGATACATGTTCAACTTATACATAGTTAGTTA CATGCTGCTAAATGTTTAGTTACTGATGCAGAACATATACCAAGCTTTAC TGCTTTACTTACAGTTTTCTCGATAACCAGTTGCAAAAACCATTATTTTT TACTTGGCTTTAGTAGTCATTTCACATAGCAGACACCATTTATGATGGAT CCAACTTCCATACACTGGTTCAAATATTATTCAACAGCCCATGTGGAAGT ATCCTATGCTCAGGATTTAGGATCCGTGGTGTATTCCTCTATCCCCTTGG ACAAGGATCAGATTCAGAAGCCTTGGATTTAGGGAATACAAGGACACGCC AAGTAGGCATGATGTGTAGGATATTTGGATACCTTGCCTTAGATTTTATC ACCTGCAGGCTACAGATTCATCTGTACCGATATTTCTCTAACTTCCAATT TGTACATGATCCATTGTGAAGTTTTAGCAAGAACTCAACACATTGCTTTG GGATTGTTCCACTGATTTTTTGGTTTACTAAGTTTTCTCTTTGGGCAAAC TTTCCTTGTACAGTTATACTGAATACTCGTATCCTTTGCTTTTGCAGTAA ATTCTGTGTTCGAAAAGATTTTCTAACGAGCCCAGCTGTGTTGAAAAAAC GACTCGTCTTTGTTGGCATTACAATGCTGATTCTGTCGCCCTGCCTTGTA ATTTTCCCATTGGTGTACCTCATTCTGAGGCATGCTGAAGAAATTTATAA TCACCCCAGTACAGCATCATCCAGAAGATGGTCAAACTTATCACGGTGGA TTTTTAGGGAGTATAATGAGGTAGCTTCTCATGCAGAACTCATTATTGTT AAAGTCATTGCTACTGCTATTGACTGGTCTACTGAAGCGTTCGACCTCTT TTGCATCCCTTATTTCATAGTTTATGTGGCTGTCAGTCTTTGTATTAGCT ACAGCTGCAAGAAACTTGTCTCTGTTGAGGGCTTTTTGTGCATTATTTCT TAGCTGTCTCTAAAACTCTGTTTACAACAATTTCAGGTAGATCATTTCTT CAGACATAGGATGAACAATAGTGCTGTGCATTCATTGAATTACTTGAAGC AATTTCCTACTCCACTCATTTCTATCATAGCAAAATTTGTATCTTTTGTT TCTGGTGGTTTGGCTGGTGCGCTGATAATAATGGGATTTCTGGGCGAATC CATTCTCGAGGGTCATGTAAGCACTTTGTCTGCACTATTTTGCTTTCTAC CACTTGCATCTTTATTCACGTTCTAAATTTTCACATCCATAATTTTTGAA GATTTTCGGACGGAACCTATTCTGGTATACTATTGTTTTTGGAGCAATAG CAGCTATAAGTCGAAAAGTAGTGGCTGACGAACTTCAAGTAATTGACCCA GAAGGGGCCATGTGCCTCGTTGTCCAGCAAACACATTACATGCCAAAGAG GTGGCGTGGGAAAGAGAGCAGTGAACTGGTTCGGAGAGAATTTGAAACAC TATTTCAGGTACCTTGCTCTGGTGCTGTTTTGATTAAGTATTTAAGAGGA AGAGGTGGTATGAGGCTTGTGTCATTGGTTTAGAATTCACCGTCATCCAT TTTGTTGGCATCCACCACCATCTGCCTTTGTTATTCCCCAAGTCACTGCA TCGTTAAAAATTACTGCTATGAGTTATGACACTTTAAGTCTTCTTTGCAA CATTGGACAATTAAATTAATAGGCAAATATAGAAGTTTACTCCCACCGTC TGGAAATAAGTGACTCGGATTTGTCTAGATTTGCATGTATCTATATACTA AAACGTGTCTAGATACATGCGAATCTAGACAAATCCGACTCACTTATTGC CGGACGGAGGGAGTACAGTTTTTCCCTAATTAGGGAGATGACAATTTTGA GCTTTTCAAGTATTTTAATTTTTTTCAGTTAAAGTGATATATCTGAAAAA ATGAAGGTTAGGCCTAGTTTGGCAACAAAGTTTTTCTAAAACTGAAGTAT ATCAATACCATAGTATTTTAGTGCCAAGCAAAGCAATACTTCAGTTTTTT CCTTTTCTCAGTTTTAGAAAAAAGAGGGTCTAACCTCTTTCTCAAATACT TAAAAAAACCCACAGTTTTGGAGAATACTTCAGTTTTAAAACCATACTAT TTGTTGGATCCAAACGTTCTGTTATCTATTTAATACTTCAGTTTTTTCAG AAACCAAAGTATTTCCTCAATACTTTAAAAATACTTTGGGTGCCAGACAG GGCCTTAGTTTTGGTTGTTAGAGATGACAGTTTTGAGCTTTCCAAGTTAT TTTCATCCTTTTCAGTTGAAGTGATATATCTGAAAAATAAAGGTTACTTC CCTGCATATCATTTTGACTGAAGTTTGAGATCCAGGATAAATTTTTGTAA TTGGCTATGCGGTTTACCATTTCTATTATAGCTCTGAGTAGTGTCTTGTT AAATTATGAATGCAGTATACTGTAGTAATGCTAGTAGAAGAGATGGCCTC CATTTTCATCACTCCTTACCTGCTCATTTTCGAGTTGCCAAAGGTAATGT TCTGAATTAGCTCAATAGATGTGTTCTTCTAAAGTTTCTTGACAGTTGTG AATTCTTATAAATTTACAGCGTGTTGATGACATTCTGCGCTTCATCTCAG ACTTCACAATTTATGTAGATGGAGTGGGAGATGTATGCAGGTCCGCTGCT GAAGCCTCTTCAGAATTTATGTTCTTACCATCTATATTTGCCGAGTCTGC AACAGCTAACATAATTGCTTTGCTGTGTTTCAATAGTTTAAGCTTGTTTA ACTTCGGAAGACATGGTAATAGAAACTATGGCTCTCCCTTTGATGCACCT AAAAGCCTAAGGAGCTCCCAAGGGAAAATGGAGAAATCATTCTTAAGGTA ATTATAATTTCAAATAATTCTAACCAGCTTTGGTGTACTTAAATACTATT CCCTCTGTCCCAAACTAATTGACACAGATTTTTCTAGATTCGCATGTATC TATAAACTAAAACGTGTATCTAGACAAATCTGCGTCAATTAATTTGGGAC GGAGGGAGTAGTTATTTGACTGTGAAGTTTGTCTTTTCTTCCGGGGTTAC CATTTTAAGCTTCTTGCAAATCCAACAGGCAAGGTGTTAATATATCTTTT TAGTAACTGCCTGTTAAAATTGCGCAAACAAAATTTACTAGCGACGTTTA TGCAGACTGTTTCCTAGAAAATGGAAACAATACGTATTTTCAATACTTAA CTGAGGTGGAGGCATACTATATACTCCCCCTGTTCCAAATTGTAAGATGT TTTAGCCTTTTTCTGAAACGCATGTATCTAGACGTCTTCTATTGTGTAGG TTGGGAGTCTAGATACATGTGTTTCAGAAAAAGGTTAAAGCATCTTATAT CTTGGAACGGAGGGAGTAGCAGAGAGTATTTTTCTCTGAATATATGACAT AAGTTGATCATTGCCACTGTTCCTTTTGTATATCTTGTTATGACGCTATC ATTCTGTTATCTTCCTGTGATCACTCGATGGATGTAGTGAGACGATGCAG AAGTATAGCACTGATCCTATGATGCATAAGAAAGTATCATCCATTTTTTC TGTTTAGTCCACTGTTCACACTGTACACTTCCAATTATGTAGCAACATTG AAGCCTAATTGTGTTGCAAGTTTTGCTTGCAGTTTTCAGAGTGTTTATCC GTCGTTGGTGGCAAGTGTGGATGGCAAACAATTCTTACACAACCTACAAA AGTTCAAGGAAAGGCAAATACGTCAACAAGCTATTGCACAGTATCAGGCA ATGGAAGCATCAGGCTTTGTGGATAGCACAGGTCAAAGGGATGATATCTT CCGTCAACTGCTCCCAAGTATTATGCGTAACCATGCTGAGGCCATCACCC CACCTGCTGCTTATAACTTGGGCCCCTTAGGATTGCTCGACACAGATCAA AGAACTCATCCGTATATTCTGGATTGGTATTACATGTGCCATTCACCACA CATGGATAGAAGTGAAGCTCCCCAATTTGACGAAGAGTCCCCTGAGACTG ATCAGAATACAAGTGTGCTAGCAAGGGAAACATCTGAAATTGAAGAAGCT GAAAATAATTACTCTGATTTGTACGGAAGAGTTCGGAGTCATATGGGGGC ATCAACATCGAGCACCTTGTTTCGGCATGCTCCTCCGACGAAGCACCATG GTAAAGAAGATAGTTCAACAGGCAATTGGTGGGAGCAGGCCCCTGCATAT TCTCATGATGATCCGCAGGGTAGTTTTCTCGAGCCTCCAGAATTTGGAAA CCATAATATGGCCCCGCAGGGTAGTTTTCTCGAGCCTCCAGAATTTGGAA ATCGTAATATGGCGGGTGGTAGCCATTCCAGTCACCACAGTGGCGATATA TCAGAGGAGAGCGAGGGAGATCTGGAGCAGAGCGATAACAGAAGCAGCAG CAGTTGGAGAGATCCTCAAACCCTTTCCCGGACAAGGTATATGGACGACT CTTACATCGAGGAAGGGCTGGGTCTTCATTTCGCGGACAAGGATGAAGAC CGGCGACCCGGTGTAGCTGATGCTTATGACCGCACCCCAGCTGGCCTTCC TGTCAGAATAATACCTCGAAGCAGTGACCCCCTGTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.