Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA044097

[Submit comment/correction]

Sequence	AA044097
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA044097
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTCAATTATAAATGGTCTACTACTACCGCGAATATTCGCTCCCGAAAATC TTCGCAACATGTTAGTTACCCTCCTCCACGGGGAAACGGGGTTAACAAAT TCCCCGTAACAACCTTGTCATTCGCCTCCCACACCTTCTCCTCCGCTCCG CCAACTCACGATTTCGTTCGTCCCTGCCAAGTTTCTCCCCGTGCCAGCAG CGCCGAATCTCCTCCAGAAGCTTCCCGGGTCGCGGCTCCAGCTCTAGAGT CCTTGGCCGCGGGTCGAGGGGGTCGGCGGGCGGAGGAGCTGCTCTGATTC GCCGGTGCGCGGCGGGGAATGCTCTACCTCAAGCTGCCGGCGGGGGATTT AGGGTTCCCGGGGGAGGAGGCGGCGCGGTGATCCCGTGCCGGACTGAGGT GGTGGCCCAGGAGGTTCGTCCGGCTACCGTCCATGGCGACGGCCGCGGCG CCTTCGGCGGGGGCGCAGGCGGCGGAGGCGGCCTGCCTGCAGGACTTCGA GCTCTACGAGAGCGAGTCGGTAAGCTTTCGCCTCCCGCTTCCCGCTCCCG GTGCTGCTTGACCGATTCGGTCGTTTGATTTGTGGGGGAGGCGAGAGATT TCCGTAGAGGCCCCCTTCAGCACGTTTGCTCCTTCAGCACGTTTGCCTCG GTAACTCTAGCTGTCTGGCTGGATTGATTGCCCCTTCGTGTCGTAGCTTT GGCATCTGCATATCGGCGGATGCTGCTTGTTTAGTTAGATTCATCCTTCA AGCTTGTCACACAGCGGATTAATTCAGCACGCAAATTGCTTCGATGAACT CGAGCTGCTGTTTCTGTGGTCTGGGTGCACGATTTCGGAAATGATCTCAG GATGAATATTTGTAATGTGTGTGAAGAGGTGAACCGGGAGATACCTTGAA GGGATGGTCCTTCTGTTCTGTGGTAACTCGATAGAGAGAAAACAGAGCTC CACTTCAGAATCAAGATAATTTTGTAGCTATTAGTATTTCCGGGCTTGAT GTTGTTGAGATGGTTTGGAGGAAGCATCTTGATCTTCGCTGCCTTTTATG CTCCACTGCTGGTGATGGTGTTGTCAACCTCCTACGATCCTGCCCCTGCC CCTGCCTGCTGGACATTCTCTGAGCGTGCCACCTGCGGTTGCCTCCATGC TTTAAGACGGCTGGTGGCTGCAACTTCTATGCTCAACGGTTGGGTGTTTT TTCCCTGGTCATATGGAAAACACTCATCCTCCTCTTGCTGTGGGTTATCT ACTCGCTTCAGTCCTCAAGCTATAGGCATGGTCGTTGAGCACACACAGCT CTGGCTCCACCGTTTCCTGTGCCAGCTTTGCTCAAATCCATCATGTTCTG GTTTGCCGATCTTAAAGAGCAAGAGCATGAGCGTCTCCTTGTCCCTCCGT GTACTCCCTGCTCCTTCTTCCTCACCAAGCATGGGGTTTAAATACTGCCA CCTGTATTTTTCTTGCCTTTTATAGCTGAAAGGCCACTTTTTTCCCCAAG CGATCCAATTCCGTTACACATAGCATATCATCCAGGTGCAAAAGTGAAAG AAAAAGGAGTCTTGCAAGCGAGTAAGAAAGCGCTGCCTACTGCTAGTGTT TTGACCTATAGCTAAAAAGCCACTTTATAGATCGTCTGACCATTAAAAGG CCCCAGGTTTGAATACATTGTTGAATACAGTTTAATCAGTATTTTTTTTT TTGAATAGGATCTTCTCAGTGTTGTTATTTGATTGTTAGCAGGTAGCAGC TCTGTTACATTTGCAACATCTAAAATGGTGACAAAGCATTTAGTCTAATT CACATGTAATAGTATCATAAGTTCTCGCTAGATGGTGTACCTTCTCACTT CCTCTGTAATGTTACATAATATCAGTTTCTTGTTTGTTATGTCAGTAATT AACTCATTGGAGAAATTGATTGATTTTCCCCGATGATTACTTTTCTTTGC AGAGGTTCTACATTTTTGGAACTAATTCTGACAAAACACTGTGGAGGTTA CTCAAGATTGATAGATCAGAAACACCAGAACTTGACATAGACGAGTGTTC TACTATCTATACACAAACTGGATACCAGGAACTTTTAGAAGGTCTCGATG AAGACCACAGGTCAACTGGAGGGGTAAAATTTGTGACAAAATTTTATGGC ATAATTGGTAATTGATTCTCTCTTTGTTGTTTGGAAATAAAAAATTAATT AACCTTACTAGAGGTCCATTTCACAGTGATTTTTTTCTTAGGTTTTGTTA AGTTCCTTGGGCCATTTTATATGTTAATTATCACCGATCGGAGAAAAATT GGGGAGATATTTGATCATCCAGTGTACCACGTGACTAAAACTTCAATGGT CGAGCTAGCAAATTCCAAATATCGATCCAGTTTTCTATGTTCCAAGGATG AGAACAGGTTTGTGCATCCCGTTTAGTACGTTTGCTCAGAATTGTTTATG AATGTTCTTAAATTGTTAGATTGACTAAGGAGAATTATGTTAATAAATTA TGTATATGAACACTACTACTTTTTTGCTTGCTATGAACTTGATTGGTTGA TTGTGCTCAATTTATTACTGAAAGTCTCAAGTTAGTTTCTAGGTGTATAG GATTAAACTTTTCTCCTAAAAAAACCATGAGTTTCTACTATTGTGTGGCA TCTTATACCTCTCAATTGCATCACTATGTAACTAGTTACTAAATTGTTAG ATTCTTTTATACTTTCTAGCGGCCAACTGCCCACCTAATGCAATACCGGT ATTATCCCAGTCTTCCATTTCCTAACTATTTCTGTTTCGTTTTCTTGTAA CAAGCTAATTCTTTTTGTAATTACACAGATACAAGAAGATTTTGAACACA CTTGATCTTAGGAAGGACTTCTTTTTCAGTTACTCATATCCTATCATGAG AAGTCTTCAGAAGAATTTAAGTGATCCTCAAGAAGGGTGGTCAATATACG AGACAACTTTTGTGTGGAATGAGTTCCTTACACGGCGAATACGTATTTGT CTAAGAAGTACTCTGTGGACCGTTCCACTAGTCTATGGTTTTTTTAAGCA GGTATGTGCTGAAGGAAATTTCCTTTGATTACTATTAATTCCTTTGGTAT GCTTTTTTAAGAGGAAATTTATTTATTCTAAAGTGTTGGCATATTTTTTT TTAGCTTTGACTAGATTTAAGAACTTACTAGTTCACTATTATCAAAGACG GTCAGTTAATTCAAACCTCCAATTTTCTTTCTTCATTTGTTGCCTCTTTA ACATAATCACGTATAAAATAAGAATCTTGATCCAGTCTTTTCATCACTTT ATATATAAGTATCTAACATAGTTCACAGTTGTGATGTGCTTGTTTTAGAT TAATAGATTTTGATCTGAACACTATTTTTTTATGCCATATTATTAGGACA AATTTGCAATATCTGGAAAGGATGTTATGTTCACACTCATTGCTAGGCGC TCAAGGCATTATGCTGGCACCAGGTTTGCACATCTGATACATTTTATTAA ATATTCCTTAGTAGTTTGTAATGCAAGTTGGATTGAAGTGGTTTAATGGA TGTTGAATAGATATTTAAAGAGGGGAGTGAATAAGAAGGGCCGGGTAGCA AATGATGTTGAGACTGAGCAAATTGTCTATGAAGCTGTGCCTAGGCCTAC AGAAGTAAGTTCTGTTGTGCAGAACAGGGGTTCAATCCCGCTGTTCTGGT CACAGGATACATCAAAGTTACATATTAAGCCTGATATCATATGTAAGTTT CTAAACTTTCCTACTATGCATGTAGTATCATTAATACATTTGTAAATAAA CATTTCCTGTTCTATCAGTGCATGAGAAGGACAAAAATTATGAAGCTACC AAGCTTCATTTCGAAAATCTTAGAAAAAGATATGGCAACCCTATCATTAT CTTAAACTTGATTAAGGTGAGTTGTAAAATCCTATTGTATAGTATCAATA TTTTTGGATACGCTGTACATGATTGCTGATTTGCCATGTTATTTTATTTT GCTGTTGTTGTTTACATATAAAGACACGTGAAAGGCGGGAGTCTATACTT CGTCGGGCATTTGATAAGGCAATAAGGATCATTAACGAATTTGATTCAGA GGAAAACCATCTGCGGTTCTTACATTGGGATCTTCATAAAAACTCTCAAG GGTATTGATTGTGTATTGATTGTTCATTTCTCATATTTTATTCAGCCTAT TAGTATTCTGTAGCATGCATTATTGATGTAATTCTGTTTCAGGAAACCTA CAAATGTGCTTGATGTTCTTTTGAAAGTGGCATTTCGGGCTTTGAGGTTG ACAGACTTTTTCTATTGTCAAGTTGCACCACCTTCAGGGTCTGAGACTGC TCACTGGCCTGCCTTATTGTGAGTTCATCATTGTCATTATTTTGCCAATA TGGTCTTATTTGCTACAAAGTTGATACTCTGATTTCTGTTTCACTCTTCT ATTTCAAGAATGGTCACTGCTCTTATTTTATATATTTAATCTTTTTTTCT CTTGTTTCTTTATAGGAACAGTCACGATCCATATTGCTGTGATGAGAGCA ACAGTGACATATCTCAAGAAGATATTTCGGGCAGTTCTGATTCCTCTGGC AATGGAACTGCAGAAGACAAAGCTGAAACTAGTGAATTACCCCAACTAAA ACCACCGATATTCCAAAAAGGTGTCTTGCGGACAAACTGTATAGACTGCT TGGATCGTACAAATGTCGCTCAGTATGCATATGGTTTAGCCGCCCTTGGA CATCAGCTGCATGCTCTTGGTTGTGTACAATCCCCAGAACTTGGTTTAGG TGCTCCCTTGGCTCATCAGTTGATGCACTTCTATGAGAGGATGGGTGACA CACTTGCTGTACAGTATAGTGGGTCGGCTGCTCATAATAAGGTATTTGAC AAAGACTCACTATTACTCTTGAAACAACGAAGTACGTAAGCAGTGAGATG AGCTATTATGAATTGGTGGTTCCATCCATGTAGTGAATATGGATTGAACT AGGAAAAATGTTCTATTGAGTTATCCATTTTAGTTTAGATGATCAAACTG CAGGTTACGGAGGAAGTTTGTGGTATATTTTTTCTGTATTCTTTGGTTAT AATGGTAGGAAGACAATTAAATCAATTTTAGTTTCAGACTTCAAGTTTAA GCAATTCATTCTTTCAATAGACCAAGTACCATCTGGGCACGTGAAGACAC TTTGTCCCCATAGAAGTATTGACCATGAGGGATCATGTTTTGTAATCATT GTTTCTATTGAAAAAACTCGGTTCCTTTGATGTGAATAATAAGATGCGCT ATAGCCCTGTCTCGTTAAGGGGTATTGCGGGATTGTATCATATAGTCTCC CAAAATGCCAGGGACAGAAGCAGTTCCACATAATAGCAACTCGTAGGAGA ACTATAAACTAGTACTTATTTGAATTGTAACCAAAAGTTGAATGATCATC ATATATTTGTTCTATGGTTTTGATTTCTGGATGCATCGCTTGCCTCTGAA CCTTAACGAAGACTAATTGATCATGGTACTACTAACATTGTGCAGAACCC CATATGGGAAGGGAAAACTGTGCTGATAATACTAAGATTGTAATATTCTG TTTATTACTTTATTAAGATCTCCATAATTAAGAAATTAAAATATTCATTT GATATGGATCTTCATTCAGTTTTACTAGCAAATTATCAATCTTCAAGTGG CAAATGTACTCTTTTTACTGCTTGTAAACTAATCTTTTGTTTTCTCTATC TTTGTATTGTGTTTCATGTTTAACCATATGCACCCAGCACTGCTCTAATT TTTCTTTGATGTCGTATTTCTTGAAGATATTCTCTGCAAAGAGGGGCCAC TTGAAGCTTTTTATACGATCACAAGAGTTCTTTAGGACACTACAACGGCA CTACAGCAATGCATGTATAGATGCTAACAAGCAGGCAGCCATAAACTTGT ATGTTTTACTAAGTATCCATGTCCACTATGCAGAACCCATTGTTTCAATA AAATATTGAGTTTGTGCTTTATATATATTTCAGATTTTTGGGGTACTTCC AACCGGAGCAGGGAAATCCTGCACTATGGGAGCTAGAATCATCTTCTGAG GAACATAACAATGAAACTTTGGATCATACAGGGTAAACACGAGTCACCTA GTTATTTACGGCCTTATCTACATGACACTATCCAAATACTCCCTCTCTCC AGAAATAAATGACTTGGATTTGTCTATCTATACACTAAAATGCATCTAGA TATATGCGAATCTAGACAAATCCAAGTCACTTAATTCCGGATGGAGGGAG TAATAAATTTGTTCGATGCTTCACATGCATGCAATCCAAAGAACTGGTGT ATAAATGAAAATTTCTCTGTGATGAAAAATCCCTCGTGAGTCACCCCTTC ACCAGCGTTTGTGCCGTTGAGCATGCGAAATTCTTCCCCATCATTTCATT ACCGCTGTATGGTGCATTACATATTAAGTACATCCCTTTATGGGGTAAAA ATCTACCATCTCCTGGAAGTGTTATGCTATTATTAAATACACACAGGTGT TTTAGTATCATGATATAGTCGGTACTTAGTTGTTTAAGGTAGTGGCAAAA AATCAGTGATGGGTCCTATTATGCTGTCCTGCAGCAGTGCAGATATATAT GTTTTTCCATTAAAGAAGTTCTGGGACGTGTTTAAATTTTTACCAGTGTT TTCACACTATTAAGCACGACGAGGACCGTTTAGCCCATTTACTTTGGGTA GCTTTCCCAGTTGTTACATCTTAAGGCTTCTCAAGTGTTTGTCTGAACTA AACATGGATTTTATAGATCAACAAGGGCCTTGTTGTCATTGACTATCTAT TTTGATGTCACAGTGACAGTGCAATGCCAAGAGTGCAATCAGATGGCAGC CTTCTTTGTGTAAGCAACACATCCATACCTGGCGATAGTGATGAACTGTT GAACGGAGCACAACCTGATGAGTTACAATCTCCACAAGTGGAGTCAGATT TAGTGCACGAAAATGAGATTTCACCACCCTTTGAAAGTGAGGCGTCAAAT TCGAGGTCAGCTTCTGTTTATTCAGGCTTTGTACATTCAGTTTCATTCTT CGTCGGTAGACGATAGTTTACTAGAAAGTACAACTGTGGTATTTCAAACA AGTATAGGTTCATCATTTGTATTTGACTGTTTTATTCTTGTCTAAAACCT ATTGCAGGTATACCCCCACAGTGTCTCATAATCATATACATCATGTCCTA AGTAGTCATATTGATGATTGCAATGGTTCGGGCGATTCAAACTTCTTGGA TCTTGAATGGCTATCAAATTCAGGCATTTCAAGCGATGAAAGGTCAATTT TTTTTGTTGTACTTTAGTTTTGTAATTGTTTCTCCCATGCATGCTCTATC GTACCCTTTAACTGTGTAATTTCCGCAAAATAACAGTAAACTGTTCTGTA CATACTTAAAAGGAACAAAGATAATTAAATTGAAGGATACCATTAGTTAA TTTTTACTATTATCAGTTCGATGTCCTTTTTCTCTGGCAATGACATAACC ATCCTTGCACTATCAAACACAGTAGTTCTGCATCAGTTTGAAGTCCTTTT GCTCTGGCGATCACATACCTGTCCTTGCAGTATTAAACACAAATCACCTC AATCTTACATTGTATCATCTGGTCAAATCATATTTACTGAGAATTAATTT GAATAATTTTGGTTAGCGCTTGGCGTTGCTCATCTAATATCTTCCAACCT GCTCACTAGTACTGCACTGACAACGTCGGGAAAAACAATATTCTTTTCTC ATCGTAACATGGTAAACCATGAACAGGTCAATTGCAACTAGCACGCCAGA TGCTCACCTTTCAACTGAGAATGTCATCAGTGGCATAATTCCTGAGACCA CGGTGAGCATACAATCTCCGCGCTCTTCTGTCTTTTAATGTTTTACAATT TGTTAGTGTAGCATGTTTTGTAAGGTATGCCTTCATGATCATTTGATGAG TGGTACCGAACAAAACTGATCACGTGATCCGGAACTTTTCAGGAAAACGA AGAACAAGTCGCTGAGGTGCAGGGTCAAAAGTTGCCCGACCATTTCAGGC AGTGGGTTGAGGATGGTGACACTTTTTGGTTTTGAGATCACTGTGGTGCT GTGTCATGCATGCCTGGCTGCTTGGAGGATGACACAACTTTTTTCCAAGT AGTTTTTTGACGGATTGGAGTAGCAGATTAGATAGTGAGAACAGACGGAT GGTTCAGCACCTCAGGCGGTCGTCTTCTCACAGCATTTCACCCACTCCAC CTAAAGGGCAGAATGCTTGCAACAAGTCAGTTGCCCGTAATTCTGCTGGA GACTTTCAGGAAGTATACATTTTTATTTATTTGGTCACGTGTTTGTACTA GGGGAGAGTAGATAGGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.