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GrainGenes Sequence Report: AA008943

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Sequence
AA008943
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA008943
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGAAGATAGAGCACAAGGTGATATCCATCACACTCGACAATGCTTCAA
CAATGATTCTGCTATGAAAGATTTGAAGGCAAAGTTCACTTTCCGGCGAT
ACAAACAATTTGTGGAGGAATATTTTCATGTTCGGTGTTGTGCACACATT
GTGAACTCGGTGGTTCAAGGTGGGACAACATGTATGGCCAATTTTATAAC
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GATCCCTATTATAGTCTAAATATAAATTACCGATGGTATTTTCCAGTTGG
AGATATGACCTCCTAAAGTAAGAATCCCGCCAATTCTTCTTGAATTGCTC
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AAAGAAAGGGATCAATACATATGAATGAAACTCAACACAATTTATTGTAA
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TTCCTAAGAGACACAAAATCAAGCAATACTTGAAGGAATTGTCCTGTGTT
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TTTCTATCTACTCTCTCCGGCCCATATTAATTGACTCACATTTGTCTAGA
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AGCAGTATCACCAGCTATATATATACCCACCCAGCACTACCGGAATAGAA
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TTGCATGTCATATTTAATTTTTGTTGTTGTTGCTGTTATATAACTTACGA
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GGTATGAGTTTTTGTTTGTCAAAGTTTGAAAAGAAGGAGGGAGGAGGGGG
GAGGGGAGGGGGGGGGGGGAGGGGGGACCGAAGCAAAAGTGTAGTTAAAT
AACTCGTACTCACATGCATAGTGAATGTTCATTTACTTGTTTCTGGCCAA
GATAAGTACTACTCCCTTTATTCCACCATATAAGCCAAAACAGATTACTA
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TTTAGACTTCTTTTAATATATAGGTTCACTCATGTTCAAAATGAATCTAT
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ATTTTCTTCACAAATCTAATACATCTTATATTATAAAAACGAGGGAGTAC
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AATTATGGCTTGTGAAGTTGTCATATGCCTGGTTTCCTGGCTTCACAGTT
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ATGTGTAGCTTGCTTAATGATCTCGCGAAGAAAAGTGACCAACTTTACCC
ATGAAGGAAGGCTTGGCAAGGAATACTATATATGAACATTGTTATCTAGT
GGCATTTTATGCATAGGCTACTGCCTCGGATCCTATATAGTATGTTTCTT
TTTTTCTTGAATGATCATTTTGTGGCATCACTACAGAAATGGGAAGCTAC
GCCGATGGCCGGTCGCTACGCCGACGGCCAAACGTCGGGGCCGTCGGCGT
AGCCATCGTCCAGACTAGCCCCGCCAAGCAACCGTCGGCGTAAAATTGCC
CTCGGTATATTCTATGCTACGCCGACGGCTACCCTCGGCGTAGCATACGC
TGACGGCTGCCCTCGGCGTAGCTATTTTTTATTTTATCTCATTAAACTTT
AAAAAATCATAACTAAATCATTCTAATTCGGAAAAATACAAATAATATAT
CAAATTTTGCAGAAAAATAAGACCTATCTATCTACACTCAAATATTACAC
ATTTATAAATAAAAATTAAGTAAAACATAAAACATTATATATAGTTTAAA
ATGGGCATAAAAAATTCAAAAACGATCGAAACAATGCGAAACCTTCGCGT
GGTGTTATATTATGTGACATAGTTAGAAGGAAAAATTTCAAACTTGGTAT
ATTGATTATGTCTCAAAGAAACCTTCACAAAATGACCTATCTCATTCGAG
GTTTCTTGGCTTTCGGGTCAAATGACCAATGTTATGGCTAGAATCAAGGC
ATAATTTGTGATAATGTGCTCATATTGTGCATACACATGCATCATGGGAT
GACGAACAATGTTGCAGGAGGAAGTTTTCCTTTTCGTCGCACCAAAAAGC
CATTTCCCATTTTCCGAGCATAAAAACAGACGGTTTTTGTGAAGCAACCA
TCAAATGGCTAATTCAAAATACTACCACCGCATTTAAAAAAAATACTATA
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TTAATTATTCTATATTAAATAGAAAAATACAAAAAAAATATATTATATTT
TTATTTGAATTCAATAATATTTTTACTTATTCATTAATATTTACTTAAAT
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GTTAATAAGATTGGTATCATAGTATTGACACCAATGTATGAATTACTTTG
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TAGTATTAGGATGGGTGACCAGCACGCTGGAGTAGTATTAAGATGGGTGA
CCTGCTGGGAAGTTTGACTAAGACTGGAATTTAATCAAATATTAATTATA
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AAGAATAAAAAATTGAGAAAAAAATTTATTTTTTTTCAAAAAAAAATGTT
TTTGCAACCGGCCGACGGCCGCACATACGTCGACGGCATTTCGATACGCC
GACGGCTTGAGTGTGCTCCTCCGAGGGAGATCTTTGCCGAGGAGGCTACG
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CGACGGCCTTTTGCCCTCGGCGTAGCGCGCGCGTCCCTAGTGCAGAAACA
TGGACATTAAGAAACACTTTCATATGGTAAAGATATTGCAACCATCAACT
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TTGCAGTACAATTTTTTCTTCATGTAGTCAAATCGTGTGCGGAGAGCTAG
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GGACCGTAGCGAGCCAAAAGCTCGCACGGGCCAGCTCGGTCCAGCCCAAC
AGCCCGCGGTAGCCCGAGAAGAAAGGGGGGTTGGGCTTTTGCCAATTTCA
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GGCCATCGTCGGCGCCGGATGTCGTCGCCGCTCCCTGATGTCGTGACCGC
CACCCCCTTGAGCTGCTCTGCCCCTTCTAGCTGCCCCCAACACCTCCGCT
CGCTCGCACACCCCCAAGCTCGCACGCCCCCAAGCTCCGCAGTCACTGCT
TGTTGAGTCGCCGGCGCTGCTCATCGCTGCTCGTCGAGCCACCGCGGCTC
TCCCAACTTCCCAGTAACACCATGGAGCCAAAGAAGCAGAAGCCTTTGTC
CTTTCTATATGGGGACACAACGGCACCTACCGCGACAAAGAAGATGGGCA
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AGACGACACGCACCTCCGCATCATCGTCTCCCTGCCCACATAGCCGCTGC
CGGGCGTGCTGCTGGCCGCACCGAGTCCGAGACGACACGCGCACCGGTGG
TGAGCTATTTTTCTTGGTGTTTGTATATTTTTTGATGTATGCAAATGTGG
TTAGATGATGCAAATGGATGATGCAAATGCAATATATTTAATGTATGCAA
GTATTTGTTTTCTTGTATGCAAAGATTTACTTCATGTATGCATACATAGT
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TGATCAAGCGAAGATCTATCTACTAGATTGTAGCAACGAGTCAATAGAAT
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TCGCTGCGTTCCGGCAGCGCTCCCGCAGTCGGTCACACGTTCGGTACTCG
ATGAATACCTTCCTCTCCCTTGTTCCAGCAGGCAGCAGAGGTTGTAGCAC
TCTCCTCGTGATTCCGGCAGCACGACGGCGTGGTACCGGAAGTAGAGGAG
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GAGAGGGCCATGGCGATCTAGGGTTTAGAGGCACCAAGGGGAGAGCTTGG
CCGGCGGATAGGGTTTAGGGAAACCCTAACTCGGCGACTTAGAGAATGCC
CTAGGCGGCGGCTGCACTGGAGGTGGCCGGCGACTTGGGGCTAGGGTTTG
GGGTGGAGGAAGTGTAGGGAAGAGGGGCACCCCTGCCCCTCCTTTTATAG
GTGGGAGGGAGGCGCGGTTGGGAGGAGGGAGTCGGTTGGGAGGAGGGAGT
CCTCCTCCAACTCCTCCTCCTTGGCCGGCGGGTGGAGGGAGTAGGACTTC
CTCCCTAAGTAGGTTTCCTACTCTCCCTCCACCAAGCAAACTTGCCATTT
GACTTTTTCAAATTGGCGTTTGACTTTCAAACTAGGATTTGATTTCTACC
TTTATTTTGCCCAGCCAAGTGACCTAGTACATGATGAAACCATTCCATAT
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GACCCTTCTAGAACATTCCCGGTGAAAACACCGGAATCATTCCCCAACTC
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TCAATAACCAATAGAGGAATTTGGAAATTCATATGGCTCCCACATATTTC
TACAATTACTTTGCGATCGAATGAACCACTTACATACGATACCAATTTCC
CTTTGTCTCATGATAGTTTACTTATCCGAGGTTTTGATCGTCGGTATCTC
TGCATACCTAGTTCAACCTCGTTACCGATAAGTACTCTTTTCTCGTTCCC
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CAATGCCACCTTTATAGCCACCCAGTTACGGTGTGGTGTTTGATGTCATC
AAAGCATCCTTCCGGTGATGGTGATAAGCATGATCTCATGGTCGAAGGAA
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TCTCCTAATGATATGACCCTGTTGTTTAACAACATCTCTATGTTCATGAT
CAGGAAACCATGATCATATGTTAACCAACAAGCTAGTTTAACAAGAGGCT
TTACTAGGTACTCTTTTATGTTTACAAATCACACAAGTTTTAATGTTTCC
GATTAATACAATTATAGCATGGTATGTAAACATTTATCATAAGTATGAAG
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TAGAGGAGGTGGAAGAGGAAGAGGATGATCAAGAAGTTGGCGAGGAGGAT
CAAGAAGATTTGTATGTGGCTGAGGAAGATGATGATAGATATGGATATGA
GGAAAACTCTTATGACAATAATGATGACATGTCCAAGGAGGATGTTCATG
GTATTCCTCAAACCGATGAAGTAGATCCACCAAGTATTGATATTAGTTTG
GGAGAAGATGATGGAAGAGTAAAATGAAAGAATAAAAGAAAGAAGGAATC
AAGTGGAGCCGAGAATTCAAAAGCTTGGAAGTATTTTGAGAAGGTGTATG
TGGTTGATGACAATAACCCGAAGGGGCCTCAGTTGTTGAAGGCAAGGTGC
ATCCATTACACTAAAGAATATGCATATGTTCAAGGTTCAAGCACATCAAC
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CGAGCCAATTAATTCAGAGTCGTCTCAGTTTCAAGCCCCTCAATGGTAAT
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CGTTAGTCACACTACAGATTTGTGGACTAGCAATCAGACCATAGCTTACA
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TATCCATCACACTCGACAATGCTTCAACAATGATTCCGCTATGAAAGATT
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TTTCATGTTCGGTGTTGTGCACACATTGTCAACTCGGTGGTTCAAGGTGG
GACAGCATGTATGGCCAATTTTATAACAAATTTAAGGGAGACAGTGAAGT
ACTTCAAGAAGTCAACCGGTCGCCTACACAAGTTTGTTGAGATTTGCCGA
GGTTTAGATCTCACAATTGGTGCACACTTGACCCTAGATGTTTGTACAAG
GTGGAGTTCTACCTACAAGATGATAGCTACTGGCCTTCCATATAAAGAGG
CATTACAGGATTATGCCAAGTCGGATCTCAACTACAAGTGGGATCCATCA
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TGCACAAGTAACTACCGCCTTTTCAGCACAGTCATATCCCACTACAAACA
TTTTCTACCGCCACATTGTGAGTATCAAGATTGCATTAACGAAAGCCATG
AACCATAATGATGCAACCTATAGGGCAGTGGGAGAAGTAATGATGGATAA
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CTATATGATGAGCAATTGGCTATAGATGAGGCGGCAGATGTGCGTGTGGA
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AATCTAGCCCCATATCATCCAATGTTTGCAATACAAGTAGCTCAATGCCC
GCATCGGATAGTGCCTTTCAAGCCCACCAAAGAAACACAACAACTACATC
ATCAAAGAGTGAATTGAGAAACTACCTAGAAGACGCGCTTGAGGATCCGG
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CCGGTGTTGGCAAAGATGGCGAAGCGGTTCTTGACAATCCCGGCTAGTTC
CGTGTCTTCGGAATCAACTTTTAGCACCGGTGGAAGGGTTTTGGATGACT
ATAGGAGTTCTCTAAAACCGACAATGGTGGAGGCATTGGTGTGTGGTGCA
AATTATATTAATGGTTCCCATAGTGACTGGAATATCATGGTATGATCTCT
ATCTCAGATTTTATTTCCACATAATGATCCACATATTTGTTGCTAACTTC
ACCAAATTTAGGAGAAGGAGGATGATGAGGAGGAAAATGTGGAGTCCATC
AAGTTGCCTAAGAGTGGGTTGAATAACAACAAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.