Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA028568

[Submit comment/correction]

Sequence	AA028568
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA028568
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CACACCTCCCTCCATCTCGAGCGGCCTACGCTGCTGGCCCTGGTTCCCAA CTTCAATCAAACCCGCCCGACCTCCACCTCGCCGTCGCCGTCGCCGTCGC CGTCGCCTCCCGCCGCCGCCGGCGAAGCGGGACCAGATGGGGACGTCGGT GCAGGTGACGCCGCTGAGTGGCGCCTACGGGGAGGGGCCGCTCTGCTACC TGCTCGTCGTCGACGACTTCCGCTTCCTCCTCGACTGCGGCTGGACCGAC CACTGCGACCCCGCCCTCCTCCAGCCCCTCGCAAGGTACCCTGCCCACCA CCGCTCCCCGCGAGCTTCGCCTTCAACCATTCCGTCCCCCGCGAGCTTGC TCGTCCACTCGGTTGCCTCAGCGCGTGCTTGCTCGCTGCTTTGGTCAGTC GCCTCGCCGGACGCCCGCCACCTGCTCGACAAATTGCGCCAGCTAGGGCG CCACATGCACAGCCGTGCGCACCACCTGCTCGGTCAATTGCCTGCATTGG TGGGGAGGGGAGGACAATGGTTGCTTGGAGCCTGCCCGACAAAAAAAGAT ATATAGTGGCTTTGCATTTCTTAGGGTTTTGCTTGCTGCAGTGGCTGCCA TCTTTGAAGTGAATCATATATGTAGCTGTGCCACTGCGCATGAATGTATG TTAATTTCAATGACCTTATGTGTATCATGCATGAATTTTTGCGCCAAAAA TGTAGCCCAGGTTGCCGTAGTATGCATGGTGTTTATGTGCTCTGATCGTT TCATGTGGTTATGTAAGCAACCTTTGTGACTGCTTGGGTTTGCGTAGCTG GTGAATATGTACCTTCAGGCAATTGCATGGAAAATTGGCCTCCCTGCCTT TAGCTCTGCTAGTCATAAGCTCGATAGATAACCTCTGGCCTGTGCTCTGA GTTCGTTATTCTTATACTTGATTTCTCTAAGCGGAGGAATTCGTTTTGTT CGTTTTGTCTTGACTGTTAAAGGGATATTACATGTATATAGTAGCAATTG TTTCGTTAGTTTCATATACCACAGTCAAGTAGAATTTTCCTATATGCTTT TAAAAATGTCTGCACATGGCAAAACACTGTTATCGCATTGCCTGTGTTGC ATGATTTTGATATGCACATTTTGACGTGTTTCTTCCTGATAATATTTTTC AACATATTCTCATTTCACAATGCATGTTTTTCTGACTTTGCTCTGATCGT TTCGCGTGGTTATGCAAGCAACCTTTGTAACTGCTTGGGTTTGCTTAGGT GGTGAATATGTTACATTCAGGCAATTACATGAAAAATTGGCCTCCCTGCC TTTAGCTCTGCTAGTCAATAATCCTGATAGATAACCTCTGGCCTGTGCTC TCAGTCCTTTATTCTTATACTCCCTCCGACCCATATTACTTGACTTGGAT TTATTAAAATTTGGATGAACCTATATACTAAATAGTGTCTAGATTCATCC AAATCTAGACAAATTTGAGTCAACTAATATGGGTCGGAGGGAGTACTTGA TTTCTCTAAGCAGAGAAATTCGTTTTGTTCGTTTTGTCTTGACTGTTAAA GGGATATTACAGGTATATAGTAGCAATTGTTTCGTTAGTTTTATATACCA CAGTCAAGTAGAATTTTCCTATAGGCTTTTAAAAATGTCCACACATGGCA AAACATTGTTATTACAGTGCTTGTGTTGCATGATTTTTTTACTTATGCAC ATAAGAATGCTTTGTATGTTTCAGGGTTGCGCCGACAATAGATGCTGTTC TTCTGTCTCATCCTGATATGATGCATCTAGGAGCTTTGCCCTATGCTATG AAACATCTTGGATTATCTGCACCAGTATATGCGACAGAACCTGTGTTTAG GCTTGGCCTTCTGACCATGTATGATTACTTTCTATCTCGATGGGTAAGCT TCCTTAGTGCCCATTGTTGTAATTCGTAATTTCTTGTACTTGTCTAGCCA GATGCATTTCCAGTTCACATAACCTCCTTGTGTGTTTGTGTGGCACCAAA TAAACATTCGCCTCAATCGTCATTTGTTGCTCTTCATTGTTCATGAAGGA CTTCTTACCATTTTTAATGTCTCTTTTGCAGCAAGTTGCAGACTTTGACT TGTTTACTTTGGATGATGTTGATGCTGCATTCCAGAATGTTGTGAGACTG AAGTACTCACAAAATCACCTTCTTAACGGTTAGTAAGGACCATGTTGATG TACACCATTTTGGTATGCTTAATTGCATTCCCTCAATAACTGTTCTCAGC AGATAAAGGTGAAGGAATAGTTATTACGCCACATGTGTCTGGGCATCTTT TGGGGGGTACAGTATGGAAGATAACCAAAGATGGGGAGGACGTCATCTAT GCTGTTGACTTCAACCACCGAAAAGAGAAGTTAGATCCTCTGCTGTGTTT GTTCTGTACAGATATTGCACTCTTTATTAGCTTAAATAACTAACACTGCC TTTTCAGGCATTTGAATGGTACTGTCCTTGGATCTTTCGTGCGGCCAGCT GTTTTGATTACTGATGCTTACAATGCCTTGAACAATCAGGTCTACAAAAG GCAGCAGGATCAAGATTTCATTGGTACAGCGCTGGACTAGCTACCAAATC ATTACTTGTTTGCGGGTTATTTTACTTGCATTACGTGTCAAAACCTATTG GTTGAAGTGTCACCCTGTTTTATGCAGATTCGATGGTGAAAGTTCTATCA AGTGGTGGTAGTGTGTTACTGCCTGTTGATACAGCTGGTAGAGTGCTAGA ACTTCTTTTAATAATGGAGCAGGTGAAATCATGATTTTATTATCACTGTA CTCTTTATCCTGTCACGCTAATGATATGCTAACCTCTTATCTTCATGCAT TGCAGTTCTGGGCTCAACGACATTTGGTCTATCCTATCTATTTTCTGACA AATGTTTCTACGAGTACTGTTGATTTTGTCAAGAGTTTTCTTGAGTGGAT GAGTGATTCAATCTCAAAGTCTTTTGAGCACACTAGAGATAATGCCTTTT TATTAAGGTATAACATTTGCCATGATGACATGCTTCCCCTCAGTGTCTCC TAGTGGATTCACACATATGTTGTCACTTTTGAGTTCGTCTGTTCTTAGAA TACTATTATCAGAGCCATTCTAAATATATTTTCTAGTTTATGCCCAGTTG TTTGTGTGATTCTTTTGTTATTGTTAATAACTTTTGTCCTTTTGATGTTG CAGATATGTCTCTCTGATAATTAACAAAGAAGAGCTGGAGAAATTAGGAG ATGCTCCAAAGGTCAGAGTAACAAATATGTATAATATGTCTAACGTAATT TGTACCTTTGGAGTTAACAGATAATTAACAGGTGGTTCTAGCGTCCATGG CAAGTTTGGAAGTTGGCTTTTCTCATGACTTATTTGTTGAGATGGCAAAC GAAGCAAAAAATCTAGTGCTTTTTACCGAGAAGGGACAGGTACATCCATG TGTGCAGCCTCTCCAAATGGGTCACACTTTTCTTCAATCTTTACATATTA TCAGTAGCCACCTTAAAATATGATTTCATAGTAACTTAAATGACTTCAAA TATGAAAAGATCTAGCTTCGGAGCTATAAACAAATTGTATGTCTCGAAGA CTTGTTCACGCTTATTTTTAACAGATTTATCTTTTTTGTTTAAAACCGAA AGAGCATGAGTCAGATGTGGTATAAGGAATAAATTGCTGAATGGATCTTT TATTACTGGTGAAAAATAATAAAAAAGATTATAAAGCCGCACTGCCATAA AATTTACCATCATTGCTGCCACCATGTTGTATAGATTTGACTGGAGTGAT CAGACGTCTTCCTTATTTTGATTTAGTAGCTGAATTCTATACCATTGCAT GTTTATGTTGTTACAAATTTCTGATTACAAAATATTCCCCTTCCAGTTTG GGACACTTGCTCGCATGCTTCAAGTGGATCCACCCCCCAAAGCTGTGAAG GTCACTATGAGCAAGCGAATTCCTTTAGTTGGTGATGAGCTGAAAGCTTA TGAAGAGGAACAAGAACGGATAAAAAAGGAAGAAGCTCTAAAGGCCAGCC TCAGCAAGGAGGAGGAGCTAAAGGCTTCTCATGGATCAAATGCGAAGGCT ACTGATCCCTTGGTCGTCGATGCAAGCTCGTCTCGTAAATTATCCAACGG TATATGATTTACTTTTCTCGATGATCCAATGGTATAAGATGCCTACACAC TTTTGCAGAACATACTTGATCTTTGTTACCTGATCCTATCACATTTACAA TTGCATAGTATAAGTTCAAAATATTATGTGTCTCCAGATAACCAGTTCCA GTTCTTCTAATGTCTGTCTCTGACTGTTTTTATGACTATTCTACTTCTGG TCCTTTTCTGCTTGTCTTGTGTGTTGACCTGATGTAGACATGTAGTTCAG TATCCATGTTTTATTCTTGTTAACTATACCGAAACAGAAAATCGATGGTA ACATATAATGGTCCATCTAGTTTCTCCGAACTGATCTCGTGTTTAAGTCT TATTACTATCTGACTCTGATGTAATATGTTGTATGTAGTTAACTGCCCTT TTTTTCTTTCTGGTTCCATCAGCTGGCTCAAATATTGGCGGGAATGTGGA TATTCTAATTGATGGATTTGTCCCTCCGGCGACCAGTGTCGCTCCTATGT TTCCTTTCTTCGAAAATACTGCTGACTGGGATGACTTCGGTGAGGTTATC AATCCCGATGATTATATGATGAAACAAGATGAAATGGATAATAATTTGAT GCTCGTAAGTTCTCTTATATGCACTCGCTGTTCCTTTTGAATACTCAGTA TGTGTTTTAATTCATTGTTACTCAGTTGCATGCCTGTCACGTATGATTGT TGTGTTGCAATCATTTCTTTGGAGACTCTGTTTTCCTTATTGAAAACCGC AAGCTTCAATTGATAAGTGGAGAACACATGGAACTTCCTTACATCTTCAT GGGTGCTCATTTGTTTTTACTTAATATGAAATGGTCGTACATAGTTGTGT GTACTCTAGGTTATTAAGCGTATGTTGTCTTTCAGGGTGCTGGAGATGGT ATGGATGGTAAGCTTGATGAGGGCTCCGCACGCCTGCTTCTTGATTCAGC ACCATCAAAAGTTATTTCAAACGAGATGACTGTAAGTTCTTTTCTGTCTC TTTTATTTAGTCTCTGCATCGATATAAAAGTGATGGCTGTACATCTATCC AGATTGAACTTTTACATCTGTTCACACCTATTTTTCATTTTTCAGGTGCA AGTGAAGTGCTCATTGGCATATATGGACTTTGAGGGTCGGTCTGATGGTC GTTCAGTAAAATCGGTTATTGCTCATGTGGCCCCACTGAAACTTGTACGT GTTGTTAGTTTGAACATCGTATCTTTAGTATGCATGGCTTTGATTTTACA ATTTTGAATCATTTGCTCCCTTTTGGGTATCTTTGTTCGTCCATTTTTTT ATCCTTTTCATAATTACTGATAATTCAGAATTCTCTCCAACCCTATGTTC TGAAGCACTTGCATTATTGAATACGAAGCTAGTAAGATCATGTGAATCTA ACGTTTGCAATATTTATCCACTTGAAGGTGGACATGCCACCAACACCATA GACTTTATGTGGATAAATATTCTGATGACTCTTTTTTTTTATTTACCACA TGTGACATCAGTGACCTGCAGTTGCAGTGCTTGTTGTCAATACTTGTGCT GCACATGGAAATCTGTAGCACATCCTGAATCTCTTCTCGAATTTTTCCAG GTTTTGGTTCATGGATCAGCAGAAGCCACCGAACATTTAAAAATGCATTG TGCAAAGAACTCTGACTTGCACGTGTATGCTCCTCAGATAGAAGAAACGA TTGATGTAACATCAGATTTGTGTGCTTACAAGGTTAGTTGGTTAACTGAC AAACTCTTCCGTAGTAGAGCTCTACTTAGGAGATCAGGAAAGTAAATTCC CTCGGGTACTGGTGTATTAATTCTTACATCCTAAGTCACTGCACCCACCA TCACGATACTCCATATTAGTGTGTAATAAGCTTTGCCAATTACTGAAGTC ACTGCACCATAATGTCGCTCAATATTAGGTAGCAACAAGAACTTTTTGTA TATGCCATTGTTTATTTAAACAAGTAGGCTAATGTAAGATTGTGACCAAT CATCATATATGTACGTACACAGACTTGCTAATTTCGTACTATCTGTGCTA TTATGAATTTTCAGGTACAACTTTCGGAGAAGTTGATGAGCAATGTCATT TCTAAGAAGGTATGAGCTTTATTTGATTCCCTCGGTGTTAATTTATTTTA TCTCATCAACCATGAACCATCCATGCCAGGAACCTGACAAGTGACCTCAA GAAACCACCTGTTCTAAACCAGTTAACCATAGTGTTTGCCCATATGTTTT CATTTGGTTATTCTTTGATTTATTGTCCATTTACTCTACTATGAGTTGTT AAATAAGGAAGCACTGGCTCTGACACTACCTCACTATCTACAGTTGGGCG AGCATGAGATTGCGTGGGTCGATGCAGAAGTTGGGAAAGTGGATGACAAG CTTACCTTGCTACCGCCCTCATCAACTCCGTCATCCCACAAGTCAGTCCT CGTGGGTGATCTGAAACTGGCCGATTTCAAGCAGTTCCTCGCAAGCAAAG GTTTACAGGTAGTGGGCCTCTGTTCTCGATGAACTCATGCTATTTGCATG CCTTGGTCATCCCGTCCTTCACGCTTTGGTTTTACAATGTGCACCACCGA ACCAATATCTGCTGGTTTATTCTCTGAAACAACTGAAATGTAAGTGCTGA TAGGACACTTCCTTCCAGGTTGAGTTTGCCGGGGGCGCTCTACGGTGCGG CGAGTACATCACCGTGCGCAAGATCGGCGATTCCAACCAGAAGGTAACTA GGCACCCGAACTGCCATATACATTTAGCAGCAATTTTCGATCAGCCACAA TGTTCTCGCAAAACTTGGCCCATGTACTATCTCTGACACGCTTGGTGGTG CATTGCAGGGTAGCACGGGTTCTCAGCAGATCGTGATCGAGGGACCGCTG TGCGAGGACTACTACAAGATCCGCGAGCTCCTCTACTCGCAGTTCTTCCT GCTGTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.