Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA006170

[Submit comment/correction]

Sequence	AA006170
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA006170
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGACCAGCAGAGAACGCACACGAGTCACACTTCACAGACACGAGCAAAAC GGAAGGGGCCATCGCAGTGTCGCGCACCCATCGGCCGCTCCGCCCCGCTG CCCCGGCTCCGATCTGCCCCCCTCGCCGCCTTGTCCCATCACGCGGCAGC ACGCAGCCTCGACGCTCGCTCCATTCGCGGCAGCACGCGCGCGGCGAGGG GTACAGCCGGCCGCCGCAGCCATGCCCAGCTCGCCCAAGGTGTTCTCCTC CTCCTCCGCCGCCGCGTCCCGCCGCTCCTCGCTCCGCCGTCTCCTCACAT CGCCGACCTTCTCCGCGGCCTGCCTATTCTTCGGCTTCGCGGGGTTCCTC GCCGCCGCGGTCACCATCGCCCGGGCGCCGGCCCCTGACGCGGCGCGCGG CCGCTGCCCCGACTCCTCCCGCCCGCTCTCCGTCTCCGTCGCCTGGGACC GGCGCCCCGGAGATGCCGGGGCTGGCGCCGTCGAGCTCCCGGCGGACCTC GCCACCGGATCGCGCGGTAGGCACAAGGTGATGGCCTTCGTCGGGATCTT CACCGGGTTCGGTTCCGTTGGCCGCCGCCGCGCGCTGAGGCGGACGTGGC TCCCCGCGGATCGGCAGGGCCTCCTCCGGTTAGTTGCTGGTATCATAGCT TCCTAGTTCGTCTTCGTTCGTCTTGCTCGAGATCTAGCTATAGTTTAGTC TTTAATGTTGAACCGTTGATCTGGTTGTTTACCAGTTAACCTACCAATGT GACGCTTAGTGATGAACTGATGATAAGGATTGGGTAGGCATTTCAGCTTG TCCATTTTATGCTCTAGAATTTACTTTCATGGATTCAAATCTCACCCTGG TGACCATTCAATTGTATTTTAATTTGCTCTTCGAGTTTGCGTAGTTATCT GCTCGGTGGCATCAGAATTGGTAATTCTTCTGCATTGGTGGATTCATAGA CAGAACTCATATGGGTTTGCAGATACTCCTGCTTTTAGTGGAATCATGCT ACTATTCTAGAACAAGTGATCGATCCTTGTGAATTGTAGATTTTGTTTCA CTACTACTGATAAGTGACATTCCTTATTTTGTTTCTTCATTTCAAGATAT AATGTGCATGGAATTGGGTACTCTATTAAATGCATATGTACAAGAAATTG TATATTTGCAATCTAGTGATAAACCGTCACCAGTTCTATTGTAGCATGTA AGCATCGACTATTTCTTTTTATTTCATTCTCTATGGATCCTTTTTCTCTC TCAGAAAATTATTGCCATGTTTCGTGATAATCACGACCCCTTGTTTTGAT TTTTATCTGGCAATTCAGGTTTTGAGGTCTGTGTAGCAATGATTATCTTT TTGGTTCACTCTAATGCAGGTTGGAGGAAGCTACTGGTCTCGCATTTAGA TTTGTAATCGGCAAAAGCAATGACAAGTCTAAGATGGCAGCTCTTGAAAG AGAGGTTGAAGAATACGATGATTTTGTGCTTTTAGATCTCGAGGAGGAGT ATAGCAGGCTTCCATACAAAACGTAAATAATATAACTCTTTATCATGTCA TTGTGCTATACATTATAGGAAACTGATCTGTTCTTATGTTTTAGGTTAGC TTTCTTTAAGGCTTCCTATGCGTTGTTCGATTCTGATTTCTATGTTAAAG CTGATGATGATATTTACTTGAGGCCAGGTGAGTAATAAACTAACAAAATC CAAGATATACCCTCTTAATGGCTTTGACACACATGTATTTTTCTGCTAGC ACTTCCATCACCAGTTTCTATTCTGCAGATAGACTTTCCTTGCTTTTGGC TAAGGAGCGTCCACATCCACAAACATACATTGGGTGCATGAAAAAAGGGC CTGTTTTTACTGATCCCAAATTGAAATGGTTAGTTTGTCATTTGATGTCA TATGCTAAATTGAGCTTCTTCTGTTTTCCATAATGCTTTTCCCGGGATAT TGGATGTCTAACTCTAAGAAGCAATACGTACAGTAACATGCTAGATATAT GGAAAGTAGCTAATACAGCAGAACCTGACCGTCTGATCCAGAAGCGAATG CTCTTTCTACAGAATTAAAGTAGTCACTCAAACTTTTAGAGTCTTATGGT CTAAGAAGTATTTGGGATCTAGATACATAATAGCATGGCCATATCTTATT GTCTGAAACCATAATATTAGCTTTGTCTGAGAAGCAAAGGAGTGATGCCG AAAATTATCCCTTTCCACCTATGACTGTGTCTCTGTATTGATTGTACCAC TTCCTGATTTACACCCAAGATGTATTGAAGTAGTGTGGCGCAGTGGATTG GTCTATTTGGAAACAATTTCTTTTAAGGCCTAAACTTGCCTTCTCTCCAT TCAGTGCTGATACCCATTTTGGATTGGGTCTAATACTTACGTATCAGGAT GGTGTTTTCATATTTAAGTTCTTAGCTGCCCCATATATGTGTTGTCTGGA ACAAACAGTTGCACTTGAGGTTTGGAAGGGAATTCTTTTTTGCTTTGCTA TGCTAAACATGAATAGAATGAATCAGCATATGTGTTGGAGTGAATTTTGT CATGAATTCCTAAACCTGCATGTATGTGTTACTTAGGCTGGCAACCTTGC AATTTGATATGACCATATCTTTAAACTTCCATGCTTGTATCATTTGGATC AAAACTTGTAACTCAGTCTGTTATTTAACTAAACACCAACTGTTCTAGTA GTCAGATTCCTAACCTTGCAATTTATTTGTGATCCCTGAAGTTACACAAT TTTTTCACAGCTAACACTCTTGCAGAAGTGGTAATAGTAATGTAATATCC TGAGGATGCATTGGATGGTAGGTATATTAAGATACATCAAATATGGCAGC AGTACTTGGTGAACCCATTGATCAGGATTTGGAACTACGAGAATAAATGT TGTTGTAGTATCTATGGTTATGGTTGTGCCTAAATGCAGAACAATCGAAC TGTATCTGGGACAAATAACCTGCTGTGTTTTTCTTTTCGAAAAACAGTGA GTGCCCCTGGTCTCTGCATTGATCGTTGCATGCAGACATAAAGAACTTGC TGCGTGGCATCCAAAACAATGTTGCAAGATTAAACTATTGGTCATACAAT GTCATCACGAGAGTTGGAAAAATACCGAATTGCAAGTCTAGGACCTAATG CTGTTAAAATGCAAACTTAAAGATGCGTGGACTAACTTGCTAGTTTAAGG GACTAGTCGATACAAACATGCAAAATTAAAGACCAAACAATATAGCTGCA TGTTAGGGGTTTAAGCAGCATAAAGCGTGCACGTTTAGGCGACCTAGATT ATAATTTGTTCCATGGGTTGTTCATAATTGTTAATTCTCCACATGGGAGA TCATACTGTGTAGCAAATCAATGCCTACTTATTTTATTTGATCGTGCTCA TTTAACAAATGCAGGTATGAGCCACAGTCCTTCCTACTTGGATCGGAATA CTTCCTTCATGCATATGGGCCTATATATGCCTTATCAGCTGATGTGGTGG TAAGCTTGGTTGCCTTGAAAAACAACAGGTAAGCTACTGGTTCACCTTCT TTAAGTGGAACTAGCAACTCAAACTTGCCATCTTGCAAGTGTTTGTAATT GTAATATATATTATTTTTTCTTAGGCGTGTCTAATAATATAAAGGAAAAG TTAGCTAGGTACAATAAAAGAATTATTATTGGAAATTCCGTTGAATGTGG TGCTGACTAGTGGGCCCTGGGGCCACATGTTATTGAGACACAAACGTAGT GATCTTTGGTGATGCTACAGAGCAATTCACCCGTAGCACCAAGTAGTCAT GCTAACACATATTGTCGCAAAGTTTCTTACTATTGGCAATGTGCTTTGAA CATTAAACTGAAAACAAGTCTTGGTGGGGAACATTTTTTCTTCCTACAGG CCGTAATATTATGAGATAAGTTAATGATGATTGAATTCTGTGATGCTGAC ACTTCTAACTGACATGGATAGGGTTTATATGGTCATGTCTCTTTCACCTA CTTGTAAATGATGTAGGTAGGCAAACTTCCGCTTTCCTGTGTCTGGTTAA GGTAGAGCTGTGGGAAAGAGTGGGAATCGGTCAGTATCCCTTGGGCCTAT AGTAGGCTACAGTGTGTAGCAAGGAAATTGGCAGCTTCTTGCTCAGAAAA TCGAGAAATGTTGTGAACACCAGTTTCTAACATACGAATATATCAAATTT CCACCATGTTGAAGCTCAAATTGAGTCAGCATCTCTCTCTTGTTTTTTAA AAGATTATTACCTATATTTGTGCAGTTTCCGAATGTTCAATAACGAGGAT GTTACGATTGGATCCTGGATGCTTGCTATGAATGTCAACCACGAGAACAC ACATGCTCTCTGTGAGCCTGAGTGCACACCATCCTCAATTGCTGTTTGGG ATATTCCAAAATGTTCAGGTTAATCTCTAACTTTGCATGGCTCTTTATTC AGGCAAAAGGTGACTGTGAAACAATGTTTTTTTTTCACATTTATATGTGC TATTGACGCCTATACCACTAACTGGGTAACATGTGTAGTGTCGTATTATA CATCACTTTGATCTACTGCAACATCATGAAGCTCAAAGGTTAGTGGTAAT GAGTGAGCAAAACCAAATATTTGGAAGAGCAATGGTTAGTAAAAATCGCA AGACTGGCCTGCGAAAAGGTTGTGTAGAGTAAACTAGATTCACGTTAGGA AGTTCAGTACAAATACAATACATGGATGGATATTTAACTAGAGATGTGTT TATAGAGGTGTCACAGATGAGAGAATCATACTATAACCTGATTGCGACAT CCATGCTGATTAAATACTCTCGGACGCGAATCACTTCGTAGACCAAGCTC ATGAATGCTAACGGGATTTTCCATCTGTGATCCAGGTCTATGCCACCCAG AGGTAAAGATGCTGGAGCTCCACCGGAGAAAAGAATGCACCGGTGGTCCA GCCGAGGTGGCTGAAACCGATGACGAATGACGTTTCAGTCTGGACACGGA ACTGTGTGGACCAGGCGACATGATGACACACACAAACGGTTGACCCCTGC CGCCCCCCAGTAGATTCTTGGAGTGCGAAACCCATTTTGATTCGATCACC AGGTAGTACAATCATCGCCACTTTGCCCGGTATAAATACCGCTGACGAGG CCTACAGCCGCGACTCAGGCGCCATATAGTACCACCATGTAGTAAAGATT CTTGCACGGGCTGCCCTACTCCGTTCCTGCCTAAGTAGTTCTTACTATCT GCTTTCAAGCACACCTGTATTATTATTGCTCGCTCGTCCGTTCATCCCCG GGGGCGAGGAATTTTTGTTGTATAGAATAGAATGCATTGCAAATTAGAAC ACTATACTAGTATAAACTTTTGCTTTCGGCGAATATATGGTACTACTATA AATCCTCTCCCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.