Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA001833

[Submit comment/correction]

Sequence	AA001833
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA001833
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTAAACCGTCACATACTGGGCTCGAACCAGGCCTTCGCCGTCGACCGCGG CCCGTTCGGGAAACCCGGCTTGCACGAACGCCGCGGACGTCTCGATCCCC CGCCGACCAGCGCCGGAATCCGGTTGTTCGCCGCCGGCAACCTCCGCTGC CCCTCCTCCTCTGCCACTCCACGAGCCTGTATTCAAATGCGACCTCCGCG CCTTACCAAGTCCCAAACGGCGGCGGCGAGCAGGGCCTACGTGGCCCCTC TGCCTCCGCTCCCGCCGCCCCGACGTGTCAGCTCCTCATCCACATTTCCC GCCTGGTCAATTGACGATTCCTCCTATTTGCTCCGCAAATACCCCACCAA ACTCGCGTCCTCTTCGTCTCGCGGTAAGCTCGTAGCGCGACCATGGCGGC GTCAGGAACCCTAGTCGTGTACAGGGCGGTGTTCACCGCGCTGGGCTTGC TCATGGTGGGCACCCTGGCGTACACCTGCATCACCGACGGATCGCCCTTT CGCACTGAGCTGCTCACTCCGTGAGTACTGTTTTTCCTCCCCGATTGTCG ATTAGATGTTAATTACTCCGGTTAGTTTCGAAAATCGTCTCATGCTTCTG CTGTGCTCCCTGCGGATCGATAGGAGGCTGTTGCATATATTTTTTGCGTG GCTGATGCTTCTACGTTGAAATAGTGCGGTTGAGGCCTGTTGGTTTGAAT ATAGAGTAACTTGCCTTGCCACTGATTAGAATACTAGAACCATTTGTAGC AATTGCATAATTTTACTTTCATTTAGGAAGTTCAGGTTGCTCATGAAAAT TCAGGTACTGTCTCTGTATGTGTATCTTACACAAGAAAGGCAGAAAATTG CTTCATTTGTCTCTATAAGCCTTTCGCTGCATGCCGATGCTTGTATCCGT ATTTGTGTATCTTGAGTTAGTAAGGTGGCGTTGACATGGAAACTCAGCCT TGATCAAATTTGCTGCAGGTTTAGGTAGCTCCTGAGAAACGCTGCTTTGT CCATTCCCATCAGCTTAGTCAGATAATAGATCTTGTCTAATCTTACTTGT TTTCAACTGATCTTCACTATTCTTCTTGTGTAGGTGGATGGTGACAACAC TGGTTGATTTTTATGTAAATGTAGTAGCAATCTCGGTAATTCCTTAGTCT CTGTACATCTATTTCCTCATTGCTGATCAATCAGATTGTTCAGATTCTGT CACAGAAAGCTAGTGATGCTTAGAATATTTGCTTGTGTTTTCTGTAGTAA CGAATTGAAAATGACAACTAGTATATAACTACACAACTAACAAAGCTATT AATAATTAAAGATATGAGATGAAATTTGCTGTGCAGCTAACTAACCTGCC AACTCCCTAACAAGTTAATAGTAAGCTATCCTTCCATAGGGGGATCTTGC CCTTGCTGTGTGTATGTGCCTTGTTGTCTGCATGCACATTTTTGTTTTTG GCTATCTTAGGTTTGTACATACAACTCGTGAACAATCCTTGTGTTTTCTT GAAAAAAGGATGCTTCGTCCTGGAAGGAATTGAGCATTAGAATGTTGCCT TATTTTAGTTCCCTCTTCAGATTGTTGACTTAAACACTCCGTTTCCAACT TGACTTGAGCTAGATATGTTTATTGCATTTATGGTGTTTCAGGTTTGGGT TATCTACAAGGAAGTAAACTGGATTAGTTCCGTCTTCTGGGTAGTTCTGT TGTTTTGTTTCGGCAGGTATTGATTCCTTTTTGCAAATATTCTACTATCT TTCTTACTGTGGCTTGTTTCGTAGTTATGTTTGTATGGATGTGTTTTTCT CCTGTTGGTTCTTAATGTGATTACCTATTTTATTTTAATTTTTCAGTGCT GCTACATGTGCCTATATTGTTAGCAAGTTATTCGAATTACCACCTTCAGG GCCTTCCCAAGATCCACTTGATCTTTTATTGCTCAGGTATATAAGAAATT GTTTTTTTATTGTATGCAGGATATGGATATTGATTATTTGAGCCAACTAC ATAATAGAGAGGCTTTAATAGCTGCAACGCTGAAAAGAACTGCATTAAGC GAAATTCGTTAATATTTCATATCCATAATCTTTCGTGATTAATTTTAACA TTTATGTTGATTGTTAATGCTTGTTCTGTTTGTTATTGCGGTAATCTATT GTTATGCTGTTATTATAAACTGGACTGATAGTTTCTTAGCTCTTGGCACT TTCTTATTATGAACTGCTAATCCCTTTTACATGCCACTTCAAGAAATAGT AATCAATTATGTACAGAAGATGGCTTTGCCAACATCAAATCAATAGTTTT GTGTTATTTGAACAAAACGAGACTGGAGTCACCTTGTTGGTAGAATGCCT GTTGAATTATAGAGGAGCGCACTCAGTGACTACTCCATCCGTTCCATAAT ATAAGATGTTATAAAAATCAATATATGAGTAAATTGGTTGTAATAAGTAA TAACATCTTATATTATGGGATTTCACTCGATATGTGTCCCGAGTCCAAGG GAGGTGGACCAGGAGATATGCAGGGACTAAGATGATTGTGCTATGACACA TCAAGGTCTCTTTTCCGCTGACACAAATCTCAAACTTAAATGGATTAGAC ACCTCAAATTCATGTTAAGGTTTCTACTGGGCTATAGAGTAATAGGCAGC TTATACTGATTAAGCTATGGTCTCTAAACTTCTTAGAGTCTAGCGAACTA TATTTTCCTTTAGATTTTTACTCTTGCTCCCAAATATACGCACTGAAGAA GCATACTCTATTTCGTCCATTTGTTCTATAAACTATACTCATGTTAATTT GTCTCGTGGTGTGTCTCAAATCTTTTCAGGCAAGGCAATCAACCTGAAAG GAAGTGCTCTTTTGTCTTAATCGGGAGAGTCATTTTCAGCATTTTGGGCA TACTCATGGCTGCACTGGTCACGTATACTGTCGTTACAGATGGACTACCT TTTAGAATGGATTTATTGACGCCGTAAGTGATAACAATCATAATTCATAT TACTCGGTTTCTTAGACCTATTATTTTTAAGCAATTCGCATCCAGGTAGA TGTGGCAGACAAAAGATTAGGAGGTAGCTATTAGATAGTAGATTACAGAA CCTTAGAATAGGAAGACATACCAAGATGTAAATCATGGATATGGGAATCA TGCTAGAAACACATCTATACTGAAGTTGCAGTTAAGAGTCAATTTTTAAT GCATACGTCCATGGGTACTTAGCTATGTTACTCAGACTACAAAATATGGA TACAGAGAATAACACCCAGAATCTAGCACCGGTGTCATAATCCTACATGG ATTCAGGGTGTCCTATTCAGTAAAGAAATCGGGCATGGATGTCCGAGAAG CACATTACTACTTTGCACTCGCCGTAGTTTTGTGTACAAGAGTACAGGTC CATCCAAATTTTAAGGAGAACTGTTAGAGGCAAGACCTAAGTAAATCTTG CAATGATGCTGACATTTATGAGATTATTGTATATGTTGCATTGATTTAAC AATTTGGATATTGAATGAATAGATTTTCTTATTCGTTATGCAAACTATAG AAGTTTTCTGGTATTTCTGGTTACAGTTGGAAATCTCAACCTTACAATTC TCTTGTGCACAGGTGGATGGCTGCAACCCTAATTGACTTCTACATAAATA TTTTTGCAATATCGGTGAGATATCTTCAAATCTCTGTAATTATCAAAGAA ATTAGAGTTAGTTTCATGGAGTAGGTAAGGATGCAAGTGGGTTACCTTTA GGGTACCCTCTACCCTCTACCCTCTACCCTCTTTAGTCCAATAAAATGAA CTAAATTTTCACAGATCTAACTTTTTGAGAAAGCTAGTTCATTTGTTTGA ACTAGACTAAAATAGAGGTGTCCCTAAAGGTTCTAAACTTGCATCTCTAG GAGTAGGCATCCTTTGACCTGACTATCATAAAATTACACTTAAAAGGGAA ATTTTCCAAGCTACATATTCTTTGACGTACCTATCATAAAAGAACACTCT TAGTAAATTCCTGTTTGAATTTTACCAGAAGGGCCCACCTGTTGGTAACA CAGTAGTAATTTGTGCCTAATTGCCTACATAATCAGTGTATTACTTACTA GTTAGTACTGGCTGACATTGCTAAAGTGGCTTGATGAGATTAAGGTATTT ACCCTCTCACAGTGCTACATTGTAAGAATGTCGATCCATTACTTAGCCCT TGTGGACAGTGTGGCAGCTTCGTCTCGGGCACCGGAGAAAATTAATCATG GGTTGGTTCAAAGTGGACGTGGTTATATAATTTATTGACTGTAATAGATA GTCACCAACAATGTAGCTTGGTTTTAGGTGTGTCGAAGAATGTGTACTTT TTTCTCTCTAAATTTCTGTTTAGTGATAGTTCCATAAAAATAAGTATAGC ATCATGACTTCATCGATGCACTAGTATCCATATTTCAGCTTGTAAAGAGG ACGACGTAATGTTTTCCCTCTTAAAAGTTAAACATACCAGTACTGGGTTT GTAGTTATTTCGTCTACTCACTTAAAGTAGTTTTTGATCATGCCATGATA TTTTACTCTTGCAGTTTTTGTCAAACATAAGTAAAAGGGACAATTAAAAC TTGCTGCTAAATCACATTTCTGTAAATTTATCTATAACATTTCCTGTGCA CACCCCCATTTGCAGCTTACCATTTTAGCACCTCTTTGAAAATTGGTAGT GTCAGTTCCTTCAATTACCTTGAAGGTGGTTTATATTTGGTTTGTTCAGT ACTTCACACAACTTTAGCTGAACCAATTTCTTTCTGTTGGGGATACACAT ACTTGTATTTTGCTCCCTGCTGTGCAGCACAGACCCAAAATTGTTAAATC TTTGATGACATGCCTACAGGTATGGGTTGTTCACAAGGAGTCGACTTGGA TATCATCAGCCATTTGGATATGCTTGCTGATATGCTTTGGAAGGTATAAA ATTATTCTACAAGCCTTTCAATATAAAGTGTCTTTTTTGGCATATCATTA CATAACAATTGGGTTCTTCTGGTTCATGAGACCTGGATTTTACTGCAGTA CTTGTCAGAACACTTACTGCATCTACATATTAACATAAGGTGTAATTGGT AACTACTGCTAATTATCAAATACTGTAGTCCGTATTATGTATTAACTAAC AATGGATCTCTTTGTCCATGCTAAATGAATTTATCAGATGTTTCTTGTAA TTTAACATAGTTTTTAGCCTGTATGTGCTCATGCTAGGTGTAAGTTGCAT ACATTTTAGTACTATGTATAGGTATATTATTTAATATTCTCTCTAAGATT CTCCCAAAGGATTATTTTTTGTTTATATCTGGGAGGCACTTTCCTGCTCG AGAGAATAGCTACTAGTAGTAAACTCTCCAATCAAGTGTACGCAACATCA TGTATTTGTTTGTGTAAACTACGTACTGATCCTTATCCTCTTTTTCTTTG ATTTAGCATCACAACATGTGGGTACATTGTCGTTCAACTTCTCCAAGTGT CATTCCAAGACCCAATATACCATCTGCTATTGAACTCCCATAGCAAGTAT GGAATTGCACCCTCACAGTAATCGTTGATCCTCCACGAGCCTGGTTAGCT TACAGTTGTGTAAACATTGCTCGACATACAGTTATTTATGTGGCATTTAC CTGTTGAAATGTAGGAAGGTCTGAAAATTCATTGAAGGGATATGTTGTTC TTGGTACACAATAATGTTTCCTATAGTGAGGTGCTAGAATAAAGGGTATA TCAGAGTAGCAGTTGGAGAAATTGTTGCTTGTTGTAATGGAATAGTTCCG TAATGAAGTTGAGACTCCTTCACTTGTTGCATTCTTGAATGTGGCTGTTC AATTGCAGTACTCGTATCGTGTATCCTATTCAATTGCTTGCAAATGATAA ATGTTTTGAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.