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GrainGenes Sequence Report: AA000860

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Sequence
AA000860
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA000860
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGACTGGCCCTGGCCGTGTCACTGCGTTTCCACCAGTTCAGGCTGGTG
CCGTCAGATGGGCGATGAGCGGATCAGAATCTGCCACGTCCCTCTGCAGT
TTTCCTCTCTCCTCCTCAGGTGACCGGCGCAGCAGAGCCATCAACTGGCG
GCGCGCAGCAACCACCGGGGTGACGTGCGCATCCTCATACTGTGCCCCAG
CTGACACCACGAGCCCCGCAGCGTCTCCAGAGTCTTCCCGCGCCGCTGCG
CGGACTGGGTGGCGCCATCGGTTTTGAATTCCTTGGACCGTGACGGCGAA
TTCGGATCTCCAACAATGGTGACCGCCGGCAAGCCCGACGATGCCGTCCT
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TGCTTTATCTTGTTGTTTTCTTACCCCGCCAATTGTCTGCTGTGAACTGT
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GAATATTATTTTCTTATTACTGACATACAGAATACGGGACAGAAGGCGGT
CTAGGCAAACTGGGAGCTGGCGTTCGTATCTGTGAGTTTCACCATGGATA
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TATGTTTCTAATTTAATCACCTGTGTGTCTCGTGCTTCGAAATTTGCAGG
GGCTAACATAAACCCTGATCTTCTCCTGGCTGCTTTCCTTCCAGCCCTTC
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TGCAGTGAAGAACCATGCTCTTTACATCCTCAACCACCTCCTCGTTAAAT
CATTCAAAAGAACTCTTCGTATTGTATATGGTTGCTCTTTACCCCTGTAT
TTGATTGTGCTTATGTTGATCTCTTCCCCTGACAATCAATGATAAAATCT
GAGTGGCTTAATCAAAGTTTGAGTTGCGGGGAAGAAGCGTGCTCTTTATA
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GATGGCCACTCTTTATCCTGTAATTTGATTGTGCTTATGTTGTTGATCTC
TTCCCCTGCCAATTGTCTGCTGTGAACTGTGATATAGCACAGCAGTTGAA
TATATTTGTTTAATGTGTATAAAAGTTGTGAAATGTTTATTTTGTAGAAA
TGCATGGTACAGATGATCTTACTTGCTGGACCTGGTGTGCTAATGTCAAC
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TTGTTACTTGGTGGCCTGCTAAGTGCCACCGATCCTGTTGCCGTGGTTGC
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AAGTTTTAATGTTAGTTTCTTCAGAGCAACTCCGATTATGAGAACCAAAA
CACAACCACTGACTCAAATAGATAGATTGCATGTTTTTGTTCTAAAGTTC
AACTGGTTTAGTGGCTGGTTGGAAAAAAAATGCTCACTAGACTTTGTTCT
TCAAGGTTACATCTAAAGTATCTTTGAGGTGCAATTGGCTTCCTGGGGGT
CTTAACACCGTGCTATCAGCATGTTAGTAGAACAGTTATTTGAGACTCGA
CACACGTACTGAACTTCATTTAAAAGGTTGAACCACCTTTGTCAATGGCT
CTGGAAAACCTATAGTGTACCAGTAAATTTGTGCTCCTTCAATGAGGGGG
AGATTCCTCTCACAATAATACTAAAATCCGTGGCTATTTTTCTTTTCCAA
CCCATGGCACTATTACAAATGCATAAAAAAATGTGATAAAGCTTTTCATG
CCATACGCAAATTTAATTTTGTTGTTTATCAACTATAGTTAAAATCAGGA
CTTAGTTAACTTACTATGACCTCAATAATCAAAAAAACCTATATGAACTA
AATATCTGACCTCTGTAATGGGGTTGACATAGTCATTGTGTATTTGTGTT
CATCAAGTACATGGTGGATAGCTAAGGTGTTAGAAAGCCAAGTAAAAATA
ACTTTTGGATGTTGTAAAATTGCATTATGAACCATTACACGCTTTTCTTT
TTTGATTAGCAGTTCATGCTAAATGGCCACACATTATTTTACAGGGTTTC
TGTTGTTGTCTATCAGTTATTCTATCGGATGGTGCTCGGAAGAAGCTTCA
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ATGCTAATTGGTATTTCTTTGAGCAGTGTTGCTCTGGGACTTGCATTTGG
AATCATATCATTACTATGGCTGGGCTGTATTTTCAACGATAAAATCTTAA
AGATGACACTTACTCTTGCTGTCAGCTATCTTGCTTTCTATACTGTAAGA
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TTCTGTGAAATAGTTCACAGGATATGGAAATAGTCTTAGAAAATCAGTCC
TAGTACTATCTCTCTTTGTACCTCCTTTTGCAATATTGCTTGTGATGCTG
TTTTACTGGTAACATGAGTTAATTTCTATATATGCATATAGCAAAGTACC
TACGTAGAAATCAAGGATTTAGGGAGCTTCACAGTTTTCATCTGAAAGAT
ATAGAACATATTCAAGCTCTCATAGTTCCGCCTTTTGTTTTCAAGGCTAT
GACTGGTTCAGTTTCTTAAAATAGTTCACACCAAACCAAAAGAGCCTTTG
TGTCAGTCCTATAATTATGTTTCGCGGTACATCCTTTTGCAATATTTCTC
ATGATGTTGCTGTACTGATAATCTAAGGTAACTTCTAGATATGCATATAT
GAAAGTACCATGATATAGGTACCGAGGAACTGAACAGAGCTTCACAGTTT
CCATCTGATCTGATTTGTTTTGCTACGTCATGTGCTTTTTAAATGTCTCG
GTATTAAGCATTTAAGTGTTTCAGAGGGCATGTGTTGTGATCAAAATGCT
GTTAATGTTGTTATTTCTGATGTGTACTTGAATAACTTGGGCGAAGATTT
GGACAGCTTAAGCGATGTTGGTAGAACTGAGTCTGTGTTGTGAAAGAAGA
GCATTGTTGTTATTACTGTAAAACTCTCAAGGAACACAGATATAGATTTT
GGTATGCTGAGAAATGGATAAATTATCGTTTTCGCATAGTAGCATCAGTT
TACCTCCTTTCCAGCTTTTCAAACTATTGACTATTTATCATTGAGCTAAA
GATTATCATGCTTCAATTCCGTATCAGCTGTCAATTTGTGTTTAGGGTAA
TCAGATATCGATATTCATTATTTGTTAGTTTATTTTTTGGTGGAAGATTA
TTGTCAGTTCGTTATTCAATGCTTGTGCATCATGAACTGGCTTATGTAAT
GTTTTCTGCAAAAAAAGGCCGCCCATTAATCTTGATATTGAAATGACTAG
TTTTGAACTATTTTATTTTGCTAATATTGTTCATATCAGGCGCAAGATGC
ACTGGAGTTCTCTGGTATTTTGACCGTCATGACCTTGGGAATGTTAGTAA
AACTTGTCTCCACATCTTATTGGCATATTCTTTTATATTGTTTCTTCAGA
CTCCAGTGCTAACTTAACCATATCTGGCAGGTTCTATGCAGCTTTTGCAA
AAACTTCTTTTAAGGGTGACAGTCAGCGAAGTTTGCATGATTCTGGTATT
GTTTTTGCAACATATATCAATTTATACCATCCGAAAATATTGAATAATCT
CAACAAATGATCTTGGTAGCTGTCGATGCTCCTTTTATGTTAGCATTACC
TGGCCTTCAGTAAATTTTCATTAGAGTTGACAAGTTTGCTGATGCCCAAC
GCATTACTTGTCTAATCTCTTTTTCCTTGCAAAACACACAACTAGTTTAA
TAAAATTTCTACTAGTAGCCATGTATTACCATCATCATCCTGAAGTAGCC
TTAGCAGGACTTTAGAGTCTGTAACTGGCGACAAACAGTGAGATGAGAGT
AAAAGTCTCACCCTCAAGCTTTACTGTCAAACTAGTAAAAATCTCTCTCT
GTCTCTGAGGGAGACACCCAAGCCCAACATTCTGCAATGGAAACAACATA
TAAATACTGGAAAGTTTCAGATGTCTCTTTGTGGCCGTGCTGACCACGTA
TTCTTGTTGATCAGCCACGCGACTATGCGTTCACACACTGCAAGTTCATT
CATCTCCACCTAGCCTCGATGGCCACGTCGACCATCCGCATCTCCACCTC
ACTGGCCACCCCCACCTTAGGGCGAGGAGAAAGCCATCAGCTCAGAGTGC
TTTTGGTAAACTGACATCATTCACAATGTCATTGTTATTCCTATCTCCTT
CGTTTTCCGAGGAATAATGTGGTTATTTGGTTACAAAAATTGTTTTGATG
TCTCTTCAGTTGACACTAAATTAAGTATCATATTGAATTCTCATTTAAGC
GATAATGGATTTATGTATGCTTTCATATTGTATGAGATATGCCTATGTGT
ATCTGACTGATGTTTTACTTGTATTCAGGGAAATAGTTGCCTATGTTGCG
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GACACCATCATAGTGTTTCTTACATGCGTATTACCCTTAGTGGGGTTGTT
ATTGCAGATGGTGTACTACAAGATAATGTCCATTTTGAGAGGAATGGTAT
TTATCTTAAATTACCTTTATCTAATTTTTGTTTTCACGTAAAAGAGGAAG
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TTGTTCGTAGTTTCATCACATGGCATTATTTCAGCCTGTGGTGGTGCAAT
GCGTGCCTTTTATACGCACCATGGTAAGGAGTTGTCGACATAGTCATTGT
ACTAAATGCTCTTATAACTCACTCCTTTCTCCTGCTTATCAATTATACTG
TCATTTTGGGCTTCATCTGTTGAATTATGAATGCAGTTAGTCTGCAATTG
CAACCAACAGATCATGTGGATAAACACTTAGTTAGCCAATAGTTCTGCTA
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TTACATTATTTCTTTTTTTTTACTGGAAAAAAGTCATATTAGTCAGTAGA
ATTTCAGTTTGATCATAGGATGCAACTTCTTAAAAGGAACTTATATGTAC
TACGTAGTATATTTTTTTGTTTGAATTCATTTTTGTGCAGTGGTTTATAA
ATACTTTTTTTTATCTCTTGCTCATCCAGGCACTTCATGGGGGTTTCTTC
TTCTGCTCTATGTATTTATTCAGATGGCACGGGTTGTCGTTGTCGGTATT
TGTTATCCGTTGTTGGGCTACTTTGGATATGGTTTGGACTTCAAAGAAGC
CACTGTTCTTGTTTGGTCAGGGCTGCGAGGTGCTGTTTCTCTATCACTAG
CACTGTCTGTTAAAGTAAGTTATTTTTTCTTGCACCAATTGACCACCTCA
TTTGTCTCTCTTTATCACTTGTCTAATTATTCTTCGAAACAGTAATTCAA
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CAGCTCAACCTCTTCTGAAACCAGAAGTCGGGACCATGGTAGGTTCTTAT
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TTATTACATTCTTTTGCAGTTTGTGTTCTTCACTGGTGGCATTGTGTTTC
TGACATTGATATTGAATGGTTCTACGACACAATTTTTATTGCACGTGCTT
GGTATGGACAAACTGTCAGTAACAAAGGTTAGCTTTACAACTTTTCACCT
TTTTCTTAATCTGAGAATTGAAGAATTTACTTGCATGTGTGCTCATATGT
ACTAGAAATTTTTCAACGTGTTATAAGTATGGGTTCCAGTGCCTATGAAT
TAAAGGTTGATGGAATATATCATCTTACAAAAGAATGCCACAAAAAATAG
TTTATCTTTTGGTCGAACCCACTTGTAAGTTCAGGATTTGTTTTGAGCCT
TGATTACCATTTCCAGTTAAGCCCTTTATCCATCAATTCCAAGGTGTTTC
TGTGACTGTTACCTTGTTGCTTCCTGAAACAGCTATCCTTTTTGGTTTCA
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CGTATGACATTTCTAATCTGATTACTGCCACAGCTTCGTATGTTGAATTA
TACAAGACATGAAATGCTAAACAAGGCATTAGAGGCTTTTGGTGATCTCA
GGGATGACGAGGAACTTGGACTTGCTGACTGGGTTATAGTGAAGAAATTC
ATCACATGTTTGAGTAACTTGGAGGATGGATGCGTGCATCCACATGCTGA
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TTTTAAATGGTATGCAATCTTATTACATGACACTCTCTGTTGTGTTACTA
GGGTTAGGGAGAGTTTCTCGCTCCTGGGGCAAGGTAGAAGAACTATTCTT
CAGTTTCTTGCTTGCTCTATTCCTCATAGGGGTTCCTCTTTATAATTTAG
TTATACTCCCTAATCTTTCTTCCCCTAAGCCCCCTGGCCTCTATTTGCCA
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TTGGCCTAGGGAACAACTGAAGATAAAGAGTTCTAACACAAACCTTTTGC
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TACAAGGCCAAAAGGCCCTTGATTTTGTACATTGATTGGCCCCAATTACT
TATTGTTGTTGCTTAGAACCTCTATCATTTAACTTTTTTTATTTTAAGTA
TTACATTTATGTTCTCAAACTTGACATCCTTTTCTTTTCTTTTCTGTTTT
TGTTTTAGACAGTTGACTTAATATTTCATCCATGATTCTATCTTCTCTCT
CTCTTTATGGAAATGTTCAGTTTCATGCTAAATGCGATTAACTAACACGG
GAAGGATTTTTTCTCTTTGTAAATATCGTGTTCAGGTGTGCAAGCCACTT
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TCATAGAATTGCAAGGAGACAACTACATGATTTCCTTGGTAAAAACTTGG
AAATAAATTTAAATGTTTTTCTGTTCTTGTTGTTTTGGGCTACAAATTCC
AGAATTTAGTACTACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGACGTTTTAGGTTT
GTAAAGAAAATGAATCTAGACTTCTTTTAGTGTGTAGATTCATCCCTAAG
TTGAGTGAACCTACAACTAAAATAAGTCTAGATACATTTGCTTCATAAAG
CTAAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTACATGAAGTTCTTTCAC
AATATGGTTGTGTATATGACTGATGTTATGTCTGAAACATATTCTTAGTG
TAGGTGCCACATTGTTGTAGTTCATACTTGGGGACAGAAAGCAGTATTTG
TTACTTGGCACAGACAGACTATTTTCATGTAGAATCAATCAGCTATGTCA
TGGTACGGATGGGTGGATGGTTCAAACCATTTTAGCTTATTAATGTTGAA
CTGGAAAAGGTTTACTTTGTTTGTAGTTAACCATGCAAAGCCTGTCTGAA
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AATGAGATTGCAAGAATTGTTATTGATGAAAGTAATGCCGTGGAAGAGGA
AGCTAGAAAGTTCCTGGAAGAAGTTCGCTGTACATTCCCTCAGGTTTGTA
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ATTATTGTTTTGTTTCATGCAAAGTTCCCGTGGAACTCCCTTCTGTCGAA
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GGTGAAAATGCCTGCATTTTGAATCCGTTTCACATTTTTTCAGCTGCTTT
GTGTGCTGAAGACTCGACAAGTAACATATTCGGTATTGACACACTTGAGT
GAGTATGTTCAAAACCTACGGAAGACTGGGTTACTGGAAGAAAAGGAAAT
GATACAACTGGATGATGCTTTGCAGGTAGTGAGAGTGTTTGACTTGTCTT
TCGTCGTTCCTGAGTAAAGATTAATGACGTCGAGGTTTCTTCACAAATCA
AAACAAATATGCTAATTCTTCACTTCTCAGACAGATTTGAAGAAGCTTAA
GAGGAATCCACCATTAGTGAAAATGAGTGTTAGCGACCTTTTAGACACTC
ATCCTTTAGTCGGCGTGCTGCCTGCTGTTGTGCGTGCTCATTTGTTACAC
AATACGAAAGAAACAGTAAAAGGACATGACACATGCCTTTATATGGAAGG
CTCAAGTGCAACTGGTATATGGATCATTTCGACTGGACTAGTAAAGGTAA
ACTTTGTGCTTCAGACCACTATATTTTTTTTAGTATATTATACTTTACTG
TGTTGGTTTGTTATATAATGGGCATATCCCTTAAGATTCCCCTCTTTTTT
TTTGACAGTGGACAAGTCAGAGGCTAAGCAGCATGTACTCATTGGATCCA
ATTTTATCACATGGAAGCACTTTGGGTCTATATGAGGTGCTAACTGGAAA
GCCTTATATCTGTAACATGATTGCAGATTCTTTTGTGCGTTGTTTCTTCA
TTGAAGCTGAAAAGATAGATCAGCTGCGTTGGTCAGATCCTTCTGTTGAG
GCTTTACTGTGGCAGGTATGCTTTAATAATACTGTCTACTTGTGTGTTTA
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GTATATTCAGGATGATAAAACATAGTTATTAGCAATTGTGTAAAGGGAAA
ATAGCACCTAACCGCCTTGTTATGTGCCTTTGACTCAAATGATTCATGTA
TTATGTAAACACTCTTGCGGAAGAAATTTTCTTAAAGCACAGTCCAGTTT
GAACGAGCTTACACAGGCATTGTCGCTTGGTTGTTTGTCTTTCCTCCTCT
CTTCACTTAAACCAGTTACTGTGTTTACATCTGGCCACATGACATGGTCC
TTCTCGAGTGTCACATGTCAATGTTTCTTGTATGAAGCAATCTGTATGTT
GTTTTAGAGAACATGGTGAAGGTAAGCCTGTGCAGAAACGGTCTGGCCAG
TTTGACCGGTTTGGACTAGTTCAAAATTTTATACTAATTTCAAAGTTTAG
ATTGGATTTGTGAATAAAATTGAACTAGGAAATTTTTGGCCGGTTTAGAC
GGTTTAAGCGGTTTTACTTTTTGCACAGGCTTAGGTGAAGGGCTCTATCC
GCTTGTCCCTAAATCATTTATACCTGAAAATTGCAGGAAAGCGCTCTAGT
CGTTGCTAAGCTTTTGATCCCGCGTGTATTCGAGAGAATAACAACGCATG
AGACGAGGCTTGTCATTGCCAAAGGATCAACCATGAACTTCTACACCGAG
GGGGAAGACATTGTACTCGAGCATAATCAAATTGGCATCTTGCTAGAAGG
ACTTGCGAAGGCAGAGAACCAAGGTAGCATCGCATCTCCAGGAGTGCTGC
TGCCGTCAAACATCGACTTGGAGTTACTTGGTCTACAGCCTTCAGGCAGG
TTCTTTACGTTTTCATCGATTGAGCAGTGATTTGTTTTTTTTTAATCTAT
ATATATAAGGTCAACTTGTACGTTTTTTAGTTACCATCTGATGATTGATG
ACACAGGTGTGTTTGACTGTTTACAGGCATGAAGGTTTTGGACTACTGCT
ATGCAGCCAGCGGTTATGAGGTGCAAGCACGAGCTCGGGTTATCATCTTT
GAACCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCTTCTCGCCGTTGCT
GACGCTGAGCAGGAATCCACCAGCCTAGCCGCAGCCAGAAACCAAGAGGG
TGACAGCCTATCTGCTAAAGCCCTGCATCTCGGCCTGTATGGCAGCACGG
AGGAATCCACCGGAGAAGACGTCGTCGTCACCATCGACTCCCCAGGCAAG
CCGTCCTTGGGCAAGTCACCCGGCGGCGCACCGTGATAGGGCGAGCGACT
GACGGATGCGTGGATGCTGCTCGTGCGGAAAGTCCCAGCTGTGCTATCGT
ATATCATGGGTTGTCCGCGACAGCGCGGTTTGCTTCACTCAAACACAGAT
TCACTACTCACCCGTGGATCTGAATTCTGATGGAGTTTGTCCCAGCGCTC
CAACAAGTGCCAACTGCTCATTTTGGGTGGAGCGGGGTTGGGGATGGCCT
CTAGCTCATTTTGGCGAGGCTGGATAAAAACCGGTGGCAGGATTTAGGGG
GGCGGCTGGTCTGAAAATAAGGAACGGAGCCGACAATGAAGGGAATGGTT
TGGTTTGAAACCGAATACGTCGACTCTTTGGCCGTGTTTTTATTGTTAAC
CCAGATCTTATTTTCTGTTTTGATTTGCTATTTTGCTGTAATGGTTCATC
TCCTGTGTACCATCATGGTTCATCTCATCATTCGAGTTGTGAATTCTTCT
GAGATTGTGCTTGCCGTACCATGCTTCGAGCATGCCTGTTTTGCTTGCAT
GCCTGCAGCCCTCTACATTGTAAGGATGGAGCGGTATTTGAATACTACTT
TCTTCCAACATCCACAATACAGGGTGGTCTAGGCAAATTTGGAGATATCA
TTTTGTAAGGGTTTGATGAGCGCCCTAAAGGGACCCCTAGTGAATCGAGA
CACTTATCATTGTGGCAAGGCTCGAGGAGAATAAGGTCAGCCTTGGTGGT
GCTTGTAGTGCATTGTGCAACACACGTCTCCAACGGAGATTACCTTCCCA
TTGGAGTTGAATTTCTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.